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长链非编码RNA LINC01133通过调控线粒体功能影响人牙周膜干细胞成牙骨质分化潜能的研究
编辑人员丨2天前
目的:探索长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)LINC01133对人牙周膜干细胞(human periodontal ligament stem cells,hPDLSC)成牙骨质分化潜能的影响及其作用机制。方法:收集2021年9月至2022年1月第四军医大学口腔医学院口腔颌面外科17~30岁10例就诊患者因正畸需要或因阻生拔除的牙齿共12颗,从离体牙上提取hPDLSC,分别转染靶向LINC01133小干扰RNA(small interfering RNA-LINC01133,si-LINC01133)或阴性对照小干扰RNA(small interfering RNA-negative control,si-NC),以转染si-LINC01133为实验组,转染si-NC为阴性对照组。利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)检测si-LINC01133的沉默效率;通过蛋白质印迹法检测hPDLSC成牙骨质分化相关蛋白包括骨涎蛋白(bone sialoprotein,BSP)、牙骨质附着蛋白(cementum attachment protein,CAP)、牙骨质蛋白1(cementum protein-1,CEMP-1)的表达;利用流式细胞术和线粒体超氧化物指示剂MitoSOX检测细胞线粒体活性氧产量;通过JC-1荧光染色法检测线粒体膜电位水平;利用蛋白质印迹法检测线粒体呼吸链复合体蛋白包括NADH脱氢酶[泛醌]1β亚单位8(NADH dehydrogenase[ubiquinone]1 beta subcomplex subunit 8,NDUFB8)、琥珀酸脱氢酶亚单位A(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A,SDHA)、泛醌-细胞色素c还原酶核心蛋白1(ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1,UQCR1)、细胞色素c氧化酶亚单位4亚型1(cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1,COXⅣ)、ATP合成酶F1亚单位α(ATP synthase F1 subunit alpha,ATP5A)的表达水平。结果:hPDLSC的LINC01133表达水平被si-LINC01133有效沉默(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:0.385±0.128)( t=10.72, P<0.01),沉默效率超过60%。LINC01133沉默后,hPDLSC BSP表达水平显著下降(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:0.664±0.179)( t=4.62, P<0.01);CAP表达水平显著下降(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:0.736±0.229)( t=2.83, P<0.05)。LINC01133沉默后,hPDLSC线粒体活性氧产量显著上升(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:1.458±0.185) (t=4.96, P<0.05);线粒体膜电位水平显著下降(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:0.209±0.029)( t=53.99, P<0.01);NDUFB8表达水平显著上升(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:1.683±0.397)( t=3.45, P<0.05);SDHA表达水平显著下降(阴性对照组:1.000±0.000,实验组:0.428±0.228)( t=5.02, P<0.05)。实验组UQCR1、COXⅣ和ATP5A的表达水平与阴性对照组相比差异均无统计学意义( P>0.05)。 结论:LINC01133可能通过调控hPDLSC线粒体功能,进而影响hPDLSC成牙骨质分化潜能。
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编辑人员丨2天前
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LINC01133/微小RNA-205/谷胱甘肽过氧化物酶3轴对乳腺癌细胞增殖和迁移的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨LINC01133/微小RNA(miRNA,miR)-205/谷胱甘肽过氧化物酶3(GPX3)轴对乳腺癌细胞增殖和迁移的影响及其机制。方法:收集河南省人民医院2018年1月到2020年1月手术摘除的129例乳腺癌和癌旁组织,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析LINC01133和miR-205表达水平;在MCF-7细胞建立LINC01133过表达和miR-205沉默细胞系,分别作为LINC01133组、lncRNA对照组、miR-205 KD组和miR对照组。分别采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析细胞增殖能力,采用Transwell分析细胞迁移能力;采用生物信息学分析LINC01133和miR-205关系及其靶蛋白;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析靶蛋白表达水平。组间比较采用 t检验。 结果:与癌旁组织LINC01133表达水平(1.12±0.15)比较,乳腺癌组织中LINC01133表达水平(0.57±0.10)显著下调,差异有统计学意义( t=3.011, P<0.05)。与lncRNA对照组细胞LINC01133表达水平(1.05±0.11)比较,LINC01133组细胞LINC01133表达水平(2.48±0.21)显著增加,差异有统计学意义( t=4.108, P<0.05)。与lncRNA对照组细胞吸光度值(2.29±0.20)比较,LINC01133组细胞吸光度值(1.54±0.16)显著下降,差异有统计学意义( t=3.025, P<0.05)。与lncRNA对照组细胞迁移数量[(80.71±8.19)个]比较,LINC01133组细胞迁移数量[(43.77±6.47)个]显著下降,差异有统计学意义( t=2.810, P<0.05)。生物信息分析显示LINC01133的靶miRNA是miR-205,miR-205的靶基因是GPX3,miR-205与GPX3 mRNA 3’端非编码区(3’UTR)区域存在碱基互补。与lncRNA对照组细胞GPX3蛋白表达水平(0.28±0.10)比较,LINC01133组细胞中GPX3蛋白表达水平(1.08±0.22)显著增加,差异有统计学意义( t=2.791, P<0.05)。与miRNA对照组细胞GPX3蛋白表达水平(0.58±0.16)比较,miR-205 KD组细胞GPX3蛋白表达水平(1.98±0.24)显著增加,差异有统计学意义( t=3.019, P<0.05)。 结论:LINC01133在乳腺癌中呈低表达,通过miR-205/GPX3轴参与乳腺癌的增殖和迁移。
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编辑人员丨2天前
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LncRNA LINC01133在侵袭性牙周炎中的表达及作用
编辑人员丨3周前
目的:探讨lncRNA LINC01133在侵袭性牙周炎中的作用及机制.方法:用qRT-PCR检测不同正常人群及侵袭性牙周炎患者中不同炎症状态下牙龈组织中LINC01133、基质金属蛋白酶9(MMP-9)的表达,并用ELISA法检测其白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)炎症细胞因子.构建侵袭性牙周炎细胞模型,通过大肠杆菌脂多糖刺激人牙龈成纤维细胞(HGFs),体外培养检测 HGFs 细胞中LINC01133表达水平的变化.构建LINC01133过表达载体,转染HGFs,用qRT-PCR和免疫印迹检测载体相关mRNA及蛋白表达水平的变化.结果:侵袭性牙龈炎患者牙龈组织中LINC01133呈现低表达,MMP-9、IL-6、TNF-α呈现高表达,且LINC01133、MMP-9两者呈负相关.经过炎症细胞模型构建,HGFs LINC01133呈现低表达,且经过转染后上调LINC01133的表达,可以抑制MMP-9、IL-6、TNF-α的表达,从而减轻炎症的发生,改善侵袭性牙周炎的进展.结论:炎性牙龈组织中的 LINC0113低表达,提示其参与侵袭性牙周炎的发病过程,且LINC01133可调控MMP-9、IL-6、TNF-α的表达,以调控侵袭性牙周炎的变化.
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编辑人员丨3周前
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采用生物信息学方法筛选与肺腺癌患者预后相关的LncRNAs
编辑人员丨2023/8/6
目的 采用生物信息学的方法探讨差异表达长链非编码RNA (lncRNAs)与肺腺癌患者预后的关系.方法 从国际肿瘤数据库(TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织的RNA测序数据和患者的临床信息,采用R语言程序包筛选差异表达的lncRNAs.应用Kaplan Meier生存曲线(Log Rank检验)及Cox回归模型进行预后分析.结果 筛选出差异表达lncRNAs共计168个,其中上调的lncRNAs有128个,下调的lncRNAs有40个.单因素和多因素回归分析结果显示:RP11-490M8.1(P=0.047)、RP11-132A1.4(P=0.049)、DRAIC(P=0.023)、LINC00942 (P=0.033)、TMPO-AS1 (P=0.006)、Z83851.4(P=0.032)和LINC01133 (P=0.035)是肺腺癌患者的独立预后因素.结论 该研究筛选出7个lncRNAs,可作为肺腺癌患者预后的独立标志物,为临床医生对肺腺癌患者的预后判断提供帮助.
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编辑人员丨2023/8/6
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LINC01133在宫颈癌中的表达及生物学意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究长链非编码RNA LINC01133在宫颈癌组织中的表达及与宫颈癌患者临床特征、预后的关系,探讨LINC01133在宫颈癌细胞中的生物学意义.方法 qRT-PCR检测LINC01133在60例宫颈癌组织和40例正常宫颈组织中的表达水平,并分析宫颈癌组织中LINC01133的表达与患者临床特征及预后的关系.qRT-PCR检测LINC01133在宫颈癌细胞中的表达;HeLa细胞经脂质体分别转染对照(si-NC)和LINC01133 siRNA(si-LINC01133)48 h后,MTS检测各组细胞增殖能力,Transwell实验检测各组细胞转移能力,划痕实验检测各组细胞迁移能力,Western-blot检测各组细胞中pPI3K和pAKT蛋白的表达.结果 qRT-PCR结果显示LINC01133在宫颈癌组织中的表达显著高于正常宫颈组织,LINC01133的高表达与宫颈癌肿瘤大小、肿瘤TNM分期及淋巴结转移显著相关,且LINC01133高表达的宫颈癌患者生存期较短(P<0.05).LINC01133在宫颈癌细胞HeLa、caski、siha中的表达均显著高于人宫颈上皮永生化细胞H8(P<0.05);转染LINC01133 siRNA后,HeLa细胞增殖、转移及迁移能力均下降,pPI3K和pAKT蛋白的表达均降低(P<0.05).结论 LINC01133在宫颈癌组织和细胞系中均高表达,且高表达与肿瘤大小、肿瘤TNM分期、淋巴结转移及预后不良相关,干扰LINC01133的表达抑制HeLa细胞的生物学行为,LINC01133可以作为治疗宫颈癌的潜在分子靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA LINC01133通过上皮-间充质转化途径促进喉鳞癌进展的机制研究
编辑人员丨2023/8/5
目的:探讨长链非编码RNA LINC01133在喉鳞癌(LSCC)中的相对表达功能及致癌机制.方法:通过实时荧光定量qRT-PCR,检测48例LSCC患者癌与癌旁组织样本中LINC01133的表达水平及其与患者临床病理特征的相关性,并通过体外功能学实验,探讨LINC01133对LSCC细胞体外增殖、迁移及侵袭能力的作用,以及对上皮-间充质转化的影响.结果:与对照组相比,LINC01133在LSCC癌组织及细胞系中表达增高(P<0.05).相关性分析提示,癌组织中LINC01133相对表达水平与患者临床分期、组织分化程度及是否伴有颈部淋巴结转移相关(P<0.05),而未发现其表达水平与其他临床特征有明显相关性(P>0.05).功能实验证实LINC01133能够促进LSCC细胞的体外增殖、迁移、侵袭能力及上皮-间充质转化进程.结论:LINC01133在LSCC组织中相对表达水平明显高于癌旁正常组织,其相对表达水平与患者临床分期、组织分化、是否伴有颈部淋巴结转移相关,并能促进LSCC细胞的恶性表型及上皮-间充质转化进程,在LSCC的发生发展中具有重要意义.
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编辑人员丨2023/8/5
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广西壮族人群LINC01133基因多态性分布研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨广西壮族人群LINC01133基因多态性位点rs76477312和rs2840587的分布情况,为研究LINC01133基因多态性与不同地区的疾病易感性的关系提供理论基础.方法 运用多重高温连接酶检测反应技术和DNA测序检测574例广西壮族人群LINC01133基因多态性位点rs76477312和rs2840587基因型、等位基因频率,并与ensemble数据库公布的千人基因组计划人群进行比较.结果 广西壮族人群rs76477312主要以CC基因型(69.0%)为主,rs2840587主要以TT基因型(94.3%)为主,广西壮族人群男女间rs76477312、rs2840587基因型、等位基因频率比较,差异无统计学意义(P>0.05).广西壮族人群rs76477312基因型、等位基因频率与美国、欧洲人群比较,差异有统计学意义(P<0.05),广西壮族人群rs2840587基因型、等位基因频率与美国、欧洲和南亚人群比较,差异有统计学意义(P<0.05).结论 不同人群LINC01133基因多态性位点rs76477312和rs2840587基因型和等位基因频率具有地区差异性,为后续LINC01133基因多态性在不同人群疾病易感性的研究提供理论基础.
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编辑人员丨2023/8/5
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LINC01133靶向miR-625调控CCND1促进胰腺癌发展的机制研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长非编码RNALINC01133通过靶向微小RNA(microRNA,miR)-625调控G1/S-特异性周期蛋白-D1(Cyclin D1,CCND1)促进胰腺癌发展的机制.方法 分析TCGA数据库中胰腺癌患者LINC01133水平和患者生存之间的关系.通过双荧光素酶报告验证LINC01133靶向miR-625和miR-625靶向CCND1.将胰腺癌细胞系SW1990分为4组:对照组、LINC01133组、LINC01133+mimic组和mimic组.通过质粒转染技术过表达miR-625和(或)LINC01133.通过qPCR和Western blot检测RNA和蛋白水平,CCK-8法、细胞划痕实验和Transwell实验检测细胞活力、细胞迁移和侵袭能力.结果 高水平的LINC01133与胰腺癌更低的生存率和无进展生存期有关(P<0.05).LINC01133直接靶向miR-625.LINC01133组miR-625水平显著低于对照组(P<0.05),LINC01133+mimic组的miR-625水平显著高于LICN01133组(P<0.05).LINC01133组的细胞活力、迁移和侵袭能力显著高于对照组(P<0.05),mimic组的细胞活力、迁移和侵袭能力显著低于对照组(P<0.05),LINC01133+mimic组的细胞活力、迁移和侵袭能力显著低于LINC01133组(P<0.05).miR-625直接靶向抑制CCND1 mRNA和蛋白的表达,LINC01133通过靶向miR-625促进CCND1的表达.结论 在胰腺癌中,LINC01133具有促癌作用,并且LINC01133可能通过靶向miR-625促进CCND1的表达水平,从而促进胰腺癌细胞生长、迁移和侵袭.
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编辑人员丨2023/8/5
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LINC00511和LINC01133诊断老年胃癌的临床价值
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨老年胃癌患者血清长基因间非蛋白编码RNA(LINC)00511和LINC01133的表达及与临床特征的关系,分析二者单项及与糖类抗原(CA)72-4联合检测对老年人胃癌的临床诊断价值.方法 选取老年胃癌患者100例作为实验组,再选取同期老年健康体检者76例作为对照组,通过定量逆转录聚合酶链反应检测血清LINC00511和LINC01133的表达,分析二者血清表达水平的相关性及与肿瘤临床特征的关系;采用受试者工作特征(ROC)曲线评估其对胃癌的临床诊断效能;通过计算ROC曲线下面积(AUC)、敏感度、特异度、阳性预测值及阴性预测值,评估单项及联合检测的临床应用价值.结果 实验组LINC00511和LINC01133表达量显著高于对照组(均P<0.01),实验组二者表达水平呈显著正相关(r=0.304,P<0.01).LINC01133血清水平与性别、TNM临床分期和淋巴结转移均无统计学差异(P>0.05),但与肿瘤合并远处转移呈正相关(P<0.01).LINC00511、LINC01133及CA72-4诊断胃癌的AUC分别为0.659、0.807和0.764,其中LINC01133诊断的敏感度(81.0%)最高,CA72-4诊断的特异度(84.2%)最高.LINC00511与LINC01133具有显著诊断互补性(P<0.05).而LINC00511和CA72-4、LINC01133和CA72-4之间均无显著互补性(P>0.05).LINC00511和LINC01133联合可将诊断的敏感度提高至92.0%,二者与CA72-4联合可将敏感度和阴性预测值分别提高至94.0%和85.7%.结论 LINC00511和LINC01133在老年胃癌患者血清中高表达,与临床进展显著相关,可能是老年胃癌辅助诊断的潜在血清学标志物.
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编辑人员丨2023/8/5
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干扰LINC01133对宫颈癌细胞增殖、炎性因子水平、氧化应激以及裸鼠成瘤的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究干扰长链非编码RNA LINC01133 在宫颈癌细胞中的作用和机制.方法 TCGA数据库和qRT-PCR分析LINC01133 在宫颈癌组织和细胞中的表达;qRT-PCR检测LINC01133-shRNAs的敲低效率;SiHa细胞分为Control组、shRNA-NC组、LINC01133-shRNA1 组,克隆形成实验检测细胞增殖,ELISA检测肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-6 和IL-1β水平;免疫荧光检测SiHa细胞中P65 的核转移;Western印迹检测P65 的磷酸化;试剂盒检测超氧化物歧化酶(SOD)和乳酸脱氢酶(LDH);建立裸鼠移植瘤模型,分析干扰LINC01133 表达对肿瘤生长的影响.结果 LINC01133 在宫颈癌组织和细胞中的表达显著上调(P<0.05).LINC01133-shRNA1 组敲除效率最为显著,选择此组作为后续实验干扰组;与对照组相比,LINC01133-shRNA1 组克隆形成率、炎性因子水平、P65 磷酸化水平、细胞核P65 含量和LDH水平均显著升高(P<0.05),SOD活性显著降低(P<0.05);在裸鼠成瘤实验中,与shRNA-NC组相比,LINC01133-shRNA1 组肿瘤组织体积、重量、SOD活性均显著降低(P<0.05),P65 的磷酸化水平显著升高(P<0.05).结论 干扰LINC01133 抑制宫颈癌细胞生长、炎性因子水平和氧化应激.
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编辑人员丨2023/8/5
