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儿童肾脏透明细胞肉瘤的BCOR和YWHAE-NUTM2B/E基因检测
编辑人员丨6天前
采用高通量测序(NGS)、Sanger测序和荧光原位杂交(FISH)等方法检测福建省立医院于2013年7月至2019年8月诊断的3例儿童肾脏透明细胞肉瘤(CCSK)的BCOR和YWHAE-NUTM2B/E等基因的状态,并结合临床表现、组织学形态及免疫表型进行诊断和讨论。3例均为3~6岁男童,镜下见CCSK经典的组织学形态,但形态出现了变异。弥漫表达BCOR和cyclin D1蛋白,Sanger测序证实存在BCOR基因的内部串联重复性扩增,NGS及FISH检测证实不存在YWHAE-NUTM2B/E、BCOR-CCNB3等基因的重排。儿童肾脏CCSK具有特征的形态学表现,但因常出现形态变异而易误诊,分子遗传学检测为该肿瘤的确诊提供了重要依据。
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编辑人员丨6天前
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NUTM1基因重排白血病的研究进展
编辑人员丨6天前
白血病的分子分型是评估疾病风险、选择治疗方案的基础。NUTM1基因(15q14)重排是急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)的一种新分子类型,主要见于儿童(≥1岁)和婴儿(<1岁),儿童患者稍多。但是在婴儿ALL中,NUTM1重排是第2位最常见的分子异常。NUTM1重排白血病患儿对常规化疗方案反应敏感,预后较好。NUTM1重排白血病患者较少,我国尚鲜见相关研究和病例报道。NUTM1基因编码的NUT蛋白是一种染色质调节因子,与组蛋白乙酰化调控及染色质重构有关。文章介绍NUTM1重排白血病的临床病理学特征、检测方法、可能的致瘤机制及治疗前景,期望提高临床对此类白血病的认识,为精准分子分型及治疗提供参考。
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编辑人员丨6天前
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NUTM1基因重排肿瘤研究进展
编辑人员丨6天前
NUTM1基因重排曾被视为NUT癌的独特分子改变。近年,在圆形梭形细胞肉瘤、急性白血病、汗孔瘤和汗孔癌等肿瘤中也发现了NUTM1重排,拓宽了此类肿瘤的疾病谱系。与NUTM1发生融合的伙伴基因有多种,大部分编码DNA结合蛋白,包括溴域蛋白家族、MAX二聚体家族、CIC转录因子、转录增强子结构域活化因子等,形成X-NUT融合蛋白。X-NUT融合蛋白的羧基端保留近乎完整的NUT蛋白,提示NUT对组蛋白乙酰化的表观遗传学调控对此类肿瘤发病机制有普遍意义。伙伴基因则可能与细胞类型有关,因而可能影响融合蛋白作用位点,决定肿瘤的具体类型以及肿瘤的临床病理特征。NUTM1重排肿瘤总体罕见,但普遍预后差。本文对NUT癌和新近认识的NUTM1重排肿瘤进行综述,包括其分子基础、临床病理特征、鉴别诊断思路和靶向治疗研究策略,期望有助于临床及病理医师对此类肿瘤的认识和精准诊断。
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编辑人员丨6天前
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靶向捕获高深度测序及转录组测序在儿童急性B淋巴细胞白血病中的应用
编辑人员丨6天前
目的:探讨靶向捕获高深度测序(Panel-seq)及转录组测序(RNA-seq)与传统检测方法在儿童初发急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)细胞及分子遗传学分型中的差异及意义。方法:回顾性分析2020年9月至2021年12月在广州市妇女儿童医疗中心新诊断为B-ALL的152例患儿临床资料。患儿除接受包括核型分析、荧光原位杂交以及43种融合基因定量筛查的传统细胞及分子遗传学方法检测外,还进行Panel-seq及RNA-seq检测。Panel-seq覆盖血液系统肿瘤常见变异的600多个基因,同时分析融合基因及基因突变;RNA-seq分析融合基因、基因突变及基因表达情况,推测染色体水平的拷贝数变异,并结合基因表达谱聚类和拷贝数变异预测高二倍体亚型。分析比较各检测方法遗传学分型结果。结果:152例患儿中,男性93例,女性59例,中位年龄4.0岁(0.8~13.0岁),中位原始细胞比例0.855(0.215~0.965)。152例患儿中,传统检测方法鉴定出4例(2.6%)BCR-ABL1、2例(1.3%)CRLF2基因相关融合、27例(17.8%)ETV6-RUNX1、1例(0.7%)iAMP21、5例(3.3%)MLL重排、8例(5.3%)TCF3-PBX1以及22例(14.5%)高二倍体核型;Panel-seq鉴定出4例(2.6%)BCR-ABL1、2例(1.3%)CRLF2基因相关融合、27例(17.8%)ETV6-RUNX1、3例(2.0%)MEF2D基因相关融合、1例(0.7%)MEIS1-FOXO1、5例(3.3%)MLL重排、5例(3.3%)PAX5基因相关融合、8例(5.3%)TCF3-PBX1、4例(2.6%)ZNF384基因相关融合和2例(1.3%)IKZF1 N159Y突变。1例MLL重排患儿因样本质量问题未进行RNA-seq检测,其余151例患儿中,共检出1例(0.7%)ACIN1-NUTM1、4例(2.6%)BCR-ABL1、3例(2.0%)CRLF2基因相关融合、8例(5.3%)DUX4基因相关融合、27例(17.9%)ETV6-RUNX1、3例(2.0%)MEF2D基因相关融合、1例(0.7%)MEIS1-FOXO1、4例(2.6%)MLL重排、5例(3.3%)PAX5基因相关融合、1例(0.7%)ZMIZ1-ABL1、8例(5.3%)TCF3-PBX1、4例(2.6%)ZNF384基因相关融合及61例(40.4%)高二倍体亚型和2例(1.3%)IKZF1 N159Y突变;RNA-seq对融合基因及高二倍体核型检出有明显优势。传统方法、Panel-seq和RNA-seq检测的细胞及分子遗传学分型率分别为45.4%(69/152)、40.1%(61/152)和87.4%(132/151),三者结合可对89.5%(136/152)患儿进行分型。结论:联合应用Panel-seq、RNA-seq技术可提高B-ALL患儿遗传学异常的检出率,从而进行更精确的细胞及分子遗传学分型,为指导治疗及判断预后提供依据。
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编辑人员丨6天前
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盆腹腔YWHAE-NUTM2B融合阳性高级别子宫内膜间质肉瘤1例
编辑人员丨6天前
本文报道1例发生在14岁女性盆腹腔的YWHAE-NUTM2B融合阳性高级别子宫内膜间质肉瘤,该肿瘤为青少年中极为罕见的高侵袭性软组织肉瘤,预后不良,目前尚无标准的治疗指南。
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编辑人员丨6天前
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CIC重排肉瘤6例临床病理学分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨CIC重排肉瘤(CRS)的临床病理学特征、鉴别诊断及预后。方法:收集山东省肿瘤医院2020年12月至2022年5月诊治的6例CRS的临床病理资料,观察其组织形态学特征、免疫表型、分子遗传学特征,并结合文献分析。结果:6例患者中男性3例,女性3例,发病年龄3~58岁(平均年龄32.8岁)。软组织3例,子宫2例,肺1例。镜下观察,肿瘤由弥漫片状的未分化性圆细胞构成,呈结节状生长;细胞异型明显,细胞核呈空泡样,部分细胞核仁明显,核分裂象多见;胞质透亮或呈弱嗜酸性;局灶瘤细胞呈梭形、上皮样或横纹肌样形态;肿瘤内可见地图样坏死及间质黏液变性。免疫表型:CD99局灶阳性(5/6)、WT-1核阳性(4/6)、Fli-1阳性(4/6)、ERG阳性(3/6)、cyclin D1阳性(6/6);其中1例CIC-NUTM1基因融合肿瘤显示NUT核弥漫阳性。INI1表达未缺失(6/6)。荧光原位杂交检测结果:6例患者均显示CIC基因重排。其中,二代测序显示存在CIC-NUTM1基因融合的患者,CIC和NUTM1分离探针均显示阳性。术后随访3~21个月,1例因病死亡,5例带瘤生存。结论:CIC重排肉瘤是一种罕见的高级别圆细胞未分化肉瘤,独特的组织学特征、免疫表型及特征性的融合基因有助于诊断和鉴别诊断。与其他未分化小圆细胞肉瘤相比,其恶性程度更高,生存期更短。
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编辑人员丨6天前
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成人颅内原发CIC-NUTM1重排肉瘤1例
编辑人员丨6天前
CIC重排肉瘤是一种具有高度侵袭性的小圆细胞肉瘤,除了常见的DUX4外,还可能存在FOXO4、LEUTX、NUTM1和NUTM2A等极少数融合伴侣。肿瘤多发生于深部软组织,极少见于中枢神经系统。2021年8月深圳市人民医院神经外科收治1例颅内原发CIC-NUTM1重排肉瘤成人女性患者,其病变位于右侧脑室,经手术全切除后患者恢复良好。
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编辑人员丨6天前
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青少年YWHAE-NUTM2B融合阳性腹盆腔肉瘤1例
编辑人员丨6天前
患者女,15岁。2021年9月18日因右下腹疼痛来我院急诊就诊。初潮12岁,平素月经欠规则,月经天数/月经周期为5~7 d/15~60+ d,量中等,有痛经史,末次月经时间为2021年7月20日,无性生活史,否认阴道异常出血史,否认肿瘤家族史。体格检查:右下腹压痛明显,可触及一巨大肿块,上界达剑突,质韧,子宫附件触诊不满意。CT检查示腹盆腔内巨大占位,周围肠脂肪间隙模糊,腹膜后多发肿大淋巴结,双侧附件区显示不清。9月22日于妇科行右侧附件切除术+大网膜切除术+腹膜病损切除术+肠系膜病损切除术+盆腔粘连松解术。术中见盆腹腔内充满分叶状肉瘤样组织,无明显包膜;左侧腹膜表面见分叶状肉瘤样赘生物附着,约15 cm×15 cm×6 cm;大网膜表面布满分叶状肉瘤样组织,体积约30 cm×20 cm×20 cm;子宫后位,大小正常,表面光滑,活动好,宫腔内无占位;左侧卵巢、输卵管正常大小,表面光滑;右侧卵巢略增大,水肿,表面见肉瘤样组织附着,剖开右侧卵巢,见卵巢内布满肉瘤样组织,右侧输卵管未见异常;子宫直肠窝及直肠表面见数枚散在肿物,大小约4 cm×3 cm×3 cm到6 cm×5 cm×5 cm不等,形态不规则。术后病理诊断:右侧附件肿瘤性病变,倾向恶性,类型难定;右侧输卵管未见肿瘤累及;盆腔肿物考虑恶性肿瘤,类型难定,伴有腹壁、大网膜、肠表面、盆腔淋巴结转移。免疫组化:AE1/AE3(-),CD10(小灶+),CAM5.2(-),desmin(-),EMA(-),WT1(-),PAX-8(+/-),inhibin-α(小灶-/+),CgA(-),Syn(-),CR(-),CK5/6(-),CD99(+),HMBE-1(-),SALL4(-),SF-1(-),Ki-67指数(60%+)(图1)。请复旦大学附属肿瘤医院病理科会诊,诊断为盆腔YWHAE-NUTM2B融合阳性肉瘤,二代基因测序显示YWHAE(NM_006761.4:exon5)-NUTM2B(NM_001278495:exon2),基因检测提示YWHAE-NUTM2B(E1-5:E2-7)基因重排。
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编辑人员丨6天前
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儿童肾脏透明细胞肉瘤临床病理学及分子遗传学特征
编辑人员丨6天前
目的:探讨儿童肾脏透明细胞肉瘤(CCSK)的临床病理学特征、诊断及预后。方法:收集首都医科大学附属北京儿童医院及河南省儿童医院2016年1月至2022年6月诊断的46例CCSK,观察其临床特征、组织学形态、免疫组织化学、分子遗传学特征及预后。结果:46例患者男性30例,女性16例,发病年龄3个月至11岁(中位年龄3岁),均为单侧,肿瘤最大径4.5~19.0 cm(中位数11 cm);Ⅰ期15例,Ⅱ期26例,Ⅲ期4例,Ⅳ期1例;组织学除经典型外,常混有2~5种组织学亚型。术后25例(54.3%)转移和/或复发,5例死亡,复发时间1~107个月不等(中位数16个月),远处转移部位主要是肺、骨、脑。肿瘤最大径与无进展生存率存在相关性,临床分期与总生存率差异具有统计学意义。免疫组织化学标志物BCOR、Cyclin D1具有高灵敏度;分子病理检测显示89.1%(41/46)存在BCOR基因第15号外显子内部串联重复,2.2%(1/46)YWHAE-NUTM2重排,2.2%(1/46)BCOR-CCNB3基因融合,三者互斥,三者联合检测阳性率达93.5%(43/46)。结论:CCSK好发于婴幼儿,肿瘤体积和分期与预后相关,组织病理联合免疫组织化学和分子检测可显著提高诊断准确性。
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编辑人员丨6天前
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基于临床实践的6种子宫罕见间叶性肿瘤临床病理学特征分析
编辑人员丨3周前
目的 探讨子宫罕见间叶性肿瘤的临床病理学特征.方法 收集2020年1月至2024年5月佛山市中医院确诊的子宫疑难罕见间叶性肿瘤病例资料,根据佛山市中医院病理科疑难罕见病变的拟定标准,共收集到6种子宫罕见间叶性肿瘤,并结合相关文献进行总结和分析.结果 该文对6种病变[包括平滑肌瘤合并脂肪母细胞瘤,多形性腺瘤基因1(PLAG1)重排纤维黏液样肉瘤,胚胎型神经外胚层肿瘤/中枢型原始神经外胚层肿瘤,非特指DICER1突变相关肉瘤,复合性子宫高级别肉瘤伴胚胎性横纹肌肉瘤、纤维肉瘤及神经外胚层样分化,MXI1-NUTM1融合肉瘤等]进行临床、形态学、免疫组化及分子检测结果特征描述.结论 子宫间叶性肿瘤相对少见,但多种子宫外间叶性肿瘤仍可发生于子宫,而且临床病理亚专科分级诊断存在一些不足,导致存在误诊漏诊的潜在风险,精准诊断有赖于临床、形态学、免疫组化及分子检测的综合评估.
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编辑人员丨3周前
