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尿酸转运蛋白及其相互作用蛋白在尿酸代谢中的作用研究进展
编辑人员丨5天前
尿酸的重吸收和排泄依赖尿酸转运蛋白的作用,人体内尿酸转运蛋白数目众多,如葡萄糖转运蛋白9(GLUT9)、有机阴离子转运体1(OAT1)、尿酸盐转运蛋白1(URAT1)等,但单一尿酸转运蛋白的错义翻译很少直接导致高尿酸血症的发生,尿酸转运蛋白的相互作用蛋白,如跨膜整合蛋白2B(ITM2B)、乙醛脱氢酶16家族A1(ALDH16A1)、PDZ结构域蛋白1(PDZK1)等在高尿酸血症的发生、发展过程中同样有着举足轻重的地位。因此不仅仅研究单一尿酸转运蛋白的错义翻译,同时关注尿酸转运蛋白及其相互作用蛋白在尿酸代谢中的作用,有利于更加深入了解高尿酸血症的发病机制。
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编辑人员丨5天前
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Pax2基因异常参与孤独症谱系障碍发病的生物信息学分析
编辑人员丨5天前
目的:对配对盒2( Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析,探讨 Pax2基因参与ASD发病的可能机制。 方法:(1)将Pathway Commons数据库中与 Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个 Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对 Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法,筛选前10个核心 Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组),采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。 结果:(1)GO分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集,在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集,在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心 Pax2基因相关ASD易感基因为 Gria1、 Dlg2、 Ntrk2、 Grid2、 Igf1、 Jmjd1c、 Ldb1、 Tcf4、 Tcf7l2、 Adrb2。(2)Western blotting实验显示,对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:Pax2基因异常可能导致 Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常,并通过多种机制参与ASD的发病。
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编辑人员丨5天前
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B细胞淋巴瘤因子-3对乳腺癌雌激素受体α信号通路及细胞增殖的影响
编辑人员丨2024/8/10
目的 探讨B细胞淋巴瘤因子-3(Bcl-3)对乳腺癌雌激素受体α(ERα)信号通路以及细胞增殖的影响.方法 取对数生长期MCF-7细胞,随机分为siControl组和siBcl-3#1组,分别滴加ControlsiRNA和siBcl-3#1siRNA,应用细胞转染试剂LipofectamineTM 2000转染5 h.取稳定转染48 h后的siControl组和siBcl-3#1组MCF-7细胞,应用实时荧光定量聚合酶链反应检测MCF-7细胞中Bcl-3、乳腺癌雌激素调控基因1(GREB1)、PDZ结构域蛋白1(PDZK1)和ERα靶基因三叶因子1(TFF1)mRNA的表达,Western blot法检测MCF-7细胞中Bcl-3、ERα蛋白表达,细胞计数试剂盒-8实验检测MCF-7细胞增殖能力.取HEK293T细胞,随机分为Input组(即阳性对照组)、IP组(即免疫共沉淀组)和IgG组(即阴性对照组),共转染Bcl-3和ERα质粒48 h后,用100 μL免疫共沉淀(Co-IP)细胞裂解液冰上裂解细胞后,分离上清液;Input组取90 μL上清液,加入30 μL 4 × Loading buffer;IP组取450 μL上清液,加入40 μL Protein A/G和绿色荧光蛋白抗体0.5 μL;IgG组取450 μL上清液,加入0.5 μL IgG、30 μL Protein A/G琼脂糖磁珠;采用Co-IP实验检测细胞中Bcl-3和ERα结合效果.取对数生长期的MCF-7细胞,采用免疫荧光共定位实验检测Bcl-3和ERα是否存在共定位现象.结果 si-Bcl-3#1组MCF-7细胞中Bcl-3、GREB1、TFF1和PDZK1 mRNA相对表达量显著低于siControl组(P<0.05).si-Bcl-3#1组MCF-7细胞中Bcl-3蛋白和ERα蛋白相对表达量显著低于siControl组(P<0.05).培养0、24 h时,si-Bcl-3#1组与siControl组MCF-7细胞增殖能力比较差异无统计学意义(P>0.05);培养48、72 h时,si-Bcl-3#1组MCF-7细胞增殖能力显著低于siControl组(P<0.05).Co-IP实验结果显示,Bcl-3和ERα存在相互作用.免疫荧光共定位实验结果显示,Bcl-3和ERα存在共定位现象.结论 Bcl-3在乳腺癌细胞中呈高表达,其能够提高乳腺癌ERα信号通路的转导活性,促进ERα阳性乳腺癌细胞增殖.
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编辑人员丨2024/8/10
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Hippo信号通路效应分子在风湿免疫系统疾病中的作用研究进展
编辑人员丨2024/7/27
Hippo信号通路的核心组分包括上游调控分子、核心激酶级联复合体和下游转录调控复合体,其通过调控核心成分的效应分子影响细胞生物学行为,在免疫调节中发挥重要作用.这些效应分子主要有Yes相关蛋白(YAP)、转录共激活因子PDZ结合基序(TAZ)、转录增强结构域转录因子(TEAD)、单极纺锤体-结合蛋白1(MOB1)、大肿瘤抑制激酶(LATS)等,具有促进类风湿关节炎成纤维细胞样滑膜细胞迁移和侵袭、调控骨关节炎疾病进程、促进病理性新骨形成推动强直性脊柱炎进展、维持颌下腺发育延缓干燥综合征疾病进程、介导α-平滑肌肌动蛋白影响系统性硬化病、介导相关靶基因调控肺纤维化等作用.本文综述了Hippo通路相关效应分子在风湿免疫系统疾病发生和进展中的调控机制,以期为探讨风湿免疫系统疾病临床治疗新靶标提供参考.
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编辑人员丨2024/7/27
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三聚体配体门控离子通道胞内区域的功能研究进展
编辑人员丨2024/5/25
配体门控离子通道是一大类重要的膜蛋白.嘌呤能配体门控离子通道(P2X)受体和酸敏感离子通道(ASIC)是三聚体配体门控离子通道的代表成员.P2X受体胞内区域的结构差异可影响脱敏过程,胞内区域的侧窗可作为离子渗透到细胞内的潜在路径并对离子选择性有决定作用,胞内区域众多氨基酸残基的磷酸化参与调节离子通道的活性.此外,胞内区域与N-甲基-D-天冬氨酸受体、γ-氨基丁酸受体、5-羟色胺受体和N型乙酰胆碱受体等其他配体门控离子通道存在相互作用并介导突触可塑性等病理生理过程.ASIC胞内区域的构象变化会暴露胞内信号分子的结合位点并促进代谢信号转导,胞内区域的氨基酸Val16、Ser17、Ile18、Gln19和Ala20可以调节通道上膜表达并参与门控过程,胞内区域的PDZ结构域可与多种细胞内蛋白质如骨架蛋白CIPP和p11相互作用从而参与对受体的调控,胞内区域羧基端和氨基端的众多磷酸化位点参与了对受体的调控.此外,胞内区域参与了疼痛、缺血性脑卒中、精神疾病、神经退行性疾病等多种病理生理过程.本文综述了P2X受体和ASIC胞内区域的结构以及在调节离子通道的门控特性和病理生理功能中的作用,以期为三聚体配体门控离子通道的药物研发提供新思路.
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编辑人员丨2024/5/25
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基于数据库挖掘分析PDZK1与乳腺癌氟维司群耐药的相关性
编辑人员丨2024/3/16
目的 探讨在乳腺癌氟维司群耐药中发挥关键作用的基因.方法 通过 GEO 公共数据库筛选两组氟维司群耐药细胞数据集,获取与氟维司群耐药相关的基因,分析蛋白互作网络(PPI)蛋白互作网络,筛选关键耐药基因,结合TCGA数据库分析关键基因临床预后相关性,通过细胞模型验证其生物学功能.结果 GEO 数据库分析发现 PDZ结构域蛋白 1(PDZK1)在氟维司群耐药株呈显著低表达(P<0.05).TCGA数据库显示PKZK1 高表达与肿瘤临床分期呈显著负相关,分析发现PDZK1 表达与乳腺癌患者预后良好显著相关,在乳腺癌细胞模型中过表达PDZK1 基因可以提升氟维司群治疗的敏感度.结论 PDZK1 的表达与氟维司群治疗耐药呈负相关,雌激素受体阳性乳腺癌患者中PDZK1 高表达人群选择氟维司群治疗的临床获益更大.
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编辑人员丨2024/3/16
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PDLIM3在子宫内膜异位组织中的表达及临床意义
编辑人员丨2024/2/3
目的:研究细胞骨架蛋白PDZ和LIM结构域蛋白3(PDLIM3)在子宫内膜异位症(EMT)患者的异位内膜病灶、在位子宫内膜及正常子宫内膜中的表达水平差异及临床意义.方法:通过基因表达综合数据库(GEO)中的多个独立数据集对PDLIM3 mRNA的表达水平进行生物信息学分析;选取四川大学华西第二医院2019 年12 月至2020 年7 月收治的58 例EMT患者和27 例其他妇科良性疾病患者,通过EMT患者获取异位病灶组和在位内膜组样本,通过其他妇科良性疾病患者获取正常内膜对照组样本.采用实时荧光定量核酸扩增法、免疫印迹法和免疫组织化学法检测不同组织样本中的PDLIM3 表达水平,并结合相关临床参数探究其临床意义.结果:相比患者在位内膜和对照组正常内膜组织,PDLIM3 mRNA(F =46.05,P<0.05)及蛋白(F =238.60,P<0.05)在异位子宫内膜病灶中的表达水平显著上调;通过免疫组化实验获得的异位子宫内膜病灶中PDLIM3 平均光密度值与EMT患者的痛经评分(r =0.86,P<0.05)及血CA 125 水平(r =0.41,P<0.05)呈正相关,但与EMT患者的疾病分期、经量多少和CA 199水平无明显相关(P>0.05).结论:PDLIM3 在异位内膜病灶中的表达水平显著上调,且其表达水平与EMT患者的痛经程度和CA 125 水平相关,提示PDLIM3在EMT的发生发展过程中可能发挥重要作用,并可能作为治疗EMT的潜在靶点.
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编辑人员丨2024/2/3
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斑马鱼MIB1启动子及互作基因的功能富集分析
编辑人员丨2024/1/20
目的 分析斑马鱼E3泛素蛋白连接酶1(MIB1)基因启动子区转录因子结合位点(TFBS),MIB1互作基因和互作蛋白的种类及其在信号通路中的作用,探讨MIB1基因的调控方式及潜在功能.方法 利用国家基因组科学数据中心(NGDC)预测非编码RNA(ncRNA),利用Alggen与AnimalTFDB在线网站预测MIB1基因TFBS种类,使用GeneMANIA与STRING分析MIB1的互作基因与互作蛋白;通过DAVID网站获取相关数据,进行基因本体(GO)可视化分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析.结果 MIB1基因启动子区及5'非翻译区可转录出ncRNA;通过预测得到121种TFBS,并发现P53转录因子既可以结合到MIB1基因的启动子区又可与MIB1蛋白相互作用;在线预测出6种MIB1的共表达基因,筛选出20种互作基因;通过GO可视化分析发现,MIB1及其互作基因在生物过程方面具有调控细胞、组织、器官生长分化及调节NOTCH信号通路等功能,且主要在细胞质核周区、细胞膜和突触后密集区等部位被富集,具有结合NOTCH蛋白、PDZ结构域蛋白等分子功能;KEGG代谢通路分析发现,MIB1及其互作基因涉及4条代谢途径.结论 MIB1包含多种TFBS,并通过与特定转录因子的相互作用,影响细胞癌变、免疫调节等多种生物学过程.MIB1还可能通过其互作基因和互作蛋白的介导,在细胞生长调控、造血干细胞分化、胚胎发育及神经元信息的传递等方面发挥重要作用.
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编辑人员丨2024/1/20
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PSD-95的生物学功能与应用研究进展
编辑人员丨2023/8/6
突触后致密物(postsynaptic density,PSD)是位于中枢神经系统突触后膜的特殊结构,是突触后信号转导和整合的关键物质[ 1].根据分子质量不同,可将其分为:突触后致密蛋白 -95 (postsynaptic density -95 ,PSD -95 )、突触后致密蛋白-93 (PSD-93 )、突触相关蛋白-97 (synapse-associated proteins -97 ,SAP -97 )和突触相关蛋白-102 (SAP-102).
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编辑人员丨2023/8/6
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细胞骨架蛋白PDLIM1在肿瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
人PDZ和LIM域蛋白1(PDZ and LIM domain protein 1,PDLIM1)是PDZ-LIM蛋白家族的成员之一,参与多种生物学过程,包括细胞骨架组织和肿瘤发生.PDLIM1通过PDZ结构域结合相关蛋白质(如辅肌动蛋白α-actinin)以及通过LIM结构域与相关激酶(如clik1)结合,并定位到肌动蛋白应力纤维,进而参与细胞骨架调控.细胞骨架具有维持细胞形态的功能,在细胞运动中起着关键作用.肿瘤细胞的浸润与转移常表现为细胞运动能力的改变,这个改变过程往往涉及到细胞骨架在时空上的动态重组,而重组的时空调控由关键的细胞信号通路介导.因此,进一步研究PDLIM1在肿瘤浸润与转移过程中的信号调控机制,可能发现潜在的治疗靶点和预后因子,有助于在精准医疗时代进行更好的个性化肿瘤防治.
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编辑人员丨2023/8/6
