-
早发性卵巢功能不全的lncRNA-miRNA-mRNA网络的构建和生物信息学分析
编辑人员丨3天前
目的:探讨lncRNA相关内源竞争RN A(ceRNA)网络在早发性卵巢功能不全中的作用机制.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中筛选出两个早发性卵巢功能不全患者的数据集,使用R语言"limma"包筛选出差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA.使用Starbase数据库预测与差异lncRNA相互作用的miRNAs,使用TargetScan和miRDB数据库预测与差异miRNAs相互作用的mRNAs,预测的mRNAs与差异mRNAs取交集.根据RNA之间的相互作用关系,建立早发性卵巢功能不全的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络.使用Metascape在线工具对ceRNA调控网络中的mRNA进行GO和KEGG功能分析,通过String数据库建立蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytohubba插件识别PPI网络中的hub基因并构建lncRNA-miRNA-hub基因网络.结果:从早发性卵巢功能不全患者与正常对照组中筛选了 116个差异lncRNAs,22个差异miRNAs和282个差异mRNAs.通过116个差异lncRNAs,利用数据库预测到了 13个差异lncRNAs,7个差异miRNAs和54个差异mR-NAs的相互作用,构建了早发性卵巢功能不全的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络.GO和KEGG富集分析结果显示,调控网络中的mRNA参与早发性卵巢功能不全的生物学过程,包括凋亡信号通路、mRNA的代谢过程和cAMP信号通路.通过PPI 网络筛选了 8 个 hub 基因(EIF4ENIF1、SENP1、RBM5、DYNLL2、AGO2、SRSF1、CAPZB、SRSF10),构建了一个 lncRNA-miR-NA-hub基因网络.结论:12个lncRNA通过参与SRSF1等hub基因的表达,调控影响早发性卵巢功能不全的发生、发展.
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
SENP2-mediated SERCA2a deSUMOylation increases calcium overload in cardiomyocytes to aggravate myocardial ischemia/reperfusion injury
编辑人员丨3天前
Background::Sarcoplasmic reticulum calcium ATPase 2a (SERCA2a) is a key protein that maintains myocardial Ca 2+ homeostasis. The present study aimed to investigate the mechanism underlying the SERCA2a-SUMOylation (small ubiquitin-like modifier) process after ischemia/reperfusion injury (I/RI) in vitro and in vivo. Methods::Calcium transient and systolic/diastolic function of cardiomyocytes isolated from Serca2a knockout (KO) and wildtype mice with I/RI were compared. SUMO-relevant protein expression and localization were detected by quantitative real-time PCR (RT-qPCR), Western blotting, and immunofluorescence in vitro and in vivo. Serca2a-SUMOylation, infarct size, and cardiac function of Senp1 or Senp2 overexpressed/suppressed adenovirus infected cardiomyocytes, were detected by immunoprecipitation, triphenyltetrazolium chloride (TTC)-Evans blue staining, and echocardiography respectively. Results::The results showed that the changes of Fura-2 fluorescence intensity and contraction amplitude of cardiomyocytes decreased in the I/RI groups and were further reduced in the Serca2a KO + I/RI groups. Senp1 and Senp2 messenger ribose nucleic acid (mRNA) and protein expression levels in vivo and in cardiomyocytes were highest at 6 h and declined at 12 h after I/RI. However, the highest levels in HL-1 cells were recorded at 12 h. Senp2 expression increased in the cytoplasm, unlike that of Senp1. Inhibition of Senp2 protein reversed the I/RI-induced Serca2a-SUMOylation decline, reduced the infarction area, and improved cardiac function, while inhibition of Senp1 protein could not restore the above indicators. Conclusion::I/RI activated Senp1 and Senp2 protein expression, which promoted Serca2a-deSUMOylation, while inhibition of Senp2 expression reversed Serca2a-SUMOylation and improved cardiac function.
Myocardial ischemia Reperfusion injury Sarcoplasmic reticulum calcium-transporting ATPases Sentrin/SUMO-specific protease...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
SUMO特异性蛋白酶1诱导蛋白质去小泛素相关修饰增加子宫内膜癌侧群细胞化疗敏感性
编辑人员丨3天前
目的:探讨通过诱导蛋白质广泛去类泛素化修饰途径抑制子宫内膜癌的干性维持潜能,达到子宫内膜癌侧群细胞化疗增敏的目的。方法:流式细胞术分选培养CD133 +CD44 +的KLE子宫内膜癌侧群细胞克隆球,Western blot法检测小泛素相关修饰蛋白1(SUMO1)及肿瘤侧群细胞干性维持基因八聚体结合转录因子4(Oct4)和性别决定区Y-box2(Sox2)蛋白的表达情况。慢病毒介导KLE侧群细胞稳定转染SUMO特异性蛋白酶1(SENP1)基因,Western blot法检测SENP1、SUMO1、Oct4和Sox2的蛋白表达;比较过表达与未过表达SENP1基因的KLE侧群细胞克隆形成率,流式细胞术检测细胞周期变化,四甲基偶氮唑蓝实验和流式细胞术检测子宫内膜癌侧群细胞对顺铂的化疗敏感性,子宫内膜癌荷瘤鼠模型检测SENP1过表达对顺铂的化疗敏感性影响。 结果:CD133 +CD44 +和CD133 -CD44 -子宫内膜癌KLE细胞克隆形成率分别为(23.64±5.03)%和(4.64±1.25)%,差异有统计学意义( P=0.003),CD133 +CD44 +子宫内膜癌KLE细胞中SUMO1、Oct4和Sox2蛋白表达水平高于CD133 -CD44 -子宫内膜癌KLE细胞(均 P<0.05)。与未转染SENP1基因的KLE侧群细胞比较,SENP1过表达的KLE侧群细胞SUMO1、Oct4、Sox2蛋白表达水平降低,细胞克隆形成率由(25.67±5.44)%下降至(7.46±1.42)%,细胞周期发生由G 0/G 1期向G 2期的偏移,顺铂半数抑制浓度由(55.46±6.14) μg/ml下降至(11.55±3.12) μg/ml,细胞凋亡率由(9.76±2.09)%上升至(16.79±3.44)%,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。过表达SENP1能够降低KLE侧群细胞增殖能力,增加化疗敏感性。 结论:通过过表达SENP1能够诱导蛋白质去SUMO化修饰,抑制子宫内膜癌侧群细胞的干性维持潜能,进而增强其化疗敏感性。
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
血管内皮生长因子A与小泛素相关修饰物特异性蛋白酶5在前列腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨3天前
目的:探讨血管内皮生长因子A(VEGFA)与小泛素相关修饰物特异性蛋白酶5(SENP5)在前列腺癌中的表达情况及临床意义.方法:使用GEPIA数据库,对VEGFA、SENP5基因的相关性及与前列腺癌病人的生存期进行分析;采用qRT-PCR、Western blotting从转录、蛋白质翻译水平检测肿瘤细胞中VEGFA、SENP5的表达情况;收集前列腺癌病人组织标本和临床资料,采用免疫组织化学法检测前列腺癌组织中VEGFA、SENP5的蛋白表达,分析其表达情况与肿瘤病人临床病理参数间的关系;使用STRING网站进行VEGFA、SENP5蛋白质互作网络图构建.结果:VEGFA与前列腺癌病人总生存时间有关(P<0.05),SENP5与病人总生存时间、无病进展生存时间均相关(P<0.05);与正常细胞相比,VEGFA与SENP5在前列腺癌细胞中mRNA、蛋白质均高表达(P<0.05);VEGFA与SENP5蛋白在肿瘤病理组织中可见淡黄色或棕黄色染色,VEGFA主要于细胞质中表达,SENP5主要于细胞核中表达;VEGFA强阳性表达与临床分期、有无远处转移相关(P<0.05),SENP5强阳性表达与Gleason评分、有无远处转移相关(P<0.05);VEGFA与SENP5间显著相关(P<0.01);SENP5可能通过SUMO1-HSP90AA1轴与VEGFA相互作用.结论:VEGFA、SENP5在前列腺癌中高表达,两者显著相关,且与肿瘤临床病理参数有关,可能是前列腺癌病人治疗的潜在靶点.
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
高原红细胞增多症多组学研究进展
编辑人员丨3天前
慢性高原病(chronic mountain sickness,CMS)或Monge综合征是一种在海拔超过2 500 m地区流行的疾病,高原红细胞增多症(high altitude polycythemia,HAPC)是CMS的亚型之一。藏族人群基因组中的高原适应基因以EPAS1和EGNL1最为关键;HIF-PHD-VHL蛋白系统在HAPC发病机制中发挥重要的作用;SENP1基因编码一种蛋白酶,具有调节缺氧相关转录因子如HIF和GATA的功能,调节EPO或EPO受体表达参与红细胞生成。随着基因检测和组学技术的发展,关于HAPC发病机制的研究在转录组学、蛋白组学和代谢组学方面取得了一些新的进展,为骨髓血液生态和造血调控方面的研究奠定基础。CMS的诊断标准存在一定的局限性,尤其是高原红细胞增多症患者的诊断应该完善先天性和真性红细胞增多症推荐的基因检测。本文就HAPC在各组学技术、造血调控及诊断流程方面的最新研究作一综述,更有利于对HAPC发病机制的认识,强调基因检测在红细胞增多的临床诊断的重要性。
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
SENP1/HIF-1α调控牙髓干细胞成血管分化的研究进展
编辑人员丨3天前
牙髓干细胞(DPSC)是从牙髓中分离的、具有高分化潜能的多能干细胞,通过DPSC进行血管再生也许是一个不错的选择。缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)是血管内皮生长因子(VEGF)的上游基因,小泛素修饰物蛋白酶1(SENP1)能够逆转HIF-1α的小泛素样(SUMO)修饰。通过SENP1/HIF-1α的调控,在许多体内外实验中都表现出了良好的血管再生特性。SENP1/HIF-1α信号轴对许多实体肿瘤有着不同程度的促进及抑制作用,目前虽然SENP1/HIF-1α信号轴在牙髓干细胞内作用的相关文献相对较少,但能够确定SENP1/HIF-1α对牙髓干细胞的血管生成方面起到重要作用。本文将阐述SENP1/HIF-1α信号通路,及其促进DPSC成血管分化的作用机制。
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
小泛素样修饰蛋白通路在骨肉瘤中异常激活与靶向治疗的研究
编辑人员丨3天前
目的:运用分子生物学方法观察小泛素样修饰蛋白(small ubiquitin-related modifier,SUMO)通路成员在骨肉瘤中的表达特点,为基于蛋白质SUMO化修饰的靶向治疗提供理论依据。方法:收集2017年1月至2019年6月于我院就诊并手术的新鲜骨肉瘤组织样本18例,经Western blot及免疫组织化学方法检测癌灶及癌旁SUMO通路核心成员SUMO1、SAE1、Ubc9、SENP1的蛋白表达水平。分别干涉SUMO1、干涉UBC9及过表达SENP1,进行如下分组:空白对照组、对照组、siR-SUMO1组、siR-Ubc9组和SENP1组。Western blot验证基因转染效率,细胞增殖检测试剂盒检测EdU的阳性表达率,划痕实验及Transwell侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力,流式细胞术检测细胞凋亡率。以骨髓间充质干细胞(BMSCs)为研究对象,评估三种治疗方案的副作用。结果:Western blot及免疫组织化学结果均显示,骨肉瘤组织中SUMO1、SAE1、Ubc9的蛋白表达水平均明显高于癌旁组织( P<0.05),但SENP1明显低于癌旁组织。基于143B骨肉瘤细胞的实验结果表明,siR-SUMO1组、siR-Ubc9组、SENP1组均能够明显抑制骨肉瘤细胞中SUMO通路的活化,表现为较对照组和无义组更低的肿瘤细胞增殖率( P<0.05),更低的细胞迁移和侵袭能力( P<0.05),以及更高的细胞凋亡率( P<0.05);然而基于BMSCs的实验结果表明,siR-SUMO1组和siR-Ubc9组能够明显抑制BMSCs的增殖,诱导细胞凋亡,表现出极大的治疗副作用,但SENP1组对BMSCs的增殖和凋亡几乎没有影响( P>0.05)。 结论:SUMO通路在骨肉瘤中被异常激活,外源性补充或内源性激活SENP1是靶向治疗的备选方案之一。
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
SAM68和SENP-1在前列腺癌组织中的表达及临床意义
编辑人员丨3天前
目的:探讨SAM68与SENP-1在前列腺癌组织中的表达及其临床意义。方法:收集2014年1月至2018年1月在本院未经相关治疗初次行穿刺活检或手术切除的前列腺组织标本94例,免疫组化法检测50例前列腺癌组织和44例良性前列腺增生组织中SAM68与SENP-1的表达情况,并结合临床病理学资料进行统计分析。结果:免疫组化结果显示:SAM68与SENP-1在前列腺癌组织中的阳性表达率明显高于前列腺增生组织( P<0.001)。SENP-1与SAM68的表达均与分化程度、TNM分期及骨转移相关( P<0.05);相关性分析显示:SENP-1与SAM68表达呈正相关( r=0.463, P<0.001)。 结论:SAM68与SENP-1在前列腺癌组织中高表达,并与前列腺癌的发生和恶性进展有关,且有望成为前列腺癌诊断和治疗的潜在靶点。
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
SENPs调控肿瘤放射敏感性的机制及其抑制剂的研究进展
编辑人员丨3天前
小类泛素修饰因子特异性蛋白酶(SENPs)调控的小类泛素化修饰在放射敏感性的调节过程中具有重要作用,抑制SENPs会导致肿瘤细胞的放射敏感性升高。据报道,SENPs通过参与DNA损伤修复、改变细胞周期分布和调控信号通路等机制调控肿瘤细胞的放射敏感性。目前,以SENP1为主的SENPs抑制剂主要分为短发卡RNA类、肽类和拟肽类、合成小分子类、虚拟筛选类和天然产物来源类。SENPs抑制剂或可作为新型的放射增敏药物,有待进一步开发和优化。笔者总结了SENPs调控肿瘤放射敏感性的机制及其抑制剂的研究进展,旨在为后续开发SENPs抑制剂作为放射增敏药物奠定理论基础。
...不再出现此类内容
编辑人员丨3天前
-
SENP-1/HIF-1α通路对慢性间歇性低氧诱导大鼠血管内皮损伤的影响
编辑人员丨1个月前
目的:探讨小泛素样修饰特异性蛋白酶1(SENP-1)/低氧诱导因子1α(HIF-1α)通路对慢性间歇性低氧(CIH)诱导大鼠血管内皮损伤的影响,阐明其相关作用机制.方法:SD大鼠随机分为对照组和CIH组,再将每组分为2、4和6周3个时间点亚组,每亚组8只.CIH组大鼠暴露于CIH舱中进行CIH诱导,制备阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)模型,对照组大鼠暴露于常氧环境中.于各时间点收集各组大鼠血清和胸主动脉组织.HE染色观察各组大鼠胸主动脉血管损伤情况,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测各组大鼠血清中一氧化氮(NO)、内皮素1(ET-1)、血管性血友病因子(vWF)和血栓调节蛋白(TM)水平,Western blotting法检测各组大鼠胸主动脉组织中SENP-1、HIF-1α和血管内皮生长因子A(VEGFA)蛋白表达水平.体外培养大鼠主动脉内皮细胞(rAECs),经SENP-1 shRNA腺病毒(sh-SENP-1)感染构建SENP-1基因低表达的rAECs细胞株,采用CIH诱导建立血管内皮细胞损伤模型,分为CIH组、CIH+sh-NC组和CIH+sh-SENP-1组,另设对照组.CCK-8检测各组细胞增殖活性,ELISA法检测各组细胞培养上清中乳酸脱氢酶(LDH)活性及细胞中NO、ET-1、丙二醛(MDA)水平和超氧化物歧化酶(SOD)活性,流式细胞术检测各组细胞凋亡率,Western blotting法检测各组细胞中SENP-1、HIF-1α和VEGFA蛋白表达水平.结果:随着CIH诱导时间的延长,与对照组比较,CIH组大鼠胸主动脉内膜逐渐粗糙并明显增厚,血清中NO水平逐渐减低(P<0.05),血清中ET-1、vWF和TM水平及胸主动脉组织中SENP-1、HIF-1α和VEGFA蛋白表达水平逐渐升高(P<0.05).与对照组比较,CIH组细胞增殖活性降低(P<0.05),细胞培养上清中LDH活性及细胞中ET-1、MDA水平和细胞凋亡率升高(P<0.05),细胞中NO水平和SOD活性降低(P<0.05),SENP-1、HIF-1α和VEGFA蛋白表达水平升高(P<0.05);与CIH组比较,CIH+sh-SENP-1组细胞增殖活性升高(P<0.05),细胞培养上清中LDH活性及细胞中ET-1、MDA水平和细胞凋亡率降低(P<0.05),细胞中NO水平和SOD活性升高(P<0.05),SENP-1、HIF-1α和 VEGFA蛋白表达水平降低(P<0.05).结论:SENP-1/HIF-α通路在CIH诱导的大鼠胸主动脉损伤组织中高度活化,沉默SENP-1表达可减轻CIH诱导的血管内皮细胞损伤,其作用机制可能与下调SENP-1/HIF-α通路活化水平有关.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1个月前
