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染色体微阵列分析在婴幼儿先天性心脏病中的应用
编辑人员丨6天前
目的:探讨全基因组、高分辨率染色体微阵列分析(CMA)技术在先天性心脏病(CHD)婴幼儿遗传病因学诊断中的应用价值。方法:回顾性分析2016年1月至2018年12月在广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心儿科住院并接受CMA检查的130例先天性心脏病婴幼儿的临床资料。患儿均按照美国Affymetrix公司CytoScan HD技术平台的标准操作流程行全基因组CMA检测,结果采用ChAS(chromosome ana-lysis suite染色体分析套件)软件及相关的生物信息学方法分析。根据CHD患儿是否合并心外异常分为孤立型CHD组和综合征型CHD组;根据CHD患儿解剖学特点对2组患儿CHD表型进行分类,分为简单型CHD组和复杂型CHD组。结果:在130例行CMA的CHD婴幼儿中,共在53例患儿中检出60个有临床意义的拷贝数变异(CNVs),总体检出率为40.8%(53/130例),其中32例(24.6%)患儿的致病性CNVs<10 7 bp。检出染色体微缺失/重复综合征29例(54.7%),其中最常见的为22q11.2微缺失综合征、Williams-Beuren综合征及Wolf-Hirschhorn综合征。孤立型CHD组致病性CNVs检出率为42.8%(30/70例),综合征型CHD组致病性CNVs检出率为38.3%(23/60例),差异无统计学意义( P=0.60)。简单型CHD致病性CNVs检出率为34.4%(20/58例),复杂型CHD致病性CNVs检出率为45.8%(33/72例),差异无统计学意义( P=0.19)。通过基因型与表型分析,发现 SUZ12、 DGCR6、 YWHAE、 CRKL、 LZTR1、 DLG1、 ADAP2、 TBX6基因是与CHD相关的候选致病基因。 结论:CMA在婴幼儿CHD中具有重要的应用价值,推荐CMA作为CHD婴幼儿临床一线遗传学检测技术,无论哪种类型CHD均应接受CMA检测。
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编辑人员丨6天前
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Zeste基因抑制子12在肿瘤组织中的表达及其对肿瘤细胞增殖、侵袭和转移的影响
编辑人员丨6天前
目的:探讨Zeste基因抑制子12(SUZ12)在宫颈癌组织中的表达及其对宫颈癌细胞增殖、侵袭和转移的影响。方法:选取2019年1月到2022年1月商丘市第一人民医院收治的67例宫颈癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用蛋白质免疫印迹(Western blot)分析肿瘤组织和癌旁组织SUZ12蛋白表达水平。将宫颈癌细胞系CaSki分为对照组和SUZ12 KD组,分别采用对照慢病毒和SUZ12短发卡RNA(shRNA)慢病毒感染细胞,筛选稳定细胞系。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和体外移植瘤实验分析两组细胞增殖能力;采用Transwell分析细胞的侵袭能力;采用划痕实验分析细胞迁移能力;采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析SUZ12调控的靶基因表达水平。组间计量数据比较采用t检验。结果:宫颈癌组织中SUZ12蛋白相对表达水平(2.17±0.14)明显高于癌旁组织(0.77±0.09),差异有统计学意义( t=36.640, P<0.05)。对照组细胞48 h吸光度( A)值(2.07±0.13)明显高于SUZ12 KD组细胞(1.39±0.10),差异有统计学意义( t=10.100, P<0.05)。对照组细胞在体内成瘤的体积[(1 055.70±125.27) mm 3]明显高于SUZ12 KD组细胞[(613.30±76.33) mm 3],差异有统计学意义( t=9.537, P<0.05)。对照组细胞在体内成瘤的重量[(5.57±0.52) g]明显高于SUZ12 KD组细胞[(3.28±0.83) g],差异有统计学意义( t=7.433, P<0.05)。对照组细胞迁移数量[(142.17±9.45)个]明显高于SUZ12 KD组细胞[(76.50±7.74)个],差异有统计学意义( t=13.170, P<0.05)。对照组细细胞划痕愈合率[(87.36±4.95)%]明显高于SUZ12 KD组细胞[(50.68±7.63) mm 3],差异有统计学意义( t=9.884, P<0.05)。对照组细胞ROCK1和ROBO1 mRNA表达水平(0.47±0.07、0.54±0.12)明显高于SUZ12 KD组细胞(1.05±0.07、1.14±0.12),差异有统计学意义( t=14.750、8.667, P<0.05)。 结论:SUZ12通过调节KLF2和ROBO1基因表达,促进宫颈癌细胞增殖、侵袭和转移等恶性细胞生物学行为。
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编辑人员丨6天前
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恶性外周神经鞘膜瘤临床病理学分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨恶性外周神经鞘膜瘤(malignant peripheral nerve sheath tumor,MPNST)的临床病理学特征、免疫表型及分子遗传学特征。方法:收集江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院)2012年1月至2022年12月诊治的23例MPNST,观察其临床及组织病理学、免疫组织化学及分子病理特点,并复习相关文献。结果:患者中男性10例,女性13例,年龄11~79岁(中位年龄36岁),其中Ⅰ型神经纤维瘤病(neurofibromatosis type 1,NF-1)相关MPNST患者14例,散发性MPNST患者9例。发生于四肢7例、躯干4例、颈肩部3例、胸腔3例、脊柱旁2例、腹腔2例、腹膜后1例、盆腔1例。组织学上肿瘤主要由条束状增生、紧密排列的梭形细胞组成,17例(17/23,73.9%)肿瘤边缘可见神经纤维瘤样区域。低倍镜下可见肿瘤细胞丰富区与稀疏区交替镶嵌分布,形成大理石样外观。高倍镜下肿瘤细胞核形不规则,呈卵圆形或锥形、子弹头样或细长波浪样,7例肿瘤细胞明显多形性,可见瘤巨细胞;核分裂象活跃(≥3个/10 HPF),常可见地图样坏死。免疫组织化学:肿瘤细胞阳性表达S-100蛋白(14/23,60.9%)、SOX10(11/23,47.8%);CD34纤维网格缺失(14/17),H3K27me3表达缺失(19/23,82.6%),1例出现SDHA及SDHB表达缺失。5例行二代测序患者中均发生NF1基因胚系或体系功能缺失性变异;4例有SUZ12基因体系突变,其中2例伴有TP53突变;1例伴有SDHA基因胚系突变及FAT1、BRAF、KRAS基因体系突变。随访19例,随访时间1~67个月;4例死亡,且均有NF-1病史。结论:MPNST的形态学谱系广泛,基因改变复杂,需与多种梭形细胞肿瘤鉴别。H3K27me3完全缺失是诊断MPNST的重要免疫标记,CD34纤维网格不完整常提示神经纤维瘤恶性转化,NF1基因功能缺失性变异及PRC2基因复合物功能失活是较常见的分子诊断辅助依据,可能还伴有其他基因改变。
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编辑人员丨6天前
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多梳基因家族蛋白在常见皮肤T细胞淋巴瘤及淋巴组织增殖性疾病中的表达
编辑人员丨6天前
目的:探讨表观遗传抑制因子PcG家族成员果蝇zeste基因增强子的人类同源物1/2(EZH1/EZH2)、胚胎外胚层发育蛋白(EED)及胚胎干细胞抑制蛋白(SUZ12)在常见皮肤T细胞淋巴瘤及淋巴组织增殖性疾病(CTCL/LPD)中的表达。方法:收集2012—2019年于中国医学科学院皮肤病医院确诊的93例CTCL/LPD及8例扁平苔藓皮损石蜡标本,行免疫组化染色,观察EZH2、EED、SUZ12及EZH1蛋白表达。采用SPSS 25.0软件进行卡方检验及Spearman相关分析。结果:93例中包括44例蕈样肉芽肿(MF)、17例NK/T细胞淋巴瘤(NK/TCL)及原发性皮肤间变大细胞淋巴瘤(PC-ALCL)、淋巴瘤样丘疹病(LyP)、种痘水疱病样淋巴组织增殖性疾病(HV-like LPD)及皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤(SPTCL)各8例。93例CTCL/LPD中83例(89.2%)EZH2、81例(87.1%)EED、78例(83.9%)SUZ12、37例(39.8%)EZH1阳性;8例扁平苔藓中1例EZH2、8例EZH1阳性,EED、SUZ12全阴性。CTCL/LPD与扁平苔藓4种蛋白的表达分级差异均有统计学意义( χ2分别为41.75、39.74、39.36及32.83,均 P < 0.001),且MF、NK/TCL、PC-ALCL、LyP、HV-like LPD及SPTCL与扁平苔藓的表达差异亦均有统计学意义(α = 0.008 3,均 P < 0.001)。同时,EZH2与EZH1的表达评分在MF、NK/TCL、PC-ALCL、LyP、HV-like LPD及SPTCL中均呈负相关( rs分别为-0.60、-0.68、-0.89、-0.74、-0.93、-0.80,均 P < 0.05)。 结论:PcG家族成员EZH2、EED、SUZ12及EZH1在CTCL/LPD中表达异常。
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编辑人员丨6天前
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达雷妥尤单抗治疗异基因造血干细胞移植后复发急性T淋巴细胞白血病1例
编辑人员丨6天前
患者,女,32岁,2020年12月因头晕、乏力就诊于当地医院。B超检查示:双侧颈部、腋窝、腹股沟多发淋巴结肿大。血常规:WBC 21.6×10 9/L,HGB 76 g/L,PLT 107×10 9/L。骨髓穿刺发现原始幼稚细胞54%,流式细胞术分析示T淋系表达(CD34、CD7、CD13、CD33、TDT、cCD3、CD5、CD99阳性,CD19、cCD79a弱阳性)伴髓系、B淋系表达(CD5 83%,CD99 97%,CD1a 0.3%,cCD79dim 60.3%,MPO 0.3%,cCD3 92.6%,TDT 47.6%),染色体核型为46,XX,6q-,t(10;12)(p15;q23),12p+[3]/46,XX[4],多重PCR检查阴性,二代测序检测到NOTCH1突变21.7%、CREBBP突变20.9%、IKZF1突变16.3%、KRAS突变18%、RAD21突变18.4%、SUZ12突变16.6%。诊断为急性T淋巴细胞白血病。患者初始用CIVP(环磷酰胺+伊达比星+长春地辛+地塞米松)方案诱导化疗,获得骨髓完全缓解(CR),微小残留病(MRD)4.4%,染色体核型正常,NOTCH1、CREBBP、IKZF1基因突变均阴性。随后继续予培门冬酶+hyperCVAD(B)方案巩固治疗,骨髓持续CR,MRD<1.5×10 -4,继续予hyperCVAD(A)方案巩固化疗1次。患者于2021年4月26日接受allo-HSCT(供者胞妹,HLA全相合),预处理方案为改良Bu/Cy方案(司莫斯汀+阿糖胞苷+白消安+环磷酰胺),单个核细胞回输量10.84×10 8/kg,CD34 +细胞回输量6.61×10 6/kg。患者于移植后10 d粒细胞植入,13 d血小板植入。患者移植后未出现明显急/慢移植物抗宿主病(GVHD)。规律复查骨髓均为CR,MRD阴性,细胞短串联重复序列(STR)在98.0%以上。2022年9月21日患者复查骨髓原始细胞占3.5%,MRD 3.8%,STR 93.7%,考虑疾病复发。随后(2022年9月27日)给予供者淋巴细胞输注(DLI)联合干扰素α治疗,治疗后2周骨髓原幼细胞占16.5%,MRD 15.1%,诊断为移植后白血病复发,原幼细胞较前上升,提示DLI疗效不佳。鉴于患者此次复查骨髓提示肿瘤细胞CD38阳性(阳性表达率高达96.3%),于2022年10月予2次达雷妥尤单抗(16 mg/kg,共800 mg)单药治疗(间隔1周),用药过程顺利,未发生不良反应。期间监测患者胆红素指标进行性升高,同时躯干部及四肢出现散在斑丘疹,考虑肝脏、皮肤GVHD,经甲泼尼龙、他克莫司联合芦可替尼抗GVHD后患者皮疹逐步消褪,但胆红素水平仍持续升高,再予巴利昔单抗(共3次)加强抗GVHD、血浆置换(共1次)治疗后胆红素水平明显下降,肝脏GVHD控制。于2022年11月2日复查骨髓形态示原幼细胞占1.0%,MRD<1.0×10 -4;STR 98.8%,提示本病缓解。1个月后复查患者骨髓细胞形态持续完全缓解,MRD阴性,STR 98.7%,CD38表达3.11%。随访13个月,持续处于CR状态。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-214-5p靶向SUZ12对宫颈肿瘤细胞增殖和侵袭能力的影响
编辑人员丨6天前
目的:探讨微小RNA(miR)-214-5p靶向SUZ12对宫颈癌细胞增殖和侵袭能力的影响。方法:选取2020年6月到2022年6月商丘市第一人民医院收治的宫颈癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析miR-214-5p表达水平。人宫颈癌细胞株CaSki随机分为对照组和miR-214-5p组。分别采用对照慢病毒和miR-214-5p慢病毒感染建立稳定细胞株。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和BrdU实验分析两组细胞的增殖活性;采用划痕实验分析细胞的迁移能力;采用Transwell分析两组细胞的侵袭能力。通过数据库和双荧光素酶报告基因分析miR-214-5p的靶基因。采用蛋白质免疫印迹(Western blot)分析靶蛋白的表达水平。组间计量数据比较采用 t检验。 结果:癌旁组织中miR-214-5p表达水平(1.37±0.13)明显高于宫颈癌组织(0.56±0.14),差异有统计学意义( t=32.110, P<0.05)。对照组细胞miR-214-5p表达水平(1.16±0.08)明显低于miR-214-5p组细胞(2.79±0.18),差异有统计学意义( t=19.300, P<0.05)。对照组细胞吸光度( A)值(2.79±0.18)明显高于miR-214-5p组细胞(1.16±0.08),差异有统计学意义( t=19.300, P<0.05)。对照组细胞BrdU阳性率[(55.83±4.00)%]明显高于miR-214-5p组细胞[(28.29±3.90)%],差异有统计学意义( t=12.080, P<0.05)。对照组细胞划痕愈合率[(80.98±5.36)%]明显高于miR-214-5p组细胞[(47.81±3.11)%],差异有统计学意义( t=13.120, P<0.05)。对照组细胞侵袭细胞数量[(124.17±12.22)个]明显高于miR-214-5p组细胞[(72.83±10.78)个],差异有统计学意义( t=7.716, P<0.05)。SUZ12是miR-214-5p的靶基因。对照组细胞SUZ12蛋白表达水平(1.10±0.08)明显高于miR-214-5p组细胞(0.46±0.08),差异有统计学意义( t=13.730, P<0.05)。 结论:miR-214-5p在宫颈癌组织中呈低表达,通过靶向调控SUZ12蛋白,调控着宫颈癌细胞的增殖、迁移和侵袭过程。
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编辑人员丨6天前
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基于生物信息学研究Zeste基因抑制子基因12在肺腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2024/7/6
目的 研究Zeste基因抑制子基因(SUZ)12 mRNA和蛋白在肺腺癌(LUAD)患者组织中的表达,并探讨其表达与患者临床病理特征的关系.方法 分别利用癌症基因组图谱(TCGA)和临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库下载正常人和LUAD患者肺组织的SUZ12 mRNA和蛋白表达数据,并分析其在正常人和LUAD患者及不同临床特征LUAD患者的表达差异.结果 与正常人群比较,LUAD患者肺组织SUZ12 mRNA和蛋白表达量显著升高(P<0.05);对患者SUZ12 mR-NA表达量分析显示,吸烟者显著高于不吸烟者和戒烟<15年者,戒烟≥ 15年者显著高于戒烟<15年者,白种人显著高于非裔人,透明细胞腺癌显著高于LUAD(未定型)、混合型腺癌、以实性为主的腺癌和腺泡腺癌,LUAD(未定型)和混合型腺癌显著高于黏液性(胶体)癌和乳头状腺癌,腺泡腺癌显著高于黏液性(胶体)癌(P<0.05,P<0.01);对患者SUZ12蛋白表达量分析显示,临床分级3级患者显著高于2级患者,p53、河马(HIPPO)、myc和无翅型MMTV整合位点家族成员(WNT)通路有改变者显著高于无改变者(P<0.05).结论 LUAD患者肺组织中SUZ12表达升高,且其表达升高与患者临床病理特征和肿瘤相关通路改变有关.
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编辑人员丨2024/7/6
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维奈克拉联合阿扎胞苷挽救性治疗双份脐血移植术后分子学复发的急性髓系白血病2例
编辑人员丨2024/6/1
病例 1:患者男性,56 岁,因后背疼痛 1 个月, 2021 年 1 月就诊于江苏大学附属人民医院.骨髓血中原始粒细胞达 32%,细胞核型正常.二代测序检出ASXL1-G646fs(33.47%)、 CEBPA-R86fs(58.60%)、RUNX1-P86fs( 1.10%) 、 Y380fs( 2.90%) 、 TET2-T970fs(80.20%)和SUZ12-I701fs(95.80%)突变.
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编辑人员丨2024/6/1
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Utilizing bioinformatics for integrated analysis of multiple genes in the diagnosis and pathogenesis of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
编辑人员丨2024/3/23
Objective:The aim of the study was to investigate effective diagnostic molecular markers and the specific mechanisms of metastatic pheochromocytomas and paragangliomas (PPGLs).Methods:Data were collected from GEO datasets GSE67066 and GSE60458. The R software and various packages were utilized for the analysis of differentially expressed genes, Gene Ontology analysis, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analysis, receiver operating characteristic curve assessment, logistic model construction, and correlation analysis. The NetworkAnalyst tool was used to analyze gene-miRNA interactions and signaling networks. In addition, the TIMER database was used to estimate the immune scores. Results:A total of 203 and 499 differentially expressed genes were identified in GSE67066 and GSE60458, respectively. These genes are implicated in cytokine and cytokine receptor interactions, extracellular matrix-receptor interactions, and platelet activation signaling pathways. Notably, MAMLD1, UST, MATN2, LPL, TWIST1, SFRP4, FRMD6, RBM24, PRIMA1, LYPD1, KCND2, CAMK2N1, SPOCK3, and ALPK3 were identified as the key genes. Among them, MATN2 and TWIST1 were found to be coexpressed with epithelial-mesenchymal transition-linked markers, whereas KCND2 and LPL exhibited associations with immune checkpoint expression and immune cell infiltration. Eight miRNAs were identified as potential regulators of key gene expression, and it was noted that TWIST1 might be regulated by SUZ12. Notably, the area under the curve of the 4-gene model for distinguishing between malignant and benign groups was calculated to be 0.918. Conclusions:The combined gene and mRNA expression model enhances the diagnostic accuracy of assessing PPGL metastatic potential. These findings suggest that multiple genes may play a role in the metastasis of PPGLs through the epithelial-mesenchymal transition and may influence the immune microenvironment.
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编辑人员丨2024/3/23
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长链非编码RNA Hotair在CKD小鼠肾脏纤维化中的作用及机制研究
编辑人员丨2023/12/30
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)Hotair在慢性肾脏病(CKD)小鼠模型肾脏纤维化中的作用及其机制.方法 采用随机数字表法将36只小鼠分为对照组、CKD组、CKD+短发夹RNA-对照(sh-Ctrl)组、CKD+短发夹RNA-Hotair(sh-Hotair)组,每组9只.对照组喂食正常饲料,其余3组均予0.2%腺嘌呤饲料喂养造模.造模6周后,CKD+sh-Ctrl组和CKD+sh-Hotair组分别予尾静脉注射100μL(1011基因拷贝)包装了对照shRNA和Hotair-shRNA的腺相关病毒,对照组和CKD组予尾静脉注射100 μL 0.9%氯化钠注射液.观察8周后处死,检测血清肌酐、尿素氮水平,取肾组织行HE染色和Masson染色观察肾脏纤维化情况.采用qRT-PCR法检测肾皮质Hotair、多梳抑制复合体2(PRC2)复合物[Zeste增强子同源物2(EZH2)、Zeste12同源物抑制因子(SUZ12)、胚胎外胚层发育蛋白(EED)]和赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)mRNA表达水平,Western blot法检测肾皮质纤维化相关蛋白胶原蛋白1A1(COL1A1)、胶原蛋白4A1(COL4A1)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)和E-钙黏蛋白(E-cad-herin)的表达水平,并检测PRC2复合物和LSD1的蛋白表达水平.结果 与对照组比较,CKD组小鼠体重下降、肾功能恶化,出现肾脏纤维化,肾皮质Hotair表达升高;与CKD+sh-Ctrl组比较,CKD+sh-Hotair组小鼠血清肌酐、尿素氮水平均降低(均P<0.01),病理检查显示肾脏纤维化程度减轻,肾皮质Hotair表达下降(P<0.01).与对照组比较,CKD组小鼠COL1A1、COL4A1和α-SMA蛋白表达水平均增加,E-cadherin表达水平减少,PRC2复合物中EZH2、EED和LSD1 mRNA和蛋白表达水平均升高(均P<0.01).与CKD+sh-Ctrl组比较,CKD+sh-Hotair组小鼠COL1A1、COL4A1 和α-SMA蛋白表达水平均降低,E-cadherin蛋白表达水平恢复,PRC2复合物中EZH2、EED和LSD1 mRNA和蛋白表达水平均下降(均P<0.01).结论 lncRNA Hotair在CKD小鼠模型中表达升高,敲低Hotair可缓解肾脏纤维化,可能与Hotair作为PRC2和LSD1的分子支架介导的表观遗传修饰相关.
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编辑人员丨2023/12/30
