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基于炎症反应相关基因构建BLCA分子亚型和预后模型
编辑人员丨3天前
目的:通过TCGA数据库中膀胱尿路上皮癌(BLCA)中炎症反应相关基因(IRRGS)的表达数据和临床数据,构建BLCA分子亚型和预后分子标签,探索其在BLCA中的预后作用。方法:检索TCGA数据库中412例BLCA患者的转录组数据及临床预后数据,利用R语言中NMF包对BLCA中的IRRGS表达进行无监督聚类分析,构建基于IRRGS的BLCA分子亚型,探索不同亚型的预后情况和肿瘤微环境情况;采用LASSO-Cox回归进行BLCA预后相关甲基化标志物筛选,并构建预后分子标签,进一步分析其在BLCA中的预后作用。结果:基于BLCA转录组数据和生存数据,发现200种IRRGS中有33种基因与BLCA预后相关(均 P<0.05),基于33种IRRGS构建BLCA分子亚型,将412例BLCA患者分为3个亚组,不同亚型具有不同预后,且不同亚型具有不同肿瘤微环境;基于33种IRRGS采用LASSO-Cox回归分析从中筛选出9种与BLCA预后相关IRRGS(DCBLD2、IL-10、IRAK2、IRF1、LDLR、PVR、RIPK2、SEMA4D、TLR2),并联合9种IRRGS构建预后分子标签,结果显示,该分子标签可以很好地判断BLCA患者预后。 结论:基于IRRGS构建的BLCA分子亚型,不同亚型间预后不同;不同亚型间肿瘤微环境不同。基于9种IRRGS构建的BLCA预后分子标签可以很好地判断BLCA预后,提示IRRGS在BLCA中可发挥重要作用。
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编辑人员丨3天前
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Sema4D与类风湿关节炎病情活动、骨破坏及继发肺间质病变相关性分析
编辑人员丨3天前
目的:检测Semaphorin 4D(Sema4D)在类风湿关节炎(RA)患者血清中的表达水平,探讨Sema4D与RA临床表现、实验室指标、骨破坏及继发肺间质病变(ILD)的相关性,分析其对RA患者病情评价的意义。方法:收集2018年9月至2019年10月北京大学人民医院及北京市海淀医院风湿免疫科RA患者共108例,并根据疾病活动指数(DAS)28评分,将RA患者分为病情活动组(DAS28>2.6)与病情稳定组(DAS28≤2.6)。另纳入健康对照者50名。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中Sema4D的水平,分析其与RA临床表现、实验室指标、骨破坏程度及RA-ILD的相关性。结果:血清Sema4D水平:RA病情活动组显著高于病情稳定组和健康对照组( P<0.05)。RA患者血清Sema4D水平与C-反应蛋白(CRP)( r=0.28, P<0.05)、类风湿因子(RF)( r=0.25, P<0.05)、DAS28( r=0.45, P<0.01)呈正相关。RA患者血清Sema4D水平与β-胶原特殊序列(β-Crosslaps)( r=0.20, P<0.05)及双手X线片Sharp-van der Heijde评分(SHS)( r=0.13, P<0.05)呈正相关。RA患者血清Sema4D水平与血管内皮生长因子(VEGF)( r=0.25, P<0.05)及胸部CT的Warrick评分( r=0.27, P<0.05)呈正相关。RA患者Sema4D阳性组的抗CCP抗体、DAS28、VEGF及RA-ILD发生率显著高于Sema4D阴性组( P<0.05)。 结论:RA患者血清Sema4D水平与病情活动、骨破坏及RA-ILD均具有相关性,血清Sema4D可作为RA患者病情监测及预后评估的指标。
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编辑人员丨3天前
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嗜酸性粒细胞信号蛋白4D在嗜酸性慢性鼻-鼻窦炎小鼠中的病理作用及意义
编辑人员丨3天前
目的:研究嗜酸性粒细胞信号蛋白4D(SEMA4D)在嗜酸性慢性鼻-鼻窦炎(ECRS)小鼠中的病理作用及意义。方法:动物实验:使用曲霉蛋白酶与卵白蛋白创建ECRS小鼠模型,配置抗SEMA4D抗体治疗液。将ECRS小鼠模型分为治疗组与对照组,治疗组小鼠接受腹膜注射抗SEMA4D抗体治疗,对照组注射等量生理盐水溶液。治疗一个月后,收集小鼠鼻腔灌洗液(NLF),检测NLF内嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞及炎性因子水平。细胞实验:分别使用人IgG-Fc及重组SEMA4D(rSEMA4D)处理人鼻上皮细胞(HNEpC)与人脐静脉细胞(HUVEC),采用体外血管渗透性测定试剂盒测定上皮细胞渗透性,使用RhoA G-LISA活化检测试剂盒测定HNEpC中活性RhoA,白细胞经内皮迁移试验检测嗜酸性粒细胞跨内皮迁移率。结果:ECRS小鼠血清可溶性SEMA4D及基质金属蛋白酶-9(MMP-9)水平显著高于正常小鼠( t=9.253,13.053,均 P<0.05)。抗SEMA4D抗体处理的ECRS小鼠NLF中嗜碱性粒细胞及嗜酸性粒细胞水平均显著低于对照组小鼠( t=14.621,18.721,均 P<0.05),且炎性因子IL-4及IL-6水平显著低于对照组小鼠( t=19.261,9.766,均 P<0.05)。渗透性试验表明,经rSEMA4D处理过的HNEpC,通透性均较对照细胞显著上升( P<0.05),嗜酸性粒细胞经内皮迁移率迁移率也显著升高( P<0.05)。rSEMA4D处理后,RohA活性均显著上升( P<0.05)。 结论:SEMA4D可能通过提高人鼻上皮细胞内RohA活性,增强内皮细胞通透性,促进嗜酸性粒细胞浸润鼻息肉,参与ECRS的发生及发展,而动物实验表明,抗SEMA4D抗体在改善ECRS小鼠模型NLF中嗜酸性粒细胞浸润及炎症反应中具有明显的效果。
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编辑人员丨3天前
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基于心电图参数QTd、QRSd与多指标特征构建急性ST段抬高型心肌梗死预后不良的预测模型
编辑人员丨1个月前
目的:探讨基于心电图参数 QT离散度(QTd)、QRS离散度(QRSd)与多指标特征构建急性 ST段抬高型心肌梗死(STEMI)预后不良的预测模型.方法:选取 2019年 1月—2021年 10月我院收治的 213例STEMI病人,采用多因素Logistic回归模型分析构建STEMI预后不良列线图预测模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)、校准曲线评价预测模型的鉴别能力、准确性.结果:出院后 3个月采用电话或门诊随访,3 例失访,预后不良发生率为 20.00%(42/210).Logistic 回归方程显示,QTd、QRSd、校正的 QT 间期(QTc)、血清信号素 4D(Sema4D)、左室射血分数(LVEF)是STEMI病人预后不良的影响因素(P<0.05).将上述 5个变量纳入构建STEMI预后不良列线图预测模型,该模型曲线下面积(AUC)为 0.892[95%CI(0.801,0.934)],校准曲线显示模型具有良好的准确度.结论:基于心电图参数与多指标特征构建 STEMI预后不良预测模型具有可靠性,可为 STEMI预后评估提供客观、有效的工具.
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编辑人员丨1个月前
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SEMA3D与癌症的相关性研究进展
编辑人员丨2024/8/10
SEMA3D是Semaphorins家族的分泌蛋白,由四部分组成,即C端基本结构域、免疫球蛋白(Ig)样结构域、丛状信号素-整合素(PSI)结构域和N端SEMA结构域[1].研究表明,SEMA3D在神经调节、再生和心血管发育中具有重要的生理功能[2-4].但SEMA3D异常表达可导致巨结肠病(hirschsprung's disease,HSCR)和癌症等疾病的发生[5-6].GUNADI等[5]研究发现,HSCR患者有神经节的结肠中SEMA3D表达异常上调与HSCR患者持续肠道症状有关.近年来,SEMA3D在癌症中的作用越来越得到重视,SEMA3D在众多癌症的发生发展中起到重要的抑制、促进或耐药作用.本文综述SEMA3D在癌症发生发展中的作用和机制.
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编辑人员丨2024/8/10
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Sema7a促进内皮细胞与巨核细胞粘附的机制研究
编辑人员丨2024/7/27
目的本研究旨在探讨Sema7a蛋白促进内皮细胞和巨核细胞之间粘附的分子机制.方法 通过使用人脐静脉内皮细胞(human umbilical vascular endothelial cells,HUVECs)和巨核细胞系MEG01在体外模拟肺部血管和巨核细胞的粘附,使用免疫荧光、流式细胞术、4D非标记定量蛋白质组学分析等技术,检测内皮细胞与巨核细胞之间的粘附、HUVECs表面的Sema7a蛋白结合情况,及与Sema7a蛋白结合后的HUVECs蛋白质表达差异及相关生物学信息的变化,预测潜在的信号通路.并利用免疫荧光技术检测HUVECs的细胞间粘附分子1(intercellular cell adhesion molecule-1,ICAM-1)和血管黏附分子 1(vascular cell adhesion molecule-1,VCAM-1)的表达.结果 Sema7a蛋白与 HUVECs结合后,激活了 HUVECs细胞MAPK信号通路,并上调了 HVUECs的黏附分子ICAM-1和VCAM-1的表达,促进了巨核细胞MEG01与HUVECs的粘附.结论Sema7a蛋白通过上调内皮细胞黏附分子ICAM-1和VCMA-1的表达,促进了巨核细胞MEG01与内皮细胞HUVECs间的粘附.
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编辑人员丨2024/7/27
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老年骨质疏松性骨折患者血清PTX3、Sema4d对术后骨折再发的预测价值
编辑人员丨2024/7/6
目的 探讨老年骨质疏松性骨折(OPF)患者血清中正五聚蛋白3(PTX3)和信号素4D(Sema4d)对术后骨折再发的预测价值.方法 选取2022年1月至2023年1月于该院就诊的168例老年OPF患者,根据术后骨折是否再发将患者分成非再发组(116例)和再发组(52例).采用酶联免疫吸附试验检测血清中的PTX3、Sema4d水平,多因素Logistic回归分析骨折再发的影响因素,Pearson相关分析PTX3水平与Sema4d水平的相关性,受试者工作特征(ROC)曲线分析PTX3、Sema4d水平对术后骨折再发的预测价值,Z检验比较曲线下面积(AUC).结果 再发组与非再发组营养供给不足、穿刺部位、骨密度T值、骨折程度及血清中PTX3、Sema4d水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);骨密度T值是术后骨折再发的独立保护因素,骨折程度及血清中PTX3、Sema4d水平是术后骨折再发的独立危险因素(P<0.05);再发组患者血清中PTX3水平与Sema4d呈正相关(r=0.415,P<0.001);PTX3、Sema4d二者联合诊断术后骨折再发的 AUC为0.910(95%CI 0.857~0.949),优于血清 PTX3、Sema4d 单独诊断(Z二者联合-PTX3=3.129、Z二者联合-Sema4d=3.123,均P=0.002).结论 老年OPF术后骨折再发患者血清中PTX3、Sema4d水平升高,PTX3、Sema4d联合诊断老年OPF患者术后骨折再发具有较高价值,可作为早期诊断指标.
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编辑人员丨2024/7/6
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SEMA4D修饰钛表面通过巨噬细胞调控内皮细胞功能的研究
编辑人员丨2024/3/16
目的 探究SEMA4D修饰钛表面对巨噬细胞的直接作用以及通过巨噬细胞对内皮细胞功能的间接调控作用.方法纯钛试件抛光清洗后,通过碱热处理和自组装技术在其表面制备SEMA4D涂层.以光滑钛(Ti)试件为对照组,浓度为 25、50 和100 ng/mL的SEMA4D溶液制备的SEMA4D修饰钛表面(Ti-4D25、Ti-4D50 和Ti-4D100)试件为实验组,采用扫描电镜和接触角测量仪分析各组的表面微形貌和亲水性.在4 组试件表面接种巨噬细胞,将获得的上清液制成条件培养基培养内皮细胞,通过CCK-8法检测两种细胞的增殖活性,通过实时荧光定量PCR检测巨噬细胞的炎性表达和VEGF表达,通过荧光染色和划痕实验检测内皮细胞的黏附和迁移能力.结果 SEMA4D修饰钛表面呈现多孔微结构并且被有机薄膜覆盖,无细胞毒性.该表面可降低巨噬细胞炎性表达,上调VEGF表达,促进内皮细胞的黏附和迁移.结论 SEMA4D修饰钛表面可以减轻炎症反应并增强内皮细胞的运动功能,从而获得有利于软组织修复的生理微环境.
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编辑人员丨2024/3/16
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川崎病内皮细胞高表达IL-1β促进中性粒细胞活化和分泌Sema4D
编辑人员丨2024/3/16
目的 探讨川崎病(KD)冠状动脉内皮细胞(HCAECs)条件培养基对中性粒细胞生物学功能的影响及机制.方法 2022年12月在西安市儿童医院收集KD患儿和健康儿童混合血清,分别刺激HCAECs作为KD组和HC组,RT-PCR检测两组细胞IL-1β表达.HCAECs分为si-IL-1β组和si-NC组,分别转染IL-1β siRNA和无效siRNA,然后加入KD血清刺激,RT-PCR检测HCAECs中IL-1β mRNA表达.收集si-IL-1β组和si-NC组细胞的培养上清液,经离心和滤菌后分别得到两组细胞的条件培养基,ELISA检测两组条件培养基中IL-1β浓度,Transwell实验检测条件培养基对中性粒细胞迁移能力的影响,流式细胞术检测条件培养基对中性粒细胞凋亡和Sema4D表达的影响.中性粒细胞分为TAPI-1预处理+si-NC条件培养基组、DMSO预处理+si-NC条件培养基组、TAPI-1预处理+si-IL-1β条件培养基组和DMSO预处理+si-IL-1β条件培养基组,用si-IL-1β组或si-NC组条件培养基分别刺激已用金属蛋白酶ADAM17的抑制剂TAPI-1或DMSO预处理的中性粒细胞,流式细胞术检测中性粒细胞Sema4D表达.结果 RT-PCR显示,KD组较HC组HCAECs中IL-1β明显高表达(P<0.01);si-IL-1 β组IL-1β mRNA表达较si-NC组明显降低(P<0.01).与si-NC组比较,si-IL-1β组条件培养基IL-1β含量明显降低(P<0.01),条件培养基处理的中性粒细胞迁移能力明显下降(P<0.01),而中性粒细胞凋亡和Sema4D表达均增加(P<0.01).与DMSO预处理+si-NC条件培养基组比较,TAPI-1预处理+si-NC条件培养基组Sema4D+中性粒细胞百分比明显升高(P<0.05),而TAPI-1预处理+si-IL-1 β条件培养基组和DMSO预处理+si-IL-1β条件培养基组中性粒细胞Sema4D无明显差异(P>0.05).结论 川崎病内皮细胞高表达IL-1 β促进中性粒细胞迁移并抑制中性粒细胞凋亡,而且可能通过激活ADAM17促进中性粒细胞分泌Sema4D.
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编辑人员丨2024/3/16
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中老年人结构相似网络与脑基因表达的关联研究
编辑人员丨2023/12/30
目的:从全基因组脑表达的角度揭示人脑结构相似网络(MSN)的生物学基础.方法:基于 194 名正常中老年受试者[男 88 名,女 106 名,平均年龄(57.56±7.76 岁)]的高分辨率三维T1 加权成像(3D-T1WI)和弥散张量成像(DTI)数据,提取7 个影像学特征指标,包括:皮层表面积、皮层厚度、灰质体积、高斯曲度、平均曲度、各向异性分数和平均扩散系数,构建MSN.同时借助艾伦人脑图谱(allen human brain atlas,AHBA)全基因组脑基因表达数据进行基因表达与MSN的空间关联分析.然后,对与MSN显著相关的基因进行富集分析.结果:所有连接密度阈值下 194 名受试者的平均MSN图与无阈值的MSN图均存在显著相关性(Pautocorr<0.05).基因表达-MSN的空间关联分析发现了 770 个与中老年MSN显著相关的基因(bonferroni,Pautocorr<0.05),这些基因主要富集于突触信号转导和中枢神经系统发育等生物学过程,并且与自闭症、精神分裂症和重度抑郁等神经精神疾病的发生有关.其中,194 名受试者的平均MSN与SLC26A4(r=0.619,P=3.311e-17)和SEMA4F(r=0.624,P=1.559e-16)的基因表达量呈正相关,与TRAPPC2B(r=-0.625,P=1.337e-17)和KCNA3(r=-0.617,P=4.349e-17)基因表达量呈负相关.结论:中老年人MSN受突触信号转导和中枢神经系统发育等通路基因的调控,是MSN用于神经精神疾病脑改变研究的生物学基础.
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编辑人员丨2023/12/30