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TNNI3与 TAZ基因变异所致罕见心脏病一个家系的研究
编辑人员丨1周前
目的:鉴定1例罕见心脏病家系(Barth综合征以及肥原性心肌病)的遗传学病因,为该家系提供遗传咨询及生育指导。方法:选取2021年7月9日于南方医科大学附属深圳市妇幼保健院就诊的1个罕见心脏病家系作为研究对象。收集家系成员的临床资料,对患儿及其父母进行家系全外显子组测序(Trio-WES),对家系其他成员进行Sanger测序验证,对变异进行生物学信息分析。参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南判断变异的致病性。结果:Trio-WES检测显示先证者携带 TAZ基因c.542G>A(p.G181A)半合子变异,该变异遗传自其母亲;此外,其母亲还携带 TNNI3基因c.557G>A(p.R186Q)变异。经Sanger测序验证,先证者姨母与外祖母同样携带该变异。参照ACMG相关指南, TAZ基因c.542G>A(p.G181A)评定为可能致病性变异(PS2_Strong+PM2_Supporting+PP3), TNNI3基因c.557G>A(p.R186Q)评定为致病性变异(PP1_Strong+PS4_Strong+PP3+PP4+PM2_Supporting)。 结论:TAZ基因c.542G>A(p.G181A)可能是先证者患Barth综合征的遗传学病因, TNNI3基因c.557G>A(p.R186Q)变异可能为先证者母亲、姨母及外祖母患肥厚型心肌病的遗传学病因。上述发现拓展了 TAZ基因的变异谱,为该家系的临床诊断提供了参考。
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编辑人员丨1周前
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限制型心肌病合并苯丙酮尿症患儿1例的遗传学分析及文献回顾
编辑人员丨1周前
目的:分析1例罕见的儿童限制型心肌病合并苯丙酮尿症(PKU)患儿的临床及基因变异,通过文献回顾总结儿童限制型心肌病的临床特点及遗传学分析。方法:选取2020年6月因"双眼睑及双下肢水肿1年,加重1月余"就诊于郑州大学附属儿童医院的1例限制型心肌病合并PKU患儿作为研究对象,并收集其临床相关资料。采集患儿及父母外周血样,进行全外显子组测序(WES)确定候选位点,Sanger测序进行验证确定变异位点,生物信息学软件分析变异致病性。以"儿童期发病"" TNNI3基因""限制型心肌病"为关键词,在万方数据知识服务平台、中国期刊全文数据库中设定检索年限为建库至2022年8月检索中文文献。并以"childhood"" TNNI3 gene""restrictive cardiomyopathy"为关键词在生物医学文献数据库(PubMed)中设定检索年限为建库至2022年8月搜索外文文献,总结其临床表现和 TNNI3基因变异特点。 结果:患儿为2岁4月龄男性,智力正常,运动、体格发育落后,未见特殊面容,头发和皮肤色泽未见明显异常,双眼睑及下肢浮肿。WES及Sanger测序结果提示患儿 PAH基因存在父源的c.331C>T(p.R111X)和母源的c.940C>A(p.P341T)复合杂合变异。同时患儿 TNNI3基因存在新发杂合变异c.508C>T(p.R170W),父亲和母亲未见该变异。依据美国医学遗传学与基因组学学会变异评级相关指南, TNNI3:c.508C>T(p.R170W)评级为致病性变异(PS2+PS4+PM2_Supporting+PM5), PAH:c.331C>T(p.R111X)评级为致病性变异(PVS1+PM2_Supporting+PM3+PP4),c.940C>A(p.P341T)评级为可能致病性变异(PM2_Supporting +PM3+PM5+PP4)。按检索限定共检索到 TNNI3基因变异所致儿童期发病的限制型心肌病30例,男女比例约1:1.55,表现为心力衰竭、窦性心律、双心房增大、ST-T波改变、心室限制型充盈、心室舒张功能下降等。30例共发现 TNNI3基因16种不同变异位点,其中c.575G>A最常见,均符合常染色体显性遗传方式。 结论:苯丙氨酸羟化酶缺乏症与限制性心肌病均为罕见病,临床表现复杂。基因检测技术发现该患儿存在 PAH:c.331C>T(p.R111X)/c.940C>A(p.P341T)复合杂合变异及 TNNI3:c.508C>T(p.R170W)变异,考虑是共患限制型心肌病及PKU的原因。
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编辑人员丨1周前
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二例限制型心肌病患儿 TNNI3基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:对2例限制型心肌病患儿进行高通量测序,明确其可能的致病原因。方法:提取患儿及其父母外周血基因组DNA,进行目标基因或全外显子测序并进行生物信息学分析,筛查与心肌病相关致病基因变异,并用Sanger测序法进行位点验证。结果:例1存在 TNNI3基因c.549+1G>T杂合变异,父母未检出该变异,为新发变异,且目前未见报道,根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)遗传变异分类标准与指南,判定为致病变异(PVS1+PS2+PM2)。例2和父亲的 TNNI3基因存在c.433C>T(p.Arg145Trp)杂合变异,Clinvar、HGMD数据库检索结果显示其为致病变异,根据ACMG标准与指南判定为可能致病变异(PS3+PM1+PP3)。 结论:TNNI3基因变异可能为2例限制型心肌病患儿的致病原因,基因检测结果为患儿的临床诊断提供了依据。
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编辑人员丨1周前
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编码心肌肌小节的基因突变与肥厚型心肌病相关研究现状
编辑人员丨2024/3/2
参与心肌粗肌丝编码的肌球蛋白重链7(MYH7)和肌球蛋白结合蛋白C3(MYBPC3)基因突变是造成肥厚型心肌病(HCM)的主要原因,少部分由编码细肌丝的慢骨骼和心脏型肌钙蛋白C1(TNNC1)、心脏型肌钙蛋白T2(TNNT2)、心脏型肌钙蛋白I3(TNNI3)、肌动蛋白α心肌1(ACTC1)及原肌球蛋白1(TPM1)等基因突变所致.本文主要介绍近几年来编码心肌肌小节的基因突变导致HCM的详细机制及其研究现状,以期为深入研究HCM发病机制和治疗途径提供参考.
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编辑人员丨2024/3/2
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基于生物信息学分析筛选舌鳞癌的关键基因
编辑人员丨2023/10/28
目的:利用生物信息学方法筛选舌癌的关键基因,探讨其与舌癌进展相关的潜在功能和通路机制.方法:分析微阵列数据集GSE13601,筛选出差异表达基因.利用注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)进行基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析.利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络、癌症基因组图谱数据库(TCGA)测序数据评估舌癌关键基因的表达.结果:共筛选出 101 个差异表达基因及 20 个关键基因,进一步研究发现,MYH2、MYLPF、NEB、ACTN2、DES、TMP2 等关键基因影响舌癌患者的生存率,并且MYH2、MYLPF、ACTN2、DES、TPM2、TNNC1、MYL1、MYH7 和 TNNI2 等基因的表达与舌癌的临床分期相关.结论:MYH2、MYLPF、NEB、ACTN2、DES、TMP2、MYL1、TNNC1、MYH7 和TNNI2 可能参与舌癌的发生、发展,具备成为舌癌潜在生物标志物和治疗靶点的潜力.
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编辑人员丨2023/10/28
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低氧和运动干预对肥胖小鼠心肌组织Ghrelin-GHSR通路及相关蛋白的影响
编辑人员丨2023/9/16
目的:探究低氧和运动干预改善肥胖小鼠心肌损伤程度和对胃饥饿素-生长激素促分泌激素受体(Ghrelin-GHSR)通路及相关蛋白的影响.方法:50只雄性C57BL/6J小鼠随机分为普通对照组(N组,n=8,饲喂普通饲料)和高脂膳食组(H组,n=42,饲喂高脂饲料8周以建立肥胖模型).将建模成功后的肥胖小鼠随机分为肥胖对照组(HN组,n=7)、肥胖常氧运动组(HE组,n=7)、肥胖低氧暴露组(HHN组,n=8)和肥胖低氧运动组(HHE组,n=7).HE和HHE组进行1h/次/天、速度12 m/min的跑台训练;HHN和HHE组进行11.2%O2暴露,8 h/次/天,6次/周.4周后,测试血糖血脂水平;HE染色观察心肌组织形态,免疫组化染色观察Ghrelin蛋白水平和分布;RT-PCR和Western blotting法分别检测心肌组织中Ghrelin、GHSR-1a、Ghrelin O-酰基转移酶(GOAT)、心肌肌钙蛋白I3基因(TNNI3)、神经肽Y1R(NPY1R)、血管内皮生长因子A(VEGFA)mRNA和蛋白的表达.结果:(1)HE和HHN组体重较HN组显著降低(P<0.05);HN组血糖(GLU)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、游离脂肪酸(FFA)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平显著高于N组,高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平显著低于N组(P<0.05);HE和HHN组GLU水平显著低于HN组,HHN组TC水平显著低于HN组(P<0.05);HHE组GLU和TC水平显著低于HE组,LDL-C水平显著低于HN组(P<0.05);HE、HHN和HHE三组FFA水平显著低于HN组,HDL-C水平显著高于HN组(P<0.05).(2)HN组较N组出现心肌细胞肥大和心肌纤维形态改变及强嗜酸性染色,损伤评分显著升高(P<0.05);HHE组心肌形态明显改善,且损伤评分显著低于HN组和HE组(P<0.05);HHN组损伤评分高于HE组(P<0.05);HHE组Ghrelin在心肌组织中表达量显著高于HN组(P<0.05).(3)HN组心肌Ghrelin和GHSR-1a mRNA表达水平较N组显著降低(P<0.05);HE组Ghrelin、GHSR-1a、GOAT和VEGFA mRNA水平显著高于HN组(P<0.05);HE组TNNI3 mRNA表达水平显著低于HN组(P<0.05);HHE组Ghrelin、GHSR-1a和VEGFA mRNA表达水平分别显著高于HHN和HE组,TNNI3和NPY1R mRNA水平分别显著低于HHN组和HE组(P<0.05).(4)HN组心肌Ghrelin和VEGFA蛋白表达量显著低于N组,NPY1R和TNNI3显著高于N组(P<0.05);HE组Ghrelin、GHSR-1a和VEGFA蛋白水平显著高于HN组(P<0.05);HE组和HE组TNNI3表达量显著低于HN组(P<0.05);HE组Ghrelin、GOAT和VEGFA蛋白表达量分别显著高于HHN组和HE组,NPY1R蛋白表达量显著低于HE组(P<0.05).(5)肥胖小鼠心肌Ghrelin和VEGFA蛋白水平分别受运动和运动×低氧影响,GHSR-1蛋白水平受运动影响,GOAT和NPY1R蛋白水平受运动×低氧的影响,TNNI3蛋白水平分别受运动和低氧影响(P<0.05).结论:低氧和运动干预可改善肥胖小鼠的心肌形态及减轻其心肌损伤程度,可能机制之一是低氧和运动干预上调心肌组织Ghrelin-GHSR信号通路相关基因和蛋白的表达.
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编辑人员丨2023/9/16
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伏立诺他对限制型心肌病小鼠心脏舒张功能障碍的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨组蛋白去乙酰化酶抑制剂辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA,商品名伏立诺他)是否能通过提高限制型心肌病小鼠野生型心肌肌钙蛋白I(WT-cTnI)的表达以改善其舒张功能.方法 选取雄性3月龄cTnI R193H限制型心肌病模型小鼠16只并随机分为SAHA组(n=6)、二甲基亚砜(DMSO)组(n=5)和对照组(n=5),分别给予SAHA 50mg/kg、DMSO 1ml/kg、生理盐水1ml/kg皮下注射,持续56d.采用Western blotting检测小鼠心肌细胞核组蛋白H3的乙酰化水平(acH3)及cTnI蛋白表达水平,采用染色质免疫共沉淀法(ChIP)比较cTnI编码基因Tnni3启动子GATA和MEF2关键区域acH3水平,采用荧光定量PCR检测Tnni3的mRNA表达水平,应用小动物高频超声仪评估小鼠心功能.结果 与对照组比较,SAHA组心肌细胞核acH3水平和Tnni3启动子关键区域acH3水平均明显升高(P<0.05);与DMSD组比较,SAHA组心肌细胞核acH3水平无明显改变(P>0.05),Tnni3启动子关键区域的acH3水平明显升高(P<0.05).3组cTnI蛋白和Tnni3mRNA表达水平差异无统计学意义(P>0.05).与对照组比较,DMSO组心脏收缩指标左室缩短分数(LVFS)、左室射血分数(LVEF)、每搏输出量(SV)、心输出量(CO)及舒张指标等容舒张时间(IVRT)、E峰减速时间(DT)、舒张早期充盈血流(E峰)、舒张晚期充盈血流(A峰)无明显改变(p>0.05),Tei指数及E/A比值明显升高(P<0.05);SAHA组IVRT、DT明显延长(p<0.05),Tei指数明显增高(P<0.05),E峰、A峰明显降低(P<0.05),E/A比值明显改变,LVFS、LVEF、SV、CO明显降低(p<0.05).与DMSO组比较,SAHA组IVRT明显升高(P<0.05),E峰、E/A比值明显下降(P<0.05),LVFS、LVEF、CO明显降低(P<0.05).结论 50mg/kg SAHA干预可上调限制型心肌病小鼠心肌细胞Tnni3启动子GATA&MEF2区域acH3水平,但对cTnI蛋白和Tnni3 mRNA表达以及心脏舒张功能可能没有改善作用,甚至会损害其舒张功能和收缩功能.
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编辑人员丨2023/8/6
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肥厚型和扩张型心肌病的分子遗传学研究进展
编辑人员丨2023/8/6
肥厚型心肌病(HCM)和扩张型心肌病(DCM)是原发性心肌病中最常见的两种临床表型,是导致年轻患者进行性心力衰竭和心源性猝死(SCD)的重要原因.一半以上家族性HCM和20% ~35%家族性DCM呈常染色体显性遗传〔1〕.已发现29个基因,至少1 500个突变位点与HCM发病密切相关,其中大部分突变来源于β-肌球蛋白重链(MYH7)、心肌肌球蛋白结合蛋白 C(MYBP)C3、肌球蛋白轻链(MYL)2、MYL3、心肌肌钙蛋白(TNN)T2、TNNI3、α-心肌肌动蛋白(ACTC1)、α-原肌球蛋白(TPM1)和TNNC1基因等9种常见的肌小节致病基因〔2〕,编码Z盘蛋白或钙调蛋白的基因突变则相对少见.与HCM不同,DCM突变区域及种类具有多样性和严重性.除肌小节基因突变外,编码细胞骨架、核膜、离子通道及钙调蛋白等相关的基因突变亦被发现与DCM发病密切相关〔3〕.最近一项研究还揭示了散发性DCM的新型易感基因,如热休克蛋白B族成员(HSPB)7、α激酶(ALPK)3基因等〔4〕.目前已发现 MYH7、MYBPC3、TPM1、TNNT2、ACTC1、肌联蛋白(TTN)、锚蛋白重复域(ANKRD)1、肌钯蛋白(MYPN)等18个基因的突变与HCM及DCM发病有关,但其致病机制不同.同时需警惕,遗传噪音产生的假阴性或假阳性突变〔5〕.本文就HCM和DCM相关致病基因及其发病机制进行综述.
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编辑人员丨2023/8/6
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心脏β-肌球蛋白重链基因Arg870位点不同突变基因型与肥厚型心肌病临床表型分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 通过分析携带心脏β-肌球蛋白重链基因(MYH7)Arg870位点不同错义突变的肥厚型心肌病患者临床表现,探讨该位点突变基因型与临床表型的关系.方法 收集529例非亲缘关系的中国肥厚型心肌病患者以及307例正常对照人群的相关资料,完善临床评估,采用Panel二代测序检测MYH7、MYBPC3、MYL2、MYL3、TNNI3、TNNT2、TPM1和ACTC1基因,将发现的突变进行Sanger测序验证,分析其基因型及临床表型.结果 529例肥厚型心肌病患者中,4例携带MYH7基因Arg870位点错义突变(2例Arg870His突变,1例Arg870Leu突变,1例Arg870Cys突变),上述基因突变在307例正常对照人群中均未检出.4例患者均为男性,室间隔厚度均>20 mm,均合并左心室流出道梗阻及至少1种心律失常(包括心房颤动、室性心动过速、心室颤动以及缓慢性心律失常),其中1例接受室间隔化学消融,3例接受永久起搏器/埋藏式心律转复除颤器植入.结论 MYH7基因Arg870His、Arg870Leu、Arg870Cys突变所致肥厚型心肌病可表现为相似的临床表型,在我国患者中发生左心室流出道梗阻以及恶性心律失常的概率较高,提示Arg870位点发生的错义突变可能趋于恶性.
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编辑人员丨2023/8/6
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国人肥厚型心肌病基因型表型相关性的初步探索
编辑人员丨2023/8/6
目的 初步探索国人肥厚型心肌病(HCM)患者的基因突变谱以及不同基因型表型相关性.方法 对首都医科大学附属北京安贞医院心脏外科中心2013年至2016年收录的51例无血缘关系的HCM患者(男35例,女16例)进行外周静脉血采集并进行人类全外显子基因测序,分析7种主要突变基因:B肌球蛋白重链(MYH7)、肌球蛋白结合蛋白c(MYBPC3)、心肌肌钙蛋白T2(TNNT2)、心肌肌钙蛋白I3(TNNI3)、原肌球蛋白1(TPM1)、重组人心室肌球蛋白轻链2(MYL2)和肌动蛋白C1(ACTC1)的突变情况,并将结果与临床特征比对并评估.结果 共发现24例(47.1%)存在22种致病性或可能致病性的突变.90.9% (20/22)的突变只出现1次,而MYH7基因663位氨基酸和TNNI3基因157位氨基酸的突变均分别出现2次.突变基因MYBPC3、MYH7、TNNT2、TNNI3、MYL2、TPM1和ACTC1分别占总突变例数的45.8% (11/24)、20.8%(5/24)、12.5% (3/24)、8.3% (2/24)、8.3% (2/24)、4.2% (1/24)和0.未发现致病或者可能致病的双突变.基因型阳性(24例)与阴性患者(27例)进行临床特征的比较后发现,晕厥史发生比例(19.6%对7.8%,P<0.05)、最大左心室壁厚度[(22.8±2.6) mm对(20 ±3.4)mm,P<0.05]、HCM家族史(20.8%对0,P<0.05)和心尖肥厚患者数量(25.5%对11.8%,P<0.05)差异均有统计学意义;两种主要突变基因MYBPC3与MYH7患者间临床特征对比后发现,左心室流出道梗阻发生率MYH7更高(80.0%对18.2%,P<0.05).结论 MYBPC3是国人HCM患者中最常见的突变基因.基因型阳性的患者较基因型阴性的患者HCM表型更严重.特定基因的突变与临床表型的具体关系还需要更进一步的研究.
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编辑人员丨2023/8/6