目的:探索Kaufman眼脑面综合征(KOS)的临床特征。方法:回顾中国人民解放军总医院第七医学中心儿科医学部儿内二病区确诊的1例KOS患儿的临床资料及检查结果。在PubMed、中国知网数据库检索KOS的相关文献，描述1例新病例的临床特点和基因型，并系统性回顾既往已报道的34例病例，总结KOS的临床特点。结果:既往已报道的34例KOS患儿的特征为：新生儿期喂养困难(90%)、呼吸困难(84%)，生长发育缓慢(85%)，智力障碍，颅面部畸形，包括：小头畸形(91%)、睑裂狭小/上睑下垂(91%)、短/前倾的鼻子(94%)、特殊的眉型(87%)等。本例患儿主要临床表现为：生长发育迟缓、喂养困难和面容异常，异常面容表现：小头畸形、右眼上睑缺损、睑裂狭小/上睑下垂、睑裂上斜、眼距宽、耳位低、低鼻梁、鼻孔前倾、小嘴、小下颌。1岁9个月时全外显子测序发现泛素蛋白质连接酶E3B基因( UBE3B基因)Exon25纯合突变c.2737C>T(p.R913X)，Sanger测序验证父母均携带此突变，诊断KOS。随访患儿至4岁8个月，精神、运动及体格发育均明显落后。 结论:新生儿期的呼吸困难和喂养困难、生长发育迟缓、智力障碍、颅面部异常是KOS患儿的常见表现，颅面部异常包括：小头畸形、睑裂狭小、短/前倾的鼻子、特殊的眉型等，诊断依靠基因检测。

目的:通过生物信息数据库的挖掘，探究转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移的关键调控基因、生物学特征和通路。方法:使用基因表达综合(GEO)数据库中转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移的样本数据集GSE8401、GSE46517和GSE12237进行差异基因筛选，设定 P<0.05及logFC>2具有统计学意义，找出差异基因(DEGs)。进一步对DEGs进行基因本体论(Gene Ontology)分析和DAVID数据库通路分析，使用String数据库制作DEGs的蛋白质相互作用(PPI)网络并利用Cytoscape可视化，使用分子复合物检测(MCODE)插件用于筛选Cytoscape中PPI网络的显著交互模块，使用cytoHubba插件对网络进一步分析，采用六种算法来选择枢纽基因，最后使用GeneMARIA数据库构建了枢纽基因和具有共同生物学功能的基因的共表达网络。 结果:最终得到158个DEGs( P<0.05，logFC>2)，其中45个基因显著下调，113个显著上调。筛选所得的DEGs主要GO富集为：(1)生物过程(BP)：DEGs主要富集在RNA剪接的调控，通过剪接体调控mRNA的剪接，DNA重组的正调控，双链断裂修复的正调控。(2)细胞成分(CC)：DEGs主要集中在核小体，焦点黏附，细胞-基质结合点，核染色体，原始溶酶体，嗜酸性颗粒体。(3)分子功能(MF)：DEGs主要集中在DNA转录因子结合和RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合上。通过string数据库，获得初步的DEGs的PPI网络(度截止＝2，节点分数截止＝0.2，k核心＝2，最大深度＝100)，得到158个蛋白质节点和196条连线。通过Cytoscape筛选获得显著的交互模块，模块1的MCODE得分为4.8，而其seed基因为UBE2V1。筛选出核心DEGs 5个，分别为UBE2N、UBE2V2、RBX1、UBE2B和RXRA。 结论:泛素化途径和核调控的细胞死亡和代谢在转移性黑色素瘤和乳腺癌脑转移中发挥重要作用。

目的:探讨新生儿Kaufman Oculocerebrofacial综合征患儿的临床表型、治疗及预后特点。方法:对贵阳市妇幼保健院新生儿科收治的1例Kaufman Oculocerebrofacial综合征患儿进行回顾性分析，并以“Kaufman Oculocerebrofacial综合征”、“睑裂狭小-上睑下垂-智障综合征”、“UBE3B基因”、“Kaufman Oculocerebrofacial syndrome”、“Blepharophimosis-ptosis-intellectual disability syndrome”、“UBE3B gene”等为检索词，检索中国知网、维普数据库、万方数据、中华医学期刊全文数据库、PubMed、Web of Science及Embase数据库，检索时间自建库至2022年6月，总结新生儿Kaufman Oculocerebrofacial综合征的临床特点、治疗及预后。结果:本例为男性患儿，临床表现为睑裂小、眼距宽、喂养困难，家系外显子检测结果提示UBE3B基因存在复合杂合变异c.1445_1448dupTCAC和c.1703dupA，国内外文献检索未见报道，为新发变异。共检索到11篇含新生儿病史记录的文献，包含本例共35例患儿，均有发育迟缓、特殊面容、睑裂狭小表现，部分患儿表现为喂养困难（94.3%）、耳部异常（94.3%）、肌张力减退（91.4%）、口部异常（88.6%）、呼吸困难（74.3%）、小下颌（71.4%）、低出生体重（45.7%）。目前Kaufman Oculocerebrofacial综合征尚无有效治疗方式，4例随访至16岁以上，均存在重度语言、智力发育落后等严重神经系统后遗症。结论:Kaufman Oculocerebrofacial综合征患儿新生儿期主要表现为发育迟缓、特殊面容、睑裂狭小、喂养困难、面部畸形、肌张力减退，可通过全外显子测序诊断，目前无有效治疗方式，多遗留严重神经系统后遗症。

目的:探究剪切因子3B亚基1（subunit 1 of splicing factor 3b，SF3B1）、泛素结合酶E2变体2（ubiquitin conjugating enzyme E2 V2，UBE2V2）和组蛋白甲基转移酶（SET domain-containing protein 2，SETD2）的表达与老年骨质疏松性椎体骨折（osteoporotic vertebral fracture，OVF）的相关性。方法:收集2020年8月至2021年8月烟台市烟台山医院31例骨质疏松性椎体骨折（vertebral fracture，VF）（VF组）和16例骨质疏松非椎体骨折（non vertebral fracture，NVF）（NVF组）的老年患者（年龄>60岁）的外周血样本，提取RNA进行转录组测序筛选差异表达基因。通过基因本体论（gene ontology，GO）分析、蛋白相互作用（protein protein interaction，PPI）网络分析、ROC曲线分析筛选VF相关基因。采用qRT-PCR检测基因的表达水平。结果:相对于NVF组，VF中有822个差异表达基因，691个上调，131个下调。qRT-PCR结果显示，相对于NVF患者（1.55±0.33）（1.70±0.33）（1.64±0.33），VF患者外周血中SF3B1（1.83±0.23）（ t=2.84， P=0.008）、UBE2V2（2.24±0.43）（ t=3.91， P<0.001）的表达增强，SETD2（1.18±0.46）（ t=3.25， P=0.003）表达降低。ROC曲线分析显示，SF3B1、UBE2V2和SETD2在VF中的AUC分别为0.803 4（ P=0.007）、0.814 5（ P=0.005）和0.786 3（ P=0.001 4）。 结论:SF3B1、UBE2V2和SETD2与老年OVF高度相关，对OVF的诊断和预测具有重要价值。

目的 探讨肝细胞癌(HCC)发生进展过程中功能富集通路和关键基因表达.方法 从基因表达数据库(GEO)下载HBV感染不同阶段和正常对照肝脏转录组数据,构建基因网络并使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)将基因分类为不同的模块,对相关模块中的基因进行富集分析.应用GEO数据集进一步验证重要基因水平.结果 共6145 个组间差异基因参与构建加权基因共表达网络,被分为9 个模块,进一步描绘了从肝脏早期病变到肿瘤的进化轨迹,从正常组织到癌组织过程中的细胞增殖、DNA损伤修复和细胞衰老相关通路线性激活;随疾病进展,脂质代谢和凝血等肝脏功能相关通路逐渐受到抑制;在肿瘤发生前,慢性炎症期免疫相关通路被激活,后期逐渐趋向于抑制状态;共鉴定出 3个重要衰老相关基因,即CCNA2、UBE2C和ANAPC1,并在外部数据集验证了这3 个基因水平变化;进一步分析显示上述3 个基因水平与肝癌患者不良预后密切相关(P<0.05).结论 通过生物信息学分析,我们初步确定了肝癌发生和进展过程中潜在途径和重要参与基因,为诊断和治疗干预提供了潜在的靶标.

目的 基于基因表达综合(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选肺腺癌(LUAD)预后相关基因.方法 从GEO数据库中筛选出GSE118370、GSE10072、GSE115002 3个数据集,使用R软件筛选LUAD组织和相邻正常肺组织中的差异基因,对差异基因进行基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.应用STRING数据库构建与差异基因相关的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.应用Cytoscape软件鉴定差异基因中的关键基因,采用基因表达谱交互式分析(GEPIA)数据库分析关键基因在LUAD组织和正常肺组织中的表达,比较关键基因高表达与低表达LUAD患者的总生存期和无病生存期,比较不同临床分期LUAD患者关键基因的表达情况.应用UALCAN数据库对LUAD组织和正常肺组织中关键基因的表达情况进行分析.结果 共获得101个上调差异基因和213个下调差异基因.GO富集分析结果显示,上调差异基因主要富集在细胞外基质组织、有丝分裂细胞周期、上皮细胞分化等生物过程中,以及细胞黏附分子结合、蛋白激酶结合等分子功能方面;KEGG通路富集分析结果显示,上调差异基因主要富集在p53信号通路、松弛素信号通路等通路.GO富集分析结果显示,下调差异基因主要富集在血管发育、细胞对细胞因子刺激的反应等生物过程中,以及细胞外基质和膜筏等细胞组成中;KEGG通路富集分析结果显示,下调差异基因主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、神经活性配体-受体相互作用等通路中.最终筛选出8个关键基因,分别是BUB1有丝分裂检查点丝氨酸/苏氨酸激酶B(BUB1B)、ZW10相互作用着丝点蛋白(ZWINT)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、DNA拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)、泛素结合酶E2C(UBE2C)、细胞周期蛋白B2(CCNB2)、NIMA相关激酶2(NEK2)、纺锤体微管的装配因子(ASPM).这8个基因在LUAD组织中的表达水平均高于正常肺组织,且与LUAD患者的总生存期、无病生存期及临床分期有关.结论 BUB1B、ZWINT、CDK1、TOP2A、UBE2C、CCNB2、NEK2、ASPM基因在LUAD组织和正常肺组织中的表达具有差异,并且与LUAD患者的总生存期、无病生存期及临床分期有关.

目的 利用生物信息学分析方法,结合 GEO 数据库,探讨获取结直肠肿瘤关键基因的差异表达情况.方法 使用GEO数据库分析结直肠肿瘤患者的肿瘤组织和正常组织基因表达数据,使用GEO2R筛选差异表达基因(differential expression genes,DEGs),利用David数据库对DEG进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,获得DEG的分子功能、细胞组分和生物过程结果,利用基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and ge-nomes,KEGG)获取差异基因在疾病状态下的信号通路信息,构建差异基因间蛋白质相互作用网络,并使用Cyto-scape软件对网络中的关键节点进行拓扑分析,筛选出结直肠肿瘤患者发生过程中的关键基因.结果 通过对GSE21510 数据集的生物信息学分析,共鉴定到664 个DEGs,其中结直肠肿瘤患者高表达基因234 个,低表达基因430 个.这些DEGs主要参与细胞分裂、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录正和负调控等生物过程,同时参与细胞核、胞质、细胞质、核浆、细胞膜等细胞成分组成,并参与蛋白质绑定、ATP绑定等分子功能的表达和实现等过程,通过蛋白质网络分析确定高表达基因CDK1、CCNB1、TOP2A、AURKA、UBE2C、BUB1、CHEK1、RRM2、MYC、TPX2 和低表达基因SLC26A3、CLCA4、GUCA2A、MS4A12、ZG16、GUCA2B、CLCA1、AQP8、MT1E、MT1G为关键基因.生存分析结果显示,关键基因CCNB1 低表达与CRC患者预后较差显著相关(logrank P<0.01);此外,CCNB1 基因与肿瘤病理分期显著相关(P<0.01).结论 所筛选的关键基因可能成为诊断或治疗结直肠肿瘤的的标志物或潜在靶点,本研究结果为结直肠肿瘤的发病机制、治疗方法等领域的研究提供了理论参考.

目的 调查广东惠州地区异常血红蛋白(Hb)的分子流行病学特征.方法 对2015年7月至2017年6月在该院体检、就诊的22546例调查对象进行血常规和H b电泳筛查,对电泳异常标本进行基因测序.结果 共发现102例异常H b患者,发生率为0.45％,其中J区带15例,K区带15例,Q区带22例,G/D区带31例,E区带19例.基因测序结果显示,α珠蛋白突变体55例,基因频率为1.02×10-3;β-珠蛋白突变体47例,基因频率为1.22×10-3;发现8种α珠蛋白突变体,包括32例Hb CS,7例Hb G-Honolulu,7例Hb Q-Thai-land,3例Hb Queens,2例Hb Ottawa,2例Hb Beijing,Hb Ube-2和Hb Arya各1例;发现6种β-珠蛋白突变体,包括19例Hb E,12例Hb New York,10例Hb G-Taipei,Hb J-Bangkok、Hb J-Kaohsiung和Hb Maputo各2例.结论 惠州地区是异常Hb的高发区,且基因种类较多,符合所在广东地区异常Hb的地域流行特征.

目的:探讨泛素结合酶E2T (ubiquitin conjugating enzyme E2T, UBE2T)在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义,并研究UBE2T基因表达在肝癌细胞迁移和侵袭过程中的作用.方法:采用实时荧光定量PCR法检测54对肝细胞癌及相应癌旁肝组织中 UBE2T mRNA的表达水平.应用免疫组织化学法检测233例肝细胞癌组织中UBE2T蛋白的表达水平,并分析UBE2T表达与患者临床病理参数之间的关系.构建含有UBE2T基因序列的pWPXL重组慢病毒载体(pWPXL-UBE2T)并将其转染肝癌HeP3B和SMMC-7721细胞系,另一方面将靶向 UBE2T基因的 shRNA慢病毒载体(GV248-shUBE2T-1和 GV248-shUBE2T-2)及阴性对照慢病毒载体(GV248-NC)转染肝癌MHCC-LM3和SK-Hep1细胞系,采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法验证UBE2T基因过表达和干扰效率,然后采用Transwell小室法分别检测UBE2T基因过表达和干扰表达对肝癌细胞迁移和侵袭的影响.结果:54对肝细胞癌组织中UBE2T mRNA表达水平明显高于相应癌旁肝组织(P＜0.000 1).在233例肝细胞癌组织中,UBE2T高表达与肝细胞癌的肝内转移有关0.004).与对照组相比,过表达UBE2T基因能够明显促进肝癌细胞Hep3B和SMMC-7721的迁移与侵袭(P值均＜0.01).与阴性对照组相比,干扰UBE2T基因表达能够明显抑制肝癌细胞MHCC-LM3和SK-Hep1的迁移与侵袭(P值均＜0.05).结论:肝细胞癌中UBE2T高表达与肿瘤肝内转移有关,而过表达UBE2T基因可以促进肝癌细胞的迁移和侵袭.

目的:应用生物信息学方法分析阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)不同病情程度的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),在分子水平上探讨AD的发病制,为研究AD提供新思路.方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载基因芯片数据集GSE28146,使用在线分析工具GEO2R分别筛选AD轻度组、中度组和重度组与正常对照组比较的DEGs.运用DAVID数据库对筛选出的DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并采用Cytoscape 软件筛选关键基因.结果:AD轻度组、中度组和重度组分别筛选出881、896和1142个DEGs.GO功能富集显示:轻度组与凋亡相关过程的激活、调节免疫反应、蛋白质磷酸化等生物过程密切相关,中度组与炎症反应、凋亡调节、钙离子的释放等生物过程密切相关,重度组与NF-κB的激活、蛋白质磷酸化和去磷酸化、细胞外基质的降解等生物过程密切相关.KEGG分析显示:轻度组主要富集到p53和TGF-β等信号通路,中度组主要富集到癌症途径、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、细胞黏附分子等信号通路,重度组主要富集到细胞周期、Hippo信号通路、神经活性配体-受体相互作用等信号通路.蛋白互作网路分析各组富集程度最高的前5个关键基因:轻度组为GART、EHMT2、KRAS、ESR1、CD44;中度组为CBLB、HERC1、UBE2G1、UBE2M、HECW2;重度组为UBE2C、SOCS3、FBXW7、UBE3B、UBA6.结论:采用生物信息学方法分析不同病情程度的AD,所富集的信号通路和筛选出的关键基因可能在AD发生发展过程中起重要作用,为进一步深入研究AD提供了依据和思路.