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大鼠尘肺病模型肠道与呼吸道共有差异菌群和代谢产物相关性研究
编辑人员丨5天前
目的:筛选大鼠肠道和呼吸道共有差异菌群和差异代谢物,分析大鼠肠道菌群和代谢物的变化在大鼠尘肺病进展中可能的作用。方法:于2020年4月,将18只SD大鼠随机分为3组(对照组、煤矿粉尘组和二氧化硅组,每组各6只)。煤矿粉尘组和二氧化硅组大鼠采用非气管暴露法分别灌注1 ml 50 mg/ml煤矿井下粉尘悬浊液和二氧化硅悬浊液,对照组大鼠灌注同等剂量灭菌生理盐水。染尘24周后采集大鼠粪便、咽拭子和肺灌洗液。采用16SrDNA基因测序技术和UHPLC-QTOF-MS非靶向代谢组学技术检测各组大鼠粪便、咽拭子和肺灌洗液中菌群和代谢物,筛选肠道和呼吸道共有差异菌群和共有差异代谢物。并采用Spearman法对差异菌群和代谢物进行相关性分析。结果:与对照组比较,煤矿粉尘组门水平下共筛选到9种肠道和呼吸道共有差异菌群,属水平下共筛选到9种肠道和呼吸道共有差异菌属,主要为厚壁菌门、放线菌门、链球菌属、乳杆菌属;与对照组比较,二氧化硅组门水平下共筛选到9种共有差异菌群,属水平下共筛选到5种共有差异菌群,主要为变形菌门、放线菌门、异杆菌属、粘液杆菌属。与对照组比较,煤矿粉尘组共筛出7种共有差异代谢物,标桩菌素、芳樟醇氧化物和异亮氨酸-亮氨酸在肠道和呼吸道中均上调;二氧化硅组与对照组比较,共筛出19种共有差异代谢物,其中二乙醇胺、1-氨基环丙烷羧酸、异亮氨酸-亮氨酸、鞘氨醇、棕榈酸、二氢鞘氨醇、1,2-二油酰基-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱、1-硬脂酰-2-油酸甘油酯磷酸化胆碱在肠道和呼吸道中均上调。结论:尘肺病大鼠肠道和呼吸道菌群存在移位现象,大鼠在尘肺病进展过程中存在脂质代谢失衡。
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编辑人员丨5天前
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老年急性心肌梗死患者儿茶酚代谢特征分析
编辑人员丨5天前
目的:分析老年急性心肌梗死患者的血浆代谢组学特征,探索其潜在的代谢标志物。方法:横断面研究,入选苏州大学附属第二医院急性心肌梗死老年患者30例(心肌梗死组),于体检中心筛选30例符合纳入标准的老年人为对照组,利用UHPLC-QTOF/MS技术检测其血浆中代谢物,在京都基因与基因组(KEGG)数据库中搜索整理所有代谢物的信息。通过主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)对比两组样本代谢物的总体趋势,利用 Mann- Whitney U检验初步筛选差异代谢物。联合 Mann- Whitney U检验、互信息和随机森林模型进一步分析差异代谢物的重要性,运用靶向代谢组学检测重要差异代谢物在两组样本中的含量,对两组数据进行 t检验比较其差异。 结果:心肌梗死组和对照组患者中,高血压、高脂血症及糖尿病患病率比较,差异无统计学意义(均 P>0.05),心肌梗死组患者血浆肌钙蛋白T(2.16±0.36)μg/L含量高于对照组(0.26±0.03)μg/L( t=5.17, P<0.05)。两组样本的总体趋势在PCA得分图和OPLS-DA模型中得到明显区分,样本中有32个差异代谢物符合初步筛选标准。进一步分析得出重要差异代谢物包括儿茶酚和4种氨基酸组成的小肽段,其与分组关系密切,且预测分组准确性的能力强。靶向代谢组学检测结果显示,儿茶酚在心肌梗死组的浓度为(310.3±40.0)ng/L,对照组为(2 607.0±758.1)ng/L,两组比较差异有统计学意义( t=5.34, P<0.01)。 结论:血浆儿茶酚具有成为老年急性心肌梗死患者代谢标志物的潜力,可能与该病的发生及预后密切相关。
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编辑人员丨5天前
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Cornus officinalis with high pressure wine steaming enhanced anti-hepatic fibrosis:Possible through SIRT3-AMPK axis
编辑人员丨1个月前
Cornus officinalis,a medicinal and edible plant known for its liver-nourishing properties,has shown promise in inhibiting the activation of hepatic stellate cells(HSCs),crucial indicators of hepatic fibrosis,especially when processed by high pressure wine steaming(HPWS).Herein,this study aims to investigate the regulatory effects of cornus officinalis,both in its raw and HPWS forms,on inflammation and apoptosis in liver fibrosis and their underlying mechanisms.In vivo liver fibrosis models were established by subcutaneous injection of CCl4,while in vitro HSCs were exposed to transforming growth factor-β(TGF-β).These findings demonstrated that cornus officinalis with HPWS conspicuously ameliorated his-topathological injury,reduced the release of proinflammatory factors,and decreased collagen deposition in CCl4-induced rats compared to its raw form.Utilizing ultra-high-performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometer(UHPLC-QTOF-MS)combined with network analysis,we identified that the pharmacological effects of the changed components of cornus officinalis before and after HPWS,primarily centered on the adenosine phosphate(AMP)-activated protein kinase(AMPK)pathway.Of note,cornus officinalis activated AMPK and sirtuin 3(SIRT3),promoting the apoptosis of activated HSCs through the caspase cascade by regulating caspase3,caspase6 and caspase9.small interfering RNA(siRNA)experiments showed that cornus officinalis could regulate AMPK activity and its mediated-apoptosis through SIRT3.In conclusion,cornus officinalis exhibited the ability to reduce inflammation and apoptosis,with the SIRT3-AMPK signaling pathway identified as a potential mecha-nism underlying the synergistic effect of cornus officinalis with HPWS on anti-liver fibrosis.
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编辑人员丨1个月前
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食管鳞状细胞癌血清中乙酰肉碱的代谢水平及其诊断价值
编辑人员丨2024/6/1
目的 探讨肉碱(L-carn itine)和乙酰肉碱(acetyl-carnitine,ACar 2∶0)对食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)的诊断价值.方法 收集2022年4月至2022年10月在广西医科大学附属肿瘤医院收治的31例ESCC患者以及同期就诊的30名健康志愿者的血清样本.采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(UHPLC-QTOF-MS/MS)技术靶向分析血清中肉碱和乙酰肉碱的代谢变化,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评价诊断效能.结果 与健康对照者相比,ESCC患者血清中的肉碱水平差异无统计学意义(P=0.149),两种乙酰肉碱同分异构体(ACar 2∶0同分异构体1和ACar 2∶0同分异构体2)的水平升高(均P<0.001).多因素分析结果显示,ACar 2∶0同分异构体1含量高于0.0163 μmol/L(OR=19.456,95%CI:1.971~192.104,P=0.011)和 ACar 2∶0 同分异构体2含量高于0.0148 μmol/L(OR=7.720,95%CI:1.047~56.915,P=0.045)是 ESCC 发生的危险因素,而肉碱(OR=1.310,95%CI:0.051~33.951,P=0.871)则与ESCC发生无明显关系.ACar 2∶0同分异构体1诊断ESCC的ROC曲线下面积(area under curve,AUC)及敏感度和特异度分别为0.957、0.900、0.862,ACar 2∶0同分异构体2诊断ESCC的AUC及敏感度和特异度分别为0.901、0.867、0.821,两者联合诊断ESCC的AUC及敏感度和特异度分别为0.952、0.867、0.889.结论 ESCC血清中乙酰肉碱水平升高,且其在诊断ESCC中具有良好的效能,可能是潜在的诊断标志物.
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编辑人员丨2024/6/1
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黄精炮制品多糖多元指纹图谱的建立及化学模式识别
编辑人员丨2024/4/13
目的 构建黄精炮制品多糖的酶水解产物指纹图谱,结合化学计量学方法评价不同蒸晒次数黄精炮制品多糖的差异.方法 采用糖苷酶水解,结合高效薄层色谱(high thin-layer chromatography,HPTLC)、亲水作用色谱-高效液相色谱-蒸发光检测器(hydrophilic interaction liquid chromatography-high performance liquid chromatography-evaporative light scattering detector,HILIC-HPLC-ELSD)和超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(ultra high pressure liquid chromatography-quadrupole time of flight tandem mass spectrometry,UHPLC-QTOF/MS)对相应的酶解产物进行高效分离和检测.由此产生的自下而上的指纹图谱反映了黄精炮制品多糖的变化,通过相似度和偏最小二乘-判别分析(partial least squares-discriminant analysis,PLS-DA)对指纹图谱进行综合评价.结果HPTLC分析发现,果糖随着蒸晒次数的增加逐渐降低,结合色谱分析发现,六蒸六晒和十二蒸十二晒为黄精炮制过程中的转折点.同时根据酶水解中寡糖的变化,利用相似度和PLS-DA对不同蒸晒次数的黄精炮制品进行了清晰的聚类.结合UHPLC-QTOF/MS分析表明,不同蒸晒次数黄精炮制品中含有蔗糖、蔗果三糖、蔗果四糖、蔗果五糖、蔗果六糖、蔗果七糖及蔗果八糖.结论 基于酶解法分析不同蒸晒次数样品的质量动态变化,结合所建立的多元指纹图谱,进一步阐释了不同蒸晒次数黄精炮制品的科学内涵.
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编辑人员丨2024/4/13
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UHPLC-QTOF-MS联合网络药理学-分子对接及动物实验探讨芎麻汤有效部位治疗偏头痛的作用机制
编辑人员丨2023/10/28
目的:运用UHPLC-QTOF-MS、网络药理学-分子对接技术及动物实验探讨芎麻汤有效部位治疗偏头痛的物质基础和作用机制.方法:采用UHPLC-QTOF-MS技术测定芎麻汤有效部位化学成分,并运用PubChem、Swiss Target Prediction数据库预测其靶点;从GeneCards数据库获取偏头痛相关靶点;通过Venny平台筛选交集靶点,Cytoscape构建"药物-活性成分-靶点-疾病"网络;运用String数据库构建蛋白互作网络后,结合Cytoscape筛选核心靶点;使用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析.利用AutoDock vina软件进行分子对接验证.观察偏头痛大鼠血清CGRP、NO含量及三叉神经髓鞘结构.结果:从芎麻汤有效部位中共鉴定107个化学成分,主要包含有机酸类、糖苷类、黄酮类等.得到TNF、AKT1、IL-1β等304个交集靶点,对应阿魏酸、天麻素、洋川芎内酯A等80个活性成分;315个GO注释条目、78条KEGG信号通路(P<0.01).分子对接发现活性成分与核心靶点及CGRP、TRPV1均自发结合.动物实验表明芎麻汤有效部位可明显降低偏头痛大鼠血清CGRP、NO含量;三叉神经可见神经纤维,致密的髓鞘板层,胞质中线粒体呈大小不一的形态.结论:芎麻汤有效部位含有的阿魏酸、天麻素、洋川芎内酯A等药效物质,可通过影响神经信号传递通路、钙信号通路、cAMP信号通路等调节外周血CGRP、NO水平,治疗偏头痛.
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编辑人员丨2023/10/28
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复方苦参注射液生物碱类成分及血中移行成分的分析
编辑人员丨2023/9/16
目的 利用超高效液相色谱—电喷雾离子化—四极杆飞行时间质谱(ultra-high-performance liquid chroma-tography-electrospray ionization-quadrupole time-of-flight mass spectrometry,UHPLC-ESI-QTOF/MS)结合 UNIFI构建靶向筛查策略分析复方苦参注射液(Compound Kushen Injection,CKI)的生物碱类成分及血中移行成分.方法 首先,采用ESI-QTOF/MS的全信息串联质谱技术采集经UHPLC分离的CKI样品及其空白样品、CKI给药后的大鼠血浆样品及空白血浆样品的信息;然后,建立CKI生物碱化学成分数据库,与MSE数据一同导入UNIFI进行靶向筛查;依据母离子、碎片离子的精确质量对筛查出的化合物进行识别;最后,使用MassLynx 4.1工作站对UNIFI输出的结果进行核实.结果 本实验共分离、鉴定了 20种CKI生物碱,其中17种生物碱能在大鼠血浆中被检出.结论 该方法能够快速分析CKI生物碱类成分及其血中移行成分,可为CKI的质量控制及药效物质研究提供参考.
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编辑人员丨2023/9/16
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基于UHPLC-QTOF/MS的博落回花中生物碱类化学成分研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:利用高通量、高灵敏和快速的UHPLC-QTOF/MS技术开展博落回花中的微量生物碱类成分的定性研究,阐明博落回花中生物碱类化学成分的类别和种类,为博落回植物的安全性提供科学依据.方法:采用UHPLC-QTOF/MS技术,借助数据挖掘方法发现和识别出博落回花中的微量生物碱类化学成分,对其高分辨一级和二级质谱数据进行解析,并与数据库进行比对,完成对微量生物碱类化学成分的结构推测和确认.结果:从博落回花中共鉴定了22个生物碱类化合物,主要化学成分为普洛托品类生物碱(原阿片碱、别隐品碱)和四氢原小檗碱类生物碱(N-甲基刺罂粟碱、N-甲基四氢小檗碱).结论:该研究结果为博落回植物的更全面、客观的品质评价和安全性评价提供了充分的科学依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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Tissue-based metabolite profiling and qualitative comparison of two species of Achyranthes roots by use of UHPLC-QTOF MS and laser micro-dissection
编辑人员丨2023/8/6
Achyranthes bidentata and Achyranthes aspera are saponin and steroid rich medicinal plants, used extensively for therapeutic treatments in Traditional Chinese Medicine (TCM) and Ayurveda. A. bidentata is reported to be one of the rare and extensively exploited medicinal plant species that face the issue of being endangered. Finding qualitative substitute with identical phyto-constituents contributing to similar composition and pharmacological benefits wil help in reducing the burden of exploitation of the natural habitats of such plants. In the present study, a comparative metabolite analysis of the whole drug and specific tissues isolated by laser micro-dissection (LMD) was carried out for both the selected species, by use of ultra-high performance liquid chromatography-quadrupole time-of-flight mass spectrometry (UHPLC-QTOF MS). The results of the study indicate that the cortex and the medullary ray tissues are rich in their content of steroidal and saponin con-stituents such as (25S)-inokosterone-20,22-acetonide, ginsenoside Ro, bidentatoside II and achyranthoside B. Metabolite profiling of the whole tissues of both the species indicates presence of identical constituents. Thus, it is inferred that A. bidentata and A. aspera can be used as qualitative substitutes for each other.
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编辑人员丨2023/8/6
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肺炎克雷伯杆菌感染小鼠脓毒症模型的非靶向代谢组学研究
编辑人员丨2023/8/6
脓毒症是医学界面临的突出难题,本研究采用超高效液相色谱与串联四级杆飞行质谱(UHPLC-QTOF-MS)联用技术对肺炎克雷伯杆菌ATCC(R) BAA 2146感染小鼠脓毒症模型进行了非靶向代谢组学研究,分析小鼠感染后血浆内源性代谢物的变化,筛选出与脓毒症感染相关的潜在生物标志物,并分析相关的代谢通路.结果表明,经主成分分析和偏最小二乘法判别分析,结合变量投影重要度与非参数检验共筛选鉴定出58种可能与肺炎克雷伯杆菌ATCC(R) BAA 2146感染小鼠脓毒症相关的代谢物.相关的代谢通路分析发现其中18种代谢物与烟酸和烟酰胺代谢、嘧啶代谢、维生素B6代谢、牛磺酸和亚牛磺酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢以及甘油磷脂代谢等8个代谢通路密切相关.
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编辑人员丨2023/8/6
