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X射线修复交叉互补1 Arg399Gln基因多态性对胃癌术后SOX化疗不良反应及预后的预测价值
编辑人员丨5天前
目的:探讨X射线修复交叉互补1(XRCC1)Arg399Gln基因多态性对进展期胃癌D 2根治术后SOX方案(奥沙利铂130 mg/m 2静脉滴注第1天,替吉奥40 mg/m 2口服2次/d ,第1~14天,每21 d重复)化疗的不良反应及预后的预测价值。 方法:回顾性分析2015年1月至2018年4月在衢州市人民医院胃肠外科收治的62例进展期胃癌D 2根治术后实施SOX方案辅助化疗患者的临床资料。收集术后病理标本行XRCC1 Arg399Gln多态性基因分型检测,分析XRCC1 Arg399Gln多态性与胃癌术后患者的临床病理特征、化疗不良反应发生的关系,并比较不同基因亚型的无病生存期(DFS)及总生存期(OS),Cox回归分析筛选预后危险因素。 结果:62例胃癌患者中XRCC1 Arg399Gln基因亚型分布分别为G/G型35例(56.45%),G/A型21例(33.87%)及A/A型6例(9.68%),XRCC1 Arg399Gln基因亚型分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律( P = 0.295)。后续的分析将G/A型和A/A型合并,G/G型和G/A+A/A型患者的临床资料分布均衡,不同基因亚型与SOX方案辅助化疗的各项不良反应无相关性。XRCC1 Arg399Gln位点G/G基因型与G/A+A/A基因型的中位DFS分别为45个月(95% CI 41.73~48.28)和38个月(95% CI 35.71~40.29),差异有统计学意义( P = 0.047);单因素Cox回归分析显示XRCC1 Arg399Gln多态性( RR = 2.178,95% CI 1.078~4.402, P = 0.030)是进展期胃癌术后行SOX方案化疗患者肿瘤复发的危险因素;多因素Cox回归及校正分析显示,XRCC1 Arg399Gln多态性( RR = 2.581,95% CI 1.242~5.363, P = 0.011)是进展期胃癌术后实施SOX方案化疗患者肿瘤复发的独立危险因素。XRCC1 Arg399Gln位点G/G基因型与G/A+A/A基因型的中位OS分别为60个月(95% CI 57.81~62.19)和55个月(95% CI 49.62~60.38),差异无统计学意义( P = 0.202);单因素Cox回归分析显示XRCC1 Arg399Gln多态性( RR = 1.702,95% CI 0.744~3.896, P = 0.208)不是进展期胃癌术后实施SOX方案化疗患者死亡的危险因素。 结论:XRCC1 Arg399Gln基因多态性与进展期胃癌术后SOX方案化疗的不良反应无相关性,但XRCC1 Arg399Gln G/G型与进展期胃癌术后SOX方案化疗患者预后密切相关,且对DFS有较好的预测价值。
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编辑人员丨5天前
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124例年龄≤60岁上尿路尿路上皮癌患者的胚系基因检测结果分析与解读
编辑人员丨5天前
目的:分析年龄≤60岁上尿路尿路上皮癌(UTUC)患者的胚系致病性突变,探讨胚系致病性突变携带者的临床病理特征。方法:回顾性分析复旦大学附属肿瘤医院2008年9月至2023年2月接受胚系基因检测的124例年龄≤60岁UTUC患者的临床资料。男86例,女38例;年龄55.0(49.8,58.0)岁;原发肿瘤位于肾盂81例(65.3%),位于输尿管34例(27.4%),二者兼有9例(7.3%)。低级别UTUC 13例(10.5%),原位癌8例(6.5%)。12例(9.7%)有膀胱癌病史,12例(9.7%)有其他恶性肿瘤病史。取患者外周血标本,行全基因组外显子测序或靶向测序寻找UTUC相关的胚系突变。按照美国医学遗传学与基因组学/美国分子病理学协会(ACMG/AMP) 2015版指南,对胚系基因检测数据进行解读,分析胚系致病性突变率,并探究胚系致病性突变携带者的临床病理特征。进一步与东亚健康人群的胚系致病性突变率比较,分析与UTUC致病风险相关的胚系突变。结果:本研究124例中,28例(22.6%)共检测到31个胚系致病性突变。有胚系致病性突变患者与无胚系致病性突变患者的年龄[54.0(47.0,58.0)岁与56.0(50.8,58.0)岁]、性别(男/女:21/7岁与65/31岁)、有膀胱癌病史(0与12/96)、T分期(T 3~4期:12/28与41/96)、组织学高级别比例(26/28与85/96)的差异均无统计学意义( P>0.05)。31个胚系致病性突变位于22个基因上,分别为BRCA2(4例,12.9%)、MSH2(3例,9.7%)、RAD54L(2例,6.5%)、BRCA1(2例,6.5%)、BRIP1(2例,6.5%)、NOTCH3(2例,6.5%)、XRCC2(1例,3.2%)、VEGFA(1例,3.2%)、TBX3(1例,3.2%)、RET(1例,3.2%)、PRKN(1例,3.2%)、PALB2(1例,3.2%)、NTRK1(1例,3.2%)、NCOA3(1例,3.2%)、MSH6(1例,3.2%)、LRP1B(1例,3.2%)、KMT2D(1例,3.2%)、KMT2A(1例,3.2%)、FANCA(1例,3.2%)、BARD1(1例,3.2%)、ARID1A(1例,3.2%)和AR(1例,3.2%)基因。对124例患者的胚系致病性突变率与东亚健康人群的胚系致病性突变率进行比较,结果显示BRCA2 ( OR=11.9, 95% CI 3.8 ~37.7, P<0.001)、MSH2( OR=11.9, 95% CI 3.2~44.5, P<0.001)、RAD54L( OR=14.2, 95% CI 2.7~73.8, P=0.002)和BRCA1 ( OR=11.8, 95% CI 2.4~59.1, P=0.003)基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。 结论:本研究年龄≤60岁UTUC患者的胚系致病性突变率为22.6%,携带BRCA2、MSH2、RAD54L或BRCA1基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。
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编辑人员丨5天前
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XRCC1基因多态性对接受奥沙利铂为基础辅助化疗的Ⅲ期结直肠癌患者预后及安全性的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨X射线修复交叉互补1(XRCC1)基因多态性对接受奥沙利铂为基础辅助化疗的Ⅲ期结直肠癌患者预后及安全性的影响。方法:回顾性分析2012年3月至2019年12月郑州大学第一附属医院胃肠外科218例R0切除术后接受奥沙利铂为基础辅助化疗的Ⅲ期结直肠癌患者的临床资料。其中男125例,女93例,年龄18~78岁。留取患者的外周血及外周血单核细胞(PBMC)分别用来进行XRCC1多态性基因分型及XRCC1基因的mRNA表达分析。通过Kaplan-Meier生存分析方法分析基因型和预后的相关性,通过χ2检验分析方法探讨基因型和不良反应的相关性。结果:218例结直肠癌患者的中位随访时间为4.9(0.3~7.3)年,中位无疾病生存期(DFS)为4.4年,中位总生存期(OS)为5.5年。XRCC1基因rs1799782位点的分布频率为:GG基因型占62.4%(136/218),GA型占33.0%(72/218),AA型占4.6%(10/218),最小等位基因频率为0.21,3种基因型分布频率符合哈迪温伯格平衡( P=0.905)。后续的分析将GA和AA型患者合并,GG基因型和GA/AA基因型患者的DFS[ M(95% CI)]分别为5.2(4.5~5.9)年和3.8(3.2~4.4)年,差异有统计学意义(χ2=6.943, P=0.008)。两种基因型患者的OS[ M(95% CI)]分别为6.0(5.3~6.7)年和4.5(3.9~5.1)年,差异有统计学意义(χ2=5.538, P=0.010)。GA/AA基因型患者的PBMC中XRCC1基因mRNA的表达水平为3.8±0.6,高于GG型患者的2.8±0.7,差异有统计学意义( t=6.140, P<0.001)。 结论:XRCC1基因rs1799782位点可能通过介导XRCC1基因mRNA的表达,从而影响接受奥沙利铂为基础辅助化疗的结直肠癌患者的预后。
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编辑人员丨5天前
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X射线修复交叉互补基因1多态性与直肠癌新辅助放化疗疗效的前瞻性队列研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨局部进展期直肠癌X射线修复交叉互补基因1 (XRCC1 rs25487)多态性与新辅助放化疗相关性。方法:使用前瞻性队列研究,纳入于2018年8月至2019年7月在贵州省肿瘤医院腹部肿瘤科就诊的55例局部进展期直肠癌患者,对患者进行新辅助同步放化疗,于同步放化疗前采血并进行DNA测序确定XRCC1 rs25487基因型。采用调整混杂因素的logistic回归分析研究肿瘤新辅助放化疗后T分期、N分期降期情况与患者XRCC1 rs25487基因多态性的关系并分层分析探究各基因型与中性粒细胞淋巴细胞比值(NLR)等临床特征的交互作用。结果:各基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡。调整混杂因素以后,相较于AA基因型患者,GG型患者新辅助放化疗后T降期率减低( OR=0.1, P<0.05)。而GA型患者新辅助放化疗后无论是T降期率还是N降期率,与AA基因型患者差异均无统计学意义( P>0.05)。并且AA/GA基因型与NLR存在交互作用而影响放疗后T降期率。 结论:XRCC1 rs25487基因多态性与局部进展期直肠癌患者新辅助放化疗的疗效相关,且与NLR值有交互作用,可能成为新辅助放化疗疗效的预测因子。
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编辑人员丨5天前
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经典Wnt通路与食管癌细胞放射抵抗相关关系探讨
编辑人员丨5天前
目的:明确经典Wnt通路在食管癌细胞放射抵抗中的作用,探讨经典Wnt通路介导食管癌细胞放射抵抗的机制,为临床上增强食管癌放射敏感性提供重要的分子靶点。方法:应用克隆形成实验检测人食管癌细胞EC9706、ECA109、KYSE70、KYSE150的放射敏感性。通过蛋白质印迹和RT-PCR检测照射后经典Wnt通路的活化情况。通过添加经典Wnt通路激活剂(AZD2858)和抑制剂(XAV-939)综合评价经典Wnt通路对食管癌细胞放射敏感性的影响。通过细胞免疫荧光技术检测照射后细胞DNA双链断裂(DSB)的产生、修复和DNA双链断裂修复蛋白焦点的形成。结果:4种食管癌细胞的放射敏感性由高到低分别为EC9706、ECA109、KYSE70、KYSE150细胞。KYSE150细胞照射后细胞核内β联蛋白增加,c-Myc基因转录上调(均 P<0.05);而EC9706细胞照射后细胞核内β联蛋白、c-Myc基因转录与照射前相近(均 P>0.05)。EC9706细胞经AZD2858处理后放射抗性增加( P<0.05),而KYSE150细胞经XAV-939处理后放射抗性降低( P<0.05)。AZD2858使EC9706细胞DNA双链断裂修复加快( P<0.05),而XAV-939使KYSE150细胞DNA双链断裂修复减慢( P<0.05);XAV-939通过抑制同源重组修复相关蛋白(BRCA1和RAD51),而不是非同源末端连接修复相关蛋白(Ku80和XRCC4)降低DNA双链断裂修复能力。 结论:经典Wnt通路通过调控照射后DNA双链断裂的同源重组修复参与对食管癌细胞放射敏感性的调控,抑制经典Wnt通路可以克服食管癌细胞的放射抵抗,增强放射对食管癌细胞的杀伤作用。
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编辑人员丨5天前
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X线修复交叉互补基因1多态性与进展期胃癌奥沙利铂联合卡培他滨方案化疗疗效的关系
编辑人员丨1个月前
目的:探讨 X 线修复交叉互补基因 1(X-ray repair cross-complementing group 1,XRCC1)rs25487基因多态性与进展期胃癌奥沙利铂联合卡培他滨(XELOX方案)化疗的疗效及疾病进展时间的关系.方法:本研究为回顾性研究,入组110例进展期胃癌患者,均接受XELOX方案化疗,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法的方法检测XRCC1 rs25487基因分型,分析患者临床病理特点及XRCC1 rs25487基因分型与患者化疗客观有效率(objective response rate,ORR)及疾病进展时间(progression-free survival,PFS)的关系.结果:110例进展期胃癌患者中,携带XRCC1 rs25487GG基因型、AG基因型、AA基因型分别为49例(44.5%)、52例(47.3%)、9例(8.2%),GG基因型患者ORR高于AG/AA基因型患者(53.1%vs 37.7%),但差异未达到统计学意义(x2=2.594,P=0.107).GG基因型患者比AG/AA基因型患者PFS更长[6.3个月(95%CI:5.7~6.9)vs 5.0个月(95%CI:4.4~5.6),P=0.049].患者临床病理特征均与化疗疗效无关,但肿瘤分化程度及TNM分期与PFS有关(P均<0.05).Cox回归显示,肿瘤分化程度、TNM分期及XRCC1 rs25487是影响PFS的独立因素.结论:XRCC1 rs25487基因型与进展期胃癌患者XELOX方案化疗疗效密切相关,测定XRCC1 rs25487基因型可以为进展期胃癌的个体化治疗提供参考.
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编辑人员丨1个月前
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甲状腺癌EB病毒感染与XRCC1、STING1、IL-10基因多态性及病理类型的关联
编辑人员丨1个月前
目的 研究甲状腺癌EB病毒感染与X射线交错互补修复基因1(XRCC1)、干扰素基因刺激蛋白1(STING1)、白细胞介素-10(IL-10)基因多态性及病理类型的关联.方法 选取2021年3月-2023年3月青岛大学附属青岛市海慈医院(青岛市中医医院)收治的甲状腺癌患者130例为恶性组,同期收治的138例甲状腺腺瘤患者为良性组,比较两组及不同病理类型甲状腺癌患者EB病毒感染率、XRCC1、STING1、IL-10基因多态性,比较不同EB病毒感染状态甲状腺癌患者XRCC1、STING1、IL-10基因多态性.结果 恶性组EB病毒感染率、XRCC1基因型AA、GA及XRCC1、IL-10等位基因A占比高于良性组,XRCC1基因型GG占比低于良性组(P<0.05);乳头状癌组、滤泡状癌组EB病毒感染率高于髓样癌组、未分化癌组(P<0.05);乳头状癌组、未分化癌组XRCC1等位基因G高于滤泡状癌组、髓样癌组(P<0.05).感染组STING1等位基因C高于非感染组(P<0.05);感染组IL-10基因型CC占比高于非感染组,基因型CA占比低于非感染组(P<0.05).结论 甲状腺癌和甲状腺腺瘤患者EB病毒感染率、XRCC1基因多态性分布具有明显差异,且EB病毒感染可能与甲状腺癌患者病理类型有关,同时IL-10基因多态性可能与甲状腺癌患者EB病毒易感性有关.
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编辑人员丨1个月前
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APEX1和OGG1基因多态性与人结直肠癌的DNA损伤反应的相关性
编辑人员丨1个月前
目的 探究APEX1和OGG1基因多态性与人结直肠癌的DNA损伤反应的相关性.方法 招募2020年3月至2022年12月在保定市第一中心医院胃肠外科和肿瘤科住院治疗的240例结直肠癌患者为研究对象.所有结直肠癌症患者都进行了病理确认.招募同时期在本院体检的300例健康志愿者为对照人员.每位受试者均获得知情同意.从病理档案室和问卷调查中获得病例、志愿者的临床信息.通过Hardy-Weinberg平衡定律预测对照组人群的基因型和等位基因频率.分析所有结直肠癌病例和对照组参与者的基因型分布和优势比.通过在逻辑回归模型中分析多态性与吸烟混杂因素的相互作用.通过计算特定组合的调整后的OR值,对具有一个以上变异等位基因的个体进行结直肠癌风险分析.结果 病例与对照组之间在年龄、性别分布、吸烟状况和癌症家族史等一般资料方面差异无统计学意义(P>0.05).对照组人群中的所有基因型频率与Hardy-Weinberg下预测的一致(P>0.05).XRCC1 399Gln/Gln个体和Arg/Gln基因型患结直肠癌发病风险显著高于Arg/Arg基因型野生型患者.OGG1326Cys和APE1 148Glu的变异等位基因显示出有害作用,OR分别为1.23和1.66.对于APE1-141G/G变异等位基因纯合的个体,获得了略微降低的OR(OR=0.58,95%CI 1.73~2.14,P=0.08),表明该等位基因可能会降低结直肠癌的风险,差异无统计学意义(P>0.05).此外,在病例组和对照组之间OGG1 Ser326Cys和APE1 Asp148Glu的基因型或等位基因分布差异无统计学意义(P>0.05).对于APE1-141T/G多态性,使用纯合子TT基因型作为参考组,观察到对GG基因型的当前吸烟者有明显的保护作用(OR=0.39,95%CI 0.16~0.88;P=0.04),但在非吸烟者中没有发现这种保护作用.XRCC1 399Arg/Gln表现出有害效应,OR=1.66,差异无统计学意义(P>0.05).结论 本研究探讨了 DNA碱基切除修复基因(XRCC1,OGG1和APE1)多态性与结直肠癌风险之间关系,多个基因变异显著增加结直肠癌癌的风险,但APE1-141G/G可能降低当前吸烟者结直肠癌的风险.
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编辑人员丨1个月前
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ERCC1 mRNA和X线修复交叉互补组1基因多态性联合检测在局部晚期鼻咽癌患者放化疗中的应用价值
编辑人员丨2024/2/3
目的 探讨核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCC1)mRNA和X线修复交叉互补组1(XRCC1)基因多态性联合检测在局部晚期鼻咽癌患者放化疗中的应用价值.方法 选取2020年1月至2021年1月在江西省上饶市人民医院接受放化疗的41例局部晚期鼻咽癌患者,采用定量反转录聚合酶链反应检测外周血中ERCC1 mRNA的表达水平,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应检测XRCC1基因型(Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln),探讨ERCC1 mRNA和XRCC1多态性与局部晚期鼻咽癌患者放化疗效果、肿瘤复发及药物不良反应(ADR)的关系,并采用logistic回归分析局部晚期鼻咽癌患者ADR的影响因素.结果 完全缓解和部分缓解患者的ERCC1 mRNA及XRCC1多态性与疾病稳定和疾病进展患者比较差异无统计学意义(P>0.05).肿瘤复发患者的ERCC1 mRNA及XRCC1多态性与非复发患者比较差异无统计学意义(P>0.05).ADR患者XRCC1 Arg194Trp位点携带AG基因型、ERCC1 mRNA高表达的频率均高于非ADR患者,差异有统计学意义(P<0.05).多因素logistic回归分析显示,XRCC1 Arg194Trp AG基因型(OR=1.876)、ERCC1 mRNA高表达(OR=1.109)是局部晚期鼻咽癌患者放化疗期间发生ADR的影响因素(P<0.05).结论 与单一检测相比,ERCC1 mRNA和XRCC1多态性联合检测预测局部晚期鼻咽癌患者放化疗期间ADR的价值更高,值得临床应用.
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编辑人员丨2024/2/3
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肝细胞癌与抑郁症的miRNA-mRNA网络共病机制研究
编辑人员丨2024/1/20
目的 基于miRNA-mRNA网络探讨肝细胞癌和抑郁症的共病机制.方法 (1)在GEO数据库中获取与肝细胞癌和抑郁症相关的miRNA微阵列数据;利用在线工具GEO2R分别分析两个数据集的差异表达miRNA(DE-miRNA),然后取交集.在 TargetScan、miRDB、miRPathDB 和 miRWalk 数据库中预测各个DE-miRNA的靶基因,然后取交集.(2)利用DAVID数据库对DE-miRNA靶基因进行功能富集分析及通路富集分析,并筛选出风险通路.(3)利用STRING 数据库和Cytoscape 3.9.1 软件构建DE-miRNA 靶基因的蛋白-蛋白相互作用网络,然后筛选中枢基因及关键基因.(4)利用Microsoft Excel软件及Cytoscape 3.9.1 软件构建DE-miRNA-mRNA-风险通路可视化网络.(5)利用GEPIA2 数据库进行中枢基因在肝细胞癌中的表达分析及生存分析.结果 (1)肝细胞癌和抑郁症共同表达的上调 DE-miRNA 为 miR-1290、miR-3156-5p,下调DE-miRNA为miR-575、miR-6737-3p,四者对789 个靶基因进行调控.(2)DE-miRNA靶基因参与的生物功能与免疫、炎症、血管生成、神经元信号传导等相关.共筛选出15 条风险通路,包括丝裂原活化蛋白激酶信号通路、磷脂酰基醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路、轴突引导、催产素信号通路、神经营养素信号通路等.(3)共获得10个中枢基因,分别为BRCA1、NOTCH1、PTEN、EGFR、ATRX、ERCC4、RAD51B、EME1、RMI1、XRCC2.将富集在风险通路上的3 个中枢基因作为关键基因.(4)构建的DE-miRNA-mRNA-风险通路网络包含了10 对DE-miRNA-中枢基因组合,以及 13 个DE-miRNA-关键基因-风险通路组合.(5)与正常组相比,BRCA1、PTEN、ATRX、ERCC4、RAD51B、EME1、RMI1、XRCC2 在肝细胞癌组中呈高表达,NOTCH1、EGFR在肝细胞癌组中呈低表达(P<0.01).BRCA1、EME1、RMI1、XRCC2 与肝细胞癌患者的生存率有关(P<0.05).结论 miR-1290、miR-3156-5p、miR-575、miR-6737-3p可能是肝细胞癌和抑郁症共同的调控因子,其通过作用于多个靶基因从而调控炎症反应、肿瘤免疫反应、神经传导等途径,进一步参与肝细胞癌和抑郁症的发生、发展.此外,BACR1、EME1、RMI1、XRCC2 这4个靶基因与肝细胞癌患者的预后密切相关.
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编辑人员丨2024/1/20
