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YWHAG基因突变致早发性癫痫性脑病临床特征与遗传学分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨YWHAG基因新生突变致1例早发性癫痫性脑病患儿的临床特征、基因突变特点、诊断、治疗及预后。方法:收集郑州大学附属儿童医院东区神经内科2018年1月确诊的1 例YWHAG基因新生突变致早发性癫痫性脑病患儿的临床资料,总结其临床特征。对核心家系成员进行全外显子组测序,并对基因突变特点进行分析。结果:先证者为女童,3岁10个月,因“间断性抽搐6个月”就诊于神经内科门诊。临床表现为癫痫发作、智力障碍、精神及运动发育迟滞、共济失调。头颅磁共振成像示髓鞘化发育不良;长程视频脑电图示广泛性1.5~3.0 Hz棘慢波发放,睡眠期多灶尖波发放,监测中患儿有临床发作;同期脑电图有异常放电,提示肌阵挛伴不典型失神。核心家系全外显子组基因测序结果发现,先证者YWHAG基因存在一杂合新生突变:NM_012479:c.169C>T(p.Arg57Cys),根据2015年美国医学遗传学与基因组学学会指南,该变异为可能致病突变。结论:YWHAG基因突变引起的早发性癫痫性脑病非常罕见,YWHAG基因c.169C>T变异是先证者早发性癫痫性脑病遗传学病因的可能致病变异。
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编辑人员丨5天前
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基于Oncomine数据库及生物信息学方法分析肝细胞生长因子在多发性骨髓瘤中的表达及作用机制研究
编辑人员丨5天前
目的:基于Oncomine数据库的基因信息,探讨肝细胞生长因子(HGF)在多发性骨髓瘤(MM)中的表达及作用机制。方法:收集Oncomine数据库中关于HGF研究的信息,对MM中HGF的表达水平变化进行分析。应用Genecards数据库收集与HGF基因相关的蛋白,并通过STRING软件绘制HGF相关蛋白网络图,应用DAVID在线工具分析蛋白功能富集的生理过程。通过DRUGSURV数据库及其在线工具分析HGF表达水平与MM患者生存间的关系,探讨其临床意义。结果:Oncomine数据库中共检索到445项不同肿瘤中关于HGF的研究;其中23项研究显示肿瘤组织与正常组织间HGF表达水平差异有统计学意义( P<0.05),包括肿瘤组织HGF表达增高10项,表达降低13项。Oncomine数据库中关于MM和正常组织HGF基因差异表达3项研究的4个数据集中,HGF在MM组织中的表达水平均高于正常组织(均 P<0.05)。通过Genecards数据库收集到SDC1、YWHAG、RAF1等25个与HGF相关的蛋白;蛋白功能富集分析显示,这些蛋白主要富集在过氧化氢介导的程序性细胞死亡的负调控、突触可塑性调节、死亡域受体对外源性凋亡信号通路的负调控等过程中,与PI3K-AKT及肿瘤相关通路有关。基于DRUGSURV数据库进行的生存分析显示,HGF高表达和低表达的MM患者总生存率差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:HGF基因可能通过PI3K-AKT通路调节MM细胞的凋亡,在MM的发生、发展中发挥作用。HGF可能是一个潜在的MM标志物,但其在预后判断中的价值需要进一步研究论证。
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编辑人员丨5天前
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癫痫伴智力障碍一例
编辑人员丨5天前
患儿 男,4岁主要临床表现为1岁后癫痫发作、发育迟滞和智力障碍。全外显子组测序提示两者在YWHAG基因的第2外显子均存在c.170G>A/p.R57H新的杂合错义变异,导致14-3-3γ蛋白第57位的精氨酸替换为组氨酸。患儿的c.170G>A变异遗传自母亲,而在外祖父母中未检测到,该变异为新自发变异,且在该家系内进行传递。患儿和母亲均为癫痫伴智力障碍,但临床高度怀疑发育性癫痫性脑病56型。
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编辑人员丨5天前
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蚁群优化算法构建乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络
编辑人员丨2023/8/6
目的 筛选ER阳性乳腺癌中受miRNA调控的关键基因,以此构建乳腺癌中miRNA-mRNA互作网络,进而了解ER阳性乳腺癌的调控机制,为筛选ER阳性乳腺癌诊断预后的生物标志物和治疗靶点打下基础.方法 利用MCF-7细胞系的AGO-IP(HITS-CLIP Protocol for Argonaute)高通测序实验数据,发现miRNA对mRNA的真实调控关系,并以此构建基于RNAs诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISCs)miRNA-mRNA调控模组.根据调控模组利用蚁群优化算法在基因互作网络中筛选关键基因,构建ER阳性乳腺癌中miRNA调控下的关键基因互作网络,并对关键基因进行功能分析.结果 本研究筛选出106个关键基因,244个调控关键基因的miRNA.根据乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络识别出了YWHAG、EP300、CHEK1、SMAD2、SMAD1、SYK、FGFR1、PIK3R2、IRS1、TGFBR2、CHUK和CSDE1等12个hub基因;并发现了hsa-miR-940、hsa-miR-545-3p、hsa-miR-3065-5p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-181b-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-765、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30e-5p、hsa-miR-19a-3p、hsa-miR-15b-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-128-3p等16个hub miRNA.这些基因主要对肿瘤细胞的增殖、侵袭、化疗抗性、放疗抗性和耐药性起重要作用.结论 本研究筛选出的关键基因及调控关键基因的miRNA对ER阳性乳腺癌的耐药性、化疗抗性、放疗抗性及肿瘤细胞的增殖、侵袭有重要调控作用,对ER阳性乳腺癌临床治疗及预后起到重要参考作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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中药复方肠复康抗结直肠癌血管生成作用靶基因网络药理学研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 运用网络药理学方法,研究中药复方肠复康(CFK)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)血管生成作用靶基因,为揭示其作用机制奠定理论基础.方法 采用TTD、DrugBank数据库、OMIM数据库、GAD和PharmGKB等5个数据库分别检索CRC基因;采用TSMSP数据库及基于VBA工具的有效成分筛选方式检索CFK所含的5味中药,利用ADME参数进行有效成分筛选,通过TCMSP数据库检索各个有效成分的靶基因,利用cytoscape 3.2.1软件及其插件ClueGO、Bisogenet、CytoNCA对靶基因进行分析并构建CFK成分靶点网络图,并结合KEGG数据库进一步说明CFK与CRC血管生成靶基因的关系.结果 CRC靶基因339个,CFK靶基因182个;通过cytoscape构建并结合网络拓扑分析,ADRA1A、ADRA1B、ADRA1D、ADRB1、CHRM1、CHRM2、CHRM3、CHRM4、INSR、PIK3CG、RXRA、BAX、BCL2、CASP8、ICAM1、NFKBIA、CASP9、KDR、MAP2、PRKCA、PTGS2等靶点与血管生成相关;CFK治疗CRC过程中BRCA1、CDK2、CDKN1A、ITGA4、MDM2、YWHAG、CREBBP、CUL2、EP300、VHL、FL-NA、SHC1、TRAF6、XP01、EGFR、GRB2、IKBKG、NTRK1、TP53、YWHAB、YWHAE与血管生成相关;主要通过调控PI3K-Akt、MAPK、HIF-1及VEGF信号通路抑制CRC患者新生血管生成.结论 CFK可能会通过VBRCA1、CDK2、CDKN1A、ITGA4、MDM2、YWHAG、CREBBP、CUL2、EP300、VHL、FLNA、SHC1、TRAF6、XP01、EGFR、GRB2、IKBKG、NTRK1、TP53、YWHAB、YWHAE等靶点调控H3K-Akt、MAPK、HIF-1及VEGF等信号通路,进而发挥抑制CRC患者新生血管生成作用,具体机制有待进一步研究.
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编辑人员丨2023/8/5
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miR-210/YWHAG分子轴与自体脂肪移植后促进脂肪细胞增殖及血管形成
编辑人员丨2023/8/5
背景:自体脂肪组织因其无免疫排斥反应、取材便利、操作便捷等优点己成为一种优良的填充材料.研究发现,移植后的脂肪细胞在血管网重建之前一直处于缺血缺氧环境中,此类环境极易使脂肪细胞发生凋亡坏死.如何加速脂肪细胞增殖和血管形成过程且抑制其凋亡是目前提高自体脂肪移植存活的重点.目的:探讨miR-210通过YWHAG对自体脂肪移植成活的作用机制.方法:剥离背部自体脂肪移植8周后SD大鼠成活脂肪组织,RT-qPCR检测脂肪组织中多个miRNAs的表达水平;双荧光素酶报告基因验证miR-210和YWHAG的靶向关系;从脂肪组织中分离脂肪细胞,分为miR-210抑制组、YWHAG过表达组、miR-210和YWHAG同时过表达组进行细胞转染,Western blot检测血管内皮生长因子、Endostatin及YWHAG的表达水平,CCK-8、Annexin V-FITC/PI及血管形成实验检测miR-210/YWHAG分子轴对脂肪细胞增殖、凋亡及血管生成的影响.结果 与结论:①miR-210在脂肪组织中高表达(P<0.001);②双荧光素酶报告基因结果表明,YWHAG是miR-210靶向蛋白(P<0.05);③敲降miR-210可显著抑制脂肪细胞增殖和血管生成并诱导其凋亡(P<0.05);④同时过表达miR-210和YWHAG对脂肪细胞增殖、凋亡和血管生成则无显著影响;⑤实验表明,miR-210通过靶向下调YWHAG促进脂肪细胞增殖和血管生成并抑制其凋亡,进而促进自体脂肪移植成活.
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编辑人员丨2023/8/5
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儿童热敏感相关癫痫25例临床特征及分子遗传学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨热敏感相关癫痫的临床特征及分子遗传特点,分析其临床表型及基因型的关系.方法 收集2015年1月至2020年9月南方医科大学第二临床医学院附属佛山市妇幼保健院儿科诊治的行基因检测的热敏感相关癫痫患儿25例临床资料,对所有患儿的基因检测结果、临床及家属资料进行总结分析.结果 热性惊厥首次发作年龄较小,1岁以内起病15例(60%),1~2岁6例(24%);生长发育落后15例(60%);有家族史8例(32%);首次脑电图异常15例(60%);最终诊断Dravet综合征7例(28%),遗传性癫痫伴热性惊厥附加症6例(24%),局灶性癫痫5例(20%),其他类型癫痫9例(36%),主要发作形式包括:全面强直-阵挛肌阵挛发作、肌阵挛发作、失神发作及痉挛发作.全外显子测序结果:检出与癫痫明确相关的致病/疑似致病性单核苷酸变异17例,检出率为68%;其中SCN1A变异8例,ADGRV1变异2例,GABRG2变异2例,PRRT2变异1例,既往未见报道的新基因变异YWHAG:c.373A>G、YWHAG:c.124C>T及重复基因突变KCND3:c.1174G>A共4例.结论 儿童热敏感相关癫痫主要以Dravet综合征及遗传性癫痫伴热性惊厥附加症最常见,SCN1A、GABRG2及ADGRV1是导致其致病的主要原因,YWHAG及KCND3新变异的发现丰富了热敏感相关癫痫的基因谱及表型谱.
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编辑人员丨2023/8/5
