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长链非编码RNA ABHD11-AS1通过调节miR-542-3p/MAP3K11对胃癌细胞侵袭和迁移的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨长链非编码RNA ABHD11-AS1(long non-coding RNA ABHD11-antisense RNA1,LncRNA ABHD11-AS1)通过调节miR-542-3p/MAP3K11对胃癌(gastric cancer,GC)细胞侵袭和迁移的影响。方法:胃癌细胞BGC-823常规培养后依次分为si-NC组、si-LncRNA ABHD11-AS1组、si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-NC inhibitor组、si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-542-3p inhibitor组、si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-542-3p inhibitor+si-con组和ABHD11-AS1+miR-542-3p inhibitor+si-MAP3K11组。预测并验证LncRNA ABHD11-AS1/miR-542-3p/MAP3K11之间的相互作用关系。qRT-PCR检测胃癌细胞中LncRNA ABHD11-AS1、miR-542-3p、MAP3K11 mRNA水平,Transwell法检测胃癌细胞迁移和侵袭能力,Western blot检测胃癌细胞中MAP3K11、MMP-2和MMP-9蛋白表达水平。结果:LncRNA ABHD11-AS1和miR-542-3p、miR-542-3p和MAP3K11靶向关系被验证。与si-NC组[(184.09±17.32)和(87.64±7.54)]比较,si-LncRNA ABHD11-AS1胃癌细胞的迁移和侵袭能力明显降低[(68.35±6.21)和(28.23±3.05)( P均<0.05)];与si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-NC inhibitor组[(75.39±7.08)和(31.26±3.15)]比较,si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-542-3p inhibitor组胃癌细胞迁移和侵袭能力升高[(138.24±12.58)和(61.23±5.86)( P均<0.05)];与si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-542-3p inhibitor+si-con组[(145.33±13.09)和(65.45±6.08)]比较,si-LncRNA ABHD11-AS1+miR-542-3p inhibitor+si-MAP3K11组胃癌细胞的迁移和侵袭能力明显降低[(108.36±9.87)和(145.33±13.09)( P均<0.05)]。 结论:下调LncRNA ABHD11-AS1调控miR-542-3p/MAP3K11轴可抑制胃癌细胞迁移和侵袭。
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编辑人员丨1周前
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重型颅脑损伤病人血清微小RNA-542-3p、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1表达及其与预后的关系
编辑人员丨2024/7/6
目的 探讨微小RNA-542-3p(miR-542-3p)、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(ln-cRNA TUG1)在重型颅脑损伤(STBI)病人血清中的表达及与病人预后的关系.方法 2020年1月~2022年7月收治的128例STBI病人为重型组,130例轻、中型TBI病人为对照组,检测病人血清miR-542-3p、lncRNA TUG1表达量,采用Pearson法分析二者相关性.Logistic回归分析血清miR-542-3p、lncRNA TUG1对STBI病人预后不良的影响,并以受试者工作特征(ROC)曲线分析二者对STBI病人预后的预测效能.结果 重型组病人血清miR-542-3p与lncRNA TUG1表达量分别低于和高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).STBI病人血清miR-542-3p与lncRNA TUG1表达量呈负相关(r=-0.595,P<0.001).预后不良组血清lncRNA TUG1与miR-542-3p水平分别高于和低于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05).高lncRNA TUG1水平是STBI病人预后不良的危险因素(P<0.05),高miR-542-3p水平是保护因素(P<0.05).血清miR-542-3p、lncRNA TUG1联合预测STBI病人预后的曲线下面积(AUC)(0.939)高于单独预测的AUC(Z=2.410,P=0.016;Z=3.339,P<0.001).结论 STBI 病人血清 miR-542-3p 表达下调,lncRNA TUG1 表达上调,二者均可用于STBI病人预后预测,且二者联合的预测价值更高.
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编辑人员丨2024/7/6
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LncRNA SNHG8在胎盘植入的表达及其对滋养细胞侵袭及迁移的影响
编辑人员丨2024/4/13
目的 探讨lncRNA SNHG8在胎盘植入(placenta accreta,PA)中的表达及对滋养细胞侵袭迁移的影响.方法 采用qRT-PCR检测PA组及对照组各30例胎盘组织中lncRNA SNHG8的表达,同时与30例PA患者产前超声评分做相关性分析.采用Transwell 和划痕实验检测干扰lncRNA SNHG8后对人绒毛膜滋养层细胞(HTR8/SVneo cells)侵袭和迁移的影响,同时,Western blot检测MMP-2和MMP-9的表达情况;StarBase软件预测lncRNA SNHG8下游靶点,并在两组胎盘组织中检测其表达;双荧光素酶报告实验检测lncRNA SNHG8与miR-542-3p的靶向关系.结果 与对照组比较,lncRNA SNHG8在胎盘植入组胎盘组织中表达上调(P<0.05),并与产前超声评分呈正相关.干扰lncRNA SNHG8后抑制了滋养细胞的侵袭迁移(P<0.05),MMP-2及 MMP-9蛋白表达也明显下降(P<0.05).生物学预测miR-542-3p存在与lncRNA SNHG8的结合位点,miR-542-3p在PA胎盘组织中表达下调(P<0.05),双荧光素酶报告实验证实lncRNA SNHG8能靶向调控miR-542-3p.共转染si-SNHG8与miR-542-3p inhibitor后,与si-SNHG8+inhibitor-NC相比,滋养细胞侵袭迁移能力增强(P<0.05).结论 lncRNA SNHG8在PA胎盘组织中高表达并与其严重程度相关,lncRNA SNHG8通过调节miR-542-3p水平促进滋养细胞侵袭迁移行为学功能,提示lncRNA SNHG8在PA滋养细胞的侵袭迁移中发挥重要作用,有望成为临床诊断生物标记物和治疗靶点.
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编辑人员丨2024/4/13
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miR-542-3p对骨肉瘤细胞侵袭能力的影响及其靶基因预测
编辑人员丨2023/8/6
目的 明确miR-542-3p对骨肉瘤细胞系HOS和SAOS2细胞侵袭能力的影响,通过生物信息学建立miR-542-3p靶基因调控网络,并探讨其潜在作用靶点.方法 使用miR-542-3p mimics转染HOS和SAOS2细胞,同时设立正常组(未转染)及阴性对照组(转染miR-neg mimics),Transwell小室试验检测转染后细胞的侵袭能力.通过美国国立生物信息中心(NCBI)基因表达共享数据库(GEO)联合GEO2R平台,获取并分析miRNA-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的基因表达谱数据及其差异表达基因,进而使用miRNA预测数据库及Cytoscape软件,预测并建立miR-542-3p靶基因调控网络.实时荧光定量PCR验证miR-542-3p转染HOS和SAOS2细胞后,部分预测目标靶基因的mRNA表达水平变化.结果 miR-542-3p干预组HOS和SAOS2细胞的侵袭能力较正常组和阴性对照组明显降低(P均<0.05).数据库差异基因分析表明,miR-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的表达差异基因共有417个,其中185个基因表达下调.miRNA预测数据库预测的266个靶基因中,有14个与差异基因分析中得到的表达下调基因重合.实时荧光定量PCR分析得出,ILK、TBPL1、ETS1这3个预测靶基因在miR-542-3p干预组中的表达水平显著低于阴性对照组,差异均有统计学意义(P均<0.05).结论 miR-542-3p通过下调ILK、TBPL1、ETS1显著抑制骨肉瘤细胞的侵袭能力.
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编辑人员丨2023/8/6
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miRNA-542-3p对胃腺癌细胞侵袭转移能力的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究microRNA-542-3p(miR-542-3p)在人胃腺癌细胞系及组织中的表达水平及对胃腺癌细胞侵袭转移的影响.方法 通过RT-PCR检测miR-542-3p在人正常胃粘膜上皮细胞GES-1及人胃癌细胞系SGC-7901和BGC-823中的表达水平;同时应用RT-PCR检测miR-542-3p在50组患者胃腺癌和癌旁组织中的表达差异.体外实验通过外源转染miR-542-3p的模拟物和抑制剂,分别于24,36,48h检测SGC-7901的转染效率,选取最佳转染时间.应用划痕实验和Transwell评估细胞侵袭转移能力的变化.结果 胃腺癌细胞系SGC-7901和BGC-823中miR-542-3p的表达水平低于其在GSE-1中的表达水平(P<0.05);miR-542-3p在癌组织中表达低于癌旁组织(P<0.05).24 h后,miR-542-3p模拟物组侵袭转移能力显著低于对照组(P<0.05),而miR-542-3p抑制剂组侵袭转移能力显著高于对照组(P<0.05).结论 miR-542-3p在多种人胃癌细胞和胃腺癌组织中呈低表达,miR-542-3p抑制胃腺癌SGC7901细胞的侵袭转移能力.
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编辑人员丨2023/8/6
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多烯磷脂酰胆碱干预大鼠非酒精性脂肪肝细胞模型基因芯片组学分析
编辑人员丨2023/8/6
背景:随着信息技术的发展及与生物医学领域的互融,产生了大量基因组学、转录组学等相关的大数据,并通过生物信息学分析与计算机科学相结合的方法对这些数据进行分析,可研究多个基因之间的相互联系.多烯磷脂酰胆碱保护肝脏、改善脂肪代谢、干预非酒精性脂肪肝细胞的相关靶点及其作用机制尚未完全明确.目的:通过筛选mRNA(ClariomTMS Assay)芯片及miRNA芯片的显著差异性基因,预测microRNA相关靶基因,研究多烯磷脂酰胆碱改善肝细胞脂肪代谢的调控机制.方法:①提取多烯磷脂酰胆碱灌胃SD大鼠的含药血清;②培养BRL大鼠肝细胞,加含体积分数50%胎牛血清的培养基建立非酒精性脂肪肝细胞模型,24 h后模型组加入正常血清、多烯磷脂酰胆碱组加入多烯磷脂酰胆碱含药血清进行干预;③提取细胞总RNAs,采用Clariom S表达谱芯片及miRNA芯片检测细胞mRNA及miRNA的表达水平.运用生物信息学方法预测miRNA的靶基因,对脂肪代谢相关基因进行富集分析和通路分析.结果与结论:经筛选和预测得到5629个预测靶基因参与13种生物学过程,14种细胞成分,有11种分子作用,代谢途径、嘌呤代谢、类固醇生物合成路径被富集;rno-miR-21-5p、rno-miR-370-3p、rno-miR-542-3p为调控网络中心;IPA数据库共检出56个与实验有关的脂肪代谢基因.提示:多烯磷脂酰胆碱治疗非酒精性脂肪肝的机制可能与rno-miR-21-5p、rno-miR-370-3p、rno-miR-542-3p,代谢途径、嘌呤代谢、类固醇生物合成路径相关性较高.
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编辑人员丨2023/8/6
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微小RNA-542-3p在人脑胶质瘤中的表达及其对细胞增殖迁移能力的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 观察微小RNA(miRNA,miR)-542-3p在脑胶质瘤患者肿瘤组织中的表达及其对肿瘤细胞增殖、迁移的影响.方法 采用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测33例脑胶质瘤患者肿瘤组织及29例颅脑外伤患者正常脑组织中miR-542-3p的表达水平;合成miR-542-3pmimics及无关序列(miR-542-3p NC),并采用Lipofectamine 2000分别将miR-542-3p mimics和miR-542-3p NC转染至人胶质瘤U87细胞株;分别进行培养后,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞的增殖能力;划痕实验检测细胞的迁移能力;Transwell实验检测细胞的侵袭能力,评价miR-542-3p在胶质瘤细胞U87中的生物学功能.结果 微小RNA miR-542-3p在脑胶质瘤组织及正常脑组织中的相对表达量分别为0.74±0.06和1.06±0.09,胶质瘤组织中miR-542-3p的相对表达水平显著低于正常脑组织(t=3.03,P<0.01).在人胶质瘤细胞株U87中分别转染miR-542-3pmimics和无关序列miR-542-3p NC后,转染miR-542-3mimics对U87细胞增殖能力无明显影响(t=0.236,P>0.05).但U87细胞中转染miR-542-3p mimics后细胞的迁移能力和侵袭能力明显增强.结论 miR-542-3p在人胶质瘤细胞中表达水平减低,并在胶质瘤细胞中发挥抑制细胞迁移和侵袭.
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编辑人员丨2023/8/6
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冠心病患者血清miR-140-3p和miR-142-5p水平检测及其与患者心血管结局和死亡率的关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究miR-140-3p和miR-142-5p在冠心病患者血清中的表达水平,探讨其与患者心血管结局和死亡率的关系.方法 选取2011年1月至2014年10月于沈阳市第十人民医院收治的542例冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)患者为研究对象,以同期500例正常健康体检者作为对照组.采用RT-qPCR检测血清中miR-140-3p和miR-142-5p表达水平,分析其与患者心血管结局和死亡率的关系.结果 与对照组相比,冠心病患者血清中miR-140-3p表达明显下调(P<0.01),miR-142-5p表达明显上调(P<0.01).与miR-140-3p高表达患者相比,miR-140-3p低表达患者心血管事件概率和死亡率均显著升高(P<0.01).与miR-142-5p高表达患者相比,miR-142-5p低表达患者心血管事件概率和死亡率均显著下降(P<0.01).Logistic分析结果显示,miR-140-3p和miR-142-5p是冠心病发生的预测因子.结论 冠心病患者血清miR-140-3p和miR-142-5p表达异常,并且两者表达水平均与患者心血管结局和死亡率相关,提示两者均参与冠心病发生、发展过程.
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编辑人员丨2023/8/6
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结直肠癌患者血清miR-542-3 p和miR-203水平及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨结直肠癌患者血清miR-542-3p和miR-203水平检测及临床意义.方法 选取2014年8月至2018年9月收治的结直肠癌患者134例为观察组,于根治性术前及术后3~4周采集全血;同期健康体检者118例为对照组,体检时采血;测定血清miR-542-3p、miR-203及血清癌胚抗原(CEA)表达水平.结果 术前,观察组miR-542-3p、miR-203水平低于对照组,CEA水平高于对照组(P<0.05).术后,观察组miR-542-3p、miR-203水平高于术前,CEA水平低于术前(P<0.05).而病理学分级越高、TNM分期越高、有淋巴血管间隙浸、有淋巴结转移、有复发患者血清miR-542-3p、miR-203表达水平越低(P<0.05).CEA与miR-542-3p、miR-203呈负相关(r=-0.569、-0.613,P<0.05).CEA、miR-542-3p、miR-203ROC曲线下面积(AUC)分别为0.753(95%CI 0.602~0.798),0.680(95%CI 0.523~0.745),0.658(95%CI 0.569~0.779),miR-542-3p、miR-203的AUC相近,皆低于CEA,miR-542-3p、miR-203诊断结直肠癌的灵敏度、特异度差异无统计学意义(P>0.05),皆低于CEA(P<0.05).结论 miR-542-3p、miR-203在结直肠癌患者血清的表达量降低,miR-542-3p、miR-203在结直肠癌的发生发展过程中起抑制作用;miR-542-3p、miR-203具有较高的灵敏度、特异度,可作为诊断结直肠癌的生物学标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA LINC01224对肾癌细胞增殖和转移影响机制探讨
编辑人员丨2023/8/6
目的 长链非编码RNA(long-chain non-coding RNA,lncRNA)被发现在肾癌发生和发展调控方面具有重要作用.本研究观察lncRNA LINC01224在肾癌组织和细胞株中表达,探讨LINC01224对肾癌细胞增殖和转移影响及作用机制.方法 实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测肾癌组织14例和肾癌细胞株(Caki-1、ACHN、786-O、OS-RC-2和A498)中LINC01224表达.将载有LINC01224编码序列的慢病毒载体(Lenti-LINC01224)感染LINC01224表达量最低的肾癌细胞株作为观察组,以载有绿色荧光基因的慢病毒(Lenti-GFP)为对照组.细胞增殖实验和Transwell迁移实验检测感染后细胞增殖和迁移能力.生物信息学技术预测LINC01224的下游基因.qRT-PCR检测感染后细胞中LINC01224和下游基因mRNA表达.蛋白质印迹法检测下游蛋白表达.结果 癌旁组织和肾癌组织LINC01224表达量分别为4.27士0.42和1.94±0.23,差异有统计学意义,t=4.826,P<0.001.人正常肾小管上皮细胞HK-2和人肾癌细胞株Caki-1、ACHN、786-0、OS-RC-2和A498中LINC01224表达量分别为6.95士0.73、2.74士0.38、4.73士0.48、4.76±0.28、1.04±0.16和3.09士0.35,差异有统计学意义,F=27.530,P<0.001.观察组细胞增殖能力从第3天开始降低,t=6.104,P=0.004.对照组和观察组OS-RC-2细胞迁移数分别为(191.50±31.15)和(71.12士16.52)个,差异有统计学意义,t=3.415,P=0.014.LINC01224可结合miR-542-3p,miR-542-3p可结合MFN2 mRNA.与对照组比较,观察组OS-RC-2细胞测定指标表达量差异有统计学意义的包括:LINC01224表达量分别为1.03士0.15和7.93±0.80,t=8.511,P<0.001;miR-542-3p表达量分别为1.03士0.13和0.32±0.04,t=5.005,P=0.002;MFN2 mRNA表达量分别为1.03±0.15和4.32±0.37,t=8.155,P<0.001.结论 LINC01224在肾癌中表达减少,可抑制肾癌细胞的增殖和迁移能力,其机制可能是抑制miR-542-3p的表达,减少miR-542-3p表达对MFN2基因抑制作用.
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编辑人员丨2023/8/6
