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高度近视患者房水非标记定量蛋白质组学分析
编辑人员丨6天前
目的:采用定量蛋白质组学技术分析高度近视患者房水中的蛋白质组谱。方法:纳入2019年1—8月在天津医科大学眼科医院于白内障手术中用1 ml注射器采集伴或不伴高度近视的年龄相关性白内障患者房水标本各34例34眼(每例100 μl),分别作为高度近视白内障组和单纯白内障组。各组分别选取16例16眼房水标本,采用BCA法进行蛋白定量并比较,采用非标记液相色谱串联质谱分析得到2个组的差异表达蛋白。进一步将生物大数据用基因本体功能富集和京都基因与基因组百科全书通路富集分析差异表达蛋白的功能和信号转导通路。各组分别选取18例18眼房水标本采用酶联免疫吸附实验(ELISA)进行质谱检测结果的扩大样本量验证。结果:高度近视白内障组房水标本平均蛋白质量浓度为(1 134.91±104.78)ng/L,明显高于单纯白内障组的(706.71±85.43)ng/L,差异有统计学意义( t=11.977, P<0.01)。2个组患者房水标本中共鉴定出463个可定量蛋白质,其中86个差异表达蛋白质,包括49个表达上调蛋白和37个表达下调蛋白。这些差异表达蛋白的分类主要包括蛋白结合活性调节因子、细胞外基质蛋白、载体蛋白、细胞间信号分子、蛋白质修饰酶等,分别占32.70%、14.50%、9.10%、9.10%和7.30%。生物信息学分析表明,86个差异表达蛋白主要富集在补体激活及其调节、急性炎症反应、细胞外基质组织重塑等生物学过程。其中21个差异表达蛋白富集于补体和凝血级联通路,15个差异表达蛋白富集于细胞外基质-受体相互作用通路,8个差异表达蛋白富集于PI3K-Akt信号通路。ELISA结果表明,随机选取的3个差异表达蛋白在2个组之间表达变化趋势均与非标记定量蛋白质组学分析结果一致。 结论:高度近视白内障与单纯白内障之间房水蛋白质表达谱有显著变化,高度近视与炎症和免疫相互作用以及细胞外基质的重塑密切相关。
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编辑人员丨6天前
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血清缺血修饰蛋白、钙调蛋白表达水平与脑小血管病患者神经功能受损的相关性分析
编辑人员丨6天前
目的:研究血清缺血修饰蛋白(ischemia modified albumin,IMA)、钙调蛋白(CaM)表达水平与脑小血管病(cerebral small vessel disease,CSVD)患者神经功能受损的相关性。方法:回顾性分析2020年4月至2021年12月在聊城市第三人民医院住院治疗的CSVD患者的140例临床资料,在患者入院时,采用酶联免疫吸附法测定患者血清中CaM水平,采用白蛋白-钴结合实验测定患者血清中IMA水平,采用美国国立卫生院卒中量表(NIHSS)量表对患者的神经功能进行评价,参照国立神经病学与中风研究所(NINDS)评价患者短暂性脑缺血情况,评价患者尿失禁情况、步态障碍情况,采用蒙特利尔认知评估(MoCA)量表对患者的认知功能进行评价。分析CSVD患者血清IMA和CaM表达水平的影响因素,分析CSVD患者神经功能受损程度的影响因素及其与患者血清IMA和CaM表达水平的相关性。结果:患者的性别、年龄、有无步态障碍、有无尿失禁等与患者血清IMA、CaM表达水平均无相关性(均 P > 0.05);认知功能障碍患者、头晕和眩晕患者、短暂性脑缺血患者的血清IMA表达水平[(38.5±5.3)×10 3U/L、(38.5±4.7)×10 3U/L、(39.0±4.4)×10 3U/L]、CaM表达水平[(190.4±34.5)μg/L、(191.2±26.7)μg/L、(199.7±24.8)μg/L]均显著高于认知功能正常患者、无头晕和眩晕患者、无短暂性脑缺血患者[(27.3±4.4)×10 3U/L、(21.0±3.8)×10 3U/L、(20.5±5.1)×10 3U/L、(180.6±29.6)μg/L、(179.5±28.6)μg/L、(168.6±32.4)μg/L]( t=14.10、24.36、22.50,均 P < 0.05)。轻度、中度、重度神经功能受损患者的认知功能障碍(38/16/9)、头晕和眩晕(39/16/8)、短暂性脑出血(35/16/9)、NIHSS评分[(3.6±0.8)分、(7.5±0.9)分、(16.2±3.2)分]、CaM表达水平[(125.3±20.5)μg/L、(185.5±23.6)μg/L、(237.9±54.3)μg/L]、IMA表达水平[(21.2±3.5)×10 3U/L、(38.5±4.3)×10 3 U/L、(74.9±5.4)×10 3U/L],组间差异均有统计学意义( t=32.87、11.28、12.42、34.59、151.73、147.84,均 P < 0.05)。多因素分析结果显示,认知功能障碍( OR=1.578,95% CI:1.043~2.386)、短暂性脑缺血( OR=2.396,95% CI:1.156~4.969)、头晕和眩晕( OR=1.906,95% CI:1.086~3.345)、NIHSS评分( OR=2.171,95% CI:1.162~4.056)、CaM水平( OR=2.022,95% CI:1.268~3.224)、IMA水平增加( OR=2.090,95% CI:1.313~3.325)均是患者神经功能受损加重的独立影响因素(均 P < 0.05)。患者血清IMA、CaM表达水平与神经功能受损程度呈明显的正相关( r=5.45、8.33,均 P < 0.05)。 结论:脑小血管病患者血清IMA、CaM表达水平的升高是神经功能受损的独立危险因素,其表达水平与神经功能受损程度呈正相关。
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编辑人员丨6天前
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白藜芦醇降低缺氧诱导因子1α蛋白SUMO化抑制皮肤鳞状细胞癌新生血管形成
编辑人员丨6天前
目的:从蛋白质泛素/类泛素化修饰平衡角度探讨白藜芦醇抑制皮肤鳞状细胞癌新生血管形成的内在机制。方法:以人皮肤鳞状细胞癌A431细胞株为研究对象,分别给予培养基中加入50 μmol/L和100 μmol/L白藜芦醇处理对数生长期A431细胞作为实验组,以不加白藜芦醇培养基处理为对照组。按照上述实验分组,培养48 h采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)实验检测各组细胞增殖活性;采用血管模拟形成实验检测白藜芦醇处理12 h对A431细胞血管拟态形成能力的影响;采用Western印迹检测白藜芦醇处理48 h各组细胞泛素(ubiquitin)、小泛素相关修饰蛋白1(SUMO1)、缺氧诱导因子1α(HIF-1α)、血管内皮生长因子受体(VEGFR)相对表达水平。将24只8周龄BALB/c雄性去胸腺小鼠随机均分3组,于腹股沟皮下接种A431细胞,治疗组予1 mg/kg或2 mg/kg白藜芦醇腹腔注射给药,对照组注射相同体积的生理NaCl溶液,每3天注射1次,第21天处死小鼠,解剖肿瘤称重;采用免疫组化检测各组肿瘤组织中CD31的表达。多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:对照组、50 μmol/L组、100 μmol/L组A431细胞增殖率差异有统计学意义( F = 17.75, P = 0.017),50 μmol/L组、100 μmol/L组低于对照组(66.53% ± 5.09%、35.88% ± 4.28%比100%,LSD- t = 21.17、29.04, P = 0.011、0.004);3组A431细胞血管管壁样细胞嵴的总长度差异有统计学意义( F = 21.37, P = 0.004),50 μmol/L组、100 μmol/L组低于对照组[(102.73 ± 11.36)μm、(37.83 ± 4.19)μm比(185.26 ± 8.02)μm,均 P < 0.05];3组细胞泛素、SUMO1、HIF-1α、VEGFR相对表达差异均有统计学意义,50 μmol/L组、100 μmol/L组泛素相对表达均高于对照组(2.09 ± 0.13、3.53 ± 0.16比0.68 ± 0.11,均 P < 0.05),SUMO1、HIF-1α、VEGFR的相对表达均低于对照组(SUMO1:1.87 ± 0.13、1.02 ± 0.11比3.10 ± 0.11,HIF-1α:0.81 ± 0.06、0.45 ± 0.06比0.97 ± 0.08,VEGFR:0.73 ± 0.09、0.39 ± 0.05比0.98 ± 0.07,均 P < 0.05)。动物试验中,对照组、1 mg/kg组、2 mg/kg组小鼠皮下肿瘤质量[(3.29 ± 0.57)g、(2.91 ± 0.49)g、(2.55 ± 0.52)g]、肿瘤组织CD31细胞阳性率(76.24% ± 5.51%、39.45% ± 5.48%、12.07% ± 3.54%)差异均有统计学意义( F = 14.33、15.34, P = 0.019、0.021),1 mg/kg组、2 mg/kg组均低于对照组(均 P < 0.05)。 结论:白藜芦醇能够抑制肿瘤生长与肿瘤组织新生血管形成,可能与通过降低HIF-1α蛋白泛素/类泛素化修饰途径抑制皮肤鳞癌新生血管形成有关。
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编辑人员丨6天前
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基于网络药理学和分子对接的半枝莲二萜类化合物抗肝癌作用机制
编辑人员丨2024/4/27
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨半枝莲二萜类成分抗肝癌的作用机制.方法 根据文献调研(1987年1月至2022年7月)获得的155个半枝莲二萜类化合物,通过SwissADME平台筛选后得到符合条件的93种活性成分,并通过Swiss Target Prediction网络平台预测得到其中65个化合物可能的作用靶点;通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank以及GEO、TCGA数据库获取与肝癌有关的靶点,利用Cytoscape软件构建可视化"活性成分-靶点-肝癌"网络作用图,并通过度值筛选主要活性成分;使用String平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络功能富集分析,利用Cytoscape软件构建PPI可视化网络图,通过cytoHubba插件的评分规则筛选出核心靶点和关键靶点;采用R语言软件包对半枝莲二萜抗肝癌的作用靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析;使用AutoDock vina软件对主要活性成分与关键靶点进行对接分析.结果 筛选出半枝莲二萜中6种活性成分包括Scutebarbolide I、Scutebata O、Scutelinquanine D、Scutellone F、Scutellone H和Scutebarbatine J,预测得到10个抗肝癌核心靶点,其中蛋白STAT3、MAPK1、MAPK3、HSP90AA1、PIK3R1和PIK3CA为关键靶点.基因富集分析得到953个GO功能条目和137条通路(P<0.05);分子对接结果显示,半枝莲二萜活性成分与关键靶点间存在潜在结合位点;网络药理学分析表明半枝莲二萜成分可能通过肽基-丝氨酸磷酸化、肽基-丝氨酸修饰、磷酸酶结合、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性等生物学过程,作用于STAT3、MAPK1、MAPK3、PIK3R1、PIK3CA等关键蛋白的表达,进一步调控癌症中蛋白多糖、化学致癌受体激活、催乳素信号通路、癌症程序性死亡受体配体1(PD-L1)表达和程序性死亡受体1(PD-1)检查点通路等信号通路,发挥治疗肝癌作用.结论 半枝莲二萜类化合物能够通过多分子、多靶点、多通路、多作用机制达到治疗肝癌作用.
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编辑人员丨2024/4/27
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前体蛋白转换酶furin和它加工的前体蛋白
编辑人员丨2023/8/6
前体蛋白是蛋白质的前体分子,需要在细胞内经各种加工修饰,才能转变成有生物活性的蛋白质.前体蛋白转换酶是在蛋白质分泌通道中对前体蛋白在特定的位点上进行剪切加工的酶.Furin是前体蛋白转换酶大家族中重要的一员,参与前体蛋白加工修饰的过程.Furin的作用底物不仅包括神经肽和肽类激素,还包括许多生长因子、受体、血浆蛋白酶及细菌外毒素等,具有重要的生物学功能.文章对Furin表达加工的过程、结构及Furin相关抑制性药物等方面进行归纳和总结,并且针对Furin加工的前体蛋白和位点进行了汇总.
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编辑人员丨2023/8/6
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蛋白泛素化修饰调控炎性肠疾病发生和发展的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
炎性肠疾病是一种慢性胃肠道功能紊乱的炎症性疾病.泛素化是一类重要的蛋白质翻译后修饰方式.近年来关于泛素化去泛素化系统在炎性肠疾病发生和发展中的作用已成为研究热点.目前蛋白泛素化修饰调控炎性肠疾病过程所需的E3泛素连接酶中,分子生物学研究较为清楚的有环指蛋白183(RNF183)、环指蛋白20(RNF20)、Itch和锌指蛋白A20.其中RNF183可靶向核因子κB抑制蛋白α(IκBα)泛素化降解促进NF-κB活化;RNF20促进组蛋白H2 B单泛素化从而下调相关炎症因子的转录;Itch促进维甲酸核孤儿受体γt泛素化降解抑制IL-17介导的肠炎;A20以其特有的泛素化和去泛素化双重活性影响炎性肠疾病的发展.本文综述了以上分子在炎性肠疾病发生、发展和转归中的作用及调控机制.
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编辑人员丨2023/8/6
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益气滋阴饮治疗2型糖尿病活性成分的虚拟筛选研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:对中药方剂益气滋阴饮治疗2型糖尿病的活性成分、作用靶标和途径进行虚拟筛选研究,从分子水平上阐述该方治疗2型糖尿病的药效机制,为其推广应用和合理组方提供理论依据.方法:从《中药原植物化学成分手册》中检索出益气滋阴饮方剂10味药材中已分离得到的化学成分,从DrugBank数据库中检索出治疗2型糖尿病的药物/类药分子,在PubChem Compound数据库中下载各成分的三维分子结构,在Cerius24.10软件中对其进行结构优化,建立益气滋阴饮小分子化合物数据集;以"type 2 diabetes mellitus"为关键词,在治疗靶蛋白数据库中搜索及筛选出2型糖尿病的靶标蛋白,然后从治疗靶蛋白数据库中查询并下载这些蛋白质的三维立体结构;将选出的化合物分子(配体)与靶标蛋白(受体)进行对接,找出活性较高(根据Degree值与Between-ness值大小排序)的小分子和相关度较高的靶标蛋白;以筛选出的小分子化合物与靶标蛋白(如N-反式-咖啡酰酪胺分子与糖原合成酶激酶-3β)的精细对接为例,讨论配体与受体间的相互作用机制.结果:检索得到化学成分及药物/类药分子分别为732、127个,筛选出2型糖尿病的靶标蛋白30个;根据Degree值与Betweenness值大小排序,筛选出了8个活性较高的小分子化合物(如N-反式-咖啡酰酪胺、金丝桃苷等)和10个相关度较高的靶标蛋白(如碳酸酐酶1、糖原合成酶激酶-3β等);N-反式-咖啡酰酪胺与糖原合成酶激酶-3β之间可形成氢键及π烷基化相互作用,从而影响受体蛋白的结构稳定性及活性而产生降低血糖作用.结论:采用虚拟筛选研究发现,益气滋阴饮治疗2型糖尿病时既存在一个小分子化合物与多个靶标相互作用,同时又有不同小分子化合物作用于同一靶标的现象,从分子水平上揭示了其通过多组分、多靶标协同作用的机制,为开发治疗糖尿病的新药时先导化合物的筛选和结构修饰提供了参考信息.
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编辑人员丨2023/8/6
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铁稳态代谢表观遗传调控机制的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
铁稳态在机体生长发育和健康维持中发挥重要作用,而机体铁稳态代谢受二价金属离子转运蛋白(DMT1)、转铁蛋白受体1(TFR1)、转铁蛋白受体2(TFR2)、铁外排蛋白(FPN)、铁调素(HAMP)、铁调素调节蛋白(HJV)、铁蛋白重链(Ferritin H)等关键基因精密调控.近年研究报道,DNA甲基化、组蛋白乙酰化和微RNA(miRNA)等表观遗传机制可发挥调控铁稳态的作用.其中,DNA甲基化可通过调控FPN、TFR2、HAMP、HJV和骨形态生成蛋白BMP家族成员6(BMP6)等铁代谢基因启动子区甲基化水平而影响这些基因的表达.此外,组蛋白脱乙酰酶(HDAC)能够通过抑制HAMP基因表达而调控铁代谢;而HDAC抑制剂可促进HAMP基因表达.多个miRNA可靶向DMT1、FPN、TFR1、TFR2和Ferritin H等基因,通过抑制这些铁代谢关键基因的表达而影响机体铁的吸收、转运、储存和利用过程.值得关注的是,表观遗传调控的一些关键酶,如DNA去甲基化酶TET2和组蛋白赖氨酸去甲基酶JmjC KDM需要铁离子才能发挥酶促活性.本文综述了DNA甲基化、组蛋白乙酰化和miRNA等表观遗传机制调控铁稳态代谢的国内外最新研究进展,并针对未来研究方向进行了讨论.
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编辑人员丨2023/8/5
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白藜芦醇治疗阿尔茨海默病的作用机制:基于网络药理学方法
编辑人员丨2023/8/5
目的 基于网络药理学方法探讨白藜芦醇(RES)治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制.方法 利用PubChem、BATMAN-TCM、Genecards、AD、TTD、String 11.0、AlzData、SwissTargetPrediction、Metascape等数据库,获得RES所有作用靶点和人类AD相关的靶点,使用Venny2.1工具取交集,获得RES治疗AD的靶点.构建靶点蛋白质相互作用网络,基因本体论(GO)与KEGG通路富集分析,使用Cytoscape 3.7.1构建RES治疗AD的"靶点-信号通路"网络图.使用SwissDock(http://www.swissdock.ch/docking)服务器进行分子对接验证.通过蛋白免疫印迹检测RES处理AD细胞模型(293Tau细胞)的pS396、pS199、Tau5、CDK5、糖原合酶激酶3β(GSK3β)和p-GSK3β的蛋白水平.结果 分析得到RES作用靶点182个,AD相关靶点525个,RES治疗AD的靶点36个,其中34.6%的靶点为蛋白质修饰酶、27.7%的靶点为代谢物相互转化酶、13.8%的靶点为基因特异性转录调节因子、10.3%的靶点为转运蛋白.RES治疗AD的核心关键靶点为1NS、APP、ESR1、MMP9、1GF1R、CACNA1C、MAPT(即微管相关蛋白Tau)、MMP2、TGFB 1与GSK3B.GO生物学过程富集分析显示,RES治疗AD主要涉及对β-淀粉样蛋白的反应、转移酶活性的正调节、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、行为、学习或记忆、老化、跨膜转运的调控等多个生物功能.KEGG通路富集分析表明富集最显著的信号通路为阿尔茨海默病通路、PI3K-AKT信号通路、cGMP-PKG信号通路、MAPK信号通路等.分子对接结果显示,RES与ESR1、GSK3B、MMP9、IGF1R、APP与INS结合较好.蛋白免疫印迹结果显示,50 μmol/L RES处理12 h可以通过调控CDK5、核心靶点GSK3β活性显著降低293Tau细胞pS396和pS199水平(P<0.001).结论 RES可以通过Aβ、Tau病理过程治疗AD,可通过调控CDK5与GSK3β改善AD病理改变.
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编辑人员丨2023/8/5
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灯盏花素注射液联合比伐芦定对急性心肌梗死患者PCI术后心电图指标及心功能的影响
编辑人员丨2023/8/5
[目的]探讨灯盏花素注射液联合比伐芦定对急性心肌梗死(AMI)患者介入术后心电图指标及心功能的影响.[方法]前瞻性选择2018年2月至2020年4月辽阳市中心医院收治的行PCI术治疗的116例AMI患者为研究对象,采用随机数表法将其分为观察组和对照组,每组各58例.对照组在常规治疗基础上给予比伐芦定治疗,观察组在对照组的基础上给予灯盏花素注射液治疗.比较两组患者治疗后心肌梗死溶栓(T IM I)血流分级、心功能指标[左室射血分数(LVEF)、左室收缩末期内径(LVESD)、左室舒张末期内径(LVEDD)]、血清指标[白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、血清心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)、缺血修饰白蛋白(IMA)、肌钙蛋白T(cTnT)水平]及心电图情况[体表心电图QT离散度(QTd)、ST段回落].治疗后随访3个月,记录两组患者主要不良心血管事件(MACE)发生情况.[结果]治疗后,两组患者TIMI血流分级较治疗前改善,且观察组优于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组患者LVEF水平高于治疗前,LVESD、LVEDD水平低于治疗前,且观察组与对照组存在差异,差异均有统计学意义(均P<0.05).两组患者血清H-FABP、IMA、cTnT、IL-6、TNF-α水平均低于治疗前,且观察组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).两组患者QTd均低于治疗前,且观察组低于对照组(P<0.05);观察组ST段回落良好率高于对照组(P<0.05).治疗后3个月随访,观察组、对照组各脱落1例,观察组MACE发生率为7.02%(4/57),低于对照组的21.05%(12/57),差异有统计学意义(χ2=4.653,P=0.031<0.05).[结论]灯盏花素注射液联合比伐芦定治疗可改善AMI患者PCI术后心肌灌注、心电图情况及心功能,减轻机体炎症反应,降低血清H-FABP、IM A、T nT水平,减轻心肌损伤,降低M ACE发生率,对改善患者预后具有重要意义.
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编辑人员丨2023/8/5
