目的:了解浙江省衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒(Echovirus, ECHOV)优势血清型与变迁并分析ECHOV VP1基因分子特征。方法:采集53例病毒性脑炎患儿脑脊液标本进行病毒分离培养。采用荧光RT-PCR和PCR分别检测脑脊液标本中人肠道病毒(human enterovirus，HEV)包括ECHOV、柯萨奇病毒(coxsackie virus，CV)和新型肠道病毒(enterovirus，EV)，以及流行性乙型脑炎病毒(japanese encephalitis virus, JEV)、腮腺炎病毒(mumps virus, MuV)、西尼罗病毒(west nile virus，WNV)、基孔肯雅病毒(chikungunya virus，CHIKV)、单纯疱疹病毒(herpes simplex virus，HSV)和巨细胞病毒(cytomegalovirus，CMV)。HEV阳性脑脊液标本采用RT-PCR法扩增HEV-B组全长VP1基因序列，测序后用多种生物信息学软件分析ECHOV VP1基因型、基因重组和遗传进化特征。结果:RD细胞分离培养出6株毒株，但Hep-2细胞分离培养结果均阴性。11份标本HEV通用荧光RT-PCR结果阳性，但其他病毒检测结果均阴性。11份HEV阳性标本中6份检出ECHOV，与分离培养结果一致，分别为4株ECHO6、1株为ECHO7和1株ECHO30血清型，柯萨奇病毒和EV检测结果均阴性。4株ECHO6病毒属于ECHO6-C2基因亚型，但分为ECHO6-41/46和ECHO6-45/48两个流行克隆，ECHO7和ECHO30分别属于ECHO7-C和ECHO30-C基因型。ECHO6与ECHO30病毒在进化过程中存在VP1基因重组。结论:ECHOV是该地区儿童病毒性脑炎主要病原体，且可能存在局部暴发流行。ECHO6与ECHO30病毒VP1基因存在重组可能性，ECHO6有成为ECHOV优势血清型的可能。

目的:了解2002-2018年浙江省病毒性脑膜炎病原学及分子流行病学特征。方法:从设立的监测点医院采集疑似病毒性脑膜炎患者样本2 173份，其中脑脊液1 718份、粪便455份，用荧光定量PCR方法检测脑脊液中人类肠道病毒（HEV）、腮腺炎病毒（MuV）、单纯疱疹病毒（HSV）、巨细胞病毒（CMV）和乙型脑炎病毒（JEV）核酸，粪便样本只检测HEV；用ELISA方法检测脑脊液中上述5种病毒IgM抗体；对HEV核酸阳性样本扩增病毒VP1基因和测序，确定病毒型别并进行进化分析。结果:在2002-2018年2 173份样本中检出HEV核酸阳性871份（40.1 %），其中脑脊液1 718份、阳性654份（38.1 %），粪便455份、阳性217份（47.7 %）；871份HEV核酸阳性样本，VP1扩增测序阳性670份，其中HEV-A 5份、HEV-B 665份，涉及23个病毒血清型，分别为柯萨奇病毒（CV）A组CVA4、CVA6、CVA9、CVA10，CVB组1~5，埃可病毒（EchoV；E）E3、E4、E6、E7、E9、E11、E14、E16、E18、E21、E25、E30、E33和肠道病毒（EV）-71，位于前3位的分别为E30、E6和CVB5，该3个血清型间隔若干年呈现病毒活动性增强的趋势。从2012-2015和2018年795份脑脊液中检出HEV核酸阳性374份、MuV 6份、HSV和CMV均为5份，对其中的368份脑脊液同时检测5种病毒IgM抗体，HEV抗体阳性2份、JEV 6份、MuV 1份。670份HEV中除1份EV-71外，EchoV 517份、CV 152份，两者之比为3.4∶1，两类病毒间隔3~5年存在优势株交替变化的趋势。VP1进化树显示，浙江省HEV位于HEV-A和HEV-B分支上，E30存在h和i基因亚型。 结论:浙江省病毒性脑膜炎的主要病原为HEV-B；EchoV检出率明显高于CV，两类病毒存在交替变化的趋势；优势血清型E30、CVB5和E6间隔若干年呈现病毒活动性增强的趋势；监测点HEV活动强度与病毒性脑膜炎暴发疫情的发生两者之间在时间上有较好的相关性。

目的:探究埃可病毒11型(echovirus 11, E11)感染人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells, RD)后细胞内宿主因子在转录水平上的变化，初步了解Polo样激酶1(polo-like kinase 1, PLK1)对E11复制的影响及可能的分子机制。方法:利用转录组测序(RNA-Seq技术)对E11感染RD细胞组和RD细胞对照组进行差异表达基因分析。使用基因本体论(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG)富集分析显著差异表达基因，利用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time PCR, qPCR)对代表性差异基因的表达水平进行验证，并初步探究抑制PLK1对E11复制的影响。结果:E11感染RD细胞后，共鉴定出3 726个差异表达基因，感染组(感染后12 h、24 h和48 h)共同显著差异表达基因484个，这些显著差异表达基因主要富集在免疫反应、细胞内信号转导、转录因子活性、序列特异性DNA结合、蛋白激酶活性、核、膜的组成成分、PI3K-Akt信号通路等。使用qPCR对6个靶基因(CXCL14、IFITM1、OAS1、SAMD9、MX1和PLK1)的表达情况进行验证，均与RNA-Seq结果一致，其中CXCL14、IFITM1、OAS1、SAMD9、MX1表达上调倍数在1.2~104.97倍之间，PLK1表达下调倍数在0.99~5.79倍之间。抑制PLK1后，E11复制能力增加。结论:炎症反应、PI3K-Akt、MAPK等通路可能在E11感染抗病毒免疫过程中发挥重要作用，此外，宿主因子PLK1可能通过调节细胞周期在E11感染中起到关键作用。

目的:探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11, Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法:本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定，结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果:上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株，其中2012—2019年环境污水共分离到136株，其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快，有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链，即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年，环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型，从2016年开始，优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论:环境污水监测真实反映人类肠道病毒(human enterovirus, HEV)的循环状况，对于HEV相关疾病预测预警具有实际意义。

目的:探究疑似病毒性脑炎患儿肠道病毒（EV）、疱疹病毒（HHV）检测阳性率。方法:收集湖南省儿童医院2017年8月至2019年12月365份疑似病毒性脑炎患儿脑脊液、血清、痰、大便、尿标本于-80 ℃冻存，采用一步法巢式逆转录多聚酶链反应（RT-PCR）检测EV，采用实时荧光定量PCR法（qPCR）检测HHV，分析这两类病毒在临床疑似病毒性脑炎患儿中的感染率。其中132例患儿确诊为EV脑炎或HHV脑炎，比较分析病毒在各种标本中的检出时间。结果:365例疑似病毒性脑炎患儿中20.5%（75/365）的患儿诊断为EV脑炎，15.6%（57/365）患儿诊断为HHV脑炎。75例EV脑炎患儿以埃可病毒6型（echo 6）感染为主，占52.0%（39/75）；其次为EV71感染（30.7%，23/75），echo11（6.7%，5/75），柯萨奇病毒A组6型（CA6，4%，3/75）及echo30、echo9、echo4、柯萨奇病毒B组1型（CB1）、脊髓灰质炎病毒各1例（1.3%，1/75）。57例HHV脑炎主要以人疱疹病毒6型（HHV6）感染最多见，占35.1% （20/57）。其次为巨细胞病毒（CMV，31.6%，18/57），EB病毒（12.3%，7/57），单纯疱疹病毒1型（HSV1，10.5%，6/57），单纯疱疹病毒2型（HSV2，8.8%，5/57），水痘带状疱疹病毒（1.8%，1/57）。患儿入院后病毒在脑脊液中的检出时间明显早于血清，脑脊液在发病后2~7 d可检出病毒，血清为7~26 d。结论:采用一步法巢式RT-PCR技术及实时荧光qPCR技术检测脑脊液病毒核酸极大程度提高了不明原因脑炎患儿病原体的检出率。肠道病毒Echo 6、EV71、疱疹病毒HHV6、CMV是导致本院病毒性脑炎的最主要的病原体，临床可根据发病时间合理选择标本类型进行测定。

目的:本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型（echovirus11，E11）的基因特征进行研究，掌握肠道病毒的流行情况，填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法:收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康儿童的粪便标本，通过病毒分离和肠道病毒分子定型方法，对阳性病毒分离物进行肠道病毒血清型鉴定，并对鉴定结果为E11的病毒分离物进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定和分析。使用MEGA软件构建基因进化树（最大似然法），与中国其他省份E11和全球E11进行遗传进化分析。结果:574份粪便标本中分离到89株肠道病毒分离株，其中E11有44株，是主要的血清型，VP1区核苷酸序列之间的相似性为96.4%~100%，在系统发育树上呈现为多个传播链，但均属于D5基因亚型，且与我国2017年后其它省份E11流行株聚为一簇。结论:本研究获得了我国西藏自治区流行的E11的基因特征的基本信息，并了解了全球E11的基因型分布。

目的:了解兰州地区新型冠状病毒肺炎疫情前后儿童呼吸道病原分布及流行特点。方法:分别选取2020年10月至11月及2021年10月至11月在甘肃省中心医院及甘肃省妇幼保健院因急性上呼吸道感染住院的患儿各286例为研究对象，进行回顾性分析。对A型流感病毒(influenza virus A，IVA)、B型流感病毒(influenza virus B，IVB)、副流感病毒(parainfluenza virus，PIV)、腺病毒(adenovirus，ADV)、肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae，MP)、肺炎衣原体(chlamydia pneumoniae，CP)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus，RSV)、埃可病毒(echovirus，ECHO)、柯萨奇B组病毒(coxsackie virus B，CVB)九种病原IgM抗体进行检测，对基本信息及流行特征进行统计分析。结果:新型冠状病毒肺炎疫情前后九种病原IgM抗体阳性检出率分别为31.8%(91/286)和5.9%(17/286)，疫情后检出率明显下降，差异有统计学意义( χ2＝62.505， P<0.05)；疫情后ADV、MP、CVB检出率均较疫情前下降，差异有统计学意义( χ2＝39.281、12.167、10.155，均 P<0.05)。疫情前1月龄~1岁、~3岁、~6岁、>6岁组阳性检出率分别为37.4%(37/99)、38.3%(36/94)、16.7%(12/72)、28.6%(6/21)，差异有统计学意义( χ2＝34.055， P<0.05)；其中MP在1月龄~1岁、~3岁、~6岁、>6岁组检出率分别为16.2%(6/37)、25.0%(9/36)、16.7%(2/12)、100%(6/6)，差异有统计学意义( χ2＝10.289， P<0.05)；CVB在>6岁组未检出，在1月龄~1岁、~3岁、~6岁组阳性检出率分别为16.2%(6/37)、22.2%(8/36)、25.0%(3/12)，差异有统计学意义( χ2＝27.742， P<0.05)。疫情后1月龄~1岁、~3岁、~6岁、>6岁组阳性检出率分别为5.9%(4/68)、4.0%(3/75)、5.7%(6/106)、10.8%(4/37)，差异无统计学意义( χ2＝2.235， P>0.05)；其中IVB在1月龄~1岁、~3岁、~6岁组阳性检出率分别为25.0%(1/4)、33.3%(1/3)、66.7%(4/6)，>6岁组未检出，差异有统计学意义( χ2＝96.022， P<0.05)。疫情前后病原混合感染检出率分别为5.6%(16/286)、0.3%(1/286)，差异无统计学意义( χ2＝2.314， P>0.05)。 结论:兰州地区儿童急性上呼吸道感染常见病原在新型冠状病毒肺炎疫情前后分布存在差异。

目的:了解2019年河南省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis，AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus，NPEV)的型别及分布情况。方法:2019年河南省共报告AFP病例513例，每例病例采集双份粪便标本进行病毒分离，对NPEV阳性毒株进行VP1基因扩增和测序鉴定，序列的比对以及遗传进化树的构建通过MEGA5.1软件完成。使用Excel 2016和SPSS19软件对NPEV阳性毒株的流行病学数据进行统计分析。结果:从513例AFP病例中共分离出39株NPEV，分离率为7.60%(39/513)，其中18株为A组病毒，21株为B组病毒，A组和B组病毒均包含7个血清型，未分离到C组和D组病毒。A组中以柯萨奇A组病毒(coxsackievirus A，CVA)4型和CVA16为主，B组中以埃可病毒(echovirus，Echo)11型为主。NPEV阳性毒株之间的核苷酸一致性为67.4%~100.0%，与原型毒株核苷酸一致性为71.4%~85.6%。NPEV主要集中在7岁以下的散居儿童当中，分离率为84.62%(33/39)，男女性别比为2.07∶1，分离率在不同年龄组之间以及不同性别之间均无统计学差异( P>0.05)。A组病毒中CVA2、CVA4和CVA16分布比较广泛，B组病毒中Echo3、Echo11和Echo30分布比较广泛。时间上除1月份以外，全年均能分离出NPEV，其中A组病毒主要发生在4~7月，分离数占到全年的66.67%(12/18)，B组病毒主要发生在9月，分离数占到全年的28.57%(6/21)。 结论:2019年河南省分离的NPEV以B组Echo11为主要血清型，病原谱、地区分布以及不同年龄NPEV的分离率相比2018年发生了明显的变化。因此要加强监测，有针对性的进行防控，有效减少AFP的发生。

目的:分析2019年广东省两起医疗机构新生儿肠道病毒感染暴发事件实验室检测结果及埃可病毒11型(Echovirus 11, Echo11)基因特性，为新生儿肠道病毒感染防控提供依据。方法:收集疑似肠道病毒感染新生儿病例病原学标本，采用荧光定量PCR和基因测序两种方法进行肠道病毒分型鉴定，对阳性标本开展病毒分离，对Echo11的VP1基因进行全长序列测定并运用Danstar6、Bioedit7.09和MEGA6.06等生物信息学软件开展遗传进化分析。结果:收集到36例新生儿病例的93份标本，经鉴定，24例55份标本肠道病毒阳性，其中23例为Echo11阳性，1例为柯萨奇病毒B组4型(CVB4)阳性。从19例病例标本中分离到肠道病毒29株，其中18例28株为Echo11，1例1株为CVB4。VP1全长序列分析发现，本研究18株Echo11核苷酸同源性为98.2%~100.0%，两起新生儿感染事件Echo11的核苷酸同源性分别为99.7%~100.0%和99.8%~100.0%，均高度同源；Echo11可分为A、B、C、D、E和F共6个基因型，其中A基因型包含5个亚型(A1~A5)，C基因型包含4个亚型(C1~C4)，D基因型可分为等5个亚型(D1~D5)，本研究18株Echo11均为D5亚型。结论:2019年广东省两起医疗机构新生儿感染暴发事件均由肠道病毒Echo11引起，均属于D5基因亚型。

目的 分析新型冠状病毒感染合并细菌感染患者的痰标本中分离到的致病菌的菌种分布特点及其对抗菌药物的敏感性.方法 收集晋中市第一人民医院2022年12月至2023年2月住院治疗的新型冠状病毒感染患者的相关资料,分析这些患者痰标本中致病菌的种类及分布,以及对各种抗菌药物的敏感性.结果 共收集到诊断为新型冠状病毒感染的患者1 056例,其中痰标本细菌培养阳性的患者105例(9.94％).共分离到127株致病菌,肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌分别为 53 株(41.73％)、30 株(23.62％)、17 株(13.39％)、11 株(8.66％)、9 株(7.09％).肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌和铜绿假单胞菌对阿米卡星、头孢他啶、头孢哌酮舒巴坦等均有较高的敏感性(＞80％).鲍曼不动杆菌对哌拉西林他唑巴坦的敏感率最高(50％).金黄色葡萄球菌对喹诺酮类及万古霉素、利奈唑胺等的敏感率较高(＞80％).结论 部分新型冠状病毒感染患者可能同时合并细菌性肺炎,需要积极鉴定致病菌并合理选择敏感抗生素.