为合成代谢途径选择宿主生物,并为合成代谢途径中的外源反应确定外源酶是合成生物学和代谢工程的两大挑战问题.自然界中存在成千上万种微生物和生物合成反应,仅通过生物实验来确定这些目标既昂贵又耗时.本文设计开发了一种名为RPS(recommend metabolic pathway's species)的新型生物推理软件系统,以辅助合成代谢途径的设计.RPS软件可根据竞争性内源反应的比例和途径末端代谢物的数量为合成代谢途径推荐合适的宿主生物,并通过酶的系统发育距离和反应动力学信息为宿主生物中的外源反应识别合适的外源酶.有别于已有的以宿主为中心的合成代谢途径设计工具,RPS软件以代谢途径为中心的特点可帮助研究人员以不同视角评估合成代谢途径设计.实验结果表明,RPS软件工具可准确识别合成代谢途径潜在的宿主生物,并为合成代谢途径中的外源反应发现合适的外源酶.用户可通过https://biolab.gxu.edu.cn/RPS在线使用RPS软件工具.

目的:对临床分离的致关节感染的两株皮疽诺卡菌（ Nocardia farcinica）进行全基因组测序并分析其耐药性。 方法:2020年1月收集两株导致老年患者膝关节感染的皮疽诺卡菌菌株，采用全基因组测序对细菌进行鉴定，根据CLSI M24推荐的微量肉汤稀释法和E-test法进行药物敏感性分析，通过ABRicate工具比对获得性耐药和毒力基因，Snippy等生物信息学工具进行同源性等基因特征分析。结果:本研究的临床分离株均为皮疽诺卡菌，对头孢曲松、头孢吡肟、头孢噻肟、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲噁唑（TMP/SMX）耐药，对亚胺培南、利奈唑胺和含有酶抑制剂类抗生素阿莫西林/克拉维酸敏感。携带A类β内酰胺酶基因 far-1、RNA聚合酶结合蛋白基因 RbpA、多耐药外排泵转录激活因子基因 MtrA和调节转录因子基因 vanR-O，分别介导对β内酰胺抗生素、利福平、大环内酯类药物和万古霉素的耐药性。不含有获得性TMP/SMX耐药基因，二氢叶酸还原酶家族基因存在多个错义突变，均携带与结核分枝杆菌同源的 icl、 mbtH、 phoP、 relA毒力基因，SNP同源分析表明两株皮疽诺卡菌具有很近的亲缘关系，两株菌仅存在10个SNP位点、6个复合基因和1段基因缺失变异。 结论:全基因测序技术有助于研究诺卡菌的分子特征和耐药机制；皮疽诺卡菌对TMP/SMX耐药现象需要重视，参与二氢叶酸代谢途径的酶基因突变有可能是TMP/SMX耐药的原因之一。

目的:探讨心脏手术麻醉中高龄患者脑氧饱和度（rSO 2）对术后认知功能障碍（POCD）的影响。 方法:回顾性分析2017年6月至2019年12月北京大学国际医院行心脏手术老年患者113例，其中男67例，女46例，年龄65~89岁。所有手术均在全身麻醉、体外循环和rSO 2及相关监测下完成。统计分析老年患者合并疾病、心脏手术史、体外循环时间、rSO 2基线值（rSO 2 baseline）、术中rSO 2最低值（rSO 2 min）、手术时间、重症监护室（CCU）停留时间、住院时间；记录患者手术前、后神经元特异性烯醇化酶（NSE）数值，术后POCD发生率及死亡率。所有数据均来源于北京大学国际医院病历系统和麻醉信息系统。采用logistic回归法进行POCD相关危险因素分析。 结果:19例（16.8%）患者术后出现POCD，且19例患者术中rSO 2下降幅度均超过基线值30%以上。POCD组与非POCD组患者术中rSO 2变异度（rSO 2 baseline-rSO 2 min）分别为（18.0±2.7）、（6.6±2.3），NSE变异度（NSE 术后-NSE 术前）分别为（31.3±9.7）、（9.5±3.0）μg/L，差异均有统计学意义（ t=18.35、17.70，均 P<0.05）。rSO 2变异度与NSE变异度呈正相关（ r=0.697， P<0.05）。logistic回归分析显示，rSO 2变异度［ OR值（95% CI）为0.374（0.059~1.895）］、合并糖尿病［ OR值（95% CI）为0.493（0.041~1.812）］、脑卒中［ OR值（95% CI）为0.325（0.084~0.917）］和房颤［ OR值（95% CI）为0.176（0.091~0.943）］是发生POCD的危险因素。 结论:术中监测rSO 2下降幅度可预测POCD的发生，推荐rSO 2作为老年患者心脏手术常规监测项目。

目的:探索Richter转化（RT）患者的克隆同源性、临床与分子生物学特征。方法:回顾性分析南京医科大学第一附属医院血液科（浦口慢淋中心）2019年1月至2021年12月确诊的18例RT患者慢性淋巴细胞白血病/小淋巴细胞淋巴瘤（CLL/SLL）及转化弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段使用及IGHV-D-J重排模式，鉴定患者克隆同源性。结合患者初诊及转化时的临床信息及分子检测，分析RT患者的高危因素。结果:18例RT患者转化时中位年龄56.5（41~75）岁。其中17例转化为DLBCL，1例转化为霍奇金淋巴瘤（HL）。17例RT DLBCL患者中，15例（88.2%）患者DLBCL与CLL/SLL克隆同源；2例（11.8%）患者与CLL/SLL克隆非同源。其中11例患者转化前未接受治疗的CLL/SLL样本与转化后DLBCL样本配对的二代测序（NGS）结果显示突变频率最高的基因均为EGR2、TP53、NOTCH1；但部分患者转化时出现上述基因突变的新获得或丢失，提示存在克隆演变；10例布鲁顿酪氨酸激酶（BTK）抑制剂治疗后转化的患者中4例出现BTK突变。上述突变可能为促进转化的高危因素；此外，TP53、EGR2突变可能为包含新药联合方案治疗RT的不良预后因素。结论:本中心转化DLBCL患者大多为克隆同源性转化；推荐有条件的中心开展相关检测。转化前未治CLL/SLL与转化后DLBCL组织的突变谱有一定异质性。

本视频重点解读2024年3月30日世界卫生组织在亚太肝病学会年会上发布的最新版《慢性乙型肝炎患者的预防、诊断、关怀及治疗指南》中的重要推荐意见。一、治疗基线与随访过程中无创评估1．显著纤维化（≥ F2）的无创检测标准为天门冬氨酸氨基转移酶（aspartate amino transferase，AST）与血小板比值（AST to platelet ratio index，APRI）评分> 0.5或瞬时弹性值> 7.0 kPa。2．肝硬化（F4）的无创评估标准应基于临床标准或APRI评分> 1.0或瞬时弹性值> 12.5 kPa。3．成年人：强烈推荐，中度确定性证据；青少年：强烈推荐，低确定性证据。二、成年人与青少年慢性乙型肝炎抗病毒治疗符合以下条件之一的青少年（≥ 12岁）与成年人（包括育龄期与妊娠期女性）均应接受抗病毒治疗：1．显著纤维化（≥ F2）或肝硬化（F4）诊断标准；2．HBV DNA> 2 000 IU/ml且ALT高于正常上限的患者；3．存在合并感染、免疫抑制状态、合并其他疾病或存在肝外表现；4．存在肝功能检测持续异常。三、慢性乙型肝炎一线抗病毒药物治疗方案初始抗病毒治疗及监测1．TDF或ETV；2．TDF + 3TC或TDF + FTC（如果TDF单药无法获取）；3．ETV或TAF用于有骨质疏松或肾功能损伤的成人、儿童及青少年。四、HBV感染母婴传播的预防及其抗病毒治疗WHO新指南增加了乙型肝炎母婴阻断的内容。为预防HBV的母婴传播，在具备HBV DNA或HBeAg检测条件时，对于HBV DNA≥ 200 000 IU/ml或HBeAg阳性的乙型肝炎病毒表面抗原（hepatitis B surface antigen，HBsAg）阳性孕妇，建议启动TDF抗病毒治疗。治疗疗程建议从妊娠中期开始至分娩结束或婴儿乙肝疫苗接种完成后（强烈推荐,中度确定性证据）。在HBV DNA和HBeAg均无法检测的地区，可考虑对所有HBsAg阳性的孕妇启动TDF抗HBV治疗，建议治疗从妊娠中期开始至分娩或婴儿乙肝疫苗全程接种完成（条件性推荐，低确定性证据）。此外，应保证婴儿完成至少3剂乙肝疫苗接种（包括出生后即刻注射的第1剂乙肝疫苗）。五、青少年和儿童使用抗病毒药物1．WHO新指南对于≥ 12岁的青少年建议的抗病毒指征与药物与成人类似。2．对于年龄< 12岁的青少年患者，建议根据患儿具体情况采取个体化治疗措施。六、HBV DNA检测1．所有HBsAg阳性患者接续进行HBV DNA的检测以便于后续的治疗与照护，即触发检测（条件性推荐，低确定性证据）。2．WHO新指南中推荐可以采用基于实验室的HBV DNA检测方法来评估患者治疗指征与抗病毒应答，同时可以用床旁HBV DNA检测来作为实验室HBV DNA检测的替代（条件性推荐，低确定性证据）。七、丁型肝炎（HDV）的检测1．对所有慢性乙型肝炎患者进行抗-HDV检测。在实验室条件或其他资源有限的地区，如无法对所有CHB患者进行抗HDV检测，建议重点关注特定高危人群，包括在HDV流行国家或地区出生的人群；有HDV感染高风险人群；患有HDV感染的人的子女和家庭成员；有终末期肝病,正在接受抗HBV治疗或提示有HDV感染证据的患者；(条件推荐，非常低确定性证据)。2．如抗-HDV阳性建议进行HDV RNA检测（条件推荐，低确定性证据）。八、抗病毒疗效与肝细胞癌监测1．抗病毒应答监测；2．核苷（酸）类似物的安全性监测；3．肝细胞癌监测；4．停止和重新开始抗病毒治疗。综上，WHO新指南在推荐乙型肝炎合并脂肪肝、糖尿病患者抗病毒治疗等方面对于我国CHB患者扩大适应证带来一定启发，有助于2030年消除病毒性肝炎危害目标的实现。

他汀类药物,即羟甲基戊二酰辅酶A(HMG-CoA)还原酶抑制剂,通过竞争性抑制内源性胆固醇合成HMG-CoA还原酶,阻断细胞内羟甲戊酸代谢途径,使细胞内胆固醇合成减少,反馈性刺激细胞膜表面(主要为肝细胞)低密度脂蛋白受体,使其数量和活性增加,以增加血清胆固醇清除、降低胆固醇水平.他汀类药物被国内外多项指南推荐为冠心病一级预防和二级预防的基础用药.随着他汀类药物在临床广泛应用,他汀类药物相关肌病(statin-associated musclesymptoms,SAMS)也日益引起人们重视.现对SAMS及其可能机制和预防措施做一综述.

目的:研究承德医学院附属医院大肠埃希菌的临床分布,分析其对常见抗菌药物的耐药性,为正确掌握细菌耐药的发展趋势、临床合理应用抗生素提供理论依据.方法:收集大肠埃希菌,采用美国临床和实验室标准协会(CLSI)推荐的表型确证实验,获得产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌.所有菌株的鉴定及药敏实验均由仪器VITEK2完成.结果:674株主要来源于尿标本45％,痰标本29.7％,血液标本14.3％,其他的脓液、胸腹水、分泌物等占11％.产酶菌株364株与非产酶菌株310株进行比较,对于统计分析的19种抗菌药物除亚胺培南、美罗培南、复方新诺明对比组间差异无统计学意义外,其他抗生素对比组间差异有统计学意义(P<0.01),产酶菌株对于氨苄西林、哌拉西林、氨苄西林/舒巴坦、哌拉西林/他唑巴坦、头孢唑林、头孢呋辛、头孢克肟、头孢他啶、头孢曲松、头孢噻肟、头孢吡肟、头孢西丁、阿米卡星、庆大霉素、环丙沙星、左氧氟沙星的耐药率明显高于非产酶菌株.结论:大肠埃希菌的耐药性已经很严重,尤其是产酶菌株的耐药率已经很高,应严格加强大肠埃希菌耐药性的监测,防止耐药菌株在院内传播和流行.

ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者急性期的关键治疗是快速再灌注,成功再灌注后所有患者处于心血管事件再发极高危状态,需要依据国内外最新进展推荐进行二级预防治疗和风险因素控制.STEMI患者的长期管理治疗包括:心肌缺血的无创性评价,左心室功能和心源性猝死评价,戒烟,以运动为基础的心脏康复,饮食和体质量控制,血压控制,血糖管理,降脂治疗,长期抗栓治疗,β-受体阻滞剂,血管紧张素转换酶抑制剂(ACEI)和血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂(ARB),盐皮质激素受体拮抗剂(MRA),改善循证治疗依从性,以及促进治疗协调性的医疗保健体系.

目的 建立超高效液相色谱-串联质谱法(UHPLC-MS/MS)的各亚型CYP450酶探针底物定量分析方法,并用于药物对代谢酶活性影响的评价.方法 采用超高效液相色谱仪-三重四极杆串联质谱仪,选用Waters HSS T3(1.8μm,10×2.1 mm)色谱柱,以0.1％甲酸水(A)-乙腈(B)为流动相进行梯度洗脱.采用CYP450酶特异性探针药物法,根据FDA推荐选择7种特异性探针药物(CYP1A2、CYP2B6、CYP2C8、CYP2C9、CYP2D6、CYP2E1和CYP3A4)进行测定.采用电喷雾离子源(ESI),在正离子扫描下,采用多反应检测模式(MRM)进行测定.采用体外共孵育法比较柴胡多炔对酶活性的抑制率.结果 7种特异性探针底物可在6 min内准确测定;空白孵育基质中的内源性物质对待测物及内标的测定无干扰;待测物最低定量限最低达0.32μmol/L,线性良好,相关系数均>0.99;精密度≤14.1％,准确度≤11.2％;提取回收率和基质效应均符合分析要求.柴胡多炔(RB-2与RB-4)对CYP1A2有较微弱的抑制(底物减少率分别为38％和24％),而对其他代谢酶活性均无明显抑制作用.结论 该方法分析时间短、专属性强、准确度好、精密度高、基质效应小,适用于7种代谢酶活性的测定.

目的 探讨育龄期男性使用抗高血压药物时的生殖风险.方法 以PubMed、Web of Science、EMbase、Scopus、中国知网(CNKI)、维普中文期刊数据库(VIP)和万方数据库(Wanfang Data)为数据源,计算机检索建库至2017年12月公开发表的有关抗高血压药物男性生殖风险的研究,手工检索纳入文章中的重要参考文献作为补充,概述抗高血压药物对男性生殖功能的影响及其机制.结果 β受体阻断药和利尿药与男性性功能障碍的发生有一定相关性,血管紧张素转换酶抑制药、血管紧张素受体阻断药和钙通道阻滞药对男性性功能影响较小,甚或有正向影响.卡托普利和依那普利能改善精子质量参数,推荐育龄期高血压患者优先选择使用.β受体阻断药、利尿剂和钙通道阻滞剂在体外和动物实验中显示对精子质量有一定的负面影响,但缺乏进一步的临床研究.结论 目前抗高血压药物生殖风险的相关研究较少,且多局限于动物研究和体外研究,尚需要长期和大规模临床研究进一步证实.育龄期男性在使用抗高血压药物时,建议医生或药师充分告知患者不同抗高血压药物的生殖风险,消除患者的顾虑,避免患者因考虑到药物的生殖风险而自行停药.服药期间出现生殖相关问题时,应该考虑到药物因素.