由于其与外部环境直接接触，肺是许多空气传播病原体、毒物和过敏原的主要靶器官，可引起各种急性和慢性肺损伤。在肺损伤的病理过程中，病原体感染所释放的外源性DNA，组织损伤导致细胞应激及细胞死亡所释放的自身DNA，均会被相应的DNA感受器所识别。环鸟苷酸腺苷酸合成酶(cGAS)作为细胞内最主要的DNA感受器，近期研究结果提示其参与炎症相关的肺损伤病理过程。本文通过回顾总结cGAS在肺损伤中作用机制的相关研究，提出cGAS可作为潜在的治疗肺损伤的新靶点，旨在为肺损伤的预防和治疗提供新思路。

目的:探究人类抗原R(HuR)对乳腺癌功能表型的影响及其对磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路的调控方式。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库了解HuR在乳腺癌组织和癌旁组织中的表达，选取与HuR显著相关的基因进行基因本体(GO)分析及基因富集分析(GSEA)。以MCF-7和SK-BR-3细胞作为研究对象，通过瞬时转染小干扰RNA(siRNA)沉默HuR基因，利用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测HuR的表达。通过细胞计数试剂盒(CCK-8)、划痕、Transwell实验检测两种乳腺癌细胞系的增殖、迁移、侵袭。通过蛋白质印记法(Western blot)检测PI3K/Akt/mTOR通路相关蛋白的表达。组间差异采用秩和检验、方差分析和 t检验。 结果:HuR在肿瘤组织中的表达高于癌旁组织(3.429±0.300比3.913±0.370， Z＝－15.216， P<0.01)，GO和GSEA结果显示HuR相关基因主要富集于通过死亡结构域受体对外部凋亡信号传导途径的负调节、血液微粒、细胞外基质结构组分、S期激酶相关蛋白2(SKP2)和E2F信号通路及脂肪酸氧化。HuR在两株乳腺癌细胞系中沉默后，CCK-8结果显示在不同时间点，沉默HuR组细胞的增殖能力显著低于对照组(0.148±0.001比0.151±0.001比0.160±0.002比0.159±0.003，0.163±0.002比0.163±0.002比0.172±0.001比0.172±0.000，0.214±0.002比0.215±0.001比0.238±0.003比0.236±0.002；0.146±0.002比0.146±0.003比0.155±0.002比0.154±0.001，0.156±0.001比0.158±0.002比0.172±0.002比0.172±0.001，0.193±0.002比0.197±0.001比0.229±0.007比0.229±0.006， F＝29.811、45.663、105.662、16.735、65.344、53.219， P<0.01)。划痕实验结果显示，实验组在24 h细胞迁移的能力显著低于空白对照组(0.038±0.020比0.067±0.025比0.223±0.047比0.167±0.035，0.082±0.040比0.140±0.027比0.318±0.023比0.254±0.041， F＝20.045、30.130， P<0.01)。Transwell实验显示，实验组通过小室的MCF-7和SK-BR-3细胞数量显著低于对照组(971.000±154.049、873.333±186.100比1 939.333±11.547，1 301.333±81.132、1 152.000±109.421比2 278.000±244.461， t＝7.328、8.067、8.190、9.442， P<0.01)。Western blot实验结果表明在两株细胞中，实验组的PI3K、Akt及mTOR的磷酸化水平均显著低于阴性对照组(0.560±0.015、0.738±0.011比0.968±0.030，0.866±0.003、0.788±0.030比0.970±0.021，0.843±0.009、0.832±0.014比1.003±0.009；0.862±0.011、0.855±0.020比0.981±0.020，0.754±0.083、0.821±0.024比0.939±0.083，0.708±0.038、0.687±0.027比0.936±0.049， t＝30.666、18.216、9.036、14.279、20.708、22.206、10.934、11.440、5.026、3.665、10.549、11.288， P<0.01、0.05)。 结论:HuR可提高乳腺癌的增殖、迁移及侵袭能力，并且可通过激活PI3K/Akt/mTOR信号通路来促进乳腺癌增殖。

目的:基于生物学信息多组学技术对儿童系统性红斑狼疮和皮肌炎共病患者相关基因的特征进行分析。方法:从GEO数据库下载儿童系统性红斑狼疮(childhood-onset systemic lupus erythematos，cSLE)与皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)相关基因芯片表达谱，将两者的差异基因取交集后进行GO功能富集及KEGG信号通路分析，通过Cytoscape软件构建蛋白质互作网络，筛选hub基因；使用CIBERSORT反卷积法分析关键基因和免疫细胞浸润的相关性，将经验证的关键基因导入Coremine Medical数据库筛选出治疗cSLE和JDM共病药物。结果:差异表达基因功能主要富集于I型干扰素通路以及抗病毒反应等；网络拓扑学分析、经外部数据集验证后共筛选出5个关键基因 STAT1、 ISG15、 MX1、 OASL、 DDX58，( P均<0.05)免疫浸润细胞相关性分析显示JDM和cSLE患者的M1巨噬细胞显著上调时与关键基因呈正相关，(P均<0.05)干扰素免疫调节、抗病毒制剂与 JDM和 cSLE共病患者的治疗存在密切关联，( P均<0.001) 结论:JDM与cSLE共同发病基因在多种生物活性、信号通路上发挥重要调控作用，筛选出的5个关键基因及药物预测可能成为共病发生的诊断与治疗开发的理论支持。

目的:探讨结直肠侧向发育型肿瘤(LST)切除后病理诊断升级的危险因素。方法:回顾性收集2018年6月至2022年12月山西省肿瘤医院收治的256例LST患者(297个病灶)的临床资料，作为建模组；收集2023年1月至2024年1月收治的125例LST患者(129个病灶)，作为外部验证组。将建模组病灶根据内镜下钳夹活体组织检查术(EFB)取样标本与LST切除后组织的病理诊断对比结果将病灶分为病理无差异组和病理升级组，比较两组患者的性别、年龄、体重指数、切除前癌胚抗原水平、饮酒史、吸烟史、结直肠癌家族史、是否合并基础疾病等临床资料，以及病灶长径、病灶表面形态特征、病灶部位等内镜下特征。统计学方法采用卡方检验，切除后病理诊断升级的危险因素分析采用多因素logistic回归模型。将独立危险因素构建列线图预测模型。绘制该模型预测建模组内部抽样和外部验证组LST病灶切除后病理诊断升级的受试者操作特征曲线(ROC)，以曲线下面积评价预测模型的应用价值。结果:病理升级组中有结直肠癌家族史的患者占比高于病理无差异组[38.7%(12/31)比22.2%(50/225)]，差异有统计学意义( χ2＝4.04， P＝0.045)。病理升级组与病理无差异组的LST病灶大小[长径≥2 cm者分别占63.9%(23/36)和44.4%(116/261)]、表面形态特征[扁平隆起型分别占8.3%(3/36)和22.6%(59/261)，颗粒均一型分别占11.1%(4/36)和28.0%(73/261)，结节混合型分别占44.4%(6/36)和24.9%(65/261)，假凹陷型分别占36.1%(13/36)和24.5%(64/261)]、病灶部位[远端结肠分别占22.2%(8/36)和33.3%(87/261)，近端结肠分别占16.7%(6/36)和28.7%(75/261)，直肠分别占61.1%(22/36)和37.9%(99/261)]比较，差异均有统计学意义( χ2＝4.80、12.62、7.08，均 P<0.05)。多因素logistic回归模型分析结果显示，有结直肠癌家族史[ OR＝2.211，95%置信区间(95% CI)1.005～4.861， P＝0.049]、病灶长径≥2 cm( OR＝2.212，95% CI 1.074～4.555， P＝0.031)、结节混合型( OR＝4.841，95% CI 1.343～17.455， P＝0.016)、假凹陷型( OR＝3.995，95% CI 1.084～14.721， P＝0.037)、病灶位于直肠( OR＝2.417，95% CI 1.024～5.705， P＝0.044)均是LST切除后病理诊断升级的独立危险因素。基于上述4个危险因素构建列线图模型，建模组内部重复抽样的ROC曲线下面积为0.833(95% CI 0.752～0.913)；外部验证组的ROC曲线下面积为0.848(95% CI 0.736～0.960)，灵敏度为0.737，特异度为0.972，最大约登指数为0.712，总准确度为0.868。 结论:有结直肠癌家族史、病灶长径≥2 cm、病灶位于直肠及LST亚型为结节混合型或假凹陷型都会干扰LST病变EFB病理的准确性，导致切除后病理诊断升级。基于该4项因素的预测模型对LST切除后病理诊断升级有较好的预测效能。

目的:从影像学上严格评价现有的相关文献，比较正畸治疗后根管治疗牙和活髓牙牙根吸收程度是否存在差异。方法:检索从影像学上比较正畸后根管治疗牙和活髓牙牙根吸收的文献，按照纳入标准筛选文献，分析纳入研究的特征，评价研究的质量，定量分析和比较正畸后根管治疗牙和活髓牙牙根吸收程度。结果:6篇研究被纳入，研究间存在比较明显的异质性( P＝0.1， I2＝46%)，按照正畸前的牙根状况作亚组分析，发现正畸前的牙根异常是明显的异质性因素，排除1篇低质量且有明显异质性的研究，其余5篇被纳入最终的Meta分析，结果显示正畸后的牙根吸收量在根管治疗牙和活髓牙之间无显著差别[MD＝0.04(-0.06，0.13)， Z＝0.80， P＝0.42]。按照牙齿类型和测量方法的亚组分析显示各亚组间都无显著差异(分别为 P＝0.63和 P＝0.62)。 结论:当评价和比较正畸治疗后根管治疗牙和活髓牙牙根吸收程度时，要考虑正畸前的牙根状况。正畸前的牙根异常，如牙创伤史和牙根吸收史，是影响评价正畸后牙根吸收程度的明显干扰因素。对现有研究的分析显示，在正畸治疗前牙根正常的前提下，正畸后根管治疗牙和活髓牙的牙根吸收程度无明显差别。在临床上根尖片和CBCT都适用于评价牙根外部根尖吸收。由于纳入的研究数量有限，并且仍存在方法学差异，因此需要更多高质量研究来提供更可靠的证据。

目的:应用生物信息学方法筛选结肠癌预后相关的炎症反应相关差异表达基因，构建并验证结肠癌预后模型。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中检索472例结肠癌患者及41名健康人正常结肠组织的RNA测序和临床数据。从国际癌症基因组联盟（ICGC）数据库中检索结肠癌预后相关基因表达及临床数据。检索时间均为建库至2022年11月。通过基因集富集分析（GSEA）数据库获取200个与炎症反应相关的基因，将其与TCGA数据库中获得的结肠癌和正常结肠组织的RNA测序基因数据集进行对比，获得炎症反应相关的差异表达基因。采用Cox比例风险模型分析评估TCGA数据库中与预后相关的差异表达基因，炎症反应相关的差异表达基因与预后相关的差异表达基因取交集，获得预后相关的炎症反应相关差异表达基因。通过LASSO Cox回归构建结肠癌预后模型。计算风险评分，按风险评分的中位值将TCGA数据库结肠癌患者分为低风险（<中位值）和高风险（≥中位值）两组。对两组患者进行主成分分析（PCA），采用Kaplan-Meier法进行生存分析。基于R软件timeROC程序包分析风险评分预测TCGA数据库结肠癌患者总生存（OS）的效能。应用ICGC数据库中的临床数据对构建的预后模型进行外部验证，依据TCGA数据库结肠癌患者中位风险评分将ICGC数据库结肠癌患者分为高、低风险组。使用R软件，对TCGA数据库中预后相关的炎症反应相关差异表达基因进行免疫细胞及免疫功能的单样本基因集富集分析（ssGESA）、免疫分型差异分析、免疫微环境相关性分析、免疫检查点基因差异分析。结果:共获得60个炎症反应相关的差异表达基因，12个与预后相关的差异表达基因，取交集获得6个预后相关的炎症反应相关差异表达基因（CCL24、GP1BA、SLC4A4、SRI、SPHK1、TIMP1）。通过LASSO Cox回归分析，基于6个预后相关的炎症反应相关差异表达基因构建结肠癌预后模型，风险评分＝-0.113×CCL24+0.568×GP1BA+（-0.375）×SLC4A4+（-0.051）×SRI+0.287×SPHK1+0.345×TIMP1。PCA结果显示，结肠癌患者可以较好地分为2个集群。TCGA数据库中高风险组OS较低风险组差（ P<0.001）；预后风险评分预测患者1、3、5年OS率的曲线下面积（AUC）分别为0.701、0.685、0.675。ICGC数据库中低风险组的OS优于高风险组，预后风险评分预测1、2、3年OS率的AUC分别为0.760、0.788、0.743。ssGSEA分析结果显示，TCGA数据库中高风险组免疫细胞浸润水平较高，尤其是活化树突细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、浆细胞样树突细胞、T辅助细胞、滤泡辅助性T细胞得分均高于低风险组，辅助性T细胞2（Th2）得分低于低风险组（均 P<0.05）；免疫功能方面，高风险组抗原呈递细胞（APC）共抑制、APC共刺激、免疫检查点、人类白细胞抗原（HLA）、促进炎症、副炎症、T细胞刺激、Ⅰ型干扰素（IFN）反应、Ⅱ型IFN反应得分均高于低风险组（均 P<0.05）。免疫分型分析结果显示，IFN-γ为主型（C2）的炎症反应评分最高，分别与创伤愈合型（C1）、炎症反应型（C3）比较差异均有统计学意义（均 P<0.05）。免疫微环境基质细胞、免疫细胞均与预后风险评分呈正相关（ r值分别为0.35、0.21，均 P<0.01）。免疫检查点差异分析结果显示，高、低风险组程序性死亡受体配体1（PD-L1）表达量比较，差异有统计学意义（ P＝0.002），且PD-L1表达量与预后风险评分呈正相关（ r＝0.23， P<0.01）。 结论:炎症反应相关基因在结肠癌肿瘤免疫中可能发挥重要作用，可以用于结肠癌患者的预后分析及免疫治疗。

目的:构建基于血清和关节液炎性标志物诊断关节置换术后假体周围感染（prosthetic joint infections，PJI）的列线图诊断模型，并验证其预测能力。方法:回顾性收集2015年1月至2020年6月于重庆医科大学附属第一医院骨科诊断为PJI或无菌性松动的181例患者临床资料作为建模组。通过lasso回归、单因素及多因素分析筛选出诊断PJI的最佳指标。通过综合考量各项指标的权重及内在联系，构建列线图诊断模型，并以此开发临床决策支持系统（clinical decision support system，CDSS）。前瞻性收集2020年7月至2022年12月于重庆医科大学附属第一医院骨科诊断为PJI或无菌性松动的49例患者作为验证组，通过受试者工作特征曲线（receiver operating characteristic curve，ROC）等方法对列线图模型的诊断性能进行外部验证。结果:181例建模组中PJI患者85例，49例验证组中PJI患者23例。在27个潜在因素中通过lasso回归分析发现体质指数（body mass index，BMI）、血液指标[包括血小板、淋巴细胞绝对值、干扰素γ（interferon γ，IFN-γ）、红细胞沉降率、IL-6、C反应蛋白、D-二聚体]及关节液指标（包括C反应蛋白、IL-1、IL-4、IL-6、多核中性粒细胞百分比、CD64）可能是诊断PJI的潜在指标。单因素回归分析发现血液学指标（包括红细胞沉降率、C反应蛋白、IL-6、D-二聚体）和关节液指标（包括C反应蛋白、关节液CD64指数、C反应蛋白、IL-1、IL-4、IL-6、关节液多形核白细胞百分比）的差异有统计学意义（ P<0.05）。多因素回归分析筛选出血清IL-6、D-二聚体、关节液CD64指数、C反应蛋白、IL-1、IL-4、IL-6及关节液多形核白细胞百分比等指标，以此为基础构建列线图模型和CDSS系统。验证组外部验证ROC曲线下面积（area under the curve，AUC）为0.978，内部验证AUC为0.995；校准曲线C指数为99.50%，内部验证C指数为99.53%，提示列线图模型在临床应用中具有良好的预测能力。 结论:基于多个诊断指标诊断PJI的列线图显示出良好的诊断性能。通过列线图构建的CDSS系统将有助于临床医生更好地诊断PJI，及时做出合理决策。

放牧是草原生态系统最主要的人为干扰因素,也是草原群落构建的重要"外部"过滤因子.然而,关于放牧强度对草原群落构建的作用机制,尤其是在这一过程中种内性状分化和种间性状差异的相对作用目前的了解还比较有限.为此,该研究利用在内蒙古典型草原建立的长期放牧控制实验平台,采用土芯法(环刀)取样,系统分析了植物群落地上(株丛、叶片)和地下(根系)性状对放牧的响应.通过环刀-小区和小区-样地两个推绎尺度,研究了基于种内与种间性状变异的放牧强度过滤作用.研究结果表明:(1)随着放牧强度的增加,大多数地上性状的种内和种间变异呈增加趋势,而根系性状的种内和种间变异则显著降低.(2)随着放牧强度的增加,在环刀尺度上,基于地上性状的种内变异和种间差异的放牧过滤强度先增大后减小,在中度放牧时达到最大;然而基于地下性状的种内变异和种间差异的放牧过滤强度逐渐增加.在小区尺度上,基于地上性状的种内变异和种间差异的放牧过滤强度呈线性降低趋势;而基于地下性状种内变异的放牧过滤强度增加,基于种间差异的放牧过滤强度减弱.(3)随着空间尺度增大,放牧强度对草原群落构建的影响由基于种间性状差异的过滤作用逐渐转变为基于种内性状变异的过滤作用,此过程受土壤水分和养分的调控.这些研究结果为深入揭示放牧对草原群落构建的调控机制提供了科学依据,也为正确理解长期放牧导致的植被景观异质性和尺度效应评估提供了重要参考.该研究中叶片和根系性状主要考虑了结构性状,因此具有一定的局限性,未来研究可结合叶片和根系碳氮含量等化学性状指标,以全面理解放牧对植物地上、地下性状变异的调控机制.

目的 通过生物信息学筛选胃癌预后焦亡相关基因(PRGs),构建和评估风险模型并分析PRGs与免疫浸润的相关性,验证胃癌治疗的新靶点.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌的转录组和临床数据并筛选差异表达的PRGs.采用单因素Cox回归及LASSO回归分析差异表达的PRGs并构建预后模型.Kaplan-Meier生存曲线、受试者操作特征曲线评估模型的准确性及预后价值.根据风险评分中位数将患者分为高、低风险组,Cox回归风险模型评估风险评分与预后的相关性.胃癌基因芯片数据集GSE84437作为预测模型的外部验证.RT-qPCR和Western blot检测SERPINE1、Caspase-1、NLRP3 mRNA和蛋白表达量.结果 筛选35个差异表达PRGs,其中5个PRGs(CRTAC1、GPX3、IRGM、RGS2和SERPINE1)被纳入风险模型构建.年龄、M分期、N分期和风险评分是TCGA队列患者生存率的独立影响因素(P＜0.05);年龄、T分期和N分期是基因表达综合(GEO)队列患者生存率的独立影响因素(P＜0.05).TCGA、GEO队列中高风险组免疫细胞浸润水平、免疫相关途径活性总体均高于低风险组(P＜0.05).CRTAC1与CD4+T细胞(r=0.488)、巨噬细胞(r=0.588)和树突状细胞(r=0.332)的浸润水平呈正相关(P＜0.01);GPX3与CD4+T细胞(r=0.372)、巨噬细胞(r=0.572)和树突状细胞(r=0.406)的浸润水平呈正相关(P＜0.01);RGS2与CD4+T细胞(r=0.343)、巨噬细胞(r=0.526)和树突状细胞(r=0.326)的浸润水平呈正相关(P＜0.01);IRGM(r=0.327)、SERPINE1(r=0.310)与巨噬细胞的浸润水平呈正相关(P＜0.01).胃癌组织中SERPINE1表达水平高于正常胃组织(P＜0.05);高表达SERPINE1组的生存时间短于低表达SERPINE1组(P＜0.01).干扰组SERPINE1、Caspase-1、NLRP3 mRNA和蛋白表达量均低于阴性对照组(P＜0.05).结论 通过生物信息学方法筛选5个PRGs构建胃癌预后模型,SERPINE1高表达与胃癌不良预后相关,可能参与调控NLRP3/Caspase-1细胞焦亡途径.

湿地公园健康状态是开展湿地保护、修复与指导其规划设计的重要依据.近年来城市区域内湿地公园建设迅速但湿地生境整体衰退严重,如珠三角乃至华南地区湿地公园面临高度外部干扰与环境限制,亟需有效手段评估区域内湿地公园健康状态以实现可持续发展.以"稳定性-功能性-可持续性"为框架,构建了包含3准则11因素40指标的湿地公园健康评价指标体系,采用层次分析法计算指标权重,并通过遥感影像处理、实地调研、统计年鉴查阅以及问卷调查等方式获取指标数据,对生态修复后的广州海珠国家湿地公园二期进行综合健康评价与分析,以期指导其保护修复与可持续发展,为城市区域内湿地公园健康评估与优化提供参考.结果表明:(1)稳定性是影响湿地公园健康状态的主要准则,权重排序为稳定性(0.5094)＞功能性(0.3046)＞可持续性(0.1860);(2)海珠湿地二期综合健康指数为3.7735,呈健康状态;(3)影响二期健康状态的主要因素是生态功能与水体特征,其中,权重排序前5的主要指标为水质类别、净化能力、水文调节、水陆面积比、水体富营养化程度;(4)结合评价结果,从水体修复、植物管护、园区管理等方面提出优化建议.