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2020年陕西省布鲁氏菌MLVA分型研究及流行病学分析
编辑人员丨1周前
目的:了解陕西省布鲁氏菌病发病情况及分离菌株或核酸的基因型,掌握其流行病学及分子遗传特征,为陕西省人间布鲁氏菌病的精准防控提供科学依据。方法:登录中国疾病预防控制信息系统收集2020年陕西省人间布鲁氏菌病的发病数据,分析流行特征;应用细菌学及PCR方法对分离菌株或核酸进行鉴定,进一步采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法进行分子分型,利用BioNumerics(Version 7.6)软件对MLVA结果进行分析。结果:2020年陕西省共报告人间布病1 086例,发病率为2.80/10万,涉及86个县(区),流行高峰在3 - 9月(865例),男女性别比为2.68∶ 1.00(791∶ 295),30 ~ 69岁年龄段占79.74%(866例),农民占83.43%(906例)。36株分离菌株生物型鉴定结果显示,4株是羊种变异型,3株是羊种1型,29株是羊种3型。36株分离菌株及7份核酸经BCSP31-PCR均鉴定为布鲁氏菌属,经AMOS-PCR均鉴定为羊种布鲁氏菌。经MLVA-16分型,panel1结果显示有2种基因型:42型(1-5-3-13-2-2-3-2)、63型(1-5-3-13-2-3-3-2),panel2A结果显示均为4-41-8,panel2B结果显示具有高度的多变性;36株分离菌株及7份核酸分为33种基因型,其中27种基因型为单分离株,6种基因型为共享型。结论:陕西省人间布鲁氏菌病防控形势严峻。MLVA-16是一种成熟的基因分型方法,确定了陕西省布鲁氏菌分离株或核酸存在多种基因型,可为人间布鲁氏菌病精准防控、暴发疫情分析及流行病学溯源提供科学依据。
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编辑人员丨1周前
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青藏高原喜马拉雅旱獭分离布鲁氏菌的MLVA分型与溯源分析
编辑人员丨1周前
目的:观察青海省青藏高原喜马拉雅旱獭分离的布鲁氏菌的多位点可变数目串联重复序列分析(multiple locus variable-number tandem repeat analysis,MLVA)分型,探讨其与既往青海省布鲁氏菌分离菌株间的亲缘关系。方法:2019年3月至2020年10月,采集青海省青藏高原喜马拉雅旱獭全血样本,对虎红平板凝集试验(rose bengal test,RBT)布鲁氏菌抗体阳性样本进行病原体分离培养,采用传统生物学方法和分子生物学方法(BCSP31-PCR和AMOS-PCR方法)进行菌株鉴定。同时,应用MLVA方法对分离菌株进行基因分型,并结合既往青海省不同宿主分离的70株布鲁氏菌的基因型,应用聚类分析方法探讨菌株间的亲缘关系。结果:共采集青藏高原喜马拉雅旱獭全血样本1 466份,从其中64份RBT阳性样本中分离培养出2株布鲁氏菌,分别命名为QH2013054、QH2013062,经传统生物学和分子生物学方法鉴定为羊种布鲁氏菌生物Ⅲ型。MLVA分型结果显示,QH2013054与QH2013062菌株在Bru16位点有差异,为不同的MLVA基因型。聚类分析结果显示,QH2013054菌株与7株菌株具有相同的MLVA基因型,其中6株来自共和县同一个家庭的3名农民和3只羊,1株来自门源回族自治县农民;QH2013062菌株与4株菌株具有相同的MLVA基因型,其中3株来自门源回族自治县的3名农民,1株来自互助土族自治县农民。结论:从青海省青藏高原喜马拉雅旱獭中分离的布鲁氏菌与在本省人、羊中分离的部分布鲁氏菌具有相同的MLVA基因型,推测宿主人、羊、青藏高原喜马拉雅旱獭可能具有共同的传染源。
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编辑人员丨1周前
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河北省保定市一起人间布鲁菌病聚集性疫情分离菌株遗传学特征分析
编辑人员丨1周前
目的:分析河北省保定市1起人间布鲁菌病(简称布病)聚集性疫情的流行病学和分离菌株遗传学特征,为布病疫情防控提供科学依据。方法:采用虎红平板凝集试验和试管凝集试验对2018年保定市1起人间布病疫情中的高危人群( n=22)进行布鲁菌抗体检测;对布病患者( n=3)血液进行培养,对分离出的菌株进行传统法鉴定,运用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLST)方法分析菌株的遗传学特征。 结果:高危人群血清布鲁菌抗体阳性率为4.55%(1/22)。3名患者血培养均检出布鲁菌可疑菌株(菌株编号:BDY-1、BDY-2、BDY-3),并鉴定为羊种生物3型布鲁菌。MLVA结果显示,BDY-1与BDY-2菌株是同一基因型,BDY-3菌株在Bruce04和Bruce16位点分别增加了2个串联重复序列,在Bruce30位点少了3个串联重复序列,3株菌株panel 1(MLVA-8)基因型为42,panel 1 + panel 2A(MLVA-11)基因型为116,均属于"东地中海组",且与羊种生物3型布鲁菌聚类最近。MLST分析显示,3株菌株均为ST8型。结论:该起疫情的病原菌是羊种生物3型布鲁菌。今后保定市布病防控工作应加强高危人群的健康教育和行为干预。
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编辑人员丨1周前
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天津地区儿童感染肺炎支原体基因型特征分析及其临床特点
编辑人员丨1周前
目的:了解天津地区儿童感染肺炎支原体( Mycoplasma pneumoniae, Mp)的基因分型、亚型的流行状况及其临床特点。 方法:以2017年12月—2019年12月天津市儿童医院收治住院的肺炎患儿作为研究对象,行纤支气管镜术取支气管肺泡灌洗液(BALF)。采用实时荧光定量PCR技术检测 Mp培养成功后的阳性标本,进行限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)分型。所有病例均搜集详细临床资料和实验室数据。 结果:经实时荧光定量PCR和分离培养方法确认后共得到 Mp阳性菌株175例,RFLP分型结果显示,Ⅰ型138例(78.9%),Ⅱ型37例(21.1%);MLVA分型结果显示,M3-5-6-2型37例,有B、G、M、S、V、Y这6个亚型;检出M4-5-7-2 138例,有E、J、P、U、X、Z和a这7个亚型。M3-5-6-2型中有P1-Ⅰ型1例(2.7%),P1-Ⅱ型36例(97.3%);M4-5-7-2型中有P1-Ⅰ型137例(99.2%),P1-Ⅱ型1例(0.7%)。不同基因型在不同年龄组间分布差异无统计学意义。M3-5-6-2基因型中的B、G、M、S、V、Y型与M4-5-7-2基因型中的E、J、P、U、X、Z、a型共13个基因型在四季分布中有统计学差异。所有 Mp感染患儿均有发热和咳嗽的症状。P1-Ⅰ/M4-5-7-2型肺炎患儿在住院时长、发热时长、高热(>39℃)、咳嗽时长、皮肤改变、消化系统症状、肝功能损伤发生率等方面均高于P1-Ⅱ/M3-5-6-2型肺炎患儿,但差异没有统计学意义。P1-Ⅱ型及M3-5-6-2型白细胞计数高于Ⅰ型及M4-5-7-2型;P1-Ⅰ型及M4-5-7-2型乳酸脱氢酶高于Ⅱ型及M3-5-6-2型,且差异有统计学意义。不同基因型患儿在炎性实变、肺不张、胸膜增厚和胸腔积液的发生率差异无统计学意义。 结论:天津地区肺炎患儿感染 Mp以P1-Ⅰ型/M4-5-7-2型为主,P1-Ⅱ型有上升趋势;P1-Ⅰ型及M4-5-7-2型与临床发热、重症表现等存在一定相关性。
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编辑人员丨1周前
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江西省羊种布鲁氏菌分子流行病学特征分析
编辑人员丨1周前
目的:掌握江西省羊种布鲁氏菌分子特征,了解分离菌株流行病学间相关性。方法:采用多位点可变数目串联重复序列分析方法(MLVA)对江西省17个县(区)25株人分离羊种布鲁氏菌进行分析。结果:25株羊种布鲁氏菌聚类可分为24个独立基因型,相似度为67.00%~100.00%,辛普森指数在0.000~0.773之间,MLVA8型有3个基因型,60.00%(15/25)为42型,32.00%(8/25)为43型,8.00%(2/25)为63型。MLVA11型有7个基因型,116、125型为主要基因型,两型菌株占56.00%(14/25)。结论:25株人分离羊种布鲁氏菌基因具有高度遗传多样性,菌株基因型繁多,各菌株间无明显流行病学相关性,表明江西省羊种布鲁氏菌传染来源复杂。
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编辑人员丨1周前
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2022年山东省烟台市1起人间布鲁氏菌病聚集性疫情溯源分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨山东省烟台市1起人间布鲁氏菌病(简称布病)聚集性疫情的潜在传染源。方法:收集2022年山东省烟台市1起人间布病聚集性疫情病例信息,分离培养菌株并提取DNA,采用BCSP31-PCR进行种属鉴定,AMOS-PCR进行种型鉴定。采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)-16进行聚类分析,并与公共数据库MLVAbank和2022年山东省布鲁氏菌监测数据进行比对分析。同时,采用全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)分型分析2022年山东省已完成全基因组测序的53株布鲁氏菌菌株,构建wgSNP系统发育树。结果:经BCSP31-PCR和AMOS-PCR鉴定,2022年山东省烟台市布病聚集性疫情相关的3株菌株均为羊种布鲁氏菌生物型。MLVA-16分型结果显示,3株分离菌株的MLVA-16分型完全一致,16个串联重复序列位点为1-5-3-13-2-2-3-2-4-41-8-4-4-3-6-5,属于东地中海分支。与MLVAbank进行比对检索,有2株哈萨克斯坦分离菌株的MLVA-16分型与本次结果一致;与2022年山东省布鲁氏菌监测数据比对分析发现,有11株分离菌株的MLVA-16分型与本次结果一致,分别分离自枣庄、临沂、泰安、烟台、潍坊市。wgSNP分型结果显示,11株布鲁氏菌菌株与本次分离菌株的距离小于7个单核苷酸多态性,分别分离自泰安、淄博、临沂、滨州、济南、济宁、烟台和威海市。结论:经2022年山东省烟台市1起人间布病聚集性疫情溯源,临沂、泰安、烟台市分离羊种布鲁氏菌菌株的亲缘关系较近,推测这些地区的羊只具有同源性。
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编辑人员丨1周前
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家庭聚集性感染布鲁氏菌的鉴定及同源性分析
编辑人员丨1周前
目的:鉴定1起家庭聚集性感染的布鲁氏菌种型并分析同源性。方法:以2022年5月在江苏省连云港市第一人民医院就诊的同一家庭来源的2例布鲁氏菌病(简称布病)患者作为研究对象,经血培养分离布鲁氏菌菌株(H4LYG01和H2LYG02)。采用全自动微生物质谱检测系统对2株分离菌株进行种型鉴定和同源性分析,采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)及多位点序列分型(MLST)对分离菌株进行分子分型。结果:鉴定结果,H4LYG01和H2LYG02均为马耳他布鲁氏菌,鉴定的可信性得分分别为9.745、9.627分,同源性为100%。MLVA结果,H4LYG01和H2LYG02的基因位点完全相同,为同一个基因型。MLST结果,H4LYG01和H2LYG02的序列型(ST)均为ST8型。结论:1起家庭聚集性感染的2例布鲁氏菌菌株均为马耳他布鲁氏菌,且为同一来源。
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编辑人员丨1周前
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非布鲁菌病疫区江苏省连云港市13株布鲁菌分离株的MLVA基因分型特征分析
编辑人员丨1周前
目的:了解非布鲁菌病疫区江苏省连云港市布鲁菌分离株的基因分型特征。方法:对2018年连云港市第一人民医院临床微生物室血培养分离的13株疑似布鲁菌菌株进行初步鉴定;同时,采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测布鲁菌特异性基因bcsp31和插入序列IS-711,对鉴定结果进行复核和分型。运用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)进行基因分型,测序结果用Mega 4.0软件进行编辑。结果:13株分离株经初步鉴定均为布鲁菌属。经Real-time PCR检测,13株分离株均为羊种布鲁菌。MLVA结果显示,13株羊种布鲁菌分为12个基因型,且聚类在"中地中海簇"中。13株羊种布鲁菌中有3株生物1型、2株生物2型和8株生物3型。结论:连云港市分离的布鲁菌菌株均为羊种布鲁菌,MLVA聚类在"中地中海簇"中。
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百日咳鲍特菌的基因多样性及分子流行病学分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨百日咳鲍特菌临床流行株的基因多样性分子流行病学特征,并分析该地区百日咳复现的可能原因。方法:采用多位点抗原序列分型(MAST)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)对2012—2017年的临床分离株进行基因多样性和分子流行病学特征分析,并与疫苗株进行比较。结果:流行株与疫苗株的分子型别特征不同。95%的流行株抗原基因型为 prn1/ ptxP1/ ptxA1/ fim3-1/ fim2-1;8种MLVA型别中MT195(34%)、MT55(30%)和MT104(26%)占主导地位,其中MT195分离率连年增长。 结论:陕西省当前流行百日咳菌株基因特征与疫苗株不同,流行株通过基因变异发生进化可能是近年来该地区百日咳复现的原因之一。
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编辑人员丨1周前
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中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析基因型多态性
编辑人员丨1周前
目的:分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法:收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编号和命名,分析不同来源菌株MLVA基因型的分布特征,同时通过Bionumerics软件绘制聚类图,分析不同基因型间的遗传关系。结果:MLVA15分型可将533株中国炭疽芽胞杆菌分为4群91个基因型,其中54个基因型为中国独有的基因型。新命名的基因型MLVA15-CHN1~MLVA15-CHN6广泛分布于中国不同地区、不同年代和宿主,其余基因型具有地区和年代特征性。结论:本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库,掌握了MLVA基因型分布特征及其遗传多态性,为中国炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。
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编辑人员丨1周前
