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FUT8水平与肺磨玻璃结节良恶性的相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:分析血清α-1,6岩藻糖基转移酶(FUT8)在良恶性肺磨玻璃结节(GGN)中的表达差异,探讨其作为GGN诊治的潜在生物标志物的意义和可行性。方法:观察性研究。采用非随机抽样的方法选取大连医科大学附属第一医院2020年9月至2021年2月经胸部高分辨率CT确诊为GGN并住院接受胸外科手术的患者作为试验组(98例),根据术后病理结果将试验组分为良性GGN组(18例)和恶性GGN组(80例)。同时选取同期行胸部高分辨率CT未发现GGN的健康体检人群作为对照组(22名)。通过酶联免疫吸附试验(ELISA)和蛋白质印迹法(Western blot)检测3组研究对象血清FUT8的表达水平。分析癌胚抗原(CEA)、鳞状细胞癌抗原(SCC-Ag)、细胞角蛋白19片段抗原21-1(CYFRA21-1)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)与FUT8水平的相关性。采用受试者工作特征曲线评估FUT8对恶性GGN的诊断效能。结果:通过ELISA法测定恶性GGN组、良性GGN组、对照组的血清FUT8水平分别为199.82(184.27,213.85)μg/L、139.63(132.32,199.48)μg/L、173.48(120.40,206.01)μg/L,差异有统计学意义( H=19.04, P<0.05);恶性GGN组血清FUT8水平均高于良性GGN组和对照组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。Western blot进一步检测血清FUT8蛋白的表达,恶性GGN组、良性GGN组、对照组的血清FUT8蛋白的表达水平分别是16 638.47±1 822.89、2 053.24±113.36、3 619.83±726.40,差异有统计学意义( F=49.78, P<0.001);恶性GGN组患者FUT8蛋白的表达均高于良性GGN组及对照组患者,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。CEA、SCC-Ag、CYFRA21-1、NSE水平与FUT8水平均无相关性(均 P>0.05)。FUT8对恶性结节诊断的受试者工作特征曲线下面积是0.744(95% CI:0.637~0.852, P<0.01),约登指数为0.525,最佳截断值为148.30 μg/L,敏感度为98.75%,特异度为52.50%。 结论:FUT8表达水平在恶性GGN患者血清中上调,可以作为恶性GGN辅助诊断的生物标志物之一。
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编辑人员丨1周前
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FUT1基因两种新的变异检测与一例类孟买型血型的家系分析
编辑人员丨1周前
目的:鉴定罕见的类孟买型Bm h,并研究其分子遗传背景。 方法:应用血清学方法鉴定先证者及其家系成员的红细胞ABO及H表型,采用聚合酶链反应-序列特异性引物基因分型方法检测先证者ABO血型基因型。应用扩增产物直接测序法和克隆测序法分析类孟买表型家系的α-1,2-岩藻糖基转移酶基因( FUT1)编码序列。 结果:先证者为罕见的类孟买Bm h型, ABO基因型为 ABO* B.01/ ABO* O.01.01型,测序发现 FUT1基因存在c.508dupT及c.787A>C两种变异, FUT1基因型为h 508dupT/h 787C。蛋白活性分析软件预测这两种变异均会造成酶失活,与血清学结果一致。 结论:鉴定了c.508dupT及c.787A>C两种 FUT1新等位基因,尚未见报道,且其为引起先证者类孟买表型的分子机理。
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编辑人员丨1周前
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岩藻糖基转移酶8在肿瘤发生和转移中的研究进展
编辑人员丨1周前
肿瘤的侵袭和转移是一个多因素、多步骤的动态过程。疾病的发生常伴随着糖基化的改变,尤其是蛋白糖基化的异常。研究结果显示岩藻糖基转移酶8(FUT8)的改变与多种恶性肿瘤的发生发展有关。FUT8在多种肿瘤细胞中表达水平明显增高,通过上调底物分子的核心岩藻糖基化修饰,参与细胞的恶性化过程与肿瘤的发展与转移。因此,利用FUT8的生物学特点,可为肿瘤的诊断和治疗提供新策略。
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编辑人员丨1周前
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双等位基因杂合性碱基缺失致类孟买血型一例
编辑人员丨1周前
目的:研究1例类孟买型血型的分子遗传机制。方法:用血型血清学方法鉴定该献血者红细胞ABO和Lewis血型抗原表型,用PCR扩增类孟买表型个体的 ABO基因第6、7外显子和 FUT1基因全编码区,对PCR产物直接测序分析,并对 FUT1基因的2处变异位点进行单倍体序列分析。 结果:血型血清学鉴定先证者为罕见的B型类孟买表型。直接测序发现先证者 ABO基因为B.01/O.01.02杂合子; FUT1基因第881~882位和768位存在杂合性碱基缺失,进一步的单倍体分析显示其中1条单倍体存在c.881_882delTT,另1条单倍体存在c.768delC,基因型为 FUT1*01N.13/01N.20杂合子,2个等位基因分别导致多肽链p.Phe294Cysfs*40和p.Val257Phefs*23移码变异。 结论:在献血人群中发现1例罕见的双等位基因复合杂合性碱基缺失导致的类孟买表型,其分子机制为c.881_882delTT和c.768delC所致的α-1,2岩藻糖基转移酶活性减弱。
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编辑人员丨1周前
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基于转录组学数据探讨岩藻糖基转移酶Ⅶ在脑胶质瘤中的表达及意义
编辑人员丨1周前
目的:基于转录组学数据筛选影响脑胶质瘤恶性进展及替莫唑胺耐药的关键基因,分析其在脑胶质瘤中的表达及意义。方法:本研究通过分析GSE23806数据库(63株细胞株)、癌症体细胞突变目录(COSMIC)数据库(34株细胞株)及中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)计划数据库(325例患者)中的转录组学数据,分别筛选出在胶质瘤干细胞中高表达的差异基因、在替莫唑胺耐药细胞中高表达的差异基因以及与胶质母细胞瘤恶性预后相关的基因,进而筛选出共同差异基因。通过CGGA与癌症基因组图谱(TCGA)计划数据库(636例患者)验证该基因在不同世界卫生组织(WHO)级别、不同四分型亚型的脑胶质瘤中的表达差异;采用Kaplan-Meier生存曲线比较该基因表达量不同的胶质母细胞瘤患者总生存期的差异;通过单因素和多因素Cox回归分析研究该基因对脑胶质瘤患者总生存期的影响;通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其潜在的生物学功能。结果:通过分析共同差异基因,筛选出岩藻糖基转移酶Ⅶ( FUT7)作为目标基因。 FUT7在胶质瘤干细胞中呈现高表达( P=0.025),且在替莫唑胺耐药的细胞中高表达( P=0.033)。在CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中, FUT7在WHO Ⅱ、Ⅲ及Ⅳ级组间表达量的差异有统计学意义(均 P<0.001),其中Ⅳ级中表达量最高,Ⅱ级中表达量最低;两数据库中, FUT7在四分型组间表达量的差异均有统计学意义(均 P<0.001),均在间质型中表达量最高。CGGA数据库和TCGA数据库中具有生存数据的胶质母细胞瘤患者(分别为138例和168例)中, FUT7高表达者比低表达者生存期短( P=0.002和 P=0.013);单因素分析结果显示, FUT7的表达量、放疗及化疗均为胶质母细胞瘤患者总生存期的影响因素(均 P<0.05);多因素Cox回归分析结果显示, FUT7表达量、放疗及化疗均为影响胶质母细胞瘤患者总生存期的独立危险因素(均 P<0.001)。GO功能富集分析显示, FUT7表达量正相关的基因富集在免疫反应、炎性反应、凋亡、趋药性、白细胞迁移及细胞增殖等功能上。KEGG通路富集分析显示, FUT7正相关的基因富集在JAK-STAT信号通路、TNF信号通路及NF-κB信号通路上。 结论:FUT7可能是影响脑胶质瘤恶性进展及替莫唑胺耐药的基因,其机制可能与免疫反应、炎性反应、凋亡、趋药性、白细胞迁移及细胞增殖功能,JAK-STAT3和NF-κB等信号通路有关。
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编辑人员丨1周前
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湖南省某医院类孟买血型血清学鉴定及基因突变分析
编辑人员丨1周前
本研究旨在探讨湖南省某医院患者类孟买血型的血清学特点和基因特征。回顾性分析中南大学湘雅三医院2016—2021年籍贯为湖南省的175 439例住院患者的ABO血型结果,采用标准血型血清学方法对研究标本进行ABO血型鉴定,以序列特异引物引导的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction-sequence specific primers,PCR-SSP)方法进行 ABO基因分型及测序,对岩藻糖基转移酶1(fucosyltransferase 1, FUT1)和岩藻糖基转移酶2(fucosyltransferase 2, FUT2)基因进行分析。结果显示,共检出4例类孟买血型,其中3例为A h,1例为B h。 FUT1基因测序结果显示,2例为 h3h3突变,1例为 h1h1突变,1例为 h 302h1 突变,其中 h 302(c.302C>T)为首次新发现的突变。 FUT2基因测序结果显示4例均为 Se 357Se 357。家系研究结果表明类孟买血型的遗传方式符合常染色体显性遗传。综上,本研究患者的导致类孟买血型的 FUT1基因突变包括 h3、 h1以及新发现的 h 302共3种,其中以 h3突变最多见。
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编辑人员丨1周前
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蛋白-O-岩藻糖基转移酶1在非小细胞肺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2024/7/20
目的 探讨非小细胞肺癌中蛋白-O-岩藻糖基转移酶1的表达及其临床意义,为非小细胞肺癌的诊断和治疗提供参考依据.方法 通过TCGA、UALCAN数据库和免疫组化技术探讨POFUT1 mRNA和POFUT1蛋白在非小细胞肺癌的表达情况.提取TCGA数据库的临床数据,采用Kaplan-Meier法进行生存分析,采用COX比例风险回归模型分析POFUT1 mRNA表达水平对非小细胞肺癌患者预后的影响.结果 POFUT1 mRNA和POFUT1蛋白在肺腺癌和肺鳞癌组织中均高表达(均P<0.05).肺腺癌中POFUT1 mRNA的表达水平与临床分期相关(P<0.001),肺鳞癌中POFUT1 mRNA的表达与肿瘤直径相关(P<0.001).COX回归分析结果显示,POFUT1 mRNA高表达(P=0.012)、肿瘤直径、临床分期、淋巴结转移与肺腺癌患者预后相关(均P<0.001),临床Ⅲ-Ⅳ期是肺腺癌患者独立危险因素.肿瘤直径(P=0.001)、临床Ⅲ-Ⅳ期(P=0.006)和POFUT1 mRNA高表达(P=0.049)与肺鳞癌患者预后相关,肿瘤直径大于5cm和POFUT1高表达是肺鳞癌患者独立危险因素.生存分析结果显示POFUT1高表达的非小细胞肺癌患者生存率显著低于低表达患者.结论 POFUT1在非小细胞肺癌组织中高表达,且其高表达与患者不良预后相关,可作为非小细胞肺癌预后评估的生物标志物.
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编辑人员丨2024/7/20
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FUT7低甲基化和CT影像在肺浸润性腺癌中列线图预测模型的构建及评估
编辑人员丨2024/7/6
目的 基于FUT7低甲基化和CT影像构建列线图模型预测肺浸润性腺癌(invasive adenocarci-noma cancer,IAC)发生的风险.方法 回顾性分析114例经术后病理确诊为肺腺癌和腺体前驱病变肺结节患者的临床和CT影像资料,检测其血液中FUT7甲基化水平.根据病理结果分为浸润性腺癌组和侵袭前病变组,采用单因素分析和多因素Logistic回归构建列线图模型.效能评价使用受试者工作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC)、校准曲线(calibration curve)、决策曲线分析法(decision curve analysis,DCA).结果 浸润性腺癌组组较侵袭前病变组FUT7_CpG_1和FUT7_CpG_4甲基化水平更低,肺窗最长径更大,结节形状更不规则,混杂磨玻璃结节、毛刺征、分叶征和胸膜征占比更高(P<0.05).其中FUT7_CpG_1、肺窗最长径、结节性质(实性、混杂磨玻璃)和毛刺征是IAC的独立影响因素(P<0.05).列线图模型的ROC曲线下面积为0.934(95%CI:0.889~0.979,P<0.001),最大约登指数对应的临界值为0.476,此时敏感度为93.24%,特异度为80.00%,阳性预测值为89.61%,阴性预测值为86.48%.校准曲线显示列线图预测IAC的概率与实际概率高度一致.DCA曲线显示阈概率值为0.06~0.80时,列线图具有较高的临床净收益.结论 血液中FUT7_CpG_1和FUT7_CpG_4低甲基化是诊断IAC的新型潜在生物标志物.列线图模型在早期识别IAC具有较高的诊断效能和应用价值,可以为临床医生决策提供理论参考.
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编辑人员丨2024/7/6
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基于生物信息学分析POFUT1表达与肿瘤免疫浸润水平及患者预后的相关性研究
编辑人员丨2024/4/27
目的 分析蛋白-O-岩藻糖基转移酶 1(protein O-fucosyltransferase 1,POFUT1)表达与肿瘤免疫浸润水平及患者预后的关系,探索POFUT1 在肿瘤免疫治疗方面的价值.方法 基于泛癌数据利用R软件分析各类肿瘤组织中POFUT1 表达水平变化及其与各类肿瘤患者风险比的相关性,筛选患者预后与POFUT1 表达相关的肿瘤类型;利用String数据库构建蛋白质互作网络,筛选以POFUT1 关联基因并进行功能富集分析;利用estimate包分析所筛选肿瘤组织POFUT1 表达与免疫浸润评分的相关性;利用TIMER数据库分析肿瘤组织POFUT1 表达与各类免疫细胞浸润水平的相关性及免疫细胞浸润水平与患者预后的相关性.结果 POFUT1在14类肿瘤中的高水平表达差异具有统计学意义(均P<0.05),与低级别胶质瘤、肺腺癌、甲状腺癌的不良预后相关(Hazard Ratio>1,P<0.05);POFUT1 及其关联基因高度参与Notch信号通路、淋巴细胞激活及免疫过程调控进程;POFUT1 表达水平与低级别胶质瘤中的B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞与树突状细胞、肺腺癌中的中性粒细胞、甲状腺癌中的B细胞、CD4+T细胞及巨噬细胞的浸润程度均呈正相关(|r|>0.2,P<0.05);上述 6 类免疫细胞高浸润程度均与低级别胶质瘤患者较差的预后相关(Hazard Ratio>1,P<0.05).结论 POFUT1 通过对免疫调控相关进程的高度参与,对部分肿瘤免疫浸润水平产生影响并影响患者预后,具有成为免疫治疗靶点的潜力.
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编辑人员丨2024/4/27
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复方生脉成骨胶囊修复激素性股骨头坏死的作用机制
编辑人员丨2024/1/6
背景:复方生脉成骨胶囊治疗早期激素性股骨头坏死的疗效佳,但具体治疗机制尚不完全明确.目的:观察复方生脉成骨胶囊干预对激素性股骨头坏死大鼠骨组织中岩藻糖基转移酶8、成骨基因及Wnt/β-catenin信号通路蛋白表达的影响.方法:取60只雄性SD大鼠,采用随机数字表法分为空白组、模型组、中药低剂量组、中药中剂量组及中药高剂量组,每组12只.模型组和中药低、中、高剂量组通过皮下注射咪喹莫特(每2周一次,共2次)与臀肌注射甲强龙(1次/周,共4次)的方法建立激素性股骨头坏死模型,末次造模给药后第2天,中药低、中、高剂量组分别灌胃给予1.89,3.78,7.56 g/(kg·d)的复方生脉成骨胶囊溶液,模型组灌胃给予等量生理盐水,连续给药8周.给药结束后,分别进行股骨头micro-CT扫描、组织学染色、压缩实验、RT-qPCR及Western blot检测.结果与结论:①micro-CT扫描显示,与空白组比较,模型组大鼠骨小梁体积分数、骨小梁数量及骨小梁厚度减少(P<0.05),骨小梁离散度增加(P<0.05);与模型组比较,中药低、中、高剂量组骨小梁体积分数、骨小梁数量及骨小梁厚度增加(P<0.05),骨小梁离散度减少(P<0.05),且呈剂量依赖性.②苏木精-伊红染色显示,与模型组比较,中药低、中、高剂量组空骨陷窝率减少(P<0.05),且呈剂量依赖性;免疫组化染色显示,与空白组比较,模型组岩藻糖基转移酶8、Runx2、骨形态发生蛋白2的蛋白表达降低(P<0.05);与模型组比较,中药低、中、高剂量组岩藻糖基转移酶8、Runx2、骨形态发生蛋白2的蛋白表达升高(P<0.05),且呈剂量依赖性.③压缩实验显示,与模型组相比,中药低、中、高剂量组股骨头最大载荷及弹性模量升高(P<0.05),且呈剂量依赖性;④RT-qPCR及Western blot检测显示,与空白组相比,模型组岩藻糖基转移酶8、Runx2、碱性磷酸酶、骨钙素、成骨细胞特异性转录因子及骨形态发生蛋白2的mRNA与蛋白表达降低(P<0.05);与模型组相比,中药低、中、高剂量组上述指标的mRNA与蛋白表达升高(P<0.05),且呈剂量依赖性.与空白组比较,模型组Wnt2、低密度脂蛋白受体相关蛋白5及β-连环蛋白的mRNA与蛋白表达降低(P<0.05),糖原合成酶激酶3β的mRNA与蛋白表达升高(P<0.05);与模型组比较,中药低、中、高剂量组Wnt2、低密度脂蛋白受体相关蛋白5及β-连环蛋白的mRNA与蛋白表达升高(P<0.05),糖原合成酶激酶3β的mRNA与蛋白表达降低(P<0.05),且呈剂量依赖性.⑤结果表明,复方生脉成骨胶囊治疗激素性股骨头坏死的机制可能是通过上调岩藻糖基转移酶8表达来激活Wnt/β-catenin信号通路,促进骨形成.
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编辑人员丨2024/1/6