目的:近年来菌群成为研究热点，而口腔菌群的一些背景状况，如年龄的差异化表现尚有待澄清。本研究拟对少年期与成年期的唾液菌群差异开展前瞻性研究。方法:本研究为前瞻性研究，纳入来自北京大学口腔医院的52例门诊患者，在平衡了性别、民族、地区、症状、压力、口腔伴随疾病等因素后，组成少年组26例，年龄的中位数(上下四分位数距)为14(1)岁，男性比例26.9%；成年组26例，年龄的中位数(上下四分位数距)为35(7)岁，男性比例15.4%。两组研究对象均除外深龋、有窦型慢性根尖周炎、重度牙周炎、严重牙列拥挤、明显腺样体或扁桃体肥大、口腔黏膜疾病，颞下颌关节紊乱病诊断情况、关节调查Fonseca记忆指数(Fonseca anamnestic index, FAI)、压力状态水平、睡眠质量即匹兹堡睡眠质量指数(Pittsburgh sleep quality index, PSQI)在两组间无统计学差异。在清晨非刺激条件下采集口腔唾液，进行16S rRNA基因测序分析，对两个年龄组的结果分析比较。结果:少年组和成年组的唾液菌群 α多样性差异没有统计学意义，然而 β多样性呈现明显区别(Bray-Curtis距离 F值＝3.044， P＝0.001；Jaccard距离 F值＝1.670， P＝0.001)，菌群构成上的丰度差异比较明显，差异具有统计学意义。属水平的显著富集菌群，在少年组是普雷沃菌属、放线菌属、奇异菌属、乏养菌属、乳杆菌属，在成年组是嗜血杆菌属、卟啉单胞菌属、隐蔽菌_(SR1)_[G-1]、密螺旋体属、小单胞菌属、土地杆菌属、坦纳菌属、毛螺菌科_[G-8]、厌氧球形菌属、毛螺菌科_[G-3]。功能预测在两组间亦有区别，少年组涉及半胱氨酸与蛋氨酸代谢、半乳糖代谢、磷酸肌醇代谢、淀粉和蔗糖代谢以及光合作用通路，成年组涉及生物素代谢、丁酸代谢、硫辛酸代谢、甲烷代谢、蛋白质外排、RNA降解以及霍乱肠毒素致病循环。 结论:少年组的特异菌群含有常驻菌、益生菌，成年组与感染相关致病菌的种类增加。今后在进行口腔菌群分析时须区分少年与成年。

目的:阐明牙周基础治疗对伴或不伴2型糖尿病（type 2 diabetes mellitus，T2DM）的牙周炎患者口腔微生态菌群动态变化的影响。方法:收集来自山东大学齐鲁医学院口腔医学院·口腔医院牙周科的14例单纯慢性牙周炎（chronic periodontitis，CP组）患者和14例伴T2DM的CP（CP-T2DM组）患者，采集所有患者基线、牙周基础治疗后1.5和3个月的唾液、舌背及4个象限第一磨牙近中颊侧的龈下菌斑样本，利用16S rRNA（V3-V4区）基因测序方法检测样本内微生物。对测序数据进行分析获得两组患者的微生物分布和群落结构信息。牙周基础治疗前后均由同一名牙周主治医师根据牙周检测指标对患者牙周状况进行评估，同时收集患者血液，并对其相关代谢指标进行评估。结果:牙周基础治疗后3个月CP-T2DM组糖化血红蛋白［（7.46±1.69）%］与基线［（7.65±1.34）%］相比差异无统计学意义（ t=0.52， P=0.610），治疗后3个月CP组及CP-T2DM组探诊深度［CP组：（2.94±0.46）mm，CP-T2DM组：（2.95±0.35）mm］及出血指数（CP组：1.91±0.42，CP-T2DM组：1.67±0.49）均较基线时的探诊深度［CP组：（3.99±0.77）mm，CP-T2DM组：（3.80±0.76）mm］（ F=25.61， P<0.001； F=17.63， P<0.001）和出血指数（CP组：3.03±0.52，CP-T2DM组：2.54±0.65）（ F=28.43， P<0.001； F=20.21， P<0.001）显著下降。菌群分析显示，基础治疗前后CP及CP-T2DM组内相同位点α及β多样性指数变化差异均无统计学意义（ P>0.05）。治疗前后CP及CP-T2DM组各位点微生物组成相似，但各位点菌群丰度发生改变，治疗后CP及CP-T2DM组唾液和舌背样本中变形菌门相对丰度与各自组内龈下菌斑变化趋势基本一致，在CP组龈下菌斑中变形菌门相对丰度随牙周基础治疗时间延长呈逐渐上升趋势，在CP-T2DM组龈下菌斑中，变形菌门相对丰度随牙周基础治疗时间的延长呈先上升后下降的趋势。CP及CP-T2DM组基线龈下菌斑中互养菌门、脱硫代硫酸盐弧菌科、甲烷短杆菌属、TG5菌属较基础治疗后3个月均呈现为特征优势菌（ P<0.05），此外螺旋体在CP-T2DM组基线呈现显著优势，CP-T2DM组治疗后1.5个月根瘤菌目、产碱杆菌科、丛毛单胞菌科、代尔夫特菌属、布劳特氏菌属等在龈下菌斑中呈现显著差异优势（ P<0.05），治疗后3个月时厚壁菌门、梭菌纲/目、肠球菌科、瘤胃球菌科等呈现显著差异优势（ P<0.05）。 结论:除龈下菌斑外，唾液和舌背菌斑可在一定程度上反映牙周基础治疗对口腔菌群微生物动态变化的影响；CP及CP-T2DM组患者在微生物组成及对治疗的反应上均存在差异。

目的 了解江苏省天然温泉场所温泉水中微生物污染现况、分布特征及其影响因素,探讨温泉水微生物污染的控制措施.方法 于2021年调查江苏省4市8家温泉场所基本情况,检测温泉水中6种微生物的污染情况和分布特征,鉴定异养菌的细菌种群,分析理化因素、消毒措施、管理措施对微生物超标的影响.结果 温泉水中菌落总数、异养菌、大肠杆菌、耐热大肠菌群、嗜肺军团菌、铜绿假单胞菌合格率或阳性率分别为86.5％、35.1％、83.8％、13.5％、8.1％、24.3％,异养菌鉴定出6个菌属;室内温泉池中菌落总数高于其它场所(x2=12.838,P＜0.05),总大肠菌群、耐热大肠菌群、军团菌仅在室内温泉池和室外温泉池有超标,异养菌和铜绿假单胞菌在所有水体均超标;水温和池水循环使用对微生物超标均有影响,水温≥40℃时菌落总数、异养菌、总大肠菌群、耐热大肠菌群合格率升高(x2分别为4.912、4.609、6.098、4.912,P＜0.05),循环使用的温泉水菌落总数和嗜肺军团菌合格率降低(x2分别为5.025、3.909,P＜0.05).结论 温泉场所水中微生物存在不同程度超标现象,建议对温泉水采用适宜的消毒措施,控制温泉水更换频率,将温泉场所纳入公共场所卫生监管范畴.

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight massspectrometry,MALDI-TOF MS)技术,简称飞行质谱技术,可在短时间内完成对微生物种属水平的鉴定[1].基本原理是使用已知菌种的蛋白质图谱建立数据库,利用不同菌种核糖体蛋白(2～20 kD)大小的差异,将未知样本的检测图谱与数据库中的微生物参考图谱进行比对,鉴定结果[2-3].与传统的微生物表型和生理生化检测方法相比,质谱鉴定的分子量范围大、扫描速度快、操作通量高,且对样品纯度要求不高[4].除了可鉴定常见细菌和真菌,对临床厌氧菌、苛养菌、丝状真菌以及分枝杆菌等疑难微生物和相对复杂样品的鉴定能力也更强,同时对耐药微生物的鉴定准确性相对较好[5].

甲醇来源丰富、价格低廉,已成为生物制造行业极具吸引力的底物之一.构建微生物细胞工厂实现甲醇到增值化学品的生物转化,具有过程绿色、条件温和、产品体系多样等优势,不仅能拓展基于甲醇的产品链,还能缓解当前生物制造"与民争粮、与粮争地"的问题,是实现绿色生物制造的重要手段.因此,阐明不同天然甲基营养菌中涉及甲醇氧化、甲醛同化和异化途径对于后续基因工程改造工作至关重要,也更有利于构建新型非天然甲基营养菌.本文讨论了甲基营养菌中甲醇代谢途径的研究现状,并结合近年来天然和人工合成甲基营养菌在甲醇生物转化中的应用进展及面临的挑战.

目的 采用16S rRNA测序方法分析耐碳青霉烯类肠杆菌(CRE)定植对重症监护病房(ICU)患者肠道微生物的影响.方法 收集ICU患者新鲜粪便或肛拭子标本,接种于含有2 μg/mL厄他培南的MacConkey平板上培养.采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对菌株进行鉴定,纸片扩散法对菌株进行药敏分析,采用聚合酶链式反应(PCR)对初步筛查出的CRE菌株进行16S rDNA片段扩增,采用微量肉汤稀释法进一步确定CRE.最后,分别提取CRE定植组与非定植组患者的粪便或肛拭子标本基因组DNA在HiSeq平台进行16S rRNA测序分析.结果 共收集ICU患者粪便或肛拭子标本241份,其中CRE阳性标本17份.16S扩增子V3～V4区测序共分离到726 OTUs,CRE未定植组有631 OTUs,CRE定植组有480 OTUs,两组间共有385 OTUs.这些共有OTUs绝大多数属于厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、疣微菌门及放线菌门.在纲水平上,CRE定植前后γ-变形菌纲(W=193.000,P＜0.001,FDR=0.004)和互营养菌(W=37.500,P=0.001,FDR=0.018)相对丰度差异有统计学意义.在种水平上,两组间肺炎克雷伯菌(W=195.000,P＜0.001)、解糖肠球菌(W=153.000,P=0.038)及弯曲杆菌(W=63.500,P=0.050)比较差异有统计学意义.未发现肠道CRE定植对ICU患者肠道微生物KEGG功能通路有显著影响.结论 CRE定植会降低ICU患者肠道微生物的多样性,CRE定植组在肺炎克雷伯菌、解糖肠球菌及弯曲杆菌的丰度上与非定植组存在显著差异.

目的 调查某儿童专科医院苛养菌分布及对抗菌药物的耐药性特点,为儿科医生合理使用抗菌药物提供参考依据.方法 通过连续性监测分析某院2018-2022年呼吸道标本分离的主要苛养菌种及其耐药性.结果 分离株数居前三位的苛养菌是:肺炎链球菌(Spn)、流感嗜血杆菌(Hi)、卡他莫拉菌(Mc).Spn对红霉素、克林霉素、四环素、头孢呋辛的平均耐药率高(均＞75％),对青霉素、头孢曲松、阿莫西林/克拉维酸的平均耐药率低(均＜15％);Hi对氨苄西林的平均耐药率较高(接近75％),对头孢噻肟、头孢呋辛、头孢克洛、阿莫西林/克拉维酸的耐药率较低(＜45％);Mc对氨苄西林平均耐药率高(＞90％),对其余常用抗菌药物平均耐药率均低(＜30％).三种细菌5年间对上述药物的耐药率比较,差异均有统计学意义(均P＜0.05).结论 考虑小儿使用抗菌药物的特殊性并结合本研究结果,Spn可先经验性使用青霉素类、第三代头孢类、β-内酰胺酶类药物,Hi可先经验性使用第二、三代头孢类、β-内酰胺类药物,Mc可经验性使用除氨苄西林外的抗菌药物,再根据病原学结果及药敏结果回报调整用药方案.

目的 探讨宫颈癌患者免疫功能、肠道微生物与放射性肠炎(RE)的关系.方法 回顾性分析 80 例宫颈癌患者的临床资料,根据放射治疗后 3 个月内是否发生RE将患者分为RE组(29 例)和非RE组(51 例),根据常见不良反应标准 5.0 版将RE组患者分为低症状级别组(1 级,18 例)和高症状级别组(≥2 级,11 例).流式细胞仪检测血浆T淋巴细胞亚群、B淋巴细胞;使用 16S核糖体RNA(16S rRNA)基因扩增测序对肠道微生物进行测序及生物信息学分析.结果 无论是放射治疗前还是放射治疗后,RE组患者的CD4+/CD8+比值、B淋巴细胞比例均低于非RE组(P均<0.05);RE组中,低症状级别组患者的CD4+/CD8+比值、B淋巴细胞比例均高于高症状级别组(P均<0.05).放射治疗前后,非RE组患者肠道微生物α多样性高于RE组(P<0.05).2 组肠道微生物组成具有明显差异的菌属主要为硬壁菌门和互养菌门;放射治疗前后,RE组Acidaminococcus、Dialister相对丰度高于非RE组,Pyramidobacter相对丰度低于非RE组(P<0.05).结论 宫颈癌患者CD4+/CD8+比值、B淋巴细胞比例和肠道微生物特征与RE密切相关,治疗期间CD4+/CD8+比值、B淋巴细胞比例下降和肠道微生态失衡的患者更容易发生RE.

目的 探讨二期翻修中应用髋臼加强型抗生素骨水泥占位器治疗假体周围感染髋臼骨缺损的临床疗效及并发症发生率.方法 回顾性分析2007年1月至2016年6月应用髋臼加强型抗生素骨水泥占位器治疗假体周围感染髋臼骨缺损的患者26例,男11例,女15例;年龄18～75岁,平均46.7岁.一期取出假体、彻底清创后植入抗生素骨水泥占位器,应用敏感抗生素抗感染治疗,感染控制后二期取出占位器并植入翻修假体.一期术中髋臼缘骨缺损以螺钉骨水泥技术修补,加强臼缘稳定,再植入占位器;臼底骨缺损采用手工捏制髋臼占位器植入,阻止占位器突入骨盆.随访期间评估髋关节功能及并发症(占位器脱位、断裂和髋臼磨损)的发生率.结果 术前髋关节穿刺关节液、术中取关节液和组织块送细菌培养,培养阳性率为80.8％(21/26).包括葡萄球菌感染15例(57.7％,15/26),革兰氏阳性杆菌感染2例(7.7％,2/26),真菌感染2例(7.7％,2/26),布氏杆菌、铜绿假单胞菌、大肠埃希菌、粪肠球菌、缺陷乏养菌、黏质沙雷菌和玫瑰色库克菌感染各1例(3.8％,1/26),其中5例(19.2％,5/26)为混合感染.一期术中采用臼缘加强型抗生素骨水泥占位器15例,采用臼底加强型抗生素骨水泥占位器11例.一期术后发生占位器脱位1例,发生占位器断裂2例,无感染复发.24例行二期翻修手术;2例未行二期手术,其中1例因严重骨缺损行旷置术、另1例患者满足于占位器功能拒绝二期翻修.二期翻修术后22例获得随访,失访2例.随访时间1～8年,平均4.1年.末次随访时Harris髋关节评分(81.2±11.2)分,高于术前的(40.9±14.0)分,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 在假体周围感染髋臼骨缺损二期翻修术中使用髋臼加强型抗生素骨水泥占位器,可在保持关节活动度的情况下增加占位器的稳定性,同时减少缺损髋臼壁的磨损造成医源性骨缺损.

缺陷乏养菌是人体呼吸道、口腔内的正常菌群,过去认为缺陷乏养菌为营养变异型链球菌[1],属革兰阳性球菌.1995年,Kawamura等[2]基于对16SrRNA序列分析,确认缺陷乏养菌是一种新的菌属.当在免疫力低下时,可经血行感染,导致感染性心内膜炎(infective endocarditis,IE).在链球菌所致的IE中,营养变异型链球菌约占5％-6％,缺陷乏氧菌则占＜1％[1,3].虽然比较罕见,但它能迅速破坏瓣膜结构,造成心力衰竭或器官栓塞等严重并发症[4].我们从1例“结缔组织病”患者血培养中培养出缺陷乏养菌,且经食道超声证实二尖瓣赘生物形成,确诊为IE,现报道如下.