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微小RNA的差异表达与胚胎质量的相关性
编辑人员丨5天前
目的:探讨微小RNA(micro RNA, miRNA)差异表达与胚胎质量的相关性,为胚胎的植入前选择提供新的依据。方法:用TaqMan微小RNA阵列(MicroRNA Array)对8个囊胚样本进行miRNA表达谱检测,筛选稳定高表达且有价值的miRNA。扩大样本量后选择囊胚,针对筛选的miRNA进行逆转录PCR检测,同时采用二代测序平台检测胚胎的染色体异常,对结果进行分析比较。结果:MicroRNA Array检测发现mir-720、mir-372、mir-886-3p和mir-512-3p表达量较高,而mir-145表达量较低,推测与早期胚胎发育相关。选择56个废弃囊胚,对上述5种miRNA进行检测,结果显示mir-145和mir-886-3p在染色体正常组中显著低表达。mir-145以相对表达量9作为阈值,mir-886-3p以相对表达量3作为阈值,其以上均未见胚胎染色体检测为正常者。结论:特定的miRNA表达差异与胚胎染色体异常存在相关性,有可能作为一种新的胚胎选择的生物标记。
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编辑人员丨5天前
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PCAT4通过海绵化miR-508-5p上调URGCP表达驱动乳腺癌进展
编辑人员丨5天前
目的:研究前列腺癌相关转录因子4(PCAT4)通过海绵化miR-508-5p上调细胞增殖上调节因子(URGCP)表达对乳腺癌进展的驱动作用。方法:通过癌症基因组图谱分析乳腺癌组织中具有差异表达的lncRNA和miRNA的微阵列数据。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)评估乳腺癌中PCAT4表达。MTT和集落形成实验测定细胞增殖能力,TUNEL法分析细胞凋亡情况,Transwell实验分析细胞迁移和侵袭变化。RNA下拉和双荧光素酶测定分析PCAT4与miR-508-5p,以及miR-508-5p与URGCP的相关性。肿瘤异种移植研究分析PCAT4/miR-508-5p/URGCP轴与体内乳腺癌细胞生长的相关性。计量资料以均数±标准差( ± s)表示,两组间比较采用 t检验,多组间比较采用单因素方差分析。Pearson相关性分析评价PCAT4和URGCP与miR-508-5p表达的相关性。 结果:乳腺癌组织和细胞中PCAT4的表达水平上调。敲除PCAT4能够抑制细胞增殖和转移,促进细胞凋亡。miR-508-5p是PCAT4的靶点,且与PCAT4呈负相关。乳腺癌中miR-508-5p过度表达可抑制细胞生长、迁移和侵袭,促进细胞凋亡。URGCP是miR-508-5p的靶点,可诱导乳腺癌的进展。肿瘤异种移植研究显示,PCAT4通过影响miR-508-5p/URGCP驱动乳腺癌进展。结论:乳腺癌组织和细胞中PCAT4表达升高,PCAT4可以作为miR-508-5p的分子海绵,并通过激活URGCP蛋白表达显著促进乳腺癌进展。
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编辑人员丨5天前
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miR-451靶向巨噬细胞移动抑制因子对结直肠癌细胞增殖迁移的影响及其作用机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨miR-451通过靶向巨噬细胞移动抑制因子(MIF)对人结直肠癌细胞SW480增殖和迁移的影响及其作用机制。方法:微阵列分析筛选SW480细胞中差异表达的微小RNA和信使RNA,实时定量PCR法检测miR-451和MIF在SW480细胞中的表达以及转染miR-451、MIF后miRNA-451和MIF的表达,细胞克隆形成实验检测miR-451和MIF的表达对SW480细胞增殖能力的影响,Transwell实验检测miR-451和MIF的表达对SW480细胞侵袭能力的影响,细胞划痕实验检测miR-451和MIF的表达对SW480细胞迁移能力的影响,TargetScan数据库分析miR-451与MIF的相关性,双荧光素酶报告基因检测miR-451与MIF的相互作用,四甲基偶氮唑蓝法检测MIF过表达对SW480细胞活力的影响。结果:与人正常结直肠黏膜细胞FHC(1.00)比较,SW480细胞中miR-451的表达(0.36±0.18)下调( P<0.001)。miR-451过表达抑制SW480细胞的增殖和迁移,miR-451低表达促进SW480细胞的增殖和迁移。与人正常结直肠黏膜细胞FHC(1.00)比较,SW480细胞中MIF的表达(2.28±0.45)上调( P<0.001);MIF低表达抑制SW480细胞的增殖、侵袭和迁移。miR-451与MIF 3′UTR特异性结合,调控MIF的表达活性。miR-451过表达降低SW480细胞的活力,MIF过表达使SW480细胞的活力增加。MIF过表达能促进SW480细胞的增殖和迁移( P<0.01),MIF过表达逆转miR-451过表达对SW48细胞增殖和迁移的作用。 结论:miR-451通过靶向MIF可能调控人结直肠癌细胞的增殖和迁移。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-146a靶向Nm23-H1对胃印戒细胞癌侵袭和转移的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨微小RNA(miR)-146a靶向Nm23-H1对胃印戒细胞癌侵袭和转移的影响及其机制。方法:选取2018年12月至2020年12月漯河市中心医院与河南省人民医院收治的49例胃低分化印戒细胞癌和对应癌旁组织作为研究对象。采用miRNA微阵列分析分析胃癌组织和癌旁组织差异表达miRNA;采用荧光定量聚合酶链反应验证胃癌组织和癌旁组织中差异表达miRNA;采用miRNA对照和miR-146a抑制剂慢病毒感染人胃印戒细胞癌细胞系HSC-39,建立对照(对照组)和miR-146a敲降细胞系(实验组)。采用Transwell分析两组细胞的侵袭能力;采用体内抑制瘤实验分析两组细胞的转移能力;采用生物信息学和双荧光素酶报告分析miR-146a的靶基因;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析组织和组细胞系靶蛋白表达水平。组间数据比较采用 t检验。 结果:肿瘤组织和癌旁组织差异表达的miRNA有84个,其中miR-146a是在肿瘤组织和癌旁组织中表达差异最大的miRNA。胃低分化印戒细胞癌组织miR-146a表达水平(2.96±0.31)高于癌旁组织miR-146a表达水平(1.29±0.23),差异有统计学意义( t=3.104, P<0.05)。实验组细胞miR-146a表达水平(0.33±0.15)低于对照组细胞miR-146a表达水平(1.02±0.19),差异有统计学意义( t=2.864, P<0.05)。实验组细胞侵袭数量[(32.12±4.14)个]低于对照组细胞侵袭数量[(81.45±8.09)个],差异有统计学意义( t=3.173, P<0.05)。实验组细胞淋巴结转移数量[(6.01±1.89)个]低于对照组细胞淋巴结转移数量[(13.50±3.09)个],差异有统计学意义( t=2.185, P<0.05)。Nm23-H1是miR-146a的靶蛋白。胃癌组织中Nm23-H1表达水平(0.36±0.11)低于癌旁组织中Nm23-H1表达水平(0.84±0.14),差异有统计学意义( t=2.850, P<0.05)。胃癌组织中Nm23-H1表达水平(0.92±0.13)低于对照组细胞Nm23-H1表达水平(0.27±0.08),差异有统计学意义( t=2.189, P<0.05)。 结论:miR-146a在印戒细胞型胃癌中呈高表达,通过靶向Nm23-H1调节胃印戒细胞癌细胞侵袭和转移。
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编辑人员丨5天前
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类风湿关节炎患者外周血单个核细胞中环状RNA差异表达分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨环状RNA(circRNA)在RA PBMCs表达谱的差异及临床意义。方法:收集4例RA患者(T组)及4名健康体检者(C组)静脉血,运用Arraystar circRNA微阵列芯片检测2组PBMCs中circRNA表达谱,应用相关数据库进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证表达失调circRNA的表达情况,并对目标circRNA构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络(即ceRNA网络)。建立受试者工作特征曲线(ROC曲线),对潜在诊断价值进行分析。采用SPSS Statistics 23.0和Graphpad Prism 8.0分析数据,采用两独立样本 t检验分析2组间差异。 结果:①微阵列芯片结果显示,与C组比较,T组PBMCs中异常表达的circRNA共有399个,其中149个上调,250个下调。②生物信息学分析:circRNA与miRNA结合位点预测提示RA中差异表达的circRNA可能通过靶向结合miR-140-5p、miR-338-5p和miR-9-5p等分子影响炎症反应;基因本体论分析发现差异表达的circRNA主要在细胞质、蛋白质结合等方面;京都基因与基因组百科全书通路分析发现涉及的通路多与人体免疫调节相关。③多样本RT-qPCR验证结果显示T组中hsa_circRNA_009012的相对表达量显著高于C组( t=-4.417, P<0.01),hsa_circRNA_101328的表达水平显著低于C组( t=-1.042, P<0.01),hsa_cir-cRNA_058230的表达无明显改变( t=4.691, P>0.05)。④ ROC曲线分析提示hsa_circRNA_009012具有诊断RA的潜在价值(ROC曲线下面积=0.96)。 结论:circRNA在RA患者PBMCs中表达失调,可能参与RA发生发展的调控,其中hsa_circRNA_009012有望成为RA诊疗的新型生物学标志物。
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编辑人员丨5天前
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重症肺炎患儿血清miR-221和miR-127的表达水平及临床意义
编辑人员丨5天前
目的:分析重症肺炎患儿血清微小RNA-221(miR-221)和微小RNA-127(miR-127)的表达及其临床意义。方法:前瞻性选取2017年1月至2019年12月期间于河北省邯郸市中心医院就诊的重症肺炎患儿151例作为重症肺炎组,根据在院期间患儿预后分为死亡组(16例)和存活组(135例),另选取同期在本院进行健康查体的健康儿童80例作为正常对照组。使用微阵列分析重症肺炎组和正常对照组中的miRNAs表达,选择上调或下调(选择依据为差异表达变化≥2倍阈值和 P<0.05)最显著的miRNAs。检测入组对象血清miR-221、miR-127及炎症因子[C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-8(IL-8)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)]水平,分析重症肺炎组血清miR-221和miR-127与上述炎症指标的相关性,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-221和miR-127对重症肺炎的诊断及预后预测的价值。 结果:重症肺炎组患儿血清miR-221和miR-127水平低于正常对照组,而CRP、PCT、IL-6、IL-8、TNF-α水平高于正常对照组(均 P<0.05)。血清miR-221与CRP、PCT、TNF-α呈负相关(均 P<0.05),血清miR-127与CRP、PCT、IL-6、IL-8呈负相关(均 P<0.05)。死亡组患儿血清miR-221、miR-127水平均低于存活组(均 P<0.05)。miR-221、miR-127联合诊断重症肺炎的曲线下面积(AUC)为0.871,联合预测重症肺炎患儿预后的AUC为0.851。 结论:重症肺炎患儿血清miR-221和miR-127水平降低,与部分炎症因子水平呈负相关,二者联合检测对重症肺炎的诊断及预后预测具有较高的临床价值。
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编辑人员丨5天前
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靶向间充质干细胞微小RNA-26a和微小RNA-146a克服非小细胞肺癌靶向治疗耐药的研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨间充质干细胞(MSC)在非小细胞肺癌(NSCLC)抵抗表皮生长因子受体抑制剂(EGFR-TKI)耐药过程中的作用及其机制。方法:HCC827及PC-9肺腺癌细胞与MSC共培养后给予吉非替尼处理,检测肺癌细胞凋亡变化;应用荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测共培养刺激后MSC细胞表达生长因子及细胞因子的情况;收集培养癌旁和远端正常肺组织来源MSC并行微小核糖核酸(miRNA)表达谱检测,并采用miRNA模拟物及抑制剂进行功能验证;此外,行聚合酶链反应微阵列分析(PCR Array)检测进一步探讨MSC调控NSCLC细胞抵抗吉非替尼的机制。两组数值间比较应用非配对 t检验。 结果:肺癌来源MSC的miR-26a表达组低于正常肺组织来源MSC的miR-26a表达组(53.3%, t=4.626, P<0.01),而肺癌来源MSC的miR-146a表达组高于正常肺组织来源MSC的miR-146a表达组(1.83倍, t=4.895, P<0.01)。应用Transwell体系共培养肺癌细胞和MSC 48 h后发现,肺癌细胞(HCC827细胞)来源的miR-26a表达组明显低于MSC来源的miR-26a表达组(45.7%, t=1.866, P<0.05);且肺癌细胞(PC-9细胞)来源的miR-26a表达组也明显低于MSC来源的miR-26a表达组(62.0%, t=1.728, P<0.05),同时肺癌细胞(HCC827细胞)来源的肝细胞生长因子(HGF)表达组明显高于MSC来源的HGF表达组(3.88倍, t=2.014, P<0.05);且肺癌细胞(PC-9细胞)来源的HGF表达组也明显高于MSC来源的HGF表达组(5.29倍, t=2.197, P<0.05)。此外,MSC培养液可促进HCC827细胞可高表达转运蛋白和药物代谢基因三磷酸腺苷结合盒转运蛋白G2(ABCG2)(4.23倍)和细胞色素P450酶2C9(CYP2C9)(2.18倍)。 结论:肺癌来源的MSC通过异常表达miR-26a和miR-146a调控促肿瘤细胞因子增强NSCLC细胞对EGFR-TKI的抗药性。
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编辑人员丨5天前
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尿外泌体miR-155与2型糖尿病肾病发病及严重程度的相关性
编辑人员丨5天前
目的:探讨2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者尿外泌体微小RNA(exosomal microRNA,exo-miR)-155与糖尿病肾疾病(diabetic kidney disease,DKD)发病及严重程度的关系。方法:于2019年1—5月从上海健康医学院崇明医院内分泌与代谢科招募5例T2DM正常白蛋白尿患者和5例2型DKD患者作为微小RNA筛选队列,采集患者尿液样本提取尿外泌体,并利用miRCURY LNA阵列检测尿exo-miR特征谱。随后于2019年6月至2022年10月通过该院内分泌与代谢科纳入符合入组标准且年龄、性别相匹配的351例T2DM患者作为验证队列。根据尿白蛋白/肌酐比值(urinary albumin/creatinine ratio,UACR)分为3组:正常白蛋白尿组(UACR<30 mg/g, n=143)、微量白蛋白尿组(30 mg/g≤UACR≤300 mg/g, n=171)和大量白蛋白尿组(UACR>300 mg/g, n=37)。根据DKD诊断指南,将微量白蛋白尿和大量白蛋白尿患者归为DKD组。采用实时荧光定量PCR法检测尿exo-miR-155表达水平。 结果:透射电镜、纳米颗粒跟踪分析和Western印迹观察分析结果均显示尿外泌体提取成功。在筛选队列中,按照 P<0.05且变化倍数(FC)>1.5的筛选标准,与T2DM患者尿液样本相比,DKD组尿外泌体样本中筛出226个差异表达miRNA,其中miR-155上调倍数最高(FC=32.75, P<0.001)。在验证队列中,与正常白蛋白尿组[0.76(0.55,0.95)]相比,大量白蛋白尿组[1.84(1.18,2.42)]尿exo-miR-155水平升高最明显( Z=-7.411, P<0.001),微量白蛋白尿组[0.86(0.69,1.25)]次之( Z=-4.092, P<0.001),而且大量白蛋白尿组尿exo-miR-155水平也明显高于微量白蛋白尿组( Z=-5.841, P<0.001)。相关分析显示,尿exo-miR-155水平与UACR呈正相关( r s=0.329, P<0.001),与估算肾小球滤过率呈负相关( r s=-0.249, P=0.015)。受试者工作特征曲线分析显示,尿exo-miR-155水平预测T2DM患者进展为DKD的曲线下面积为0.892(95% CI 0.859~0.925),对应截断值为0.982,灵敏度和特异度分别为71.9%和87.7%。多因素Logistic回归分析结果显示尿exo-miR-155≥0.982是T2DM患者进展为DKD的独立危险因素( OR=3.310,95% CI 1.981~5.530, P<0.001)。 结论:尿exo-miR-155在微量白蛋白尿和大量白蛋白尿T2DM患者中表达水平较高,其与白蛋白尿程度相关,可作为识别有潜在DKD的预测标志物。
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编辑人员丨5天前
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基于生物信息学对脊髓损伤后关键微小RNA与转录因子的筛选及其靶基因预测
编辑人员丨5天前
目的:探讨脊髓损伤(SCI)后关键的微小RNA(miRNAs)与转录因子(TFs)并进一步了解miRNAs、TFs与靶基因的互作关系。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载基因表达谱(GSE19890),将差异倍数(log2FC)≥1和错误发现率(FDR)≤0.05作为标准阈值,通过对微阵列数据分析筛选出差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。预测DEmiRNAs靶基因后分别进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路和基因本体论(GO)功能富集分析,接着基于TFs-靶基因互作分析确定关键的TFs,根据靶基因的蛋白-蛋白互作网络分析确定特殊的DEmiRNA。结果:通过对数据的分析,分别与对照组相比,SCI后1 d出现5个下调基因和74个上调基因,3 d后有118个下调基因和21个上调基因,7 d后有450个下调基因和11个上调基因。韦恩在线分析筛选出7个重叠的DEmiRNAs参与了SCI后的表达调控。KEGG富集分析主要涉及细胞衰老、胰岛素抵抗和促性腺激素释放激素(GnRH)等信号通路,GO富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、基因表达的正调控和大脑发育等。通过TFs-靶基因互作分析发现了6个TFs,比较10个Hub靶基因后我们发现了特殊的DEmiRNA(miR-124-3p)。结论:7个DEmiRNAs与6个TFs在SCI后可能通过调控靶基因的表达起着关键作用,其中miR-124-3p通过调控特殊的靶基因产生了重要影响。
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编辑人员丨5天前
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柴胡疏肝汤治疗癫痫大鼠的效果及其对miR-34a表达的影响
编辑人员丨2周前
目的 探讨柴胡疏肝汤治疗癫痫大鼠的效果及其对miR-34a表达的影响.方法 将42只大鼠随机分为癫痫组(n=15)、柴胡疏肝汤组(n=12)及空白组(n=15).除空白组外,另两组采用腹腔注射氯化锂-盐酸匹罗卡品法构建癫痫大鼠模型.造模结束后,给予柴胡疏肝汤组大鼠灌胃2 mL/100 g柴胡疏肝汤,空白组、癫痫组给予等量生理盐水灌胃,均为1次/d,持续灌胃3周.造模结束后,采用microRNA微阵列芯片检测癫痫大鼠模型海马组织差异表达的miRNA.干预期间观察记录3组大鼠的癫痫发作情况.最后一次灌胃结束后采用实时荧光定量PCR检测3组大鼠海马组织miR-34a表达水平.结果 MicroRNA微阵列芯片测序分析从癫痫大鼠海马组织中共筛选出40个差异表达的miRNA,其中miR-34a在癫痫大鼠模型海马组织中呈高表达.与癫痫组比较,柴胡疏肝汤组大鼠癫痫发作次数、发作持续时间减少(P<0.05).与空白组比较,癫痫组、柴胡疏肝汤组大鼠模型海马组织中miR-34a的表达水平升高(P<0.05);与癫痫组比较,柴胡疏肝汤组大鼠模型海马组织中miR-34a的表达水平降低(P<0.05).结论 柴胡疏肝汤可能通过抑制癫痫大鼠模型海马组织中miR-34a的表达而减少癫痫发作.
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编辑人员丨2周前
