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无创DNA产前检测血浆质控物的研究进展
编辑人员丨5天前
无创产前基因检测(NIPT)是应用高通量基因测序技术检测孕妇外周血中胎儿游离DNA片段,以评估胎儿常见染色体非整倍体(T21、T18、T13)风险的一种产前筛查方式,为防治出生缺陷做出了极大的贡献。为确保检测结果的准确可靠,须在检测中加入质控物对检测全过程进行严格的质量控制。但目前大多数检测平台的血浆提取过程中缺乏血浆质控物。在不同平台的室间质评中,也需要通用的血浆质控物。为解决这个质控问题,近年来出现了6种NIPT血浆质控物的制备策略,根据其基质和阳性DNA的来源不同,分别具有不同的适用范围和优缺点。
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编辑人员丨5天前
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一例嵌合型染色体数目与结构异常胎儿的产前筛查与诊断
编辑人员丨5天前
目的:联合应用多种技术对一例高龄孕妇进行产前筛查与诊断。方法:采用无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)技术对胎儿进行非整倍体筛查,抽取羊水细胞进行胎儿染色体核型分析和低深度全基因组测序拷贝数变异检测(copy number variation sequencing,CNV-seq),对孕中期胎儿进行系统超声检查;对孕妇夫妇的外周血细胞进行染色体核型分析。结果:NIPT提示胎儿性染色体异常;羊水核型提示为嵌合型性染色体异常45,X[53]/46,X,+mar[7];胎儿羊水细胞DNA CNV-seq显示seq[GRCh37]del(Yq11.1q12) chrY:g.13 104 553-28 819 361del,seq[GRCh37]del(Yp11.32p11.2) chrY:g.10 001-9 873 915del(嵌合比例30%);超声检查提示胎儿肾脏发育异常;引产儿外生殖器表现为男性;孕妇夫妇外周血染色体核型未见异常。结论:NIPT可筛查部分胎儿性染色体异常疾病,后续的产前诊断与遗传咨询将有赖于胎儿核型分析、拷贝数变异检测以及超声检查等多种技术的联合应用。嵌合型性染色体异常胎儿的生后表型难以准确评估,产前遗传咨询应全面告知其可能的预后。
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编辑人员丨5天前
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孕妇外周血浆胎儿游离DNA高通量测序筛查致病性拷贝数变异的技术标准共识
编辑人员丨5天前
由致病性拷贝数变异(pathogenic copy number variations, pCNV)导致的基因组病是出生缺陷的一个重要遗传学病因。近年来,随着基于孕妇血浆胎儿游离DNA高通量测序技术的发展、生物信息分析流程的完善以及大样本数据的积累,无创产前筛查(noninvasive prenatal screening, NIPS)胎儿pCNV疾病已开始应用于临床,国内对此技术的规范应用亟需专业的指导意见。基于此,本组专家就筛查的目标疾病和全流程临床规范应用细节达成技术共识,以期达到NIPS筛查pCNV疾病规范应用的目的。
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编辑人员丨5天前
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无创DNA产前检测技术筛查唐氏综合征阳性结果的验证与分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨应用高通量测序技术对孕妇外周血中胎儿游离DNA进行唐氏综合征筛查的临床应用价值。方法:选择2013年4月至2019年12月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心就诊,行无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)21-三体高风险的1039例孕妇,行羊膜腔穿刺术抽取羊水细胞经荧光定量PCR(quantitative fluorescent polymerase chain reaction,QF-PCR)和染色体核型分析进行验证,探讨经NIPT检测出的21-三体高风险的阳性准确性。结果:1039例NIPT提示为21-三体高风险的孕妇中,经染色体核型分析,886例确诊为21-三体,其阳性预测值(positive predictive value, PPV)为85.27%,包括标准型唐氏综合征核型839例(94.70%)、易位型28例(3.16%)、嵌合型14例(1.58%)、其他异常染色体5例(0.56%)。正常核型153例,假阳性率为14.73%(153/1039)。QF-PCR结果与核型结果相符共计1027例,其准确率为99.32%(1027/1034)。结论:无创DNA检测胎儿21-三体的阳性预测值为85.27%,准确率较高,可以广泛应用于唐氏综合征胎儿出生缺陷的筛查。
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编辑人员丨5天前
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改良磁珠筛选法富集母体外周血胎儿游离DNA在无创产前检测中的应用价值
编辑人员丨5天前
目的:评估改良磁珠筛选法富集胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)在无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)中的应用价值。方法:从2017年10月至2019年12月在北京市海淀区妇幼保健院接受常规NIPT的11 000例孕妇中,回顾性纳入cffDNA浓度偏低(<6.00%),或首次检测Z值灰区(3.00~4.00),或产前介入性产前诊断确定假阳性或生后确定假阴性病例共31例。取首次常规NIPT留存的血浆标本,使用改良磁珠筛选法富集cffDNA进行NIPT(改良富集法NIPT)。采用Wilcoxon秩和检验比较改良富集法NIPT与常规NIPT测得的男胎cffDNA浓度变化。结果:31例孕妇中13例常规NIPT cffDNA浓度偏低,11例常规NIPT 13/18/21-三体假阳性(3例13-三体,4例18-三体,4例21-三体,均经介入性产前诊断证实),6例首次常规NIPT Z值灰区(复测为低风险),1例常规NIPT 21-三体假阴性(生后染色体检查证实)。使用改良富集法后,<150 bp的游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)片段得到有效富集,21例男胎的cffDNA浓度由常规NIPT的4.43%(2.45%~17.61%)提升至改良富集法NIPT的13.46%(7.75%~36.64%),差异有统计学意义(Z=-14.22, P<0.01)。13例常规NIPT cffDNA浓度偏低者经改良富集法NIPT,均成功检出为低风险;6例Z值灰区病例及11例假阳性病例中的6例经改良富集法NIPT确定为低风险,与常规NIPT复测结果一致;1例假阴性病例确定为高风险。 结论:与常规NIPT相比,改良富集法NIPT降低了因cffDNA浓度偏低导致的检测失败率,降低了假阳性率,并成功检测出假阴性病例,显示出更高的检测成功率和更低的假阳性率。
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编辑人员丨5天前
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3133例孕妇无创DNA产前检测的临床分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨无创DNA产前检测技术(non-invasive prenatal testing,NIPT)在筛查胎儿染色体异常的临床应用价值。方法:选择2017年02月至2019年02月在钦州市妇幼保健院接受NIPT检测的3133例孕妇作为研究对象,对NIPT结果高风险的孕妇建议行羊膜腔穿刺术及胎儿染色体核型检测,部分孕妇同时行胎儿染色体拷贝数变异(copy number variations,CNVs)检测,并对NIPT与羊水细胞染色体分析的符合情况进行分析。结果:3133例孕妇中NIPT提示高风险39例,其中29例孕妇进行胎儿染色体核型检测,17例同时行染色体CNVs检测,经羊水染色体核型检测确诊16例胎儿染色体异常,经染色体CNVs检测额外提示2例染色体的其他异常;NIPT高风险行羊水染色体CNVs检测可明显提高染色体异常的检出率;各类NIPT指征中,高龄妊娠组阳性预测值最高。结论:NIPT可明显提高胎儿染色体异常的检出率,是一种无创、准确性高的产前筛查,但不能完全替代介入性产前诊断,需严格掌握NIPT的适应指征、局限性及结果的咨询,此外,染色体拷贝数变异检测可明显增加胎儿染色体异常的检出率,对高风险的孕妇行介入性产前诊断查胎儿染色体核型同时建议行染色体拷贝数变异检测。
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编辑人员丨5天前
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母体性染色体异常对无创产前检测胎儿性染色体非整倍性的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨母体性染色体异常对孕妇外周血胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)筛查胎儿性染色体非整倍性(sex chromosome aneuploidies,SCAs)结果的影响。方法:以36例NIPT提示为SCAs高风险、但经羊水诊断证实为假阳性的孕妇为研究对象,对其进行母体外周血染色体核型分析或母体白细胞全基因组高通量低深度测序。结果:共发现8例孕妇存在性染色体异常,异常率达22.22%,其中3例为非整倍体异常,4例为性染色体嵌合体,1例为染色体结构异常。NIPT重分析测序结果与母体染色体拷贝数变异(copy number variants,CNVs)检测的结果基本一致。当cffDNA(ChrX)/cffDNA的比值>2时,6/8的孕妇存在母体性染色体异常,胎儿核型为正常;而当其比值<2时,36例孕妇中仅2例存在母体性染色体异常,10例胎儿被证实为SCAs。结论:母体性染色体异常会显著干扰NIPT的检测结果,这可能是NIPT检出胎儿SCAs假阳性的重要原因。当NIPT提示胎儿SCAs时,有必要检查母体的性染色体。cffDNA(ChrX)/cffDNA的比值可能有助于判断异常信号的来源。
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编辑人员丨5天前
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无创产前检测对常规染色体数目异常之外的拷贝数变异的检出意义:205例临床分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨无创产前检测(non-invasive prenatal testing, NIPT)检出胎儿拷贝数变异(copy number variations, CNVs)的临床价值。方法:2015年1月1日至2018年9月1日在广东省妇幼保健院行NIPT的孕妇37 845例,除常规染色体数目异常外检出205例CNVs,纳入回顾性分析。205例检出CNVs的孕妇中137例接受了介入性产前诊断。随访妊娠结局。分析NIPT对于CNVs的检测效能。采用描述性统计分析。结果:NIPT对CNVs的检出率为0.54%(205/ 37 845),110例经产前诊断未发现染色体核型异常,2例产前诊断结果与NIPT检出CNVs不符,25例产前诊断结果与NIPT一致。NIPT筛查CNVs的阳性预测值为18.2%(25/137),灵敏度为100.0%(25/25),特异度为99.7%(37 625/37 737)。27例产前诊断结果异常孕妇中5例失访,8例引产终止妊娠,14例活产且新生儿表型正常。110例产前诊断未发现异常孕妇中87例足月分娩,其中2例存在卵圆孔未闭,余85例新生儿表型正常;3例早产;1例孕28周 +2因子痫前期终止妊娠;另有2例难免流产;2例孕妇要求引产;15例失访。 结论:常规NIPT对于胎儿CNVs具有一定的检测效能,但阳性结果须结合介入性产前诊断结果、超声随访结果等进行详细的遗传咨询。
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编辑人员丨5天前
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MLL2新发移码突变致Kabuki综合征Ⅰ型胎儿的超声表现及基因变异分析1例
编辑人员丨5天前
孕妇40岁,孕5产1,顺产1女,现体健,人工流产1次,2020、2021年均孕50 d左右因胚胎停育行清宫术2次,胚胎未进行染色体检查。夫妻双方否认家族遗传病史、近亲结婚史,既往体健,无乙肝、结核等慢性传染病史,无高血压、糖尿病等慢性病史。外院11 +4周颈项透明层检查厚1.5 mm,11 +5周行唐氏筛查提示18-三体临界风险,12 +3周行无创DNA检查呈低风险,12 +5周超声提示胎儿多发畸形,遂来甘肃省妇幼保健院院行进一步检查。现孕16 +3周,产前超声显示:双顶径2.65 cm,头围9.25 cm,股骨长1.10 cm,肱骨长0.91 cm;胎儿腰骶部脊柱略侧弯;主动脉起源于解剖学左心室,肺动脉起源于解剖学右心室,心房心室及大动脉关系正常,主动脉弓峡部明显较细,宽约0.8 mm;胎儿腹壁连续性回声中断,腹腔内脏器、胃泡、肠管从缺损处翻到腹腔外,自由漂浮在羊水中,表面未见膜状物包裹;胎儿左手姿势固定,呈"钩状",双侧小腿与足底在同一切面,双足呈内翻姿态,动态观察后姿势不变;因胎儿体位受限,多次连续动态观察,未测得典型颜面部及胆囊声像(图1)。超声提示:①宫内妊娠,单活胎,胎儿大小相当于孕14周,胎儿双顶径、头围、腹围、股骨、肱骨均低于M-2SD线,考虑胎儿生长受限(图2A);②胎儿腰骶部脊柱侧弯;③主动脉弓缩窄;④胎儿腹裂;⑤胎儿四肢声像图所见,考虑左侧钩状手,双足内翻。充分告知患儿父母病情后,患儿父母坚持要求终止妊娠,经引产后证实:胎儿腹裂,腰骶部脊柱侧弯,左侧钩状手,双足内翻,与产前超声提示基本相符(图2B)。
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编辑人员丨5天前
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外周血中游离胎儿DNA检测在唐氏筛查临界风险孕妇中产前筛查的应用价值
编辑人员丨5天前
目的:探讨外周血中游离胎儿DNA检测在唐氏筛查临界风险孕妇中产前筛查的应用价值。方法:选取广东省梅州市妇女儿童医院2016年8月至2019年3月收治的1 852例传统唐氏筛查临界风险孕妇进行前瞻性研究,均在知情同意条件下自愿接受外周血中游离胎儿DNA检测,结果回报高风险患者自主选取接受羊水穿刺-核型分析,统计外周血中游离胎儿DNA检测、羊水穿刺-核型分析结果,并追踪随访妊娠结局。结果:入组孕妇均获得外周血中游离胎儿DNA检测结果,提示高风险13例,阳性率为0.70%(13/1 852),其中18三体综合征高风险3例,21三体综合征高风险5例,性染色体异常高风险5例;13例高风险孕妇中,12例接受了羊水穿刺-核型分析,11例确诊为染色体异常,胎儿染色体异常发生率为0.59%(11/1 852),确诊18三体综合征3例,21三体综合征5例,性染色体异常3例;外周血中游离胎儿DNA检测诊断18三体综合征符合率为3/3,诊断21三体综合征符合率为5/5,诊断性染色体异常符合率为3/5;外周血中游离胎儿DNA检测低风险获访孕妇中,均无21三体综合征。结论:外周血中游离胎儿DNA检测应用于产前筛查中,与羊水穿刺-核型分析具有较高符合率,可作为唐氏筛查临界风险孕妇一种无创性二线筛查手段,对产前有创性诊断具有较高指导价值。
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编辑人员丨5天前
