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肺移植术后肺部菌群研究进展
编辑人员丨1周前
肺移植是终末期肺痰病患者唯一有效的治疗手段,但肺移植受者的长期存活率仍较低。随着细菌16s核糖体小亚基RNA(rRNA)基因测序、高通量测序技术的发展,呼吸道样本中微生物的相对丰度得以量化,潜在病原体和共生环境也得以识别,揭示了健康肺部存在丰富的菌群。越来越多的证据表明,肺部菌群不仅可以调节肺部免疫稳态,而且在多种呼吸系统疾病的发生与发展中起重要作用。肺移植受者的肺部菌群有异于健康人群,并与其术后并发症及预后相关。本文对近年来国际上关于肺移植受者的肺部菌群特点及其与肺部感染、慢性排斥反应的关系进行综述,以期为肺移植术后并发症的发生与诊治提供新的思路。
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编辑人员丨1周前
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miRNA在老年性黄斑变性中的调控作用
编辑人员丨1周前
miRNA是一种性质稳定的小分子RNA,在动物、植物内大量表达,可通过与目的mRNA的3’非翻译区碱基互补配对结合,在转录后水平调控靶基因的表达。某些miRNA的表达失调及其后续的异常生物学调控,与老年性黄斑变性(AMD)发生发展中的炎症反应、氧化应激损伤、吞噬功能障碍以及异常血管生成方面有着密切联系。鉴于miR-155、miR-125b及miR-34a的失调似乎对AMD的发生起到了更加重要的作用,这些miRNA或有望成为AMD的诊断标记物及治疗新靶点。
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编辑人员丨1周前
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lncRNA MIR210HG在子痫前期胎盘组织中的表达及其功能分析
编辑人员丨1周前
目的:研究子痫前期(PE)产妇胎盘组织中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达及其中之一MIR210HG对绒毛膜滋养层细胞系HTR8/SVneo细胞生物学特性的影响,并对MIR210HG进行功能分析。方法:选取2018年7月至2019年7月青岛大学附属医院收治的PE产妇39例(PE组)和同期正常妊娠产妇39例(对照组)。(1)采用转录组测序(RNA-seq)技术分析两组产妇胎盘组织中差异表达的lncRNA;实时荧光定量PCR技术方法检测两组产妇胎盘组织中差异表达的lncRNA之一MIR210HG的表达水平,并分析MIR210HG表达水平与收缩压、舒张压和新生儿出生体重的相关性。(2)构建小分子干扰RNA(siRNA),转染HTR8/SVneo细胞以敲低MIR210HG的表达,实验分为两组,即MIR210HG敲低(KD)组(HTR8/SVneo细胞转染siRNA敲低了MIR210HG的表达)和阴性对照(NC)组(HTR8/SVneo细胞转染NC siRNA),采用活细胞计数(CCK-8)法、穿膜小室(transwell小室)体外实验检测两组HTR8/SVneo细胞增殖和迁移能力的变化。(3)采用RNA相互作用百科全书(ENCORI)数据库预测与MIR210HG相互作用的RNA,并采用基因本体(GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)和BioCarta通路富集方法对MIR210HG的功能进行分析。结果:(1)RNA-seq技术共检测出显著差异表达的lncRNA 26个,其中表达上调21个、下调5个。MIR210HG在PE组产妇胎盘组织中的表达水平显著高于对照组(分别为9.30 ±1.90、1.10 ±0.20; t=4.425, P<0.01);MIR210HG的表达水平与收缩压( r2=0.234, P<0.05)和舒张压( r2=0.190, P<0.05)均呈线性正相关关系,与新生儿出生体重呈线性负相关关系( r2=0.157, P<0.05)。(2)与NC组相比,KD组HTR8/SVneo细胞的增殖和迁移能力均显著增强( P均<0.05)。(3)ENCORI数据库分析共预测出可能与MIR210HG相互作用的RNA 38个。GO功能注释分析显示,MIR210HG可能参与免疫应答分子中介物产生的调控等27条通路的功能;KEGG通路富集显示,MIR210HG可能参与同种异体移植物排斥等8条通路的功能;BioCarta通路富集显示,MIR210HG可能参与翻译起始因子通路等8条通路的功能。 结论:lncRNA MIR210HG在PE产妇的胎盘组织中表达上调,降低MIR210HG的表达水平可促进HTR8/SVneo细胞的增殖和迁移,MIR210HG可能是滋养层细胞生物学行为的调节因子。
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编辑人员丨1周前
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microRNA特异性表达对肺癌的诊断及预后的临床意义
编辑人员丨1周前
microRNA是一类具有非编码功能的RNA,在植物、病毒以及人类中广泛存在,其参与人体多个生理过程,具有显著的调节作用。microRNA能够与mRNA结合从而使mRNA酶降解,即可阻断相应蛋白的编码,对其生物学功能造成改变和影响。最近几年的发现表明,microRNA与众多肺癌的发生、发展、诊断、治疗、预后等密切相关。肺癌是具有高发病率、低治疗率、高致死率的一种肺癌,成为危害人们生命健康的头号杀手。研究表明,microRNA在肺癌疾病的诊断筛查等过程中具有显著的特异度和敏感度。本文分析了microRNA的产生机制,并对microRNA特异性表达对肺癌诊断及预后生物学标志物方法进行了认真分析探讨,这为microRNA在肺癌诊断、治疗和预后方面的临床价值提供参考依据。
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编辑人员丨1周前
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微小RNA——新的肾移植生物标志物
编辑人员丨1周前
越来越多研究表明,微小RNA(miRNAs)在控制DNA和蛋白质生物合成及活性以及病理学中发挥着重要作用。由于miRNAs的稳定性、高敏感性、易检性等特征,使其具有运用于肾移植诊断和预后的巨大潜力。本文从miRNAs的产生及其特点出发,对其在肾移植中诸如缺血再灌注损伤,同种异体移植物排斥反应或慢性移植肾功能丧失的标志作用做一综述。
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编辑人员丨1周前
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转运RNA衍生片段在疾病中的作用及其机制研究进展
编辑人员丨1周前
转运RNA(tRNA)是将信使RNA(mRNA)翻译成蛋白质的关键分子,研究表明它还是一些非编码小RNA的前体RNA。近年来,人们发现在细菌、真菌、植物和动物中存在一些长约16~60 nts的非编码RNA(ncRNA),它们是由tRNA精确剪切而来的片段(tRF),并非是随机降解的产物。目前人们对这类小分子RNA的认识还很有限,近年的研究表明tRF在各种疾病中具有重要的功能。本文针对tRF的分类、修饰及其在各种疾病中的作用及机制等研究进展进行综述。
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编辑人员丨1周前
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植物同源结构域锌指蛋白5A在肝细胞癌中的表达及其临床意义
编辑人员丨1周前
目的:基于生物信息学方法分析植物同源结构域锌指蛋白5A(PHF5A)在肝细胞癌(肝癌)中的表达及临床意义。方法:肿瘤免疫估计资源(TIMER)、UALCAN及临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库分析PHF5A在肝癌中的表达。UALCAN数据库分析PHF5A表达与肝癌临床病理学特征的相关性,并利用癌症基因组图谱(TCGA)肝癌数据进行二元Logistics回归验证。基因表达谱交互分析(GEPIA)、Kaplan-Meier Plotter数据库分析PHF5A表达与肝癌患者预后的相关性,通过Cox回归模型评估PHF5A的预后价值并构建列线图预测患者的预后。LinkedOmics数据库分析肝癌中PHF5A的共表达基因,并进行基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,预测其生物学功能。基因集富集分析(GSEA)探讨PHF5A在肝癌中作用的机制。通过STRING数据库进一步构建PHF5A的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。单样本基因集富集分析(ssGSEA)研究PHF5A表达与肿瘤免疫浸润的关系,TIMER数据库分析PHF5A与免疫检查点基因的相关性。两组PHF5A表达比较采用 t检验或秩和检验,生存分析采用Kaplan-Meier法及Log-rank检验,采用Cox比例风险回归模型确定PHF5A对预后的价值。 结果:UALCAN数据库显示肝癌组织中PHF5A mRNA表达水平升高[癌比癌旁为23.761(18.367,30.691)比12.462(10.650,14.983), P<0.001]。CPTAC数据库进一步验证,肝癌中PHF5A蛋白表达量亦显著高于癌旁[0.006(-0.680,0.577)比-1.990(-2.582,-1.477), P<0.001]。PHF5A与肝癌患者临床分期(Ⅰ期比Ⅲ期)、组织学分级(G1比G3,G1比G4,G2比G3)显著正相关( P<0.05);Logistics回归分析显示,PHF5A与临床分期、组织学分级、T分期以及甲胎蛋白(AFP)水平显著相关[比值比( OR)=1.426、2.279、1.409、2.335, P<0.05]。GEPIA数据库显示PHF5A高表达组总生存期(OS)及无病生存期(DFS)更短[风险比( HR)=1.700,1.400, P<0.05];Kaplan-Meier Plotter数据库显示PHF5A高表达组OS、无进展生存期(PFS)、无复发生存期(RFS)、疾病特异性生存期(DSS)更短( HR=1.720、1.480、1.460、2.280, P<0.05)。多因素Cox分析结果显示,PHF5A是肝癌患者OS及PFS较短的独立危险因素( HR=1.928、2.272, P<0.01)。GO、KEGG富集分析结果显示PHF5A与RNA的剪接及加工、细胞周期、细胞分裂、正调控转录等显著相关( P<0.05)。GSEA富集分析结果显示PHF5A基因显著富集于剪接体、RNA降解、G2M检查点、细胞周期等信号通路( P<0.001)。ssGSEA分析表明PHF5A表达与肝癌组织中包括辅助型T细胞2、浆细胞样树突状细胞、细胞毒性细胞在内的多种免疫细胞浸润相关[相关系数(cor)=0.367,-0.278,-0.289, P<0.001]。PHF5A表达与常见的免疫检查点分子标志物PD1、PDL1、CTLA4、LAG3显著正相关(cor=0.246、0.267、0.273、0.168, P<0.01)。 结论:PHF5A在肝癌中高表达并提示预后不良,可能与异常的选择性剪接及抑制性免疫微环境相关。
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编辑人员丨1周前
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不同细胞来源外泌体对眼表的作用研究进展
编辑人员丨1周前
外泌体是由细胞分泌的一种膜性囊泡,可广泛参与细胞间通讯、抗炎、免疫调节等。眼表相关的外泌体来源细胞有间充质干细胞(MSC)、调节性T细胞(Treg)、未成熟树突状细胞(imDC)和髓源性抑制细胞(MDSC)。不同细胞来源的外泌体通过递送不同的生物分子给受体细胞而发挥作用。MSC来源的外泌体通过抑制T细胞增生、转换巨噬细胞表型、调控辅助性T(Th)细胞分化、上调Treg表达等机制对眼表炎症与免疫相关疾病有积极作用,同时可减少新生血管和炎症反应,培育了一个可促进角膜损伤修复的微环境。Treg来源外泌体内含微小RNA(miRNA)(miR-503、miR-330和miR-9)和诱导型NO合成酶,可通过干扰细胞周期进程,诱导凋亡和其他T细胞分化为Treg表型,抑制T细胞的同种异体排斥反应从而诱导免疫耐受。imDC来源外泌体通过递送miR-682抑制角膜植片免疫排斥。MDSC来源外泌体在体内外促进Treg扩增,抑制活化T细胞的增生和细胞毒性反应,还表达miR-29a-3p和miR-93-5p,可抑制Th1和Th17细胞分化。鉴于上述外泌体的抗炎及免疫抑制作用,本文就其对眼表炎症与免疫相关疾病如角膜损伤、黏多糖贮积症、干眼、干燥综合征和眼部移植物抗宿主病等的研究进行综述。
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编辑人员丨1周前
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间充质干细胞来源外泌体在移植物抗宿主病中的研究进展
编辑人员丨1周前
间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC)是一种多能干细胞,具有自我更新分化、免疫活性和抗炎的潜力。异基因造血干细胞移植(allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo-HSCT)是目前恶性血液病最有效的治疗方案,但移植后移植物抗宿主病(graft-versus-host disease,GVHD)的存在,阻碍了allo-HSCT的发展。目前已证实,间充质干细胞来源的外泌体(MSC-derived exosome,MSC-exo)在allo-HSCT和GVHD方面有广阔的治疗前景。本文现就MSC的免疫调节作用、MSC-exo的生物活性以及MSC-exo对于GVHD治疗及预防作用等的研究进展做一综述,旨在为未来GVHD的治疗提供新的思路。
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编辑人员丨1周前
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抑制NLRC5调控CD4 +T细胞功能对小鼠移植物的免疫保护作用
编辑人员丨1周前
目的:探讨抑制NLRC5调控CD4 +T细胞功能对小鼠移植物的免疫保护作用。 方法:体外培养、纯化和富集小鼠(购自中山大学动物实验中心)脾脏来源CD4 +T细胞,转染短发卡RNA(shRNA)慢病毒载体NLRC5-RNA干扰(RNAi)-绿色荧光蛋白(GFP);随机分为3组,分别为对照组、T细胞组和NLRC5-RNAi组,每组5只。建立小鼠胰岛移植和皮肤移植模型,术前回输已转染慢病毒的CD4 +T细胞,术后观察各组胰岛和皮肤移植物生存情况,并于术后第7天检测移植胰岛和移植皮肤外周血细胞因子白细胞介素(IL)-10和干扰素(IFN)-γ的表达水平,流式细胞术检测小鼠脾细胞内淋巴细胞亚群分化情况。组间差异采用 t检验。 结果:移植术后NLRC5-RNAi组胰岛移植物葡萄糖耐受更好。NLRC5-RNAi组胰岛中位生存时间[(19.0±3.4) d]较对照组[(11.6±1.9) d, t=5.156, P<0.01]和T细胞组[(10.0±1.4) d, t=4.151, P<0.01]延长,差异有统计学意义。NLRC5-RNAi组皮肤移植物的中位生存时间[(15.4±3.8) d]较对照组[(8.0±0.9) d, t=3.375, P<0.05]和T细胞组[(7.8±0.8) d, t=3.848, P<0.05]延长,差异有统计学意义。外周血酶联免疫吸附试验(ELISA)检测提示胰岛移植NLRC5-RNAi组IL-10表达量[(344.0±4.1) ng/L]较其他组升高( t=124.141, P<0.01),IFN-γ表达量[(85.1±6.6) ng/L]较其他组降低( t=7.633, P<0.05),差异有统计学意义;皮肤移植NLRC5-RNAi组IL-10表达量[(275.9±12.5) ng/L]较其他组升高;IFN-γ表达量[(96.6±2.5) ng/L]较其他组降低,差异有统计学意义( t=7.490, P<0.01);流式细胞术提示胰岛移植NLRC5-RNAi组脾脏细胞中辅助性T细胞(Th2)含量[(0.190±0.053)%]较其他组升高( t=5.220, P<0.05),Th1含量[(0.810±0.036)%]较其他组降低( t=6.219, P<0.05);皮肤移植NLRC5-RNAi组Th2含量[(0.130±0.012)%]较其他组升高( t=21.060, P<0.01),Th1含量[(0.180±0.026)%]较其他组降低,差异有统计学意义( t=9.248, P<0.05)。 结论:抑制NLRC5基因表达后,CD4 +T细胞分化偏向Th2,表达Th2型细胞因子增多,一定程度上延长了移植物存活时间,对移植免疫耐受的诱导具有积极意义。
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编辑人员丨1周前