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TTYH2在皮肤黑色素瘤中的表达及其预后价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨蛋白tweety同源物2(TTYH2)在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的表达水平、作用机制和对临床预后的意义。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载365例皮肤黑色素瘤患者的表达数据和临床信息,以基因型和基因表达量关联数据库(GTEx)下载812例健康人皮肤组织表达数据,分析TTYH2在SKCM组织和正常组织中的表达水平。生存分析和Cox比例风险回归分析用于评估TTYH2表达对SKCM患者预后生存的影响。京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体(GO)分析用于筛选TTYH2显著富集的信号通路。应用STRING在线平台进行蛋白质互作网络分析,筛选关键的蛋白质网络节点基因。免疫细胞浸润分析使用CIBERSORT算法分析22种免疫细胞在每个样本中的表达情况,使用卡方检验分析高、低表达组中免疫细胞的差异, P<0.05为差异有统计学意义。 结果:SKCM患者TTYH2的表达明显高于正常组织中的表达。生存分析表明SKCM患者TTYH2高表达组具有较差的预后。TTYH2高表达是SKCM总生存率差的独立预测因子( HR=1.21,95% CI 1.08~1.37, P=0.001)。KEGG结果显示TTYH2主要富集在细胞突触、离子通道、钙信号通路和细胞外基质-受体相互作用途径等相关通路上,GO分析得出TTYH2参与的生物过程等均可能与肿瘤的发生发展密切相关;蛋白互作网络分析显示,TTYH2与氯化物胞内通道蛋白5、氯离子通道蛋白2、甘氨酸受体家族成员和γ-氨基丁酸受体家族成员等有相互作用,揭示了其可能在SKCM的发病过程中具有重要作用。免疫细胞浸润分析显示,记忆B细胞、CD4记忆T细胞和单核细胞在TTYH2低表达组中的丰度显著增加,而在TTYH2低表达组中滤泡辅助T细胞和调节性T细胞的丰度显著降低。 结论:TTYH2的表达可能通过多种途径调控SKCM细胞的发生发展,影响SKCM患者的生存预后,是SKCM潜在的生物学预后标志物及治疗靶标。
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编辑人员丨1天前
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腺病毒介导的东亚钳蝎氯毒素对人胶质瘤U251细胞的作用
编辑人员丨1天前
目的:探讨腺病毒介导的人工合成东亚钳蝎氯毒素(Ad-rBmK CTa)对人胶质瘤U251细胞的抑制作用及其相关机制。方法:设置3.5×10 9、7.0×10 9、3.5×10 10pfu/ml三个效价梯度Ad-rBmK CTa组,分别作用于U251细胞24、48、72 h,同时设置空白对照组(不加入细胞和Ad-rBmK CTa)、阴性对照组(只加入U251细胞)。通过激光共聚焦荧光显微镜观察病毒感染情况;采用四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测各组细胞增殖情况;采用流式细胞术检测各组细胞周期及细胞凋亡;采用蛋白质印迹法检测凋亡相关蛋白bax、bcl-2和caspase-3表达情况。 结果:Ad-rBmK CTa作用于U251细胞24 h后感染效率达90%以上。随着Ad-rBmK CTa效价升高,作用相同时间的U251细胞增殖抑制率逐渐升高(均 P<0.01);随着时间延长,同一效价Ad-rBmK CTa作用的U251细胞增殖抑制率亦逐渐升高(均 P<0.01)。7.0×10 9 pfu/ml Ad-rBmK CTa作用于U251细胞48 h后,G 0/G 1期细胞比例为(40.7±0.8)%,S期和G 2期细胞比例分别为(35.7±0.6)%、(23.6±1.4)%,差异具有统计学意义( F=225.119, P<0.01)。7.0×10 9 pfu/ml Ad-rBmK CTa作用于U251细胞24、48、72 h时,细胞凋亡率分别为(7.4±1.4)%、(19.2±1.7)%和(22.3±1.7)%,差异有统计学意义( F=49.470, P<0.01)。7.0×10 9 pfu/ml Ad-rBmK CTa作用于U251细胞48 h后,与阴性对照组相比,bax、caspase-3蛋白的表达水平升高,bcl-2蛋白表达水平下降。 结论:Ad-rBmK CTa可能作用于DNA损伤诱导的G 1/S检测点,使细胞周期停滞于G 0/G 1期,从而抑制U251细胞的体外增殖,但其诱导U251细胞凋亡的作用并不明显。其机制可能与氯离子 -通道直接或间接受到抑制相关。
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编辑人员丨1天前
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加权基因共表达网络分析和差异基因表达分析鉴定氯离子通道附件1基因对结肠癌预后保护作用
编辑人员丨1天前
目的:结合应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异基因表达分析2种方法筛选结肠癌mRNA表达谱中的差异共表达基因,并分析差异共表达基因与预后的关系。方法:基于生物信息学方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库分别下载TCGA结肠腺癌数据集的转录组学数据和GSE68468数据集的芯片表达谱数据,筛选出两者在正常组织与结肠癌组织之间的差异表达基因(DEG)和最显著相关的加权基因模块,通过差异基因和加权基因取交集筛选出结肠癌相关差异共表达基因。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI )网络,利用最大派系中心度(MCC)计算方法筛选出MCC评分排名前10位的核心差异共表达基因,使用TCGA结肠腺癌数据集验证核心基因在正常组织和结肠癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier生存分析探索核心基因与患者总生存期和无病生存期之间的关系。使用人类蛋白质图谱(HPA)数据库,对生存相关的差异共表达基因进行免疫组织化学染色验证。结果:TCGA结肠腺癌数据集中DEG共3 481个,GSE68468数据集中DEG共7 275个,共获得237个差异共表达基因。使用PPI网络的MCC计算方法得到10个核心的差异共表达基因,分别为氯离子通道附件1( CLCA1)、 MAPK3、胰高血糖素( GCG)、溶质载体家族26成员3( SLC26 A3)、核受体亚家族1组H成员4( NR1 H4)、脂肪酸结合蛋白1( FABP1)、鸟苷酸环化酶激活因子2A( GUCA2 A)、二磷酸尿苷葡糖醛酸糖基转移酶家族2成员A3( UGT2 A3)、肉碱棕榈酰转移酶2( CPT2)和跨膜4域A12( MS4 A12)。与正常组织相比,TCGA结肠腺癌数据集结肠癌组织的 CLCA1、 GCG、 SLC26 A3、 NR1 H4、 FABP1、 GUCA2 A、 UGT2 A3、 CPT2和 MS4 A12 9个核心基因均下调( P均<0.05),其中 CLCA1高表达结肠癌患者的总生存期和无病生存期均长于低表达组( P均<0.05),免疫组织化学染色结果在蛋白质水平也验证了结果的准确性。 结论:CLCA1可能在结肠癌的发展中起关键作用,可作为进一步诊断和治疗的潜在生物标志物。
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编辑人员丨1天前
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CLCNKB基因在经典型Bartter综合征发病机制中的作用
编辑人员丨1天前
Bartter综合征是一种以低钾性碱中毒、高肾素-血管紧张素-醛固酮血症等为特征的遗传代谢性疾病。经典型Bartter综合征是Bartter综合征的常见类型,主要由编码位于基底膜侧的电压门控氯离子通道蛋白ClC-Kb的 CLCNKB基因变异所致。该病各年龄段均可发病,主要见于儿童期,临床表现多变,从严重到非常轻微。本文综述了经典型Bartter综合征致病基因 CLCNKB及其编码蛋白ClC-Kb的结构与功能,阐释了 CLCNKB可能的变异机制,回顾了中国人群 CLCNKB基因变异情况并对基因型-表型的相关性进行简单阐述。
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编辑人员丨1天前
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囊性纤维化的发病机制和分子调节治疗的研究进展
编辑人员丨1天前
囊性纤维化(CF)是一种常染色体隐性单基因遗传病,由于囊性纤维化跨膜传导调节蛋白( CFTR)基因纯合和双重杂合突变所致。 CFTR基因编码的是一种氯离子通道蛋白,分布于气道、胰腺导管上皮等部位,其功能异常将产生一系列临床表现。近10年来针对CFTR功能缺陷这一源头问题的特异性分子调节治疗取得了令人瞩目的成果。CF也因此成为一种模式疾病,为其他罕见的遗传疾病在遗传学、分子和细胞发病机制以及药物研发方面开创了新路线。现就近年来CF的发病机制以及分子调节治疗的最新研究进展进行综述,旨在提高广大医师对该病机制的认识,了解分子调节治疗。
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编辑人员丨1天前
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电压门控性氯离子通道与智力障碍的研究进展
编辑人员丨1天前
电压门控性氯离子通道作为生物体内一类重要的离子通道,有许多重要的生理功能。CLCN基因编码电压门控性氯离子通道蛋白,该基因家族共有9个成员(CLCN1~7,CLCNKa与CLCNKb)。CLCN基因突变引起氯离子通道蛋白的异常表达,影响神经元信号传导、离子稳态、细胞内转运以及溶酶体蛋白降解等生物学活动,进而改变离子通道门控特性,干扰神经系统的正常发育进程,从而可能导致智力障碍的发生。近年来,通过对CLCN基因家族的进一步研究发现,该家族部分成员基因突变与智力障碍的产生关系密切。该文将对电压门控性氯离子通道和智力障碍的相关性进行综述。
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编辑人员丨1天前
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TMEM16A:缺血性脑卒中的靶点分子
编辑人员丨1天前
2008年,TMEM16A被确定为是钙离子激活氯离子通道蛋白家族成员,同时证明该通道可以被胞内钙浓度增加激活 [1,2,3],截至目前发现除胞内钙浓度之外,膜电压 [4,5]、钙调蛋白 [6,7]、氢离子 [8]、磷脂酰肌醇 [9,10]、热效应 [11]和机械效应 [12]等激活。该通道广泛表达于多种细胞,包括上皮细胞 [13,14,15]、血管平滑肌细胞 [16]、血管内皮细胞 [17]、心房细胞 [18]、胰腺腺泡细胞 [19]和感觉神经元 [11]等,定位于细胞膜表面 [20,21]。自2008年被发现以来,亲水性分析预测TMEM16A有8个跨膜结构域 [1,2,3],后2014年晶体结构分析证实该分子有10个跨膜结构域,膜的疏水核心中嵌入了一个高度保守的区域,包含一个Ca 2+结合位点,介导TMEM16A的Ca 2+激活 [22](图1)。
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编辑人员丨1天前
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双氢青蒿素激活LNCaP细胞氯通道并抑制细胞增殖
编辑人员丨1天前
目的:探讨双氢青蒿素(DHA)通过氯离子通道抑制前列腺癌LNCaP细胞增殖的作用及其机制。方法:采用噻唑蓝(MTT)法检测DHA抑制LNCaP细胞增殖,并确定其半抑制浓度(IC 50值):分别配制的浓度梯度为0.625、1.250、2.500、5.000、10.000、20.000、40.000、80.000、160.000 μmol/L DHA溶液,并按实验设计加入含有LNCaP细胞的96孔板中,在酶联免疫检测仪490 nm处测量各孔的吸光度( A)值;全细胞膜片钳:检测DHA激活LNCaP细胞氯电流以及氯通道抑制剂4,4’-二异硫氰酸基-2,2’-二苯乙烯磺酸二钠(DIDS)和5-硝基-2-(3-苯丙胺)苯甲酸(NPPB)抑制LNCaP细胞氯离子电流。依次用0、±40 mV、±80 mV电脉冲刺激细胞,每个刺激间隔时间为200 ms,每个周期间隔为4 s。开始刺激后的10 ms收集和测量电流。通过将电流归一化到膜电容来确定电流密度。组间比较使用独立样本 t检验。 结果:DHA能够抑制LNCaP细胞增殖,其抑制效果具有时间依赖性,DHA抑制LNCaP细胞增殖的IC 50值随时间延长逐渐降低。在用DHA处理LNCaP细胞24、48、72 h后,其IC 50值分别为(51.34±1.49)、(24.98±2.07)、(22.79±1.38) μmol/L[ n=3, t=17.901(24 h比48 h), t=24.349(24 h比72 h), P<0.01]。此外,DHA也能激活LNCaP细胞氯通道产生氯电流,在80 mV电压钳制下,LNCaP细胞的电流密度增加至(48.30±7.52) pA/pF,被激活的电流可被氯通道抑制剂抑制至(6.35±2.47) pA/pF(DIDS)和(9.25±2.09) pA/pF(NPPB)[ n=3, t=9.180(DHA比DIDS), t=8.666(DHA比NPPB), P<0.01]。 结论:DHA能够抑制前列腺癌LNCaP细胞增殖,其抑制效果具有时间依赖性;DHA也能够激活LNCaP细胞氯离子通道产生氯离子电流,且激活的氯电流能够被氯通道抑制剂所抑制。
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编辑人员丨1天前
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CLC-2氯离子通道靶向阻滞对人结膜成纤维细胞纤维化的抑制作用及其机制
编辑人员丨1天前
目的:探讨CLC-2氯离子通道靶向阻滞对人结膜成纤维细胞(HConF)纤维化过程的抑制作用。方法:将HConF分为空白对照组、脂质体2000(Lipo2000)组、无义小干扰RNA(siRNA)组和CLC-2 siRNA转染组,其中空白对照组不做任何处理,其他各组分别采用含有相应转染试剂的培养基培养。采用实时荧光定量PCR法检测各组细胞中CLC-2 mRNA的表达水平;采用CCK-8试剂盒检测各组HConF的增生能力,即吸光度( A)值;采用流式细胞仪检测各组HConF凋亡比例;采用细胞划痕实验和Transwell迁移实验检测各组HConF迁移能力;采用胶原收缩实验检测各组胶原面积收缩率;采用Western blot法检测各组细胞胶原蛋白(Collagen)Ⅰ、Collagen Ⅲ、PI3K、Akt、p-PI3K和p-Akt的蛋白表达水平。 结果:空白对照组、Lipo2000组、无义siRNA组和CLC-2 siRNA转染组CLC-2 mRNA相对表达量和细胞 A值总体比较差异均有统计学意义( F=90.110、198.680,均 P<0.001),其中CLC-2 siRNA转染组CLC-2 mRNA相对表达量和细胞 A值明显低于无义siRNA组,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。空白对照组、Lipo2000组、无义siRNA组和CLC-2 siRNA转染组细胞凋亡率分别为(4.78±1.10)%、(4.54±1.51)%、(4.82±0.88)%和(28.90±0.91)%,总体比较差异有统计学意义( F=363.260, P<0.001),其中CLC-2 siRNA转染组细胞凋亡率明显高于无义siRNA组,差异有统计学意义( P<0.001)。各组细胞迁移率和细胞迁移数量总体比较差异均有统计学意义( F=74.493、1 625.431,均 P<0.001),其中CLC-2 siRNA转染组细胞迁移率明显低于无义siRNA组,细胞迁移数量明显少于无义siRNA组,差异均有统计学意义(均 P<0.01)。各组细胞胶原面积收缩率总体比较差异有统计学意义( F=104.692, P<0.001),其中CLC-2 siRNA转染组细胞胶原面积收缩率明显低于无义siRNA组,差异有统计学意义( P<0.001)。各组Collagen Ⅰ和Collagen Ⅲ蛋白相对表达量及p-PI3K/PI3K比值和p-Akt/Akt比值总体比较差异均有统计学意义( F=112.073、456.931、340.889、43.021,均 P<0.001),其中CLC-2 siRNA转染组Collagen Ⅰ和Collagen Ⅲ蛋白相对表达量及p-PI3K/PI3K比值和p-Akt/Akt比值明显低于无义siRNA组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:靶向抑制CLC-2氯离子通道基因表达可通过PI3K/Akt信号通路促进HConF凋亡,抑制细胞迁移、胶原合成及胶原收缩,抑制纤维化过程。
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编辑人员丨1天前
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甲磺司特在Th2细胞介导疾病中的研究进展
编辑人员丨1周前
甲磺司特是一种特异性的Th2细胞抑制剂,已被广泛用于哮喘和特应性皮炎等多种过敏炎症性疾病和其他疾病的治疗,取得了良好的效果并具有很高的安全性.研究表明,甲磺司特可通过调节GATA3和氯离子通道,抑制Th2细胞及IL-4等Th2型细胞因子的产生和功能,从而发挥治疗过敏性疾病的作用;甲磺司特对树突状细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞和神经元等细胞也有调节作用.因此,甲磺司特也成为了治疗Th2细胞介导疾病研究领域关注的焦点.
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编辑人员丨1周前
