目的 通过生物信息学分析,寻找与银屑病发病密切相关的特征基因,并探寻中药复方对其作用机理.方法 利用中药系统药理学数据库(TCMSP)对健脾解毒汤的药物作用靶点进行研究.通过OMIM数据库、GeneCard数据库以及GEO数据库筛选银屑病的病理靶点;使用R包对基因进行功能注释;从NCBI GEO公共数据库下载银屑病数据集GSE13355的基因表达数据;通过Cytoscape建立"活性成分-靶点"网络;采用WGCNA方法,寻找协同表达的基因模块;利用WGCNA-R包构建数据集中基因的共表达网络;采用CIBER-SORT算法推断22种免疫浸润细胞的相对比例,并进行Pearson相关性分析;通过miRcode数据库获得关键基因相关的miRNA.统计分析采用R语言(version4.2.1)进行.结果 最终得到对应药物靶点共132个,将药物靶点与疾病靶点取交集,得43个交集靶点.GO和KEGG富集分析主要涉及cellular response to chemical stress、response to oxidative stress、gland development、HIF-1、Th17 cell differentiation、PI3K-Akt等信号通路.WGC-NA分析共检测到8个基因模块,其中black模块相关性绝对值最高,将black模块中筛选后得到的912个基因与43个交集靶点取交集,结果显示,ABCC1、BIRC5、PCNA这3个基因均有交集,关键基因与多种免疫细胞显著相关.对关键基因和铁死亡相关基因进行相关性分析,关键靶点的表达水平和铁死亡相关基因的表达水平显著相关.结论 ABCC1、BIRC5、PCNA、AIFM2、BECN1和GPX4在银屑病中具有重要的生物学功能,为今后的新药研发奠定基础.

目的 本研究旨在建立本中心去白细胞悬浮红细胞容量内部质量控制标准,以指导成分制备,加强内部质控,提高血液制剂的质量.方法 抽取本中心 2023 年 3-8 月使用 2 个厂家去白细胞型塑料血袋采集的全血1 523袋,分别称取过滤前及过滤后的重量,依据公式及测定的比重计算全血采集量、过滤损耗容量及产品容量.依据数据分布特征确定去白悬浮红细胞容量参考范围,分析全血采集量、过滤损耗容量及产品容量在两个厂家之间的差异.比较近一年去白细胞悬浮红细胞质控容量数据及另抽取的 100 袋去白细胞悬浮红细胞与参考区间的差异,验证参考区间的有效性.结果 样本总体全血采集量中位数为 402.0 mL,过滤损耗容量中位数为 41.4 mL;去白悬浮红细胞容量均数为 322.5 mL,其中使用厂家A去白细胞型塑料血袋的全血采集量(A:中位数 404.4 mL;B:中位数397.7 mL,P<0.01)及去白悬浮红细胞产品容量(A:均值 331.4 mL;B:均值 312.0 mL,P<0.01)均更高,且过滤损耗容量更低(A:中位数 39.5 mL;B:中位数 46.6 mL,P<0.01);去白悬浮红细胞容量数据标准差为 19.6,则去白悬浮红细胞容量参考区间为284.1～360.9 mL.验证样本及质控抽检数据均与区间样本无差异(P>0.05).结论 根据实际情况,将本中心去白细胞悬浮红细胞的容量标准确定为 284.1～360.9 mL.

目的:通过整合单细胞RNA测序(sing-cell RNA sequencing, scRNA-seq)和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据，探索肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)中差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)和预后相关基因，并构建基于这些基因的预后模型。为了更好地了解LUSC中的免疫微环境(tumor microenvironment, TME)，进一步分析了免疫细胞的浸润特征，揭示其与LUSC患者预后的潜在关联。方法:从基因表达综合数据库GEO(GSE118245)中获取LUSC单细胞RNA测序数据，并通过质量控制和数据标准化，鉴定出不同的细胞群体。使用Seurat软件包进行主成分分析(principal component analysis, PCA)和统一流形近似投影(uniform manifold approximation and projection, UMAP)进行降维聚类。基于TCGA数据库中的LUSC患者样本，使用TCGAbiolinks包获取批量RNA测序数据，并对肿瘤样本和正常样本之间的DEGs进行筛选，采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)构建基因共表达网络。使用Cox回归和最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)回归构建基于DEGs的预后模型，Kaplan-Meier生存曲线评估患者总生存期(overall survival, OS)。使用CIBERSORT算法评估不同风险组中的免疫细胞浸润比例，比较22种免疫细胞在高风险和低风险组中的差异。结果:从LUSC单细胞数据中质控得到出5 360个细胞，注释为13个不同的细胞群，并通过SingleR注释为8种细胞类型。与对照组相比，LUSC组中的中性粒细胞、CD4＋ T细胞和骨骼肌细胞比例显著上升。差异表达基因分析共筛选出3 396个DEGs，其中1 851个基因上调，1 545个基因下调。GO和KEGG富集分析表明，DEGs主要参与细胞周期、感染和补体级联反应等重要生物过程。在TCGA-LUSC数据中，使用WGCNA识别出与LUSC发展显著相关的蓝色模块，在此基础上筛选出61个交集基因进行进一步分析。单因素Cox回归和LASSO回归分析共识别出4个独立的预后相关基因(ITIH3、MME、PLAAT1和ATP13A5)，构建了风险评分模型。Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组患者的总生存期显著低于低风险组。免疫浸润分析结果表明，高风险组患者肿瘤中的CD8＋ T细胞、活化的记忆CD4＋ T细胞和滤泡辅助性T细胞比例显著高于低风险组，进一步支持了免疫微环境对LUSC进展的关键作用。结论:通过整合单细胞和TCGA数据，成功鉴定了LUSC中的关键差异表达基因，构建了有效的预后模型。模型在多个验证队列中表现出预后预测，揭示的免疫细胞浸润特征为LUSC的免疫微环境提供了新的见解。免疫细胞在LUSC的发生和进展中发挥重要作用。

目的:研究甘肃不同产地党参性状、无机元素及党参炔苷(LBT)差异,分析彼此间的相关性,为党参质量评价及产地归属提供依据.方法:收集甘肃9个产地党参药材,进行性状比较,并采用原子吸收光谱法测定党参中10种无机元素含量;采用高效液相色谱法(HPLC)测定LBT含量;并统计分析无机元素和LBT含量,联合性状进行相关性研究.结果:不同产地党参性状、无机元素及LBT含量存在差异,各元素平均含量高低顺序大致为 K＞Mg＞Ca＞Na＞Fe＞Mn＞Co＞Zn＞Ni＞Cu;LBT含量范围为 0.75～6.50 mg/g.聚类分析将其分为四类.相关性分析表明不同产地党参中LBT含量与Mn、Na、Mg含量呈显著正相关;Co含量与党参"菊花心"特征呈负相关;Fe、Ca含量与党参根头部横环纹特征存在正相关.正交偏最小二乘法判别分析发现LBT、K、Mn、Ca、Na、Mg是鉴别不同产地党参的主要成分元素.结论:不同产地党参性状、无机元素及LBT含量表现出一定的相关性,三方面联合可有效评价党参质量及产地归属.

目的:通过机器学习结合生物信息学技术以筛选核心预后价值的巨噬细胞的特征基因，并且探索其与免疫微环境、肿瘤免疫治疗的关系。方法:本研究搜集TCGA数据库中COAD数据集和GEO数据库中（GSE39582）数据集。CIBERSORT法计算肿瘤样本中M2型巨噬细胞水平，通过相关性分析、单因素和多因素Cox回归分析和随机生存森林算法筛选特征基因。ESTIMATE算法计算肿瘤样本的免疫微环境评分（间质评分与免疫评分），并且研究特征基因及其关系，最后在免疫治疗队列中进行验证。结果:本研究确定PPM1M与MRAS作为机器学习确定的核心预后基因。在TCGA数据中，高表达水平MRAS人群拥有更短的无进展生存时间（P=0.0013）。在GEO数据中，高表达PPM1M基因（P=0.031）和MRAS基因（P=0.002）均与复发相关。PPM1M、MRAS基因和肿瘤免疫评分和间质评分均呈正相关、与抑制性调节T淋巴细胞水平呈正相关。最后，在免疫治疗评价中，高表达的PPM1M和MRAS患者接受免疫治疗的预后更好。结论:机器学习确定的M2型巨噬细胞特征基因与生存、复发和进展相关。在免疫微环境中，PPM1M和MRAS均与抑制性的肿瘤免疫成分和间质成分呈正相关。此外，PPM1M和MRAS可能成为免疫治疗疗效的新型标志物。

本文通过扫描电镜(SEM)、氨基酸分析、傅立叶红外光谱(FTIR)、X 射线晶体衍射(XRD)和热重分析(TG)等技术对二化螟盘绒茧蜂 Cotesia chilonis茧丝纤维的微观形态、氨基酸类别与组成、二级结构和热稳定性等作了分析.结果表明,二化螟盘绒茧蜂的茧丝纤维表面较为粗糙,直径为 1.89±0.04 μm.茧丝纤维主要由碳(60.67%)、氮(21.17%)和氧(17.22%)等元素组成,其丝蛋白主要成分包括天冬氨酸/天冬酰胺、丝氨酸和丙氨酸等;蛋白二级结构主要为 β-折叠;其峰值降解温度为 332.27℃±2.58℃.本文研究揭示了二化螟盘绒茧蜂茧丝纤维的结构特征与理化性能,为拓展该蜂的应用领域、开发性能优越的非蚕丝蛋白以及设计改造新型丝蛋白纤维提供基础.

目的 分析2012-2021年山东省县域道路交通伤害死亡率的时空聚集特征,为制定精准防制策略提供依据.方法 利用山东省死因登记报告系统数据,计算交通伤害死亡率.分别采用Geoda 1.18和SatScan 9.7进行空间自相关和时空扫描分析以探索时空聚集特点,并运用主成分回归分析探索其影响因素.结果 2012-2021年山东省道路交通伤害死亡率总体呈下降趋势,秋季偏高.各年均存在空间相关性,"高—高"聚集区主要位于鲁中南和鲁西北.时空扫描显示全人群存在4个聚集区,一级聚集区存在于2012年3月至2015年2月,覆盖26个区县,主要位于鲁中南.城乡与总人群相似,均主要位于鲁中南,城市主要聚集区存在于2012年1月至2014年12月,覆盖19个区县;农村主要聚集区存在于2012年1月至2014年12月,覆盖38个区县.主成分回归分析显示,反映经济、交通情况的变量影响较大,其中常住人口数、客货运输量与死亡率呈正相关,其他呈负相关.结论 2012-2021年山东省道路交通伤害死亡率总体呈下降趋势.主要聚集区存在于鲁中南,且农村聚集更明显.提示应根据聚集性特征,关注高风险地区的法律执行、基础设施建设、人口流动等影响因素,因地制宜地采取或调整防控策略.

本研究旨在阐明烟草甲Lasioderma serricorne Defensin(LsDef1 和LsDef2)基因在响应细菌侵染过程中的功能.利用生物信息学分析了 LsDef1 和 LsDef2 编码蛋白的结构、特征和系统进化关系.采用实时荧光定量 PCR(RT-qPCR)技术检测LsDef1 和LsDef2 在烟草甲不同发育阶段(卵、1龄幼虫、2龄幼虫、3龄幼虫、4龄幼虫、蛹、成虫)、4 龄幼虫不同组织(脂肪体、表皮、中肠、血细胞和马氏管)、病原微生物诱导情况、细菌及细菌细胞壁成分胁迫后的表达模式.序列比对发现烟草甲LsDef1 和LsDef2 具有典型的6个半胱氨酸,形成3对二硫键,属于β防御素.RT-qPCR显示LsDef1 和LsDef2 基因在烟草甲不同发育阶段均有表达,在幼虫 4 龄处于高水平表达;主要表达组织为脂肪体(Fat body)和血细胞(Hemocyte),其次为表皮和中肠,而在马氏管的表达水平最低.外来病原物诱导后,LsDef1 和LsDef2 基因表达量显著增加,对金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus诱导最为敏感,进一步得细菌和细菌细胞壁成分诱导表达模式显示金黄色葡萄球菌诱导高峰期出现在诱导后 6 h;PGN-SA 诱导表达高峰期为3 h.烟草甲LsDef1 和LsDef2 是一类可被革兰氏阳性菌诱导的抗菌肽,研究结果为进一步研究昆虫防御素类抗菌肽的功能奠定了基础.

中药谱效关系是利用数据分析技术将有效物质群特征峰与中药药效信息关联,反映中药物质成分与功效强度间复杂关系的一种方法.自中药谱效关系被提出后,由于其在中药活性成分群整体特征精细表达与中药多指标、多靶点作用机制联系上表现出的显著优势,现已被广泛应用于中药的质量控制、药效物质基础、炮制前后药效研究及有效部位筛选等研究领域.本文通过整理近十年中药谱效关系研究的相关文献资料,在中药谱效关系研究不断拓展、完善的新形势下,对中药谱效关系的研究策略及在中药多领域中的研究现状进行梳理与提炼,同时针对当前中药谱效关系研究存在的核心问题,进行初步分析展望,以期为谱效关系在中药多领域的深入研究提供参考.

组织蛋白酶在昆虫的消化、发育与变态中起重要作用,是捕食性蝽唾液(毒液)中普遍存在的成分,但其生理功能尚不清楚.本文利用同源比对的方法从蠋蝽Arma custos基因组中鉴定出组织蛋白酶基因,使用生物信息学软件分析其序列特征和进化关系,采用 RT-PCR 技术分析它们在成虫不同组织中的表达特征.结果表明,蠋蝽基因组中有 37个组织蛋白酶基因,根据结构域分为组织蛋白酶B(AcCAB1-4)、组织蛋白酶D(AcCAD1-13)和组织蛋白酶 L(AcCAL1-20).多序列比对及结构域预测结果表明,组织蛋白酶 B 和组织蛋白酶 L 均含有Peptidase_C1 结构域、保守的酶催化位点(谷氨酰胺、半胱氨酸、组氨酸和天冬酰胺)以及 1 个由半胱氨酸残基(C)和组氨酸残基(H)构成的催化二联体,而组织蛋白酶 D 中存在保守 Asp 结构域和 2 个保守的酶催化位点(天冬氨酸).RT-PCR结果显示,除AcCAL7和AcCAB2外,其余33个组织蛋白酶基因均在肠道中表达,且绝大多数表现特异性或高表达.AcCAL2、AcCAL5-7、AcCAL9等 20个组织蛋白酶基因在唾液腺中表达,且AcCAL2仅在主腺后叶和副腺表达,AcCAL7仅在主腺前叶表达,AcCAD13仅在主腺后叶表达,AcCAB2仅在主腺前叶和主腺后叶表达.这些结果表明,多数组织蛋白酶基因在蠋蝽口外消化和肠道消化中发挥消化功能.