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基于PDCA循环的新药临床研究中人类遗传资源管理实践
编辑人员丨2天前
目的:旨在通过对医疗机构的临床研究人类遗传资源的管理,确保遗传资源利用的合理合法,维护国家生物安全。方法:采用文献阅读和调查法,利用戴明环,从计划、实施、检查、制定对策4个环节对本院的人类遗传资源管理进行持续的质量改进。结果:医院人类遗传资源管理理念得到认可,管理质量显著提升。结论:PDCA循环管理方法对于医疗机构新药临床研究中的人类遗传资源管理有着积极意义,是现行制度下提升管理水平的有效途径。
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编辑人员丨2天前
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颅额鼻综合征患者1例的临床及遗传学分析
编辑人员丨2天前
目的:探讨1例颅额鼻综合征(CNFS)患者的临床特征及遗传学病因。方法:选取2021年11月13日于贵阳市妇幼保健院就诊的1例CNFS患者为研究对象。收集患者的临床资料,抽取患者及其父母的外周静脉血样,进行家系全外显子组测序(trio-WES)与Sanger测序验证,并对候选变异进行生物信息学分析。结果:患者为15岁女性,以前额膨凸、眼距与鼻背过宽、双鼻尖为主要临床表现。基因检测结果提示其携带 EFNB1基因c.473T>C(p.M158T)杂合错义变异,其父母均未携带该变异。生物信息学分析: EFNB1基因c.473T>C(p.M158T)变异在HGMD及ClinVar数据库中未见收录,在1000 Genomes、ExAC、gnomAD及神州基因组数据云等数据库中均未见人群携带频率收录;经REVEL在线软件预测,该变异对基因或基因产物可造成有害影响;经UGENE软件分析,该变异位点所编码的氨基酸在不同物种间高度保守;经AlphaFold2软件进行3D建模显示,该变异可能影响Ephrin-B1蛋白的结构与功能。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南与临床基因组资源中心(ClinGen)的建议,该变异被评级为致病性变异。 结论:结合患者的临床特征与基因检测结果,确诊其为CNFS, EFNB1基因c.473T>C(p.M158T)杂合错义变异可能为该患者的遗传学病因。上述发现为其家系的遗传咨询和产前诊断提供了依据。
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编辑人员丨2天前
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口腔医学领域人类遗传资源管理存在问题及对策探讨
编辑人员丨2天前
目的:对口腔医学领域人类遗传资源管理存在的问题进行分析,并探讨相应对策。方法:通过对科技部人类遗传资源事项公示信息中口腔医学相关项目的整理分析,结合文献和科研管理负责人访谈,提炼总结口腔医疗机构人类遗传资源管理中存在的问题,并提出管理对策。结果:口腔医学领域人类遗传资源利用活动获批项目61项,呈逐年增加趋势。其中口腔专科医疗机构为组长单位获批项目43项。口腔医疗机构人类遗传资源管理存在资源开发利用不足、生物样本库亟待发展和资源共享机制待完善等问题。访谈结果显示,人类遗传资源管理有待完善,管理部门和专业管理人员的制度建设和培训等方面有待加强。结论:口腔医学院校和医疗机构应全面统筹机构人类遗传资源管理,建立健全管理体系,加强生物样本库建设,多途径拓展共享资源,充分利用人类遗传资源开展研究,促进口腔医学高质量发展。
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编辑人员丨2天前
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基于真实世界研究的淋巴瘤研究数据库建设与应用
编辑人员丨2天前
目的:针对临床数据数量庞大和质量差的现状,本研究旨在以建立淋巴瘤研究数据库为例,探索高质量研究数据库的建立路径以及在真实世界研究的作用。方法:汇总研究领域专家意见,参考相关指南和标准,建立标准医学知识库;回顾性抽取2005年2月-2021年12月期间就诊于北京大学肿瘤医院淋巴瘤患者电子诊疗数据,采用深度学习、自然语言处理等方式,搭建"基于电子病历系统的淋巴瘤数据库-生物样本信息库-延伸遗传信息库"的动态智能信息整合与处理系统。结果:研究数据库在满足了临床科研人员的研究需求的同时,实现医院病历数据和生物样本信息数据的申请、审批、溯源和分析全过程留痕管理。数据库中核心科研变量总数为668个,结构化变量占46.0%。截至2021年12月25日,数据库中共有淋巴瘤患者68 687人,男女患者人数比值为8/9,就诊次≥3次的患者占比为23.0%。此外,研究者可在数据库中根据目标条件叠加检索,显示命中的就诊记录,建立研究队列,进行统计建模,挖掘数据信息。结论:通过整合管理流程和利用自然语言人工智能新技术建立循证等级高的数据库,有助于医院信息系统的互联互通与资源共享,从而达到为开展真实世界研究提供可靠详实数据的目的。
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编辑人员丨2天前
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中国乳腺癌专病队列研究:泛共享生物样本库的建设与进展
编辑人员丨2天前
目的:生物样本库建设在疾病的精准预防、诊治研究中发挥着不可替代的作用,基于大人群队列的可共享生物样本库网络是未来发展方向。本研究的生物样本库是国家精准医学计划"中国乳腺癌专病队列研究"的重点内容之一,旨在解决标准化程度不足、共享性不够的瓶颈。方法:通过建设"实体库-信息库-延伸库"、泛共享的乳腺癌专病队列生物样本库网络以及建立严格的标准制定与质量控制标准建设标准化生物样本库。结果:生物样本库为乳腺癌风险评估、预测预警、早期筛查、分型分类、个体化治疗、疗效和安全性预测及监控等精准防治诊治方案和临床决策系统研究提供可共享的生物样本库资源。结论:生物样本库资料细化完整,病例样本量充足,可满足医疗大数据、基因组学、代谢组学和表观遗传学等多个领域的研究需要。
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编辑人员丨2天前
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分子诊断技术在儿童炎症性肠病诊治中的意义
编辑人员丨2天前
随着生物学信息技术的不断发展,分子诊断越来越多地被应用于临床实践与治疗。儿童炎症性肠病(IBD)是感染、免疫、环境等因素作用于特定遗传背景下引起的慢性肠道炎症。儿童IBD,尤其是早发、极早发IBD的发病与单基因缺陷关系更为密切。在临床工作中早期识别这类患儿,及时完善基因检测,不仅可以明确基因缺陷类型,而且可以揭示其炎症信号传导通路,为治疗方案选择提供理论依据。同时IBD治疗药物相关的药物遗传学直接影响机体对药物的应答率,从而影响临床缓解及肠黏膜修复,因此尽快了解与揭示亚裔人口的自身药物免疫原性,对减少不必要的医疗资源浪费、减少患儿在诱导缓解及维持缓解期不必要的药物不良反应、减少并发症及复发十分重要。总之,分子诊断在儿童IBD诊治中的意义不仅仅限于病因诊断,对治疗方法及药物选择也有指导意义。
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编辑人员丨2天前
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我国HIV流行毒株分离培养与标准株筛选鉴定
编辑人员丨2天前
目的:通过对我国人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者全血样本中的HIV进行分离培养与基因型、表型鉴定,筛选符合中华预防医学会团体标准《病原微生物菌(毒)种标准株艾滋病病毒毒株建立技术规范》(T/CPMA 027—2023)评价要求的HIV标准株。方法:收集48份HIV感染者全血样本;通过分离样本中的外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),并将其与健康人全血样本中分离得到的PBMCs共培养分离感染者体内的HIV,测定培养上清液中的p24抗原浓度和病毒滴度;对于分离成功的毒株,提取病毒RNA,对 gag、 pol基因和 env C2V3片段进行扩增测序,判断基因型、基因重组和耐药位点;通过将病毒培养上清液接种到表达CCR5或CXCR4的Ghost细胞,判断病毒嗜性;通过将病毒培养上清液接种MT-2细胞,观察合胞体的形成。 结果:从48份HIV感染者的新鲜EDTA抗凝全血中分离培养出14株病毒培养上清液的p24抗原浓度>1 ng/ml的HIV毒株;1株病毒滴度≥10 5TCID 50/ml,8株滴度≥10 4TCID 50/ml,5株滴度≥10 3TCID 50/ml;其基因型为9株B亚型、3株CRF01_AE重组型和2株CRF07_BC重组型;14株HIV毒株中11株含有耐药位点;细胞嗜性分析结果显示其中8株为CCR5嗜性,6株为CXCR4/CCR5双嗜性;14株毒株中只有2株可引起MT-2细胞病变,为合胞体诱导型。 结论:本研究共分离出14株具有HIV典型生物学、遗传学特性的HIV毒株,经评价1株为符合《病原微生物菌(毒)种标准株艾滋病病毒毒株建立技术规范》(T/CPMA 027—2023)的HIV标准株。本研究可为HIV-1标准株的筛选提供技术指导。下一步可按照标准株的共享机制完成申请及储备库建设,为HIV疫苗与药物研发等相关研究提供资源。
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编辑人员丨2天前
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中国国家出生队列研究调查对象的基线特征分析
编辑人员丨2天前
目的:探讨生命早期环境因素、遗传因素和遗传与环境交互作用对子代近期和远期健康的影响以及系统评价和比较辅助生殖受孕和自然受孕人群的妊娠结局和子代健康相关结局。方法:中国国家出生队列(CNBC)研究是一项覆盖辅助生殖受孕家庭和自然受孕家庭的多中心前瞻性出生队列研究。2016年,CNBC项目陆续在我国12个省(自治区、直辖市)的24所医院启动,以家庭为单位纳入研究对象,并在辅助生殖治疗前、胚胎移植、孕早期、孕中期、孕晚期及分娩时以及出生后第42天、6个月、12个月、36个月多个时点采集数据信息和生物样本。结果:截至2020年6月,CNBC共纳入27 044个辅助生殖受孕家庭,29 589个自然受孕家庭,CNBC的研究人群中绝大部分为城市居民。在辅助生殖受孕家庭中,男女双方分别有65.5%和63.7%为大学及以上文化程度,年龄为(33.83±5.52)和(32.38±4.67)岁;女方83.2%为初产妇,吸烟率为0.8%,饮酒率为2.1%。在自然受孕家庭中,男女双方分别有81.5%和86.5%为大学及以上文化程度,年龄为(32.06±5.09)和(30.40±4.27)岁,女方67.2%为初产妇,吸烟率为0.1%,饮酒率为2.2%。不同地区的辅助生殖受孕家庭和自然受孕家庭的基线特征均有差异。结论:CNBC的建立将为研究生命早期遗传、环境因素、遗传-环境交互作用以及辅助生殖技术治疗相关因素对出生后子代健康的影响提供了重要资源。
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编辑人员丨2天前
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《人类遗传资源管理条例实施细则》政策解读与新时期的管理策略分析
编辑人员丨2天前
目的:通过解读《人类遗传资源管理条例实施细则》(以下简称为"《细则》"),为各机构在新时期开展人类遗传资源的规范化管理提供建议。方法:梳理《细则》实施对人类遗传资源管理带来的挑战,结合实际工作经验讨论新时期人类遗传资源的管理策略。结果:人类遗传资源管理在生物样本安全、数据管理、知识产权保护和项目过程管理等方面仍面临重大挑战。结论:新时期各机构应加速生物样本平台和科研数据平台的建设,加强知识产权管理,优化项目过程管理,做好人类遗传资源管理和服务工作。
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编辑人员丨2天前
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精准医疗时代下减重代谢手术的发展
编辑人员丨2天前
精准医学是以个体化医疗为基础,随着基因组测序技术以及生物信息与大数据科学的交叉应用,而发展起来的新型医学模式。精准医疗模式的建立,有利于医疗资源的合理利用,实现患者利益最大化。减重代谢外科是新世纪的新兴学科,其发展任重道远,精准医疗的加入,使得减重代谢学科实现快速、正向发展。在精准医疗的大环境下,减重代谢外科现正处于起步阶段,现阶段精准减重代谢外科的成功实施初步着眼于对于术后体质量的预测以及表观生物遗传学在体质量差异方面的研究。而对于术后恢复、营养支持治疗、对患者的精确随访以及个体化治疗等方面,还有待填补空缺。未来可以通过建立多中心、大样本临床研究库,并完善临床登记数据,完成长期精准随访,实现大规模资源与数据的整合;利用好大数据平台进行深度的生物数据挖掘,以期利用大数据参考达到对肥胖治疗的精准预测与掌控,从而制定出详实的实施方案与细则标准。同时要注意患者隐私的保护,避免个人健康数据泄露。
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编辑人员丨2天前
