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甲状腺激素受体相互作用蛋白6和细胞分裂周期蛋白42在结直肠癌组织的表达及其临床意义
编辑人员丨1周前
目的:探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白6(TRIP6)和细胞分裂周期蛋白42(Cdc42)在结直肠癌组织中的表达,及其与结直肠癌临床特征和预后的关系。方法:收集2018年6月至2022年11月广东医科大学附属医院病理学确诊的112例结直肠癌组织标本和癌旁组织标本,采用免疫组织化学法检测上述组织中TRIP6和Cdc42表达,采用 χ2检验分析两者的表达与结直肠癌临床病理参数及预后的关系。 结果:TRIP6在结直肠癌组织中表达率明显高于癌旁组织[60.71%(68/112)比14.29%(16/112)],两者差异有统计学意义( χ2=51.505, P<0.01)。Cdc42在结直肠癌组织中表达率明显高于癌旁组织[52.68%(59/112)比10.71%(12/112)],两者比较差异有统计学意义( χ2=45.551, P<0.01)。TRIP6表达水平与结直肠癌患者淋巴结转移、TNM分期、浸润深度明显相关( χ2=4.385、5.499、6.220, P<0.05),TRIP6表达水平与结直肠癌患者性别、组织学分化程度、年龄、肿瘤部位无明显相关( χ2=0.019、0.007、0.178、0.084, P>0.05)。Cdc42表达水平与结直肠癌患者淋巴结转移、组织学分化程度、浸润深度、TNM分期明显相关( χ2=4.923、5.089、5.434、6.286, P<0.05),Cdc42表达水平与结直肠癌患者性别、年龄、肿瘤部位无明显相关( χ2=0.017、0.029、0.048, P>0.05)。 结论:TRIP6和Cdc42在结直肠癌组织中表达上调,其可能作为预测结直肠癌患者生物学行为和预后的分子标志物,TRIP6和Cdc42参与了结直肠癌的发生、发展过程。
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编辑人员丨1周前
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甲状腺激素受体相互作用蛋白6和高迁移率族蛋白B1在乳腺癌组织的表达及其临床意义
编辑人员丨1周前
目的:探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白6(TRIP6)和高迁移率族蛋白B1(HMGB1)在乳腺癌中的表达及其生物学意义。方法:收集齐齐哈尔医学院第五附属医院(大庆市龙南医院)2015年7月至2021年7月乳腺癌组织和癌旁组织标本112例,应用免疫组织化学方法检测以上组织中TRIP6和HMGB1的表达,采用 χ2检验结合临床病理资料行相关性分析。 结果:乳腺癌组织中TRIP6阳性表达率为74.11%(83/112),明显高于癌旁组织中TRIP6阳性表达率23.21%(26/112),两者之间的差异有统计学意义( χ2=58.060, P<0.01)。TRIP6表达水平与乳腺癌TNM分期(TNM stage)、肿瘤大小、组织学分级、淋巴结转移明显相关( χ2=5.586、9.156、4.658、5.812, P<0.05)。TRIP6表达水平与乳腺癌年龄、组织学分型无明显相关( χ2=0.001、0.066, P>0.05)。乳腺癌组织中HMGB1阳性表达率为65.18%(73/112),明显高于癌旁组织中HMGB1阳性表达率16.96%(19/112),两者差异有统计学意义( χ2=53.787, P<0.01)。HMGB1表达水平与乳腺癌TNM分期、淋巴结转移、肿瘤大小明显相关( χ2=5.899、0.004、5.080, P<0.05),差异有统计学意义。HMGB1表达水平与乳腺癌年龄、组织学分型、组织学分级无明显相关( χ2= 0.027、4.658、0.149, P>0.05)。 结论:TRIP6和HMGB1在乳腺癌组织中表达上调,TRIP6和HMGB1有助于乳腺癌患者预后的评估。
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编辑人员丨1周前
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泛素特异性蛋白酶7基因的泛癌分析及其在瘢痕溃疡癌变中的表达
编辑人员丨1周前
目的:探讨泛素特异性蛋白酶7(USP7)在瘢痕溃疡癌变过程中的生物学作用及其临床意义。方法:采用回顾性观察性研究结合生物信息学分析方法。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库中获取USP7在肿瘤和/或其对应癌旁正常组织中的RNA表达谱数据,并将RNA测序数据进行log 2转化。通过多维度癌症基因集cBioPortal数据库分析 USP7基因变异情况,并分析其突变位点。通过TIMER 2.0数据库中“差异表达”模块获得TCGA数据库中肿瘤、癌旁正常组织USP7 mRNA表达情况。使用基因表达谱交互分析2(GEPIA2)数据库分析皮肤黑色素瘤(SKCM)、宫颈鳞状细胞癌(CESC)、肺鳞状细胞癌(LUSC)和头颈鳞状细胞癌(HNSC)中高表达USP7患者与低表达USP7患者的生存率并绘制Kaplan-Meier生存曲线。利用Sangerbox数据库分析USP7在泛癌中的表达与微卫星不稳定性(MSI)或肿瘤突变负担(TMB)的相关性。通过GEPIA2数据库中“相关性分析”模块,评估USP7在泛癌中的表达与5种DNA错配修复基因( MLH1、 MSH2、 MSH6、 PMS2和 EPCAM)表达水平和3种必需DNA甲基转移酶(DNMT)——DNMT1、DNMT3A、DNMT3B表达水平的相关性。通过TIMER 2.0数据库中“免疫-基因”模块分析USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中表达及其与免疫细胞(B细胞、CD4 +T细胞、CD8 +T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞)浸润的相关性。利用GEPIA2数据库的“相似基因检测”模块获得与USP7表达模式相似且排名前100的蛋白集。将前述蛋白集与利用STRING数据库获得的与USP7有直接物理结合作用且排名前50的蛋白集进行交集分析。通过DAVID数据库对上述2个蛋白集进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。收集2018年10月—2022年10月武汉大学附属同仁医院暨武汉市第三医院病理科有相应临床病理特征的正常皮肤、增生性瘢痕、瘢痕溃疡、瘢痕癌的术后标本,采用免疫组织化学法检测组织中USP7表达情况,样本数为6。对数据行Log-rank检验、单因素方差分析及Bonferroni检验。 结果:在泛癌中, USP7的主要基因变异类型为突变和扩增,变异频率(>6%)居前3位的肿瘤依次为膀胱尿路上皮癌、SKCM和子宫内膜癌。 USP7基因在泛癌中的主要突变为错义突变。在突变频率最高的SKCM中,主要突变类型是USP7_ICP0_bdg结构域的错义突变。USP7 mRNA在乳腺浸润癌、胆管癌、结肠癌、食管癌、HNSC、肾嫌色细胞癌、肝细胞肝癌、肺腺癌、LUSC、前列腺癌和胃癌肿瘤组织中的表达均明显高于其对应的癌旁正常组织( P<0.05),在多形成性胶质细胞瘤、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌和甲状腺癌中的表达均明显低于其对应的癌旁正常组织( P<0.05);此外,USP7 mRNA在SKCM转移组织中的表达远高于其原发肿瘤组织( P<0.05)。生存曲线显示,在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中,高表达USP7患者与低表达USP7患者的存活率比较,差异均无统计学意义(Log-rank P>0.05,风险比分别为1.00、0.99、1.00、1.30)。USP7在结肠癌、结直肠癌、胸腺癌、甲状腺癌中的表达均与TMB呈显著负相关(Pearson相关系数分别为-0.26、-0.19、-0.19和-0.11, P<0.05);USP7在神经胶质瘤、CESC、肺腺癌、混合肾癌、LUSC中的表达均与MSI呈显著正相关(Pearson相关系数分别为0.22、0.14、0.15、0.08和0.14, P<0.05),在结肠癌、结直肠癌、乳腺浸润癌、前列腺癌、HNSC、甲状腺癌和弥漫性大B细胞淋巴瘤中的表达均与MSI呈显著负相关(Pearson相关系数分别为-0.31、-0.27、-0.13、-0.19、-0.16、-0.18和-0.53, P<0.05)。USP7在CESC中的表达与MSH2和MSH6的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.51和0.44, P<0.05),在HNSC中的表达与EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.39、0.14、0.49、0.54和0.41, P<0.05),在LUSC中的表达与EPCAM、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.20、0.36、0.40和0.34, P<0.05),在SKCM中的表达与EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.11、0.33、0.42、0.55和0.34, P<0.05);USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中的表达与DNMT1、DNMT3A和DNMT3B的表达均呈显著正相关(Spearman相关系数分别为0.42、0.34和0.22,0.45、0.52和0.22,0.36、0.36和0.22,0.38、0.46和0.21, P<0.05)。USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中的表达仅与CD4 +T细胞浸润呈显著正相关(Partial相关系数分别为0.14、0.22、0.13、0.16, P<0.05)。与USP7表达模式相似且排名前100的蛋白集中,排名前5的蛋白依次是C16orf72、BCLAF1、UBN、GSPT1、ERI2(Spearman相关系数分别为0.83、0.74、0.73、0.73和0.72, P值均<0.05)。与USP7有直接物理结合作用且排名前50的蛋白集与前述蛋白集的交集仅有1个蛋白,即为甲状腺激素受体相互作用因子12。KEGG富集分析显示,USP7相关基因涉及细胞周期、剪接体、细胞衰老和p53信号通路等。GO富集分析显示,USP7相关基因涉及转录调控、蛋白质泛素化、DNA修复和细胞质模式识别受体信号通路等。临床样本分析显示,USP7在增生性瘢痕(0.35±0.05)、瘢痕溃疡(0.43±0.04)和瘢痕癌(0.61±0.03)中的表达均明显高于正常皮肤(0.18±0.04), P<0.05。 结论:USP7可能为临床瘢痕溃疡癌变恶化的生物标志物。
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编辑人员丨1周前
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连续重复给予含左炔诺孕酮紧急避孕药对雌性大鼠生育力及其子代健康的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨连续重复给予含左炔诺孕酮(levonorgestrel,LNG)紧急避孕药(emergency contraception pills,ECPs)对雌性大鼠生育力及其F1代仔鼠健康的影响。方法:成年SPF级雌性大鼠于每个动情周期连续给予3次LNG-ECPs,分别给予3个(P-3)、6个(P-6)和12个(P-12)动情周期。雌性大鼠每个给药时程下,采用Excel产生随机数按体质量分层随机分为2组,分别为LNG-ECPs组和溶媒对照组,分别灌胃给予0.12 mg/kg LNG-ECPs和等体积溶媒。各组于末次给药后4 h分别取1/2动物(12~18只)进行解剖(6~9只)和交配(6~9只);剩余1/2动物(12~18只)于停药恢复3个动情周期后再分别进行解剖(6~9只)和交配(6~9只),计算脏器系数。采用酶联免疫吸附法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测雌性大鼠血清中卵泡刺激素(follicle-stimulating hormone,FSH)、黄体生成素(lutenizing hormone,LH)、雌激素、孕激素、睾酮、抗苗勒管激素(anti-Müllerian hormone,AMH)以及游离甲状腺激素3(free thyroid hormone,fT3)的水平。雌性大鼠卵巢组织切片苏木精-伊红(hematoxylin and eosin,HE)染色后进行卵泡计数。记录LNG-ECPs给药结束和停药恢复期雌性大鼠妊娠率及窝仔数,测定F1代仔鼠生长指数以及主动和被动运动能力等指标。取P-12大鼠卵巢组织进行转录组学测序,建立LNG-ECPs致卵巢差异表达基因谱,分析LNG-ECPs致卵巢损伤的差异基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:①连续给予3个和6个动情周期后,LNG-ECPs组雌鼠的血清激素水平和生育力与溶媒对照组相比,差异均无统计学意义(均 P>0.05);F1代仔鼠生长指数和行为学结果与溶媒对照组仔鼠相比差异均无统计学意义(均 P>0.05)。②连续给予12个动情周期后,与溶媒对照组相比,LNG-ECPs组大鼠血清中FSH[(0.21±0.17)U/L]、LH[(0.27±0.08)U/L]和孕激素[(0.68±0.23)μg/L]水平显著低于溶媒对照组[(1.00±0.82)U/L, P=0.043;(1.00±0.50)U/L, P=0.006;(1.00±0.20)μg/L, P=0.027],雌二醇[(2.24±1.03)μg/L]和睾酮[(1.25±0.25)μg/L]水平明显高于溶媒对照组[(1.00±0.35)μg/L, P=0.019;(1.00±0.07)μg/L, P=0.044];卵巢中原始卵泡数量(4.88±2.36)显著少于溶媒对照组(16.13±9.36, P=0.005),闭锁卵泡数量(24.38±5.01)显著高于溶媒对照组(19.13±2.30, P=0.018);LNG-ECPs组中F1代仔鼠负重游泳时间[(157.13±32.29)s]明显低于溶媒对照组[(198.06±40.01)s, P=0.003]。停药恢复3个动情周期后,LNG-ECPs可造成大鼠血清中FSH[(2.48±1.18)U/L]、LH[(1.60±0.41)U/L]、睾酮[(1.37±0.23)μg/L]及FSH/LH值(1.61±0.41)显著高于溶媒对照组[(1.00±0.67)U/L, P=0.024;(1.00±0.27)U/L, P=0.014;(1.00±0.18)μg/L, P=0.011;1.00±0.49, P=0.042],且雌激素水平[(0.49±0.15)μg/L]和AMH水平[(0.79±0.15)μg/L]显著低于溶媒对照组[(1.00±0.37)μg/L, P=0.011;(1.00±0.10)μg/L, P=0.016],同时,大鼠卵巢中原始卵泡数量(6.25±5.06)仍显著少于溶媒对照组(12.00±5.56, P=0.048);F1代仔鼠在旷场中的运动总距离[(89.85±36.98)m]以及负重游泳时长[(112.00±29.52)s]均显著低于溶媒对照组[(147.55±23.13)m, P<0.001;(137.69±25.85)s, P=0.014]。③转录组测序结果表明,与溶媒对照组相比,LNG-ECPs组雌性大鼠卵巢组织中存在 Cd5、 Cxcr1、 Lexm、 Fga、 Mybphl和 Gstm5等显著差异表达的基因,参与萜类骨架生物合成、卵巢类固醇生成和皮质醇的合成与分泌等类固醇激素合成相关过程,还涉及碳代谢、丁酸甲酯代谢和半胱氨酸等物质代谢过程,以及细胞因子-细胞因子受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用等免疫调节过程。 结论:在雌性大鼠中,短期重复(<12个周期)给予LNG-ECPs对雌鼠生育力及其F1代仔鼠生长发育和行为学未见明显影响;而长期重复(12个周期)给予LNG-ECPs会导致卵巢功能损伤,并会对F1代仔鼠的健康产生负面影响,停药恢复3个动情周期后仍未见明显改善。
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编辑人员丨1周前
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成髓细胞瘤转录因子第2亚型和甲状腺激素受体相互作用蛋白6在胃癌组织的表达及其临床意义
编辑人员丨1周前
目的:探讨成髓细胞瘤转录因子第2亚型(MYBL2)和甲状腺激素受体相互作用蛋白6(TRIP6)的表达与胃癌临床病理因素和预后之间的关系。方法:选取大庆市龙南医院(齐齐哈尔医学院第五附属医院)和广东医科大学附属医院2018年11月至2022年11月病理资料完整的105例胃癌组织标本和对应癌旁组织标本,应用免疫组织化学方法检测上述胃癌组织和对应癌旁组织中MYBL2和TRIP6表达水平,采用 χ2检验进行相关分析。 结果:胃癌组织中MYBL2表达率明显高于对应癌旁组织中MYBL2表达率[74.29%(78/105)比32.38%(34/105)],差异有统计学意义( χ2=37.041, P<0.01)。MYBL2表达水平与胃癌患者TNM分期、淋巴结转移明显相关( χ2=6.881、5.735, P<0.05),MYBL2表达水平与胃癌患者年龄、组织学分化程度、性别无明显相关( χ2= 0.008、0.037、0.059, P>0.05)。胃癌组织中TRIP6表达率明显高于对应癌旁组织中TRIP6表达率[66.67%(70/105)比27.62%(29/105)],差异有统计学意义( χ2=32.124, P<0.01)。TRIP6表达水平与胃癌患者组织学分化程度、TNM分期、淋巴结转移明显相关( χ2=4.952、6.983、6.217, P<0.05),TRIP6表达水平与胃癌患者年龄、性别无明显相关( χ2= 0.179、0.175, P>0.05)。 结论:胃癌组织中MYBL2和TRIP6表达水平升高,MYBL2和TRIP6参与胃癌的发生、发展过程,MYBL2和TRIP6可以作为预测胃癌患者预后的生物学指标。
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编辑人员丨1周前
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子宫平滑肌瘤中TRIP6蛋白及mRNA的表达
编辑人员丨2023/9/30
目的 探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白 6(thyroid receptor-interacting protein 6,TRIP6)在子宫平滑肌瘤中的表达及临床靶向药物治疗中的意义.方法 采用Western blot法检测子宫平滑肌瘤和瘤旁正常子宫平滑肌组织中TRIP6蛋白表达,应用RT-PCR检测子宫平滑肌瘤和瘤旁正常子宫平滑肌组织中TRIP6 mRNA表达.结果 11 例子宫平滑肌瘤组织中,有 8 例(8/11,72.72%)TRIP6 蛋白表达低于正常子宫平滑肌组织(P<0.05);有 7 例(7/11,63.64%)TRIP6 mRNA表达显著低于正常子宫平滑肌组织(P<0.05);其中,有7 例(7/11,63.64%)TRIP6 蛋白与mRNA表达水平一致降低.结论 TRIP6 在子宫平滑肌瘤中的表达降低,提示TRIP6 表达降低可能与子宫平滑肌瘤的发生、发展相关.
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编辑人员丨2023/9/30
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TRIP6在120例胃癌组织中的表达及其临床意义
编辑人员丨2023/8/6
[目的]探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白6(TRIP6)蛋白在胃癌中的表达及临床意义.[方法]采用免疫组化法检测120例胃癌组织和相应癌旁组织中TRIP6蛋白的表达,并分析其与临床病理学参数和预后的关系.[结果] TRIP6蛋白在胃癌组织中阳性表达率为70.8% (85/120),显著高于癌旁组织的35.0% (42/120)(P<0.05).TRIP6蛋白表达与胃癌患者的肿瘤大小、肿瘤浸润深度、分化程度、淋巴结转移、远处转移及TNM分期密切相关(P<0.05).Kaplan-Meier分析显示TRIP6表达阳性患者有着更差的预后(5年生存率11.8%vs 45.7%,P<0.05).多因素分析显示,胃癌患者TNM分期、远处转移以及TRIP6表达是影响胃癌患者预后的独立危险因素.[结论] TRIP6蛋白在胃癌组织中表达上调,且与胃癌患者不良预后相关,TRIP6的检测将有助于胃癌的诊断、胃癌患者恶性程度和预后的评估.
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编辑人员丨2023/8/6
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甲状腺激素受体相互作用蛋白6在胰腺癌发病机制中的作用
编辑人员丨2023/8/6
甲状腺激素受体相互作用蛋白6(thyroid hormone receptor interactor 6,TRIP6)又被称为Zyxin相关蛋白1(Zyxinrelated protein 1,ZRP-1),是属于LIM蛋白Zyxin家族的一种调节蛋白.TRIP6最初作为与胞核甲状腺素受体相互作用的蛋白质被发现,后来作为一种局部黏附分子被认识,其可募集各种分子,参与肌动蛋白细胞骨架重组、细胞黏附、细胞迁移、抗凋亡应答和转录调控等反应.TRIP6可参与溶血磷脂酸受体2 (lysophosphatidic acid-2,LPA2)-Fas/CD95介导的细胞迁移,可通过与MAGI-1b PDZ支架蛋白作用提高细胞侵袭性;还可调节LPA2介导的抗凋亡信号途径,对抗Fas/CD95引起的凋亡,调节NF-κB信号通路[1].
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编辑人员丨2023/8/6
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柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的网络药理学研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制.方法 从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用OMIM、TTD和PharmGkb数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标.采用Excel筛选分子和靶标,Cytoscape软件建立柴胡疏肝散的中药成分-靶点网络图,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对基因功能及代谢通路进行分析.结果 从数据库筛选出柴胡疏肝散122个中药成分与卒中后抑郁的42个靶蛋白相互作用,其中雌激素受体(ESR1)、前列素内环氧化物合成酶2(PTGS2)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)、SLC6A4和白三烯A4水解酶(LTA4H)为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点,主要涉及花生四烯酸代谢通路、5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路,通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁.结论 通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制,为进一步阐明其作用靶点奠定了基础.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于GEO甲状腺癌芯片数据的生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 用生物信息学分析方法挖掘甲状腺癌的关键基因并探索其发病机制.方法 从公共基因芯片数据库(GEO)中下载3组甲状腺癌表达谱芯片数据,采用R软件筛选甲状腺肿瘤组织与癌旁组织差异表达基因,对差异表达基因作GO富集分析 、KEGG通路分析 、蛋白质相互作用(PPI)网络分析,利用Cytoscape建立PPI互作模块.结果 (1)经差异分析得到差异表达基因383个,其中上调基因217个,下调基因166个.(2)GO富集结果显示,上调基因主要富集在细外基质组织 、胶原纤维组织 、调节细胞增殖等生物学过程,下调基因主要富集在调节脂肪细胞分化 、肾发育 、内分泌系统发育等生物学过程.(3)KEGG信号通路结果显示,上调基因主要参与ECM受体相互作用 、磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PI3K-Akt)信号通路 、血小板活化等信号通路,下调基因主要参与癌症转录失调 、甲状腺激素合成 、TGF-β 信号通路等信号通路.(4)基于String数据库型筛选出CDC6、AURKA、FEN1、MCM4和MYC 5个degree得分较高的中心基因,Cytoscape软件MCODE插件共筛选出显著模块3个,涉及基因主要富集在DNA复制 、细胞周期等信号通路.结论 本研究获取了5个与甲状腺癌发生 、发展相关的关键基因,包括CDC6、AURKA、FEN1、MCM4和MYC.这些基因主要是参与DNA复制 、细胞周期 、PI3K-Akt信号通路 、ECM受体相互作用等与甲状腺癌相关的生物过程发挥作用.
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编辑人员丨2023/8/6
