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卵巢肿瘤结构域蛋白酶1在脓毒症小鼠急性肺损伤中的作用:与TAK1-MAPK信号通路的关系
编辑人员丨6天前
目的:评价卵巢肿瘤结构域蛋白酶1(OTUD1)在脓毒症小鼠急性肺损伤中的作用及其与转化生长因子β活化激酶1 (TAK1)-丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的关系。方法:雄性野生型和OTUD1基因敲除的C57BL/6N小鼠各20只,6~8周龄,体质量20~25 g。采用随机数字表法分别分为野生型假手术组(WT-Sham组)、野生型脓毒症组(WT-SEP组)、OTUD1基因敲除型假手术组(KO-Sham组)和OTUD1基因敲除SEP组(KO-SEP组),每组10只。采用盲肠结扎穿孔法制备脓毒症小鼠急性肺损伤模型。于术后24 h时处死小鼠,采集腹主动脉血样,取肺组织。采用血气分析仪行血气分析,计算氧合指数(OI),光镜下观察肺组织形态学并计算肺损伤评分,确定肺组织湿重/干重(W/D)比值,测定髓过氧化物酶(MPO)活性;采用ELISA法测定血浆TNF-α和IL-6浓度,Western blot法检测肺组织OTUD1、磷酸化(p-)TAK1、p38、c-Jun氨基末端激酶(JNK)和细胞外调节蛋白激酶(ERK)的表达。结果:与WT-Sham组比较,WT-SEP组小鼠PaO 2和OI降低,肺损伤评分、W/D比值、MPO活性、血浆TNF-α和IL-6浓度升高,肺组织OTUD1、p-TAK1、p-p38、p-JNK和p-ERK表达上调( P<0.05);与WT-SEP组比较,KO-SEP组小鼠PaO 2和OI降低,肺损伤评分、W/D比值、MPO活性、血浆TNF-α和IL-6浓度升高,肺组织p-TAK1、p-p38、p-JNK和p-ERK表达上调( P<0.05)。 结论:OTUD1参与了脓毒症小鼠急性肺损伤的内源性保护机制,可能与抑制TAK1-MAPK信号通路激活,降低炎症反应有关。
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编辑人员丨6天前
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泛素连接酶Cullin3对三阴性乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及其机制探讨
编辑人员丨6天前
目的:探讨泛素化连接酶E3蛋白(Cullin3,CUL3)对三阴性乳腺癌(TNBC)细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响及其作用机制。方法:基于生物信息学方法获取TNBC组织中CUL3基因和蛋白的表达数据,评估CUL3在TNBC患者肿瘤组织( n=160)中和正常乳腺组织(NC)( n=572)中的表达及其与临床预后的关系。通过CCK8细胞增殖实验、划痕实验、Transwell实验检测过表达CUL3对TNBC细胞体外增殖、迁移及侵袭能力的影响;通过免疫共沉淀(IP)联合质谱分析筛选出可能与CUL3相互作用的蛋白质,确定CUL3调控的底物蛋白为谷胱甘肽S-转移酶P1(GSTP1);通过划痕实验、Transwell实验检测过表达GSTP1对TNBC细胞迁移及侵袭能力的影响,探索过表达CUL3是否可以逆转GSTP1对细胞迁移及侵袭能力的影响;通过Western 印迹和IP检测CUL3对GSTP1蛋白泛素化修饰的影响,验证CUL3调控GSTP1表达影响TNBC迁移和侵袭的分子机制。 结果:CUL3在TNBC中表达量显著增高( P<0.000 1),CUL3高表达与TNBC患者预后不良相关,高表达CUL3的TNBC患者总生存期(OS)、无病生存期(RFS)均更短(OS, P=0.018;RFS, P=0.008);过表达CUL3可显著增加TNBC细胞增殖(231细胞组 F=11.97, P=0.002;468细胞组 F=51.92, P<0.001)、迁移[231细胞系和468细胞系过表达组穿膜细胞数分别为(74.7±4.0)、(128.0±6.1)个,而空白对照(NC)组分别为(21.0±2.7)、(70.0±6.6)个,231和468细胞组 t分别为-19.24和-11.23, P均<0.001]和侵袭能力(231细胞系和468细胞系过表达组48 h细胞增殖率分别为56.6%±4.4%、51.6%±3.7%,而NC组分别为40.5%±2.9%、32.9%±4.8%,231细胞组 t=-5.26, P=0.006 3;468细胞组 t=-5.38, P=0.005 8);GSTP1在TNBC表达中降低,上调GSTP1可抑制TNBC细胞迁移[231细胞系和468细胞系过表达组穿膜细胞数分别为(16.3±6.5)、(33.0±6.2)个,而NC组分别为(34.3±2.5)、(77.3±5.0)个,231细胞组 t=5.44, P=0.006;468细胞组 t=7.20, P=0.002]和侵袭(231细胞系和468细胞系过表达组48 h细胞增殖率分别为49.6%±1.7%、36.2%±1.4%,而NC组分别为59.4%±4.7%、53.0%±1.7%,231细胞组 t=3.42, P=0.027;468细胞组 t=13.18, P<0.001),而上调CUL3可逆转GSTP1对细胞迁移[231细胞系和468细胞系过表达组穿膜细胞数分别为(37.0±1.0)、(67.0±5.3)个,231细胞组 t=-3.97, P=0.017;468细胞组 t=-6.12, P=0.004]、侵袭(231细胞系和468细胞系过表达组48 h细胞增殖率分别为71.9%±3.6%、59.4%±2.1%,231和468细胞组 t值分别为-9.61和-16.01, P均<0.001)的抑制作用;CUL3通过增加GSTP1泛素化修饰,促进泛素-蛋白酶体系统降解GSTP1蛋白,从而降低GSTP1蛋白的稳定性。 结论:过表达CUL3通过促进GSTP1泛素化降解诱导细胞迁移和侵袭,从而促进TNBC发生发展。
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编辑人员丨6天前
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泛素特异性蛋白酶7基因的泛癌分析及其在瘢痕溃疡癌变中的表达
编辑人员丨6天前
目的:探讨泛素特异性蛋白酶7(USP7)在瘢痕溃疡癌变过程中的生物学作用及其临床意义。方法:采用回顾性观察性研究结合生物信息学分析方法。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库中获取USP7在肿瘤和/或其对应癌旁正常组织中的RNA表达谱数据,并将RNA测序数据进行log 2转化。通过多维度癌症基因集cBioPortal数据库分析 USP7基因变异情况,并分析其突变位点。通过TIMER 2.0数据库中“差异表达”模块获得TCGA数据库中肿瘤、癌旁正常组织USP7 mRNA表达情况。使用基因表达谱交互分析2(GEPIA2)数据库分析皮肤黑色素瘤(SKCM)、宫颈鳞状细胞癌(CESC)、肺鳞状细胞癌(LUSC)和头颈鳞状细胞癌(HNSC)中高表达USP7患者与低表达USP7患者的生存率并绘制Kaplan-Meier生存曲线。利用Sangerbox数据库分析USP7在泛癌中的表达与微卫星不稳定性(MSI)或肿瘤突变负担(TMB)的相关性。通过GEPIA2数据库中“相关性分析”模块,评估USP7在泛癌中的表达与5种DNA错配修复基因( MLH1、 MSH2、 MSH6、 PMS2和 EPCAM)表达水平和3种必需DNA甲基转移酶(DNMT)——DNMT1、DNMT3A、DNMT3B表达水平的相关性。通过TIMER 2.0数据库中“免疫-基因”模块分析USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中表达及其与免疫细胞(B细胞、CD4 +T细胞、CD8 +T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞)浸润的相关性。利用GEPIA2数据库的“相似基因检测”模块获得与USP7表达模式相似且排名前100的蛋白集。将前述蛋白集与利用STRING数据库获得的与USP7有直接物理结合作用且排名前50的蛋白集进行交集分析。通过DAVID数据库对上述2个蛋白集进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。收集2018年10月—2022年10月武汉大学附属同仁医院暨武汉市第三医院病理科有相应临床病理特征的正常皮肤、增生性瘢痕、瘢痕溃疡、瘢痕癌的术后标本,采用免疫组织化学法检测组织中USP7表达情况,样本数为6。对数据行Log-rank检验、单因素方差分析及Bonferroni检验。 结果:在泛癌中, USP7的主要基因变异类型为突变和扩增,变异频率(>6%)居前3位的肿瘤依次为膀胱尿路上皮癌、SKCM和子宫内膜癌。 USP7基因在泛癌中的主要突变为错义突变。在突变频率最高的SKCM中,主要突变类型是USP7_ICP0_bdg结构域的错义突变。USP7 mRNA在乳腺浸润癌、胆管癌、结肠癌、食管癌、HNSC、肾嫌色细胞癌、肝细胞肝癌、肺腺癌、LUSC、前列腺癌和胃癌肿瘤组织中的表达均明显高于其对应的癌旁正常组织( P<0.05),在多形成性胶质细胞瘤、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌和甲状腺癌中的表达均明显低于其对应的癌旁正常组织( P<0.05);此外,USP7 mRNA在SKCM转移组织中的表达远高于其原发肿瘤组织( P<0.05)。生存曲线显示,在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中,高表达USP7患者与低表达USP7患者的存活率比较,差异均无统计学意义(Log-rank P>0.05,风险比分别为1.00、0.99、1.00、1.30)。USP7在结肠癌、结直肠癌、胸腺癌、甲状腺癌中的表达均与TMB呈显著负相关(Pearson相关系数分别为-0.26、-0.19、-0.19和-0.11, P<0.05);USP7在神经胶质瘤、CESC、肺腺癌、混合肾癌、LUSC中的表达均与MSI呈显著正相关(Pearson相关系数分别为0.22、0.14、0.15、0.08和0.14, P<0.05),在结肠癌、结直肠癌、乳腺浸润癌、前列腺癌、HNSC、甲状腺癌和弥漫性大B细胞淋巴瘤中的表达均与MSI呈显著负相关(Pearson相关系数分别为-0.31、-0.27、-0.13、-0.19、-0.16、-0.18和-0.53, P<0.05)。USP7在CESC中的表达与MSH2和MSH6的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.51和0.44, P<0.05),在HNSC中的表达与EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.39、0.14、0.49、0.54和0.41, P<0.05),在LUSC中的表达与EPCAM、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.20、0.36、0.40和0.34, P<0.05),在SKCM中的表达与EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.11、0.33、0.42、0.55和0.34, P<0.05);USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中的表达与DNMT1、DNMT3A和DNMT3B的表达均呈显著正相关(Spearman相关系数分别为0.42、0.34和0.22,0.45、0.52和0.22,0.36、0.36和0.22,0.38、0.46和0.21, P<0.05)。USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中的表达仅与CD4 +T细胞浸润呈显著正相关(Partial相关系数分别为0.14、0.22、0.13、0.16, P<0.05)。与USP7表达模式相似且排名前100的蛋白集中,排名前5的蛋白依次是C16orf72、BCLAF1、UBN、GSPT1、ERI2(Spearman相关系数分别为0.83、0.74、0.73、0.73和0.72, P值均<0.05)。与USP7有直接物理结合作用且排名前50的蛋白集与前述蛋白集的交集仅有1个蛋白,即为甲状腺激素受体相互作用因子12。KEGG富集分析显示,USP7相关基因涉及细胞周期、剪接体、细胞衰老和p53信号通路等。GO富集分析显示,USP7相关基因涉及转录调控、蛋白质泛素化、DNA修复和细胞质模式识别受体信号通路等。临床样本分析显示,USP7在增生性瘢痕(0.35±0.05)、瘢痕溃疡(0.43±0.04)和瘢痕癌(0.61±0.03)中的表达均明显高于正常皮肤(0.18±0.04), P<0.05。 结论:USP7可能为临床瘢痕溃疡癌变恶化的生物标志物。
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编辑人员丨6天前
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类泛素化蛋白酶8对T细胞活化与分化的影响
编辑人员丨2023/11/18
目的 探讨类泛素化蛋白酶 8(SENP8)在T细胞活化和分化过程中的作用.方法 C57BL/6背景的Senp8基因打靶小鼠(Senp8F/F小鼠,简称WT小鼠)与同背景的Cd4-Cre转基因小鼠交配,获得在T细胞中特异性缺失SENP8的小鼠(Senp8F/F;Cd4-Cre小鼠,简称KO小鼠),通过鼠尾基因组DNA PCR以及胸腺细胞免疫印迹实验进行基因型鉴定.流式细胞术分析SENP8缺失对稳态T细胞比例和数量的影响,并以李斯特菌尾静脉注射感染WT和KO小鼠,7d后流式细胞术分析CD8+T细胞活化、扩增、效应因子表达情况.结果 PCR鉴定结果揭示,KO小鼠有Cd4-Cre基因和纯合的Loxp片段;免疫印迹结果显示,KO小鼠胸腺细胞中的SENP8蛋白表达下降;证明成功构建了T细胞中特异性敲除SENP8的小鼠模型.流式细胞术检测结果表明,CD4+T细胞和CD8+T细胞在稳态WT和KO小鼠脾脏中的比例和数量并无显著差异.李斯特菌感染7d后,条件性缺失SENP8不影响CD4+T细胞、CD8+T细胞数量增加和活化标志分子CD44表达,也不影响CD4+T细胞、CD8+T细胞中干扰素γ(IFN-γ)和颗粒酶B(GzmB)的表达.结论 T细胞中缺失SENP8分子不影响T细胞的活化、扩增及李斯特菌感染过程中T细胞的细胞毒作用.
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编辑人员丨2023/11/18
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泛素特异性蛋白酶4对透明细胞肾细胞癌细胞增殖能力的影响
编辑人员丨2023/10/14
目的 探讨人类泛素特异性蛋白酶4(USP4)对透明细胞肾细胞癌(KIRC)细胞增殖能力的影响.方法 从TCGA数据库及GEO数据库中下载KIRC患者的基因表达及临床信息资料,进行转化及整理;同时利用Ualcan、HPA数据库等在线工具对数据库中的KIRC患者进行进一步分析,研究USP4表达与KIRC患者临床病理特征(包括TNM分期和病理分级)以及生存预后的关系.在KIRC细胞株Caki-1、OSRC-2中转染USP4干扰和过表达质粒,通过平板克隆、细胞计数试剂盒8实验检测USP4对KIRC细胞增殖能力的影响.结果 生物信息学分析显示,USP4在KIRC组织中的mRNA及蛋白表达水平均明显低于癌旁正常肾脏组织(均P<0.05).KIRC组织中USP4 mRNA表达水平与患者肿瘤T分期、病理分期、组织学分级、总生存率、疾病特异性生存率、无进展生存率均有关(均P<0.05);与性别、年龄、N分期、M分期均无关(均P>0.05).细胞实验结果显示,USP4蛋白在Caki-1、OSRC-2细胞中显著过表达,而过表达USP4会明显降低Caki-1、OSRC-2细胞增殖能力和克隆形成能力(均P<0.05);敲低USP4会明显提高Caki-1细胞克隆形成能力(均P<0.05).结论 USP4在KIRC组织中低表达,而过表达USP4可抑制KIRC细胞增殖能力.
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编辑人员丨2023/10/14
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联合检测泛素连接酶Cullin1和基质金属蛋白酶MT4-MMP在乳腺癌组织中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探究泛素连接酶Cullin1和基质金属蛋白酶MT4-MMP在不同类型乳腺癌组织中表达情况及临床意义. 方法 2015年1月至8月,选择徐州市肿瘤医院80例乳腺癌组织及其对应的癌旁正常乳腺组织,应用免疫组织化学法和Western blotting法分别检测其中Cullin1和MT4-MMP的表达情况,并分析其相关性.结果 Cullin1、MT4-MMP蛋白在乳腺癌组织中的表达均高于癌旁正常乳腺组织,差异均有统计学意义(77.5% vs 28.8%,67.5% vs 17.5%,χ2=38.174、40.921,均P<0.01);在乳腺癌组织中,Cullin1及MT4-MMP蛋白的表达呈正相关(P<0.05).Cullin1及MT4-MMP在乳腺癌中的蛋白表达在分子分型、腋窝淋巴结是否转移及TNM分期组间差异有统计学意义(P<0.05);在患者年龄、肿瘤大小、肿瘤部位、是否复发转移组间差异无统计学意义. 结论 Cullin1及MT4-MMP可能参与了乳腺癌的形成及发展过程,且两者在此过程中有一定协同作用.在分型差、分期晚的乳腺癌中, Cullin1及MT4-MMP更高的表达状态提示其可能成为新的乳腺癌恶性程度指标.
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编辑人员丨2023/8/6
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抗肿瘤NEDD8活化酶抑制剂的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
NEDD8活化酶(NAE)是Neddylation过程中的限速酶,抑制NAE的活性,能够降低泛素-蛋白酶体系统(UpS)通路的活性和相关蛋白的降解,诱导肿瘤细胞凋亡.与蛋白酶体抑制剂相比,NAE抑制剂对干扰细胞内环境稳态更有特异性.随着对NAE研究的不断深入,多种NAE抑制剂已被报道.根据这些NAE抑制剂的结构特点,可分为AMP类似物、双黄酮类脱氧鸭嘴花碱酮衍生物和金属铑络合物类等.本文介绍了类泛素化修饰Neddylation过程,其限速酶NAE与肿瘤的生理作用,并综述了NAE抑制剂的最新研究进展.
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编辑人员丨2023/8/6
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类泛素化蛋白酶1在肝细胞肝癌组织的表达及其与侵袭和转移的关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨类泛素化蛋白酶1(SENP-1)在人肝细胞肝癌中的表达及其与肝癌细胞侵袭转移的关系.方法 应用聚合酶链式反应(PCR)和免疫组织化学方法检测肝癌组织,癌边缘组织,非癌组织中SENP-1和缺氧诱导因子-1 α(HIF-1α)的表达,同时检测微血管密度(MVD),使用PCR和Western blot检测3种肝癌细胞株MHCC97H、MHCC97L和HepG2的SENP-1表达,SENP1-siRNA质粒转染基因沉默高表达SENP-1基因的肝癌细胞MHCC97H,划痕和侵袭试验检测转染前后肝癌细胞迁移和侵袭能力的变化,Western blot检测转染前后半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶(Caspase-8)、B淋巴细胞瘤2基因(bcl-2)和相关下游基因HIF-1 α和血管内皮生长因子(VEGF)表达变化.结果 肝癌边缘组织中SENP-1、HIF-1α的表达显著高于肝癌组织及非癌组织(P=0.000),癌边缘组织中MVD低于癌组织(P=0.000).3种肝癌细胞株SENP-1表达均比人永生化肝细胞株高,SENP-1的表达随着肝癌细胞株侵袭转移能力的增加而增高.SENP1-siRNA质粒转染MHCC97H细胞后,促细胞凋亡蛋白Caspase-8表达升高,抑制细胞凋亡蛋白bcl-2表达降低,相关下游基因HIF-1α和VEGF的表达降低.划痕试验结果显示,转染后肝癌细胞划痕距离在24h后较未处理组增加.Transwell试验结果显示,转染后肝癌细胞穿膜细胞数较未处理组明显减少(P=0.000).结论 SENP-1在人肝癌细胞肝癌中的高表达具有促进肝细胞癌侵袭转移的作用,其机制可能与SENP-1的过表达促进肝癌细胞适应缺氧微环境和抑制细胞凋亡有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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有氧训练对衰老小鼠快缩型骨骼肌蛋白质降解的抑制作用研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨规律有氧训练对衰老小鼠骨骼肌蛋白质降解的影响.方法:17月龄雄性C57BL/6小鼠18只据体重随机纳入对照组(C组)与有氧训练组(AE组).训练组小鼠以自身体重2.5%的负荷进行8周游泳训练,每周训练6天,每天1次,每次45min.末次训练24h后处死全部小鼠,禁食6h.酶联免疫吸附测定血清TNF-α、IL-1β和IL-6含量,荧光法检测类糜蛋白酶与钙蛋白酶活性,对硝基苯磷酸底物法检测酸性磷酸酶活性,免疫印迹法检测泛素蛋白酶体系统关键蛋白Atrogin-1、MuRF-1、Ubquitin及钙蛋白酶系μ-Calpain表达,色谱法检测腓肠白肌内3-MH含量.结果:8周有氧训练可致衰老小鼠腓肠白肌促炎细胞因子含量、类糜蛋白酶与钙蛋白酶活性、3-MH含量以及Atrogin-1、MuRF-1、Ubquitin与μ-Calpain蛋白表达显著下降,且变化具有显著性意义(P=0.000).但溶酶体酶活性未见组间差异.结论:有氧训练可削弱衰老小鼠快缩型骨骼肌蛋白质降解,可能具有防治衰老性肌肉萎缩发生发展的潜力,其作用机制可能与其削弱炎性细胞因子生成集聚,进而抑制泛素蛋白酶体与钙蛋白酶系统的活性有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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Deneddylation修饰酶NEDP1的作用机制及研究进展
编辑人员丨2023/8/6
神经前体表达发育下调蛋白8(neural precursor cell-expressed developmentally downregulated 8,Nedd8)是一种类泛素蛋白,其参与蛋白质修饰的作用机制与泛素高度相似,即通过与底物的赖氨酸残基共价结合,从而对底物进行Neddylation修饰.Neddylation修饰可调控多种重要的生命活动,如细胞周期和免疫应答等.Nedd8蛋白酶1(Nedd8 protease 1,NEDP1)是隶属于小类泛素修饰物特异性蛋白酶家族(small ubiquitin-like modifier specific protease family,Ulp/Senp family)家族的半胱氨酸蛋白酶,可以特异性去除底物与Nedd8的共价结合,例如,NEDP1能够去除p53、鼠双微体蛋白(murine double minutes 2 protein,Mdm2)、smad泛素化调节因子1(smad ubiquitylation regulatory factor 1,Smurf1)等多个蛋白质的Neddylatio修饰,进而调节Neddylation修饰蛋白的生物学功能.临床研究表明,NEDP1与肿瘤的发生发展密切相关,包括肺癌、结肠癌、胶质母细胞瘤等,另外,NEDP1还参与成骨发育异常、神经退行性疾病、血管炎症等病变过程.本文对NEDP1蛋白的结构,调控Neddylation通路的作用模式和NEDP1作用底物的进展进行总结,以期为肿瘤等相关疾病的诊断和治疗提供参考.
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编辑人员丨2023/8/6
