目的:探讨成簇的规律性间隔的短回文重复序列关联的失活核酸酶9-脱氧核糖核酸甲基转移酶3A基因复合体(CRISPR-dcas9-DNMT3A)介导的O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶基因(MGMT)基因启动子区域DNA甲基化修饰对胶质瘤细胞替莫唑胺(TMZ)耐药性的影响。方法:CRISPR-dcas9-DNMT3A表达载体通过慢病毒包装感染TMZ耐药细胞系U251-R[U251(中国医学科院基础医学研究所)通过替莫唑胺高浓度反复间歇诱导法诱导产生]，验证其对MGMT启动子区域DNA甲基化程度，MGMT表达水平以及TMZ药物敏感性影响。结果:慢病毒感染成功的U251-R细胞，MGMT启动子区域甲基化水平增高[44.7%(17/38)、63.2%(24/38)、77.1%(27/38)比7.9%(3/38)， P<0.05]，MGMT蛋白表达减少，细胞对TMZ化疗的敏感性增加( P<0.05)。 结论:CRISPR-dcas9-DNMT3A慢病毒感染的U251-R细胞可通过增加其MGMT基因启动子区域甲基化水平减少MGMT蛋白表达从而增加化疗敏感性。

先天性巨结肠(Hirschsprung's disease，HSCR)是一种多基因与环境共同作用的复杂疾病，遗传易感性和胚胎期肠道微环境紊乱是其发病的两大主要原因，但其病因及发病机制仍不明确。随着对HSCR发病机制不断深入的研究，发现DNA甲基化异常可能参与神经嵴细胞的增殖、成熟、分化和迁移等过程，从而导致HSCR发生。

目的:初探BCAR1、PDE1C、OPRD1以及NRXN1基因启动子区甲基化水平的改变与原发性痛风及高尿酸血症的相关性。方法:在中国科学院大学宁波华美医院门诊及体检中心同期随机选取原发性痛风患者50例、高尿酸血症患者30例和健康对照体检者50名，提取脱氧核糖核酸（DNA），经甲基化转化后对3组受试者BCAR1、PDE1C、NRXN1以及OPRD1 4个基因启动子区的目标序列进行焦磷酸测序，得到其甲基化率。采用方差分析和非参数检验对3组病例的4种基因启动子区甲基化率进行统计学分析。结果:受试者工作特征曲线（ROC曲线）分析提示PDE1C（pos4、pos5、pos6）的甲基化水平对诊断痛风有较高的准确性，ROC曲线下面积（AUC）为0.712、0.772、0.775， P均<0.05；OPRD1 pos4的甲基化水平对诊断高尿酸血症有较高的准确性（AUC=0.733， P<0.05）。 结论:DNA甲基化可能与痛风及高尿酸血症的发病和炎症反应具有一定的相关性，但仍需进一步研究。

甲状腺相关性眼病(TAO)的发生与发展及其表观遗传的关系密切。其中，TAO的发生与脱氧核糖核酸甲基化所引起的差异基因表达、非编码核糖核酸(RNA)调控及微小RNA(miRNA)相关。miRNA－155和miRNA－146a通过参与免疫炎症及脂肪组织的增殖分化等参与TAO的病理过程；miRNA－21的表达与TAO的活动性及严重程度相关；miRNA－130a和miRNA－27在TAO眼眶成纤维细胞的成脂分化及脂肪组织增生中发挥着重要作用；miRNA－199a－3p和miRNA－199a－5p可增加患者眼眶脂肪组织的氧化应激和血管生成；TAO患者的miRNA－183和miRNA－96在外周血分化簇(CD)4+T细胞中表达升高，参与TAO病程的调节免疫；miRNA－29可通过抑制转化生长因子β1信号通路抑制细胞纤维化；miRNA－143可通过直接靶向胰岛素样生长因子－1受体，间接降低促甲状腺素受体和核苷酸结合寡聚域样受体热蛋白结构域相关蛋白3浓度，调节TAO的炎症反应。此外，长链非编码RNA、环状RNA、转运RNA衍生片段及组蛋白修饰的表观遗传调控亦与TAO的发病相关。

目的 分析调控慢性乙型肝炎和乙肝相关肝癌患者血清样本中脱氧核糖核酸(deoxyribonucle-ic acid,DNA)羟甲基化相关的关键基因和信号通路,探讨慢性乙肝进展为肝癌的可能机制.方法选取2020年3月～2021年11月永康市第一人民医院乙肝肝癌患者和慢性乙型肝炎患者各40例,循环核酸(circulating free DNA,cfDNA)试剂盒法提取cfDNA,采用DNA羟甲基化测序技术检测两组样本的表达谱并筛选差异修饰基因(differentially modified genes,DMGs),运用生物信息学分析方法对DMGs进行生物学功能与通路富集分析.结果 检测到上调的DMGs数为28个,下调的DMGs数为3个;富集分析发现这些基因参与的主要生物学进程为单生物体过程类别、细胞类别、结合分子功能类别,主要的信号通路为代谢通路等.基于蛋白质互作网络(protein-protein interaction network,PPI)分析显示,在PPI中具有重要作用的基因为CSF2、ALB等.结论 肝癌发生发展过程涉及到多个基因和通路,这些具有5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)修饰差异的基因和通路或将成为预防慢性乙型肝炎转化为肝癌的潜在靶点.

类风湿关节炎(RA)是一种常见的慢性自身免疫性疾病.脱氧核糖核酸(DNA)甲基化是一种重要的表观遗传修饰.本文对近年DNA甲基化与RA发生、发展、诊断、治疗和预后关系研究进行了综述,发现DNA甲基化与RA的发生和发展密切相关,有希望作为RA诊断、治疗和预后的新靶点.其中,MAP3K5和LBH等甲基化基因参与RA发病阶段的调控,CYP2E1 和DUSP22 等甲基化基因调控RA的发展过程,SHROOM1 等甲基化基因可用于RA的诊断,Foxp3 和patched 1(PTCH1)等基因甲基化水平可用于评价RA的治疗效果.此外,给药前后的整体甲基化水平改变可用于RA的预后,有利于加深RA发病机制、疾病过程在表观遗传学上的认识.

目的 白磺酰胺生物合成蛋白 2(DPH2)基因是白喉毒素靶标白硫胺生物合成的关键酶,它对前列腺癌患者的预后和免疫浸润的影响尚不清楚,探讨其在前列腺癌中的免疫浸润及预后预测中作用.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获得的前列腺癌患者的表达谱和临床信息.使用Wilcoxon秩和检验,比较前列腺癌和正常前列腺组织之间的DPH2 表达水平.进行功能富集分析以探索所涉及的潜在信号通路和生物学功能.使用单样本基因集富集分析评估免疫细胞浸润.UALCAN数据库用于分析DPH2 的甲基化状态.采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析确定DPH2 的预后价值.构建列线图以预测癌症诊断后 1 年、3 年和 5 年的复发转移率.结果 DPH2 在前列腺癌中过表达,与 T分期(P=0.013)、N分期(P=0.025)、PFI事件(P=0.023)和 OS(P＜0.001)显著相关.DPH2 过表达导致 OS和疾病特异性生存率显著下降.多变量Cox分析将DPH2 确定为 OS的独立预后标志物.同样,DPH2 的低甲基化状态也与预后不良有关.功能富集分析表明,富集途径包括葡萄糖醛酸盐代谢过程、脱氧核糖核酸-结合转录激活物RNA活性、特异的聚合酶Ⅱ、细胞周期、细胞衰老和卵母细胞减数分裂.此外,DPH2 的过表达与自然杀伤细胞、Mast细胞、Th1 细胞和浆细胞样树突状细胞的免疫细胞浸润水平呈负相关.结论 DPH2 可能是一种新型的预后生物标志物,在前列腺癌的免疫浸润中起重要作用.

目的 通过检测老年结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者粪便DNA中人类错配修复基因1(human mutl homolog 1,hMLH1)甲基化水平,探讨其临床价值,为老年CRC患者的早期无创诊断探索新途径.方法 选取作者医院自2015-06/2016-09月确诊的30例年龄在60岁以上的CRC患者为观察组,选择同期的30例60岁以上且体检正常者为对照组.分别提取两组患者的粪便DNA,采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific polymerase chain reaction,MSP)技术检测其hMLH1基因的甲基化状态;同时,收集观察组患者的外周血,检测血清中的癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA);分别比较观察组患者hMLH1基因甲基化检出率与CEA检出率,以及观察组与对照组甲基化检出率的差异性;分析观察组患者hMLH1基因甲基化与患者年龄、性别、肿瘤位置的相关性.结果 观察组患者hMLH1基因甲基化检出率为63.33％(19/30)显著高于对照组的6.67％(2/30)(x2=21.172,P＜0.01);观察组患者MSP法甲基化检出率63.33％显著高于传统CEA检测法的检出率36.67％(11/30)(x2=4.67,P＜0.05);CRC患者hMLH1基因甲基化与患者年龄、性别、肿瘤位置均无显著相关性(P＞0.05).结论 观察组患者粪便DNA中hMLH1基因甲基化检出率较高,明显优于传统的血清CEA检测,可作为早期无创诊断老年性CRC的重要手段.

目的:研究粪便样本细胞中RUNX3异常甲基化谱.方法:使用850K芯片对患者的结肠癌组织与癌旁组织的脱氧核糖核酸(DNA)甲基化进行分析,初步筛选RUNX3中的差异性甲基化位点.进而应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)做进一步组织样本验证及新鲜粪便样本的检测,并对数据进行标准化处理.结果:患者癌组织中存在较多高甲基化位点,共筛选出RUNX3等10个差异显著的甲基化基因位点.MSP结果表明,癌组织RUNX3基因的甲基化水平明显高于癌旁组织(P＜0.05).新鲜粪便样本中结肠癌患者RUNX3启动子的甲基化率明显大于正常人(P＜0.001).结论:新鲜粪便样本细胞中RUNX3甲基化水平可以用于结肠癌的诊断以及疗效评价等方面.

目的 观察123个汉族成骨不全(osteogenesis imperfecta,OI)家系中存在表型不一的家系比率,并探讨导致同一突变不同表型的潜在机制.方法 分析123个汉族OI家系(包括以往研究的117个家系)中存在表型不一的家系比率.用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)SNaPshot分型技术检测21个家系先证者及其表型不一家系成员的血液和口腔黏膜的脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)中COL1A1和COL1A2基因21个SNP位点的分型,从而检查体细胞样本的嵌合率.同时检测2个存在COL1A2基因同一突变(c.1009G>A)家系的甲基化程度差异.结果 在123个OI家系中,21个(17.1％)家系存在表型不一,仅1例先证者的父亲显示体细胞基因镶嵌,其血液中有43.1％突变等位基因,口腔上皮细胞有39.6％的突变等位基因.在2个存在COL1A2基因同一突变(c.1009G>A)的家系中,2例先证者的甲基化程度均高于其母亲.结论 国人OI家系内COL1A1和COL1A2基因同一突变发生不同表型的比率为17％.在这21个表型不一的家系中只有1例(4.8％)先证者的父亲存在体细胞镶嵌.甲基化程度可能与表型严重程度有关.在遗传咨询时,对先证者无临床表型的家属进行致病基因的突变检测是十分必要的.