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柚皮素通过核因子κB预防缺血再灌注性急性肾损伤
编辑人员丨4天前
目的:探究柚皮素(naringenin)对缺血再灌注(ischemia-reperfusion,IR)致急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的预防作用及其机制。方法:为探究柚皮素的肾脏保护作用,大鼠经柚皮素预处理后,使用经典的双侧肾蒂夹闭法构建IR-AKI大鼠模型,HE染色检测大鼠病理损伤程度,苦味酸法检测肾功能,实时荧光定量PCR法检测炎症相关基因表达水平。进一步通过差异基因分析和蛋白质互作网络筛选IR-AKI过程中的枢纽基因,预测其转录因子并构建调控IR-AKI的转录因子蛋白库,经反向分子对接筛选可与柚皮素结合的转录因子并对其结合模式进行进一步分析以探究柚皮素对IR-AKI的保护机制。最后通过实验方法验证生物信息学结果。结果:与AKI组相比,柚皮素预处理组大鼠肾脏病理明显改善,肾小管损伤评分减少( P<0.01),血肌酐水平及肾损伤分子1(KIM-1)mRNA表达明显下降(均 P<0.05),证实柚皮素对IR-AKI的预防作用。实时荧光定量PCR结果显示,柚皮素预处理可减轻IR-AKI后核因子κB(NF-κB)、肿瘤坏死因子α及白细胞介素1β的表达(均 P<0.05),即柚皮素对IR-AKI的炎症损伤具有抑制作用。对GSE98622数据集进行差异基因分析,得到359个差异基因。反向分子对接结果显示,在IR-AKI中,柚皮素可与NFKBIA、BCL3、NFKB2、RELA等主要富集在NF-κB相关炎症通路中的转录因子结合,且显著升高AKI后 BCL3的表达量( P<0.05),抑制 RELA、 NFKB2表达(均 P<0.05)。 结论:柚皮素可预防由IR-AKI导致的炎性反应,其机制与促进BCL3表达从而抑制NF-κB通路有关。
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编辑人员丨4天前
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基于R语言数据挖掘的明清新安医家治疗郁证的用药规律探析
编辑人员丨4天前
目的:对新安医学古籍中治疗郁证的方药使用规律进行数据挖掘,深度剖析新安医家治疗郁证组方的用药思路。方法:检索《中华医典》第5版以及中医古籍文献数据库在线资源中新安医家治疗郁证的有关文献,使用Excel提取处方信息建立数据库,运用R语言对处方所使用的中药频次、性味、关联规则和聚类进行数据分析。结果:共筛选出符合条件的处方127首,使用中药共177味,用药总频次1 031次,使用频次最高的前3位的中药依次为茯苓(57次)、甘草(46次)、白芍(40次);药物四气以平性和温性为主,其中温性药物使用频次最多,累计298次;药物五味使用频数较高者为辛、苦、甘3类,辛味药频次475次,占比28.70%,其次是苦味药,频次459次,占比27.73%,甘味药453次,占比27.37%;置信度 > 0.800的药物组合依次为甘草+当归,甘草+当归、白芍,甘草+柴胡,甘草+白术,香附+川芎,当归+白术、甘草,白芍+当归、茯苓,甘草+当归、茯苓,甘草+白术、当归,甘草+柴胡、白芍,甘草+白术、人参,甘草+人参、当归,香附+神曲,人参+黄芪,甘草+黄芪。结论:新安医家治疗郁证的方剂药物性味以辛、苦、甘、温为主,调节人体寒热阴阳,缓急调和,宣通气机。
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编辑人员丨4天前
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糖尿病肾病中铜死亡相关基因的生物信息学分析及靶向中药预测
编辑人员丨4天前
目的 通过生物信息学方法分析与糖尿病肾病(DN)有关的铜死亡相关基因,并预测靶向作用于这些基因的中药.方法 从GEO数据库中下载与DN相关的基因表达数据集(GSE96804和GSE30529),并从相关文献中获取铜死亡相关基因.基于GSE96804数据集,筛选DN中差异表达铜死亡相关基因(DECAGs),并分析DECAGs之间表达量的相关性;根据DECAGs的表达量对DN样本进行聚类分型分析和基因集变异分析(GSVA).基于聚类分型结果进行加权基因共表达网络分析,获取疾病关键基因模块和核心基因.利用"limma"程序包获取GSE96804数据集中的差异表达基因,然后与核心基因取交集以获得交集基因.基于GSE96804数据集及交集基因,通过3种机器学习模型筛选疾病特征基因.通过受试者工作特征曲线,基于GSE96804数据集评估特征基因对DN的诊断价值,并基于GSE30529数据集进行验证.通过分析疾病特征基因与DECAGs之间的相关性获得关键DECAGs.在CoreMineTM MEDICAL数据库,针对DECAGs进行中药预测.结果 共获得7个DECAGs,其中DBT、PDHA1、FDX1表达量与GCSH的表达量呈正相关,DLAT、PDHA1表达量与FDX1的表达量呈正相关,GLS表达量与DLAT的表达量呈负相关.基于DECAGs可将DN样本可分为两簇(C1簇和C2簇).GSVA结果显示,与C1簇相比,NOD样受体(NLR)、Notch和Toll样受体(TLR)等信号通路在C2簇中富集.棕色模块(含369个核心基因)与基于DECAGs的聚类分型高度相关.共获得114个交集基因,通过3种机器学习模型最终筛选出疾病特征基因G6PC.在GSE96804、GSE30529数据集中,G6PC表达量诊断DN的曲线下面积分别为0.987、0.900.PDHA1、FDX1、DBT、GCSH与G6PC具相关性,故作为关键DECAGs.根据DECAGs筛选出168味中药,中药四气以寒性、温性和平性为主,五味以苦味、甘味为主,常见归经为肝经、脾经和肾经,功效以补虚类、清热和活血化瘀最常见.其中,丹参、青风藤、紫草、茯神、白术、苦豆草、蛇床子、艾叶均至少靶向2个DECAGs.结论 7个DECAGs及其相关的NLR、Notch、TLR等信号通路可能是DN铜死亡相关发病机制的重要环节,其中,PDHA1、FDX1、DBT和GCSH是关键DECAGs,G6PC是DN的疾病特征基因.丹参、青风藤、紫草等中药可能通过调控铜死亡治疗DN.
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编辑人员丨4天前
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对《辅行诀》中大黄味咸记载的探讨
编辑人员丨1个月前
从《神农本草经》记载至今,大黄药味为苦味,而敦煌遗书《辅行诀》二十五味药精中记载大黄为火中木,属于咸味药,与历代本草中大黄味苦的定义不同.且从《辅行诀》中收载的"汤液经法图"体系看,味苦泻心清热,味咸泻肺通便,以泻下为主的大黄似乎更应属于咸味.本文通过查阅有关大黄基源、别名、产地、功效等信息的历代本草记载,结合"汤液经法图"理论体系中五味的作用特点对大黄的法象药理和功效药理进行匹配分析,并对含有大黄的三黄泻心汤、大承气汤和大陷胸汤进行方解,论证大黄归属为咸味的可能性.旨在为以"汤液经法图"理论为基础、以法象药理与功效药理相结合为途径的中药药味认识及大黄的临床组方配伍应用提供新的思路.
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编辑人员丨1个月前
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"肺与大肠相表里"视角下探索肠道菌群与肺癌因果关联及潜在干预中药预测
编辑人员丨2024/8/17
目的 在"肺与大肠相表里"理论指导下采用孟德尔随机化(Mendelianrandomization,MR)明确与肺癌发生具遗传因果效应的肠道菌群,并预测能通过调控肠道菌群干预肺癌的潜在中药.方法 从IEU OpenGWAS数据库获取肠道菌群与肺癌的全基因组关联研究汇总数据.使用R语言TwoSampleMR软件包进行MR分析,以逆方差加权法为主要的遗传因果效应评估方法.对工具变量邻近基因进行功能富集分析以探析相关微生物介导肺癌发生的信号通路.结合CTD和Coremine数据库预测对工具变量邻近基因具有潜在调控作用的中药,统计其性味归经及功效信息.结果 MR分析发现了 10个与肺癌发生具遗传因果效应的肠道菌群,其中变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、Marvinbryantia、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae UCG004)和粪居拟杆菌Bacteroides coprocola菌群与肺癌发生风险降低相关,草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、普氏菌属 7(Prevotella 7)、黑臭杆菌属(Odoribacter)和大肠杆菌 Escherichia coli 菌群与肺癌发生风险升高相关.工具变量邻近基因主要富集在Janus激酶(Janus kinase,JAK)/信号转导和转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)和磷脂酰肌醇-3-羟激酶(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)等信号通路.潜在调控中药四气以温为主,寒、平次之,五味以苦味为主,甘、辛次之,归经以肝为主,肺、脾、胃和肾次之,功效以清热为主,补虚次之,还包含活血、理气、祛风湿、化痰止咳平喘和利水渗湿等.其中映射频率靠前的代表中药包括人参、马齿苋、生姜、姜黄、郁金、白果、五味子和丹参等.结论 基于"肺与大肠相表里"中医经典理论,采用MR分析发现以厚壁菌门、Marvinbryantia和变形菌门为代表的10种肠道菌群可能通过JAK/STAT、MAPK、PPAR和PI3K/Akt等信号通路介导肺癌发生发展.潜在调控中药主要包括清热药、补虚药、活血药和理气药等.丰富了"肺与大肠相表里"的生物学内涵,将为从"肠道菌群"视角探索肺癌的中医药防治策略提供参考.
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编辑人员丨2024/8/17
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中药苦味成分的发现策略与方法研究进展
编辑人员丨2024/5/11
苦味成分不仅是中药主要的呈味物质,也是重要的药效物质.但由于中药苦味成分的多样性与结构相似性,苦味成分的靶向分离与示踪难度大,单一苦味成分与中药整体呈味特征有偏差,使很多中药苦味成分仍有待深入解析.通过对传统的逐级分离与分析方法进行总结,介绍了推测苦味来源、定位苦味部位、鉴定苦味成分、验证苦味成分等研究方法;梳理了基于本草学知识、基于苦味成分结构相似性、基于苦味受体结合等苦味成分发现策略及数据挖掘、计算机辅助、生物靶向定位等新技术;提出了谱-味关联分析等苦味成分发现新思路,为更加快速、精准地发现中药苦味成分,推动中药苦味成分解析进程.
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编辑人员丨2024/5/11
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口服中成药治疗慢性脑供血不足的用药规律研究
编辑人员丨2024/3/16
目的 分析治疗慢性脑供血不足的口服中成药的用药特点及组方规律,为临床治疗和新药研发提供参考.方法 通过检索中国知网、万方、维普、PubMed等中英文数据库,筛选中成药治疗慢性脑供血不足的相关文献.建立数据库并提取有效信息,统计中成药剂型、使用频率、证型、单味中药使用频次及性味归经、高频药对;利用SPSS Modeler软件对中药进行关联规则分析.结果 共收集481篇文献,涉及86种中成药,中成药剂型以胶囊剂为主,养血清脑颗粒用于治疗慢性脑供血不足使用频次最高,慢性脑供血不足涉及多个证型;使用频次较高的单味中药有川芎、丹参、当归、黄芪、牛膝、甘草、天麻等,药物性味以温药、苦味为主,归经以肝、心、脾为主,功效以活血祛瘀、补血为主;高频药对为川芎-当归、川芎-丹参、川芎-红花、川芎-黄芪,功效以补血活血、活血祛瘀、活血通经、益气活血为主;关联规则分析结果显示,核心组方为黄芪、川芎、当归、红花、丹参.结论 中成药治疗慢性脑供血不足涉及多个证型,川芎是其核心用药,益气活血通络为其基本组方思路,黄芪、川芎、当归、红花、丹参为其核心处方.
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编辑人员丨2024/3/16
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基于药症相应探讨历代本草辨治痒症思路
编辑人员丨2023/12/30
目的 基于药症相应,探讨历代本草文献中治疗痒症的思路.方法 检索《中华医典》数据库中本草类的全部文献数据,收集整理治疗痒症的本草信息,对筛选纳入的本草(中药)进行性味、归经统计分析,以痒症辨治病机要素进行分类统计,提取各类本草(中药)的辨治内容.结果 在76部历代本草专著中,筛选出119味治疗痒症的本草(中药).治疗痒症的本草(中药)药性以温性、寒性、平性为主,药味以苦味、辛味、甘味为主,归经以肝经、肺经为主,病机要素为风邪袭扰、湿邪闭阻、火热毒损、气血郁闭、正虚失荣.结论 痒症辨治常用祛风散邪药、祛湿化浊药、清热泻火药、理气活血药、补虚扶正药,且药物之间多互相配伍使用;邪扰、郁闭、正虚为痒症辨治主要病机特点,符合邪气袭扰作祟、气血郁闭不通、正气亏虚不足的机体功能紊乱状态.
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编辑人员丨2023/12/30
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《中国药典(一部)》治疗中风中成药用药规律分析
编辑人员丨2023/10/21
目的 分析临床常用治疗中风中成药的用药规律.方法 收集 2020 年版《中国药典(一部)》收载治疗中风中成药的名称、剂型、功能主治等信息,采用Excel 2010 软件分类统计其剂型、适用证型、性味归经、单药使用频次及单方组方药物数量,采用SPSS Modeler 18.0 软件,并运用Apriori算法,对中成药不同组方不同剂型且药味频次≥4 的中药进行关联分析并排序,采用VOSviewer 1.6.14 软件制作中药关联网络图.结果 共得中成药 75 种,主治证型 7 类,以气虚血瘀证(34 种,45.33%)及风痰入络证(28 种,37.33%)为主.经胃肠道给药 72 种,主要包括胶囊剂(26 种)、丸剂(16 种)、片剂(15 种)等 6 种剂型;非胃肠道给药 3 种,均为注射剂.中成药组方中药以川芎、丹参、红花出现频次较高,以温性,辛、甘、苦味药为主,主要归肝、脾、心经.结论 中成药治疗中风多从肝、脾、心三脏着手,处方以解气虚血瘀及风痰入络之证为主.该研究可为治疗中风中成药的深入研究提供理论参考.
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编辑人员丨2023/10/21
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中药熏洗治疗痔术后肛缘水肿用药规律分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:基于相关文献分析中药熏洗治疗痔术后肛缘水肿的用药规律.方法:收集中国知网数据库(CNKI)1997年1月1日至2016年12月30日发表的中药熏洗治疗痔术后肛缘水肿的文献,从符合纳入标准的文献中提取相关信息,行规范化处理后建立数据库,利用Access数据库、SPSS 17.0及SPSS Clement 12.0统计软件进行频数与关联规则分析,总结中药熏洗治疗痔术后肛缘水肿的用药规律.结果:共收录符合纳入标准的文献101篇,包括处方101首、中药112味.中药类别共19类,使用频数前3位由高到低分别为清热药(主要是清热燥湿药和清热解毒药)、活血化瘀药、泻下药,总频率为56.62%;中药使用频数前5位由高到低依次为黄柏、苦参、芒硝、五倍子、大黄,累计频率为30.69%.所用药物中,寒性药物使用频数为521次(63.00%),苦味594次(41.98%);中药归经前3位为肝经、脾经、大肠经,三者的使用总频率为48.33%.结论:中药熏洗治疗痔术后肛缘水肿常从祛湿、清热、化瘀着手,用药以清热解毒、清热燥湿、活血化瘀类药物为主.
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编辑人员丨2023/8/6
