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2018-2022年华东地区临床分离念珠菌耐药性监测
编辑人员丨1天前
目的 监测中国华东地区临床分离念珠菌的耐药性,为临床诊断和治疗提供参考.方法 以质谱或分子的方法对2018年1月—2022年12月收集的菌株进行复核鉴定,采用肉汤微量稀释法进行10种抗真菌药物的药敏试验.依据2022年美国临床和实验室标准化协会(CLSI)M27 M44s-Ed3和M57s-Ed4对药敏试验结果进行判读.结果 共收集念珠菌3 026株,无菌部位分离菌株占65.33%,主要标本类型为血液38.86%和胸腹水10.21%.白念珠菌占比(44.51%)最高、其次为近平滑念珠菌复合群19.46%、热带念珠菌13.98%、光滑念珠菌10.34%和其他念珠菌0.79%.对测试的10种抗真菌药物:白念珠菌较为敏感,敏感率最低为93.62%,2.97%的菌株对氟康唑剂量依赖性敏感(SDD);近平滑念珠菌对氟康唑SDD为2.61%,耐药率为9.42%,对其他药物的敏感率均大于90%;光滑念珠菌对氟康唑SDD为92.01%,耐药率为7.99%,泊沙康唑、伏立康唑非野生型菌株(NWT)分别为32.27%、48.24%,其他药物的敏感率均大于90%;热带念珠菌对氟康唑、伏立康唑耐药率分别为29.55%、26.24%,对泊沙康唑、伊曲康唑NWT分别为76.60%、21.99%,对棘白菌素类药物耐药率为2.36%.结论 华东地区念珠菌的分离率和菌种分布与国内外报道基本一致,近平滑念珠菌复合群对氟康唑有一定的耐药性,热带念珠菌对三唑类药物有较高的耐药性,光滑念珠菌对氟康唑非敏感率较高.白念珠菌、近平滑念珠菌、热带念珠菌和光滑念珠菌均出现了对棘白菌素类耐药菌株.
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编辑人员丨1天前
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基于凋亡相关长非编码RNA的肺腺癌预后风险模型的构建与验证
编辑人员丨1周前
目的:检测凋亡相关长非编码RNA(lncRNA)对肺腺癌(LUAD)预后的预测能力,并探讨其分子机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和高通量基因表达数据库(GEO)分别下载535例和125例LUAD患者转录组和临床信息,筛选出与161个凋亡基因高度相关的lncRNA。通过Cox回归和lasso分析获取预后相关lncRNA并构建预测模型,并验证模型的稳定性。通过肿瘤突变负荷(TMB)、药物敏感性、免疫细胞相关性和基因集变异分析探讨该模型可能的生物学途径及潜在的分子机制。结果:研究构建一个由19个凋亡相关的lncRNA组成的LUAD预后预测模型。通过模型风险评分可将LUAD患者分为高低风险组,高评分与患者总生存率呈负相关( P<0.05)。训练集和测试集中1、3、5年的受试者工作特征曲线下面积(AUC)均>0.7。该评分与患者的临床指标如总分期[Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ+Ⅳ分别为-0.069(-0.256,0.169)比0.063(-0.156,0.309)比0.099(-0.099,0.463), H=16.9, P<0.01]、T分期[T1/T2/T3+T4分别为-0.083(-0.389,0.130)比0.037(-0.165,0.282)比0.180(-0.066,0.392), H=20.8, P<0.01]和N分期[N0/N1/N2+N3分别为-0.055(-0.252,0.201)比0.043(-0.143,0.357)比0.119(-0.064,0.457), H=13.1, P<0.01]成正相关,可作为LUAD的独立预后因素(风险比=3.402,95%可信区间:2.338~4.952, P<0.01)。高评分组患者对Gefitinib的药物敏感性高于低评分组[2.168(2.101,2.239)比2.204(2.153,2.251), Z=11.60, P<0.01],同时对Dasatinib[0.989(0.353,2.056)比1.463(0.809,2.402), Z=11.60, P<0.01]以及Imatinib[4.925(4.873,4.971)比4.937(4.892,4.972), Z=10.60, P<0.05]的药物敏感性也高于低评分组。评分影响肿瘤免疫细胞含量。高风险组TMB高于低风险组[6.105(2.395,12.421)比4.342(1.579,10.237), Z=8.41, P<0.05],且主要富集glycolysis,myc targets v1和mtorc1 signaling等信号通路。 结论:建立基于凋亡相关lncRNA的LUAD预后模型,并验证了该模型的性能。
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编辑人员丨1周前
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老年复治涂阳肺结核患者的临床特征及耐药性特点分析
编辑人员丨1周前
目的:分析复治涂阳肺结核老年患者的临床特征及耐药性特点,为临床治疗提供参考。方法:回顾性分析2017年7月至2019年7月同济大学附属上海市肺科医院结核科收治的复治涂阳肺结核患者100例,以60岁年龄为界限分为老年组(77例)和非老年组(23例),分析并比较两组患者的临床特征,并按照相关规程操作检测12种抗结核药物的敏感性数据,计算耐药率以及比较不同药物的耐药情况。结果:本研究中的100例复治涂阳肺结核患者,男性74例(74.0%)、女性26例(26.0%);并发症以气管支气管结核为主(18.0%)、并发症主要为糖尿病(12.0%);且80.0%以上者接受过1~2次治疗方案。在12种抗结核病药物敏感性测试中,耐药率居于前3位的分别为异烟肼(52.0%、52/100)、利福平(39.0%、39/100)和乙胺丁醇(23.0%、23/100),且老年组对于异烟肼(62.3%、48/77)和利福平(46.8%、36/77)的耐药率显著高于非老年组17.4%(4/23)、13.0%(3/23)( χ2=14.334、8.459, P=0.000、0.004);在耐多药菌谱中,以异烟肼和利福平的组合比例最高,其中也包括含有乙胺丁醇或氧氟沙星的药物组合。比较老年组和非老年组的耐药率结果显示,老年人群的耐药率(67.5%、52/77)显著高于非老年人群(34.8%、8/23)( χ2=10.203, P=0.001),且涵盖耐药谱广泛。 结论:耐多药菌谱的形式具有多样性,了解本地区老年患者群体耐药监测数据有助于以此为基础设计更优化合理的治疗方案,为老年人肺结核的规范化诊治指南的制定及干预措施、防控策略的制定提供依据。
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编辑人员丨1周前
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人源性类器官在结直肠癌中的应用及研究进展
编辑人员丨1周前
类器官是一种新兴的三维培养模型,具有培养简单、稳定性好、能高度重现来源组织的特征和异质性等优点。它既可作为临床预测模型,在体外对患者进行抗癌药物筛选和敏感性测试,从而制定个性化的治疗方案;亦可以作为基础研究的工具,通过进行自身基因编辑和修饰研究,或结合气-液界面培养法和微流控技术研究,探索结直肠癌发生发展分子机制及寻找潜在治疗靶点。本文就结直肠癌类器官在临床应用和基础研究中的现状和进展作一综述。
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编辑人员丨1周前
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高通量体外药敏实验在晚期胃癌个体化用药中的意义
编辑人员丨1周前
目的:通过高通量体外药敏实验(HDS)评估晚期胃癌对不同治疗药物的抑制率,筛选其敏感的药物,制定、优化患者"个体化"治疗方案。方法:获取16例晚期胃癌患者的胃癌细胞,通过HDS技术检测原代胃癌细胞中所有可能对胃癌有效的抗癌药物的单药浓度梯度及其组合的高通量体外药敏测试,并根据药敏结果指导临床用药,进行疗效评估。结果:大部分原代胃癌细胞对化疗药物呈泛耐药性,尤其是含奥沙利铂在内的化疗方案在体外药敏试验中表现出较差的肿瘤抑制率。相反,硼替佐米表现出较高的敏感性。紫杉类药物/方案显示出略高于铂类的肿瘤抑制率。16例患者客观缓解率(ORR)为37.5%,疾病控制率(DCR)为75%。结论:晚期胃癌细胞对化疗药物呈现广泛耐药性,HDS检测在胃癌化疗药物的筛选需要进一步探索。
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编辑人员丨1周前
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基于机器学习的艾司奥美拉唑相关急性肾损伤风险预测模型的构建与验证
编辑人员丨1周前
目的:分析接受艾司奥美拉唑治疗的住院患者发生急性肾损伤(AKI)的影响因素,构建艾司奥美拉唑相关AKI的风险预测模型。方法:研究设计为回顾性研究。研究对象选自2018年1月至2020年12月于山东第一医科大学第一附属医院住院并接受艾司奥美拉唑治疗的患者。通过医院电子病历系统收集患者临床资料,包括患者基本信息、手术类型、干预措施、用药信息和实验室检查结果。根据是否发生艾司奥美拉唑相关AKI将患者分为AKI组和非AKI组,比较2组临床特征。采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO回归)分析艾司奥美拉唑相关AKI的影响因素。以8∶2的比例将患者随机分为训练集和测试集。基于训练集数据,采用5种机器学习算法[logistic回归(LR)、随机森林(RF)、梯度提升机(GBM)、极端梯度提升(XGBoost)和轻量梯度提升机(LightGBM)]建立艾司奥美拉唑相关AKI预测模型;基于测试集数据,比较5种模型的受试者工作特征曲线下面积(AUC)、敏感性、特异性和准确率。结果:共有5 436例患者纳入研究,包括男性3 231例、女性2 205例,年龄61(51,70)岁。393例(7.23%)发生艾司奥美拉唑相关AKI。LASSO回归分析共筛选出24个与艾司奥美拉唑相关AKI密切相关的变量,包括肝功能不全、慢性肾功能不全、低蛋白血症等。基于训练集(4 349例)数据构建艾司奥美拉唑相关AKI风险预测模型,结果显示5种模型的预测性能均良好(AUC均大于0.900)。以测试集(1 087例)数据对5种模型的预测性能进行验证,发现GBM模型的AUC最高(0.922),且预测性能较为稳定(在训练集与测试集中各项指标差异较小)。结论:应用艾司奥美拉唑与AKI发生明显相关,发生风险受患者基线肾功能、合并疾病及合并使用的其他药物等因素影响。基于GBM算法构建的风险预测模型,有助于临床对艾司奥美拉唑相关AKI发生风险进行早期评估。
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编辑人员丨1周前
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广西地区淋球菌临床分离株对庆大霉素的药物敏感性研究
编辑人员丨1周前
目的:评估中国广西地区淋球菌临床分离株对庆大霉素的药物敏感性以及庆大霉素与其他7种抗生素最小抑菌浓度(MIC)之间的相关性。方法:2020年12月至2021年12月在广西地区14个地级市的37家医疗机构收集淋球菌临床分离株584株,采用琼脂稀释法测定淋球菌对头孢曲松、头孢克肟、阿奇霉素、大观霉素、青霉素、四环素、环丙沙星和庆大霉素的药物敏感性。将各抗生素MIC值进行以2为底数的对数转换,采用Spearman相关性分析评估庆大霉素MIC与其他7种抗生素MIC之间的相关性。结果:庆大霉素的MIC范围为1 ~ 16 mg/L,MIC 50及MIC 90值分别为4、8 mg/L;361株(61.8%)庆大霉素MIC ≤ 4 mg/L,为完全敏感菌株,223株(38.2%)MIC为8 ~ 16 mg/L,为中度敏感株,未见耐药株。淋球菌对阿奇霉素、青霉素、四环素、环丙沙星的耐药菌株数分别为136(23.3%)、415(71.1%)、339(58.0%)和574(98.3%),对头孢曲松和头孢克肟的低敏菌株数分别为17(2.9%)和6(1.0%),未发现对大观霉素耐药的菌株。Spearman相关分析显示,庆大霉素MIC与阿奇霉素、大观霉素、青霉素、四环素、环丙沙星MIC弱相关(均 P < 0.05),与头孢曲松、头孢克肟MIC之间无相关性(均 P > 0.05)。 结论:本研究中测试的所有淋球菌分离株均对庆大霉素表现出一定程度的敏感性,庆大霉素与其他抗生素之间存在交叉耐药性的可能性较小。
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编辑人员丨1周前
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基于微流控技术的肺芯片模型在肺癌研究中的应用
编辑人员丨1周前
肺癌是全球死亡率最高的癌症,严重威胁我国人民群众的生命健康。基于我国对肺癌精准诊疗的需求和研究现状,针对早期肺癌的精准诊断、治疗后复发监测、靶向与免疫治疗耐药等问题,需要提出针对患者的个体化解决方案并提供敏感性药物,这需要为临床提供能够针对患者肿瘤组织病理和分子分型特点的研究模型。基于微流控技术的器官芯片模型将类器官培养技术与微流控技术相结合,可以在3D培养的同时,以组织工程技术和微制造技术来模拟人体器官的基本结构,探究更为细致的生理病理反应;还能通过微流体控制和生物传感技术来进行更为快速高效的个性化药敏测试。该模型的出现极大地推动了肺癌领域的研究进展,本文将对近几年基于微流控技术的肺芯片模型在肺癌研究中的应用进行综述,并展望该技术在未来的发展。
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编辑人员丨1周前
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纸片扩散法在淋球菌药物敏感性检测中准确性的评价
编辑人员丨1周前
目的:评估纸片扩散法在淋球菌药物敏感性检测中的准确性。方法:选取2021年在广西14个地市的37家医疗机构收集的584株淋球菌临床分离株,分别使用琼脂稀释法与纸片扩散法进行大观霉素、头孢曲松和头孢克肟的药物敏感性测定,计算纸片扩散法与琼脂稀释法的一致性。结果:大观霉素、头孢曲松和头孢克肟纸片扩散法的分类一致率分别为87.64%、83.45%和80.31%,配对 χ 2检验结果表明两种方法检测的药物敏感性结果存在显著性统计学差异( χ 2=65.000、52.128和95.870, P均<0.001)。 结论:某些厂家的纸片扩散法可能不是临床实践中筛选淋球菌耐药菌株的合适选择,未来需要更多高准确性的纸片以实现纸片扩散法在淋球菌耐药筛查中的应用,或在使用前对不同厂家生产的纸片扩散法进行评估,选择与琼脂稀释法一致性较好的进行测试。
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编辑人员丨1周前
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新型分枝杆菌荧光报告噬菌体的构建及其在结核分枝杆菌药敏检测中的应用
编辑人员丨1周前
目的:设计基于纳米荧光素酶(Nluc)的新型荧光报告系统,构建新型分枝杆菌荧光报告噬菌体ΦFN,分析该噬菌体检测结核分枝杆菌耐药性的能力。方法:构建P furAma启动子控制表达的Nluc荧光报告系统,将其整合至耻垢分枝杆菌基因组中,测试其在分枝杆菌的荧光报告能力;随后将P furAma- nluc报告系统整合到TM4分枝杆菌噬菌体基因组中,构建新型分枝杆菌荧光报告噬菌体ΦFN;通过调整药物预处理时间、感染时间等条件,建立ΦFN检测分枝杆菌耐药性的快速检测流程,在96孔板中检测52株已知耐药性的结核分枝杆菌临床分离株对3种一线抗结核药物耐药的耐药性。 结果:整合型表达荧光报告系统P furAma- nluc的耻垢分枝杆菌可报告下限达到100菌落形成单位(colony-forming unit,CFU),低于已报道的P left启动子表达 nluc系统。新型分枝杆菌荧光报告噬菌体ΦFN可通过孔板读值法在24 h内检测到分枝杆菌的存在,检测下限达到100 CFU。药物与待测菌预培养48 h后再加入噬菌体孵育24 h,敏感菌在10 5 CFU以下均无法检测到荧光信号,可有效区分敏感株并进行耐药性的快速检测。以罗氏药敏实验作为金标准,使用ΦFN检测52株结核分枝杆菌临床菌株对利福平、异烟肼和链霉素的耐药性,检测准确性分别是51/52、48/52、49/52。 结论:利用新型重组荧光报告噬菌体检测结核分枝杆菌对利福平、异烟肼、链霉素的耐药性具有极高的准确性,报告时间仅需3 d,有望成为一种快速简便的结核分枝杆菌耐药性检测新方法。
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编辑人员丨1周前
