目的:探讨4例Rotor综合征患儿 SLCO1B1/ SLCO1B3基因的变异特点，为临床诊疗和遗传咨询提供依据。 方法:以2019年1月至2022年1月湖南省儿童医院肝病科收治的4例患儿作为研究对象，对其进行家系全外显子组测序分析，并用凝胶电泳法对长散布元件-1(LINE-1)插入变异进行验证。结果:4例患儿均表现为皮肤及巩膜黄染。基因检测提示其 SLCO1B1基因存在3处变异，分别为c.1738C>T(p.R580*)、c.757C>T(p.R253*)以及c.1622A>C(p.Q541P)； SLCO1B3基因存在2处变异，分别为c.481＋22insLINE-1及c.1747＋1G>A。3例患儿携带 SLCO1B1/ SLCO1B3基因纯合变异，1例携带复合杂合变异。Sanger测序证实了上述变异的存在，凝胶电泳实验证实4例患儿均携带 SLCO1B3基因第6内含子约6 kb的LINE-1插入变异。 结论:4例Rotor综合征患儿均由 SLCO1B1/ SLCO1B3基因的变异所致。 SLCO1B3基因LINE-1插入变异可能是中国Rotor患者中常见的变异类型。

长散布核元件-1（long interspersed nuclear element-1，LINE-1）是人类基因组中唯一自主转座的非末端重复序列逆转录转座子，能够复制并粘贴到基因组的新位点。为了确保进化成功，可遗传的新LINE-1插入物在携带遗传信息的生殖细胞和胚胎干细胞中积累。然而，早期胚胎发育中LINE-1抑制的减少可能会导致反转座子插入引起基因组突变，LINE-1 mRNA和蛋白质表达增加可能通过诱导胎儿卵母细胞消耗、DNA损伤与免疫炎症反应间接造成早期胚胎损伤乃至妊娠丢失。本文总结并分析了近年来关于LINE-1表观调控在配子发生及早期胚胎发育过程中的作用及其诱发早期自然流产的研究进展。

目的:探讨1例Rotor综合征患儿的遗传学病因。方法:收集患儿的临床资料，应用高通量测序技术对患者行全外显子组测序并进行Sanger测序验证。用单管三引物PCR分析法检测 SLCO1B3基因第5内含子长散布元件-1(long-interspersed element-1，LINE-1)的插入情况。 结果:高通量全外显子组测序发现患儿携带 SLCO1B1基因c.1738C>T纯合无义变异。 SLCO1B3基因第5内含子中LINE-1的纯合插入，导致第5外显子或第5～7外显子跳跃，并在 SLCO1B3转录本中引入了终止密码子。 结论:SLCO1B1基因c.1738C>T纯合变异以及 SLCO1B3基因第5内含子LINE-1的纯合插入可能是该Rotor综合征患儿的致病原因。

长散布核元件-1(LINE-1)序列的异常与肿瘤的发生发展有着密切关系.LINE-1过表达可以促进细胞增殖,对肿瘤的预后及转移产生影响.LINE-1反转录转座和甲基化状态在临床诊断、预后、疾病监测以及治疗等方面有着潜在的应用价值.

丝裂原活化蛋白激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase,MAPKK或MKK)是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)级联的重要组成部分,在植物的生长发育和胁迫应答过程中发挥重要作用.目前,已在多种植物中鉴定了MKK基因家族,但在十字花科植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)中MKK基因家族的系统鉴定与分析尚未见报道.为了探索小拟南芥MKK基因家族的进化和功能,本研究通过全基因组分析鉴定了小拟南芥中16个MKK基因,散布于小拟南芥的10条染色体上.基于系统发育分析和多重序列比对,将这些基因分为5个亚族:A亚族(5个)、B亚族(2个)、C亚族(4个)、D亚族(3个)和E亚族(2个).分子进化和共线性分析表明小拟南芥中存在7对复制基因,分别是ApMKK1-1/1-2、ApMKK2-1/2-2、ApMKK3-1/3-2、ApMKK4-1/4-2、ApMKK5-1/5-2、ApMKK9-1/9-2和ApMKK10-1/10-2,其中ApMKK1-1/1-2在复制事件之后发生了加速进化.结合ApMKKs启动子区的顺式元件分布和ApMKKs在成熟叶片、茎、花和果实以及盐胁迫下的表达模式,结果发现复制基因的表达具有组织特异性和功能多样性.部分复制基因在组织中的表达模式存在差异,但在盐胁迫下的表达模式却基本相同.本研究结果为解析MKK介导的小拟南芥发育过程和非生物胁迫信号转导通路的复杂机制奠定了基础.

随着表观遗传学中DNA甲基化的深入研究,人们发现CpG岛(CpG island)DNA甲基化在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的临床诊断中发挥重要作用.目前,研究证实检测CRC患者组织、粪便和血液中基因的异常甲基化在CRC的早期筛查和诊断中具有很高的敏感性和特异性.本文就胞裂蛋白9(septin 9,SEPT9)、多配体聚糖2前体(syndecan 2 precursor,SDC2)、波形蛋白(vimentin,VIM)、p16和长散布核苷酸元件-1(long interspersed nucleotide element-1,LINE-1)5个基因的甲基化及其在CRC诊断中的相关进展进行了综述.

目的 探讨基因工程小鼠短散布核元件(SINE)B1反义RNA(B1as RNA)对抗疲劳,抗氧化和清除衰老细胞中活性氧的作用.方法 将36只自然衰老BALB/c小鼠分为A、B、C 3组,每组12只,分别注射B1as RNA,LacZ3F3R RNA和盐水,转棒疲劳仪检测抗疲劳能力.另选6周龄年轻健康小鼠12只(D组),不做任何处理作为对照.测定各组小鼠活性氧,超氧化物歧化酶(SOD),谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和丙二醛水平;检测Sesn1和Sesn2基因的mRNA的表达水平,线粒体DNA拷贝数(mtDNAcn)和脾脏组织细胞中β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)阳性率.结果 A组小鼠第6～8次在转棒疲劳仪上停留的时间明显长于B、C组(P<0.01);A、B、C、D组小鼠脾脏组织细胞中SA-β-gal阳性细胞比率分别为24.63％、36.02％、37.14％、0.76％,A组明显低于B、C组(P<0.05),高于D组(P<0.01).C组小鼠肝脏和脾脏组织中的mtDNAcn明显高于D组小鼠(P<0.01),A组小鼠肝脏和脾脏组织中mtDNAcn明显低于C组(P<0.05).C组小鼠外周血细胞活性氧、丙二醛水平明显高于D组(P<0.01);A组小鼠的活性氧、丙二醛水平明显低于B、C组(P<0.05);A组小鼠的SOD、GSH-px活性明显高于C组(P<0.05);A组小鼠肝脏、脾脏中Sesn1、Sesn 2抗氧化防御基因的mRNA表达量明显高于C组(P<0.05),但低于D组(P<0.01).结论 B1as RNA具有抗疲劳和抗氧化活性,并能清除衰老细胞中积累的活性氧.

长散布元件-1(long interspersed elements-1,LINE-1)约占人类基因组的17％,是人类基因组中唯一具有自主转座能力的转座子.LINE-1可通过逆转录转座过程插入到新的基因位点上,从而会导致基因组的不稳定.因而机体对LINE-1的复制和转座有着严格的限制,在正常体细胞中几乎检测不到LINE-1的表达.然而,在绝大多数的肿瘤组织或癌组织中LINE-1的表达却普遍存在,提示LINE-1的表达和转座与肿瘤的发生发展密切相关.LINE-1在肿瘤细胞中的差异表达可以作为肿瘤早期诊断的标志物,同时也可作为肿瘤治疗预后评价的重要指标.与此同时,LINE-1作为肿瘤治疗潜在靶点的可行性也在评估和验证中.本文介绍了在临床方面LINE-1作为肿瘤诊断、预后方面的应用,以及作为肿瘤治疗潜在靶点的研究进展,以期为临床上肿瘤的诊断和治疗提供一些参考.

长散布元件-1(long interspersed nuclear element-1,LINE-1)逆转录转座子是肿瘤中染色体不稳定、基因组不稳定和遗传异质性的主要标志,并已成为许多疾病发生、发展和不良预后的标志物之一.LINE-1也参与调控免疫系统,并通过多种方式影响免疫微环境.LINE-1逆转录转座子的异常表达可对先天免疫应答产生强烈刺激,激活免疫系统,引发自身免疫和炎症反应.因此,抑制LINE-1的活性已成为多种肿瘤的潜在治疗策略.本文主要综述了LINE-1的调控机制、LINE-1与肿瘤和免疫的相关性以及LINE-1的多种抑制剂,为LINE-1的研究提供了新的认识.

目的:建立绿色荧光蛋白(GFP)标记的急性淋巴细胞白血病(ALL)移植瘤小鼠模型,研究ALL髓外浸润过程中血清游离DNA(cfDNA)特异基因甲基化的变化,为ALL髓外浸润监测提供理论和实验依据.方法:60只ICR小鼠随机分为对照组、实验15 d组和实验30 d组,每组20只.实验组小鼠通过尾静脉注射构建GFP标记ALL移植小鼠模型,流式细胞术检测白血病细胞髓外浸润情况.分别在建模后第15和30天时采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测各组小鼠血清中双加氧酶2(TET2)、DNA甲基转移酶3α(DNMT3a)、DNA甲基转移酶3β(DNMT3b)、Wnt家族成员5A(Wnt5A)及逆转座子长散布核元件-1(LINE-1)mRNA表达水平,重亚硫酸盐测序法(BSP)检测各组血清中Wnt5A和LINE-1启动子区甲基化水平.结果:实验15 d组和实验30 d组小鼠脾脏组织中均可见明显绿色荧光,且实验30 d组较实验15 d组荧光强度增强;实验30 d组小鼠脾脏质量高于对照组(P<0.05),脾肿大较为明显.流式细胞术检测,与对照组比较,实验15 d组和实验30 d组小鼠外周血细胞荧光强度均明显增强,且实验30 d组小鼠外周细胞血荧光强度较实验15 d组增强(P<0.05).RT-qPCR法检测,与对照组比较,实验15 d组和实验30 d组小鼠血清中Wnt5A和TET2 mRNA表达水平均明显降低(P<0.05),LINE-1、DNMT3a和DNMT3b mRNA表达水平明显升高(P<0.05).BSP法检测,与对照组比较,实验15 d组和实验30 d组小鼠血清LINE-1启动子区甲基化水平明显降低(P<0.05),在浸润过程中逐步呈现低甲基化;抑癌基因Wnt5A启动子区甲基化水平明显升高(P<0.05).结论:ALL移植瘤小鼠模型于建模早期即出现髓外浸润,血清cfDNA中Wnt5A和LINE-1启动子区的异常甲基化直接影响其异常表达.cfDNA特异位点甲基化水平检测可为ALL早期诊断与治疗监测提供新的方法和策略.