-
长链非编码核糖核酸C5orf66反义链1在直肠癌组织的表达及其临床意义
编辑人员丨1天前
目的:探讨直肠癌患者组织中长链非编码核糖核酸C5orf66反义链1(lncRNA C5orf66-AS1)表达水平与患者临床病理参数及预后的关系。方法:选取2015年4月至2016年4月于南京医科大学第一附属医院确诊的74例直肠癌患者肿瘤组织作为直肠癌组,选取直肠癌患者相应癌旁正常组织(距离肿瘤>10 cm)作为癌旁对照组,随访5年记录患者生存情况。癌症基因组图谱(TCGA)数据库检索直肠癌中lncRNA C5orf66-AS1表达水平,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测直肠癌患者组织lncRNA C5orf66-AS1表达水平;分析肿瘤组织lncRNA C5orf66-AS1表达水平与直肠癌患者临床病理参数及预后的关系;分析影响直肠癌患者预后的因素。采用 t检验及 χ2检验比较组间差异。 结果:TCGA数据库中直肠癌组织lncRNA C5orf66-AS1表达水平低于正常组织(0.44±0.12比0.95±0.21, t=17.155, P<0.05),差异有统计学意义。RT-qPCR检测结果显示,直肠癌组lncRNA C5orf66-AS1表达水平(0.48±0.19)低于癌旁对照组(1.01±0.23, t=15.283, P<0.05),差异有统计学意义。lncRNA C5orf66-AS1高表达组和lncRNA C5orf66-AS1低表达组肿瘤大小、淋巴结转移、TNM分期比较,差异有统计学意义( χ2=0.041、0.012、0.605、1.655、0.962, P<0.05)。lncRNA C5orf66-AS1高表达的直肠癌患者术后5年生存率高于lncRNA C5orf66-AS1低表达患者( χ2=12.404, P<0.05),差异有统计学意义。淋巴结转移是影响直肠癌患者死亡的独立危险因素[风险比( HR)=2.134,95%可信区间( CI):0.850~1.524, P<0.05],差异有统计学意义,lncRNA C5orf66-AS1是影响直肠癌患者死亡的保护因素( HR=0.745,95% CI:0.610~0.910, P<0.05),差异有统计学意义。 结论:lncRNA C5orf66-AS1表达水平与直肠癌患者病情进展及预后可能有密切联系。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
基于N6-甲基腺嘌呤相关长链非编码RNA的直肠乙状结肠交界处癌预后模型的构建
编辑人员丨1天前
目的:探索单独针对直肠乙状结肠交界处癌(RSC)的危险因素和生物标志物来预测患者预后并开发新的治疗靶点。方法:本研究从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中收集66例肿瘤和6例正常组织,使用PERL和R软件包综合分析23个m6A调控因子的表达水平、突变情况及与RSC患者预后的关系,通过确定了lncRNAs和m6A的关系,进一步利用Lasso回归构建预后模型。结果:与邻近正常组织比较,23个m6A调节因子中有7个在RSC中存在差异表达,并且有5个m6A调节因子与患者预后相关( P<0.05)。共表达分析结果显示,278个lncRNA的表达与m6A密切相关,许多lncRNAs是预测RSC预后的危险因素( P<0.05)。m6A-lncRNAs在肿瘤组织中表达异常( P<0.05),可用于预测RSC预后的模型,不受其他临床特征影响。通过LASSO回归,基于3个m6A-lncRNAs分子MCM3AP-AS1、AF117829.1和HCG15建立RSC的预后模型,生存曲线证明了该模型在预测患者生存率方面具有较高的准确性( P<0.05),该模型可以应用于不同临床分层亚组的预后判断。 结论:m6A甲基化修饰异常及m6A相关lncRNAs与RSC的发生密切相关,相应的预后模型可以为RSC患者的预后评估和个性化治疗策略提供依据。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
靶向抑制lncRNA CTB-191K22.5降低结直肠癌SW480细胞增殖和侵袭的机制研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨下调长链非编码RNA(lncRNA)CTB-191K22.5对结直肠癌SW480细胞增殖和侵袭的影响及分子机制。方法:采用TCGA数据库分析结直肠癌组织和正常组织中CTB-191K22.5的表达差异。将CTB-191K22.5抑制物(Anti-CTB-191K22.5)和阴性抑制物(Control)转染至结直肠癌SW480细胞,分别记为观察组和对照组,实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)评估抑制效果。MTT法和Transwell小室法分别评估SW480细胞的增殖和侵袭变化。Western blot评估SW480细胞中PI 3K/AKT/mTOR信号通路蛋白水平。生物信息学软件starBase v2.0预测CTB-191K22.5的靶基因。qRT-PCR评估SW480细胞中CTB-191K22.5靶基因的表达。正态分布的计量资料以均数±标准差( ± s)表示,两组间比较采用 t检验。 结果:与正常组织相比,结直肠癌组织中CTB-191K22.5呈现明显高表达( P<0.01)。对照组和观察组SW480细胞中CTB-191K22.5表达分别为6.60±0.85和1.08±0.21,转染Anti-CTB-191K22.5后CTB-191K22.5表达水平降低( P<0.01)。与对照组相比,观察组SW480细胞增殖能力下降( P<0.01)。对照组和观察组SW480细胞侵袭数分别为(135.4±16.29)个和(42.24±14.59)个,转染Anti-CTB-191K22.5后SW480细胞侵袭能力下降( P<0.01)。与对照组相比,观察组SW480细胞中PI 3K/AKT/mTOR信号通路蛋白表达水平降低。miR-326可能是CTB-191K22.5的靶基因。与对照组相比,转染Anti-CTB-191K22.5显著提高SW480细胞中miR-326表达水平( P<0.01)。 结论:结直肠癌组织中CTB-191K22.5高表达,下调CTB-191K22.5可能通过靶向miR-326抑制结直肠癌SW480细胞的增殖和侵袭。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
长链非编码RNA结直肠肿瘤差异表达基因微RNA-181a-5p和自噬相关蛋白5在原发性痛风性关节炎中的表达及临床意义
编辑人员丨1天前
目的:探索长链非编码RNA(lncRNA)结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)、微RNA-181a-5p(miR-181a-5p)、自噬相关蛋白5(ATG5)在原发性痛风性关节炎(GA)患者外周血中的表达及临床意义。方法:收集80例GA患者[急性期痛风(AG)、间歇期痛风(IG)各40例]和50名健康体检者(HC)临床资料、实验室检查指标及外周血标本。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测lncRNA CRNDE、miR-181a-5p、ATG5 mRNA表达水平;蛋白质印迹法检测ATG5蛋白表达水平。比较3组间lncRNA CRNDE、miR-181a-5p、ATG5 mRNA表达量并与临床指标做相关性分析,构建受试者工作特征曲线(ROC)评估lncRNA CRNDE、miR-181a-5p、ATG5 mRNA在痛风诊断中的价值。符合正态分布的计量资料使用 t检验或方差分析,非正态分布用Mann-Whitney U检验或Kruskal-Wallis H检验,变量间的相关分析采用Spearman分析,各指标的诊断价值采用ROC曲线。 结果:①LncRNA CRNDE、miR-181a-5p、ATG5 mRNA在3组间表达差异均有统计学意义( H=32.12、57.73、68.32, P均<0.001)。其中,lncRNA CRNDE表达水平在AG组明显高于IG组和健康对照组[61.95(11.39,108.30)×10 -3,25.71(15.40,38.40)×10 -3,13.80(3.97,23.99)×10 -3; Z=-3.24, P=0.001; Z=-5.03, P<0.001],且在IG组的表达水平高于健康对照组( Z=-3.56, P<0.001);miR-181a-5p、ATG5 mRNA表达水平在AG组明显低于IG组及健康对照组[miR-181a-5p:39.81(31.22,69.38)×10 -3,60.74(44.19,90.35)×10 -3,121.30(101.50,316.90)×10 -3; Z=-3.01, P=0.030; Z=-6.93, P<0.001。ATG5 mRNA:4.52(2.31,26.63)×10 -3,43.63(13.72,102.70)×10 -3,153.90(66.62,365.80)×10 -3; Z=-5.47、-7.36, P均<0.001)],在IG组的表达水平低于健康对照组( Z=-5.25、-4.47, P均<0.001)。ATG5蛋白表达水平在3组间表达的差异有统计学意义( F=6.24, P=0.030),AG组高于健康对照组,差异有统计学意义[(0.96±0.13)与(0.61±0.04), t=4.25, P=0.013],但IG组(0.78±0.15)与AG组( t=1.51, P=0.206)、HC组( t=1.85, P=0.138)差异无统计学意义。②Spearman相关性分析显示,在GA组中lncRNA CRNDE与miR-181a-5p、ATG5 mRNA的表达水平呈负相关( r=-0.49, P<0.001; r=-0.35, P=0.002);miR-181a-5p与ATG5 mRNA表达水平在呈正相关( r=0.64, P<0.001);lncRNA CRNDE表达水平与ESR、WBC呈正相关( r=0.49, P<0.001; r=0.43, P=0.001);miR-181a-5p表达水平与ESR、WBC呈负相关( r=-0.29, P=0.009; r=-0.35, P=0.002);ATG5 mRNA表达水平与ESR、WBC、中性粒细胞绝对值(GR)呈负相关( r=-0.26, P=0.021; r=-0.26, P=0.024; r=-0.27, P=0.021)。在AG组中lncRNA CRNDE与ESR、WBC呈正相关( r=0.36, P=0.022; r=0.36, P=0.026),miR-181a-5p与WBC呈负相关( r=-0.34, P=0.038)。③ROC曲线显示:lncRNA CRNDE、miR-181a-5p、ATG5 mRNA表达水平预测痛风的ROC曲线下面积分别为0.764、0.875、0.864;三者联合预测痛风的ROC曲线下面积为0.928。 结论:LncRNA CRNDE、miR-181a-5p、ATG5可能参与了GA的发病机制,并且有望成为监测痛风发病的生物学指标。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
长链非编码RNA 00461在恶性肿瘤中的研究进展
编辑人员丨1天前
长链非编码RNA 00461 (linc00461)是长链非编码RNA家族中的重要一员,近年来备受关注。随着linc00461基础和临床研究的深入,发现其除了在包括糖代谢在内的多种生物学过程中起重要调控作用外,同时在癌症的发生发展中发挥促癌作用。linc00461已被证实在多种恶性肿瘤患者的细胞和组织中差异表达,通过调控功能靶基因影响恶性肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭及转移,并且linc00461的表达模式与恶性肿瘤的耐药性产生和预后相关,这将为肿瘤治疗的个体化和精准化提供新的思路和策略。本综述总结了linc00461在神经胶质瘤、头颈鳞状细胞癌、非小细胞肺癌、结直肠癌、肾细胞癌、子宫内膜癌和乳腺癌等恶性肿瘤中的作用机制。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
低表达长链非编码RNA结直肠肿瘤差异表达基因促进人骨肉瘤MG63细胞凋亡并抑制其增殖和侵袭
编辑人员丨1天前
目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)对骨肉瘤细胞增殖、侵袭和凋亡能力的影响。方法:采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测6种骨肉瘤细胞株(Saos-2、HOS、MG63、143B、U-2OS)及正常骨细胞(hFOB1.19,购自中国北京医学科学院)中lncRNA CRNDE的表达,小干扰RNA(siRNA)技术构建MG63 lncRNA CRNDE低表达株。将lncRNA CRNDE小干扰RNA(lncRNA CRNDE-siRNA、无意义阴性序列(si-NC)分别转染MG63细胞,然后将转染后MG63分为3组,lncRNA CRNDE小干扰RNA(siRNA)组(lncRNA CRNDE-siRNA)、阴性对照组(Control-si)和空白对照组(Control-nc);细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞增殖;膜联蛋白V-异硫氰酸荧光素(Annexin V-FITC)/碘化丙锭(PI)检测细胞凋亡;Transwell法检测细胞迁移能力。细胞增殖结果以及流式细胞法凋亡结果采用重复测量资料的方差分析;细胞迁移检测结果的组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:与正常骨细胞(1.037±0.025)比较,5种骨肉瘤细胞株的表达量升高,分别为Saos-2(4.034±0.033)、HOS(3.896±0.045)、MG63(5.932±0.045)、143B(2.905±0.030)、U-2OS(5.632±0.015),而骨肉瘤细胞中MG63 lncRNA CRNDE1表达水平最高( F=215.568, P<0.01);RT-qPCR显示,转染后MG63细胞内的lncRNA CRNDE表达明显降低,低表达细胞株构建成功( F=32.535, P<0.01);CCK-8实验结果显示,与阴性对照组(Control-si)和空白对照组(Control-nc)比较,lncRNA CRNDE-siRNA组MG63细胞增殖活力明显受到抑制,24、48、72 h的吸光度( A)值分别为(0.422±0.023)%、(0.402±0.019)%、(0.320±0.021)%( F=48.632, P<0.01)、(0.659±0.032)%、(0.696±0.035)%、(0.409±0.032)%( F=18.110, P<0.05)以及(1.006±0.078)%、(0.982±0.069)%、(0.713±0.030)%( F=27.751, P<0.05);Annexin V-FITC/PI检测结果显示,Control-si、Control-nc和lncRNA CRNDE-siRNA组MG63细胞的凋亡率显著上升,分别为(5.871±0.501)%、(4.231±0.261)%、(14.231±1.591)%( F=119.480, P<0.01);Transwell结果显示,Control-si、Control-nc和lncRNA CRNDE-siRNA组迁移细胞数分别为(85.0±3.2)、(88.0±8.0)、(54.0±1.9)个( F=282.690, P<0.01)。 结论:lncRNA CRNDE在骨肉瘤细胞中高表达,且与癌细胞增殖,凋亡和侵袭高度相关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
外泌体长链非编码RNA在胰腺癌诊断中的应用现状与展望
编辑人员丨1天前
胰腺癌发病率逐年升高,早期诊断困难,现有血清标志物难以满足临床需求,需要开发新的诊断标志物。液体活检技术在胰腺癌诊断及疗效评估中具有较好的应用前景,检测分析胰腺癌细胞来源外泌体中特异性分子标志物有助于胰腺癌的诊断及预后评估。目前在外泌体长链非编码RNA(lncRNA)检测应用领域还处于探索阶段。本文针对外泌体lncRNA在胰腺癌诊断中的研究现状与进展进行综述,旨在评价循环外泌体lncRNA检测在胰腺癌诊断中的潜在价值与应用前景。近年研究证实了检测循环外泌体lncRNA用于胰腺癌诊断具有可行性,部分lncRNAs如转移相关肺腺癌转录物(MALAT1)、结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)、肝癌高表达转录本(HULC)、SOX2重叠转录本(Sox2ot)、AK296146和尿路上皮癌相关基因1(UCA1)等具有成为胰腺癌诊断标志物的潜能,联合检测多种lncRNAs可能具有更高的诊断价值。然而,目标lncRNA的筛选、循环外泌体富集纯化流程的标准化和外泌体lncRNA的检测及定量方法等,尚需进一步探索。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
结直肠癌竞争性内源RNA网络的建立及C14orf132、GAS1表达关系及其意义
编辑人员丨1天前
目的:通过生物信息学分析建立结直肠癌竞争性内源RNA(ceRNA)网络,对筛选出的ceRNA C14orf132-GAS1的表达及意义进行探讨。方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库对结直肠癌数据集进行分析,筛选差异表达的长非编码RNA(lncRNA)和mRNA,采用倍数法(fold change)和 t检验识别差异表达基因,校正后 P<0.05且|log2 fold change|>1的基因被鉴定为差异表达基因。采用超几何检验方法筛选出lncRNA-mRNA形成的ceRNA对,并对可能的靶微小RNA(miRNA)进行筛选。从TCGA数据库下载结直肠癌临床数据集。使用R包的"survival"和"survminer"进行生存分析。选取30例新鲜的结直肠癌及癌旁组织,应用荧光实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)对筛选出的ceRNA对和miRNA进行检测,并对这些分子间的相关关系进行Pearson相关分析。 结果:肿瘤组织中上调的mRNA数量为1 731,下调的为3 691;上调的lncRNA为1 126,下调的为2 105;上调的miRNA为14,下调的为190。经过筛选,确定C14orf132-miR-33a-GAS1轴可能为结直肠癌进展中有重要意义的ceRNA。生物信息学结果显示,C14orf132-GAS1作为ceRNA对,在肿瘤中表达水平(13.37±1.76、14.45±4.55)低于正常组织(15.71±0.62、16.00±2.42, t=-9.44、-2.40, P<0.05);miR-33a在肿瘤中表达水平(5.53±1.84)高于正常组织(3.25±0.77, t=4.10, P<0.01)。组织验证结果与生物信息学结果符合。 结论:由C14orf132-miR-33a-GAS1轴形成的ceRNA机制可能在结直肠癌进展过程中发挥重要作用。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
LINC01600在结直肠癌临床诊断中的应用价值
编辑人员丨1天前
目的:分析长链非编码RNA LINC01600在结直肠癌组织中的表达以及在临床结直肠癌诊断过程中的价值。方法:选取2020年1月至2023年12月新乡医学院第一附属医院收治的37例结直肠癌患者的临床标本作为研究标本,选择对应的癌旁组织作为对照样本。提取癌旁组织和结直肠癌组织的总RNA,采用转录组学技术分析癌组织和癌旁组织差异表达的长链非编码RNA。选取差异最为显著的长链非编码RNA LINC01600作为研究对象。采用荧光定量聚合酶链反应技术检测结直肠癌组织和癌旁组织中LINC01600的表达水平。制作受试者工作特征曲线分析LINC01600对结直肠癌的临床诊断效能。采用单因素方差分析不同临床分期,不同分化程度患者LINC01600表达水平。并分析LINC01600和患者预后的关系。结果:结直肠癌和癌旁组织共检出39 123个长链非编码RNA,其中包括2 018个新的长链非编码RNA。差异分析显示,其中有1 626个差异表达的长链非编码RNA,其中1 019个上调基因,607个下调基因。长链非编码RNA主要富集于核糖体通路、柠檬酸循环通路和RNA剪接相关通路。本研究选取差异最为显著的上调长链非编码RNA LINC01600进行研究。癌旁组织长链非编码RNA LINC01600表达水平(0.85±0.10)明显低于结直肠癌组织(1.99±0.31),差异有统计学意义( t=21.390, P<0.05),中高分化患者肿瘤组织中长链非编码RNA LINC01600表达水平(1.70±0.11)显著低于低分化患者(2.19±0.24),差异有统计学意义( t=7.510, P<0.05)。淋巴结转移患者结直肠癌组织长链非编码RNA LINC01600表达水平(2.24±0.23)显著高于结直肠癌组织(1.80±0.20),差异有统计学意义( t=6.229, P<0.05)。Ⅲ期患者结直肠癌组织长链非编码RNA LINC01600表达水平(2.19±0.32)显著高于结直肠癌组织(1.92±0.27),差异有统计学意义( t=2.796, P<0.05)。LINC01600高表达组结直肠癌患者中位生存时间(14个月)明显低于LINC01600低表达患者(26个月),差异有统计学意义(Log-rank=4.618, P<0.05)。肿瘤组织长链非编码RNA LINC01600诊断结直肠癌的曲线下面积(AUC)为0.814[95%可信区间( CI)=0.754~0.968, P<0.05]。LINC01600敏感性为92.45%,特异性为89.36%。 结论:长链非编码RNA LINC01600在结直肠癌患者肿瘤组织中达水平明显高于癌旁组织,有助于临床结直肠癌患者术前和预后诊断。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
非小细胞肺癌组织LncRNA CRNDE表达及临床意义
编辑人员丨2024/6/8
目的:分析长链非编码RNA结直肠肿瘤差异表达基因(LncRNA CRNDE)在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达及临床病理意义.方法:2020 年2 月至 2023 年 5 月,来自我院的 63 例NSCLC患者被纳入研究.采用实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测肿瘤组织和邻近正常组织中LncRNA CRNDE的表达.利用本研究队列和TCGA队列分析LncRNA CRNDE的临床病理意义和预后价值.结果:RT-qPCR分析显示,LncRNA CRNDE在肿瘤组织中的表达显著高于邻近的正常组织[3.04(0.56,13.04)vs.0.24(0.05,1.99),P<0.001].在受试者工作特征曲线中,LncRNA CRNDE是有能力区分NSCLC肿瘤组织和邻近正常组织的,曲线下面积为0.713(P<0.001),特异度较高,为81.0%.肿瘤组织LncRNA CRNDE在TNM Ⅲ期中表达水平高于Ⅰ~Ⅱ期患者(P =0.001).TCGA数据显示,与邻近的正常组织(n =106)相比,LncRNA CRNDE在NSCLC肿瘤组织(n =1 014)中呈高表达[41.00(24.00,72.00)vs.22.60(10.60,47.70),P<0.001].Ln-cRNA CRNDE高表达与所有患者较短的总生存(OS)时间以及肺鳞癌患者较短的OS时间和首次进展时间有关(P<0.05).多变量生存分析结果也表明,N2/3分期(P =0.004)和LncRNA CRNDE高表达(P =0.010)与NSCLC患者较短的OS时间显著相关.结论:LncRNA CRNDE有希望作为NSCLC的潜在诊断标志物和治疗靶点.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/6/8
