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二代测序技术在Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(Vero细胞)生产质量控制中的应用
编辑人员丨2天前
目的 将二代测序(next generation sequencing,NGS)技术应用至Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(Vero细胞)(Sabin strain inactivated poliomyelitis vaccine,sIPV)生产质量监控中,以期确保疫苗的安全性和批间一致性.方法 将脊髓灰质炎病毒(poliovirus,PV)Sabin株Ⅰ型、Ⅱ型和Pfizer株Ⅲ型工作种子批分别接种至生物反应器微载体培养的单层Vero细胞上,33 ℃培养3~4d,获得疫苗代次病毒液,每个型别制备3批.提取各型别工作种子批毒种和疫苗代次病毒液RNA,用NGS技术分析基因突变频率、神经毒力决定位点、突变热点及批间一致性.结果 3种型别PV工作种子批毒种经培养后,Sabin株Ⅱ型和Pfizer株Ⅲ型比Sabin株Ⅰ型更易发生突变,非编码区神经毒力决定位点突变频率明显上升(t=3.21~5.83,P均<0.05),编码区神经毒力决定位点突变频率变化较小(t=1.29~2.34,P均>0.05)或明显下降(t=6.01~9.62,P均<0.05);Sabin株Ⅱ型毒株的nt869位点及Pfizer株Ⅲ型毒株的nt2 493位点各发生1个突变热点,突变方式均为C→T,其中nt2493既是神经毒力决定位点,也是突变热点.3种型别各3批疫苗代次病毒液均具有良好的批间一致性,基因组VP1区域各核酸位点突变频率批间拟合R2为0.947~0.995.结论 NGS技术可高效检测sIPV生产过程中PV基因组的突变,且稳定可靠,可用于该疫苗的质量控制.
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编辑人员丨2天前
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基于Web of Science核心集重症护理研究可视化分析
编辑人员丨2天前
目的:通过知识图谱可视化技术对Web of Science核心集已发表的重症护理相关文献进行数据分析,归纳重症护理研究现状及热点。方法:检索2011年1月至2020年12月Web of Science核心集数据库,对提取信息进行数据标准化处理,利用知识图谱可视化等方法对提取数据进行分析处理。结果:共纳入783篇重症护理领域相关文章,文献数量呈逐年递增趋势,其中杂志《Amercian Journal of Critical Care》(305篇)上刊登最多,美国(437篇)是发表文献最多的国家,澳大利亚(centrality=0.67)是中心度最高的国家,我国在发文数量及中心性方面均处于中下水平。国家间有合作,但并非紧密合作;作者间相互合作呈小聚集,大分散状态。被引文献聚类分析与关键词突现分析显示重症护理领域多个方面曾为研究热点,其中"重症监护后综合征""儿童重症护理"为近年来研究热点。结论:重症护理研究领域仍处于上升发展阶段,重症监护后综合征及儿童重症护理为重症护理研究最新热点。
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编辑人员丨2天前
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基于VOSviewer和CiteSpace的中医补肾法研究热点与前沿可视化分析
编辑人员丨2天前
目的:运用文献计量学方法分析中医补肾法的知识基础和研究热点前沿,为临床研究提供参考。方法:检索Web of Science核心合集数据库建库至2023年11月27日中医补肾法相关文献。采用VOSviewer 1.6.18软件绘制作者共现图,采用CiteSpace 6.1.R6软件对机构、作者、关键词、文献共被引等进行共现、聚类和突现分析,绘制网络图谱。结果:纳入文献522篇,来源期刊174种,发文量最多的期刊和机构分别是 J Ethnopharmacol(58篇)和广州中医药大学(49篇)。最大的合作团队是以河南中医药大学的李建生教授、李素云教授为代表的团队。频次排名前3位的关键词依次为extract、mechanism和apoptosis。关键词聚类分析显示,该领域研究主要集中在治疗病种和方法层面。 结论:中医补肾法的知识基础集中在网络药理学、转录组学分析、肠道菌群研究等技术方法,以及非酒精性脂肪肝、生精功能障碍、卵巢早衰、纤维化等疾病。研究热点集中在绝经后骨质疏松症、AD、COPD等疾病,网络药理学和分子对接等方法,以及山茱萸、中药提取物、炎症等方面。槲皮素、分子对接、NF-κB、安全性可能是其研究热点前沿。
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编辑人员丨2天前
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肾移植后马尔尼菲蓝状菌、烟曲霉、哥伦比亚分枝杆菌混合感染1例
编辑人员丨2天前
肾移植患者需要服用多种免疫抑制剂抗排斥治疗,是各类感染的高危人群。罕见病原体感染、混合感染是诊断及治疗的难点,抗生素覆盖病原微生物不准确和血药浓度不足均会影响疗效,增加病死率,及时且精准的鉴定病原微生物至关重要 [1]。现阶段病原微生物检测最常见的方法是体液涂片和培养,组织病理学检查是侵袭性真菌感染确诊的金标准,聚合酶链式反应(PCR)能够快速、准确、高灵敏度的找到特定感染病原体,抗原抗体检测可区分急性和既往感染。但体液培养耗时长、灵敏度差、抗生素治疗后送检标本的阳性率更低。怀疑侵袭性真菌感染时,并非所有患者都能获取感染组织标本送检组织病理学检查。PCR难以发现未知病原微生物。免疫抑制患者的病原微生物抗体检测,诊断效率亦欠佳 [2]。宏基因组二代测序技术(mNGS)可直接提取送检样本中全部微生物的核酸进行高通量测序,快速且客观的检测样本中的病原微生物,广覆盖、无偏倚、无需假设。近年来已广泛应用于急危重症和免疫缺陷患者感染的鉴别诊断中 [3,4]。本文报道1例肾移植患者,间断发热1个月,右侧鼻翼及鼻腔丘疹样溃疡形成,双侧眼睑粘膜红肿,CT见两肺大片状及结节样实性密度影,通过mNGS鉴定出马尔尼菲蓝状菌、烟曲霉、哥伦比亚分枝杆菌混合感染,调整抗生素后病情好转,现进行分析总结。
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编辑人员丨2天前
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宏基因组测序辅助儿童少见病原菌髋关节感染快速准确诊断一例
编辑人员丨2天前
宏基因组二代测序(metagenomic next generation sequencing,mNGS)是一种直接从环境或者临床样本中提取全部微生物DNA的临床诊断技术 [1];理论上可以检测临床样本中的所有病原体,特别适用于罕见、新型和非典型病因的复杂感染性疾病 [2]。目前,mNGS广泛应用于儿童重症感染、细菌性脑膜炎、粒细胞缺乏伴发热等疾病的病原学诊断 [3]。儿童化脓性髋关节炎(septic arthritis of the hip,SAH)是各类病原体引起的髋关节滑膜以及随后关节内所有结构的炎症,占儿童骨关节感染性疾病的30%左右 [4,5,6,7];可表现为急性的寒战、高热、关节的局部活动能力下降和姿势受限 [8]。快速准确地获取病原学证据是SAH诊断和治疗的关键,目前,该疾病确定病原学主要靠血培养或关节液培养 [9,10]。本文报道了SAH常规细菌培养阴性,通过mNGS快速准确诊断儿童SAH的病原学,从而使用敏感抗生素针对性治疗的一例病例分析,并结合文献,旨在探讨mNGS对儿童SAH临床诊断的潜在价值,并将mNGS的临床应用进行总结分析,为复杂感染性疾病及时诊治提供思考。
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编辑人员丨2天前
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快速等温扩增法在采供血机构沙门菌监测中的应用
编辑人员丨2天前
目的:评价快速重组酶介导的等温扩增技术(RAA)在采供血机构沙门菌生物学监测中的应用。方法:加热快速裂解肠炎沙门菌标准菌株提取DNA,采用沙门菌RAA荧光型检测试剂在小型Genchek荧光检测仪内37 ℃条件下识别并扩增沙门菌的特异基因片段,20 min内实时读取荧光检测值,根据扩增曲线判定结果。评估RAA法的检测灵敏度,同时采用RAA法检测13个标准菌株和5个实验室分离的沙门菌株验证其特异性。采集51份样本,分别接种肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌标准菌株,以及无沙门菌污染的空白对照,营养琼脂平板培养48 h计数菌落数,同时采用国标GB 4789.4—2016的方法和RAA法进行沙门菌检测。结果:RAA法在37 ℃ 20 min的条件下对肠炎沙门菌的最低检出限为1.9×10 2 CFU/mL,和非沙门菌无交叉反应。使用中消毒液和血液运输箱内壁沙门菌生物学的检测结果与国标法相同,Kappa值均为1。 结论:RAA技术可快速、灵敏、特异性地检测沙门菌,可应用于采供血机构沙门菌的生物学监测。
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编辑人员丨2天前
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中医汤剂知识图谱的构建与样例查询方法研究
编辑人员丨1个月前
利用现代化信息技术为中医药的科研、传播、教学等方面提供有效的研究方法与途径是当前的研究热点,更是未来的发展方向.知识图谱通过其独特的知识展示,为挖掘医学知识中隐藏的关联关系提供方法,为中医药的传承发展提供动力,为中医药的学习研究提供参考.中医方剂作为中医治疗的重要手段之一,扮演着重要的角色.利用知识图谱技术,实现对中药方剂中汤剂类型的经方进行实体和关系的提取,并构建一个中医汤剂知识图谱.通过对中医文献、中医医案、中医方剂数据库、名老中医经验等非结构化及半结构化信息进行深入分析和文本挖掘,将整理好的知识存入Neo4j图数据库中,并使用中医药物图片作为相应中药实体节点显示,帮助理解知识图谱中的实体和关系并发现隐藏的模式、趋势和关联性.设计一种样例查询算法进行查询分析,为中医汤剂知识的学习、浏览及检索提供新思路,为分析挖掘中医药中潜在的关联关系提供新方案,为中医药知识的表达及可视化提供新范式.
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编辑人员丨1个月前
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紫堇属植物苄基异喹啉类成分研究进展
编辑人员丨2024/6/15
全球紫堇属Corydalis约400余种,广泛分布于北温带和非洲南部地区.在我国,该属多种物种作为民间用药具有上千年历史.紫堇属植物富含异喹啉生物碱,对该类成分通常以回流、超声加热、湿法超微粉碎法和酶解辅助技术等方法提取,并使用溶剂分离法、硅胶柱色谱法、反向填料柱色谱法、HPLC法、离子交换树脂法、高效逆流色谱法和活性引导技术等方法进行分离纯化法.紫堇属生物碱有效部位或单体成分都具有较强药理活性,现代药理学表明,该属所含生物碱类成分对心脑血管、抗肿瘤、镇痛、消炎、保肝和抗血小板凝集等均具有显著的药理作用.本文对已报道的紫堇属植物生物碱类成分的结构类型、特征、药理作用以及提取分离方法研究进行综述,为植物药用化学成分富集和安全用药提供借鉴.
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编辑人员丨2024/6/15
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地诺孕素治疗子宫内膜异位症的快速卫生技术评估
编辑人员丨2024/5/11
目的:快速评价地诺孕素治疗子宫内膜异位症的有效性、安全性和经济性,旨在为临床药物选择和决策提供循证依据.方法:计算机检索PubMed、Embase、Cochrane Library、中国知网、SinoMed、万方数据、国内外卫生技术评估(HTA)机构官方网站及相关数据库,收集地诺孕素治疗子宫内膜异位症的HTA报告、系统评价/Meta分析和药物经济学研究,检索时限均为建库起至2023年9月.资料提取和质量评价后,对纳入研究的结果进行描述性分析.结果:共纳入9篇系统评价(Meta分析)、2篇药物经济学研究.Meta分析文献质量偏低,经济学研究质量较好.有效性方面,与无治疗相比,地诺孕素可以显著降低术后复发率、盆腔疼痛(VAS)评分,提高妊娠率及有效率;地诺孕素与促性腺激素释放激素激动剂(GnRHa)、复方口服避孕药(COC)在复发率方面疗效相当;在复发率、妊娠率方面,地诺孕素优于达那唑,孕三烯酮以及米非司酮.安全性方面,与安慰剂对比,地诺孕素阴道出血、头痛的发生率显著增高,骨质丢失情况无差异;地诺孕素阴道出血发生率显著高于GnRHa,但潮热、骨质丢失的发生率低于GnRHa.经济性方面,与GnRHa比较,地诺孕素更具有成本-效益优势;而与COC比较,地诺孕素不具有经济性.结论:地诺孕素治疗子宫内膜异位症具有良好的有效性和安全性;经济性优于GnRHa,但劣于COC.
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编辑人员丨2024/5/11
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UPLC-MS/MS测定代用茶中98种非法添加化学药物
编辑人员丨2024/4/13
目的 建立一种基于UPLC-MS/MS平台同时测定代用茶中98种非法添加化学物质的筛查方法.方法 样品采用50%甲醇溶液超声提取,以ACQUITY? HSS T3(2.1 mm×100 mm,1.8 μm)为色谱柱,以乙腈(含0.1%甲酸)-10mmol/L甲酸铵溶液(含0.1%甲酸)作为流动相,采用ESI离子源正负离子模式进行多反应监测(MRM)扫描,通过保留时间、质谱母离子及碎片离子确定非法添加的化学物质.结果 所测的98种化合物均在相应的线性范围内呈现良好的线性关系(r≥0.995),在1.0,5.0,25.0 ng/ml 3个浓度水平上回收率在60.1%~125.8%之间,检出限为0.0031~0.3432 μg/g,定量限为0.0102~1.1440 μg/g,分析时间为35 min.结论 该方法简捷、高效,能较好地针对代用茶中风险较高的98种非法添加化合物进行筛查,为代用茶的监管提供了有力的技术支撑.
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编辑人员丨2024/4/13