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山东省潍坊市农村居民耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌耐药基因特征及核心基因组特征分析
编辑人员丨6天前
目的:探究山东省潍坊市农村居民耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(CR-ECL)耐药基因特征及核心基因组特征。方法:收集2017年山东省潍坊市农村社区居民粪便标本,使用耐碳青霉烯类肠杆菌显色培养基筛选耐药菌株,通过激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOFMS)分析获得CR-ECL阳性菌株,针对CR-ECL分离株,采用微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性试验获得CR-ECL耐药表型,开展全基因组测序(WGS)和分析、 blaNDM基因周围环境及菌株间系统进化分析。 结果:共获得并检测628份粪便标本,6份为CR-ECL阳性(检出率0.96%),均表现为多重耐药(MDR)表型。6株CR-ECL共有4个MLST分型(ST),均携带多种耐药基因( blaNDM-1、 blaNDM-5等)和毒力基因( acrA、 acrB、 entB、 fepC等),且 blaNDM基因周围遗传环境中均存在移动遗传元件 ISAba125、 TN3-IS3000、 TN3及 IS5。系统发育树显示,核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing,cgMLST)与单核苷酸多态性(SNPs)结果具有一致性,cgMLST结果显示菌株2BC0101B与2BC0251B,2BG0561B与2BI0221B之间等位基因差异分别为2和1,SNPs结果显示上述2对菌同样各自聚成一簇,并发现美国国立生物技术信息中心数据库(National Center for Biotechnology Information,NCBI)中鸡粪样本的菌株居于进化树中心,且本地序列均可追溯到美国人源序列。 结论:山东省潍坊市农村社区居民中已检出多重耐药碳青霉烯类阴沟肠杆菌。
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编辑人员丨6天前
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鸟肠球菌所致社区获得性肺炎1例报道及文献复习
编辑人员丨6天前
鸟肠球菌,经常从鸡粪中分离出来(因此而得名),最初由于Q群抗原的存在而被称为"Q群链球菌"。鸟肠球菌很少从临床微生物送检标本中分离出来,因此对这种细菌引起的感染性疾病的临床特征知之甚少。本文报道从1例以胸痛伴发热为首发症状的58岁男性患者的胸腔积液中分离出鸟肠球菌,并复习了涉及鸟肠球菌的相关文献。
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编辑人员丨6天前
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强还原处理和施用有机肥对设施蔬菜地土壤微生物群落稳定性的影响
编辑人员丨1个月前
强还原土壤灭菌(RSD)方法是修复退化设施蔬菜地土壤的有效措施,但以绿肥为碳源的RSD方法田间应用是否有效还未明确.本研究以退化设施蔬菜地土壤为对象,设置6个处理:未施肥对照(CK)、未施肥+淹水覆膜(FF)、施用鸡粪有机肥(OM)、施用鸡粪有机肥+淹水覆膜(OMR)、田菁绿肥还田(TF)和田菁绿肥还田+淹水覆膜(TR),研究强还原处理和施用有机肥对土壤微生物群落组成、多样性和稳定性的影响.结果表明:与CK相比,OMR和TR处理显著降低了细菌Chaol指数,改变了细菌和真菌的群落结构,同时显著提高了芽孢杆菌、红球菌、梭状芽孢杆菌和青霉菌的相对丰度;TR处理显著降低了尖孢镰刀菌的相对丰度.冗余分析和曼特尔检验发现,土壤铵态氮和可溶性有机碳含量是影响细菌群落变化的关键因子,而土壤pH是影响真菌群落变化的关键因子.内聚力分析表明,OMR和TR处理显著提高了细菌群落稳定性,但2个处理之间的差异不显著;TR处理也显著提高了真菌群落稳定性,且显著高于OMR处理.可见,以绿肥为碳源的RSD是改善土壤健康的有效修复措施.
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编辑人员丨1个月前
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不同施肥措施臭氧浓度升高对不同水稻品种光合特性的影响
编辑人员丨1个月前
近地层臭氧(O3)已严重威胁到作物生产,而施肥可以调节土壤的养分平衡,进而促进作物生长.以两个水稻品种(徽两优898和南粳9108)为研究对象,利用开顶式气室,设置2个O3浓度处理(NF:环境大气为对照;NF40:环境大气+40 nmol/mol O3),每个O3处理下嵌套设置3个肥料处理(Ino:施无机肥处理,270 kg N hm-2 a-1;Red:减施无机肥30%处理,189 kg N hm-2 a-1;Com:有机无机肥配施处理,Red+有机肥鸡粪5000 kg hm-2 a-1),通过测定不同生育期水稻光合参数,探究不同肥料处理下O3对水稻不同生育阶段光合生理的影响.结果表明,NF40对水稻营养生长阶段的饱和光合速率(Asat)没有显著影响,而显著地降低了水稻灌浆期的Asat.基于两个水稻品种的Asat和相对叶绿素含量(SPAD)相对减少量与O3累积剂量关系的斜率,发现杂交稻徽两优898(Asat和SPAD的斜率:-1.55和-0.98)比常规稻南粳9108(Asat和SPAD的斜率:-0.92和0.06)对O3更敏感.此外,基于不同O3处理下水稻的气孔导度(gs)和胞间二氧化碳浓度(Ci),可以看出O3造成南粳9108光合速率降低的主要是非气孔因素,而徽两优898光合的降低是由气孔因素和非气孔因素共同限制.与Ino处理相比,Red处理主要通过降低叶片SPAD进而显著地抑制两种水稻品种的Asat,但Ino处理和Com处理间Asat没有显著差异,说明有机无机肥配施能部分缓解减施无机肥造成水稻光合的降低.O3和肥料处理对两个水稻的所有光合参数都没有显著的交互影响,表明短期有机无机肥配施并不能有效缓解O3对作物造成的负面影响.在O3污染背景下,研究结果可以为通过合理的农田氮肥管理措施减缓O3造成的作物减产提供理论依据.
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编辑人员丨1个月前
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不同废弃物对黑水虻幼虫生长、营养组成及生产性能影响研究
编辑人员丨2024/6/22
本文以黑水虻Hermetia illucens为研究对象,探索不同废弃物对其幼虫生长、营养组成及生产性能的影响.结果表明,黑水虻幼虫可将餐厨垃圾(FW)、厨余垃圾(KW)、蔬菜废弃物(VW)、猪粪(PM)、牛粪(DM)、鸡粪(CM)等转化成优质蛋白质和脂肪.以FW和KW作为基质养殖10 d后,幼虫体长(19.0 mm、17.1 mm)与单头重(171.54mg、136.82 mg)显著高于其它处理.虫粉粗蛋白含量受废弃物种类影响相对较小.不同废弃物处理虫粉均显示出良好氨基酸谱.尽管各处理虫粉总必需氨基酸含量低于鱼粉和豆粕,但FW、KW和CM处理虫粉缬氨酸含量高于鱼粉和豆粕,VW处理虫粉异亮氨酸和缬氨酸含量高于鱼粉和豆粕,PM处理虫粉组氨酸和缬氨酸含量高于鱼粉和豆粕.以FW和KW作为基质养殖10d后,尽管虫粉不饱和脂肪酸和必需脂肪酸比例低于采食PM和DM的处理,但远高于其它处理的虫粉粗脂肪含量(42.13%、37.49%),虫粉不饱和脂肪酸和必需脂肪酸含量也最高;料虫比(6.06、7.90)显著低于其它处理,幼虫转化率(59.40%、52.07%)显著高于其它处理;废弃物减量化率(89.53%、84.46%)仅低于VW处理(94.86%).利用黑水虻幼虫处理FW和KW,幼虫生长性能和营养组成优于其它废弃物处理,且生产性能最好.
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编辑人员丨2024/6/22
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不同粒径生物炭对土壤磷吸附-解吸特性的影响
编辑人员丨2023/12/16
粒径是影响物质吸附性能的一个重要因素.本研究以不同粒径(0.25~1 mm、0.075~0.25 mm、<0.075 mm)油菜秸秆生物炭(SBC)和鸡粪生物炭(MBC)分别与两种土壤(高磷土、低磷土)混合进行室内培养30 d,通过土壤磷等温吸附试验与解吸试验,结合土壤磷吸附相关性质,评价不同粒径生物炭对土壤磷吸附-解吸特性的影响.结果表明:在水体系中,3个粒径的SBC与MBC对磷的吸附能力大小均表现为<0.075 mm(43125、20083 mg·kg-1)>0.075~0.25 mm(37376、13199 mg·kg-1)>0.25~1 mm(27749、12251 mg·kg-1);在土壤体系中,同一种生物炭的3个粒径间土壤磷吸附量差异较小.与无生物炭处理相比,添加SBC提高了 土壤对磷的最大吸附量(Smax),增幅为236.8%~755.7%,并降低了土壤磷解吸率;添加MBC的Smax增幅较SBC低,但提高了 土壤磷解吸率(增幅为7.2%~295.9%).两种生物炭处理均显著增加了 土壤总磷、速效磷和交换性钙、镁含量,其中SBC处理交换性钙、镁含量增幅为64.0%~257.1%,MBC处理增幅为39.1%~205.3%,且土壤交换性钙、镁含量与Smax呈极显著正相关.综上,生物炭粒径对土壤磷吸附性能的影响较小,提高土壤对磷吸附性能的关键因素是生物炭施入后带入的钙、镁;油菜秸秆生物炭对土壤磷吸附能力强,适用于提高富磷土壤对磷的固持能力,减少盈余磷素的流失;而鸡粪生物炭更适于改善低磷水平土壤,提高有效磷含量.
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编辑人员丨2023/12/16
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一株多功能菌株的发掘、鉴定及解磷条件优化
编辑人员丨2023/9/2
从菌糠鸡粪堆肥中筛选高效的解磷菌并优化其解磷能力,发掘多功能微生物资源以实现农业废弃物的有效利用.利用无机磷选择培养基从堆肥中筛选高效解磷菌,结合形态学观察、生理生化试验、分子生物学鉴定,对菌株进行鉴定.利用单因素和响应面试验优化菌株的解磷培养条件;通过解磷、解钾和产吲哚乙酸能力的测定确定菌株的堆肥潜力.筛选得到一株高效解磷菌株Pb1,经鉴定发现菌株隶属于Bacillus smithii strain;培养条件为葡萄糖 15.0 g/L、硫酸铵 3 g/L、磷酸三钙 7.0 g/L、无机盐 0.48 g/L、温度 55.0℃、摇床转速 225 r/min、初始pH 7.0、装液量 60.0 mL/250 mL、接种量 3.0%(V/V)时,菌株Bacillus smithii Pb1 的解磷能力最强;进一步通过响应面优化发现,当磷酸三钙 6.4 g/L、摇床转速 207 r/min、装液量 65.0 mL/250 mL时,菌株Pb1 培养3 d,发酵液中溶磷量可达 534.68 mg/L,是优化前的 1.58 倍.同时,发现B.smithii Pb1 解有机磷、解钾、产吲哚乙酸能力,分别为 238.99 mg/L、81.06 mg/L、23.26 mg/L.菌株B.smithii Pb1 在高温(55℃)条件下展现出了解无机磷、有机磷、解钾和产吲哚乙酸的能力,为菌株B.smithii Pb1 开发成好氧堆肥菌剂奠定基础.
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编辑人员丨2023/9/2
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知母种苗移栽施用基肥的筛选研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:筛选研究知母种苗移栽时适宜的基肥种类和施肥量,为指导知母合理施肥、规范化种植提供科学依据.方法:分别对施用不同基肥种植收获的三年生知母的根茎干重、须根干重、产量和水分、总灰分、酸不溶性灰分、芒果苷含量各项指标进行测定分析,通过比较优选出知母种苗移栽时适宜的基肥种类和施肥量.结果:有机肥组合中施用鸡粪15 000 kg·hm-2可提高知母产量40.18%,芒果苷含量提高16.33%;复合肥组合中施用N∶P∶K(20∶8∶12)750 kg ·hm-2可提高知母产量47.28%,芒果苷含量提高45.95%;有机肥与复合肥混合组合中施用鸡粪7500 kg ·hm-2和复合肥450 kg ·hm-2可提高知母产量45.10%,芒果苷含量提高88.24%.结论:在知母生产中可选用适宜的有机肥混合复合肥施肥方法,提高知母药材的产量和品质.
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编辑人员丨2023/8/6
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纳米氧化锌对堆肥过程中细菌群落演替的影响
编辑人员丨2023/8/6
纳米氧化锌(纳米ZnO)的广泛应用使其进入农业生产领域的可能性增加.鉴于堆肥是处理农业废弃物的主要方式,采用实验室模拟堆置,以鸡粪、秸秆粉为主要原料进行堆肥实验,研究3种浓度的纳米ZnO (0.1,1,10 mg/kg)对堆肥过程中理化指标的影响,并采用高通量测序技术研究堆体中细菌群落结构及组成的变化.结果显示,纳米ZnO不会影响堆肥过程中的温度及腐熟程度,但降低了堆肥过程中的pH;对堆体中细菌Alpha多样性影响不显著,但改变了细菌群落结构及组成.其中,堆肥高温期(5 d)厚壁菌门及拟杆菌门的一些属对纳米ZnO处理响应最明显,0.1 mg/kg浓度纳米ZnO提高了Cohnella的相对丰度,而1、10 mg/kg浓度纳米ZnO增加了魏斯氏菌属、芽孢杆菌属、肠球菌属的相对丰度,降低了一些拟杆菌属的丰度:本研究表明纳米ZnO不仅影响堆肥理化性质,也影响堆肥中一些功能微生物,结果可为评价纳米ZnO的环境效应提供重要依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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空肠弯曲菌喹诺酮类抗生素敏感性检测及其耐药机理分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解我国不同宿主来源空肠弯曲菌对喹诺酮及氟喹诺酮类抗生素的耐药现状,分析耐药菌株的耐药机制.方法 利用96孔琼脂稀释法分析不同来源空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星两种抗生素的最小抑菌浓度(MIC).对102株检测耐药的菌株和27株敏感菌株通过基因测序的方法分析其耐药机制.结果 234株空肠弯曲菌中共筛查到218株(93.16%)萘啶酸耐药菌株,其中鸡粪和鸭粪来源菌株耐药率均为100.00%,腹泻病人粪便来源菌株耐药率是97.96%,食品动物来源菌株耐药率是97.83%,牛粪来源菌株耐药率是77.97%,耐药率差异有统计学意义(P<0.05),鸡粪和鸭粪来源菌株耐药率最高;211株(90.17%)环丙沙星耐药菌株,其中鸡粪和鸭粪来源菌株耐药率均为100%,腹泻病人粪便来源菌株耐药率是91.84%,食品动物来源菌株耐药率是95.65%,牛粪来源菌株耐药率是77.97%,耐药率差异有统计学意义(P<0.05),鸡粪和鸭粪来源菌株耐药率最高.所有的耐药菌株gyrA基因的喹诺酮类耐药决定区(QRDR)都存在Thr-86-Ile点突变.gyrB基因相关区域测序显示不存在有意义突变.结论 我国分离空肠弯曲菌菌株对萘啶酸、环丙沙星耐药严重,gyrA基因QRDR内的Thr-86-Ile突变能引起空肠弯曲菌对喹诺酮类及氟喹诺酮类抗生素高水平耐药.
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编辑人员丨2023/8/6
