目的:了解青海省玉树藏族自治州（简称玉树州）鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）规律成簇的间隔短回文重复（CRISPR）的基因分型，探讨其遗传特征。方法:选取1963 - 2007年分离自玉树州鼠疫自然疫源地的44株代表性鼠疫菌，提取DNA，针对CRISPR的3个位点（YPa、YPb和YPc）设计引物，进行PCR扩增，并对扩增产物进行测序及分析，鉴定CRISPR间区序列（spacer），确定CRISPR基因型和类群。结果:44株鼠疫菌在CRISPR 3个位点上共有23种spacer，YPa位点14种、YPb位点6种、YPc位点3种，其中有2种新spacer，a106和a107。根据spacer阵列形式，44株鼠疫菌被分为15个CRISPR基因型、6个CRISPR类群，6个类群分别为Cb4、Cc3′、Ca7、Ca7′、Ca△5′和Ca35′，其中Ca7为主要流行类群（34株）。结论:玉树州鼠疫菌CRISPR位点具有多种基因型，遗传多态性较高，种群结构复杂。

目的:了解云南松鼠是否携带鼠疫噬菌体，并探讨其流行病学意义。方法:2015 - 2018年，在云南鼠疫疫源地和非疫源地的5个调查点进行鼠疫宿主动物调查。对调查中捕获的松鼠，取其脾、肝、肠道标本，低温保存备用。取肠道标本磷酸盐缓冲液（PBS）增菌液，经0.22 μm滤膜滤过后加入到含有100 μl鼠疫疫苗株（EV76）菌悬液的LB液体培养基中，28 ℃、220 r/min恒温气浴振荡培养18~24 h，采用双层平板法观察噬菌斑的生长情况，电镜下观察鼠疫噬菌体的形态结构；同时取脾、肝、肠道标本进行鼠疫菌特异标志基因caf1检测。结果:共捕获到10只松鼠，其中赤腹松鼠8只，珀氏长吻松鼠2只。共分离出4株鼠疫噬菌体，其中在赤腹松鼠分离出2株，在珀氏长吻松鼠分离出2株；家鼠鼠疫疫源地弥勒县和新平县各分离出1株，野鼠鼠疫疫源地剑川县和洱源县未分离出，非鼠疫疫源地永善县分离出2株。肉眼下观察，家鼠鼠疫疫源地分离出的2株噬菌体产生的噬斑为透明状，生长状态良好；非鼠疫疫源地分离出的2株噬菌体产生的噬斑为半透明状，生长状态欠佳。电镜下观察，噬菌体为较典型的肌尾噬菌体，噬菌体头部直径约40 nm，肌尾约120 nm，肌尾末梢可见尾丝簇。10份松鼠脾、肝、肠道标本caf1检测均为阴性。结论:云南松鼠中携带鼠疫噬菌体的比例较高，虽然鼠疫菌特异标志基因caf1检测均为阴性，但由于鼠疫噬菌体的存在，松鼠有可能成为鼠疫菌传播的一种载体。

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌（以下简称鼠疫菌）引起的一种烈性传染病，发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行，导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势，2000 - 2018年，世界卫生组织（WHO）共收到来自美洲、非洲和亚洲21个国家报告的2万多起鼠疫病例 [1]。我国动物间鼠疫一直较为活跃，且除个别年份外，几乎每年都有人间鼠疫发生。2019年11月，北京市首先出现2例内蒙古自治区输入性肺鼠疫病例，随后内蒙古自治区又报道2例腺鼠疫病例，提示这一甲类传染病仍对人们的生命安全具有极大的潜在威胁 [2,3,4]。链霉素是WHO鼠疫手册 [5]和我国《鼠疫诊疗方案（试行）》（卫办应急发[2011]第18号） [6]中治疗鼠疫的首选药物。但值得注意的是，2021年Dai等 [7]发现国内1株鼠疫菌因编码核糖体蛋白S12的rpsL基因第128 bp位点的碱基发生了突变，从而产生了对链霉素的高度耐药性。为此，本研究应用基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法（简称MGB荧光探针法），选取鼠疫流行较为严重的玉树藏族自治州（以下简称玉树州）鼠疫自然疫源地内分离的鼠疫菌，检测链霉素耐药位点rpsL基因第128 bp位点碱基的突变情况，判断当地菌株的耐药情况，为鼠疫疫情的防控提供参考。

目的:分析贵州省鼠疫疫源地监测结果，掌握当地鼠疫疫情动态，以便制订防控措施。方法:于中国疾病预防控制信息系统鼠疫防治信息管理系统，收集2018 - 2020年贵州省鼠疫监测点的鼠疫监测数据，分析贵州省鼠疫疫情。监测数据中鼠类动物捕获方法为笼夹法、5 m笼夹法和逐日捕鼠法，实验室检测采用细菌培养法和血球凝集法。结果:室内采用笼夹法共捕获鼠类动物2 273只，以褐家鼠为优势种，占47.29%（1 075/2 273）；黄胸鼠和小家鼠为常见种，分别占43.55%（990/2 273）和5.10%（116/2 273）。室外采用5 m笼夹法共捕获鼠类动物1 460只，以斯氏家鼠为优势种，占35.48%（518/1 460）；黄胸鼠和大绒鼠为常见种，分别占16.03%（234/1 460）和8.70%（127/1 460）。共检查鼠类动物5 742只（其中包括笼夹法和5 m笼夹法捕获的3 733只以及逐日捕鼠法捕获的2 009只），检出带蚤鼠类动物1 176只，鼠体染蚤率为20.48%；印鼠客蚤占56.63%（3 020/5 333），为优势蚤种，印鼠客蚤指数为0.53。实验室检测结果均为阴性。结论:贵州省鼠疫疫源地仍然处于静息状态，但不能排除复燃的可能。应进一步加强鼠疫监测工作，提高鼠疫监测质量，做好健康教育宣传，严防人间鼠疫暴发流行。

目的:分析甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地内气象因素对鼠疫流行的影响。方法:收集1973 - 2016年肃北、肃南2个县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫监测资料（来源于甘肃省疾病预防控制中心）和当年及领先1、2、3年（相对于当年作为参照的前1、2、3个年份）的气象因素（年均降雨量、气温、相对湿度）资料（来源于中国气象数据共享服务网）。采用R2.3.2软件，以年鼠疫检菌阳性率为因变量，气象因素为自变量建立时间序列半参数广义相加模型（generalized additive model，GAM），采用非线性效应关系定量研究气象因素对鼠疫的影响。结果:2006 - 2016年与1974 - 1983年相比，年均气温、相对湿度、降雨量的平均值肃北县分别上升了0.99 ℃、3.55%RH、12.16 mm；肃南县分别上升了1.00 ℃、2.01%RH、14.60 mm。1973 - 2016年共发生11起人间鼠疫，发病12例，死亡7例。肃北县鼠疫疫源地内领先3年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加0.40%；领先2年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.66%。肃南县鼠疫疫源地内领先1年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加1.32%；领先3年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.96%。另外，肃北、肃南县领先2年年均气温在一定范围内每升高1.00 ℃，动物鼠疫发生分别增加73.17%、70.18%。结论:甘肃省肃北、肃南县鼠疫的发生流行与气象因素关系密切，一定范围内的年均气温上升对鼠疫的流行不仅有明显的促进作用，而且存在滞后效应。另外，同一疫源地内不同类型气候对动物鼠疫流行的影响存在一定差异。

目的:分析青海省鼠疫疫情监测结果，掌握青海省鼠疫流行态势，为今后的鼠疫防控工作提供科学依据。方法:收集2011-2020年青海省人间鼠疫疫情资料（来自青海省地方病预防控制所人间病例数据库）和动物间鼠疫疫情资料（来自青海省鼠疫监测数据和鼠疫疫源地调查数据），采用描述性流行病学方法进行分析，包括人间鼠疫疫情，动物间鼠疫疫情地区分布，宿主动物、病原学和血清学监测结果等。结果:2011-2020年，青海省发生人间鼠疫疫情1起，因剥食旱獭时不慎划伤右手中指感染，自死者的心、肝、肺、淋巴结穿刺液、气管分泌物和咽拭子样本中均分离出鼠疫耶尔森菌。共发生动物间鼠疫疫情16起，流行地区分布在海西州、玉树州和海北州，其中海西州动物间鼠疫流行最多，10年间共发生13起。宿主动物监测显示，主要宿主动物为喜马拉雅旱獭，其平均密度为0.07匹/hm 2。病原学监测显示，共分离出鼠疫耶尔森菌31株，其中海西州分离出27株；分离出鼠疫耶尔森菌的宿主动物以喜马拉雅旱獭为主，占总数的77.42%（24/31）。血清学监测显示，共检出鼠疫F1抗体阳性血清66份，其中犬阳性血清最多，为43份；喜马拉雅旱獭次之，为20份。 结论:2011-2020年青海省动物间鼠疫连年不断，局部地区呈活跃态势，鼠疫防控总体形势严峻。

目的:调查确定云南省玉龙县鼠疫自然疫源地的流行范围，并评估其流行风险，为鼠疫监测及防控工作提供依据。方法:2017年，在玉龙县8个乡镇，每个乡镇根据地理景观、海拔、人口、面积等各选取2 ~ 3个自然村作为调查样点，10 - 11月采用夹（笼）夜法捕获小型兽类宿主动物及其寄生蚤，采集宿主动物脏器等分离鼠疫菌，并用胶体金试纸条检测鼠疫F1抗原和抗体，自毙小型兽类标本同时进行反向间接血凝试验（RIHA）检测鼠疫特异性抗原；采集犬、猫、鼠等指示动物血清使用间接血凝试验（IHA）进行鼠疫F1抗体检测。结果:共获包括自毙小型兽类在内的宿主动物1 019只，隶属4目6科12属22种。其中工具捕获小型兽类1 016只，室外996只，室外捕获率为25.28%（996/3 940），其构成为齐氏姬鼠占30.32%（302/996）、斯氏家鼠占22.09%（220/996）、大绒鼠占17.37%（173/996）、灰麝鼩占12.35%（123/996），均是调查区小型兽类的优势种；社鼠占8.13%（81/996）、大足鼠占4.02%（40/996）、褐家鼠占1.81%（18/996），均为常见种。居民区室内共捕获小型兽类9种20只，捕获率为1.11%（20/1 800）。其中褐家鼠占30.00%（6/20）、大足鼠占25.00%（5/20）、小家鼠占10.00%（2/20），均为居民区优势鼠种。8种18只小型兽类染带寄生蚤67匹，隶属3科5属5种，总染蚤率为1.77%（18/1 019），总蚤指数为0.070。居民区室内获寄生蚤49匹，3种4只小型兽类染带寄生蚤，染蚤率为19.05%（4/21），蚤指数为2.333。其中缓慢细蚤染蚤率最高，为9.52%（2/21），蚤指数为0.571；猫栉首蚤指名亚种蚤指数最高，为1.571，染蚤率为4.76%（1/21），二者为居民区小型兽类体表主要寄生蚤种。室外5种14只小型兽类染带寄生蚤18匹，染蚤率为1.40%（14/998），蚤指数为0.018。其中缓慢细蚤染蚤率最高，为0.50%（5/998），蚤指数为0.005；特新蚤指名亚种染蚤率次之，为0.40%（4/998），蚤指数为0.004；方叶栉眼蚤的蚤指数最高，为0.007，染蚤率排第三，为0.30%（3/998）；棕形额蚤指名亚种的染蚤率和蚤指数均最低，分别为0.20%（2/998）和0.002。方叶栉眼蚤、缓慢细蚤和特新蚤指名亚种为室外小型兽类体表主要寄生蚤种。共采集指示动物血清419份，其中犬血清402份，IHA检测结果阳性1份，阳性率为0.25%（1/402）；猫、鼠血清共17份，IHA检测结果均为阴性。小型兽类脏器分离培养鼠疫菌、胶体金试纸条检测均为阴性；自毙小型兽类RIHA检测阴性。结论:玉龙县鼠疫自然疫源地新增一个鼠疫指示动物阳性点，应加强该区域的鼠疫疫情监测和防控。

目的:探讨青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫菌规律间隔成簇短回文重复序列（CRISPR）的基因型及其地区分布。方法:选取青海省地方病预防控制所保存的1954-2011年在不同地区宿主、媒介体内分离的1 004株鼠疫菌作为实验对象，采用传统的苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。分别对3个CRISPR位点（YPa、YPb和YPc）进行PCR扩增、测序，将所测得CRISPR序列与文献最新报道的CRISPRDictionary数据库进行检索比对，以鉴定间区序列（spacer）；对CRISPR各位点新发现的spacer，在美国国家生物技术信息中心（NCBI）数据库进行Blast序列比对，推测基因序列来源。根据CRISPR spacer阵列的多态性对青藏高原鼠疫菌进行基因分型。结果:1 004株鼠疫菌共发现53种spacer，其中新发现6种，分别为a105、a106、a107、b51、b52、c14；1 004株鼠疫菌被分成44个不同的CRISPR基因型，10大类群，新发现基因型15种，喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR基因型以G26-a1′、G7、G22、G24-a1′、G22-a1′、G9、G26-a1′a60型为主，青海田鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR基因型为G37-a6′型。结论:青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR基因型具有高度多样性，且地区分布特征显著。

目的:了解我国是否存在耐药及耐消毒剂鼠疫菌株，为鼠疫临床治疗提供准确信息。方法:收集我国1943 - 2016年分离自10处鼠疫自然疫源地的2 753株鼠疫菌，根据美国国立生物信息中心（NCBI）公布的耐氨基糖苷类链霉素基因strA、strB，耐β-内酰胺类抗菌药物基因TEM、SHV、CTX-M，耐磺胺类药物基因sul1、sul2、sul3，耐消毒剂基因qacE△1-sul1的序列信息，分别针对每个基因设计1对引物。提取2 753株鼠疫菌基因组DNA，采用PCR法对所有DNA样本进行上述9个目的基因扩增。结果:PCR检测阴性对照和阳性对照成立，2 753株鼠疫菌DNA样本均未见耐氨基糖苷类链霉素基因strA、strB，耐β-内酰胺类抗菌药物基因TEM、SHV、CTX-M，耐磺胺类药物基因sul1、sul2、sul3及耐消毒剂基因qacE△1-sul1对应的目的条带。结论:我国鼠疫菌尚未检测到上述耐药及耐消毒剂基因，但鼠疫菌耐药性的监测工作仍需持续开展。

目的:调查云南省3个县（市）人群和犬猫弓形虫血清流行病学现状及其影响因素，评估犬猫将弓形虫传播给人类并致病及流行的风险。方法:选择云南省弥勒市、芒市和梁河县3个家鼠鼠疫疫源地所在县（市）作为调查地区，采集16个自然村的人群及犬猫血样，采用间接酶联免疫吸附试验检测血清弓形虫IgG抗体，并对其影响因素进行logistic回归分析。结果:共检测368份人血清、307份犬血清、12份猫血清，弓形虫IgG抗体阳性率分别为54.62%（201/368）、90.88%（279/307）、91.67%（11/12）。logistic回归分析显示，芒市和梁河县人群弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）分别是弥勒市的8.20倍（ AOR = 8.20，95% CI：4.38 ~ 15.36）、2.22倍（ AOR = 2.22，95% CI：1.24 ~ 3.97）；30 ～ < 40岁年龄组人群弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）比< 30岁年龄组减少57%（ AOR = 0.43，95% CI：0.19 ~ 0.98，均 P < 0.10）。梁河县犬弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）比弥勒市减少89%（ AOR = 0.11，95% CI：0.02 ～ 0.47）；2岁及以上犬弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）是2岁以下犬的2.05倍（ AOR = 2.05，95% CI：0.91 ～ 4.64，均 P < 0.10）。 结论:云南省3个家鼠鼠疫疫源地所在县（市）人群和犬猫血清弓形虫IgG抗体阳性率均较高，人群和犬弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）与地区和年龄有关，犬猫将弓形虫传播给人类及其他动物的风险较大，应加强重点区域监测，开展健康教育，并采取相应卫生措施。