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广泛耐药肺炎克雷伯菌耐药表型分析及耐药机制研究
编辑人员丨4天前
目的:研究广泛耐药肺炎克雷伯菌(XDRKP)耐药表型特点及相关耐药机制。方法:收集山西白求恩医院2018年1月至2020年12月内分离的3 201株肺炎克雷伯菌并根据已有药敏结果筛选116株广泛耐药肺炎克雷伯菌纳入研究。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)及梅里埃VITEK-compact 2进行菌株鉴定及药敏试验,药敏结果K-B法或微量肉汤稀释法复核。改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合乙二胺四乙酸协同碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测XDRKP碳青霉烯酶表型,并与碳青霉烯酶基因扩增结果比对。聚合酶链反应(PCR)扩增耐药基因:碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaNDM、blaVIM、blaIMP、blaOXA);氨基糖苷耐药基因:16S rRNA甲基化酶基因(rmtA、rmtC、rmtD、rmtG、rmtH、armA、npmA、rmtB、rmtE、rmtF),氨基聚糖苷修饰酶基因变体[aac(6′)-Ib-cr];喹诺酮耐药基因:DNA解旋酶保护蛋白qnr家族基因(qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS),外排泵蛋白基因(oqxAB、qepA),氨基聚糖苷修饰酶基因变体[aac(6′)-Ib-cr];替加环素耐药Tet蛋白基因[外排泵蛋白基因:tet(A)和tet(L)],核糖体保护蛋白基因[tet(M)],替加环素修饰酶基因[tet(X)]。对照分析各XDRKP耐药表型与相应耐药基因携带情况间的关系。结果:共收集到XDRKP 116株。头孢菌素类及喹诺酮类抗菌药物耐药率100%(116/116),碳青霉烯类抗菌药物耐药率99.14%(115/116),氨基糖苷类抗菌药物庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星耐药率分别为95.69%(111/116)、94.83%(110/116)、88.79%(103/116),磺胺类抗菌药物耐药(44/116)与替加环素耐药(3/116)检出率较低。mCIM联合eCIM试验结果与碳青霉烯酶基因扩增结果一致率95.65%(110/115)。各耐药基因阳性率:blaKPC 90.52%(105/116),blaNDM 10.34%(12/116),rmtB 81.90%(95/116),armA 2.59%(3/116),oxqAB 65.52%(76/116),qnrB 6.03%(7/116)、qnrS 12.93%(15/116)、aac(6′)-Ib-cr 7.76%(9/116),tet(A)21.55%(25/116)。其余各耐药基因未检出。匹配分析发现,共有65株XDRKP耐药表型与耐药基因型不匹配,即抗菌药物耐药表型不能用携带相应耐药基因来解释。结论:XDRKP中各类耐药基因的广泛分布和某些基因[如aac(6′)-Ib-cr、oqxAB]的多重耐药作用是广泛耐药产生的潜在原因。不同菌株针对同一类抗菌药物可能携带一种或多种耐药基因。此外,部分菌株耐药表型与耐药基因不匹配,提示耐药基因的表达调控及存在其他耐药机制也与XDR的产生有关。
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编辑人员丨4天前
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2017-2021年江苏省临床分离耶尔森菌分子特征分析
编辑人员丨4天前
目的:了解江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌的分布特点及分子特征。方法:2017-2021年,在小肠结肠炎耶尔森菌国家级主动监测点江苏省徐州市铜山区和盐城市东台市,采集腹泻患者粪便标本,进行耶尔森菌菌株分离;同时,收集全省哨点医院疑似耶尔森菌菌株。提取分离菌株DNA进行全基因组重测序,并上传至EnteroBase数据库进行耶尔森菌种型鉴定,原始数据经清洁和处理后进行16S核糖体RNA(16S rRNA)基因多态性分析;通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)和病原菌毒力因子数据库(VFDB)扫描5种毒力基因(ail、ystA、ystB、yadA、virF)携带情况,同时构建K-mer树并进行基因组特征分析。结果:2017-2021年,共采集腹泻患者粪便标本2 058份,经分离鉴定,得到57株耶尔森菌;同时,通过哨点医院收集到2株耶尔森菌。经EnteroBase数据库比对,51株菌为小肠结肠炎耶尔森菌,4株菌为 Yersinia proxima,阿利克西奇耶尔森菌、马赛耶尔森菌、中间耶尔森菌及 Yersinia canariae各1株。16S rRNA基因多态性分析显示,全部菌株被聚类为3个大组,可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。51株小肠结肠炎耶尔森菌中,49株为毒力基因Ⅲ型(ail-、ystA-、ystB+、yadA-、virF-),2株为毒力基因Ⅱ型(ail+、ystA+、ystB-、yadA-、 virF-);8株其他耶尔森菌均为毒力基因Ⅳ型(ail-、ystA-、ystB-、yadA-、virF-)。K-mer分析可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌,JS-XZ-2020001菌株与其他小肠结肠炎耶尔森菌距离较远,血清型为O8的小肠结肠炎耶尔森菌分布较集中。 结论:江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌以小肠结肠炎耶尔森菌为主,其他耶尔森菌少量并存,同时发现了 Yersinia proxima和 Yersinia canariae两个耶尔森菌新种型。小肠结肠炎耶尔森菌的毒力基因携带以Ⅲ型为主。16S rRNA基因多态性分析和K-mer分析均可有效区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。
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编辑人员丨4天前
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鼻腔微生物多样性对慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者手术预后的影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者鼻腔微生物多样性,以及术后复发者鼻腔微生物组学特征和炎性细胞及因子特点,以了解微生物组学因素对CRSwNP手术预后的影响。方法:2017年12月至2018年12月期间,招募于四川大学华西医院耳鼻咽喉科接受手术治疗的77例CRSwNP患者,其中男34例,女43例,年龄29~76岁。收集患者的鼻腔分泌物和鼻息肉组织。于分泌物中提取鼻腔微生物DNA,基于16S核糖体RNA(16S rRNA)进行高通量测序,检测细菌群落组成。使用Luminex分析鼻息肉组织中白细胞介素(IL)-5、IL-8、IL-17A、IL-17E、IL-18、IL-27和干扰素γ(IFN-γ)等细胞因子。计数外周血和鼻息肉组织中嗜酸粒细胞和中性粒细胞含量。术后随访1年,记录鼻息肉的复发情况,分析鼻息肉复发与炎性因子、炎性细胞计数及鼻腔微生物多样性特征的相关性。对二分类变量采用卡方检验,对连续变量采用Mann-Whitney U检验,两组之间平均相对丰度的差异比较采用Wilcoxon秩和检验。结果:随访1年时复发患者12例,其中男5例,女7例。复发组与未复发组患者在年龄、性别、哮喘、变应性鼻炎、湿疹等方面的差异无统计学意义。复发组的鼻部症状总分[42.3(30.2,67.1), M( Q1, Q3),后同]明显高于未复发组[37.8(29.4,50.3)], Z=-4.930, P<0.001。鼻息肉组织中,复发组患者嗜酸粒细胞[40.83(22.33,102.00)个/HP,HP为高倍视野,后同]和中性粒细胞[30.83(20.33,56.44)个/HP]数量显著高于未复发组[13.72(13.50,48.33)个/HP和18.50(12.00,26.08)个/HP, Z值分别为-6.997、-8.243, P值均<0.001]。复发组IFN-γ、IL-17A、IL-17E、IL-18的表达量明显高于未复发组,但阳性率差异无统计学意义。属水平上,未复发组患者鼻腔棒状杆菌属的平均相对丰度为(11.90±20.31)%,高于复发组的(0.15±0.20)%,但校正后差异无统计学意义(FDR P=0.638)。未复发组葡萄球菌属平均相对丰度为(8.17±27.70)%,低于复发组的(8.99±15.89)%,但校正后差异无统计学意义(FDR P=0.638)。 结论:CRSwNP患者中性粒细胞介导的炎性反应与鼻息肉复发密切相关。鼻内镜术后鼻息肉的复发可能与保护性微生物丰度的减少和致病微生物数量的增加有关。
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编辑人员丨4天前
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肝细胞癌病人线粒体DNA拷贝数与临床病理特征的关系及对预后的影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨肝细胞癌病人线粒体DNA拷贝数与临床病理特征的关系及对预后的影响。方法:采用回顾性队列研究方法。收集2011年3—6月海军军医大学附属东方肝胆外科医院收治的71例行手术切除肝细胞癌病人的临床病理资料;男61例,女10例;中位年龄为55岁,年龄范围为26~80岁。所有病人检测肝癌组织和癌旁组织线粒体DNA拷贝数。观察指标:(1)肝细胞癌病人肝癌组织和癌旁组织线粒体DNA拷贝数及其与临床病理特征的关系。(2)随访情况。(3)肝细胞癌病人预后影响因素分析。采用门诊或电话方式进行随访,了解病人术后生存情况。随访时间截至2019年9月。正态分布的计量资料以 x±s表示,组间比较采用独立样本 t检验或配对样本 t检验。偏态分布的计量资料以 M(范围)表示。计数资料以绝对数表示,组间比较采用 χ2检验或Fisher确切概率法。单因素和多因素分析均采用COX回归模型,单因素分析中 P<0.10的指标纳入多因素分析。采用Kaplan-Meier法计算生存率和绘制生存曲线,采用Log-rank检验进行生存分析。 结果:(1)肝细胞癌病人肝癌组织和癌旁组织线粒体DNA拷贝数及其与临床病理特征的关系:71例肝细胞癌病人肝癌组织线粒体DNA拷贝数为0.85±0.08,癌旁组织线粒体DNA拷贝数为1.16±0.08,两者比较,差异有统计学意义( t=2.96, P<0.05)。71例病人中,48例为线粒体DNA低拷贝数,23例为线粒体DNA高拷贝数。线粒体DNA低拷贝数和高拷贝数病人肿瘤包膜(完整、不完整)和微血管侵犯(有、无)分别为20、28例,21、27例和16、7例,4、19例,上述指标比较,差异均有统计学意义( χ2 =4.84,4.74, P<0.05)。(2)随访情况:71例病人均获得随访,随访时间为2.1~85.3个月,中位随访时间为47.8个月。71例病人1、3、5年总体生存率分别为87.3%、64.7%、37.4%。48例线粒体DNA低拷贝数病人1、3、5年总体生存率分别为81.2%、50.0%、29.2%;23例线粒体DNA高拷贝数病人1、3、5年总体生存率分别为95.7%、86.5%、54.7%,两者生存情况比较,差异有统计学意义( χ2 =5.86, P<0.05)。(3)肝细胞癌病人预后影响因素分析:单因素分析结果显示肿瘤数目、门静脉癌栓、微血管侵犯、巴塞罗那临床肝癌分期、线粒体DNA拷贝数是影响肝细胞癌病人预后的相关因素(风险比=2.211,2.911,3.899,3.587,0.440,95%可信区间为1.024~4.777,1.485~5.704,2.115~7.186,1.615~7.966,0.223~0.871, P<0.05)。多因素分析结果显示:微血管侵犯和线粒体DNA拷贝数是肝细胞癌病人预后的独立影响因素(风险比=2.754,0.437,95%可信区间为1.374~5.521,0.205~0.932, P<0.05)。 结论:肝细胞癌病人线粒体DNA拷贝数与肿瘤包膜、微血管侵犯有关;微血管侵犯和线粒体DNA拷贝数是肝细胞癌病人预后的独立影响因素。
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编辑人员丨4天前
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食管癌患者与健康对照者的食管菌群差异分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨食管癌患者食管微生态状况,并比较其与健康人群食管菌群的差异。方法:选择2018年7月至2019年7月在十堰市太和医院就诊的82例食管癌患者和同期年龄、性别相匹配的20名健康对照者,30份食管癌病理组织根据分化程度分为低分化(8份)、中分化(9份)和高分化(13份)。采集食管癌患者和健康对照者的食管组织样本,提取样本DNA,对细菌16S rRNA V4区域行PCR扩增。运用Illumina HiSeq 4000测序平台测序,行α多样性分析和主坐标分析(PCoA),采用线性判别分析效应量(LEfSe)的线性判别分析(LDA)值筛选差异物种,ROC曲线验证随机森林模型,BugBase数据库预测食管细菌表型。采用非参数Kruskal-Wallis H检验和Wilcoxon秩和检验进行统计学分析。 结果:食管癌患者Chao1指数高于健康对照者[362.51(284.29,646.13)比284.83(244.31,344.74)],差异有统计学意义( Z=-2.857, P=0.004)。PCoA显示食管癌患者和健康对照者样本间距离较近,两者微生态菌群构成差异无统计学意义( P>0.05)。食管癌患者食管蓝藻菌门和疣微菌门的丰度均高于健康对照者(0.2%比0.1%、0.4%比0),而食管变形菌门、 SR1菌门和 TM7菌门的丰度均低于健康对照者(21.9%比34.2%、0.1%比0.2%和0.2%比0.5%),差异均有统计学意义( Q=0.090、0.077、0.010、0.026、0.001, P均<0.05)。低分化,中分化和高分化食管癌患者食管梭状芽孢杆菌纲、梭状芽孢杆菌目、巴斯德氏菌目、巴斯德氏菌科、埃肯菌属、放线杆菌属和嗜血杆菌属的相对丰度分别为28.3%、24.2%和17.0%,28.3%、24.2%和17.0%,3.2%、0.3%和5.0%,3.2%、0.3%和5.0%,0、1.5%和0.1%,0.5%、0和0.7%,1.3%、0.2%和3.9%,比较差异均有统计学意义( Q=0.579、0.557、0.390、0.711、0.768、0.768、0.768, P均<0.05)。LEfSe分析显示,食管癌患者梭杆菌目、瘤胃球菌属、气味杆菌属和S24_7科的丰度均高于健康对照者(21.5%比11.7%、0.5%比0.1%、0.1%比0、0比0),差异均有统计学意义(LDA值=2.591、2.379、2.790、2.927, P均<0.05)。ROC曲线证实随机森林模型可靠,AUC值为0.92。BugBase数据库预测显示,食管癌患者生物膜形成、致病潜力、移动元件、氧需求(厌氧菌、需氧菌、兼性菌)和氧化胁迫耐受食管细菌表型较健康对照者更丰富( P均<0.05)。 结论:食管癌患者的食管菌群发生改变,梭杆菌目、瘤胃球菌属、气味杆菌属和S24_7科可作为潜在的菌群标志物。
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编辑人员丨4天前
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基于16S rRNA基因测序的寻常型银屑病患者肠道菌群差异研究
编辑人员丨4天前
目的:研究成年寻常型银屑病患者和健康人群之间肠道微生物的差异。方法:采集2017年9月至2018年2月于中国医学科学院皮肤病医院确诊的22例寻常型银屑病患者和23例健康对照者粪便样本,提取肠道菌群总DNA扩增,并采用二代16S rRNA基因靶向测序技术测序,分析菌群多样性及菌群分布。对照Silva数据库进行物种注释及分类,采用秩和检验分析各层级样本物种差异;采用QIIME软件(Version 1.9.1)计算OTU数目及α多样性主要指数(Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数), t检验分析指数差异;PCoA分析反映样本β多样性差异,置换多元方差分析两组群落组成结构差异;秩和检验及LEfSe分析评估物种差异。 结果:银屑病组OTU数目(147.55 ± 57.07)与健康对照组(148.96 ± 50.45)比较,差异无统计学意义( t = 0.088, P = 0.930)。银屑病组Shannon指数(4.08 ± 0.80)、Chao1指数(169.52 ± 63.17)、Simpson指数(0.87 ± 0.07)与健康对照组(分别为4.11 ± 0.94、175.36 ± 53.59、0.86 ± 0.90)比较,差异均无统计学意义( t = 0.12、0.34、0.27,均 P > 0.05)。PCoA分析银屑病组与健康对照组的第一主成分差异为49.8%,第二主成分差异为15.62%,置换多元方差分析显示两组间β多样性差异有统计学意义( P = 0.011)。银屑病组与健康对照组有差异的菌群包括在银屑病组中显著升高的厚壁菌门、梭菌纲、梭菌目,丹毒丝菌目、丹毒丝菌科,健康对照组中显著升高的艾普西隆变形杆菌纲、弯曲杆菌目、弯曲杆菌科、弯曲杆菌属,拟杆菌目、拟杆菌科。 结论:寻常型银屑病患者与健康人的肠道菌群存在一定差异,肠道菌群有可能成为寻常型银屑病的潜在生物标志物。
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编辑人员丨4天前
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建立一种实时荧光定量PCR方法检测与鉴定人苍白杆菌及布鲁氏菌
编辑人员丨4天前
目的:建立一种实时荧光定量PCR方法检测与鉴定人苍白杆菌( Ochrobactrum anthropi, O.anthropi)及布鲁氏菌,并应用于临床样本的检测。 方法:从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)网站GenBank数据库下载苍白杆菌属和与苍白杆菌属相邻近属种菌株的16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)基因核苷酸序列。使用MEGA 5.1软件构建系统发育树;应用DNAstar(V7.1)软件设计引物及探针,建立检测与鉴定 O.anthropi的实时荧光定量PCR方法,验证方法的灵敏性和特异性,并应用该方法检测牧区临床患者血液样本中 O.anthropi感染情况。 结果:共从NCBI网站下载苍白杆菌属17个种37株、与苍白杆菌属相邻近的布鲁氏菌属8个种15株菌株的16S rRNA基因核苷酸序列。16S rRNA基因系统发育树分析发现, O.anthropi与苍白杆菌属 O.cytisi、 O.lupini、 O.tritici种菌株具有高度同源性(相似性均为100.0%),与布鲁氏菌属8个种菌株的相似性为99.1%,与其他13个种苍白杆菌属菌株的相似性为84.5% ~ 98.6%。成功建立了实时荧光定量PCR检测方法(巢氏PCR),检测 O.anthropi标准菌株DNA,单一实时荧光定量PCR最低检测限为3.67 fg核酸DNA,循环阈值(cycle threshold,CT)= 36.40,巢式PCR检测CT = 14.67;且未检出布鲁氏菌属等非苍白杆菌属菌株。对126份临床患者血液样本进行检测, O.anthropi的检出率为17.46%(22/126)。 结论:建立了实时荧光定量PCR方法检测 O.anthropi,该方法具有较高的灵敏性和较强的特异性,可用于 O.anthropi与布鲁氏菌的鉴定及临床样本检测。
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编辑人员丨4天前
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16S rRNA序列测定结肠腺瘤性息肉与肠道菌群的相关性分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨作为结肠癌癌前病变的结肠腺瘤性息肉(CAP)中肠道菌群的改变特征。方法:随机收集2017年11月至2018年4月在昆明医科大学第一附属医院进行结肠镜检查的结肠腺瘤性息肉患者(CAP组)30例和无腺瘤息肉的健康个体(HC组)30名。通过内镜下电凝电切治疗,收集CAP患者的腺瘤组织和健康志愿者(HC)的肠黏膜组织,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行扩增,通过Illumina MiSeq平台进行序列测定,实验结果使用秩和检验( Wilcoxon检验)进行比较法分析。 结果:CAP患者的腺瘤组织中肠道菌群α多样性高于健康肠黏膜组织(Chao指数、Ace指数 P<0.01)。门水平分析中,CAP组中拟杆菌门(FC=0.38)的丰度显著降低( P<0.01);属水平分析中,拟杆菌属(FC=0.32)、埃希菌属(FC=0.57)、瘤胃球菌属(FC=0.42)、 Blautia(FC=0.27)、 Dorea(FC=0.57)在CAP组中丰度降低( P<0.05);假单胞菌属(FC=2.43)、乳球菌(FC=2.84)、土芽孢杆菌属(FC=2.07)和不动杆菌属(FC=2.36)丰度升高( P<0.05)。 结论:与HC肠黏膜组织相比,CAP患者腺瘤组织中菌群的丰度和多样性存在显著的差异,表明腺瘤性息肉患者黏膜中菌群存在失衡现象。这种肠道微环境的失衡,对研究结肠腺瘤性息肉的发生和发展具有重要意义。
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编辑人员丨4天前
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结缔组织病合并长节段横贯性脊髓炎患者40例临床特征分析
编辑人员丨4天前
目的:分析探讨结缔组织病(CTD)合并长节段横贯性脊髓炎(LETM)患者的临床特征与预后。方法:选2006年1月至2016年12月北京协和医院神经内科和风湿免疫科住院的40例合并LETM的CTD患者,根据是否出现视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD),将患者分为CTD-LETM-NMOSD者和CTD-LETM-非NMOSD者,回顾性分析患者一般资料、临床特征、自身抗体、影像学表现、治疗、预后和转归,采用Kaplan-Meier曲线分析疾病复发率。结果:40例患者中,系统性红斑狼疮24例,原发性干燥综合征16例。CTD-LETM-NMOSD者28例(70.0%),CTD-LETM-非NMOSD者12例(30.0%)。CTD-LETM-NMOSD者抗SSA抗体阳性率(75.0% 比 5/12, P<0.05)、抗水通道蛋白4(AQP4)抗体(AQP4-IgG)阳性率(89.3% 比 0, P<0.05)显著高于CTD-LETM-非NMOSD者。两者间CTD类型、CTD病程、脊髓炎首发比例、抗Sm抗体、抗U 1核糖核蛋白抗体、抗双链DNA抗体、抗SSB抗体、抗核糖体核蛋白P抗体、抗磷脂抗体、脑脊液特异性寡克隆区带及影像学特点均差异无统计学意义。Kaplan-Meier曲线显示,CTD-LETM-NMOSD者疾病复发率高于CTD-LETM-非NMOSD者[75.0%(21/28)比 3/12, P<0.01]。 结论:CTD合并LETM可分为两个亚型,即NMOSD和非NMOSD,前者抗SSA抗体、抗AQP4抗体阳性率及复发率均高于后者,提示其发病机制可能存在差异,前者可能是CTD与NMOSD共病,而后者可能是CTD继发神经系统损害。
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编辑人员丨4天前
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老年与中青年食管鳞癌患者食管菌群的宏基因组学对比研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨老年与中青年食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)患者食管组织的菌群特征及差异,以助于研究老年ESCC患者潜在的生物标志物。方法:采用回顾性研究,选取2018年7月至2019年7月在湖北省十堰市太和医院确诊的72例ESCC患者,其中老年组49例(≥60岁,男性40例,女性9例),中青年组23例(<60岁,男性21例,女性2例),以同期消化内镜中心20名胃镜检查无异常的健康体检者作为对照组(年龄范围35~78岁,中位年龄57岁,男性16名,女性4名)。收集ESCC患者病变食管组织和健康对照组中段食管组织、提取基因组DNA,对细菌16SrRNA基因序列V4高变区扩增,采用Illumina HiSeq测序技术,对比分析老年和中青年ESCC患者菌群特点。采用QIIME和Rstudio软件分析序列数据,统计学方法采用非参数Kruskal-Wallis检验或Wilcoxon秩和检验。结果:两组患者菌群Shannon指数[5.17(4.53,5.95)比4.79(3.74,5.97)]、Simpson指数[0.94(0.91,0.96)比0.92(0.83,0.96)]和Chao1 [343.55(259.76,570.59)比329.16(268.88,648.00)]指数相似,差异无统计学意义( Z=-0.791、-1.057、-0.380,均 P>0.05);Beta多样性老年组与中青年组亦无明显差异(PC1=19.14%、PC2=6.95%, PPC1=0.67、 PPC2=0.42)。在门水平,中青年组丰度前五的菌门依次为厚壁菌门( Firmicutes)、拟杆菌门( Bacteroidetes)、变形菌门( Proteobacteria)、放线菌门( Actinobacteria)和梭杆菌门( Fusobacteria),老年组患者丰度最高的五个门分别是厚壁菌门( Firmicutes)、拟杆菌门( Bacteroidetes)、变形菌门( Proteobacteria)、梭杆菌门( Fusobacteria)和放线菌门( Actinobacteria);两组差异显著的是梭杆菌门( Fusobacteria)( Q=0.596, P<0.05)。在属水平,中青年组丰度前五的菌属依次为:普雷沃菌属( Prevotella)、拟杆菌属( Bacteroides)、链球菌属( Streptococcus)、月形单胞菌属( Selenomonas)和韦荣球菌属( Veillonella);而老年组丰度前五的分别是普雷沃菌属( Prevotella)、拟杆菌属( Bacteroides)、链球菌属( Streptococcus)、月形单胞菌属( Selenomonas)和嗜血杆菌属( Haemophilus),两组有显著差异的为梭杆菌属( Fusobacterium)( Q=0.938, P<0.05)。基于未观测状态重建的群落系统发育研究(PICRUSt)功能预测,老年组患者氨酰tRNA生物合成( Aminoacyl.tRNA.biosynthesis)、核苷酸切除修复( Nucleotide.excision.repair)、核糖核酸聚合酶( RNA.polymerase)、核糖体( Ribosome)、克拉维酸生物合成( Clavulanic.acid.biosynthesis)、光合作用( Photosynthesis)和光合作用蛋白( Photosynthesis.proteins)丰度较中青年组降低(均 Q=0.734, P<0.05)。 结论:老年ESCC患者食管菌群与中青年患者的Alpha多样性和Beta多样性无明显差异,但老年患者梭菌属菌群丰度增高。
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编辑人员丨4天前
