目的:了解江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌的分布特点及分子特征。方法:2017-2021年，在小肠结肠炎耶尔森菌国家级主动监测点江苏省徐州市铜山区和盐城市东台市，采集腹泻患者粪便标本，进行耶尔森菌菌株分离；同时，收集全省哨点医院疑似耶尔森菌菌株。提取分离菌株DNA进行全基因组重测序，并上传至EnteroBase数据库进行耶尔森菌种型鉴定，原始数据经清洁和处理后进行16S核糖体RNA（16S rRNA）基因多态性分析；通过美国国家生物技术信息中心（NCBI）和病原菌毒力因子数据库（VFDB）扫描5种毒力基因（ail、ystA、ystB、yadA、virF）携带情况，同时构建K-mer树并进行基因组特征分析。结果:2017-2021年，共采集腹泻患者粪便标本2 058份，经分离鉴定，得到57株耶尔森菌；同时，通过哨点医院收集到2株耶尔森菌。经EnteroBase数据库比对，51株菌为小肠结肠炎耶尔森菌，4株菌为 Yersinia proxima，阿利克西奇耶尔森菌、马赛耶尔森菌、中间耶尔森菌及 Yersinia canariae各1株。16S rRNA基因多态性分析显示，全部菌株被聚类为3个大组，可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。51株小肠结肠炎耶尔森菌中，49株为毒力基因Ⅲ型（ail-、ystA-、ystB+、yadA-、virF-），2株为毒力基因Ⅱ型（ail+、ystA+、ystB-、yadA-、 virF-）；8株其他耶尔森菌均为毒力基因Ⅳ型（ail-、ystA-、ystB-、yadA-、virF-）。K-mer分析可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌，JS-XZ-2020001菌株与其他小肠结肠炎耶尔森菌距离较远，血清型为O8的小肠结肠炎耶尔森菌分布较集中。 结论:江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌以小肠结肠炎耶尔森菌为主，其他耶尔森菌少量并存，同时发现了 Yersinia proxima和 Yersinia canariae两个耶尔森菌新种型。小肠结肠炎耶尔森菌的毒力基因携带以Ⅲ型为主。16S rRNA基因多态性分析和K-mer分析均可有效区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。

目的:分析甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地内气象因素对鼠疫流行的影响。方法:收集1973 - 2016年肃北、肃南2个县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫监测资料（来源于甘肃省疾病预防控制中心）和当年及领先1、2、3年（相对于当年作为参照的前1、2、3个年份）的气象因素（年均降雨量、气温、相对湿度）资料（来源于中国气象数据共享服务网）。采用R2.3.2软件，以年鼠疫检菌阳性率为因变量，气象因素为自变量建立时间序列半参数广义相加模型（generalized additive model，GAM），采用非线性效应关系定量研究气象因素对鼠疫的影响。结果:2006 - 2016年与1974 - 1983年相比，年均气温、相对湿度、降雨量的平均值肃北县分别上升了0.99 ℃、3.55%RH、12.16 mm；肃南县分别上升了1.00 ℃、2.01%RH、14.60 mm。1973 - 2016年共发生11起人间鼠疫，发病12例，死亡7例。肃北县鼠疫疫源地内领先3年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加0.40%；领先2年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.66%。肃南县鼠疫疫源地内领先1年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加1.32%；领先3年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.96%。另外，肃北、肃南县领先2年年均气温在一定范围内每升高1.00 ℃，动物鼠疫发生分别增加73.17%、70.18%。结论:甘肃省肃北、肃南县鼠疫的发生流行与气象因素关系密切，一定范围内的年均气温上升对鼠疫的流行不仅有明显的促进作用，而且存在滞后效应。另外，同一疫源地内不同类型气候对动物鼠疫流行的影响存在一定差异。

耶尔森菌噬菌体是以耶尔森菌属细菌为宿主的病毒，不仅影响宿主菌的生存和进化，而且在生物量循环和能量流动中发挥重要作用。至2022年11月，美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NBCI）共上传了119株耶尔森菌噬菌体完整基因组序列。不同耶尔森菌噬菌体的基因组大小和遗传内容不同，基因组之间的相似性较低。本文综述了耶尔森菌噬菌体基因组的基本特征和基因功能，并探讨不同种耶尔森菌噬菌体基因组间的差异，以期为解释耶尔森菌噬菌体间基因功能差异及其遗传进化提供参考。

目的:了解青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）种群结构及地区分布特征。方法:选取1954 - 2020年分离自青藏高原鼠疫自然疫源地的319株代表性鼠疫菌，利用全基因组测序技术，比对全球鼠疫菌系统发育树纳入的2 298个SNP位点；并采用MEGA 6.0软件对319株青藏高原鼠疫菌构建系统发育树，确定该疫源地鼠疫菌的SNP种群结构，描述其地区分布特征。结果:青藏高原鼠疫自然疫源地分离的319株鼠疫菌分布在5个分支中，分别为1.IN、2.ANT、3.ANT、0.PE和2.MED。1.IN分支包含209株（65.52%，209/319）菌株，为青海省鼠疫菌的优势种群，占90.51%（143/158）；2.ANT分支包含83株（26.02%，83/319）菌株，为西藏自治区鼠疫菌的优势种群，占67.24%（78/116）；3.ANT、0.PE、2.MED分支分别包含12（3.76%，12/319）、9（2.82%，9/319）、6株（1.88%，6/319）菌株，散在分布于青藏高原范围内青海省、甘肃省、四川省、西藏自治区、新疆维吾尔自治区。结论:青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫菌的SNP种群结构较为丰富，菌株分布在1.IN、2.ANT、3.ANT、0.PE和2.MED 5个分支，总体呈现特定地区分布特征。

目的:了解重症腺型鼠疫临床表现及预后情况，探讨重症腺型鼠疫病例救治经验。方法:对2019年11月11日化德县收治的1例重症腺型鼠疫患者的临床资料、救治经过进行回顾分析。结果:该患者为55岁男性，于鼠疫疫源地捕食野兔后发病；临床表现为发热，乏力，左侧腋下皮肤硬、肿、热、痛，后期淋巴结肿大明显，呃逆及胸腔积液；实验室检查显示弥散性血管内凝血（DIC）、脓毒症、多脏器功能障碍；入院第3天经鼠疫菌培养、鼠疫噬菌体裂解试验阳性确诊为腺型鼠疫。确诊后给予血小板、血浆、液体复苏、链霉素联合莫西沙星等治疗后，纠正DIC，多脏器功能恢复正常，硬肿消退；疗程共19 d，体温恢复正常并达到痊愈。结论:本例患者是以淋巴管炎、皮肤硬肿、凝血异常为主要表现的重症腺型鼠疫病例；及时识别、评估以及早期、联合治疗是救治成功的关键。

目的:探讨基于单核苷酸多态性（SNP）的甘肃省鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）的基因分型及其地区分布特征。方法:选取1962 - 2017年甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地和阿拉善黄鼠鼠疫疫源地分离的52株鼠疫菌，培养并提取基因组DNA，进行Illumina PE150二代测序，鉴定鼠疫菌SNP位点。基于SNP位点，采用Mega 10.0软件中邻接法的Kimura-2-parameter模型确定甘肃省鼠疫菌种群特征，并对群内菌株采用最大似然法的Hasegawa-Kishino-Yano模型构建分子进化树。结果:甘肃省52株鼠疫菌共鉴定出103个SNP位点，其中，基因间区位点28个，非同义突变位点43个，同义突变位点31个，无义突变位点1个。52株鼠疫菌划分为2个生物型3个群，分别为古典型（1.IN2、3.ANT），中世纪型（2.MED）。其中，35株属于1.IN2群，13株属于3.ANT群，4株属于2.MED群。1.IN2群内菌株进一步划分为肃北县鱼儿红乡、党城湾镇，肃南县马蹄乡、大河乡，夏河县5个亚群。3.ANT群内菌株进一步划分为阿克塞县红柳湾镇和肃北县党城湾镇马场2个亚群。结论:SNP方法能够对甘肃省不同鼠疫疫源地的鼠疫菌进行基因分型，且具有一定的区域性特征。

目的:分析呼伦贝尔高原蒙古旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫监测结果，掌握该疫源地鼠疫疫情的发展和变化特点。方法:2009 - 2020年，每年5 - 9月在满洲里市、陈巴尔虎旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗开展监测，采用一日弓形夹法调查达乌尔黄鼠密度，5 m夹线法调查其他小型啮齿类动物；对达乌尔黄鼠体外寄生蚤，于低倍光镜下进行分类鉴定，对获取的鼠、蚤可检材料，按照《鼠疫诊断标准》（WS 279-2008），进行鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）分离培养；采集捕获的活鼠血清，采用间接血凝试验进行鼠疫抗体检测。结果:2009 - 2020年，呼伦贝尔高原蒙古旱獭鼠疫自然疫源地达乌尔黄鼠平均密度为0.45只/hm 2；其他小型啮齿类动物捕获率为1.25%（787/63 091），共获鼠类4科8属9种；达乌尔黄鼠总染蚤率为28.37%（1 945/6 856），蚤指数为1.04，共获蚤类2科3属3种；共剖检达乌尔黄鼠6 674只，培养各种蚤类2 537组6 787只，鼠疫菌检测结果均为阴性；共检测达乌尔黄鼠血清6 795份，检出阳性血清11份，阳性检出率为0.16%，阳性血清最高滴度为1∶1 280。2010 - 2014年连续5年均发现间接血凝试验阳性血清，且均分布在满洲里市、新巴尔虎右旗。 结论:呼伦贝尔高原蒙古旱獭鼠疫自然疫源地多个年度检出达乌尔黄鼠鼠疫菌抗体阳性血清，值得高度警惕，今后应持续开展监测工作，加强检菌工作，以及时发现可能存在的鼠疫疫情，做好各项鼠疫防控工作。

[目的]通过对在重金属污染的天津市渤海湾淡水区域鉴定出的摇蚊耐污种红裸须摇蚊Propsilocerus akamusi进行肠道细菌群落多样性和潜在功能研究,了解生境的变化对摇蚊幼虫肠道细菌群落的影响.[方法]将在受重金属污染的天津市渤海湾淡水区域鉴定到的红裸须摇蚊4龄幼虫用实验室蒸馏水饲养7 d作为实验室培养组,并提取实验室培养组和野外采集组的红裸须摇蚊4龄幼虫肠道细菌基因组DNA,对16S rRNA基因V3-V4区进行高通量测序,将测序结果进行数据质控、序列对比和过滤,分析肠道细菌群落物种组成变化并预测肠道细菌潜在功能.[结果]基于红裸须摇蚊4龄幼虫肠道细菌16S rRNA测序结果共注释到11个门、13个纲、33个目、54个科、71个属、90个种以及105个可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs).实验室培养组红裸须摇蚊4龄幼虫肠道内细菌群落多样性和丰度较野外采集组下降,两组优势菌门相似,均包含厚壁菌门(Firmicutes)、变形 菌门(Proteobacteria)、拟杆 菌门(Bacteroidota)及脱硫弧菌门(Desulfobacterota),野外采集组4龄幼虫肠道内变形菌门丰度显著高于实验室培养组的;实验室培养组4龄幼虫肠道内气单胞菌属Aeromonas、希瓦氏菌属Shewanella、沙雷氏菌属Serratia、假单胞菌属Pseudomonas以及耶尔森氏菌属Yersinia的平均丰度较野外采集组显著降低.线性判别分析结果揭示,野外采集组和实验室培养组的红裸须摇蚊4龄幼虫肠道内存在丰度差异显著的细菌物种.KEGG分析结果显示,红裸须摇蚊4龄幼虫肠道内细菌基因组中有关新陈代谢的基因相对丰度极高,实验室培养组红裸须摇蚊4龄幼虫肠道内细菌基因组中有关环境信息处理和细胞进程的基因相对丰度较野外采集组的显著下降.[结论]本研究结果表明,野外不良环境中生存的红裸须摇蚊幼虫与实验室纯水环境培养幼虫肠道细菌群落多样性以及基因功能存在显著差异,这有助于从环境角度切入研究摇蚊个体抗性机制,为进一步探索摇蚊幼虫肠道内共生微生物抵抗环境胁迫发挥必要作用的研究提供新思路,也为昆虫在不良环境中的耐受机制与其肠道菌群稳态调控机理的研究奠定了基础.

目的 掌握黑龙江省漠河口岸鼠的种类、分布、季节消长及携带病原体情况,为该口岸深入开展鼠类及相关传染病防治研究提供参考和依据.方法 采用夹夜法于2019-2022年每年的5-8月开展鼠密度监测,每月连续监测3 d.应用巢式PCR和普通PCR方法,对采集的鼠类样本开展斑点热群立克次体(SFGR)、鼠疫耶尔森菌、伯氏疏螺旋体等11种鼠源病原体检测.采用χ2检验比较鼠类密度和鼠类携带病原体阳性率差异.结果 捕获鼠类1目3科6属7种共208只.黑线姬鼠为该地区优势种,占35.58%;朝鲜姬鼠次之,占16.83%.共检出6种病原体,总阳性率50.48%;其中SFGR阳性率最高(40.38%),其次为汉坦病毒(11.54%)和伯氏疏螺旋体(3.85%).病原体复合感染鼠20只,占总阳性数的19.05%,其中3种病原体复合感染鼠1只.结论 漠河口岸鼠类携带汉坦病毒、伯氏疏螺旋体和SFGR等多种病原体,应重点加强该地区的鼠类及鼠源疾病的预警监测.

目的 分析内蒙古自治区(内蒙古)鄂尔多斯长爪沙鼠鼠疫疫源地(疫源地)蚤类的组成、空间分布和分离鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)的情况,为当地鼠疫防控提供依据.方法 收集2014-2022年内蒙古鄂尔多斯高原长爪沙鼠疫源地5个旗(区)的鼠体表寄生蚤类的监测数据,使用Excel 2019软件进行数据处理,ArcGIS 10.5软件绘制地图,对不同年代、不同地区蚤的种类、数量及其感染鼠疫情况进行统计分析.结果 共获蚤类4科9属14种17 010匹.各年度获蚤4～11种,年均获蚤8.30种.各年度获蚤563～3 158匹,年均获蚤1 890匹,其中,同形客蚤指名亚种和秃病蚤为优势蚤种.长爪沙鼠年均染蚤率为33.48％,蚤指数为0.92,杭锦旗蚤指数最高,乌审旗蚤指数最低.有4个年度从2个旗(区)的3种125匹蚤中分离出鼠疫菌19株.结论 近年来,鄂尔多斯长爪沙鼠疫源地动物疫情暴发流行,鄂托克旗、鄂托克前旗和杭锦旗疫情形势最为严峻,通过疫蚤叮咬传播至人间的风险较高.