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2014年湖南省C亚属人腺病毒1株临床分离株的全基因组特征分析
编辑人员丨2天前
目的:了解2014年湖南省C亚属人腺病毒(HAdV-C)分离株的基因特征。方法:2014年从湖南省长沙市严重急性呼吸道感染儿童病例咽拭子标本中分离到一株HAdV-C病毒株(Hunan2014-s024),分段扩增目的基因片段,拼接后获得全基因组序列,同时下载GenBank数据库中国内外流行的HAdV-C代表株全基因组序列构建HAdV-C数据库,使用生物信息学软件进行全基因组序列特征分析。结果:Hunan2014-s024株与2006年山西省健康儿童粪便标本中分离到的HAdV-C病毒株(MK041244-CHN-2006)的同源性最高,并以该病毒基因组元件为主要骨架,在penton base基因上交换了2012年湖南省急性下呼吸道感染患儿分离株(MK041246-CHN-2012)的基因片段。结论:2014湖南株(Hunan2014-s024)为2006年山西省病毒株(MK041244-CHN-2006)与2012年湖南株(MK041246-CHN-2012)的重组病毒,由于其致病性可能发生了改变,因此有必要加强HAdV-C的分子流行病学监测,以了解其潜在疾病负担和公共卫生意义。
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编辑人员丨2天前
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病毒导致的亚急性甲状腺炎糖皮质激素递减疗法的疗效分析
编辑人员丨2天前
目的:分析病毒导致的亚急性甲状腺炎(subacute thyroiditis,SAT)应用糖皮质激素递减疗法的疗效及预后。方法:回顾性分析2016年1月至2020年1月在首都医科大学附属北京安贞医院内分泌代谢科门诊就诊的93例病毒导致的SAT患者行激素递减疗法的疗效及预后。根据治疗方法不同分为试验组(26例,醋酸泼尼松剂量递减方案治疗)和对照组(67例,非甾体抗炎药治疗)。统计分析两组患者疼痛、发热等不适症状消失时间,并比较复诊甲状腺功能、红细胞沉降率(erythrocyte sedimentation rate,ESR)、快速C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)等化验指标及恢复正常的时间,超声评估甲状腺局部肿块消失时间;电话随访停药后复发率及1年后永久性甲状腺功能减退(甲减)的发生率。结果:两组患者初诊时一般指标及临床特点具有可比性。试验组SAT患者经过激素递减方案治疗均达到治愈,且治愈率优于对照组,但两组比较差异无统计学意义(100% vs 89.6%, P>0.05)。与对照组相比,试验组的发热缓解时间[(6.53±2.94)d vs(15.34±5.91)d]、疼痛缓解时间[(5.22±2.32)d vs(19.45±2.54)d]、甲功恢复正常用时[(21.36±3.21)d vs(29.13±5.25)d]均更短,永久性甲减发生率(23.1% vs 47.8%)、1年后复发率(19.2% vs 44.8%)更低,差异均具有统计学意义( P<0.05)。 结论:激素递减疗法治疗SAT缩短临床症状的改善时间及甲功恢复时间,且甲减发生率更低。
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编辑人员丨2天前
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浙江衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒优势血清型与VP1基因分析
编辑人员丨2天前
目的:了解浙江省衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒(Echovirus, ECHOV)优势血清型与变迁并分析ECHOV VP1基因分子特征。方法:采集53例病毒性脑炎患儿脑脊液标本进行病毒分离培养。采用荧光RT-PCR和PCR分别检测脑脊液标本中人肠道病毒(human enterovirus,HEV)包括ECHOV、柯萨奇病毒(coxsackie virus,CV)和新型肠道病毒(enterovirus,EV),以及流行性乙型脑炎病毒(japanese encephalitis virus, JEV)、腮腺炎病毒(mumps virus, MuV)、西尼罗病毒(west nile virus,WNV)、基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)、单纯疱疹病毒(herpes simplex virus,HSV)和巨细胞病毒(cytomegalovirus,CMV)。HEV阳性脑脊液标本采用RT-PCR法扩增HEV-B组全长VP1基因序列,测序后用多种生物信息学软件分析ECHOV VP1基因型、基因重组和遗传进化特征。结果:RD细胞分离培养出6株毒株,但Hep-2细胞分离培养结果均阴性。11份标本HEV通用荧光RT-PCR结果阳性,但其他病毒检测结果均阴性。11份HEV阳性标本中6份检出ECHOV,与分离培养结果一致,分别为4株ECHO6、1株为ECHO7和1株ECHO30血清型,柯萨奇病毒和EV检测结果均阴性。4株ECHO6病毒属于ECHO6-C2基因亚型,但分为ECHO6-41/46和ECHO6-45/48两个流行克隆,ECHO7和ECHO30分别属于ECHO7-C和ECHO30-C基因型。ECHO6与ECHO30病毒在进化过程中存在VP1基因重组。结论:ECHOV是该地区儿童病毒性脑炎主要病原体,且可能存在局部暴发流行。ECHO6与ECHO30病毒VP1基因存在重组可能性,ECHO6有成为ECHOV优势血清型的可能。
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编辑人员丨2天前
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2021年甘肃省武威市呼吸道感染患者中人腺病毒的分子流行病学特征
编辑人员丨2天前
目的:基于甘肃省武威市急性呼吸道感染(acute respiratory infection, ARI)病例样本,分析人腺病毒(human adenovirus, HAdV)的感染情况以及基因分型。方法:针对2021年1—8月采集的甘肃省武威市ARI病例的鼻咽拭子样本,使用荧光定量PCR(RT-PCR)对12种呼吸道病毒进行筛查;选取HAdV阳性样本进行病毒分离,普通PCR扩增分离株的Hexon基因Loop2区域以及3个结构蛋白(Penton base、Hexon、Fiber)全长,从GenBank数据库下载国内外各型别原型株以及代表株全基因组进行系统发育和一致性分析。结果:本研究共收集ARI样本574份,共检出呼吸道病毒阳性标本233份,检出率位居前三位的分别是鼻病毒(15.16%,87/574)、人偏肺病毒(7.67%,44/574)和HAdV(7.32%,42/574)。574份样本中,男、女HAdV检出率差异无统计学意义;HAdV主要发生在0~1岁(10.61%,14/132);各月份均有检出,差异无统计学意义;从42份HAdV阳性标本中分离出28株阳性株,分别为HAdV-B(4株均为HAdV-3)和HAdV-C(包括7株P1H2F2、8株HAdV-1、9株Px1/Ps3H5F5)两个亚属,其中P1H2F2和Px1/Ps3H5F5为本研究基因重组模式。结论:HAdV是甘肃省武威市2021年1—8月ARI病例中第三流行的病毒,感染型别以C亚属为主,其次为B亚属。
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编辑人员丨2天前
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基于毛细电泳的多重PCR方法检测儿童呼吸道腺病毒感染常见血清型的价值
编辑人员丨2天前
目的:建立一种呼吸道腺病毒常见血清型检测方法,并利用该方法检测温州地区儿童呼吸道人腺病毒(HAdV)感染的主要血清型。方法:利用基于毛细电泳的多重PCR法建立呼吸道腺病毒常见12种血清型检测方法,将2018年1月至2019年12月收治于温州医科大学附属育英儿童医院,经直接免疫荧光法检测HAdV阳性的1 059例急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本作为研究对象,对其进行回顾性分析,采用多重PCR方法测定HAdV-1、2、3、4、5、7、14、21、37、40、41和55型等12种血清型,同时随机抽取部分标本与一代测序法比较检测结果一致性。结果:共收集到1 059份HAdV抗原阳性的呼吸道标本,多重PCR法检测发现,1种血清型阳性947例(89.4%),2种血清型混合感染13例(1.2%),阴性24例(2.3%),阳性但不能分型75例(7.1%)。947例单种血清型阳性儿童中,B亚群的HAdV-3型415例(43.8%),HAdV-7型318例(33.6%),HAdV-55型12例(1.2%),HAdV-21型2例(0.2%);C亚群的HAdV-2型108例(11.4%),HAdV-1型70例(7.4%),HAdV-5型16例(1.7%);E亚群的HAdV-4型6例(0.6%)。未检出HAdV-14、HAdV-37、HAdV-40和HAdV-41。随机抽取多重PCR法检测的HAdV分型阳性的标本51例,与一代测序的检测进行比较,均符合。结论:建立并验证了基于毛细电泳的多重PCR法对儿童呼吸道腺病毒感染常见血清型的诊断价值。B亚群的HAdV-3、HAdV-7和C亚群的HAdV-2、HAdV-1为温州地区儿童呼吸道腺病毒感染的主要血清型,HAdV-14、HAdV-37、HAdV-40和HAdV-41未检出。
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编辑人员丨2天前
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法尼酯X受体激动剂奥贝胆酸调控金属硫蛋白1在小鼠脂肪肝中的作用研究
编辑人员丨2天前
目的:观察法尼酯X受体(FXR)与金属硫蛋白1(MT1)在脂肪肝小鼠肝脏的表达改变,及FXR激动剂奥贝胆酸(OCA)对小鼠肝脏MT1表达的调节作用。方法:16只6周龄雄性C57BL/6小鼠[体质量(20±1.5)g]分别给予45% FAT高脂饮食(HFD)及10% FAT对照饲料(CON)处理12周诱导非酒精性脂肪肝(NAFLD)动物模型,分为HFD组与CON组( n=8),应用qPCR从mRNA水平检测肝脏FXR、MT1表达变化;人工合成的FXR的激动剂OCA处理C57BL/6小鼠3 d,分为OCA组与CON组( n=8),应用qPCR和免疫印迹方法分别从mRNA水平和蛋白水平检测其MT1表达变化。采用不同浓度OCA(0、0.1、0.5、1、2、5 μmol/L组)处理人肝癌细胞系HepG2细胞24 h,或采用FXR腺病毒(分为Ad-FXR组与Ad-GFP组)过表达处理24 h,应用qPCR从mRNA水平检测其MT1A表达变化;构建小鼠MT1启动子区荧光素酶报告基因并转染HEK293T细胞,应用OCA或二甲基亚砜(DMSO)处理24 h后,裂解细胞,检测荧光素酶活性,探讨OCA对MT1启动子活性的调控作用。 结果:(1)同CON组饮食相比,HFD饮食可诱导小鼠肥胖,血脂水平升高,肝脏出现明显的脂肪变,肝脏脂质含量明显增高,肝脏FXR与MT1表达均有所下降(均 P<0.05)。(2)OCA处理可明显上调小鼠肝脏MT1 mRNA水平和蛋白水平表达(均 P<0.05)。(3)在培养的HepG2细胞中给予不同浓度OCA处理,发现同对照组相比,OCA 0.5 μmol/L处理可增加HepG2细胞MT1A的mRNA表达水平( P<0.05)。(4)腺病毒介导的FXR过表达可上调HepG2细胞MT1A mRNA的表达水平( P<0.05)。(5)荧光素酶报告基因法进一步证实,OCA处理可增强小鼠MT1的启动子活性( P<0.05),为对照组的1.98倍。 结论:小鼠MT1基因可在转录水平受到FXR激动剂OCA的调控,OCA可能通过诱导小鼠MT1的表达在调节NAFLD的进程中发挥作用。
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编辑人员丨2天前
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在中国南方出现的引起肺炎的新型重组人腺病毒HAdV-C104的基因特征研究
编辑人员丨2天前
根据生物学特性和血清中和试验,人腺病毒(human adenovirus,HAdV)可被划分为7个亚属(A~G)和52个血清型;随后依据全基因组序列测定和生物信息学分析,进一步鉴定了至少61个型别(HAdV-53~113)。2017年,一项在中国南方进行的HAdV分子流行病学调查显示,在呼吸道感染患者中主要检出的HAdV型别为HAdV-3、HAdV-2和HAdV-7。此外,本研究从一名肺炎患者中分离出1株属于HAdV-C的新型重组HAdV。经系统发育和基因重组等分析表明,该新型重组株具有HAdV-1的penton和hexon基因,以及HAdV-2的fiber基因。根据国际腺病毒工作小组基于3种主要衣壳蛋白的命名方法,该病毒可被命名为"P1H1F2",并进一步命名为HAdV-C104。随后的体外实验表明,HAdV-C104的增殖能力与HAdV-1、HAdV-2和另一新型重组株P1H2F2相当。此外,HAdV-C104感染患者被诊断为肺炎,经抗病毒治疗后痊愈。本研究进一步证实基因重组是HAdV-C分子进化的主要驱动力。
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编辑人员丨2天前
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2017—2019年河南省漯河市严重急性呼吸道感染病例人腺病毒基因特征分析
编辑人员丨2天前
目的:了解我国河南省漯河市严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)病例人腺病毒(human adenovirus,HAdV)基因特征。方法:对2017年10月至2019年2月SARI病例中鉴定的HAdV阳性标本进行病毒分离后,扩增并测定其Hexon基因的Loop2区域,初步鉴定病毒分离株型别。然后根据初筛结果,分别使用HAdV各型特异性引物扩增病毒株3个靶基因(Penton base、Hexon和Fiber)的序列全长,并与各型原型株以及国内外相应型别代表株进行系统发育和序列同源性分析,以确定HAdV病毒株型别并了解其基因特征。结果:从河南省漯河市783份SARI病例中鉴定的27份HAdV阳性咽拭子标本中,共分离获得18株病毒分离株,分子分型结果显示,这些毒株分属于B亚属(HAdV-3、HAdV-7和HAdV-55)、C亚属(HAdV-1、P1H2F2、Px1/Ps3H5F5、P89H5F5和HAdV-6)和E亚属(HAdV-4)。其中C亚属HAdV-1分离阳性率最高(33.3%),其次为B亚属HAdV-3(22.2%)和C亚属P1H2F2(11.1%)。本研究4种HAdV病毒株(HAdV-3、HAdV-4、HAdV-7和HAdV-55)基因组序列在时间和空间上具有显著的保守性和稳定性特点,而HAdV-C鉴定了3种基因重组模式(P1H2F2、Px1/Ps3H5F5和P89H5F5),其潜在的公共卫生意义需进一步研究证实。结论:2017—2019年河南省漯河市SARI病例HAdV感染主要以C亚属为主,其次为B亚属和E亚属,该数据为当地腺病毒相关传染病的预防控制提供了科学依据。
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编辑人员丨2天前
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去铁酮对脑缺血再灌注大鼠海马区铁跨膜转运蛋白表达的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究大鼠脑缺血再灌注后去铁酮(DFP)对铁跨膜转运蛋白包括铁跨膜转入蛋白和铁跨膜转出蛋白表达的影响.方法 将48只大鼠随机分为假手术组、脑缺血再灌注组(I/R组)和去铁酮(DFP)+脑缺血再灌注组(DFP+I/R组).各组大鼠术前1h预处理灌胃,再行大脑中动脉线栓法脑缺血再灌注模型制备术,术后连续灌胃给药2天.术后72 h采用Longa神经行为学评分标准记录大鼠活动;普鲁士蓝染色检测海马区铁聚集情况;Western blot检测各组大鼠海马组织铁跨膜转运蛋白的表达,包括铁跨膜转入蛋白:转铁蛋白受体(TFR)和二价金属离子转运体1(DMT1);铁跨膜转出蛋白:膜铁转运蛋白(Fpn)、膜铁转运辅助蛋白(Heph)、人类猫白血病C亚类病毒受体(FLVCR)和胸腺癌抵抗蛋白(BCRP).结果 与I/R组比较,DFP+ I/R组神经行为学评分显著下降(P<0.01),神经元内铁聚集颗粒明显减少,TFR和DMT1蛋白表达明显减少(P<0.05或P<0.01),Heph、FLCVR和BCRP蛋白表达明显增加(P<0.05或P<0.01).结论 去铁酮可以下调铁跨膜转入蛋白TFR和DMT1的表达,上调铁跨膜转出蛋白Heph、FLVCR和BCRP的表达,促进血红素铁和非血红素铁外排,降低脑铁沉积,从而减轻脑缺血再灌注后神经损伤,改善疾病预后.
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编辑人员丨2023/8/6
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发热伴血小板减少综合征和恙虫病患者临床特征和器官损害的差异
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)和恙虫病患者临床表现和器官损害的差异,探讨影响预后的因素.方法 2014年10月至2017年6月安徽医科大学第一附属医院收治的SFTS患者49例,恙虫病患者16例.评估患者的一般资料(地区、年龄、性别和各种临床表现).病程中连续监测血常规、肝肾功能、心肌酶谱、脂肪酶、淀粉酶、电解质、C反应蛋白、降耗素原、PT和活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT).正态分布的计量资料采用t检验,非正态分布的计量资料采用非参数检验,计数资料采用卡方检验进行统计学分析.结果 SFTS患者年龄(62.1±15.5)岁,范围17~87岁;恙虫病患者年龄(56.1±9.2)岁,范围 47~73岁;两组年龄差异无统计学意义(t=l.47,P=0.147).SFTS患者中男性25例(51%),恙虫病患者中男性8例(50%),两组性别构成差异无统计学意义(x2=0.005,P=0.943).SFTS和恙虫病患者头痛呕吐、体表淋巴结肿大、意识障碍、蛋白尿、血尿、肺部感染、多器官功能损伤和急性胰腺炎发生率比较差异均有统计学意义(x2值分别为8.82、4.38、8.71、11.17、7.88、5.56、4.35、9.43和8.13,P<0.05或0.01).SFTS患者白细胞计数(Z=2.73)、中性粒细胞计数(Z=2.46)、淋巴细胞计数(Z=3.15)、血小板计数(Z=4.25)、白蛋白(Z=2.65)和血钠水平(t=2.10)低于恙虫病患者,比较差异均有统计学意义(P<0.05或0.01);AST(Z=2.94)、乳酸脱氢酶[lactate dehydrogenase,LDH(Z=3.42)]、肌酸激酶[creatine kinase,CK(Z=2.88)]、淀粉酶(Z=2.77)、脂肪酶(Z=2.82)、肌酐(Z=2.07)和尿素氮(Z=2.50)较恙虫病患者明显升高,比较差异均有统计学意义(P<0.05或0.01).SFTS死亡16例,生存33例.死亡组与生存组年龄(t=3.33)、血小板计数(Z=2.55)、ALT(Z=2.10)、AST(Z=2.22)、LDH(Z=2.26)、CK(Z=3.50)、CK-MB(Z=3.10)、肌酐(Z=2.17)、尿素氮(Z=2.36)、血钠(t=2.65)比较差异均有统计学意义(P<0.05或0.01).结论 SFTS病情危重,病死率高,恙虫病预后较好,早期鉴别诊断并给予合理治疗是降低患者病死率的关键.
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编辑人员丨2023/8/6
