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DNAH5基因新型复合杂合变异所致Kartagener综合征患儿1例的临床及遗传学分析
编辑人员丨6天前
目的:分析1例Kartagener综合征(KTS)患儿的临床特征与遗传学病因。方法:选取2020年10月于邛崃市妇幼保健院就诊的1例KTS患儿为研究对象。对患儿及其父母进行家系全外显子组测序以及生物信息学分析,通过Sanger测序进一步验证候选变异。模拟分析错义变异导致的蛋白结构改变,应用HSF 3.0在线平台对非编码区变异进行危害性预测。结果:患儿具有支气管扩张、鼻窦炎及内脏反位等临床表现,基因检测提示其 DNAH5基因存在c.5174T>C与c.7610-3T>G复合杂合变异,Sanger测序证实二者分别遗传自患儿母亲和父亲。两个变异在dbSNP、1000 Genomes、ExAC、ClinVar及HGMD等数据库中均未见收录。蛋白结构分析结果提示c.5174T>C(p.Leu1725Pro)可能影响蛋白局部结构的稳定性从而影响生物活性,HSF 3.0分析结果提示c.7610-3T>G可能破坏剪接受体从而影响转录。 结论:DNAH5基因c.5174T>C与c.7610-3T>G复合杂合变异可能是患儿的遗传学病因。上述发现进一步拓展了 DNAH5基因的变异谱。
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编辑人员丨6天前
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CFAP43或 CFAP44基因突变致精子鞭毛多发形态异常患者的辅助生殖助孕结局研究
编辑人员丨6天前
目的:探讨 CFAP43或 CFAP44基因突变致精子鞭毛多发形态异常(multiple morphological abnormalities of the flagella,MMAF)患者行卵胞质内单精子注射(intracytoplasmic sperm injection,ICSI)助孕的临床结局。 方法:回顾性队列研究分析2014年9月至2020年7月期间于安徽医科大学第一附属医院妇产科生殖医学中心就诊的121例MMAF男性不育症患者的临床资料和基因检测结果,纳入9例 CFAP43或 CFAP44基因突变MMAF患者,5例MMAF患者(P3、P5、P7、P8和P9)选择ICSI助孕治疗,统计并分析这5例患者ICSI助孕的临床结局。 结果:Sanger测序证实9例MMAF患者携带 CFAP43或 CFAP44基因双等位基因突变,其中3例患者的突变位点以往未曾报道,分别为 CFAP43基因的新发纯合突变(c.4132delC:p.Arg1378Glufs*10)和新发复合杂合突变(c.3938G>A:p.Arg1313Gln;c.4342G>A:p.Glu1448Lys)以及 CFAP44基因的新发复合杂合突变(c.1718C>A:p.Pro573His;c.4075G>A:p.Glu1359Lys)。5例MMAF患者夫妇接受5个ICSI周期,已生育4个健康亲生子代。 CFAP43或 CFAP44基因突变MMAF患者组ICSI受精率为76.47%(39/51),5例患者中临床妊娠3例,活产3例。与 DNAH1基因突变MMAF患者组和严重少弱精子症患者组相比, CFAP43或 CFAP44基因突变MMAF患者ICSI助孕结局差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:CFAP43或 CFAP44基因突变会导致精子严重的鞭毛畸形和运动能力下降,是MMAF的重要病因。ICSI技术可以有效地解决 CFAP43或 CFAP44基因突变MMAF患者的生育难题。
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编辑人员丨6天前
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9例原发性纤毛运动障碍临床诊断的回顾分析及DNAH5新突变鉴定
编辑人员丨6天前
目的:总结分析9例经支气管镜纤毛病理活检或基因确诊的儿童原发性纤毛运动障碍(PCD)患儿的临床资料。方法:分析2017年7月至2021年7月在湖北省妇幼保健院确诊为PCD的患儿的临床资料,分析其临床特征及支气管纤毛活检的透射电镜(TEM)检测及基因检测的结果。结果:9例病例资料中男3例,女6例,确诊时的年龄6岁4月~13岁10月,中位确诊年龄为9岁7月。2例有新生儿呼吸道感染病史,9例患儿均表现为反复呼吸道感染,表现为咳嗽、咳痰、鼻窦炎以及支气管扩张(6例),3例有内脏转位。所有患儿确诊前以"肺炎"、"支气管哮喘"、"鼻窦炎"等常见病反复就诊,1例为右中叶支气管扩张伴反复感染切除术后。6例完成基因检测,3例基因检测结果阴性的患儿中,2例通过TEM诊断,1例符合典型的PCD症状;3例基因阳性结果均为复合杂合突变,1例为DNAH5基因突变,1例为RSPH4A和DNAH5 2个基因突变,1例为DNAH1突变,其中DNAH5 c.1320+1G>A和p.K4504*为新鉴定致病性变异。7例经支气管镜取支气管黏膜行TEM检测,6例检测结果符合PCD病理改变。结论:对于原因不明的儿童早期呼吸道反复感染,及早进行TEM和较全面的基因检测是早期诊断PCD的必要条件。
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编辑人员丨6天前
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儿童原发性纤毛运动障碍1例及文献复习
编辑人员丨6天前
目的:探讨原发性纤毛运动障碍(primary ciliary dyskinesia,PCD)的临床特点及诊断方法。方法:回顾性分析1例儿童昆明市儿童医院诊断的1例PCD病例的诊疗经过,包括一般资料、临床特点、辅助检查结果,并进行文献复习。结果:患儿,女,8岁,因反复咳嗽就诊,既往反复患肺炎及鼻窦炎,纤毛活检电镜提示纤毛数量减少,基因检测位于chr5-13809290的DNAH5基因出现c.7615T>C(p.W2539R)突变,故确诊为PCD。该患儿突变位置为新发突变位点。结论:PCD是儿童的罕见疾病,电镜检查及基因检查等有助于PCD的诊断,对于反复呼吸道感染及湿性咳嗽患儿需警惕PCD可能。
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编辑人员丨6天前
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中国原发性纤毛运动障碍患儿纤毛超微结构及基因分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨中国原发性纤毛运动障碍(PCD)患儿纤毛超微结构及基因变异特点。方法:搜集重庆医科大学附属儿童医院呼吸中心2018年11月至2021年5月经支气管黏膜活检纤毛透射电子显微镜检查及第二代全外显子trio家系测序的8例PCD患儿资料,在国内外数据库PubMed、中国知网、维普、万方进行文献检索,检索时间为自数据库建库起至2021年9月,结合相关报道完善纤毛活检及基因检测的中国PCD患儿资料,总结其基因突变和纤毛结构的关系。结果:8例患儿确诊中位年龄为6.25岁,其中男6例,女2例,大多有慢性咳嗽、慢性鼻-鼻窦炎、支气管扩张,伴全内脏转位2例。支气管纤毛透射电子显微镜结果示支气管黏膜纤毛内、外动力臂(IDA+ODA)缺陷5例,IDA缺陷1例,纤毛数量减少1例,正常1例。完善基因分析,共检测出致病基因突变10个,其中DNAH5检测到新发致病突变1个:c.11029-2A>T(剪切突变)。通过文献复习并结合本文病例,共纳入80例同时完善了纤毛活检及基因检测的中国PCD患儿,其中DNAH5、DNAH11、HYDIN基因为中国患儿常见突变基因,ODA缺陷(26.25%,21/80)、IDA缺陷+微管紊乱(25.00%,20/80)是中国患儿常见的纤毛超微结构缺陷,有16.25%(13/80)PCD患儿纤毛超微结构正常。结论:对致病基因与纤毛超微结构统计分析,大多PCD相关基因突变可通过其编码蛋白的位置及功能,从而预测纤毛超微结构的变化。PCD"标志性"纤毛超微结构缺陷检出率70.00%(56/80),16.25%(13/80)PCD患儿纤毛超微结构正常,提示纤毛活检并非PCD的"金标准",在患儿临床表现符合PCD典型症状时,即使纤毛透射电子显微镜下结构正常,仍不能排除PCD,基因分析也是PCD诊断的重要手段。
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编辑人员丨6天前
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一例由 DNAH5基因变异所致的原发性纤毛不动综合征
编辑人员丨6天前
目的:探讨1例原发性纤毛不动综合征患者的遗传学机制。方法:应用高通量测序和生物信息学分析检测患者的致病变异,用Sanger测序法对其家族成员进行验证,采用短效长方案行胞浆内单精子注射(intracytoplasmic single sperm injection,ICSI)助孕。结果:患者存在梗阻性无精子症,鼻呼出一氧化氮值84 ppb,鼻窦及双肺存在原发性纤毛不动综合证的典型表现。测序发现其携带DNAH5基因第11外显子c.1489C>T(p.Q497X)和第38外显子c.6304C>T(p.R2102C)双等位基因变异。患者通过ICSI助孕获得临床妊娠。结论:上述发现丰富了DNAH5基因的变异谱。DNAH5基因的变异不影响ICSI助孕的结局。
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编辑人员丨6天前
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TMB在肾透明细胞癌中的临床意义
编辑人员丨6天前
目的:研究肿瘤突变负荷(TMB)在肾透明细胞癌患者中的临床意义。方法:通过癌症基因组图谱获取肾透明细胞癌的体细胞突变数据、基因表达数据甲基化数据和相关临床数据以及临床蛋白质组肿瘤分析协作组数据库中肾透明细胞癌的蛋白组数据,计算肾透明细胞癌患者的TMB值并分析TMB与总生存率的关系及其与临床预后的关系。TMB值按降序排列,以中位数将所有肿瘤样本分为高TMB组(171例)和低TMB组(166例),对两组的基因表达数据进行基因富集分析,对肾透明细胞癌突变率最高的前10位基因进行多组学分析。结果:高TMB组患者的总生存率低于低TMB组( P=0.035);肿瘤级别越高的ccRCC患者的TMB值越高,差异有统计学意义( P=0.036)。突变率最高的前10位基因中,突变数据和预后相关的只有BAP1和HMCN1;SETD2、HMCN1、MTOR、PBRM1、MUC16的基因表达与ccRCC患者的临床预后相关;BAP1、DNAH9、HMCN1、KDM5C、MTOR的甲基化水平与ccRCC患者的临床预后相关。 结论:高TMB的肾透明细胞癌患者预后较差,不同肿瘤分级患者的TMB值不同,其突变率最高的前10位基因在突变水平、转录组水平以及甲基化水平与肾透明细胞癌患者预后相关。
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编辑人员丨6天前
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儿童原发性纤毛运动障碍13例病例系列报告
编辑人员丨1个月前
背景 原发性纤毛运动障碍(PCD)临床表现多样,容易延误诊治.目的 分析儿童PCD的临床特征和遗传谱.设计 病例系列报告.方法 通过浙江大学医学院附属儿童医院病历系统收集2017年6月1日至2023年12月31日收治的PCD基因阳性患儿的性别、发病和确诊年龄、临床表现、辅助检查和基因检测结果等临床信息.检索中、英文数据库,纳入中国PCD相关基因阳性的PCD病例报告和病例系列报告,检索时间为数据库建库起至2023年12月31日,总结中国PCD病例的临床表型、基因型及其在中国各地区分布.主要结局指标 中国PCD患儿临床特征和基因型.结果 13例PCD患儿进入本文分析,男7例(53.8%),女6例.中位发病年龄为9.0岁(3 d至14.3岁),中位诊断年龄为11.3岁(24 d至14.9岁).临床主要表现为咳嗽伴咳痰11例(84.6%),鼻窦炎10例(76.9%),发热7例(53.8%),支气管扩张、内脏转位和肺不张各6例(46.2%),鼻塞、流脓涕和符合Kartagener综合征各4例(30.8%).13例患儿共检测到8个基因的突变,其中DNAH11基因突变4例(28.6%),DNAH5基因突变3例(21.4%),CCDC114、DNAH9、DNAAF3、ODAD1、CCNO和RSPH1基因突变各1例;23个双等位基因突变位点,ACMG判定为致病8个,可能致病7个,意义未明(VUS)8个;对8个VUS位点进一步行蛋白功能软件预测均为有害.文献复习72篇病例报告和病例系列报告进入本文分析,PCD 391例,相关基因阳性316例,共检测出PCD相关基因40个.基因变异位点频率排名最高的前5位为DNAH5(21.2%)、DNAH11(17.7%)、CCDC40(7.9%)、YDIN(6.6%)、CCNO(6.0%).PCD 病例临床表型最常见的是长期咳嗽伴咳痰(91.3%)、慢性鼻窦炎(87.0%)、支气管扩张(70.6%)和肺功能异常(64.2%).北京、上海和浙江地区均以DNAH11和DNAH5基因变异为主,重庆以HYDIN基因变异(19.1%)为主,广东以DNAH1基因变异(22.2%)为主,广西以RSPH4A(13.3%)、HYD1N(10.0%)、DNAH11(10.0%)、CCDC40(10.0%)和 ZMYND10(10.0%)基因变异为主,湖南以 DNAH5(18.2%)和DNAAF4(13.6%)基因变异为主.结论 中国最常见的PCD相关基因是DNAH11和DNAH5,临床表型以长期咳嗽伴咳痰、慢性鼻窦炎等呼吸道症状为主.
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编辑人员丨1个月前
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DNAH5基因新发移码变异所致1例原发性纤毛不动综合征患者的临床特征及遗传学分析
编辑人员丨2024/5/11
目的:探讨1例原发性纤毛不动综合征(PCD)患者的临床特征和遗传学特点.方法:选取2020年7月于山东省临沂市人民医院生殖医学科门诊就诊的1例PCD患者为研究对象,收集患者的临床资料,应用全外显子组测序(WES)对患者进行基因检测,应用Sanger测序对候选变异进行验证.采用SWISS-MODEL进行预测变异基因的蛋白结构.结果:先证者存在慢性鼻炎、支气管扩张、内脏转位及男性不育的临床表型.先证者行WES检测显示DNAH5基因第74外显子存在c.12890dup(p.N4297Kfs*13)纯合移码变异,导致多肽链合成提前终止,对基因功能造成影响.SWISS-MODEL预测示突变后蛋白缺失了一部分氨基酸残基,导致蛋白3D构象发生变化.该变异在ClinVar、gnomAD及OMIM数据库中均未见收录.参照美国医学遗传学与基因组学学会相关指南,判定此变异为致病性变异(PVS1+PM2_P+PM3_P).结论:DNAH5基因c.12890dup(p.N4297Kfs*13)纯合移码变异可能是导致该患者临床表型的原因,上述发现丰富了 DNAH5基因的变异谱.
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编辑人员丨2024/5/11
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原发性纤毛运动障碍三例纤毛结构与基因变异并文献复习
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨原发性纤毛运动障碍(PCD)临床、纤毛结构缺陷及基因变异特点.方法 对山东大学附属省立医院小儿呼吸科2013-2016年通过支气管黏膜活检纤毛电镜诊断的3例PCD患儿采用靶向目标捕获二代测序行基因检测,分析其临床表现、纤毛结构和基因变异特点,通过关键词“PCD""gene""Chinese"对在线人类孟德尔遗传数据库、人类基因组变异数据库、PubMed和中国知网建库至2017年7月的文献进行检索,分析总结已报道的中国PCD患者基因变异的病例资料.结果 3例患儿年龄10~11岁,1男2女,均有反复呼吸道感染、慢性鼻-鼻窦炎、支气管扩张,2例伴全内脏转位.例1支气管黏膜纤毛内外动力蛋白臂缺失,LRRC6基因复合杂合变异;例2支气管黏膜纤毛内外动力蛋白臂缺失,DNAH5和DNAH 11基因杂合变异;例3支气管黏膜纤毛微管数目异常和内动力蛋白臂缺陷,CCDC39基因纯合变异.3例基因变异位点均为未报道的新变异.检索共筛选出8篇文献,共报道12例基因变异的PCD中国患者,均存在自幼反复呼吸道感染、慢性鼻-鼻窦炎、支气管扩张,其中合并右位心9例.4例进行了有效的鼻(或支气管)黏膜纤毛活检,纤毛内外动力蛋白臂缺失1例,内动力蛋白臂和放射辐缺失1例,外周微管对和中央微管对部分缺失1例,纤毛结构正常1例.共发现PCD相关致病基因变异8种,DNAH5基因变异3例,DYX1C1基因变异2例,CCNO基因变异2例,CCDC39、CCDC40、HYDIN、ARMC4、DNAI1基因变异各1例.结论 PCD临床表现为自幼反复呼吸道感染、慢性鼻-鼻窦炎、支气管扩张.15例发现基因变异的中国PCD患者中11例为Kartagener综合征患者,纤毛结构可有内外动力蛋白臂、放射辐、外周微管对及中央微管对的缺陷,15例共发现10种PCD相关致病基因变异:DNAH5、DYX1C1、CCNO、CCDC39、CCDC40、HYDIN、ARMC4、DNAI1、LRRC6、DNAH11.
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编辑人员丨2023/8/6
