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长链非编码RNA叉头框蛋白D2相邻对链RNA1在胶质瘤细胞中的表达和功能
编辑人员丨3天前
目的 研究长链非编码RNA叉头框蛋白D2相邻对链RNA1(lncRNA FOXD2-AS1)对胶质瘤生物学行为的影响.方法 首先用qPCR实验检测FOXD2-AS1在U251、LN229、U87这3种胶质瘤细胞系中的表达情况,筛选出高表达的2种细胞系进行培养,再构建慢病毒载体转染2种细胞系敲低FOXD2-AS1作为实验组,将空载慢病毒颗粒转染的细胞作为阴性对照组,将常规培养未进行转染的细胞作为空白组,采用划痕实验、Transwell实验检测2种胶质瘤细胞系中各组细胞迁移及侵袭能力,将FOXD2-AS1敲低后进行转录组测序,进行差异基因取交集,并对共同差异基因进行富集分析.结果 qPCR实验显示FOXD2-AS1在LN229、U251这2种胶质瘤细胞系中明显高表达,与阴性对照组和空白组相比,被慢病毒载体转染敲低FOXD2-AS1时,2种胶质瘤细胞系中实验组细胞迁移及侵袭能力明显下降.生信数据库分析敲低FOXD2-AS1时发现2种胶质瘤细胞系共有48个相关差异性表达基因,进一步通过KEGG通路富集分析发现,2种胶质瘤细胞系中FOXD2-AS1敲低都与多种信号通路(细胞过程中的聚焦粘附、环境信息处理中的神经活性配体-受体相互作用、遗传信息处理中的剪接体、人类疾病中的癌症通路、新陈代谢中的代谢途径、有机系统中的补体和凝血级联反应)存在相关性.结论 LncRNA FOXD2-AS1在胶质瘤细胞迁移、侵袭中发挥作用,其可能的作用机制可还有待后续进一步研究.
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编辑人员丨3天前
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POU3F3对垂体瘤细胞增殖和周期的影响及其作用机制
编辑人员丨3天前
目的:探讨POU3F3对垂体瘤细胞增殖和周期的影响及其作用机制。方法:选取2016年6月到2019年12月驻马店市中心医院手术切除的150例垂体瘤和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析POU3F3和微小RNA(miRNA,miR)-127-5p表达水平;采用短发卡RNA(shRNA)和过表达技术在RC-4BC垂体瘤细胞中分别敲降POU3F3和过表达miR-127-5p,采用Lipo2000过表达采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和流式细胞术分析POU3F3和miR-127-5p对细胞增殖和周期的影响;采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析POU3F3和miR-127-5p及其靶基因关系;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析POU3F3和miR-127-5p对靶基因表达的影响。组间比较采用 t检验。 结果:与癌旁组织中POU3F3表达水平(1.10±0.19)比较,垂体腺癌组织中POU3F3表达水平(2.84±0.22)显著增加,差异有统计学意义。与癌旁组织中miR-127-5p表达水平(1.04±0.15)比较,垂体腺癌组织中miR-127-5p表达水平(0.34±0.11)显著下调,差异有统计学意义。与对照shRNA组细胞G 0/G 1期、S期和G 2/M期[(37.54±3.45)%、(39.10±3.90)%和(20.58±2.87)%]比较,POU3F3 shRNA组细胞G 0/G 1期比例(64.33±6.24)%显著增加,而S期和G 2/M期比例[(20.14±3.01)%和(14.33±2.88)%]显著下调,差异有统计学意义。与对照mimic组细胞G 0/G 1期、S期和G 2/M期[(35.66±4.02)%、(40.89±4.61)%和(25.33±2.19)%]比较,miR-127-5p minic组细胞G 0/G 1期比例显著增加[(59.48±6.14)%],而S期和G 2/M期比例[(24.23±2.71)%和(17.59±1.99)%]显著下调,差异有统计学意义。miR-127-5p与POU3F3存在碱基配对,FOXD1是miR-127-5p靶基因。与对照shRNA组和对照mimic组细胞FOXD1蛋白表达水平(1.16±0.21、0.97±0.14)比较,POU3F3 shRNA组和miR-127-5p mimic组细胞FOXD1蛋白表达水平(0.22±0.15、0.32±0.12)显著下降,差异有统计学意义。 结论:POU3F3通过miR-127-5p/ FOXD1调控垂体腺癌细胞增殖和周期。
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编辑人员丨3天前
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长链非编码RNA FOXD2-AS1在头颈肿瘤中的研究进展
编辑人员丨3天前
头颈肿瘤包含多种肿瘤类型,鼻咽癌、喉癌是最常见的头颈鳞状细胞癌,甲状腺癌是最常见内分泌性恶性肿瘤。近年来头颈肿瘤的发病率迅速上升,尤其是甲状腺癌;而头颈鳞状细胞癌患者缺乏准确的早期诊断手段,且治疗后期患者易对放化疗产生抵抗,仍需不断探索头颈肿瘤新的诊断和治疗手段。目前大量研究证实长链非编码RNAs可通过多种方式参与头颈肿瘤的发生发展。其中长链非编码RNA FOXD2-AS1已被证实在多种恶性肿瘤中表达异常,本文总结了FOXD2-AS1在头颈肿瘤中的表达情况及其生物学功能,探索FOXD2-AS1在头颈肿瘤诊断及治疗中的潜在价值。
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编辑人员丨3天前
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长链非编码RNA FOXD2-AS1在骨肉瘤中的表达及对骨肉瘤的作用及机制
编辑人员丨3天前
目的:研究长链非编码RNA(lncRNA) FOXD2-AS1在骨肉瘤组织及细胞株中的表达及对细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移的作用与机制。方法:采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测36例骨肉瘤组织与癌旁组织中FOXD2-AS1的表达量并分析其表达与临床特征的关系。检测FOXD2-AS1在骨肉瘤细胞株(MG63,Saos-2,U2-OS,143B)和人成骨细胞株(hFOB1.19)的表达,并选取两种高表达的细胞株敲降其表达,通过细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、膜联蛋白V-异硫氰酸荧光素(Annexin V-FITC)/碘化丙锭(PI)流式细胞术、Transwell实验检测增殖、凋亡、侵袭和迁移,并通过RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA-IP)、蛋白质印迹法(Western blot)和ChIP检测FOXD2-AS1对EZH2和p21的影响。结果:FOXD2-AS1在骨肉瘤组织中的表达高于癌旁组织( t=17.900, P<0.01);并且在体积大、TNM分期高的骨肉瘤组织中表达量更显著( χ2=4.208、9.257, P<0.01)。FOXD2-AS1在骨肉瘤细胞株中的表达量均高于人成骨细胞株( t=14.540、9.970、5.890, P<0.01),尤其是在MG63和Saos-2细胞株中,敲降FOXD2-AS1的表达能够抑制增殖( P<0.05)、促进凋亡( P<0.01)和抑制侵袭和迁移( P<0.01)。RNA-IP、Western blot和ChIP结果显示FOXD2-AS1与EZH2互作,敲降FOXD2-AS1降低了EZH2和H3K27me3与p21启动子区的分子结合。 结论:FOXD2-AS1能够提示临床预后不良,促进骨肉瘤细胞的恶性生物学行为,其机制可能是通过与EZH2互作,从而抑制p21的表达实现的。
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编辑人员丨3天前
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LINC00662/微小RNA-186-5p/叉头框转录因子D1调控乳腺癌MCF-7细胞生物学行为的研究
编辑人员丨3天前
目的:探究LINC00662能否靶向微小RNA(miR)-186-5p/叉头框转录因子D1(FOXD1)轴调控乳腺癌MCF-7细胞增殖、迁移和侵袭。方法:实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测28例乳腺癌组织和癌旁组织中LINC00662、miR-186-5p和FOXD1 mRNA表达,蛋白质印迹法(Western blot)检测FOXD1蛋白表达。分别转染LINC00662小干扰RNA(si-LINC00662)、共转染si-LINC00662与miR-186-5p抑制剂、si-LINC00662与FOXD1过表达载体至MCF-7细胞,细胞计数试剂盒(CCK-8)和克隆形成实验检测细胞增殖,Transwell检测细胞迁移和侵袭,Western blot检测p21、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、基质金属蛋白酶(MMP)-2和FOXD1蛋白表达。双荧光素酶报告系统验证LINC00662与miR-186-5p、miR-186-5p与FOXD1的调控关系,两组间比较采用独立样本 t检验。 结果:乳腺癌组织组中LINC00662(1.01±0.08比2.36±0.09, t=59.324, P<0.01)、FOXD1水平(0.97±0.07比1.93±0.09, t=44.553, P<0.01)高于癌旁组织,miR-186-5p水平(0.96±0.05比0.34±0.04, t=51.236, P<0.01)低于癌旁组织。si-LINC00662组克隆形成数[(114.00±7.93)个比(62.00±5.81)个, t=15.869, P<0.01]、迁移细胞数[(164±10.03)个比(75±7.14)个, t=21.687, P<0.01]、侵袭细胞数[(103.00±7.83)个比(44.00±4.35)个, t=19.761, P<0.01]少于si-NC组,存活率[(100.03±8.12)%比(52.29±5.34)%, t=14.737, P<0.01]、MMP-2(0.71±0.05比0.24±0.03, t=24.181, P<0.01)蛋白水平低于si-NC组,P21(0.15±0.02比0.58±0.04, t=28.845, P<0.01)、E-cadherin(0.23±0.02比0.66±0.04, t=28.845, P<0.01)蛋白水平高于si-NC组。LINC00662靶向负调控miR-186-5p;miR-186-5p靶向负调控FOXD1。si-LINC00662+抗miR-186-5p组克隆形成数[(60.00±±5.62)个比(102.00±7.23)个, t=13.759, P<0.01]、迁移细胞数[(74.00±7.26)个比(131.00±9.91)个, t=13.920, P<0.01]、侵袭细胞数[(45.00±4.41)个比(88.00±5.67)个, t=17.959, P<0.01]多于si-LINC00662+抗miR-NC组,存活率[(52.31±5.35)%比(85.06±6.46)%, t=11.714, P<0.01]、MMP-2(0.23±0.03比0.59±0.04, t=21.600, P<0.01)蛋白水平低于si-LINC00662+抗miR-NC组,P21(0.57±0.04比0.26±0.03, t=17.400, P<0.01)、E-cadherin(0.64±0.04比0.35±0.03, t=12.969, P<0.01)蛋白水平高于si-LINC00662+抗miR-NC组。 结论:LINC00662通过发挥miR-186-5p分子海绵上调FOXD1促进乳腺癌MCF-7细胞增殖、迁移和侵袭。
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编辑人员丨3天前
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长链非编码RNA FOXD3-AS1对乳腺癌细胞增殖和侵袭的调控作用
编辑人员丨3天前
目的:检测长链非编码RNA FOXD3-AS1(lncRNA FOXD3-AS1)在乳腺癌中的表达并观察lncRNA FOXD3-AS1对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响。方法:利用生物信息学的方法对肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌中的表达量进行分析,应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测lncRNA FOXD3-AS1在10例乳腺癌及癌旁正常组织的临床样本及细胞系中的表达。细胞计数试剂盒(CCK-8)、5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)细胞增殖检测试剂盒及集落形成实验检测敲低lncRNA FOXD3-AS1组和阴性对照组细胞增殖能力。Transwell小室法及划痕实验检测检测敲低lncRNA FOXD3-AS1组和阴性对照组细胞迁移和侵袭能力。配对样本采用配对样本 t检验,或独立样本 t检验。 结果:TCGA数据库分析结果显示lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌组织中表达明显升高[0.860(0.152~2.451)比0.032(0.015~0.078), P<0.01]。在10例乳腺癌及癌旁正常组织的临床样本中,利用RT-qPCR结果验证lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌组织中高表达( t=9.297, df=9, P<0.01)。CCK-8实验及EdU实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞的增殖活力明显低于阴性对照组[(15.2±0.93)%比(43.17±1.17)%, P<0.01];克隆形成实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞的克隆形成能力显著低于阴性对照组[(26.33±2.40)个比(66.33±3.28)个, P<0.01]。Transwell迁移实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组的细胞穿膜数量显著低于阴性对照组[(93.67±2.33)个比(170.3±3.48)个, P<0.01;(30.67±1.76)个比(103.00±3.79)个, P<0.01];划痕实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞较阴性对照组细胞更慢的靠近划痕区域(24 h, t=6.149, df=12, P<0.01;48 h, t=7.938, df=12, P<0.01)。 结论:lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌中高表达,并具有促进乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的能力。
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编辑人员丨3天前
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lncR FOXD2-AS1调控miR-145-5p对非小细胞肺癌细胞生物学特性的影响
编辑人员丨2024/5/11
目的 探讨长链非编码RNA(lncR)FOXD2-AS1调控微小RNA(miR)-145-5p对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞增殖、迁移、侵袭和上皮-间质转化(EMT)等生物学特性的影响.方法 体外培养人NSCLC细胞系A549、H1299、SK-MES-1及人正常肺支气管上皮细胞系16HBE,应用RT-qPCR检测各细胞系中lncR-FOXD2-AS1和miR-145-5p表达.选取lncR-FOXD2-AS1相对高表达的SK-MES-1作为敲低实验的研究对象,将SK-MES-1细胞按照转染处理的不同分为NC组(转染si-NC)和si-FOXD2-AS1组(转染si-FOXD2-AS1),转染后,RT-qPCR检测细胞中lncR-FOXD2-AS1、miR-145-5p表达,CCK-8法检测细胞增殖活性,Transwell实验检测细胞迁移、侵袭能力,Western blotting法检测细胞中E-cadherin、N-cadherin、Fibronectin蛋白表达.双荧光素酶报告基因实验验证lncR-FOXD2-AS1和miR-145-5p的相互关系.结果 与16HBE细胞相比,lncR-FOXD2-AS1在NSCLC细胞系中高表达(P<0.05),miR-145-5p在NSCLC细胞系中低表达(P均<0.05).与NC组比较,si-FOXD2-AS1组细胞miR-145-5p表达升高(P<0.05),0、24、48 h时OD值降低(P均<0.05),迁移及侵袭穿膜细胞数减少(P均<0.05),E-cadherin蛋白表达升高(P<0.05),N-cadherin、Fibronectin蛋白表达降低(P均<0.05).双荧光素酶实验证实miR-145-5p是 lncR-FOXD2-AS1的靶基因.结论 lncR-FOXD2-AS1在NSCLC细胞系中表达升高,敲低lncR-FOXD2-AS1通过靶向调控miR-145-5p抑制NSCLC细胞的增殖、迁移、侵袭和EMT进程.
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编辑人员丨2024/5/11
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子宫内膜癌组织中lncRNA HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE的表达与患者临床病理特征及预后的关系
编辑人员丨2024/3/16
目的 探讨子宫内膜癌组织中长链非编码RNA HOXA-AS2(lncRNA HOXA-AS2)、长链非编码RNA FOXD2-AS1(lncRNA FOXD2-AS1)、长链非编码 RNA CRNDE(lncRNA CRNDE)的表达与患者临床病理特征及预后的关系.方法 收集2017年10月至2020年2月于该院住院手术的119例子宫内膜癌患者术中切除的子宫内膜癌的癌组织及癌旁组织标本.回顾性分析组织中HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE相对表达水平,以及三者表达与患者临床病理特征、3年生存率的关系.结果 子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE相对表达水平均高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05).子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE 相对表达水平两两之间均呈正相关(rHOXA-AS2 vs.FOXD2-AS1=0.384,P=0.001;rHOXA-AS2 vs.CRNDE=0.576,P<0.001;rFOXD2-AS1 vs.CRNDE=0.326,P=0.003).HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE高表达组中国际妇产科学联合会分期为Ⅲ+Ⅳ期、发生淋巴结转移、浸润深度为深层、分化程度为低分化的患者所占比例高于低表达组,差异有统计学意义(P<0.05).子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2低表达组3年生存率(52/60,86.67%)高于子宫内膜癌患者癌组织HOXA-AS2高表达组(40/59,67.79%),差异有统计学意义(x2=6.039,P<0.05);子宫内膜癌患者癌组织FOXD2-AS1低表达组3年生存率(53/59,89.83%)高于子宫内膜癌患者癌组织FOXD2-AS1高表达组(39/60,65.00%),差异有统计学意义(x2=10.456,P<0.05);子宫内膜癌患者癌组织CRNDE低表达组3年生存率(51/60,85.00%)高于子宫内膜癌患者癌组织CRNDE 高表达组(41/59,69.49%),差异有统计学意义(x2=4.079,P<0.05).HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE是子宫内膜癌患者死亡的危险因素(P<0.05).结论 子宫内膜癌的癌组织HOXA-AS2、FOXD2-AS1、CRNDE的表达与患者临床病理特征及预后密切相关.
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编辑人员丨2024/3/16
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大黄素抑制胃癌AGS细胞YAP1、FOXD1基因表达及相关机制
编辑人员丨2024/3/2
目的 探讨大黄素抑制胃癌AGS细胞增殖、迁移、侵袭及癌基因YAP1、FOXD1基因表达的可能机制.方法 培养胃正常上皮细胞GES-1与胃癌细胞AGS,使用不同浓度大黄素进行干预.通过CCK8实验、划痕实验、Transwell小室实验验证大黄素处理后AGS细胞的生物学表型变化.使用在线软件分析TCGA数据库中糖酵解代谢关键酶HK2和癌基因YAP1、FOXD1在胃癌组织及正常组织中的表达情况.印迹法验证大黄素对AGS中糖酵解代谢关键酶HK2和癌基因YAP1、FOXD1蛋白的影响变化.添加外源性糖酵解代谢产物丙酮酸,增强糖酵解代谢活性,验证癌基因YAP1和FOXD1的相应变化.结果 胃正常上皮细胞GES-1与胃癌细胞AGS在不同浓度大黄素干预后,发现GES-1的大黄素半数致死量浓度明显高于AGS(P<0.05).进一步的CCK8增殖实验、划痕实验、Transwell小室实验结果均发现大黄素可以明显抑制AGS的增殖、迁移、侵袭等肿瘤生物学能力(P<0.05).TCGA生物信息数据库分析发现糖酵解途径关键酶HK2和癌基因YAP1、FOXD1在胃癌组织中的表达明显高于胃正常组织的表达(P<0.05).大黄素可以明显抑制糖酵解关键酶HK2和癌基因YAP1、FOXD1的蛋白表达(P<0.05).补充外源性糖酵解代谢产物丙酮酸后,癌基因YAP1、FOXD1的蛋白表达显著升高(P<0.05).结论 大黄素对胃癌AGS细胞有显著的药理抑制作用,可以明显抑制其肿瘤生物学表型.大黄素在显著抑制糖酵解代谢关键酶HK2的同时,也显著抑制癌基因YAP1、FOXD1的蛋白表达.当添加外源性丙酮酸增强糖酵解代谢通路后,癌基因YAP1、FOXD1的蛋白表达显著升高.以上提示YAP1、FOXD1和糖酵解代谢的密切相关性,大黄素可能通过抑制胃癌AGS细胞糖酵解代谢,抑制癌基因YAP1 和FOXD1.
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编辑人员丨2024/3/2
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Lnc-FOXD3-AS1通过激活SMAD1/5/8促进缺铁性贫血大鼠体内Hepcidin表达
编辑人员丨2024/2/3
目的:探讨长链非编码RNA FOXD3-AS1(lnc-FOXD3-AS1)对缺铁性贫血(IDA)大鼠模型Hepcidin表达调控作用.方法:无特定病原级(SD 大鼠)接受反复放血和饲喂低铁饲料诱导 IDA 模型.将大鼠分为对照组、IDA组、IDA大鼠经lnc-FOXD3-AS1 过表达治疗组(pcDNA-FOXD3-AS1+IDA组)、IDA大鼠经过表达空载体治疗组(pcDNA-null+IDA 组)、IDA 大鼠经 pcDNA-FOXD3-AS1 联合Smad1/5/8 的激活抑制剂Compound C治疗组(pcDNA-FOXD3-AS1+Compound C+IDA 组),每组 n=8.试剂盒法检测各组大鼠血液中铁含量,用 qRT-PCR 法检测肝脏组织和血清中 lnc-FOXD3-AS1 的表达,western blot和ELISA法检测大鼠肝脏组织和血清 Hepcidin 以及 SMAD1/5/8 蛋白的表达和激活.结果:IDA组的大鼠IDA模型诱导成功.与对照组比,IDA组中大鼠肝脏组织和血清中铁含量维持在缺铁状态(均P<0.05),且 Hepcidin、lnc-FOXD3-AS1 和 SMAD1/5/8 的表达水平都显著降低(均 P<0.05),另外SMAD1/5/8 的磷酸化水平明显降低(P<0.05).与 pcDNA-null+IDA 组比,pcDNA-FOXD3-AS1+IDA组的肝脏组织和血清中铁含量明显增加(均 P<0.05),且 Hepcidin、lnc-FOXD3-AS1 和SMAD1/5/8 的表达水平都显著升高(均P<0.05),另外SMAD1/5/8 的磷酸化水平明显升高(P<0.05).与pcDNA-FOXD3-AS1+IDA组比,pcDNA-FOXD3-AS1+Compound C+IDA组的肝脏组织和血清中铁含量明显减少(均 P<0.05),且 Hepcidin 和和 SMAD1/5/8 的表达水平都显著降低(均 P<0.05).结论:lnc-FOXD3-AS1 在IDA大鼠体内低表达,其通过激活SMAD1/5/8 信号促进IDA大鼠体内Hepcidin 的表达.本研究对于更深入地理解IDA发生的生物学网络机制具有重要意义.
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编辑人员丨2024/2/3
