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长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA对肝癌细胞增殖和肝癌相关基因表达的影响
编辑人员丨1周前
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA))同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖及HCC相关基因表达的影响。方法:15例人HCC组织及癌旁组织由西安交通大学第二附属医院生物诊疗中心样本库于2017年6月至2019年11月收集。采用实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测HOXA11-AS的表达并用RNA荧光原位杂交进行亚细胞定位;通过转染lncRNA Smart Silencer敲低Bel-7402和Hep3细胞中HOXA11-AS的表达,并采用细胞计数试剂(CCK-8)、平板克隆形成实验、流式细胞术检测细胞的增殖、周期及凋亡情况;利用qPCR芯片检测敲低HOXA11-AS对HCC相关基因表达的影响,使用R语言clusterProfiler包对差异基因进行功能富集分析,并通过rescue实验验证差异基因介导HOXA11-AS调控HCC细胞增殖的作用。分别采用 t检验和Turkey检验分析两组或多组间差异。 结果:HOXA11-AS在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织(9.72±5.99比5.53±4.92, t=2.09, P<0.05),在3种HCC细胞系(Bel-7402、HepG2和Hep3B)中的表达显著高于与正常肝细胞系L-O2(1.81±0.33、1.49±0.17、3.53±0.30比1.00±0.02, t=4.20、4.94、14.34, P均<0.05)。RNA荧光原位杂交显示HOXA11-AS在HCC细胞的胞核和胞质均有分布。HOXA11-AS功能缺失实验提示敲低组细胞增殖活性明显低于对照组(Bel-7402:0.95±0.03比1.27±0.07, t=8.60, P<0.01;Hep3B:0.59±0.04比0.74±0.03, t=6.00, P<0.01);敲低组细胞克隆形成数量显著低于对照组(Bel-7402:228.33±25.18比572.33±26.08, t=19.74, P<0.01;Hep3B:112.33±11.50比214.33±14.64, t=9.49, P<0.01);敲低组S期细胞比例显著高于对照组[Bel-7402:(33.13±2.37)%比(18.92±0.49)%, t=10.15, P<0.01;Hep3B:(27.66±0.85)%比(21.88±0.81)%, t=8.48, P<0.01];敲低组凋亡细胞比例显著高于对照组[Bel-7402:(18.50±0.95)%比(15.43±1.24)%, t=3.41, P<0.05;Hep3B:(8.65±0.88)%比(3.28±0.34)%, t=9.82, P<0.01]。qPCR芯片检测显示敲低HOXA11-AS可显著改变46个HCC相关基因的表达,这些基因显著富集于细胞增殖、周期和凋亡等相关生物学过程以及肿瘤坏死因子(TNF)、酪氨酸激酶(JAK)/信号转导与转录激活因子(STAT)、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和Ras等肿瘤相关通路。过表达KIT、SPARC、HDAC10可逆转HOXA11-AS敲低对HCC细胞增殖的抑制作用。 结论:HOXA11-AS在HCC细胞中高表达,可通过影响细胞周期、凋亡以及HCC相关基因的表达促进HCC细胞增殖。
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编辑人员丨1周前
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同源盒基因A11反义RNA在脑胶质瘤中的表达及生物学功能
编辑人员丨1周前
目的:探讨长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA( HOXA11-AS)在脑胶质瘤中的表达及生物学功能。 方法:首先分析 HOXA11-AS在癌症基因组图谱(TCGA)计划数据库(689例)的低级别脑胶质瘤、胶质母细胞瘤以及GTEx数据库(255例)的正常脑组织样本中的表达情况。基于TCGA数据库,进一步分析 HOXA11-AS在世界卫生组织(WHO)Ⅱ~Ⅳ级的脑胶质瘤样本中的表达情况。根据 HOXA11-AS表达量的中位数分为高表达组和低表达组,并绘制Kaplan-Meier生存曲线,采用log-rank检验比较 HOXA11-AS低表达组与高表达组脑胶质瘤患者的生存差异。进一步的体外实验以人星形胶质细胞为对照组,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验验证 HOXA11-AS在脑胶质瘤U251、U87及LN229细胞株中的表达。U87和LN229细胞株中分别使用携带 HOXA11-AS cDNA序列的过表达慢病毒载体构建过表达 HOXA11-AS的细胞株,使用空载慢病毒载体构建对照细胞株。U87和LN229细胞株中分别使用siRNA转染敲低 HOXA11-AS的表达。进一步通过EdU增殖实验、细胞划痕实验和Transwell实验研究 HOXA11-AS对胶质瘤细胞增殖、迁移以及侵袭能力的影响。 结果:HOXA11-AS在正常脑组织、低级别脑胶质瘤及胶质母细胞瘤中表达量的差异具有统计学意义( P<0.001)。TCGA数据库中,WHO Ⅲ、Ⅳ级脑胶质瘤的 HOXA11-AS表达量均高于Ⅱ级脑胶质瘤( P<0.001)。全级别脑胶质瘤患者中, HOXA11-AS高表达组( n=344)的总生存期短于低表达组( n=345, P<0.001)。进一步的体外实验中,qRT-PCR检测结果显示,与对照组比较,U87组、LN229组及U251组 HOXA11-AS的表达均升高(均 P<0.001)。U87和LN229过表达组 HOXA11-AS的表达均较其对照组上调(均 P<0.001)。U87敲低组、LN229敲低组的 HOXA11-AS表达均较其对照组下调(均 P<0.001)。EdU增殖实验结果显示,U87和LN229过表达组的EdU阳性率分别高于U87和LN229对照组(均 P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的EdU阳性率均下降(均 P<0.001)。细胞划痕实验结果显示,U87和LN229过表达组的细胞迁移率分别高于U87和LN229对照组(均 P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的细胞迁移率均下降(均 P<0.001)。Transwell实验结果显示,U87和LN229过表达组的穿胶细胞数分别多于U87对照组和LN229对照组(均 P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的穿胶细胞数均低(均 P<0.05)。 结论:HOXA11-AS在脑胶质瘤中呈高表达,并可促进胶质瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。
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编辑人员丨1周前
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HOXA11-AS在恶性肿瘤中的表达及作用研究
编辑人员丨2023/8/6
长链非编码RNA HOXA11反义RNA(HOXA11-AS)是一种近年来发现的lncRNA.最早使用探针在小鼠胚胎cDNA文库中发现HOXA11-AS,随后在人宫颈癌、胃癌及神经胶质瘤等恶性肿瘤细胞中相继被学者发现并在其中发挥重要作用.HOXA11-AS能够通过与miRNA和EZH2蛋白等相互作用促进肿瘤的增殖、转移等恶性生物学行为,被认为是致癌性lncRNA.HOXA11-AS的发现为肿瘤的防治提供了新的思路.
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编辑人员丨2023/8/6
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HOXA末端转录本反义RNA在肝癌组织中的表达及对肝癌HepG2细胞增殖、侵袭 与迁移能力的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨HOXA末端转录本反义RNA(HOTTIP)在肝癌组织中的表达以及对肝癌HepG2细胞增殖、侵袭与迁移能力的影响.方法 收集2012年1月至2018年6月在辽宁省丹东市第一医院经手术切除的肝癌组织及对应的癌旁组织标本各60例,应用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测HOTTIP在肝癌组织及癌旁组织中的表达情况,并分析表达情况与临床病理特征的关系.通过细胞转染技术构建HOTTIP高表达HepG2细胞株为实验组,设空载质粒pcDNA3.1-NC为对照组.CCK-8法检测HOTTIP对HepG2细胞增殖能力的影响,Transwell法检测HOTTIP对HepG2细胞侵袭与迁移能力的影响.结果HOTTIP mRNA在肝癌组织中的表达高于癌旁组织,差异有统计学意义(1.9±0.6比0.9±0.7,t=6.069,P<0.01).以HOTTIP mRNA表达中位值(1.92)为临界点,将60例肝癌病例分为高表达组(30例)和低表达组(30例).HOTTIP表达与TNM分期、分化程度及淋巴结转移有关(χ2值分别为10.800、8.076、5.711,均P<0.05),与患者年龄、性别、肿瘤直径、肿瘤数目、有无合并肝炎及甲胎蛋白(AFP)水平无关(均P>0.05).RT-qPCR结果显示转染过表达HOTTIP肝癌HepG2细胞中HOTTIP mRNA表达增加,与对照组相比差异有统计学意义(63±6比13±9,t=9.129,P<0.01).CCK-8法实验结果提示HepG2细胞过表达HOTTIP后细胞增殖活力增强(24、36、72 h在490 nm处吸光度分别为1.497±0.017比0.826±0.006、2.002±0.025比1.211±0.020、3.257±0.042比1.772±0.021),差异均有统计学意义(t值分别为5.321、7.349、8.793,均P<0.01).Transwell侵袭实验中,实验组转入底层膜的细胞数为(101±9)个,多于对照组的(41±11)个,差异有统计学意义(t=6.839,P<0.01).Transwell迁移实验中,实验组转入底层膜的细胞数为(112±9)个,多于对照组的(53±11)个,差异有统计学意义(t=7.105,P<0.01).结论 HOTTIP在肝癌组织中表达上调,过表达HOTTIP后能够促进肝癌细胞的增殖、侵袭与迁移.
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编辑人员丨2023/8/6
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lncRNA HOXA11-AS对膀胱尿路上皮癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响及其机制研究
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究lncRNA HOXA11-反义RNA(HOXA11-AS)对膀胱尿路上皮癌J82细胞增殖、侵袭迁移的影响及与微小RNA-515-5p(miR-515-5p)之间的调控关系.方法:qRT-PCR检测膀胱尿路上皮癌组织、癌旁组织和J82细胞中HOXA11-AS和miR-515-5p的转录水平,MTT法和Transwell实验检测J82细胞的增殖、迁移和侵袭能力,Western blot检测细胞中Cyclin D1、p21、p27、MMP-2、MMP-9和MMP-14的表达,双荧光素酶报告系统验证HOXA11-AS和miR-515-5p的结合关系.结果:与正常癌旁组织相比,膀胱尿路上皮癌组织中HOXA11-AS含量显著升高(P<0.05),miR-515-5p的含量显著下降(P<0.05);干扰HOXA11-AS表达可以抑制膀胱尿路上皮癌J82细胞增殖、迁移和侵袭,使Cyclin D1、MMP-2、MMP-9和MMP-14表达下降,p21和p27表达升高;过表达miR-515-5p抑制J82细胞增殖、迁移和侵袭;HOXA11-AS靶向负调控miR-515-5p的表达;抑制miR-515-5p表达可逆转干扰HOXA11-AS表达对J82细胞增殖、迁移和侵袭的作用.结论:LncRNA HOXA11-AS通过靶向miR-515-5p抑制膀胱尿路上皮癌J82细胞增殖、迁移和侵袭.LncRNA HOXA11-AS是膀胱尿路上皮癌的潜在靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA HOXA11-AS在乙肝继发小肝癌中的表达意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)同源异形盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)在乙肝继发小肝癌中的表达意义.方法 选择乙肝肝硬化患者268例,其中200例为单纯乙肝肝硬化患者(肝硬化组),68例为乙肝继发小肝癌患者(小肝癌组),检测2组血细胞中lncRNA HOXA11-AS表达水平,并对其与患者的临床病理特征进行相关性分析.结果 2组的性别、年龄、体重指数、AFP、ALT、AST值对比差异无统计学意义(P>0.05).小肝癌组的lncRNA HOXA11-AS相对表达水平高于肝硬化组(P<0.05).在小肝癌组中,lncRNA HOXA11-AS相对表达水平与肿瘤最大直径、临床分期、远端转移、肿瘤包膜、组织学分化存在相关性(P<0.05).单因素和Cox多因素分析显示临床分期、远端转移、组织学分化、肿瘤包膜为影响lncRNA HOXA11-AS相对表达水平的主要因素(P<0.05).结论 lncRNA HOXA11-AS在乙肝继发小肝癌患者中呈现高表达情况.临床分期、远端转移、组织学分化、肿瘤包膜与lncRNA HOXA11-AS表达存在相关性,也是影响lncRNA HOXA11-AS的主要因素.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA在急性淋巴细胞白血病患儿骨髓中的表达及意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)在急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿骨髓中的表达及意义.方法 选取108例初治ALL患儿及57例非肿瘤性疾病患儿,比较ALL患儿与非肿瘤性疾病患儿、不同ALL病理类型、治疗后不同疗效ALL患儿HOXA11-AS的相对表达量.实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测108例不同临床特征ALL患儿骨髓中HOXA11-AS的相对表达量.结果 108例初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量明显高于非肿瘤性疾病患儿(P﹤0.01),其中,B-ALL型初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量明显低于T-ALL型患儿(P﹤0.01).108例初治ALL患儿经2个周期的化疗后完全缓解46例,未完全缓解62例,完全缓解患儿HOXA11-AS的相对表达量明显低于未完全缓解和初治ALL患儿(P﹤0.01).BCR/ABL融合基因阳性表达初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量,明显高于BCR/ABL融合基因阴性表达患儿(P﹤0.05).结论 HOXA11-AS在ALL患儿中表达上调,并与ALL分型有关,其可能参与ALL的发生发展过程.
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编辑人员丨2023/8/5
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沉默HOXA11-AS靶向miR-766-3p对ox-LDL诱导的血管内皮细胞损伤的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)同源异形盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)靶向微小RNA-766-3p(miR-766-3p)对氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的血管内皮细胞损伤的影响.方法 以100μg/mL的ox-LDL处理人脐静脉血管内皮细胞(human umbilical vein endothelial cell,HUVEC)24 h建立细胞损伤模型.将HUVEC分为对照(con)组、ox-LDL组、ox-LDL+si-NC组、ox-LDL+si-HOXA11-AS组、ox-LDL+miR-NC组、ox-LDL+miR-766-3p组、ox-LDL+si-HOXA11-AS+anti-miR-NC组、ox-LDL+si-HOXA11-AS+anti-miR-766-3p组.RT-qPCR检测HOXA11-AS和miR-766-3p表达.流式细胞术分析细胞凋亡.试剂盒检测LDH释放量、胞内SOD活性.ELISA法检测培养液中TNF-α、IL-1β水平.双荧光素酶报告实验确定HOXA11-AS和miR-766-3p的靶向关系.结果 与con组比较,ox-LDL组HUVEC细胞凋亡率、LDH释放量、HOXA11-AS表达量以及培养液中TNF-α、IL-1β水平显著升高(P<0.05),SOD活性、miR-766-3p表达量显著降低(P<0.05).与ox-LDL+si-NC组比较,ox-LDL+si-HOXA11-AS组HUVEC细胞凋亡率、LDH释放量以及培养液中TNF-α、IL-1β水平显著降低(P<0.05),SOD活性显著升高(P<0.05).与ox-LDL+miR-NC组比较,ox-LDL+miR-766-3p组HUVEC细胞凋亡率、LDH释放量以及培养液中TNF-α、IL-1β水平显著降低(P<0.05),SOD活性显著升高(P<0.05).miR-766-3p是HOXA11-AS的直接靶点.与ox-LDL+si-HOXA11-AS+anti-miR-NC组比较,ox-LDL+si-HOXA11-AS+anti-miR-766-3p组HUVEC细胞凋亡率、LDH释放量以及培养液中TNF-α、IL-1β水平显著升高(P<0.05),SOD活性显著降低(P<0.05).结论 沉默HOXA11-AS通过靶向上调miR-766-3p表达能够抑制ox-LDL诱导的血管内皮细胞凋亡、 氧化应激和炎性反应.
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编辑人员丨2023/8/5
