目的:探讨HOXC10在胃癌中的作用及其与幽门螺杆菌(H.Pylori)感染的关系。方法:mRNA芯片筛选H.Pylori感染胃上皮腺癌细胞系AGS的上调基因，并通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)验证HOXC10的表达差异。免疫组织化学检测H.Pylori感染对胃癌组织HOXC10表达的影响，并在GEO数据集中分析HOXC10与胃癌预后的关系。HOXC10小干扰RNA(siRNA)转染AGS细胞转染后，流式细胞术、细胞计数试剂盒(CCK-8)、Tanswell和成球实验评估H.Pylori对胃癌细胞凋亡、周期、增殖、侵袭、迁移和干性的影响。通过Kaplan-Meier方法及Log-rank(Mantel-Cox)生存期检验进行生存分析。两组间比较采用 t检验，多组间比较采用方差分析并用Neuman-Keuls检验进行两组间比较。 结果:H.Pylori感染AGS细胞后mRNA芯片分析表明HOXC10表达显著上调，并且在胃癌细胞和临床组织中采用RT-qPCR、Western blot和免疫组织化学法也进一步证明H.Pylori感染可导致HOXC10表达上调( t＝12.480、3.916， P<0.01)。此外，GEO数据集(GSE19188和GSE31210)分析显示HOXC10高表达与胃癌患者不良预后相关。siRNA沉默HOXC10表达能明显阻断H.Pylori感染对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移的促进作用( t＝8.818、15.920， P<0.01)；并逆转H.Pylori感染对AGS细胞顺铂耐药性的增强作用[半数抑制浓度(IC 50)：1.550 mg/L比5.442 mg/L， t＝1.342， P<0.01]。成球实验和周期分析结果表明沉默HOXC10表达能显著抑制H.Pylori诱导形成的胃癌干细胞并导致S期阻滞( t＝7.528， P<0.01)，进而降低H.Pylori介导的胃癌细胞顺铂耐药。 结论:H．Pylori可通过上调HOXC10促进胃癌细胞增殖、侵袭和迁移，并抑制S期阻滞，导致胃癌细胞顺铂耐药。

目的:探讨同源盒基因C10(HOXC10)对脑胶质瘤细胞生物学行为的影响及其在肿瘤微环境中的作用机制。方法:应用癌症基因组图谱(TCGA)与中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库分析HOXC10在高级别胶质瘤(胶质母细胞瘤)和低级别胶质瘤中的表达水平及其对患者生存的影响。按照HOXC10-siRNA转染操作说明书分别将HOXC10-siRNA 1(HOXC10-siRNA 1组)、HOXC10-siRNA 2(HOXC10-siRNA 2组)和siRNA NC(NC组)转染至U251细胞，在转染组中分别加入100 ng/ml重组蛋白趋化因子配体2(reCCL2)，记为HOXC10-siRNA 1+reCCL2和HOXC10-siRNA 2+reCCL2组。采用实时荧光定量聚合酶链反应和Western blot法检测各组细胞中HOXC10 mRNA和目的蛋白的表达，细胞计数试剂盒8法检测各组细胞的增殖能力，Transwell实验和划痕实验检测细胞迁移能力，流式细胞术检测细胞凋亡情况，多因子检测各组细胞中趋化因子的表达。共孵育实验检测HOXC10和趋化因子配体2(CCL2)招募并极化肿瘤相关巨噬细胞(M2型巨噬细胞)的作用。结果:TCGA数据库高级别脑胶质瘤中HOXC10中位表达水平(8.51)高于低级别脑胶质瘤(1.00， P<0.001)，CGGA数据库高级别脑胶质瘤中HOXC10中位表达水平(0.83)高于低级别脑胶质瘤(0.00, P<0.001)。TCGA数据库HOXC10高表达患者5年生存率(28.2%)低于HOXC10低表达者(78.7%， P<0.001)，CGGA数据库HOXC10高表达患者5年生存率(20.3%)低于HOXC10低表达者(58.0%, P<0.001)。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组细胞迁移数[分别为(45±3)个和(69±4)个]均低于NC组[(159±3)个，均 P<0.05]。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组48 h细胞迁移率[分别为(15±2)%和(28±4)%]低于NC组[(80±5)%，均 P<0.05]。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组细胞中Vimentin的表达水平分别为141 740.00±34 024.56和94 655.00±5 687.97，N-cadherin的表达水平分别为76 810.00±14.14和94 254.00±701.45，β-catenin的表达水平分别为75 786.50±789.84和107 296.50±9 614.53，均低于与NC组(分别为233 768.50±34 114.37、237 154.50±24 715.50和192 449.50±24 178.10，均 P<0.05)。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组细胞(96 h)吸光度值(分别为0.44±0.05和0.32±0.02)低于NC组(0.92±0.12，均 P<0.05)，HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组细胞凋亡率[分别为(10.23±1.24)%和(13.81±2.16)%]高于NC组[(4.60±0.07)%，均 P<0.05]。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组U251细胞中CCL2的表达水平分别为271.63±44.27和371.66±50.21，低于NC组(933.93±29.84，均 P<0.05)，CCL5(分别为234.81±5.95和232.62±5.72)、CXCL10(分别为544.13±48.14和500.87±15.65)、CXCL11的表达水平(分别为215.75±15.30和176.18 ±16.49)均高于NC组(分别为9.98±0.71、470.54±18.84和13.55±0.73，均 P<0.05)。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组招募CD14 + THP1细胞数分别为(159.33±1.15)个和(170.67±1.15)个，低于NC组[(360.00±7.81)个，均 P<0.05]；HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组招募CD14 + THP1细胞数分别为(159.33±1.15)个和(170.67±1.15)个，低于HOXC10-siRNA 1+reCCL2组和HOXC10-siRNA 2+reCCL2组[分别为(287.00±3.61)个和(280.67±2.31)个，均 P<0.05]。HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组细胞中肿瘤生长因子β表达水平(分别为0.30±0.02和0.28±0.02)低于NC组(1.06±0.10，均 P<0.05)，HOXC10-siRNA 1组和HOXC10-siRNA 2组细胞中NOS2表达水平(分别为11 413.95±1 911.85和5 894±945.21)高于NC组(13.39±4.32，均 P<0.05)。 结论:HOXC10在脑胶质瘤中高表达，且与脑胶质瘤患者不良预后有关。敲低HOXC10的表达可降低人脑胶质瘤U251细胞的增殖、迁移及转移能力。HOXC10在脑胶质瘤微环境中可能通过促进CCL2的表达进而招募并极化肿瘤相关巨噬细胞即M2型巨噬细胞从而发挥免疫抑制的作用。

目的:探讨应用生物信息学筛选的结肠癌细胞焦亡相关基因特点，对基于差异表达的细胞焦亡相关基因构建的结肠癌预后模型予以验证。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载结肠癌患者RNA测序的基因数据和临床数据。通过检索文献确定52个与细胞焦亡相关基因，将其与TCGA数据库中获得的结肠癌和正常结肠组织的RNA测序基因数据集进行对比，获取差异表达的临床样本细胞焦亡基因，应用STRING网站和R软件分析这些基因蛋白质互作网络。依据TCGA数据库临床样本中细胞焦亡基因的差异表达情况，将TCGA数据库中结肠癌患者分为焦亡组和未焦亡组，根据基因表达量，以 P<0.05筛选两组间差异表达明显的基因；基于这些差异表达基因，采用LASSO Cox回归构建细胞焦亡相关的结肠癌预后模型。按照模型计算的风险评分的中位值将从TCGA数据库中收集的患者分为高风险（≥中位值）和低风险（<中位值）两组，通过Kaplan-Meier生存函数分析两组总生存，采用R软件的timeROC程序包分析应用风险评分预测TCGA数据库结肠癌患者生存不同时间的效能。采用多因素Cox回归分析临床病理因素及模型风险评分对TCGA数据库患者生存的影响。通过R软件分析、获取TCGA数据库结肠癌患者高、低风险组间差异基因，应用R软件对差异表达细胞焦亡基因进行基因本体（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析及免疫细胞、免疫功能的单样本基因集富集分析（ssGESA）。 结果:依据TCGA数据库数据获得38个结肠癌组织与正常组织间差异表达的临床样本细胞焦亡相关基因。应用LASSO Cox回归建立了由13个细胞焦亡相关差异表达基因构成的预后模型，即风险评分=0.118×MID2+0.354×IL20RB+0.083×HOXC11+0.011×TMEM88+0.021×SYNGR3+0.246×UPK3B+ 0.030×EGFL7+0.109×TMPRSS11E+0.138×IFITM10+0.161×RNF207+0.097×LINGO1+0.202×HEYL+0.025×ROBO3。生存分析显示，TCGA数据库高风险组的总生存较低风险组差（ P<0.001）；受试者工作特征（ROC）曲线分析显示，预后模型风险评分预测TCGA数据库结肠癌患者生存1、3、5年的曲线下面积均>0.7。多因素Cox回归分析显示，风险评分为TCGA数据库结肠癌患者生存独立影响因素（高风险比低风险： HR=3.988，95% CI 2.865~5.551， P<0.001）。GO和KEGG富集分析显示，TCGA数据库中高、低风险组间差异表达基因（SULF1、FBLN2、COL1A1、DES、SFRP2、FNDC1、MYH11、APOE、C3、SPP1、COL1A2、COL10A1、THBS2、AEBP1、CNN1、IGHG1、SFRP4）在高风险组中均上调，主要与细胞基质结构成分和细胞外基质（ECM）受体相互作用相关。ssGSEA法分析显示，高风险组的免疫细胞浸润水平较高，尤其是B细胞、巨噬细胞、肥大细胞、辅助性T细胞、肿瘤浸润性淋巴细胞明显高于低风险组；免疫功能方面，高风险组趋化因子受体、免疫检查点、人白细胞抗原、副炎症、T细胞抑制、T细胞刺激、Ⅱ型干扰素反应高于低风险组。 结论:基于细胞焦亡相关基因构建的结肠癌预后模型对结肠癌患者预后预测有一定价值。细胞焦亡相关基因在结肠癌的肿瘤免疫中可能发挥重要作用，可以用于结肠癌患者的预后分析。

目的:通过生物信息学方法挖掘与卵巢上皮性癌（卵巢癌）耐药相关的可作为竞争性内源RNA（ceRNA）的长链非编码RNA（lncRNA），并进行临床验证。方法:（1）挖掘与卵巢癌相关的lncRNA并构建ceRNA调控网络：综合应用文本挖掘、数据预测和网络构建等生物信息学方法，建立与卵巢癌耐药相关的潜在ceRNA调控网络，即lncRNA-微小RNA（miRNA）-mRNA调控网络。（2）临床验证：收集2008年6月至2016年10月在广西医科大学附属肿瘤医院行肿瘤细胞减灭术的卵巢癌患者共95例，其中铂类药物耐药患者54例（耐药组），铂类药物敏感患者41例（敏感组），采用实时荧光定量PCR技术检测两组卵巢癌组织中lncRNA的表达，分析lncRNA表达对卵巢癌患者预后的影响，并分析lncRNA表达对卵巢癌耐药的诊断效能。结果:（1）文本挖掘初步筛选出25个与卵巢癌发生、发展相关的差异表达lncRNA；亚细胞定位分析发现，有8个lncRNA存在于细胞质中；通过进一步数据挖掘、共线文献分析，预测其中的两个lncRNA分子［即生长阻滞特异性转录因子5（GAS5）和HOXC基因座转录因子（HOTAIR）］可作为关键ceRNA分子；构建ceRNA调控网络，GAS5与miRNA（即miR139-5p、miR-24-3p）及mRNA［即乳腺癌易感基因1（BRCA1）、肿瘤蛋白p53（TP53）、表皮生长因子受体（EGFR）、B细胞淋巴瘤2基因（BCL-2）、细胞癌基因（FOS）、H-Ras蛋白（HRAS）］组成ceRNA调控网络，HOTAIR与miRNA（即miR-30a-5p）及mRNA［即磷酸肌醇3激酶调控亚基2（PIK3R2）、TP53、丝蛋白（VIM）］组成ceRNA调控网络。（2）实时荧光定量PCR技术检测显示，与敏感组（设为1.0）比较，耐药组卵巢癌组织中GAS5的表达水平为2.1±1.6，HOTAIR的表达水平为3.5±1.9，两组分别比较，差异均有统计学意义（ P=0.011， P<0.01）；Cox回归模型多因素分析显示，GAS5、HOTAIR表达为影响卵巢癌患者无病进展生存率和总生存率的独立危险因素（ P<0.05）。GAS5与HOTAIR联合检测诊断卵巢癌的受试者工作特征（ROC）曲线下面积（AUC）为0.871，显著高于GAS5单独检测和HOTAIR单独检测（AUC分别为0.678、0.863），分别比较，差异均有统计学意义（ P均<0.05）。 结论:GAS5与HOTAIR高表达与卵巢癌耐药密切相关，可作为卵巢癌化疗反应的潜在预测指标；GAS5与HOTAIR联合检测对卵巢癌患者具有一定的诊断效能。这种利用ceRNA调控网络预测关键分子的方法，为卵巢癌的诊断和治疗提供了新的思路。

目的:筛选出斑秃的差异表达基因(differentially expressed gene ，DEGs)，探究其免疫浸润机制并预测中药治疗靶点，为斑秃的发病机制和中医治疗探究提供新的思路。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载斑秃相关基因芯片表达谱；筛选DEGs并进行富集分析；基于String数据库构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction，PPI)，并通过Cytoscape软件筛选关键基因；通过CIBERSORT反卷积法分析免疫细胞浸润相关性；利用医学本体信息检索平台Coremine medical数据库筛选关键基因对应的中药靶点。结果:在3个斑秃芯片样本中共筛选出164个DEGs。GO富集分析显示这164个DEGs主要富集在皮肤发育、分子活性、内肽酶抑制物活性、超分子纤维等方面；KEGG富集分析筛选出金黄色葡萄球菌感染、雌激素信号通路、Wnt信号通路、转化生长因子β(TGF-β)等信号通路。通过PPI分析共筛选出 KRT85、BMP2、KRTAP3-1、KRT27、MSX2、KRTAP11-1、HOXC13、DSG4、KRT82、TCHH这10个关键基因。DEGs与免疫浸润细胞相关性分析结果显示，γδT细胞( P<0.001)、M1巨噬细胞( P<0.001)等差异具有统计学意义。通过Coremine medical数据库映射出黄芪( P＝0.0178)、鳖甲( P＝0.0012)、降香( P＝0.0033)等潜在中药靶点。 结论:本研究利用生物信息学方法筛选斑秃发病相关候选基因，表明其与免疫浸润细胞密切相关，并筛选出了潜在的中药治疗靶点，为深入研究斑秃病理学机制和治疗方法提供了理论依据。

Objective:As an important regulator of embryonic morphogenesis,homeodomain-containing gene 10 (HOXC10) has been found to promote progression of human cancers and its expression indicates poor survival outcome.However,very few studies are available on the role of HOXC10 in gastric carcinoma.Therefore,the aim of this study was to determine the role of HOXC10 in gastric cancer and the potential mechanism underlying its function for cancer biology.Methods:A primary gastric cancer mouse model was obtained via intra-gastric wall injection of gastric cancer cells and was used to evaluate the function of HOXC10 during gastric cancer progression in vivo.Immunohistochemistry was performed to visualize and measure HOXC10 protein expression in gastric cancer tissue.Cells were transfected with plasmids to increase the expression of HOXC10,and siRNA transfection was performed to suppress HOXC10 expression.Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and western blotting were utilized to measure mRNA and protein expression,respectively.Proliferation,migration,and invasion were investigated using 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) assay,wound healing assay,and matrigel invasion assay in vitro,respectively.Results:HOXC10 expression was significantly increased in gastric cancer tissues compared to matched normal tissues.HOXC10 up-regulation significantly increased tumor volumes in nude mice.Plasmid transfection significantly increased HOXC10 protein and mRNA expressions and effectively promoted cell proliferation.Moreover,HOXC10 up-regulation significantly promoted migration and invasion of gastric cancer cells.Mechanistic investigation showed that HOXC10 up-regulation significantly increased mRNA and protein expression of mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling related genes,including c-myc,c-jun and p53,while also modulating the phosphorylation of c-Jun N-terminal kinase (JNK),extracellular signal-regulated kinase (ERK) and P38 but not their total protein levels.Conclusions:This study demonstrated the tight link between HOXC 10 and gastric cancer cell proliferation and metastasis via involvement of the MAPK pathway.

目的:胚胎生育过程中因肢体发育异常造成的出生缺陷比率不低, 其相关基因表达模式尚不明确.本实验通过建立实时定量PCR芯片 (Real-time quantitative polymerasechain reaction array, qPCR array) 检测方案, 研究C57BL/6品系小鼠后肢发育相关基因的表达谱.方法:以同源异形盒基因家族 (Hox) 、Wnt5a、配对同源结构域基因 (Pitx1) 、成纤维生长因子 (Fgf8) 、音猬因子 (Shh) 等小鼠肢体发育相关的重要基因制作基因检测表达谱, 以C57BL/6品系怀孕雌鼠为材料, 取胚胎肢芽发育的四个关键时期 (E10.5, E11.5, E12.5, E13.5) 的胎鼠后肢, 利用qPCR array方案检测表达谱中基因的相对表达水平差异.结果:通过已建立的qPCR array检测了C57BL/6品系小鼠胚胎后肢发育时期Hox家族、Wnt5a、Pitx1、Fgf8、Shh等基因的表达差异.以E10.5为对照, 检测出在后肢发育时期基因呈三种表达模式, 即Hoxb6、Hoxb8、Hoxc8、Hoxc9、Hoxc10、Hoxd9和Shh基因的表达水平呈上调;Hoxa11、Hoxa13、Hoxc12、Hoxc13、Hoxd13等基因表达出现下调;Hoxc9、Hoxc10、Hoxc11、Hoxd9、Hoxd12、Fgf8和Pitx1等基因的相对表达量呈先上调后下调的曲线表达模式, 且有少部分基因在小鼠后肢发育时期表达水平无明显变化.结论:Hox家族、Wnt5a、Pitx1、Fgf8、Shh等基因在小鼠后肢发育时期表达, 并且表达模式存在明显差异.

目的:探讨沉默同源框C10(Homeobox C10,HOXC10)基因表达对骨肉瘤细胞MG-63细胞增殖和凋亡的影响,并初步探讨可能的作用机制.方法:采用脂质体转染法将特异性针对HOXC10基因的shRNA转入骨肉瘤MG-63细胞(HOXC10-shRNA组),同时以转染Scramble-shRNA作为对照组(Scramble-shRNA组),分别应用实时荧光定量PCR及蛋白质印迹法检测HOXC10 mRNA及蛋白的表达水平.转染处理后,分别采用CCK-8法及FCM法检测骨肉瘤MG-63细胞的增殖抑制率及凋亡情况,采用蛋白质印迹法检测HOXC10、ATM和核因子-κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)及凋亡相关蛋白Survivin和Caspase-3的表达水平.结果:HOXC10-shRNA转入MG-63细胞后,HOXC10 mRNA和蛋白的表达水平均明显下调(P均＜0.05).与Scramble-shRNA组细胞活力(0.95±0.12)％和凋亡率(4.35±0.52)％相比,HOXC10-shRNA组细胞活力(0.38±0.06)％明显下降,细胞凋亡率为(18.19±3.76)％明显升高(P均＜0.05);ATM/NF-κB信号通路中相关蛋白ATM、NF-κB及Survivin的表达水平均明显下调(P均＜0.05),而Caspase-3表达明显上调(P＜0.05).结论:沉默HOXC10基因表达后可抑制骨肉瘤MG-63细胞增殖并促进其凋亡,其机制可能与调控ATM/NF-κB信号通路的活化相关.

Objective: Glioblastoma (GBM) is the most common primary malignant brain tumor regulated by numerous genes, with poor survival outcomes and unsatisfactory response to therapy. Therefore, a robust, multi-gene signature-derived model is required to predict the prognosis and treatment response in GBM. Methods: Gene expression data of GBM from TCGA and GEO datasets were used to identify differentially expressed genes (DEGs) through DESeq2 or LIMMA methods. The DEGs were then overlapped and used for survival analysis by univariate and multivariate COX regression. Based on the gene signature of multiple survival-associated DEGs, a risk score model was established, and its prognostic and predictive role was estimated through Kaplan–Meier analysis and log-rank test. Gene set enrichment analysis (GSEA) was conducted to explore high-risk score-associated pathways. Western blot was used for protein detection. Results: Four survival-associated DEGs of GBM were identified: OSMR, HOXC10, SCARA3, and SLC39A10. The four-gene signature-derived risk score was higher in GBM than in normal brain tissues. GBM patients with a high-risk score had poor survival outcomes. The high-risk group treated with temozolomide chemotherapy or radiotherapy survived for a shorter duration than the low-risk group. GSEA showed that the high-risk score was enriched with pathways such as vasculature development and cell adhesion. Western blot confirmed that the proteins of these four genes were differentially expressed in GBM cells. Conclusions: The four-gene signature-derived risk score functions well in predicting the prognosis and treatment response in GBM and will be useful for guiding therapeutic strategies for GBM patients.

目的 探讨地西他滨联合异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)治疗伴TP53突变骨髓增生异常综合征(MDS)老年患者的效果及预后.方法 收集福建医科大学附属协和医院2016年10月收治的1例接受地西他滨联合allo-HSCT治疗的伴TP53突变MDS老年患者的临床资料,并进行文献复习.结果 患者,女性,65岁,入院检查诊断为MDS伴原始细胞增多Ⅱ型.地西他滨治疗1个疗程后缓解,4个疗程时TP53突变转阴,7个月后复发,TP53突变仍为阴性,但检测到CCNB3、HOXC11、RP1L1和DNAH7等基因突变;桥接2个疗程地西他滨再次缓解,行同胞供者全相合allo-HSCT.于移植后第151天发现二次复发,经小剂量阿糖胞苷治疗无效,移植后第239天因病情进展、肺部感染死亡.结论 地西他滨对于伴TP53突变的高危MDS患者有良好效果,但疗效持续时间较短,虽TP53突变被抑制,但新突变的产生可能导致复发,allo-HSCT对伴TP53突变MDS老年患者的不良预后并无显著改善.