-
胰岛素样生长因子2-MRNA结合蛋白2与口腔黏膜黑色素瘤患者病理特征和预后的关系
编辑人员丨5天前
目的:探讨胰岛素样生长因子2-MRNA结合蛋白2(IGF2BP2)表达变化及其与患者临床病理特征和预后的关系。方法:选取驻马店市中心医院收治的口腔黏膜黑色素瘤患者75例,取病理检测的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法检测IGF2BP2蛋白表达,分析肿瘤组织IGF2BP2蛋白表达与患者临床临床病理学的关系。随访3年,统计生存情况,分析肿瘤组织IGF2BP2蛋白表达水平与患者3年生存率的关系。计数资料比较采用卡方检验。结果:癌旁组织IGF2BP2蛋白表达阳性率[17.33%(13/75)]明显低于口腔黏膜黑色素瘤组织[82.67%(62/75)],差异有统计学意义( χ2=15.254, P<0.01)。男性患者IGF2BP2蛋白表达阳性率[82.35%(42/51)]与女性患者肿瘤组织[83.33%(20/24)]比较,差异无统计学意义( χ2=0.574, P>0.05)。年龄≥40岁患者IGF2BP2蛋白表达阳性率[80.49%(33/41)]与女性患者肿瘤组织[82.35%(28/34)]比较,差异无统计学意义( χ2=0.807, P>0.05)。肿瘤直径≥4 cm患者IGF2BP2蛋白表达阳性率[81.40%(35/43)]与肿瘤直径<4 cm患者肿瘤组织[84.38%(27/32)]比较,差异无统计学意义( χ2=0.987, P>0.05)。发病于牙龈患者IGF2BP2蛋白表达阳性率[80.85%(38/47)]与女性患者肿瘤组织[85.71%(24/28)]比较,差异无统计学意义( χ2=0.681, P>0.05)。Ⅰ~Ⅱ期患者IGF2BP2蛋白表达阳性率[76.19%(32/42)]低于Ⅲ~Ⅳ期患者肿瘤组织[90.91%(30/33)]比较,差异有统计学意义( χ2=4.281, P<0.01)。未淋巴结转移患者IGF2BP2蛋白表达阳性率[70.27%(26/37)]与女性患者肿瘤组织[94.74%(36/38)]比较,差异有统计学意义( χ2=8.991, P<0.01)。IGF2BP2低表达患者3年生存率[84.61%(11/13)]明显高于IGF2BP2高表达患者[54.84%(34/62)],差异有统计学意义( χ2=12.984, P<0.01)。单因素回归分析结果显示临床分期、淋巴结转移和IGF2BP2表达水平与口腔黏膜黑色素瘤患者预后有关( r=0.254、0.514、0.198, P均<0.05)。多因素Cox回归模型结果显示IGF2BP2表达水平高表达是口腔黏膜黑色素瘤患者不良预后的危险因素( P<0.05)。 结论:口腔黏膜黑色素瘤组织中IGF2BP2蛋白高表达,与肿瘤临床分期和淋巴结转移等临床病理学特征和预后密切相关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
miR-34家族用于胃癌治疗的分子基础及临床前景
编辑人员丨5天前
miR-34家族在胃癌中起着重要作用,与正常胃黏膜组织相比,在胃癌细胞株和胃癌组织中检测到miR-34家族的失活或表达减低,表明其与胃癌的发生发展有关。研究表明miR-34通过调节IGF2BP3、生存素、Bcl-2以及上皮-间质转化相关通路,在抑制胃癌进展中发挥关键作用,可见miR-34是胃癌治疗的重要靶点。临床治疗方面,miR-34不仅被证实具有放化疗增敏性,并且在肿瘤临床试验中取得了不错的疗效。随着靶向胃癌的miR-34载体出现,使其用于胃癌治疗成为可能。深入了解miR-34用于胃癌治疗的分子基础及临床疗效,有助于评估miR-34家族作为胃癌治疗新靶点的潜力。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
基于TCGA和GEO分析m 6A调控基因在结直肠癌组织中的表达
编辑人员丨5天前
目的:探讨N6-甲基腺嘌呤(m 6A)在结直肠癌组织中表达及临床意义。 方法:2021年9月至2021年12月,利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)对结直肠癌中m 6A相关调控因子的表达进行汇总分析,对不同临床病理特征及分子分型下m 6A调控因子的基因表达进行对比统计,对不同表达m 6A的结直肠癌病例做生存分析。 结果:在TCGA数据库中,胰岛素样生长因子2 mRNA绑定蛋白1(IGF2BP1),胰岛素样生长因子2 mRNA绑定蛋白3(IGF2BP3)和YTH结构域m6A RNA结合蛋白1(YTHDF1)在结直肠癌组织中较正常组织高表达(TCGA-COAD比IGF2BP3:12.80比204.46,logFC=4.00, P=0.003;YTHDF1:2 347.56比3 712.77,logFC=0.66, P < 0.001;TCGA-READ比IGF2BP1:6.20比359.32,logFC=5.82, P=0.007;YTHDF1:2 470.10比4 369.09,logFC=0.82, P=0.020);将TCGA和GEO数据库做交集后,发现甲基转移酶样14(METTL14)、YTH结构域m6A RNA结合蛋白3(YTHDF3)和α-酮戊二酸依赖的加双氧酶AlkB同源蛋白5(ALKBH5)均在结直肠癌组织中下调(TCGA-COAD比METTL14:1 051.56比711.40,logFC=-0.56, P < 0.001;YTHDF3:4 613.85比3 155.05,logFC=-0.55, P < 0.001;ALKBH5:4 250.10比2 555.55,logFC=-0.73, P < 0.001;TCGA-READ比METTL14:1 113.3比674.36,logFC=-0.72, P < 0.001;YTHDF3:5 034.30比3 331.95,logFC=-0.60, P=0.004;ALKBH5:4 902.20比2 529.71,logFC=-0.95, P < 0.001;GEO-CRC比METTL14:6.58比6.33,logFC=-0.06, P < 0.001;YTHDF3:6.28比6.20,logFC=-0.02, P=0.002;ALKBH5:5.07比4.98,logFC=-0.02, P < 0.001)。在不同分子分型结直肠癌中IGF2BP2、HNRNPC、TP53和YTHDF2在KRAS突变中低表达(IGF2BP2:48.53比44.04, t=2.64, P=0.008;HNRNPC:121.30比112.60, t=2.32, P=0.020;TP53:65.30比60.26, t=2.11, P=0.034;YTHDF2:54.07比51.19; t=1.97, P=0.048)。不同临床病理特征分析显示,IGF2BP1在淋巴结阳性(8.97比6.11,W=20 008, P=0.002)、存在远处转移(8.94比6.41,W=19 104, P=0.009)及Ⅲ~Ⅳ期(7.46比7.13,W=8 779, P=0.025)的结直肠癌中较对照组升高。ALKBH5高表达、高龄、存在脉管侵犯和病理分期晚与较短生存期显著相关(ALKBH5高表达比ALKBH5低表达:5.85年比NA, HR:1.63,95% CI:1.071~2.491, P=0.021。> 68岁比 < 68岁:6.78年比NA,HR:1.59,95% CI:1.049~2.422, P=0.047。Ⅲ~Ⅳ期比Ⅰ~Ⅱ期:4.55年比8.33年, HR:2.89,95% CI:1.895~4.425, P < 0.001。有静脉侵犯比无静脉侵犯:5.48年比NA, HR:2.82,95% CI:1.672~4.783, P < 0.001)与生存时间短具有明显相关性。 结论:m 6A中的部分调控因子与结直肠癌的生物学特征及预后相关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
Pax2基因异常参与孤独症谱系障碍发病的生物信息学分析
编辑人员丨5天前
目的:对配对盒2( Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析,探讨 Pax2基因参与ASD发病的可能机制。 方法:(1)将Pathway Commons数据库中与 Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个 Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对 Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法,筛选前10个核心 Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组),采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。 结果:(1)GO分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集,在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集,在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心 Pax2基因相关ASD易感基因为 Gria1、 Dlg2、 Ntrk2、 Grid2、 Igf1、 Jmjd1c、 Ldb1、 Tcf4、 Tcf7l2、 Adrb2。(2)Western blotting实验显示,对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:Pax2基因异常可能导致 Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常,并通过多种机制参与ASD的发病。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
胰岛素样生长因子2信使RNA结合蛋白3对弥漫型胃癌细胞增殖、迁移和M2巨噬细胞极化的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨胰岛素样生长因子2信使RNA(mRNA)结合蛋白3(IGF2BP3)对弥漫型胃癌细胞增殖、迁移和替代活化巨噬细胞(M2)巨噬细胞极化的影响。方法:本研究使用的细胞来源于浙江美森细胞和上海中国科学院细胞库。使用短发夹RNA慢病毒和慢病毒包装质粒分别感染人弥漫型胃癌细胞系NUGC-4和SNU-668,构建IGF2BP3敲低和过表达细胞株以及相应的对照细胞株。应用逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分析各弥漫型胃癌细胞系的IGF2BP3表达水平和转染效率。通过细胞计数试剂盒-8(CCK-8)试验、集落形成试验和划痕试验,探究IGF2BP3对人弥漫型胃癌细胞的增殖和迁移能力的影响。使用佛波酯将人单核细胞THP-1诱导成巨噬细胞,收集对照组和实验组胃癌细胞的条件培养基(CM)处理巨噬细胞,通过RT-qPCR检测M2巨噬细胞标志物分化簇(CD)163、CD206、转化生长因子-β1(TGF-β1)、白细胞介素10(IL-10)和过氧化物酶体增殖激活受体γ(PPARG)。两组间均值比较采用 t检验。 结果:CCK-8试验显示,对照组450 nm吸光度( A450)高于IGF2BP3敲低组(24 h:0.22±0.10比0.10±0.09, t=6.806, P<0.05;48 h:0.46±0.21比0.30±0.10, t=8.372, P<0.05;72 h:0.71±0.38比0.51±0.11, t=7.827, P<0.05;96 h:1.01±0.44比0.79±0.09, t=4.539, P<0.05);而对照组 A450低于IGF2BP3过表达组(24 h:0.25±0.02比0.38±0.01, t=12.074, P<0.05;48 h:0.60±0.02比0.87±0.04, t=9.273, P<0.05;72 h:0.93±0.02比1.36±0.02, t=27.955, P<0.05;96 h:1.40±0.05比1.88±0.08, t=9.057, P<0.05)。集落形成试验结果显示,对照组集落形成率高于IGF2BP3敲低组[(74.73±7.92)%比(52.90±6.25)%, t=3.747, P<0.05];对照组集落形成率低于IGF2BP3过表达组[(23.57±3.96)%比(41.47±3.26)%, t=6.040, P<0.05]。划痕试验显示,对照组划痕愈合率与IGF2BP3敲低组的差异无统计学意义[(3.42±1.68%)%比(2.33±1.66%)%, t=0.802, P>0.05]。对照CM处理组M2巨噬细胞标志物mRNA相对表达量高于IGF2BP3敲低CM处理组(CD163:1.00±0.02比0.18±0.01, t=86.622, P<0.05;CD206:1.00±0.07比0.60±0.08, t=6.303, P<0.05;TGF-β1:1.00±0.01比0.81±0.05, t=7.007, P<0.05;IL-10:1.00±0.01比0.83±0.03, t=9.798, P<0.05;PPARG:1.00±0.02比0.39±0.01, t=41.025, P<0.05);对照CM处理组M2巨噬细胞标志物mRNA相对表达量低于IGF2BP3过表达CM处理组(CD163:1.00±0.05比2.31±0.09, t=22.020, P<0.05;CD206:1.00±0.01比2.07±0.12, t=15.553, P<0.05;TGF-β1:1.00±0.02比1.25±0.03, t=11.128, P<0.05;IL-10:1.00±0.05比1.30±0.13, t=3.623, P<0.05;PPARG:1.00±0.01比1.50±0.02, t=30.753, P<0.05)。 结论:IGF2BP3能促进弥漫型胃癌细胞增殖和刺激巨噬细胞向M2型极化,但对弥漫型胃癌细胞迁移能力无影响。
...不再出现此类内容
编辑人员丨5天前
-
m6A阅读蛋白IGF2BP1对食管鳞状细胞癌细胞生物学行为的影响及其机制探讨
编辑人员丨2周前
本研究旨在探讨胰岛素样生长因子-2 mRNA结合蛋白1(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1,IGF2BP1)对食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)细胞体外功能的影响及其作用机制.利用TIM-ER2.0数据库、免疫组化及实时定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)分析IGF2BP1在ESCC组织和癌旁组织中的蛋白及mRNA水平.采用siRNA敲低IGF2BP1在KYSE30和TE-1细胞中的表达,利用CCK-8实验、平板集落形成实验、划痕愈合实验、Transwell实验以及流式细胞术检测敲低IGF2BP1对细胞功能的影响.利用Western blot检测敲低IGF2BP1对上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关蛋白及PI3K/AKT通路磷酸化水平的影响.利用STRING、GEPIA数据库筛选出与IGF2BP1蛋白互作的其余N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)甲基化酶并进行差异表达分析.通过RM2Target、SRAMP数据库预测下游靶基因及其m6A修饰位点.结果显示,IGF2BP1在ESCC组织和细胞中高表达(P<0.05或P<0.001);敲低IGF2BP1后KYSE30和TE-1细胞增殖、迁移和侵袭能力减弱(P<0.05或P<0.001),细胞凋亡增多(P<0.05或P<0.001),同时促进E-cadherin的表达(P<0.05或P<0.01),抑制N-cadherin、Vimen-tin的表达(P<0.05或P<0.01)以及PI3K/AKT通路的磷酸化(P<0.05或P<0.01);锌指CCCH结构域蛋白13(zinc finger CCCH domain containing protein 13,ZC3H13)与 IGF2BP1 蛋白互作且在 ESCC 中的表达水平与 IGF2BP1 正相关;ZC3H13 和IGF2BP1共同调控的潜在靶基因CNNM2、KIAA1549、SP3均具有高可信度的m6A修饰位点.本研究提示,IGF2BP1可能通过m6A依赖的方式与其余m6A甲基化酶协调作用,激活PI3K/AKT通路的磷酸化而促进ESCC细胞的增殖、迁移、侵袭,抑制细胞凋亡,并促进EMT进程,发挥致癌作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2周前
-
子宫内膜癌组织中IGF2BP1mRNA,PEG10mRNA表达及与增殖基因表达的相关性和预后研究
编辑人员丨3周前
目的 研究子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)组织中胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1,IGF2BP1)mRNA,父系表达遗传印记基因 10(patrilineal expression of genetic imprinting gene 10,PEG 10)mRNA表达及与增殖基因表达的相关性及预后.方法 选取2017年1月~2019年1月湖北理工学院附属妇幼保健院诊治的100例EC患者.实时荧光定量PCR检测EC癌组织和癌旁组织中IGF2BP1 mRNA,PEG 10 mRNA 及增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)mRNA,细胞周期素 Dl(cyclin D1)mRNA,细胞周期蛋白依赖激酶4(cyclin dependent kinase 4,CDK4)mRNA表达.免疫组织化学检测IGF2BP1,PEG 10蛋白表达.相关性采用Pearson相关分析.Kaplan-Meier曲线分析不同IGF2BP1,PEG 10表达组EC患者的预后差异.COX回归分析EC患者的预后影响因素.结果 EC癌组织中IGF2BP1 mRNA(1.84±0.33),PEG 10 mRNA(2.12±0.40),PCNA mRNA(3.14±0.42),cyclinD1 mRNA(2.81±0.36),CDK4 mRNA(2.37±0.34)高于癌旁组织(0.78±0.21,0.91±0.25,0.74±0.13,0.67±0.21,0.59±0.18),差异具有统计学意义(t=25.652~54.588,均P<0.05).癌组织中IGF2BP1(70.00%),PEG10(72.00%)蛋白阳性率高于癌旁组织(100%,9.00%),差异具有统计学意义(x2=75.000,82.363,均P<0.05).EC 中 IGF2BP1 mRNA,PEG 10 mRNA 表达与 PCNA mRNA,cyclinD1 mRNA,CDK4 mRNA 表达呈 正相关(r=0.562~0.625,均P<0.05).EC 中 IGF2BP1 mRNA 与 PEG 10 mRNA表达呈显著正相关(r=0.663,P<0.05).FIGO分期Ⅲ期、并发淋巴结转移EC癌组织中IGF2BP1(86.49%,87.50%),PEG 10(89.19%,90.63%)阳性率高于 FIGO 分期 Ⅰ~Ⅱ 期(60.32%,61.90%)、无淋巴结转移(61.77%,63.24%),差异具有统计学意义(x2=6.863~8.608,均P<0.05).IGF2BP1阳性组患者三年总体生存率70.00%(49/70)低于阴性组的90.00%(27/30);PEG 10阳性组患者三年总体生存率为69.44%(50/72),低于阴性组的92.86%(26/28),差异具有统计学意义(Log-rank x2=4.133,5.491,P=0.042,0.019).FIGO 分期Ⅲ期(OR=1.449,95%CI:1.148~1.830)、并发淋巴结转移(OR=1.442,95%CI:1.124~1.850),IGF2BP1 阳性(OR=1.637,95%CI:1.239~2.163)及 PEG 10 阳性(OR=1.576,95%CI:1.136~1.187)是影响EC患者生存预后的独立危险因素(均P<0.05).结论 EC中IGF2BP1,PEG10表达升高,两者与增殖基因表达呈正相关,是EC预后评估的肿瘤标志物.
...不再出现此类内容
编辑人员丨3周前
-
抑制Hmga2促进小鼠脂肪间充质干细胞成骨分化并加速骨缺损修复
编辑人员丨1个月前
目的 探讨高迁移率族蛋白A2(HMGA2)在脂肪间充质干细胞(ADSCs)成骨分化进程中的作用及其在骨缺损修复中的应用.方法 通过GEO数据库和Rstudio软件,挖掘出在ADSCs"成脂-成骨"分化平衡中的关键节点因子HMGA2,并通过在线蛋白互作网络分析工具String和绘图软件Cytoscape,绘制HMGA2在成骨分化中的互作关系网络,预测其下游作用靶点.设计Hmga2 siRNA并转染小鼠原代脂肪间充质干细胞(mADSCs),诱导其体外成骨分化,在不同时间点(Day 3,Day 7,Day 14)收集样本,通过碱性磷酸酶染色和茜素红染色评估成骨分化能力,并通过RT-qPCR和Western blotting检测成骨特异性标志物Runt相关转录因子2(RUNX2)、骨桥蛋白(OPN)和骨钙素(OCN)的表达.将敲低 Hmga2 的mADSCs移植至小鼠不可自愈合颅骨缺损处,术后6周通过μCT扫描、骨组织学染色检测成骨标志物,评价骨缺损修复效果.结果 GEO数据库分析结果显示HMGA2在ADSCs成脂分化进程中表达上调.蛋白互作网络分析提示在ADSCs成骨分化中,HMGA2的潜在作用靶点包括SMAD7、CDH1、CDH2、SNAI1、SMAD9、IGF2BP3、ALDH1A1.抑制Hmga2后,mADSCs中成骨分化相关标志物RUNX2、OPN和OCN的表达显著上调,且碱性磷酸酶的表达和钙结节的形成增加(P<0.05).在小鼠颅骨缺损模型中,敲低Hmga2促进了骨缺损部位的新骨形成(P<0.05).结论 HMGA2是调控ADSCs成骨分化的重要因子,抑制Hmga2能显著促进ADSCs成骨分化,并加速体内骨缺损的修复.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1个月前
-
USP11调节IGF2BP3介导口腔鳞状细胞癌细胞增殖和侵袭机制研究
编辑人员丨2024/7/6
目的:探究去泛素化酶(USP11)通过调节胰岛素样生长因子2-mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)表达影响口腔鳞状细胞癌(OSCC)恶性表型的分子机制.方法:免疫组化和Western blot检测OSCC患者(n=50)癌组织和癌旁组织中USP11蛋白表达,Western blot检测USP11蛋白在正常人口腔上皮角质细胞(HOK)和人OSCC细胞SCC-25和CAL-27中表达;Kaplan-Meier生存模型分析USP11高低表达对OSCC患者生存率的影响;siRNA USP11(si-USP11)转染SCC-25和CAL-27细胞敲低内源性USP11表达;CCK-8、划痕实验和Transwell实验检测细胞增殖、迁移和侵袭;Western blot检测敲低USP11后的IGF2BP3蛋白表达;敲低USP11和过表达IGF2BP3,检测OSCC细胞增殖、迁移和侵袭的变化;过表达USP11同时敲低IGF2BP3,检测敲低IGF2BP3对USP11过表达OSCC细胞增殖、迁移和侵袭的影响;裸鼠接种SCC-25细胞构建皮下移植瘤模型,考察敲低USP11对SCC-25细胞成瘤抑制作用.结果:与癌旁组织相比,OSCC患者癌组织中USP11蛋白免疫组化评分显著升高(P<0.01);与HOK细胞相比,SCC-25和CAL-27细胞USP11蛋白表达显著增加(P<0.01).敲低USP11降低OSCC细胞增殖、迁移和侵袭能力(P<0.01),下调IGF2BP3蛋白表达.过表达IGF2BP3逆转USP11敲低对OSCC细胞增殖、迁移和侵袭能的抑制作用;敲低IGF2BP3逆转USP11过表达对OSCC细胞增殖、迁移和侵袭的促进作用.裸鼠致瘤性实验显示敲低USP11抑制移植瘤模型中 SCC-25细胞体内生长.结论:USP11在OSCC患者癌组织中表达升高且高表达患者预后更差,USP11通过上调IGF2BP3蛋白表达促进OSCC细胞增殖、迁移和侵袭.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/7/6
-
基于TCGA数据库分析m6A调节因子甲基化修饰对肺腺癌预后的影响
编辑人员丨2024/5/11
目的 通过生物信息学分析探究m6A甲基化调节因子在肺腺癌中的表达及预后.方法 通过TCGA数据库下载516例肺腺癌患者的转录组数据及其临床数据,使用R软件分析比较肺腺癌组织和癌旁组织中20个m6A甲基化调节因子的表达差异,并通过单变量Cox回归分析进行生存分析.通过Consensus Cluster Plus R非监督类的方法进行m6A聚类生存分析.结果 16个m6A甲基化调节因子在肺腺癌中差异表达,其中有5个m6A甲基化调节因子(IGF2BP1、IGF2BP3、HNRNPC、RBMX、YTHDC2)与肿瘤分期、7个m6A甲基化调节因子(IGF2BP1、IGF2BP3、HNRNPC、RBMX、METTL3、YTHDF2、METTL14)与 T 期和 2 个 m6A 甲基化调节因子(IGF2BP3、YTHDC2)与N期显著相关.Cox回归分析结果表明6个m6A甲基化调节因子(IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、HNRNPA2B1、HNRNPC、RBM15)是影响肺腺癌患者预后的独立危险因素.结论 m6A甲基化调节因子与肺腺癌进展有关,6个m6A甲基化调节因子可以作为预测肺腺癌患者预后的潜在生物标志物.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/5/11
