目的 通过基于基因表达综合(GEO)数据集的生物信息学方法筛选和分析甲型H1N1流感病毒性肺炎的潜在生物标志物.方法 从GEO数据库获取甲型H1N1流感病毒性肺炎的数据集,并筛选差异表达基因,使用STRING 12.0数据库和Cytoscape 3.9.1软件对这些差异表达基因进行分析并筛选出Hub基因,使用DAVID数据库对这些差异表达基因进行功能富集分析.结果 筛选出1 019个差异表达基因,其中上调基因522个,下调基因497个.富集结果显示,这些差异表达基因的功能主要富集于细胞质、蛋白质磷酸化、免疫应答、补体成分、激酶活性、T细胞受体信号通路及FoxO信号通路等.最终确定了 CDK1、CCNA2、CCNB2、CDC20、TOP2A、KIF20A、DLGAP5、BUB1、KIF11和TPX2为Hub基因.结论 本研究阐明了 10个Hub基因(CDK1、CCNA2、CCNB2、CDC20、TOP2A、KIF20A、DLGAP5、BUB1、KIF11 和 TPX2)有可能作为甲型H1N1流感病毒性肺炎诊断和治疗的潜在生物标志物,但仍需更多的实验来进一步探索这些Hub基因在甲型H1N1流感病毒性肺炎中的具体机制.

目的:探讨结肠癌转移相关基因1(MACC1)和驱动蛋白超家族23(KIF23)在乳腺癌组织中的表达及其临床意义。方法:收集2015年2月至2020年11月临沂市人民医院和临沂市肿瘤医院病理学确诊的97例乳腺癌组织和对应癌旁组织，使用免疫组织化学方法检测上述组织中MACC1和KIF23表达，进行 χ2检验统计学分析两者的表达与乳腺癌临床病理学参数之间的关系。 结果:MACC1在乳腺癌组织中阳性表达率为71.13%(69/97)，明显高于在癌旁组织中阳性表达率[18.56%(18/97)]，两者差异有统计学意义( χ2＝54.205， P<0.01)。KIF23在乳腺癌组织中阳性表达率为65.98%(64/97)，明显高于在癌旁组织中阳性表达率[20.62%(20/97)]，两者差异有统计学意义( χ2＝40.648， P<0.01)。MACC1在表达水平与乳腺癌肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移明显相关( χ2＝5.026、7.570、4.478， P<0.05)，差异有统计学意义。KIF23表达水平与乳腺癌肿瘤大小、组织学分化程度、TNM分期、淋巴结转移明显相关( χ2＝5.206、8.521、5.165、6.8206， P<0.05)，差异有统计学意义。 结论:检测乳腺癌组织中MACC1和KIF23的表达有助于判断乳腺癌生物学行为。

目的:分析miR-379和人类驱动蛋白家族成员4A(KIF4A)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及其关系。方法:回顾性选取2016年1月至2019年11月在东莞市人民医院普济分院乳腺科确诊的52例TNBC患者作为研究组，另选取同期确诊的70例非三阴性乳腺癌(NTNBC)患者作为对照组，检测两组患者组织中miR-379、KIF4A的mRNA表达水平，绘制受试者工作特征(ROC)曲线，并计算miR-379、KIF4A预测TNBC的曲线下面积(AUC)，分析miR-379、KIF4A表达水平与临床病理参数的关系，并分析miR-379表达水平与KIF4A表达水平的相关性。结果:研究组中KIF4A mRNA的表达水平高于对照组[(6.93±0.43) vs (3.75±0.25)， P<0.05]，miR-379的表达水平低于对照组[(0.54±0.17) vs (0.87±0.32)， P<0.05]；miR-379联合KIF4A检测对TNBC的诊断价值最大：AUC为0.823(95% CI：0.730~0.917)，特异度为0.785，灵敏度为0.950；单因素分析结果显示，不同临床分期、不同肿瘤长径、淋巴结转移与否的TNBC患者miR-379表达比较，差异有统计学意义(均 P<0.05)；不同临床分期、肿瘤长径的TNBC患者KIF4A mRNA表达比较，差异有统计学意义(均 P<0.05)；Pearson相关性分析结果显示，TNBC组织中miR-379和KIF4A的表达呈负相关( r＝－0.349， P<0.05)。 结论:TNBC患者组织中miR-379表达下调，KIF4A表达上调，且与不良临床病理特征有关，对患者病情的评估有一定的指导意义。

目的:探讨驱动蛋白20A（KIF20A）和程序性细胞死亡因子4（PDCD4）与食管癌临床病理特征的关系。方法:收集2021年5月至2023年11月于广东医科大学附属医院诊治的81例食管癌患者的癌组织和癌旁组织标本，通过免疫组织化学法检测KIF20A和PDCD4在食管癌组织和癌旁组织中表达，应用 χ2检验评价其表达与食管癌临床病理特征的关系。 结果:KIF20A在食管癌组织中表达率76.54%（62/81），明显高于癌旁组织中表达率23.46%（19/81），差异有统计学意义（ χ2＝45.654， P<0.01）。PDCD4在食管癌组织中表达率43.21%（35/81），明显低于癌旁组织中表达率86.42%（70/81），差异有统计学意义（ χ2＝33.158， P<0.01）。KIF20A表达水平与食管癌患者性别、年龄无明显相关（ χ2＝0.002、0.055， P>0.05），KIF20A表达水平与食管癌患者组织学分化程度、TNM分期、淋巴结转移明显相关（ χ2＝7.481、6.067、5.284， P<0.05）。PDCD4表达水平与食管癌患者性别、组织学分化程度、年龄无明显相关（ χ2＝0.036、0.040、0.210， P>0.05），PDCD4表达水平与食管癌患者TNM分期、淋巴结转移明显相关（ χ2＝5.044、5.620， P<0.05）。 结论:食管癌组织中KIF20A呈高表达、PDCD呈低表达，KIF20A和PDCD4在食管癌发生、发展过程中起重要作用。

患儿女，3岁3个月。患儿3月龄因"不追视"于外院诊断为"家族性渗出性视网膜病变（FEVR）？发育落后"，为进一步明确诊断于2018年10月首次就诊于北京大学人民医院眼科门诊。患儿为第2胎，第2产，胎龄39周顺产，出生体重3 100 g；否认缺氧窒息史及输血史。母孕早期曾重感冒行口服药、输液治疗（具体用药不详），孕晚期产检B型超声检查提示胎儿双顶径小。父母非近亲结婚。患儿分别于4月龄、6月龄、10月龄、1岁3月龄、2岁4月龄、3岁3月龄于北京大学人民医院眼科门诊复诊。现3岁3个月，患儿不与人交流，低头，会简单地说"爸爸、妈妈"，陌生环境不敢独走。头围（枕额径）45.2 cm（－2 SD），面部宽鼻梁，招风耳，厚下唇，薄上唇。未见下肢及足部淋巴水肿。

目的:观察分析父母均存在家族性渗出性玻璃体视网膜病变（FEVR）相关基因变异的34个家系的临床和遗传学特点。方法:队列研究。2010年1月至2018年12月在上海交通大学附属新华医院眼科及天津医科大学眼科医院眼科就诊并行基因检测的722例FEVR患者中父母均存在FEVR相关基因变异的34个FEVR家系（先证者34例67只眼，其父母68例136只眼）纳入研究。先证者及其父母均行适合各自年龄的全面眼科检查，包括BCVA、眼压、眼轴、裂隙灯显微镜、间接检眼镜、FFA或眼底彩色照相、广域眼底照相检查。根据疾病严重程度将临床表现分为严重表型和轻微表型。纳入34例40岁以上正常健康者作为对照组。采集家系成员及对照组受检者外周血样，对已知参与FEVR的基因FZD4、LRP5、NDP、TSPAN12、ZNF408和KIF11进行高通量测序分子遗传学分析。采用Kruskal-Wallis检验分析基因变异类型与临床表型之间的关系。采用 χ2检验比较FEVR患者群和正常人群FEVR基因变异的差异。 结果:34例先证者67只眼中，严重表型48只眼（71.64% ），轻微表型19只眼（28.36% ）。先证者患者父母68例136只眼中，正常表型76只眼（55.88% ），轻微表型60只眼（44.12% ），未见严重表型。在34例先证者中共检测到FEVR相关基因65种变异，以LRP5突变最为常见（64.61% ），其次是FZD4 （12.31% ）、NDP （10.77% ）、TSPAN12 （6.15% ）、ZNF408(4.62%）和KIF11 （1.54%）基因突变。FEVR相关基因变异以错义突变最常见；但相关性分析结果显示，变异类型与临床表型的严重性无显著相关性（ H=1.775， P=0.620）。65种变异中，21种为已报道突变，44种为本研究新发现的变异。携带单个致病基因多个突变位点20例39只眼，携带2个致病基因突变13例26只眼，携带3个致病基因突变1例2只眼。先证者在LRP5、NDP、ZNF408、FZD4、TSPAN12、KIF11基因上的突变率明显高于对照组，差异有统计学意义（ χ2=64.702， P<0.001 ）。 结论:父母均存在FEVR相关基因突变的家系，其突变基因主要以LRP5最为多见，其次分别为FZD4、NDP、TSPAN12、ZNF408、KIF11。FEVR相关基因突变类型以错义突变最为常见，但临床表型与基因变异类型无明显相关。大多先证者临床表型严重，而携带FEVR致病基因变异的父母大多表现为正常或轻微表型。

目的:探索人乳头状瘤病毒（human papilloma virus，HPV）阳性和阴性头颈部鳞状细胞癌（head and neck squamous cell carcinoma，HNSCC）的差异表达基因及关键通路，为HPV相关HNSCC的诊断和治疗提供候选基因靶点。方法:从美国国立生物技术信息中心(Gene Expression Omnibus,GEO）数据库中检索获得序号为GSE3292的HPV相关HNSCC表达谱芯片研究系列（其中HPV 阳性癌组织8例、阴性28例，含口腔癌15例、口咽癌9例、喉癌9例、下咽癌3例），通过Gene-Cloud of Biotechnology Information（GCBI）分析平台筛选得到差异表达基因，运用DAVID数据库进行基因本体分析和信号通路富集分析。通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络后，利用Cytoscape软件筛选关键基因并进一步行信号通路富集分析，最后使用UALCAN数据分析工具检验关键基因在癌症基因组图谱（the cancer genome atlas，TCGA）数据库中的表达差异性。结果:从芯片检测的25 000多个基因中筛选得到573个差异表达基因，其中上调基因539个，下调基因34个，经Cytoscape两轮筛选确定细胞周期蛋白依赖性激酶1（cyclin-dependent kinases 1，CDK1）、增殖细胞核抗原（proliferating cell nuclear antigen，PCNA）、微小染色体维持蛋白（minichromosome maintenance proteins，MCM）家族（MCM2、MCM3、MCM6、MCM7）、复制因子C4（replication factor C subunit 4，RFC4）、驱动蛋白家族成员11（kinesin family member 11，KIF11）等27个基因为关键基因。基因本体分析和信号通路富集分析显示差异表达基因主要分布于染色体及核质、核内腔、膜包围内腔等部位，并参与DNA复制、DNA代谢、细胞周期、细胞分裂等生物学过程以及以p53信号通路为核心的6个主要信号通路（ P<0.01）。经TCGA数据库检验证实27个关键基因在HPV阳性及阴性HNSCC中的表达差异均有统计学意义（ P<0.01）。 结论:CDK1、PCNA、MCM家族等关键基因在HPV诱发HNSCC的过程中发挥重要作用，而p53通路是此过程的核心通路，且在HNSCC两个亚型中的调控作用存在差异。CDK1、MCM7、RFC4有望成为治疗HPV阳性HNSCC的潜在靶点，而MCM2、MCM3、PCNA、KIF11可能作为HPV阳性HNSCC诊断及预后的标志物。

目的:探讨驱动蛋白家族20A(KIF20A)和星形细胞上调基因-1(AEG-1)与原发性肝癌(PLC)临床病理特征关系。方法:采用免疫组织化学法检测2011年2月～2019年8月广东医科大学附属医院收治69例PLC、33例肝硬化和17例正常肝组织中KIF20A和AEG-1表达，各组间比较采用 χ2检验。 结果:KIF20A在正常肝组织、肝硬化组织与PLC组织中的阳性表达率分别为5.88%(1/17)、33.33%(11/33)、73.91%(51/69)，两两之间比较差异有统计学意义( t＝ 4.635、26.407、15.422， P<0.05)，KIF20A表达水平与PLC血管浸润和TNM分期明显相关( t＝6.067、7.753， P<0.05)；AEG-1在正常肝组织、肝硬化组织与PLC组织中的阳性表达率分别为11.76%(2/17)、42.42%(14/33)、72.46%(50/69)，两两之间比较差异有统计学意义( t＝ 4.847、21.022、8.618， P<0.05)，AEG-1表达水平与PLC血管浸润、肿瘤大小、TNM分期明显相关( t＝ 4.804、6.355、6.355， P<0.05)。 结论:检测KIF20A和AEG-1有助于评估PLC患者病情。

目的:探讨无脑回-巨脑回畸形患儿的临床特征及遗传病因学机制，分析其临床表型与基因型的关系。方法:收集2016年10月至2017年12月在深圳市儿童医院神经内科诊治的21例无脑回-巨脑回畸形患儿的临床资料并进行随访，对所有患儿进行全基因组测序分析。结果:21例患儿中伴癫痫18例(86%)，不伴癫痫3例(14%)；癫痫起病年龄较小，1岁以内起病16例(89%)；其中单纯巨脑回畸形16例(76%)，无脑回合并巨脑回畸形3例(14%)，单纯无脑回畸形2例(10%)。癫痫综合征主要包括West综合征12例(67%)，大田原综合征2例(11%)，其他癫痫性脑病2例(11%)，局灶性癫痫2例(11%)。头颅磁共振成像(MRI)提示单纯巨脑回畸形占多数，其中广泛性巨脑回畸形更多见(56%，9/16例)。全基因组测序结果：检出与无脑回-巨脑回畸形明确相关的致病/疑似致病性单核苷酸变异(SNV)/拷贝数变异(CNV)13例，检出率为62%， PAFAH1B1基因变异4例，染色体17p13.3微缺失综合征(导致 PAFAH1B1整个基因缺失)6例， DCX、KIF2A、PIK3R2基因变异各1例。其中 PAFAH1B1基因变异或缺失导致无脑回-巨脑回畸形占比48%(10/21例)，并以顶枕叶或广泛性脑回畸形为主要改变。既往未见报道的新变异有 PAFAH1B1：c.1067G>A、 PAFAH1B1：c.897delT及 KIF2A：c.2225delG。 结论:无脑回-巨脑回畸形多伴癫痫，以West综合征常见，头颅MRI提示广泛性巨脑回畸形多见。 PAFAH1B1基因变异或缺失是导致无脑回-巨脑回畸形的主要原因。新变异的发现丰富了无脑回-巨脑回畸形的基因型谱数据库。

家族性渗出性玻璃体视网膜病变（FEVR）是一种严重的遗传性视网膜血管疾病。其临床表现多样，患者病情轻重不一，严重者可能双眼致盲。FEVR的致病基因也十分复杂，目前已发现的经典和候选致病基因有十余种，包括 NDP、 FZD4、 LRP5、 TSPAN12、 CTNNB1、 KIF11、 ZNF408、 RCBTB1、 LRP6、 CTNNA1、 CTNND1、 JAG1、 ILK、 ATOH7、 DLG1、 DOCK6、 ARHGP31和EVR3区域。这些致病基因涉及Wnt/β-连环蛋白路径、Norrin/β-连环蛋白路径、Notch通路等多个信号通路，通过调控和影响视网膜浅层、深层血管发育以及玻璃体血管退化、血管内皮细胞间连接和血视网膜屏障稳态等结构和生理病理过程来最终导致疾病发生发展。