目的:了解烟台地区非O1/O139群霍乱弧菌致病性现状。方法:分别于2020年7月和11月、2021年的1月和4月对烟台市某两条河入海口采集样本32份，获得22株非O1/O139群霍乱弧菌分离菌株，采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对分离菌株进行分子分型，采用聚合酶链式反应（PCR）方法对该22株分离菌株的毒力基因 ctxA、 ctxB、 ace、 cep、 zot、 rtxA、 hlyA、 toxR、 tcpA和 cri进行检测分析。 结果:22株非O1/O139群霍乱弧菌菌株间的条带相似度为23.0%~100.0%，分为17个PFGE型，呈高度的多态性带型分布。22株非O1/O139群霍乱弧菌分离株主要携带3种毒力基因（ rtxA、 tcpA和 zot），其中携带 rtxA和 tcpA最多，均为17株，其次是 zot，共14株。14株菌株同时携带 rtxA、 tcpA和 zot，5株不携带上述毒力基因。 结论:烟台地区入海口流行的非O1/O139群霍乱弧菌株污染情况多样化，主要携带具有黏附、毒素以及损伤小肠表皮细胞等方面的致病基因。

目的:分析霍乱弧菌O1血清群El Tor产毒株基因组的重组特征。方法:在美国国立生物技术信息中心数据库中，选取分离时间从1937—2015年的292株霍乱弧菌O1血清群El Tor菌株完成图序列或草图序列，以菌株N16961的基因组序列为参照，使用snippy软件获得菌株的全基因组比对信息，利用ClonalFrameML软件对数据进行重组分析，比较大小染色体间重组数目及重组区域总长度的差异，以及不同分离地区菌株的基因组重组片段数目和总长度的差异。使用KOBAS分析工具对重组热点基因进行基因本体富集分析。结果:292株霍乱弧菌菌株中，发生基因重组163株（55.8%）；其中，归一化处理的小染色体重组片段数目 M（ P 25， P 75）为4.7×10 -6（9.3×10 -7，2.0×10 -5），大于大染色体[2.4×10 -6（3.4×10 -7，5.7×10 -6）]（ P<0.001）；小染色体重组区域占小染色体长度的比例 M（ P 25， P 75）7.1%×10 -5（3.7%×10 -6，4.8%×10 -4），大于大染色体[2.2%×10 -5（2.4%×10 -6，8.4%×10 -5）]（ P<0.001）。分离自非洲、亚洲、欧洲、北美洲和南美洲的菌株重组片段数目 M（ P25， P75）分别为23（1.0，33.0）、1.0（0.0，34.0）、6.0（2.0，13.0）、0.0（0.0，1.0）和29.5（6.8，56.8）（ P<0.001）；分离自各大洲的菌株重组区域总长度 M（ P25， P75）分别为233.0（4.0，461.0）、11.0（0.0，695.5）、56.0（4.0，111.0）、0.0（0.0，9.0）和347.5（132.8，1 323.5）bp（ P<0.001）。富集分析结果显示，62个重组热点编码基因的功能主要集中在趋化、趋性、对外界刺激的反应、受体活性和分子转导活性。 结论:霍乱弧菌El Tor大小染色体的重组片段数目及区域长度存在差别，不同大洲菌株重组片段数目及重组区域总长度不同。

非O1、非O139群霍乱弧菌(non-O1 non-O139 Vibrio cholerae，NOVC)感染常与腹泻、肠道外感染有关，如菌血症、中耳炎、皮肤和软组织感染，口腔感染NOVC的病例极少被报道。现报道1例食管癌术后化学治疗患者口腔出现NOVC感染。患者以腹泻、腹痛伴发热起病，口唇和脸颊出现血疱，上下唇内侧和上腭黏膜出现广泛糜烂，舌底出现较大溃疡创面，经过抗菌药物治疗后腹泻好转，口腔感染症状消失。

非O1群、非O139群霍乱弧菌感染病情隐匿，在我国属于少见病，临床工作中普遍对该疾病认识不足，易出现误诊、漏诊，因此早期识别和诊治尤为重要。现回顾分析1例非O1群、非O139群霍乱弧菌引起的肛周脓肿患者的诊治经过，结合文献归纳我国非O1群、非O139群霍乱弧菌肠外侵袭性感染的临床特征，为该病的诊断和治疗提供经验。

目的:通过分析一起因食用被污染田螺引起的霍乱疫情进行流调病学调查和应急处置，为霍乱疫情防控提供科学依据。方法:2023年1月1日至6月30日，广州市白云区医疗机构采用现场流行病学方法开展辖区内腹泻病例搜索，对霍乱疫情涉及病例及密切接触者开展流行病学调查，采集可疑食物和可能污染环境样本并开展溯源排查。结果:本次疫情病原体为非产毒O1群小川型霍乱弧菌，涉及确诊病例1例，病例表现为腹泻、稀水样便。现场流调推测可疑饮食史为外带田螺，应急监测采样102份（密接人群肛拭子13份，水产品29份，外环境46份，污水3份，江河水样本11份），其中阳性11份（污水3份，田螺3份，田螺售卖档口外环境涂抹5份），结果均为非产毒O1群小川型霍乱弧菌。结论:本起疫情为霍乱弧菌O1群引起的散发疫情，经流调溯源确定传染源为被污染田螺，传播途径为田螺未加工熟透，经食用后引起发病。本次处置提示对霍乱的高效监测能及时发现并有效阻断霍乱疫情的传播。

目的:分析1株从菌血症患者血液中分离到的O139群霍乱弧菌产毒株的耐药性及基因组特征。方法:使用肉汤稀释法和全自动药敏分析仪测定菌株的抗生素敏感性，使用二代基因测序和纳米孔测序获得菌株的完整基因组序列，使用BLAST在线比对与CARD、Resfinder、ISfinder、VFDB等数据库进行比对分析，明确菌株携带的耐药基因、插入序列和毒力基因等，使用MEGA 5.1软件构建基于核心基因组单核苷酸多态性的遗传系统发生树。结果:霍乱弧菌SH400为O139群产霍乱毒素的菌株，携带了多个毒力相关基因和4个毒力岛。该菌株对链霉素、四环素、磺胺甲恶唑/甲氧苄啶耐药并携带了相应的耐药基因。该菌株携带了大小为172 914 bp并且含有10种耐药基因的IncA/C型质粒。结合基因组进化关系发现，菌株间携带耐药基因和耐药质粒的情况呈现出一定聚集性。菌株SH400的传统ST型为ST69，cgMLST型为与cgST-252高度相似的新型别。结论:该株O139群霍乱弧菌携带 ctxAB毒力基因、多种耐药基因和IncA/C型质粒，且存在多重耐药岛。

目的:分析2015-2021年北京市霍乱弧菌的病原学和流行特征，为霍乱防控提供参考。方法:对北京市2015-2021年分离到的霍乱弧菌，进行血清分型、毒力基因检测和PFGE实验；对收集的霍乱病例流行病学和临床资料，用描述性流行病学方法分析其流行特征。结果:北京市2015-2021年共分离76株O1群霍乱弧菌（来源分别为人源性61株、环境涂抹10株和水产品5株），包括68株小川型菌株和8株稻叶型菌株，其中6株为O1群小川型菌株 ctxAB基因阳性，均分离自散发病例。PFGE结果显示，76株分为33种带型。北京市2015-2021年共报告霍乱疫情38起，以散发疫情为主（92.11%，35/38）；累计报告病例45例，6-9月占97.78%（44/45）。北京市有9个行政区报告霍乱病例，朝阳区和昌平区分别占42.22%（19/45）和31.11%（14/45）；霍乱病例的年龄分布在19~63岁，44例病例均出现腹泻症状，1例临床症状不详。腹泻次数为3~9次/d的占84.09%（37/44）。临床症状中，出现黄色稀水样便、腹痛、恶心/呕吐和发热的分别占95.45%（42/44）、68.18%（30/44）、40.91%（18/44）和36.36%（16/44）。 结论:2015-2021年北京市分离到的霍乱弧菌以O1群小川型为主，PFGE带型多样；北京市有9个行政区报告霍乱疫情，以散发为主，6-9月为疫情高峰。

目的 对2022年陕西省城固县1起霍乱疫情调查溯源.方法 对病例进行个案调查,对现场环境进行卫生学调查,收集当地气温及降水资料.采集病例、同餐人员及同期腹泻患者粪便或肛拭子样本,采集剩余食品、环境水体、水产品样本,进行霍乱弧菌核酸检测及分离培养.对分离到的霍乱弧菌进行血清学和质谱鉴定,利用国家致病菌识别网药物敏感试验指南进行药敏试验,提取菌株DNA进行毒力基因检测,利用二代测序平台进行全基因组测序,用测序拼接数据进行毒力基因及耐药基因预测,与既往分离的霍乱弧菌、pubMLST下载的国内外霍乱弧菌基因组序列进行核心基因组多位点序列分析(cgMLST)及核心基因组单核苷酸多态性分析(cgSNP).结果 本起疫情从1例霍乱病例和1例带菌者中各分离到1株霍乱弧菌,均为O139群,携带ctxAB毒力基因,对磺胺类、碳青霉烯类、三代头孢菌素类、喹诺酮类、β-内酰胺类药物均敏感,而对氯霉素、多粘菌素类、四环素类、氨基糖苷类有抗药性;cgMLST分析结果显示,菌株为大流行菌克隆株序列型(ST)69型,与陕西省既往霍乱菌株无关联.同餐人员及同期腹泻病例共106人均未检出霍乱弧菌.水体样本96份,鱼类样本35份,环境样本7份,畜禽粪便样本7份.经霍乱弧菌核酸检测阳性2份,分别为文川河某处采集的鱼类样本2份中检出霍乱弧菌hlyA、O139群基因核酸阳性,ctxAB毒力基因阴性.结论 本起疫情为霍乱弧菌O139群引起的散发疫情,其病原为国内的大流行菌株,感染来源可能与水产品污染有关,高温、干旱等因素是霍乱发生的原因之一.

目的 对2018-2023年福州市分离的霍乱弧菌进行全基因组测序,预测毒力基因、耐药基因和序列位点信息,分析不同菌株间遗传关系,为防治霍乱提供依据.方法 对60株霍乱弧菌进行全基因组序列测定,运用生物信息学软件对测序数据进行质控、基因组装和预测,采用PubMLST、ResFinder、VFDB等数据库预测不同菌株的多位点序列分型、耐药基因和毒力基因情况,结合NCBI数据库,经核心基因组单核苷酸多态性(core genes Single Nucleotide Poly-morphism,cgSNP)系统发育分析和去重组分析,采取最大似然法构建系统发育树.结果 60株霍乱弧菌基于7个管家基因分型,获得16种已知序列型(sequence type,ST)和38种新分配的ST,O1群临床分离株H339为ST75,O1群食品分离株H13、H363和H381均为ST175,非O1/非O139 群霍乱弧菌(non-O1/non-O139 Vibrio cholerae,NOVC)分离株H263、H357均为ST1218,H293、H306均为ST1700,H311、H314、H316均为ST1699,其余分离株存在多样性.共预测29种耐药基因,包括喹诺酮类、叶酸通路拮抗剂类、氨基糖苷类和β-内酰胺等,大部分菌株携带喹诺酮类耐药基因.经过VFDB数据库预测,所有病原菌株均含有rtx、hlyA毒力因子,96.7%(58/60)菌株携带tlh基因,O1群分离株均携带tcp、zot、ace基因,O1群临床分离株携带ctxA基因.全基因组系统发育树进化分析将全部菌株分为20个分支,基因组高度分歧.结论 新发现38种STs.O1群食品分离株之间存在遗传相关性,O1群临床分离株与O1群食品分离株之间、O1群与NOVC菌株之间亲缘关系较远,分离菌株存在多样性.此项研究能够为食源性疾病溯源提供数据支持.

目的 了解非01/非0139群霍乱弧菌感染的流行病学特征、临床表现、诊断及治疗,以期提高对该病的认识.方法 对1例非01/非0139群霍乱弧菌血流感染患者的临床表现、实验室检查、治疗及转归进行回顾性分析,并以"非01/非0139群霍乱弧菌"和"血流感染"为主题词,检索万方、维普和中国知网数据库,以"non-01/non-0139 Vibrio cholerae"和"bloodstream infection"为主题词检索PubMed数据库,获取国内外报道的病例,复习非01/非0139群霍乱弧菌血流感染的临床特征及诊疗方法.结果 该例69岁男性患者肝门部胆管癌术后6个月,腹胀、发热、无腹泻,血培养检测出霍乱弧菌,经质谱、VITEK 2XL和16S rRNA基因鉴定均为霍乱弧菌,血清学确认为非01/非0139群.使用哌拉西林抗感染治疗10 d后,患者康复出院.通过文献复习发现26例非01/非0139群霍乱弧菌血流感染患者大多数有慢性肝炎、肝硬化等消化道基础疾病,主要症状为急性腹泻、腹胀腹痛、发热、恶心、呕吐等.菌株对多种抗菌药物敏感,予抗感染及对症治疗后80.77％患者好转出院,15.38％死亡,主要因感染性休克引起的多器官衰竭而死亡.结论 非01/非0139群霍乱弧菌血流感染好发于免疫功能低下者,尤其是慢性肝炎、肝硬化、恶性肿瘤、糖尿病患者,及时血培养检查和准确鉴定对其诊断非常重要.早期应用敏感抗生素治疗预后相对较好.