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一例PDHA1突变致女婴丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症临床及遗传学分析并文献复习
编辑人员丨6天前
目的:探讨丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症的临床特征及基因突变遗传学特点。方法:回顾性分析由河北省人民医院确诊的1例丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症罕见女婴患儿的临床特点及基因学特征,并结合本病的研究进展做文献复习。结果:罕见女婴发病,起病早,重度精神运动发育落后,持续高乳酸、高丙酮酸血症,代谢性酸中毒,头颅MRI显示透明隔较小,隔间腔缺如;穹隆显示不明确,胼胝体压部细小,呈蓬状向前突。第三脑室顶向背侧抬高,左侧侧脑室扩张向右侧突,左侧室间孔明显扩大。脑电图间歇期:左侧后头部(O1、T5)导联可见大量中高幅棘慢波、慢波,少量多棘慢波散发或连续发放。双侧半球各导联可见大量低幅慢波活动。二代基因测序发现患儿PDHA1基因在chrX-19371287位置有C>T(p.A169V)的杂合错义突变,父母PDHA1基因未见该突变。确诊为丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症。结论:PDHA1突变所致的丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症在早期缺乏特异性表现,且女性患者因有X染色体随机失活,更为少见。对原因不明的精神运动发育落后、持续高乳酸血症、难以纠正的代谢性酸中毒患儿,需警惕该病。可通过基因分析诊断。
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编辑人员丨6天前
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一例锥体束受累的丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症的 PDHA1基因变异分析
编辑人员丨6天前
目的:对1例表现为发作性共济失调合并锥体束征阳性患者的 PDHA1基因进行变异分析,明确其致病原因并探讨其可能的机制。 方法:应用高通量测序、Sanger测序及SCA动态变异位点检测并分析。结果:患者为青少年男性,表现为发作性共济失调,双侧膝反射亢进,踝阵挛(+)。基因检测结果显示患者的 PDHA1基因发生了c.1159-1162dupAAGT变异,父、母和胞姐未携带此变异,提示为新生变异,而SCA动态变异未见异常,患者确诊为丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症。 结论:PDHA1基因c.1159-1162dupAAGT变异可能为患者的致病原因,丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症患者表型复杂,极少数可有锥体束受累,可能与早期神经元发育受影响有关。
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编辑人员丨6天前
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丙酮酸脱氢酶E1-α缺乏症产前诊断1例
编辑人员丨6天前
本文报道了1例由产前超声提示胎儿脑部发育异常、引产后全外显子组测序及Sanger验证确诊的丙酮酸脱氢酶E1-α缺乏症病例。孕25周 +1时超声提示胎儿双侧侧脑室轻度增宽,颅内出血可能,复查MRI提示胎儿胼胝体缺如、双侧侧脑室增宽、室旁囊肿。经遗传咨询及慎重考虑后,胎儿父母选择终止妊娠。为明确病因,取引产胎儿皮肤组织进行全外显子组测序,发现胎儿 PDHA1基因的10号外显子发生移码变异c.924_930dup(p.R311Gfs*5),Sanger测序验证该位点结果与全外显子组测序结果一致,且为新发的致病性变异,确诊为丙酮酸脱氢酶E1-α缺乏症。
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编辑人员丨6天前
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PDHA1、GBP1蛋白在非小细胞肺癌中的表达及与临床病理特征的关系
编辑人员丨6天前
目的:探讨PDHA1、GBP1蛋白在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及与临床病理特征的关系。方法:选取延安大学附属医院2016年1月至2019年1月收治的102例NSCLC患者,取NSCLC组织、癌旁组织进行免疫组织化学分析,统计PDHA1蛋白及GBP1蛋白在NSCLC中的表达水平,并分析PDHA1、GBP1蛋白与临床病理特征的关系。结果:PDHA1蛋白在NSCLC组织中的阳性表达率低于对应癌旁组织中,差异有统计学意义( χ2=3.903, P=0.018)。GBP1蛋白在NSCLC组织中的阳性表达率高于对应癌旁组织( χ2=21.355, P<0.001),PDHA1蛋白及GBP1蛋白与组织分化程度、淋巴结是否转移及TNM分期有关( P值均<0.05)。PDHA1、GBP1蛋白的表达在NSCLC组织中有相关性( r=-0.306, P=0.003)。 结论:在NSCLC组织中,PDHA1蛋白低表达,GBP1蛋白高表达。两者均与组织分化程度、淋巴结是否转移及TNM分期有关,对NSCLC肿瘤筛查、诊断、预后以及指导治疗方面均有一定意义。
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编辑人员丨6天前
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PDHA1基因突变所致丙酮酸脱氢酶复合物缺乏症研究进展
编辑人员丨6天前
丙酮酸脱氢酶复合物(pyruvate dehydrogenase complex,PDC)是糖代谢过程中所需的关键酶,能将丙酮酸转化成乙酰CoA进而完成三羧酸循环。PDC缺乏会造成丙酮酸代谢障碍,从而引起一系列临床表现如颅脑畸形、神经肌肉功能障碍、酸中毒等。目前临床报道的PDC缺乏症绝大部分是由X连锁的 PDHA1基因突变后PDC酶活性降低导致的。由于PDC缺乏症的发病率低,临床症状复杂,且多为个案报道,因此,本文主要针对 PDHA1基因突变后的致病机制、临床特点和治疗进行总结,加深对该疾病的认识。
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编辑人员丨6天前
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儿童Leigh综合征的临床分析及 PDHA1基因变异功能初步研究
编辑人员丨6天前
目的:回顾性分析儿童Leigh综合征(Leigh syndrome,LS)的临床及分子遗传学特点。方法:收集2012年9月至2021年5月于福建省立医院儿科确诊为LS的9例患儿的临床资料及基因检测等结果进行分析和总结;同时利用计算机软件预测基因 PDHA1(c.124G>A)变异型蛋白的三维结构,对比野生型和变异型结构,评估 PDHA1基因变异对蛋白质结构的影响。 结果:9例LS患儿男5例,女4例,中位起病年龄10个月;主要表现为精神运动发育迟缓或倒退、癫痫发作、喂养困难、营养不良、呼吸异常、听力异常等;颅脑MRI提示病变仅累及脑干4例,其中2例病变进展并累及基底节或丘脑;基底节和小脑同时受累2例,1例同时累及脑干、大脑皮层及乳头体;脑萎缩和脑积水各1例。核基因变异2例,线粒体基因变异7例;与野生型PDHA1蛋白结构对比,变异型PDHA1蛋白侧链结构发生变化。结论:LS具有显著的临床和遗传异质性;本文报道了LS可导致乳头体病变;报道2例核DNA(nDNA)变异,分别是 SDHA基因复合杂合变异(c. 393C>G;c. 448G>A)和 PDHA1基因变异(c. 124G>A);对 PDHA1基因变异进行蛋白结构功能预测,发现此变异导致蛋白质侧链发生变化。
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编辑人员丨6天前
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铜死亡相关差异长链非编码RNA评分公式在肾透明细胞癌中的临床价值
编辑人员丨6天前
目的:探讨基于生物信息学方法构建的肾透明细胞癌(ccRCC)预后相关的铜死亡相关差异长链非编码RNA(lncRNA)评分公式在患者临床诊断、预后预测以及治疗抉择中的价值。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取ccRCC患者的基因矩阵和临床数据(数据更新至2022年3月29日)。基因矩阵收录539例ccRCC组织和72例癌旁正常组织表达数据;临床数据收录530例ccRCC患者资料。采用Pearson相关性分析、Wilcoxon符合秩检验和单因素Cox比例风险模型分析筛选预后相关的铜死亡相关差异lncRNA。采用R软件将530例包含生存资料的ccRCC患者以近似1∶1的比例随机抽样分组,分为训练集(266例)和验证集(264例)。采用LASSO回归构建铜死亡相关差异lncRNA评分公式并进行交叉验证。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估铜死亡相关差异lncRNA评分公式的特异度和灵敏度,计算曲线下面积(AUC)。根据中位风险值将ccRCC患者分为低风险组和高风险组,采用Kaplan-Meier法分析高、低风险组患者总生存(OS)的差异。采用 t检验分析不同临床病理特征患者的风险值差异。采用R包rms构建可以预测ccRCC患者1、3、5年OS率的列线图。采用R包pRRophetic预测ccRCC患者临床治疗中常见的靶向药物(如索拉菲尼、舒尼替尼等)的半数抑制浓度( IC50),采用Wilcoxon符号秩检验比较高、低风险组患者 IC50值。收集山西医科大学第一医院2021年6月至12月行根治性肾切除术患者经病理检测确诊的20例ccRCC组织及其配对癌旁正常组织。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测ccRCC组织关键lncRNA的表达。 结果:基于TCGA数据库中ccRCC患者10个铜死亡基因(FDX1、LIAS、LIPT1、DLD、DLAT、PDHA1、PDHB、MTF1、GLS、CDKN2A)的表达矩阵,筛选出153个与预后相关的铜死亡相关差异lncRNA。LASSO回归分析,最终得到包含4个铜死亡相关差异lncRNA的评分公式:风险值=0.020×AC015912.3+0.011×AC026401.3+0.063×AC103706.1+(-0.076)×EPB41L4A-DT。根据中位风险值(0.76)将患者分为高风险组(≥0.76)和低风险组(<0.76)。ROC曲线结果显示,评分公式对于患者1、3、5年OS率的预测准确性较好。训练集、验证集、总队列中高风险组均较低风险组患者OS更差(均 P<0.001)。年龄、病理分级、肿瘤分期、根据铜死亡相关差异lncRNA评分公式计算的风险值是OS的独立影响因素(均 P<0.001)。铜死亡相关差异lncRNA评分公式计算得到的风险值在不同病理分级、肿瘤分期、T分期、N分期、M分期患者间差异均有统计学意义(均 P<0.01),但在不同性别、年龄患者间差异均无统计学意义(均 P>0.05)。构建的列线图对于患者1、3、5年OS率具有较好的预后准确性。高风险组应用舒尼替尼、西罗莫司敏感性更高,低风险组应用阿昔替尼、索拉非尼、帕唑帕尼敏感性更高。qRT-PCR检测结果表明,ccRCC肿瘤组织与癌旁组织比较,AC015912.3基因相对表达量为1.00±0.04比0.68±0.24( t=6.37, P<0.01),AC026401.3基因相对表达量为1.00±0.05比0.64±0.22( t=7.29, P<0.01),AC103706.1基因相对表达值为1.00±0.04比0.64±0.20( t=7.49, P<0.01),EPB41L4A-DT基因相对表达量为1.00±0.06、0.73±0.10( t=10.68, P<0.01)。 结论:基于TCGA数据库构建的铜死亡相关差异lncRNA评分公式可作为ccRCC患者临床诊断、预后预测的新型指标,帮助指导患者的临床药物治疗,有助于精准诊疗。
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编辑人员丨6天前
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以呼吸心跳骤停为突发表现的丙酮酸脱氢酶复合物缺乏症一例
编辑人员丨6天前
目的:探讨以呼吸心跳骤停为首发表现的丙酮酸脱氢酶复合物缺乏症患儿的临床、影像学特点及基因分析。方法:对2017年深圳市宝安区妇幼保健院因突发呼吸心跳骤停就诊的1例丙酮酸脱氢酶复合物缺乏症患儿的临床特征、影像学资料进行总结,以"丙酮酸脱氢酶复合物缺乏症"、"PDHA1"等为关键词,查阅PubMed数据库、中国知识基础设施工程(CNKI)数据库、万方数据库建库至2019年3月相关文献,对国内报道的病例进行总结。结果:先证者男,2个月10 d,感染后突发呼吸心跳骤停,伴高乳酸血症,难以纠正的代谢性酸中毒。头颅MRI检查提示:(1)双侧大脑基底节区异常信号,符合Leigh病影像学改变;(2)左侧室管膜下少许出血。脑电图提示异常放电。线粒体病相关基因检测提示 PDHA1基因存在c.1132C>T,p.H378C半合突变。患儿于1岁时死亡。 结论:丙酮酸脱氢酶复合物缺乏症多以神经系统症状起病,以心跳呼吸骤停为突发表现的报道罕见,及时心肺复苏、呼吸机支持能暂时挽救生命,为原发病治疗争取时间,但最终预后差,病死率高。 PDHA1基因c.1132C>T,p.H378C变异是其致病原因。
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编辑人员丨6天前
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复方ANBP通过调控TCA循环相关酶促进糖尿病创面愈合
编辑人员丨1个月前
目的:制备糖尿病大鼠背部全层皮肤缺损模型,观察复方ANBP对大鼠糖尿病创面愈合的影响和作用,从线粒体功能探讨复方ANBP对大鼠糖尿病创面的促愈机制.方法:将90只雄性SD大鼠随机分为空白组、模型组、复方ANBP组、贝复新组和烟酰胺单核苷酸(nicotinamide mononucleotide,NMN)组5组,每组16只.于3、7和14 d观察各组创面愈合情况后取材,分析创面愈合率,用HE和Masson染色观察局部组织病理变化,多重免疫荧光和Western blot检测三羧酸(tricarboxylic acid,TCA)循环相关酶丙酮酸脱氢酶E1 α1亚基(pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1,PDHA1)、柠檬酸合酶(citrate synthase,CS)、异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH1)和α-酮戊二酸脱氢酶(oxoglutarate dehydrogenase,OGDH)蛋白的表达情况,透射电镜观察创面组织线粒体数量和形态.结果:在糖尿病创面愈合进程中,空白组、复方ANBP组的组织形态学较模型组显著改善,在3、7和14 d空白组、复方ANBP组、贝复新组、NMN组创面愈合率显著升高(P<0.01).与模型组相比,其余各组创面肉芽组织新生填补创面缺损,生成丰富的胶原纤维.在干预后3、7和14 d,与模型组对比,空白组、复方ANBP组、贝复新组、NMN组TCA循环相关酶PDHA1、CS、IDH1和OGDH荧光强度显著增强,表达数量增多.3、7和14 d模型组TCA循环相关酶水平显著降低(P<0.01),复方ANBP组、贝复新组、NMN组水平均显著升高(P<0.01).复方ANBP干预后,复方ANBP组线粒体数量增多密度增加、线粒体形态改善空泡化率降低(P<0.05).结论:复方ANBP可能是通过增加线粒体数量、改善线粒体形态,上调PDHA1、CS、IDH1和OGDH蛋白表达水平,改善线粒体功能,加速创面肉芽组织新生,从而达到促进大鼠糖尿病创面愈合的目的.
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编辑人员丨1个月前
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基于生物信息学分析靶向铜死亡相关基因治疗心源性脑卒中
编辑人员丨2024/5/25
目的 基于生物信息学和机器学习探究靶向心源性脑卒中的铜死亡相关特征基因,分析特征基因与心源性脑卒中之间的潜在关系.方法 通过基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)获取心源性脑卒中患者的相关数据集,基于该数据集对铜死亡相关基因进行差异性分析,采用聚类分析和机器学习筛选铜死亡特征基因,通过接收者操作特征曲线验证特征基因的准确性和构建疾病预测模型以预测心源性脑卒中患病的风险;利用免疫细胞浸润分析和基因集富集分析探究疾病和铜死亡亚型与免疫微环境的关系及铜死亡特征基因与免疫细胞的相关性和生理病理学过程.结果 共筛选出3个铜死亡差异特征基因分别为丙酮酸脱氢酶E1亚基alpha 1(Pyruvate dehydrogenase E1 subunit alpha 1,PDHA1)、二氢硫辛酰胺脱氢酶(Dihydrolipoamide dehydrogenase,DLD)、溶质载体家族 31 成员 1(Solute carrier family 31 member 1,SLC31A1),3个特征基因表现出良好的准确性,并且其构建的疾病预测模型对心源性脑卒中的患病风险有良好的预测性.免疫浸润分析发现,心源性脑卒中与巨噬细胞、肥大细胞具有较强的相关性,3个特征基因同样与巨噬细胞、肥大细胞有一定的相关性,并且与嗜酸性粒细胞、中性粒细胞和γδT细胞有很强的相关性.基因集富集分析表明,铜死亡主要与免疫炎症反应、三羧酸循环、丙酮酸代谢和神经营养因子信号传导通路集ErbB受体酪氨酸激酶家族(ErbB receptor tyrosine kinase family,ERBB)信号通路等密切相关.结论 铜死亡特征基因PDHA1、DLD、SLC31A1和心源性脑卒中与免疫微环境之间存在很强的相关性,为心源性脑卒中的病理机制提供了依据,并为靶向药物的开发提供了方向,对心源性脑卒中的认识和治疗具有重要意义.
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编辑人员丨2024/5/25
