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基于网络药理学和代谢组学探讨黄芪四妙汤治疗2型糖尿病的作用机制
编辑人员丨1周前
为探析黄芪四妙汤(Huangqi Simiao Decoction,HSD)治疗2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制.通过网络药理学筛选HSD的成分靶点及T2DM相关疾病靶点,构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络、药物-成分-交集靶点网络,并筛选出潜在活性成分及靶点;使用AutoDock Vina软件进行分子对接验证潜在成分与核心靶点的相互作用;通过超高效液相色谱-串联质谱代谢组学技术检测血清,采用主成分分析(PCA)及偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)等多元统计分析,结合MetaboAnalyst数据库寻找各组差异代谢物与相关代谢通路,并将筛选的差异代谢物结合网络药理学筛选的交集靶点联合分析相同代谢通路.网络药理学显示,HSD治疗T2DM的9个核心成分为槲皮素、山柰酚、豆甾醇、汉黄芩素、β-谷甾醇、黄藤素、黄连素、黄连碱、小檗红碱;5个核心靶点为AKT1、TP53、TNF、IL6、VEGFA.分子对接显示,核心成分和靶点基因结合较好.代谢组学显示,共鉴定出112个共同差异代谢物,经HSD治疗后,其中88个代谢物浓度上升,24个代谢物下降.富集分析表明,HSD调节T2DM患者机体代谢主要与氨基酸代谢、三羧酸循环等7条代谢通路有关.代谢组学与网络药理学联合分析显示,二者均涉及组氨酸代谢通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路.结果表明,HSD对T2DM具有较好的治疗作用,基于代谢组学和网络药理学分析发现其作用机制可能是HSD中槲皮素、山柰酚、豆甾醇等药效基础通过调控多种代谢物,加强对组氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢通路的影响,为进一步防治T2DM提供了依据.
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编辑人员丨1周前
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基于氨基酸及特征肽测定的不同产地鸡内金质量研究
编辑人员丨1周前
目的:建立鸡内金氨基酸及特征肽的含量测定方法,对不同产地鸡内金进行质量评价.方法:采用高效液相色谱法对鸡内金的12个氨基酸类成分进行测定,同时采用超高效液相串联三重四级杆质谱法对鸡内金的2个特征肽进行测定,并采用偏最小二乘法分析(PLS-DA)对测定结果进行分析.结果:18批鸡内金的12种氨基酸成分总含量相对标准偏差(RSD)范围为2.84%~14.01%,鸡源多肽Ⅰ、鸡源多肽Ⅱ含量RSD分别为47.13%、14.62%,均呈现一定的波动,PLS-DA分析结果显示,3批产地山西和3批产地辽宁独自分为一类,9批产地山东与3批产地浙江的样品共同分为一类.结论:本研究建立的鸡内金氨基酸及特征肽的含量测定方法,能较好地评价不同产地的鸡内金质量,可为鸡内金及动物类药材的质量评价提供参考.
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编辑人员丨1周前
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大强度飞行训练对飞行员机体影响的代谢组学研究
编辑人员丨1周前
目的:研究大强度飞行训练对飞行员机体代谢的影响。方法:以25名接受大强度飞行训练的飞行员作为观察组,14名2周内未执行飞行任务的飞行员作为对照组,采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)的代谢组学技术检测其尿液和唾液,用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)进行组间差异代谢物筛选,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对差异代谢物进行注释和富集分析。结果:与对照组比较,观察组共9个代谢物有差异表达,包括胍丁胺、次黄嘌呤、腺嘌呤、黄嘌呤、肌苷、肌肽、多巴胺、5-羟基吲哚-3-乙酸、吲哚-3-乙酸,涉及嘌呤代谢、色氨酸代谢、组氨酸代谢、β-丙氨酸代谢、酪氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢6条主要代谢通路。结论:大强度飞行训练可能通过多条代谢通路引起飞行员代谢紊乱,这些通路可能因缺氧及应激诱发,并可能与飞行疲劳的产生相关。
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编辑人员丨1周前
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基于超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱平台的六价铬亚慢性暴露大鼠血清代谢组学研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨基于代谢组学技术分析六价铬[Cr(Ⅵ )]亚慢性染毒的毒作用及其机制。方法:6周龄健康雌性SD大鼠29只,采用随机数字表法随机分为3组,对照组10只、Cr(Ⅵ)低剂量组9只、Cr(Ⅵ)高剂量组10只。对照组大鼠饮纯净水,Cr(Ⅵ)低和Cr(Ⅵ)高剂量组大鼠分别饮用10、50 mg/LCr(Ⅵ)水溶液(分别为28、140 mg/L重铬酸钾),连续染毒90 d。利用超高效液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)联用技术检测各组大鼠的血清代谢物。采用主成分分析、偏最小二乘判别分析和正交偏最小二乘判别分析不同Cr(Ⅵ)染毒浓度大鼠血清代谢轮廓特征。Metabo Analyst 4.0软件对数据集进行代谢通路分析。结果:UPLC-Q-TOF-MS/MS仪器检测性能稳定,实验检测数据可靠。对照组、Cr(Ⅵ)低和Cr(Ⅵ)高剂量组大鼠代谢轮廓差异明显,Cr(Ⅵ)接触致大鼠血清代谢轮廓特征发生明显改变。筛选出Cr(Ⅵ)低剂量组与对照组间存在18个差异代谢物,Cr(Ⅵ)高剂量组和对照组间存在23个差异代谢物,其中不同Cr(Ⅵ)剂量组与对照组有13个代谢物同时存在差异,分别是3-羟基- 11Z-十八烷基肉碱、鹅肌肽、焦磷酸法尼酯、油酰乙醇胺、亚麻油肉碱、硫胆酸3-O-葡萄糖酰胺、溶血磷脂酰胆碱[20∶2(11Z,14Z)]、溶血磷脂酰胆碱[20∶3(5Z, 8Z,11Z)]、溶血磷脂酰胆碱[22∶2(13Z,16Z)]、磷脂酰甘油[16∶0/22∶5(7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)]、磷脂酰肌醇[18∶1(11Z)/20:4(5Z,8Z,11Z, 14Z)]、磷脂酰肌醇[20∶ 3(5Z,8Z, 11Z)/18∶0],5羟色胺。甘油磷脂代谢、色氨酸代谢、戊糖与葡糖醛酸间转化、萜类骨架生物合成代谢通路与Cr(Ⅵ)亚慢性染毒相关。结论:Cr(Ⅵ)亚慢性暴露可能会导致大鼠血清代谢指纹特征改变,血清差异代谢物主要与氨基酸、脂质代谢相关。
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编辑人员丨1周前
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严格膳食干预下不同钙摄入量对中国健康成年人机体代谢的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨严格膳食干预下不同钙摄入量对中国健康成年人机体代谢的影响。方法:于2015年9—10月,在哈尔滨医科大学公共卫生学院招募64名大学生(男、女性均为32名),采用双盲、随机、对照的试验设计,对研究对象进行持续35 d的膳食干预研究。将64名对象随机分为补钙组和对照组,每天给予相同的饮食,同时分别给予补钙组和对照组400 mg/d的钙补充剂和安慰剂,并在干预研究的第1、3、5周采集血液和尿液样本,检测血液中钙代谢相关激素[甲状旁腺素和1,25(OH) 2D 3]、生化指标及其代谢产物。采用主成分分析和偏最小二乘判别分析比较两组对象血液和尿液样本中代谢产物的差异,采用重复测量方差分析比较两组对象钙代谢相关激素和生化指标的差异。 结果:64名对象的年龄为23~28岁,男、女性均为32名;干预前补钙组和对照组的基线特征均衡。补钙组和对照组的血液和尿液中的代谢产物、钙代谢相关激素[甲状旁腺素、1,25(OH) 2D 3]水平和生化指标(血清钙、血清磷、糖脂代谢和肝肾功能指标)的差异均无统计学意义( P值均>0.05)。 结论:中国健康成年人300~400 mg/d的钙摄入量短期内不会导致机体产生钙缺乏所致的健康危害。
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编辑人员丨1周前
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人参不同药用部位皂苷类成分差异性分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨人参不同药用部位(人参、人参叶、人参花)中皂苷类成分的差异性,为其质量评定提供参考。方法:采用超高效液相色谱-串联四级杆飞行时间高分辨质谱(UFLC-Triple-TOF-MS/MS)分析人参、人参叶、人参花中皂苷类成分含量,采用SynergiTM Hydro-RP 100 A柱,0.1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)为流动相,通过主成分分析法(PCA)分析样品分组情况,以偏最小二乘回归分析法(PLS-DA)分析不同药用部位化学成分差异。结果:人参、人参叶、人参花的代谢组分具有明显差异,共得到10个差异化学成分,且具有不同的变化规律。结论:人参不同药用部位化学成分存在明显差异,可为人参的进一步研究与合理应用提供参考。
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编辑人员丨1周前
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基于机器学习的胰腺及上消化道肿瘤手术精细化营养支持的策略研究
编辑人员丨1周前
目的:通过机器学习方法建立模型探讨胰腺及上消化道肿瘤手术精细化营养支持的策略。方法:回顾性分析2016年12月至2018年5月间北京协和医院基本外科120例行胰腺及上消化道肿瘤手术患者的临床资料。纳入患者年龄、身高、体重、体温、脉搏、呼吸频率、血红蛋白、白蛋白、血糖、能量摄入、蛋白质摄入等11项临床指标,以术后有无并发症为结局,采用支持向量机(SVM)交叉验证方法分别建立患者术后1、2、3 d并发症预测模型,绘制受试者工作特征曲线(ROC),计算曲线下面积(AUC)。纳入除蛋白质和能量摄入之外的9个变量进行SVM的逆运算,获取并发症发生率最低时的最适能量和蛋白质摄入区间。对其中50例患者的血清样品进行核磁共振氢谱(1H-NMR)波谱检测。运用偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)获取患者术前1 d与术后1 d、术后1 d与术后3 d体内代谢物的变化,从人代谢组数据库(HMDB)获取相应的代谢物及代谢通路。结果:89例患者中52例术后发生并发症,无并发症组和并发症组患者各临床指标的差异均无统计学意义。患者术后1、2、3 d SVM并发症预测模型的AUC值分别为0.80、0.65和0.72,最适能量区间分别为20.7~41.5、103.7~124.4、112.0~132.7 kJ·kg -1·d -1,最适蛋白质区间分别为0.2~0.5、0.5~1.0、0.8~1.1 g·kg -1·d -1。基于1H-NMR代谢组学的PLS-DA模型得分图显示手术前后不同时间血液代谢产物出现显著变化。PLS-DA权重图离群值及HMDB筛选分析显示,术后1 d主要表现为糖异生增加,术后3 d主要表现为蛋白质分解增加。 结论:通过机器学习建模有助于获取胰腺及上消化道肿瘤手术后不同时点患者的最佳能量与蛋白质需求量区间,以此为依据可为适宜的个体化营养治疗提供方法学保证。
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编辑人员丨1周前
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脓毒症大鼠早期血浆代谢组学的动态变化
编辑人员丨1周前
目的:测定脓毒症大鼠早期血浆代谢组学指标,寻找不同时间点的脓毒症差异代谢物和相关代谢通路,初步揭示脓毒症大鼠早期的病理生理变化。方法:将15只8周龄雄性SD大鼠按随机数字表法分为假手术组(S组,6只)和脓毒症组(C组,9只),采用盲肠结扎穿孔术制备脓毒症大鼠模型;S组只游离盲肠,不予以结扎和穿孔。造模后2、6、12 h通过眼眶采血收集血浆,利用气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)联用技术测定血浆代谢组学,利用NIST数据库和Feihn代谢组学数据库的标准离子片段谱库比对鉴定内源性代谢物。通过MetaboAnalyst 4.0网站进行多元回归分析,包括主成分分析(principal components analysis,PCA)和偏最小二乘法判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)模式识别各代谢物的变化,筛选相关差异代谢物[ P<0.05、变化倍数(fold change)>1.5、变量权重值(variable important in projection, VIP)>1.5],并进一步通过KEGG分析相关代谢通路。 结果:PCA和PLS-DA模式识别结果显示,各个时间点的C组和S组代谢物之间表现出聚类型分布,不同时间点的C组代谢物之间也呈现聚类型分布。2、6、12 h时点S组与C组之间分别检测出14个、25个和21个差异代谢物。2 h时差异代谢物相关信号通路涉及淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢;6 h时差异代谢物相关信号通路涉及淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢、半胱氨酸和蛋氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、甘氨酸-丝氨酸和苏氨酸代谢、花生四烯酸代谢以及氨酰tRNA生物合成;12 h时差异代谢物相关信号通路涉及半乳糖代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、精氨酸生物合成、丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢、D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢以及维生素B6代谢。结论:脓毒症大鼠早期血浆代谢物水平呈现显著性的动态差异,血浆差异代谢物的改变可能参与脓毒症的病理生理学过程。
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编辑人员丨1周前
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非靶向代谢组学技术筛选成人大骨节病尿液差异代谢物
编辑人员丨1周前
目的:筛选成人大骨节病患者尿液中差异代谢物及代谢通路,为寻找大骨节病特异性生物标志物及发病机制提供新的科学依据。方法:在陕西省大骨节病病区永寿县选取成人大骨节病患者作为病例组,同时在同病区村选取无大骨节病临床症状的健康人群作为对照组。采集研究对象空腹中段晨尿,使用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术检测尿液中小分子代谢物,通过多变量统计分析偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)以及与KEGG、人类代谢组学数据库(HMDB)比对,鉴定并筛选大骨节病患者差异代谢物及代谢通路。结果:共纳入58名研究对象,病例组39名,其中男性23名、女性16名;年龄为(61.2 ± 7.8)岁;体质指数为(22.7 ± 6.5)kg/m 2。对照组19名,其中男性10名、女性9名;年龄为(50.0 ± 9.0)岁;体质指数为(24.3 ± 5.5)kg/m 2。鉴定并筛选出与大骨节病发病机制高度相关的一级差异代谢物3个(HT-2毒素、T-2四醇、硒-腺苷硒蛋氨酸),均表达下调;二级差异代谢物38个,其中10个上调、28个下调。筛选出差异代谢通路9条,主要涉及氨基酸代谢、脂类代谢和能量代谢。 结论:成人大骨节病患者和健康对照的尿液代谢谱存在显著差异,主要涉及氨基酸代谢、脂类代谢和能量代谢,其中一级差异代谢物HT-2毒素、T-2四醇、硒-腺苷硒蛋氨酸与大骨节病发病机制高度相关。
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编辑人员丨1周前
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彝药通关藤HPLC指纹图谱建立及化学计量学研究
编辑人员丨1周前
目的:建立通关藤药材的HPLC指纹图谱,并结合化学计量学方法对不同产地通关藤质量进行评价。方法:采用HPLC法建立指纹图谱,色谱柱为DiKMA C18(250 mm ?×?4.6 mm,5 μm),流动相为乙腈-0.05%磷酸水溶液,梯度洗脱,流速为1.0 ml/min,检测波长230 nm,柱温30 ℃,进样量10 μl。将色谱信息导入中药色谱指纹图谱相似度评价系统(2012版),进行相似度分析。采用SPSS Statistics 26进行系统聚类分析,采用SIMCA 14.1软件进行主成分分析和偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)。 结果:确定12个共有峰,指认其中2个色谱峰分别为通关藤苷G、通关藤苷I。15批样品指纹图谱与对照指纹图谱相似度为0.942~0.995。当平方欧式距离为20时,样品可聚为2类,S1~S3、S13~S15聚为一类,S4~S12聚为一类;主成分分析和PLS-DA结果表明,15批通关藤质量具有一定差异性,且与产地相关。结论:该结果可为分析不同产地通关藤药材质量差异及后期相关配方颗粒的质量标准提供参考。
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编辑人员丨1周前
