目的 分析并构建新生儿缺血缺氧性脑病(hypoxic-ischemic encephalopathy,HIE)竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的调控网络,筛选预测缺血缺氧性脑病诊治的潜在靶点.方法 通过TCGA和GEO数据库获取HIE的非编码RNA高通量测序数据,并进行差异基因分析.根据ceRNA理论构建出circRNA(circular RNA)-miRNA-mRNA网络,进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路和基因本体理论(Gene Ontology,GO)分享,探索和功能注释具有ceRNA潜在功能的circRNA.结果 对GSE121178数据集进行筛选,获得差异circRNAs165个,其中上调59个,下调106个;对GSE181127数据集进行筛选,获得差异miRNAs 63个,其中上调60个,下调3个.用miRecords、miRTarBase、TarBase数据库对获得差异miRNAs进行靶点mRNA预测,并对3个数据库预测结果取交集,共获得11个靶点mRNA(PIK3R1、BACE3、VEGFA、PPP2R2A、LATS2、WDR82、VEZT、TUBA1A、THBS1、SLC7A6、CDK6).经阈值筛选,筛选了10个共表达circRNAs、4个共表达miRNAs和11个共表达mRNAs,构建circRNA-miRNA-mRNA网络.KEGG富集分析显示:HIE涉及的20个交集蛋白在信号通路中,较为靠前的10条信号通路包括T细胞受体信号通路、Ras信号通路、Rap1信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、FoxO信号通路、ErbB信号通路、胰岛素抵抗、酪氨酸激酶抑制作用、细胞衰老和细胞周期等靶点.说明这些信号通路或与HIE的发生有关.动物实验表明:模型组大鼠神经功能缺损评分高于空白组(P<0.001).模型组miR-31-5p的mRNA表达水平明显低于空白组(P<0.05),模型组中miR-520g-3p,miR-30a-5p,miR-29a-3p表达水平明显高于空白组(P<0.05);WB显示,模型组中CDK6、THBS1和TUBA1的表达水平明显高于空白组(P<0.05),模型组中VEZT和WDR82的表达水平明显低于空白组(P<0.05).结论 构建了HIE的circRNA-miRNA-mRNA调控网络,找到了疾病的潜在治疗靶点,为HIE的诊治提供了新方向.

目的:探讨胰岛淀粉样多肽（IAPP）对阿尔茨海默病（AD）小鼠脑组织中长链非编码RNA（LncRNA）和信使RNA（mRNA）表达谱的影响。方法:选取7月龄雄性APP/PS1转基因AD模型小鼠10只，体质量20～30 g。将AD模型小鼠按数字表法随机分为IAPP干预组和对照组，每组5只。IAPP干预组小鼠腹腔内注射0.5 μmol/L的IAPP（200 μg/kg），每日1次。对照组小鼠腹腔注射相同剂量的磷酸盐缓冲液。两组小鼠干预时间均为10周。干预完成后，颈椎脱位处死小鼠，开颅剥离完整脑组织提取总RNA。应用基因芯片技术获得2组小鼠脑组织LncRNA和mRNA表达谱，筛选出差异表达的LncRNA和mRNA。在差异表达的LncRNA和mRNA中随机选取6个LncRNA，采用实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR）验证基因芯片结果的可靠性。将筛选出的差异表达的mRNA与基因本体论（GO）数据库的各条目比对，从分子功能、生物过程和细胞成分3个领域行GO富集分析；使用京都基因和基因组百科全书（KEGG）数据库行信号通路富集分析。结果:实验过程中小鼠死亡4只，每组2只。IAPP干预组与对照组比较，显著差异表达的LncRNA共有902个，其中显著上调238个、显著下调664个；显著差异表达的mRNA共555个，其中显著上调236个、显著下调319个。qRT-PCR检测验证LncRNA的表达情况，与对照组比较，IAPP干预组AD小鼠脑组织中AK034056、Spock3表达上调，Map3k8、rgs20、Rint、Ppp2r1b表达下调，差异均有统计学意义（ P值均<0.05）。qRT-PCR检测结果与芯片结果相符。GO富集分析：555个差异表达的mRNA，富集得到2 224个GO条目，其中显著上调的差异表达mRNA具有蛋白质结合、细胞周期等分子功能，与催化复合物、蛋白质复合物等细胞组分相关，参与了细胞代谢、高分子代谢等生物过程；显著下调的差异表达mRNA具有G蛋白偶联受体活性、跨膜信号受体活性等相关分子功能，与细胞黏附复合物、整合素复合物等细胞组分相关，参与G蛋白偶联受体信号通路、生物过程的调节等生物学过程。KEGG通路富集分析：555个差异表达的mRNA，富集得到62个通路，其中显著上调的差异表达mRNA富集评分较高的通路为神经退行性变的途径、阿尔茨海默病通路、氧化磷酸化通路、GABA能突触通路等，显著下调的差异表达mRNA富集评分较高的通路为钙信号通路、趋化因子信号通路、磷酸肌醇代谢通路、神经活性配体-受体相互作用通路、白细胞介素-17信号通路等。 结论:IAPP干预使AD小鼠脑组织 LncRNA、mRNA表达谱发生显著变化。差异表达的mRNA分别参与多种不同的生物学过程，差异表达的LncRNA可能通过调控相关mRNA的表达，发挥其生物学功能。

目的:通过分析常染色体显性遗传性智力障碍35型患儿的临床及遗传学特点以提高对该病的认识。方法:报道北京儿童医院2018年7月收治的1例常染色体显性遗传性智力障碍35型患者的临床资料、遗传学特点，并进行文献复习。结果:先证者男性，1岁3个月龄，表现为发育落后，低热，患儿面容特殊（额部突出、鼻梁塌平），张口呼吸，肌张力减低。头颅磁共振成像示侧脑室增宽、透明隔间腔及Vergae腔形成、中间帆腔囊肿。基因检测结果示PPP2R5D基因位点新生突变（NM_006245：c.1258G>A，p.E420K）。检索到既往共10篇国外文献报道31例常染色体显性遗传性智力障碍35型患者，包括本例共32例。32例中临床表现为智力发育迟缓（32例；100.0%）、运动发育迟缓（26例；81.3%）、巨头畸形（26例；81.3%）、癫痫（8例；25.0%），此外有特殊面容、震颤、眼科异常、骨骼发育异常、心脏畸形等表现。PPP2R5D基因突变均为新生错义突变，常染色体显性遗传。结论:常染色体显性遗传性智力障碍35型主要临床表现为发育迟缓/智力障碍、严重的语言发育落后、巨头畸形、肌张力减低、特殊面容。PPP2R5D基因新生错义突变为本病的遗传学病因。

目的:检测非小细胞肺癌(NSCLC)中PPP2R2A的表达，探讨NSCLC的临床病理学特性与其表达之间的关系。方法:应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测37例NSCLC肿瘤组织，及其相应的癌旁组织中PPP2R2A的表达，并分析其与临床病理特征之间的关系。结果:RT-PCR检测显示PPP2R2A的相对表达量在NSCLC组织、癌旁正常组织分别为1.15±0.38、3.78±1.77差异有统计学意义( P<0.01)；PPP2R2A的低表达与患者的临床病理学特征如年龄、性别、TNM分期及有无淋巴结转移无明显相关( P>0.05)，但是和肿瘤的病理类型、分化程度显著相关( P<0.05)。 结论:PPP2R2A在非小细胞肺癌中的低表达，有助于判断非小细胞肺癌的生物学特性。

目的:使用全外显子组测序技术对一例发育迟缓的婴儿进行基因检测，查明该患儿致病原因。方法:应用全外显子组测序技术对其进行致病基因筛查，结合临床表型资料，锁定候选基因致病位点，利用Sanger测序技术对先证者及其家系成员完成致病变异验证。结果:发现先证者存在 PPP2R5D基因c.592G>A(p.E198K)杂合变异，该变异为已知致病变异，根据相关文献报道及患儿临床症状，诊断该患儿的致病原因为 PPP2R5D基因c.592G>A变异引起的。 结论:Jordan综合征是一种罕见的遗传疾病，应用全外显子组测序技术能够快速发现 PPP2R5D基因变异，有助于该疾病的临床诊断和辅助治疗及该家系的遗传咨询及产前诊断。

目的:探讨大电导钙激活钾通道(BKCa)基因敲除后大鼠胰腺转录组基因表达及信号转导通路变化，分析BKCa基因在胰腺中的作用。方法:3只BKCa基因敲除成年雌性SD大鼠(BKCa敲除组)由首都医科大学基础医学院生理学与病理生理学系王伟教授馈赠，设3只野生型成年雌性SD大鼠为野生组。取完整的胰腺组织，提取总RNA，采用转录组测序技术进行测序、差异分析软件DESeq2筛选BKCa敲除组和野生组胰腺组织间的差异表达基因，利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对差异表达基因进行生物功能富集分析。采用RT-PCR法对富集分析出的关键基因进行验证。结果:BKCa敲除组和野生组大鼠胰腺样本共检测到18 258个基因，经DESeq2软件筛选出348个表达差异基因，其中200个基因在BKCa敲除组胰腺中高表达，148个基因低表达。GO数据库显示214个差异表达基因富集在56个GO条目，其中24个涉及生物学过程，18个涉及细胞组分，14个涉及分子功能；KEGG数据库显示348个差异表达基因中15个富集于PI3K/Akt信号通路，经RT-PCR验证，其关键基因Hsp90ab1、Hsp90aa1、Foxo3a、Col1a2在BKCa敲除组胰腺组织的表达显著高于野生组( P<0.0001)，而Thbs1、Pik3r1和Ppp基因表达差异无统计学意义。 结论:在转录组水平上筛选出BKCa敲除组与野生组大鼠差异表达基因，其显著富集于PI3K/Akt信号通路，为预测BKCa在胰腺中发挥的功能提供了线索。

目的:探讨粪便中SDC2、PPP2R5C及ADHFE1基因甲基化状态及其在结直肠癌和癌前病变筛查中的价值。方法:招募青岛大学附属青岛市中心医院2020年8月至2021年3月结直肠癌患者64例、腺瘤患者72例、增生性息肉患者33例和健康体检者59名，收集研究对象清晨粪便标本，提取基因组DNA并进行亚硫酸盐修饰处理，采用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测SDC2、PPP2R5C及ADHFE1基因的甲基化状态；同时进行粪便隐血试验（FOBT）。以病理结果为金标准，通过受试者工作特征（ROC）曲线及曲线下面积（AUC）比较3个基因甲基化联合检测与FOBT预测结直肠癌和癌前病变的效果。采用R-Studio软件构建粪便基因甲基化联合检测与其他临床特征预测结直肠癌列线图，并行校准验证。结果:粪便SDC2、PPP2R5C和ADHFE1基因甲基化联合检测在结直肠癌+腺瘤[74.3%（101/136）比47.1%（64/136）， χ2＝23.20， P＝0.001]、结直肠癌[90.6%（58/64）比70.3%（45/64）， χ2＝8.91， P＝0.003]、腺瘤[59.7%（43/72）比26.4%（19/72）， χ2＝14.43， P＝0.002]中的阳性率均高于FOBT，在增生性息肉[21.2%（7/33）比6.1%（2/33）， χ2＝0.12， P＝0.125]、健康对照[10.2%（6/59）比8.5%（5/59）， χ2＝4.01， P＝1.000]中阳性率差异均无统计学意义。基因甲基化联合检测预测结直肠癌+腺瘤的效能优于FOBT[AUC：0.85（95% CI 0.80~0.91）比0.71（95% CI 0.64~0.78）， P<0.05]，尤其对腺瘤的预测更优于FOBT[AUC：0.82（95% CI 0.74~0.89）比0.64（95% CI 0.57~0.69）， P<0.001]。ADHFE1基因甲基化状态预测结直肠癌的灵敏度和特异度均较高（90.6%、96.6%）。在>50岁结直肠癌患者中，基因甲基化联合检测阳性率高于FOBT[90.2%（55/61）比68.9%（42/61）， P<0.05]。依据基因甲基化联合检测和各临床特征构建的预测结直肠癌列线图校准曲线显示，预测和观察到的结直肠癌诊断效能之间具有高度一致性。 结论:粪便中SDC2、PPP2R5C及ADHFE1基因甲基化水平在结直肠癌和腺瘤患者中升高，基因甲基化联合检测有望成为结直肠癌及癌前病变筛查的非侵入性检测方法。

本文报道1例新生儿期起病的常染色体显性智力障碍35型（mental retardation autosomal dominant 35，MRD35）患儿的诊治过程。患儿男，生后1.5 h发病，表现为反复抽搐、肌张力低下、头围大、先天性肌性斜颈、喂养困难。动态脑电图示左中央区-颞区阵发性痫样波放电。全外显子组测序示患儿 PPP2R5D基因杂合变异c.139G>A（p.Glu47Lys），为新发变异，父母为野生型。随访至患儿1岁龄时，发育迟缓明显。MRD35临床缺乏特异性，需全外显子组测序明确诊断；且无特异性治疗，多为对症治疗，包括康复训练、语言训练、控制癫痫发作等。

目的:探讨突变等位基因肿瘤异质性（MATH）与子宫癌肉瘤（UCS）临床病理特征的关系及其对预后的预测意义。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）项目的公共数据库下载并使用maftools R软件预处理UCS的测序数据及临床资料数据；采用 t检验分析MATH值与UCS临床病理特征的关系；Kaplan-Meier法生存分析影响UCS患者总生存时间（OS）的因素，单因素及多因素Cox回归模型分析MATH值对UCS患者预后的预测意义。 结果:（1）56例UCS患者的MATH值为47.1±15.6。UCS患者的MATH值，年龄≤68岁患者显著高于年龄>68岁者（分别为52.2±15.1、41.9±14.7， P=0.012），TP53基因突变型患者显著高于TP53基因野生型者（分别为48.8±15.1、29.8±10.0， P=0.009），PTEN基因突变型患者显著低于PTEN基因野生型者（分别为35.8±16.6、50.1±14.0， P=0.004）；而不同体质指数、手术病理分期、种族以及FBXW7、PIK3CA、PPP2R1A基因突变状态UCS患者的MATH值比较，差异均无统计学意义（ P>0.05）。（2）以56份UCS组织标本的MATH均值（为47.1）作为界值，将MATH值>47.1判定为高MATH，MATH值≤47.1判定为低MATH。单因素分析显示，MATH值、手术病理分期、术后放疗及术后化疗是影响UCS患者OS的危险因素（ P<0.05）；多因素分析显示，MATH值（ HR=0.32，95% CI为0.15~0.68）、手术病理分期（ HR=2.23，95% CI为1.07~4.65）、术后放疗（ HR=0.37，95% CI为0.17~0.78）是影响UCS患者OS的独立因素（ P<0.05）。 结论:UCS患者的MATH值与患者年龄、PTEN基因及TP53基因突变型有关，且MATH值是UCS患者预后的潜在预测指标。

目的:基于网络药理学方法分析消瘰丸治疗恶性淋巴瘤的作用机制，为新药研发及经典方剂的临床运用提供参考。方法:通过TCMSP数据库获取玄参、浙贝母、牡蛎的主要化学成分及其靶点，根据ADME筛选中药活性成分；通过GeneCards、OMIN、TTD、DURGBANK数据库获取恶性淋巴瘤主要靶点，运用Cytoscape中BisoGenet功能筛选出消瘰丸治疗恶性淋巴瘤的主要靶点，并构建消瘰丸成分-恶性淋巴瘤靶点蛋白相互作用网络；应用Metascape数据平台对消瘰丸治疗恶性淋巴瘤的相关靶点进行生物信息学富集分析，应用Cytoscape软件构建消瘰丸成分-恶性淋巴瘤靶点-通路网络。结果:消瘰丸治疗恶性淋巴瘤的核心有效成分为玄参苷、浙贝素、花葵素、碳酸钙，作用靶点为PRS27A、TP53、PPP2CA，主要作用于NF-κB、HIF-1通路，其功能主要为通过rDNA染色体沉默、巨细胞分化程度的调控发挥作用，而2条通路共同作用的去泛素化功能可能是消瘰丸治疗恶性淋巴瘤的主要治疗靶点。结论:本研究揭示了消瘰丸治疗恶性淋巴瘤的多成分、多靶点、多通络的作用机制，为消瘰丸的临床开发利用提供基础。