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Impaired autophagy activity-induced abnormal differentiation of bone marrow stem cells is related to adolescent idiopathic scoliosis osteopenia
编辑人员丨1天前
Background::Osteopenia has been well documented in adolescent idiopathic scoliosis (AIS). Bone marrow stem cells (BMSCs) are a crucial regulator of bone homeostasis. Our previous study revealed a decreased osteogenic ability of BMSCs in AIS-related osteopenia, but the underlying mechanism of this phenomenon remains unclear.Methods::A total of 22 AIS patients and 18 age-matched controls were recruited for this study. Anthropometry and bone mass were measured in all participants. Bone marrow blood was collected for BMSC isolation and culture. Osteogenic and adipogenic induction were performed to observe the differences in the differentiation of BMSCs between the AIS-related osteopenia group and the control group. Furthermore, a total RNA was extracted from isolated BMSCs to perform RNA sequencing and subsequent analysis.Results::A lower osteogenic capacity and increased adipogenic capacity of BMSCs in AIS-related osteopenia were revealed. Differences in mRNA expression levels between the AIS-related osteopenia group and the control group were identified, including differences in the expression of LRRC17, DCLK1, PCDH7, TSPAN5, NHSL2, and CPT1B. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analyses revealed several biological processes involved in the regulation of autophagy and mitophagy. The Western blotting results of autophagy markers in BMSCs suggested impaired autophagic activity in BMSCs in the AIS-related osteopenia group. Conclusion::Our study revealed that BMSCs from AIS-related osteopenia patients have lower autophagic activity, which may be related to the lower osteogenic capacity and higher adipogenic capacity of BMSCs and consequently lead to the lower bone mass in AIS patients.
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编辑人员丨1天前
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一个早期婴儿型癫痫性脑病9型家系的临床特征及遗传学分析
编辑人员丨1天前
目的:分析一个早期婴儿型癫痫性脑病9型家系临床特征及遗传学特点。方法:采用N048:癫痫全面版基因检测panel-V2、基因拷贝数变异分析进行外周血检测,抽取羊水进行单核苷酸多态性微阵列(single nucleoticle polymorphism array, SNP-array)检测。结果:基因检测显示女婴Xq21.31q22.1区域杂合缺失,其中 PCDH19基因外显子缺失,变异来源于母亲。SNP-array检测示女性胎儿,arr [hg19] Xq21.31q22.1(89 558 626-99 701 006) ×1。此家系母女及胎儿均为早期婴儿型癫痫性脑病9型。 结论:PCDH19基因变异为该家系患早期婴儿型癫痫性脑病9型的可能原因。
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编辑人员丨1天前
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新型冠状病毒核酸血液筛查系统的检测性能评价
编辑人员丨1天前
目的:采用假病毒对三种新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸血液筛查试剂的检测性能进行比较和分析,为SARS-CoV-2核酸血液筛查的试剂选择提供依据。方法:使用慢病毒包装系统构建包含SARS-CoV-2基因组片段的假病毒。使用A、B、C三个单位的SARS-CoV-2核酸血液筛查系统进行RNA提取和扩增,根据各试剂检测结果计算其检测限(limit of detection, LoD)、特异度和精密度。结果:A、B、C三个单位N区段的单检LoD分别为3.46、8.73、23.87 copies/mL,混检LoD分别为13.65、78.92、159.14 copies/mL。ORF1ab区段的单检LoD分别为6.32、12.22、24.05 copies/mL,混检LoD分别为26.94、67.97、94.80 copies/mL。各试剂检测SARS-CoV-2阴性血浆的特异度均为100%,检测2LoD和较高浓度假病毒的批内和批间变异系数均小于5%。结论:A公司的SARS-CoV-2核酸血筛系统灵敏度最高。三种试剂均有良好的特异度和精密度。
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136个耳聋家庭Usher综合征1型相关基因变异情况分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨Usher综合征1型(Usher syndrome type 1,USH1)相关基因在136例中国河南籍耳聋家庭中的变异情况。方法:总结2016年11月至2019年12月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心应用二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术进行耳聋基因检测的136个耳聋家庭的临床资料和测序数据,统计分析USH1相关基因( MYO7A、 USH1C、 CDH23、 PCDH15、 USH1G、 CIB2)的变异情况。 结果:共有5个耳聋家庭检测到USH1相关基因的9个致病或可能致病变异,占所有耳聋家庭的3.7%(5/136),其中4个耳聋家庭致病基因为 MYO7A,1个耳聋家庭致病基因为 CDH23,9个变异中的7个变异为首次报道,包括 MYO7A基因的c.313delG、c.5257dupA、c.5435A>T、c.5636G>C、c.5722T>G变异,以及 CDH23基因的c.155_166del、c.4802delA变异。其中家庭2和家庭3的患者视力目前无异常,但根据基因诊断及行走延迟考虑为USH1的可能性大。 结论:在本组河南籍耳聋患者中, MYO7A为USH1相关基因中最常见的致病基因。应用NGS技术可以在视觉症状出现之前对USH1患者进行初步诊断。
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编辑人员丨1天前
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不明病因早发癫痫性脑病的遗传学及早期诊断研究
编辑人员丨1天前
目的:探究病因不明的早发癫痫性脑病(EOEE)的遗传学病因及其在早期诊断中的价值。方法:前瞻性收集2018年1月至2021年1月就诊于福建省立医院门诊及住院部的60例病因不明的EOEE患儿的资料,采集外周血进行全外显子组测序及拷贝数变异(CNV)检测,分析患儿临床特点、遗传学测序结果。结果:检测出EOEE相关的致病或可疑致病突变24例,包括婴儿痉挛症(10例)、Dravet综合征(3例)、吡哆醇依赖性癫痫及大田原综合征(各1例)、非已知癫痫性脑病(9例)。患儿起病年龄1 d~11个月(中位年龄4.2个月),就诊年龄2 d~4岁(中位年龄10个月),确诊年龄均控制在就诊1个月以内。发现单基因变异20例(33.3%),CNV 4例(6.7%);涉及13种基因: KCNQ2、SCN1A、SCN8A、CACNA1E、CDKL5、PPP3CA、PCDH19、TSC1、TSC2、ZEB2、ALDH7A1、DCX、HNRNPU;4例CNV异常分别为17p13.3缺失、11q23.3q25缺失、1q36.31-p36.33缺失、1q43-1q44缺失合并Xp22.33重复;共20种变异为国内外首次报道的新发位点;11q23.3q25缺失导致婴儿痉挛症为国内外首次报道; ZEB2变异导致婴儿痉挛症、 PPP3CA基因导致癫痫性脑病均系国内首例报道。 结论:基因与CNV是EOEE患儿的重要潜在病因,病因不明时联合采用全外显子组测序和CNV测序技术检测,可提高EOEE患儿的遗传学病因诊断水平;对此类患儿早期进行遗传学检测,可以早期确诊及进行癫痫精准治疗。
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编辑人员丨1天前
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microRNA-23b-3p对高糖诱导的人晶状体上皮细胞自噬和凋亡的抑制作用及其机制
编辑人员丨1天前
目的:探讨微小RNA-23b-3p(miR-23b-3p)对高糖诱导的人晶状体上皮细胞自噬和凋亡的调控作用。方法:纳入2019年9月至2020年10月在西安医学院第一附属医院眼科收治的糖尿病性白内障(DC)患者30例为DC组,同期就诊的单纯白内障患者30例为单纯白内障组。2个组均行常规晶状体超声乳化及人工晶状体植入术,术中收集晶状体前囊膜组织。实时荧光定量PCR检测各组晶状体前囊膜组织中miR-23b-3p表达。体外培养人晶状体上皮细胞系HLEB3细胞,将其分为正常对照组、高糖组,分别于正常和高糖培养基中培养。根据生物信息学数据库预测原钙黏附蛋白17(PCDH17)与miR-23b-3p的靶向关系,双荧光素酶报告基因实验验证两者的靶向关系;取高糖培养的HLEB3细胞,分为miR-23b-3p拟似物组、阴性对照(NC)拟似物组、NC-siRNA组、PCDH17-siRNA组、miR-23b-3p拟似物+Vector组、miR-23b-3p拟似物+pcDNA-PCDH17组,分别转染相应试剂后实时荧光定量PCR法检测miR-23b-3p和PCDH17 mRNA表达;Western blot法检测哺乳动物ATG6同源蛋白(Beclin-1)、微管相关蛋白1轻链3(LC3B)、c-Jun氨基末端激酶(JNK)、磷酸化(p-)JNK、c-Jun、p-c-Jun、B淋巴细胞瘤基因-2相关X蛋白(Bax)、B淋巴细胞瘤基因-2蛋白(Bcl-2)蛋白的表达;流式细胞术检测细胞凋亡率。结果:DC组晶状体前囊膜组织中miR-23b-3p相对表达量为0.35±0.15,明显低于单纯白内障组的1.00±0.09,差异有统计学意义( t=44.627, P<0.01);正常对照组、高糖组、高糖+NC拟似物组、高糖+miR-23b-3p拟似物组细胞中miR-23b-3p,LC3B Ⅱ/Ⅰ、Beclin-1、Bcl-2、Bax蛋白相对表达量以及细胞凋亡率总体比较,差异均有统计学意义( F=21.325、28.318、17.634、15.482、22.325、26.537,均 P<0.01);其中与正常对照组比较,高糖组细胞凋亡率、LC3B Ⅱ/Ⅰ、Beclin-1、Bax蛋白表达量显著升高,Bcl-2蛋白表达量下降,与NC拟似物组比较,miR-23b-3p拟似物组细胞凋亡率、LC3B Ⅱ/Ⅰ、Beclin-1、Bax蛋白表达量显著下降,Bcl-2蛋白表达量显著升高,差异均有统计学意义(均 P<0.05);生物信息学和双荧光素酶报告基因实验结果显示, PCDH17是miR-23b-3p的靶基因,miR-23b-3p拟似物组中PCDH17 mRNA相对表达量较NC拟似物组显著降低( P<0.05)。与NC-siRNA组相比,PCDH17-siRNA组细胞凋亡率、LC3B-Ⅱ/Ⅰ、Beclin-1以及Bax蛋白表达量显著下降,Bcl-2蛋白表达量显著升高,差异均有统计学意义( t=9.116、12.413、5.349、3.273、8.419,均 P<0.01)。NC拟似物组、miR-23b-3p拟似物组、miR-23b-3p拟似物+Vector组、miR-23b-3p拟似物+pcDNA-PCDH17组细胞中p-JNK/JNK、p-c-Jun/c-Jun、LC3B Ⅱ/Ⅰ、Beclin-1、Bcl-2、Bax蛋白相对表达量总体比较,差异均有统计学意义( F=24.724、19.319、23.418、17.562、20.263、15.249,均 P<0.05);其中与miR-23b-3p拟似物+Vector组比较,miR-23b-3p拟似物+pcDNA-PCDH17组细胞中p-JNK/JNK、p-c-Jun/c-Jun、LC3B Ⅱ/Ⅰ、Beclin-1以及Bax蛋白表达量显著升高,Bcl-2蛋白表达量降低,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:miR-23b-3p对高糖环境下HLEB3细胞具有保护作用,其机制主要是通过靶向PCDH17调控JNK信号通路抑制高糖诱导HLEB3细胞的自噬和凋亡。
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一个双基因Usher综合征1D/F型耳聋家系的基因检测
编辑人员丨1天前
目的:探讨1个先天性重度耳聋家系的致病基因变异类型,明确其可能的遗传学病因。方法:运用高通量测序的方法对家系中的先证者进行415个遗传性耳聋相关基因的序列检测,应用Sanger测序法对高通量测序结果进行验证并对先证者父母和妹妹进行基因变异位点验证。结果:先证者基因组DNA中检测到与双基因Usher综合征1D/F型耳聋相关的 CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)杂合变异和 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)杂合变异,先证者父亲携带 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)杂合变异,先证者母亲携带 CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)杂合变异。先证者妹妹听力正常,携带 CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)杂合变异,不携带 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)杂合变异。按照美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南进行致病性评级, CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)变异和 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)变异均为可能致病性变异(PS1+PM2+PP3+PP4)。 结论:CDH23基因c.5131G>A(p.Val1711Ile)变异和 PCDH15基因c.2884C>T(p.Arg962Cys)变异可能为该家系耳聋发生的遗传学原因。
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编辑人员丨1天前
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Goldengate高通量耳聋基因芯片在大前庭水管综合征中的有效性验证及应用分析
编辑人员丨1天前
目的:将Goldengate高通量耳聋基因芯片应用于大前庭水管综合征患者,验证芯片的准确性及有效性,为制定更加详细的大前庭水管综合征遗传检测策略提供参考。方法:2016年8月至2018年2月利用本研究团队研发的Goldengate高通量耳聋检测芯片,检测15例确诊为大前庭水管综合征耳聋患者及60例健康人对照样本,并利用Sanger测序法验证芯片检测结果。所有大前庭水管综合征患者均进行 SLC26A4基因测序,并与芯片结果进行对比分析。 结果:12/15患者通过芯片检测出 SLC26A4基因突变,通过芯片检测和 SLC26A4基因直接测序共检出9种突变,其中7种突变被两种方法均检出,该芯片可检测出 SLC26A4基因直接测序法所提供的等位基因信息的93.33%(28/30)。除 SLC26A4基因以外,15例大前庭水管综合征患者通过芯片还同时检测出 GJB2、 PCDH15、 TMC1、 MYO6以及线粒体基因的突变,并均经过Sanger测序法得到验证。 结论:Goldengate高通量耳聋基因芯片具有检测覆盖广、准确性高等特点,可作为大前庭水管综合征患者的初步检测手段。
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编辑人员丨1天前
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PCDH19基因突变相关癫痫的临床和遗传学特点研究
编辑人员丨1天前
目的:回顾性分析11个家系 PCDH19基因突变相关癫痫的临床和遗传学特点。 方法:对2013年3月至2019年7月郑州大学第三附属医院小儿神经内科确诊的11个家系共13例 PCDH19基因突变相关癫痫患者的临床表现和基因突变特点进行分析。 结果:1. PCDH19基因突变结果:11例先证者中,10例携带 PCDH19基因点突变,1例为5号外显子缺失。1例男性患儿为 PCDH19基因突变嵌合体,为c.840C>A,变异比例为34.27%。家系分析,11例先证者中5例为遗传性突变,6例为新发突变。5例遗传性突变中3例为父源遗传,父亲为无临床症状的半合子;2例为母源遗传,其中1例为患者,1例为表型正常的携带者。2.临床特点:13例中,女12例,男1例。起病年龄均<2岁,临床表型包括:癫痫伴智力低下9例(其中Dravet综合征3例),癫痫不伴智力低下4例。在同一家系内携带相同 PCDH19基因突变的女性表型具有明显异质性,少数女性(2例)可不发病。13例癫痫发作均具有丛集性特点,12例有热敏性特点,仅3例有癫痫持续状态。13例中,仅2例达到2年以上无发作,表现为Dravet综合征的3例先后予6~8种抗癫痫药物治疗,仍有频繁发作。 结论:PCDH19基因突变相关癫痫受累者以女性为主,少数男性嵌合体可发病,具有明显的表现异质性,丛集性发作和热敏感为其主要临床特点,多伴智力损伤。 PCDH19基因突变可为遗传性突变或新生突变,多数为点突变。
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编辑人员丨1天前
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PCDH15基因复合杂合新突变致无色素性视网膜色素变性表型的1F型Usher综合征一家系
编辑人员丨1天前
目的:确定1个具有无色素性视网膜色素变性(RPSP)表型的Usher综合征(USH)家系的致病基因及其与眼部表现相关性。方法:回顾性临床研究。2019年11月于河南省人民医院眼科门诊检查确诊的具有RPSP表现的1F型USH患儿1例和其父母纳入研究。患儿女,9岁。双眼夜盲4年余;听力下降7年,目前双耳感音神经性耳聋。双眼最佳矫正视力0.5 +。眼底未见明显色素沉着。外围视野视敏度下降。光相干断层扫描检查,周边视网膜外层变薄,椭圆体带消失。视网膜电图检查,视杆、视锥系统反应重度下降。患儿父母临床表型正常。抽取患儿及其父母外周静脉血,提取全基因组DNA,采用自主研发的靶向捕获试剂盒(PS400),使用二代基因测序技术检测基因变异,对可疑致病突变位点通过Sanger测序进行验证,并在家系成员中进行共分离。依据序列变异解读标准和指南对变异进行致病性评估;利用生物信息学技术评估变异对编码蛋白的影响。 结果:基因检测结果显示,先证者检测到 PCDH15基因c.4109dupA (p.K1370fs)(M1 )、c.17dupA (p.Y6_L7delinsX)(M2 )复合杂合突变位点,经Sanger测序验证,变异在该家系中呈共分离状态。经序列变异解读标准和指南评估,M1、M2均为 PCDH15基因致病性变异,M1导致编码蛋白跨膜结构完全改变,M2导致基因仅能翻译出6个氨基酸,预测不能合成PCDH15蛋白。根据临床表型、基因变异致病性以及蛋白结构预测,最终临床诊断为 PCDH15相关1F型USH。 结论:PCDH15基因c.4109dupA、c.17dupA为该家系患儿USH的致病突变位点,该复合杂合新突变导致PCDH15蛋白无法正常合成,从而引起眼部及耳部表现。
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编辑人员丨1天前
