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VEXAS综合征的研究进展
编辑人员丨5天前
VEXAS综合征是一种新近定义的难治性成人发病自身炎症综合征,由造血干细胞中UBA1编码泛素激活酶的基因的蛋氨酸体细胞突变引起,导致催化缺陷的UBA1亚型表达。患者由此出现一系列全身炎症表现和血液系统症状—反复发热、肺部浸润、皮肤症状、大细胞性贫血、血栓栓塞性疾病和仅限于髓系和红系前体细胞胞质的空泡。到目前为止,除了大剂量糖皮质激素外,对多数免疫抑制药物的效果很差,持续有效的治疗方法尚未确立,而且也缺乏足够的临床研究,因此需要对VEXAS综合征进行深入的研究。本文旨在描述VEXAS综合征的临床新进展、治疗选择以及预后,以便更好地了解VEXAS综合征发病机制和靶向治疗及改善预后。
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编辑人员丨5天前
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基于生物信息学分析识别老年骨质疏松症核心致病基因及通路
编辑人员丨5天前
目的:采用生物信息学方法分析老年骨质疏松症相关的核心致病基因及相关通路。方法:于2020年11月至2021年8月,以在北京积水潭医院就诊的8例骨质疏松症病例和5名健康体检者为研究对象。采集8例老年骨质疏松症患者与5名健康体检者的外周血,开展高通量转录组测序,并对表达谱进行分析。对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。通过 STRING、Cytoscape 工具构建 PPI 调控网络、筛选核心基因。结果:8例骨质疏松症病例中,男性1例,女性7例,年龄为(72.4±4.2)岁;5名健康体检者中,男性1名,女性4名,年龄为(68.2±5.7)岁。分析筛选出差异表达基因1 635个,其中847个基因高表达,788个基因低表达。GO富集分析结果显示,差异基因在分子功能方面主要富集于核糖体结构成分、蛋白质二聚化活性等;细胞组分方面主要富集于核小体、DNA组装复合物、胞质部分、蛋白-核酸复合物、游离核糖体等。KEGG信号通路分析结果显示,差异表达基因主要富集于系统性红斑狼疮、核糖体等。筛选出的10个核心基因分别为 UBA52 、UBB、RPS27 A、RPS15 、RPS12 、RPL13 A、RPL23 A、RPL10 A、RPS25和 RPS6,且其中7个基因均可编码核糖体蛋白。 结论:老年骨质疏松症的发病可能与核糖体相关基因和通路有关联。
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编辑人员丨5天前
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基于蛋白质-蛋白质相互作用网络的燃煤污染型氟暴露人群血浆微小RNA靶基因模块化分析
编辑人员丨5天前
目的:建立燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个微小RNA(microRNA,miRNA)靶基因的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选具有重要作用的基因及基因模块。方法:将本课题组前期筛选的燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA(hsa-miRNA-3131、hsa-miRNA-4516、hsa-miRNA-6501-5p、hsa-miRNA-10b-5p、hsa-miRNA-4683)的靶基因定位到STRING在线数据库(https://string-db.org),筛选PPI网络。使用Cytoscape v3.6.0软件对PPI网络可视化,通过NetworkAnalyzer插件得到拓扑属性值度和拓扑属性值介数,筛选PPI网络的中心节点(度和介数均最高的节点)。同时,采用CytoHubba插件中的最大团中心(MCC)分析方法来确定PPI网络中的重要节点。通过MCODE插件进行聚类分析,筛选PPI网络的基因模块。将基因模块所包含的蛋白质名称在线提交KOBAS v3.0数据库(http://kobas.cbi.pku.edu.cn/),对MCODE插件筛选出的基因模块进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果:靶基因的PPI网络由1 035个节点和4 346个边组成。泛素蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)的度(101)和介数(0.010 723 89)均最高,为PPI网络的中心节点。经MCC分析,UBA52为PPI网络中的重要节点。从PPI网络中选择排名前5的基因模块,5个基因模块的KEGG通路富集分析中高度富集的基因通路分别为泛素介导的蛋白水解、剪接体、内吞作用、神经活性配体-受体相互作用、囊泡转运。结论:成功建立了燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA靶基因的PPI网络,筛选出UBA52基因和5个基因模块主要通路。
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编辑人员丨5天前
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VEXAS综合征1例
编辑人员丨5天前
报告1例VEXAS综合征患者。患者男,63岁。以结节红斑、耳痛、间断低热起病,激素治疗有效,减停后反复再发。查血色素90 g/L,平均红细胞体积111.8 fL,C反应蛋白77.6 mg/L,红细胞沉降率101 mm/1h。自身抗体均阴性。皮肤活检病理符合结节红斑。骨扫描见鼻骨炎性病变。尿游离λ链阳性。骨髓及外周血涂片中可见部分单核细胞、淋巴细胞存在异常空泡。综合软骨炎及结节红斑等自身免疫表现和血细胞中特征性的空泡表现,全外显子组测序检测到UBA1基因c.122T>C(p.Met41Thr)的杂合突变,VEXAS综合征诊断明确。予甲泼尼龙24 mg/d治疗后,患者右耳肿痛迅速消退,听力恢复,结节红斑好转。
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编辑人员丨5天前
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UBA5基因突变导致发育性癫痫性脑病1例并文献复习
编辑人员丨5天前
目的:总结1例泛素样修饰剂活化酶5( UBA5)基因突变导致发育性癫痫性脑病(DEE)患儿的临床特征及基因突变特点,并进行文献复习。 方法:回顾性分析2020年3月就诊于徐州医科大学附属徐州儿童医院神经内科的1例DEE患儿的临床特点及基因检测结果。以"癫痫性脑病""发育性脑病""Eephalopathy""Developmental encephalopathy""UBA5"为关键词,对PubMed、中国知网及万方等国内外数据库从建库至2020年6月相关文献进行检索,并对国内外报道的 UBA5基因突变所致DEE确诊病例进行汇总分析。 结果:患儿,女,7个月23 d,自4个月开始出现癫痫性痉挛发作,经促皮质素(ACTH)及多种抗癫痫药物未能控制;患儿全面发育落后,身材矮小,小头畸形,面部表情少,易激惹,竖头不稳,不能追视,不能逗笑,四肢肌张力低;全外显子组测序显示患儿 UBA5基因存在一处点突变和基因拷贝数变异(CNV)缺失,其中点突变系父源性c.722A>C(p.E241A),位于第8号外显子区域,CNV缺失系母源性5-11号外显子区域,构成复合杂合突变。共检索出国外文献5篇(18例患儿),国内文献0篇,对国外的18例确诊病例和本例汇总分析显示,19例均在婴儿早期出现难治性癫痫发作,发作形式多为癫痫性痉挛发作(63.2%,12/19例),其次为肌阵挛(31.6%,6/19例)。患儿出生史均无异常,后出现不同程度的发育障碍,主要为小头畸形(94.7%,18/19例)、视觉缺陷(89.5%,17/19例)、身材矮小(94.7%,18/19例)、智力落后(89.5%,17/19例)、运动障碍(84.2%,16/19例)和肌张力低下(100.0%)等,其中大多数(68.4%,13/19例)已死亡。脑电图可呈现正常或者高峰节律紊乱等,其中1例出现暴发抑制。头颅磁共振成像(MRI)主要为不同程度的髓鞘化延迟(47.4%,9/19例)、脑萎缩(52.6%,10/19例)和胼胝体发育不良(26.3%,5/19例)等。 结论:UBA5基因突变累及的患儿常在婴儿早期出现难治性癫痫发作,发作类型主要为癫痫性痉挛发作;此外还呈现严重的精神运动发育迟滞、小头畸形和肌张力障碍等,预后极差,致死率高;头颅MRI提示不同程度的髓鞘发育不良、脑萎缩和胼胝体发育不良等;对具有以上临床表现的病例,应考虑行基因检测明确诊断。
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编辑人员丨5天前
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UBA5基因变异相关婴儿痉挛症患儿表型及基因型特点
编辑人员丨5天前
目的:分析 UBA5基因变异相关婴儿痉挛症(IS)的临床表型及基因型特点。 方法:回顾性分析2017年3月至2019年6月北京大学第一医院儿科诊治的4例 UBA5基因变异所致IS的患儿资料,对其临床表现、脑电图、头颅影像学、治疗及随访结果进行总结。 结果:4例(男3例、女1例)均确诊IS并携带 UBA5基因复合杂合变异,检测到6种变异位点,其中5种为国际上尚未报道的新变异。4例均以痉挛发作起病,起病年龄为出生1 d~8个月;2例在病程中出现局灶性发作。4例脑电图均监测到高度失律及痉挛发作。完成头颅磁共振成像检查3例中2例为非特异性异常,1例正常。4例起病前均发育落后,起病后有不同程度倒退且进步缓慢;1例小头畸形,3例肌张力高。末次随访年龄为7个月~6岁4个月,4例均接受多种抗癫痫药物联合治疗且发作均未控制。 结论:UBA5基因变异相关IS患儿起病年龄较早,常伴发育落后、小头畸形、肌张力异常,癫痫发作常为难治性。
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编辑人员丨5天前
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UBA5基因突变致早发性癫痫性脑病1例并文献复习
编辑人员丨5天前
目的:分析1例由 UBA5基因突变导致的早发性癫痫性脑病患儿的临床及遗传学特征,并进行文献复习。 方法:对2020年6月就诊于郑州大学第三附属医院小儿神经内科的1例 UBA5基因突变患儿的临床资料及遗传学特征进行回顾性分析,并检索国内外数据库,总结该病的临床特征及基因变异特点。 结果:1.患儿,女,4月龄出现痉挛发作,脑电图提示高度失律,多种抗癫痫药物治疗效果欠佳,伴严重认知、运动发育落后、肌张力减退、小头畸形。全外显子组测序结果提示 UBA5基因复合杂合突变:第3外显子c.214C>T(p.R72C)及第9外显子c.844_c.845insA(p.Y282Xfs*1),其父携带c.214C>T突变,其母携带c.844_c.845insA突变。2.至2020年12月,共检索到15例 UBA5突变所致早发性癫痫性脑病患者,表现为难以控制的癫痫发作、脑电图异常、肌张力减退、严重认知障碍及运动障碍、小头畸形、脑萎缩等。共发现 UBA5基因11种不同突变位点,其中c.1111G>A最常见,均符合常染色体隐性遗传。 结论:UBA5基因突变可导致早发性癫痫性脑病,为常染色体隐性遗传,其起病年龄早,癫痫发作难以控制,远期预后差。
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编辑人员丨5天前
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新生儿脊髓性肌萎缩伴先天性骨折一例并文献复习
编辑人员丨5天前
目的:报道国内首例脊髓性肌萎缩伴先天性骨折(spinal muscular atrophy with congenital bone fractures,SMABF)1型新生儿,探讨变异型SMA合并先天性骨折患儿的临床特征、诊断治疗及基因特点。方法:对深圳市儿童医院新生儿重症监护病房收治的1例SMABF1新生儿临床资料进行回顾性分析。以"儿童脊髓性肌萎缩或脊肌萎缩症"、"先天性骨折"、"甲状腺激素受体相互作用因子4"、"婴儿,新生"、"新生儿"和"Spinal muscular atrophy"、"Congenital fracture"、"Thyroid hormone receptor interaction factor 4 or TRIP 4"、"Infant, newborn"为关键词,分别对中国生物医学文献数据库、中国知网、万方数据库、维普中文科技期刊全文数据库、PubMed、Embase、The Cochrane Library、Web of Science、Springer Link、OVID数据库自建库至2019年12月22日收录的文献进行检索,总结变异型SMA合并先天性骨折患儿的临床特征和基因突变特点。结果:本例患儿为足月女婴,表现为关节挛缩,肌力、肌张力低下,伴先天性肱骨骨折、呼吸衰竭,全外显子基因检测发现TRIP4基因第2个外显子发生纯合变异:c.135dupA p.(Arg46fs),父母均为携带者,家属要求出院后当天死亡。文献检索目前国内尚无SMA合并先天性骨折新生儿病例报道,国外文献共收集6篇15例患儿,SMABF1 3例,其他具有SMA合并先天性骨折表现但致病基因不同12例,涉及的基因包括TRIP4、ASCC1、UBA1、EXOSC9和BICD2。结论:SMABF1患儿主要表现为胎动减少,肌力、肌张力低下,关节挛缩及先天性骨折,无特异治疗方法,多早期死亡。文献复习显示变异型SMA合并先天性骨折发病率低,临床表现与SMABF1相似,涉及多种不同基因变异,积极开展基因检测可明确诊断。
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编辑人员丨5天前
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ncRNA介导的EphB4上调与低级别胶质瘤不良预后及肿瘤免疫浸润的相关性
编辑人员丨2024/3/30
目的 探讨促红细胞生成素生成人肝细胞受体B4(erythropoietin-producing human hepatocellular receptors B4,EphB4)在低级别胶质瘤(lower-grade glioma,LGG)组织中的表达、其上游靶点以及与患者预后及肿瘤免疫浸润的相关性,分析其作为治疗靶点的潜在作用.方法 首先应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库胶质瘤数据分析EphB4在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析EphB4对不同癌症生存期的影响.用R语言和starBase数据库分析EphB4可能上游调节非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA).用肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库进行EphB4表达与肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物和免疫检查点相关性分析.结果 UBA6-AS1/hsa-miR-346轴是最有潜力影响LGG中EphB4表达的上游ncRNA相关通路.同时,EphB4水平与LGG肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物、免疫检查点表达均呈显著正相关.结论 ncRNA介导的EphB4上调与LGG的不良预后和肿瘤免疫浸润相关.
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编辑人员丨2024/3/30
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云南省马铃薯早疫病病原及毒性特点分析
编辑人员丨2023/12/9
[背景]早疫病是马铃薯主要病害之一,其病原为链格孢属(Alternaria)真菌,组成具有种复杂性和毒性差异性.[目的]明确云南省马铃薯早疫病两个致病种毒性特点和功能基因差异.[方法]以云南省大理州鹤庆县马铃薯主产区采集、分离和纯化的 Alternaria solani(TA-0410)和Alternaria alternata(TB-1129)两株菌为材料,进行孢子形态观察、毒性测定、全基因组测序和比较分析研究.[结果]发现 TA-0410 为大孢子种,分生孢子褐色或黄色,孢子大小为[37.4-151.9(±28.1)]μm×[4.3-22.9(±4.1)]μm,喙长;TB-1129 为小孢子种,分生孢子灰褐色,大小为[18.6-42.6(±9.3)]μm×[6.1-15.3(±2.3)]μm,喙短.毒性测定表明TA-0410 为唯一致病种,TB-1129 不能直接侵染引起马铃薯早疫病,但A.alternata在有伤接种条件下能产生并扩大病斑.两株菌测序分析发现TA-0410基因组大小为32.26 Mb,contig N50为1158607 bp,含177个特有基因,TB-1129基因组大小为33.30 Mb,scaffold N50 为 2338721 bp,含 600 个特有基因.此外,对唯一致病菌TA-0410 进行全基因组分泌蛋白特征 RxLx[EDQ]挖掘,共得到 12 个候选分泌蛋白,同源注释均为假定蛋白.结构域分析发现 2 个分泌蛋白ASR_2859 和ASR_19579 中分别包含和致病相关的BID_1 和UBA结构域.[结论]A.solani和A.alternata均能引起马铃薯早疫病,A.alternata仅在有伤条件下侵染;两个菌株侵染和病斑扩展阶段的表型主要由孢子活力及生物毒性相关蛋白控制.
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编辑人员丨2023/12/9
